4I7PA

T4 lysozyme l99a/m102h with 4-bromoimidazole bound
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
176
structure length
176
Chain Sequence
IPTTENLYFQGSMNIFEMLRIDEGLRLKIYKDCEGYYTIGIGHLLTKSPDLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINHVFQMGVTGVAGFTNVLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQCPDRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title The impact of introducing a histidine into an apolar cavity site on docking and ligand recognition.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 64
structure length 176
sequence length 176
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4i7pA00
3SB6A 3C7ZA 2IGCA 1L62A 2B6ZA 3HU9A 4E97A 1CTWA 123LA 4S0WA 151LA 2O79A 2Z6BA 5LZMA 236LA 1CX6A 1L27A 213LA 1L67A 2NTGA 1C6EA 3FADA 3GUPA 4I7NA 1L55A 1PQIA 191LA 1OV7A 1PQOA 1C6MA 215LA 2L78A 1QUOA 3HU8A 240LA 1G0QA 2F47A 130LA 1QTZA 4I7PA 3L64A 1L86A 1KY1A 1LLHA 256LA 1DYFA 190LA 4ARQB 1P64A 1PQMA 2OU9A 2RBOA 1L10A 3G3WA 1KW5A 3HUKA 3F8VA 1G1WA 1QSBA 1L45A 111LA 1C6KA 1L73A 239LA 1L37A 1L89A 1P37A 2OEAX 1L56A 1L94A 1G0KA 1C68A 1L81A 249LA 4ARLA 1T8AA 1D3JA 174LA 196LA 4YXAC 1KY0A 3QAKA 3GULA 1P56A 212LA 3HH4A 4EPFA 3EMLA 147LA 253LA 139LA 3HH3A 2RBPA 3HUQA 2B74A 138LA 1DYEA 1C6NA 1LWKA 4LZMA 2ANVA 233LA 1OVJA 4W56A 1L22A 1QS5A 150LA 104LA 4ARMA 1G0PA 1L31A 1LGXA 3GUKA 1L0KA 3CDOA 137LA 1QUGA 1L46A 205LA 2HUKA 3GUIA 4EXMA 1QT8A 4GBRB 1L85A 1T6HA 1D2WA 1P46A 2OTYX 1L48A 1LGWA 3UONA 120LA 1L74A 2CUUA 1L38A 3C80A 1L16A 231LA 1OWZA 1L02A 126LA 1L08A 1P7SA 7LZMA 1C6IA 209LA 3SBBC 4I7MA 2B6TA 3HH5A 3SB7A 1LI6A 3SB9A 3DN1A 1L41A 1L29A 3CDQA 3OE9A 1QSQA 3C7WA 167LA 1K28A 1L58A 2RB0X 1L96A 4ARPA 1KW7A 1C67A 1CU6A 1CUPA 4I7TA 131LA 261LA 3HTBA 1PQJA 1G1VA 2QARC 1G0JA 2LCBA 2B6YA 1LYJA 155LA 181LA 3DN0A 3OE8A 4DAJA 192LA 4W58A 1KS3A 161LA 3NYAA 5I14A 178LA 1C6QA 1PQKA 217LA 170LA 255LA 1L95A 1JTMA 1G0LA 4PK0A 1L25A 157LA 3C7YA 4I7JA 237LA 1G07A 1NHBA 1D3FA 225LA 3HWLA 3FI5A 1L15A 3PBLA 2NTHA 4I7OA 1CV5A 113LA 3DN6A 1XEPA 2B6XA 4EKRA 229LA 166LA 3C8RA 1L60A 1C62A 1L35A 4I7KA 1SSWA 1C6DA 119LA 232LA 248LA 228LA 3HDEA 4W51A 1P5CA 1L82A 211LA 1L47A 158LA 1L69A 199LA 4EKSA 1L99A 3C8SA 1KNIA 176LA 1QTVA 1CU2A 108LA 189LA 3C83A 4OO9A 1L93A 1L01A 3OE0A 1DYBA 1L57A 1QT4A 1PQDA 6LZMA 3GUNA 2HUMA 1L80A 122LA 2RAZX 4YXCA 1L83A 1C66A 3HDFA 3RZEA 1D9WA 1LI3A 4YX7C 1OVHA 2OE4X 115LA 173LA 1L23A 216LA 3HT6A 1L75A 246LA 230LA 3CDRA 3F9LA 197LA 141LA 1QTHA 1L33A 206LA 2RB1X 1L17A 226LA 3HT7A 129LA 1C6BA 1L87A 4DJHA 1P2RA 1P36A 171LA 2OU8A 1L70A 1L34A 1DYAA 3NY9A 1QUDA 3CDVA 2RAYX 169LA 2O7AA 180LA 3GUOA 1L63A 1CU0A 1C6HA 1C6GA 1CVKA 223LA 3V2WA 1G06A 3DMVA 4W57A 1L12A 1P3NA 4I7RA 1L72A 1L66A 1CV4A 1SX7A 3ODUA 182LA 1SSYA 3CDTA 1DYGA 214LA 2B6WA 258LA 1L68A 1L54A 177LA 112LA 1L42A 3G3XA 250LA 1QT6A 2B7XA 165LA 1XJTA 3NY8A 4I7QA 4LDOA 103LA 1ZURA 1OV5A 219LA 1CV3A 1L79A 3HH6A 3C82A 3PDSA 160LA 1L92A 1QTCA 1SWZA 1L49A 185LA 201LA 220LA 172LA 2B75A 1L88A 1OWYA 1L40A 2RB2X 3V2YA 156LA 1D3NA 1SWYA 3JR6A 259LA 3DMXA 1LWGA 4DKLA 1CX7A 125LA 4ARQA 1C63A 1L11A 1LGUA 4EKQA 3RUNA 1LYIA 4ARMB 3GUJA 221LA 1CV1A 1TLAA 1LYGA 3L2XA 3HTDA 1C69A 1L09A 200LA 1L53A 3G3VA 168LA 2OU0X 1L14A 114LA 1L36A 3DN2A 243LA 1LW9A 3FA0A 2B70A 1C6JA 2A4TA 159LA 3DN3A 3HT9A 3LZMA 1L90A 1L61A 3DNAA 3HT8A 4PJZA 187LA 162LA 247LA 260LA 2O4WA 1LPYA 2LC9A 2RBNA 4LDEA 2LZMA 3VW7A 145LA 1CU3A 1L71A 3SB5A 1C6TA 4I7LA 1L76A 1T8FA 4AQNA 1T97A 3C8QA 4ARJA 3SB8A 1CV0A 4W59A 163LA 2HULA 4IAPA 1LYHA 2RBSA 1EPYA 102LA 262LA 1L03A 149LA 245LA 4ZPUA 152LA 140LA 183LA 1C64A 224LA 238LA 1L18A 234LA 1P6YA 148LE 1C6PA 1P2LA 144LA 3OE6A 4EPIA 1QT5A 128LA 1L06A 3D4SA 1QUHA 1L19A 1C61A 118LA 1B6IA 4EJ4A 1L28A 2OE7X 3HTGA 2RH1A 2B73A 241LA 184LA 1LI2A 1XJUA 1L00A 1L43A 164LA 146LA 195LA 2F2QA 3HTFA 1L65A 257LA 3SN6R 3DKEX 242LA 210LA 4W55A 175LA 1L21A 1CU5A 1L52A 1L77A 1LYFA 109LA 1L39A 1L30A 3SBAA 198LA 143LA 1DYDA 1D3MA 1L64A 4W52A 1L04A 2B72A 1WTHA 2QB0B 2OE9X 2Q9DA 186LA 1C6CA 1QTBA 1C6LA 1L05A 1L0JA 235LA 1D2YA 1L51A 107LA 1C6FA 1CUQA 1L26A 4W54A 1QT7A 4EKPA 218LA 3DN4A 1G0MA 1L50A 1LYEA 1CV6A 1C65A 142LA 4W53A 1C6AA 2RBRA 1L24A 251LA 4GRVA 4K5YA 1L44A 127LA 1QS9A 1JTNA 1I6SA 2RBQA 1SX2A 1G0GA 1QTDA 1ZYTA 1ZWNA 1JQUA 1L98A 254LA 2ANXA 2Q9EA 252LA 1C60A 1L59A 1DYCA 1OVKA 222LA 110LA 244LA 1OYUA 2F32A 4LDLA 1L84A 188LA 3C81A 1L32A 227LA 1L97A 4I7SA 2OTZX 3DMZA 1L91A 3K2RA 3DN8A 3GUMA 1L13A 1L07A 1T8GA 1QT3A 1L20A 3HUAA 1LYDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2IGCA 2HECA 3CQLA 123LA 1IWWA 1LJIA 4S0WA 151LA 2O79A 4WMGA 1GF4A 1CX6A 213LA 207LA 4GLAA 4NWHA 4I7NA 5DL9A 1L55A 5LVGA 1PQOA 215LA 1IOQA 3WL2A 3RNXA 3L64A 1LKRA 1B7QA 190LA 1P64A 2HU3A 1IOTA 2RBOA 1LHMA 4XJHA 1KW5A 1QSBA 4FJRA 111LA 1L73A 1HEWA 5D5FA 4J1AA 3G3AB 1VAUA 1XSFA 4ARLA 4J1BA 4Z46A 3HBDA 1NWGA 1D3JA 1LZ8A 174LA 1KY0A 1VEDA 3GULA 1UIAA 3HH4A 1GFVA 1B5VA 1GBXA 138LA 1LWKA 2ANVA 1OVJA 4H9AA 2H9JA 4W56A 1HFZA 4O34A 1B7RA 1G0PA 1LGXA 3GUKA 3CDOA 1DQJC 205LA 4GBRB 1LGWA 3UONA 154LA 4NHQA 1L38A 3C80A 1L16A 1LHJA 231LA 126LA 2DQEY 4ML7A 2DQCY 1C6IA 2BPUA 1W6ZA 2B6TA 3HH5A 1W08A 4WM6A 1RCMA 1UIEA 1B5UA 5KKJA 1HC0A 2HTXA 1JITA 2XBRA 1L96A 4J0LA 1BB3A 4GCEA 3E3DA 4H8XA 4I7TA 3RZ4A 4NHPA 4CJ2A 1IWVA 1IR9A 4XJDA 1LZYA 5LA8A 1LZ1A 1GF9A 4EMNA 4NSJA 155LA 4DAJA 161LA 2FYCA 4LT2A 1PQKA 9LYZA 1BGIA 255LA 1L25A 4KT3A 1GEVA 3GXRA 4LT1A 132LA 3C7YA 237LA 1G07A 3HWLA 4DDBA 1WVUA 1GFAA 2Z39A 3P64A 3PBLA 2NTHA 4I7OA 113LA 1JSEA 1XGRC 2B6XA 1B5XA 4EKRA 229LA 4HV1A 4YF2A 3C8RA 3TXFA 4HTKA 5B05A 4H94A 228LA 3HDEA 1GDXA 1LJ4A 4WLXA 135LA 1LSEA 1L82A 3WU9A 158LA 4EKSA 1TCYA 1LJ3A 1RE2A 4H9EA 5KXLA 1LMTA 1BQLY 1B5WA 2FBDA 3W6CA 4WOAA 1C66A 3HDFA 3RZEA 1OVHA 216LA 3RW8A 2HUBA 4DWXA 3CDRA 3F9LA 4PHIA 197LA 1HMLA 4N0JA 1LYYA 1LZAA 1D6QA 3HT7A 1DI4A 1LSAA 2OU8A 1L70A 3B72A 3HFMY 133LA 7LYZA 3CDVA 3GUOA 1C6HA 1XGTC 1CVKA 2BQIA 4CFOA 1V7SA 4EOFA 3AB6A 1LSNA 3CDTA 1G7JC 1LSCA 4WM2A 2Z2EA 4PRQA 1RI8B 1GFRA 4DT3A 4WL6A 3NY8A 4LDOA 4KPMA 1BVXA 160LA 5LVKA 2Z37A 3D3DA 172LA 1N4FA 1JUGA 3J4GA 1JTOL 1LWGA 4ARQA 4LYOA 5E4PA 4AXTA 1LGUA 3RUNA 3A3QA 3P68A 4G4HA 4PRUA 1L53A 4NHTA 2OU0X 4NGZA 114LA 2DQIY 194LA 3LZMA 1L90A 1L61A 3DNAA 3ZVQB 3TMVA 2BQNA 1REYA 1LPYA 145LA 3SB5A 4WG7A 4I7LA 1SLYA 4AQNA 3A90A 3A93A 4ARJA 1TAYA 1LSYA 1LHHA 4IAPA 1LPIA 1EPYA 149LA 140LA 5LIOA 224LA 1L18A 234LA 148LE 1ZVHL 5B06A 1LMOA 2Z38A 1L19A 4DQJA 1B6IA 1E8LA 153LA 5HLLA 1XJUA 3CSZA 1IY3A 3SN6R 3F6ZA 242LA 210LA 4OW1A 1L21A 3AZ4A 1HSWA 1L77A 109LA 1L39A 4WLDA 3CT5A 4UWVA 1UIHA 1FLYA 1IOCA 2QB0B 1HFXA 2OE9X 4XYYA 186LA 1QTBA 1C6LA 4M4OA 1L0JA 5DLAA 1LZEA 1F10A 4W54A 4WM5A 4EKPA 1LZ9A 2H5ZA 3DN4A 1LMNA 4NGLA 1CV6A 4NY5A 1C65A 142LA 4Z98A 1C6AA 3W3EA 4C3WA 2BQGA 5KXZA 1I6SA 1SX2A 1QTDA 4II8A 1GBSA 254LA 1B0DA 2ANXA 1IR7A 1IP5A 1LZ5A 4HP0A 5KXPA 1C60A 1GF0A 1IORA 1DYCA 4I8SA 3AGHA 1L84A 5LAFA 3P65A 1BB5A 4H91A 3C81A 3WPJA 1L97A 4I7SA 1IIZA 3DN8A 1L13A 4GN5C 1LYDA 2YSSC 1L62A 4E97A 4H1PA 1LJJA 3WPLA 1I56A 4LYCA 1PS5A 1T6VL 1YL1X 2Z6BA 1BHZA 236LA 1L27A 3B0KA 1C45A 1C6EA 5LAGA 4B0DA 2L78A 3HU8A 4QEQA 1AM7A 240LA 1G0QA 2RSCA 1XEKA 5LINA 4I7PA 2I25L 1KY1A 1LZSA 256LA 1DYFA 4ARQB 1PQMA 1JJ0A 3EO5A 1L10A 4BAFA 3WUNA 1C6KA 5APCA 2ZIJA 3ATNA 4IASA 3TMXA 4G4CA 4WLYA 1L81A 1HEMA 3WPKA 249LA 2BAAA 3WVYA 196LA 5LVIA 3QAKA 4DD0A 1P56A 212LA 3EBAB 5HQ1A 4RDSA 139LA 1GBWA 3HH3A 3FI7A 3P4ZA 5II3A 1T3PA 1CJ7A 1C6NA 4LZMA 1UIDA 4WM3A 1L22A 1OUFA 1CKHA 4ET8A 3TXJA 4ARMA 3EMSA 5K7OA 1A2YC 1HERA 3CSQA 5I54A 1GB9A 1LYZA 4B4IA 3GUIA 1QT8A 1T6HA 4H90A 1P46A 2EQLA 5KKIA 1B7SA 120LA 1JHLA 4ANRA 2CUUA 1FKQA 1H6MA 4CHXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2IGC A;  2HEC A;  3CQL A;  123L A;  1IWW A;  1LJI A;  4S0W A;  151L A;  2O79 A;  4WMG A;  1GF4 A;  1CX6 A;  213L A;  207L A;  4GLA A;  4NWH A;  4I7N A;  5DL9 A;  1L55 A;  5LVG A;  1PQO A;  215L A;  1IOQ A;  3WL2 A;  3RNX A;  3L64 A;  1LKR A;  1B7Q A;  190L A;  1P64 A;  2HU3 A;  1IOT A;  2RBO A;  1LHM A;  4XJH A;  1KW5 A;  1QSB A;  4FJR A;  111L A;  1L73 A;  1HEW A;  5D5F A;  4J1A A;  3G3A B;  1VAU A;  1XSF A;  4ARL A;  4J1B A;  4Z46 A;  3HBD A;  1NWG A;  1D3J A;  1LZ8 A;  174L A;  1KY0 A;  1VED A;  3GUL A;  1UIA A;  3HH4 A;  1GFV A;  1B5V A;  1GBX A;  138L A;  1LWK A;  2ANV A;  1OVJ A;  4H9A A;  2H9J A;  4W56 A;  1HFZ A;  4O34 A;  1B7R A;  1G0P A;  1LGX A;  3GUK A;  3CDO A;  1DQJ C;  205L A;  4GBR B;  1LGW A;  3UON A;  154L A;  4NHQ A;  1L38 A;  3C80 A;  1L16 A;  1LHJ A;  231L A;  126L A;  2DQE Y;  4ML7 A;  2DQC Y;  1C6I A;  2BPU A;  1W6Z A;  2B6T A;  3HH5 A;  1W08 A;  4WM6 A;  1RCM A;  1UIE A;  1B5U A;  5KKJ A;  1HC0 A;  2HTX A;  1JIT A;  2XBR A;  1L96 A;  4J0L A;  1BB3 A;  4GCE A;  3E3D A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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