4I7SA

T4 lysozyme l99a/m102h with 3-trifluoromethyl-5-methyl pyrazole bound
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
175
structure length
175
Chain Sequence
PTTENLYFQGSMNIFEMLRIDEGLRLKIYKDCEGYYTIGIGHLLTKSPDLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINHVFQMGVTGVAGFTNVLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQCPDRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title The impact of introducing a histidine into an apolar cavity site on docking and ligand recognition.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 64
structure length 175
sequence length 175
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4i7sA00
1L10A 1L24A 1L32A 3HU8A 162LA 120LA 4ARPA 161LA 1C64A 128LA 1D3FA 1L73A 131LA 1QUGA 1L65A 2LZMA 1T8FA 1L03A 1L50A 1L76A 227LA 220LA 2OU9A 4OO9A 1L74A 3HT8A 1SX7A 250LA 3GUMA 251LA 1L07A 1CV1A 177LA 1L06A 1L49A 160LA 1L81A 1L84A 3C8RA 4W54A 4ARQB 171LA 1G0LA 259LA 3OE6A 1T8AA 1L86A 198LA 262LA 256LA 3DMVA 3GULA 4I7SA 1L59A 197LA 1LGWA 1L94A 1DYEA 1C6BA 1L19A 1PQDA 1L55A 1L01A 1LWGA 1NHBA 1P2RA 4I7KA 149LA 4IAPA 1SSWA 2F2QA 4S0WA 1QUOA 3NY9A 1L0KA 213LA 231LA 4ZPUA 3V2WA 2OU0X 3NYAA 2QARC 199LA 168LA 2QB0B 109LA 1C6KA 1P2LA 1WTHA 3G3VA 4W51A 5I14A 1L26A 2HULA 1L42A 222LA 1JTNA 2IGCA 3HTDA 1T97A 1L71A 3GUIA 210LA 1C6EA 4DJHA 1L33A 1G0QA 230LA 1C6GA 1L25A 1DYGA 3JR6A 3OE8A 2RH1A 143LA 247LA 1DYAA 1LYIA 1C69A 2L78A 1L13A 3SB5A 4PK0A 165LA 1QUHA 3HWLA 1P36A 234LA 3SBBC 1L72A 238LA 1JTMA 235LA 4LDLA 257LA 1L69A 1C6AA 1JQUA 3UONA 3GUKA 2RBSA 4LDEA 1L11A 2OTZX 1CV0A 122LA 2RBRA 1C6CA 4ARMB 1G0KA 1QTDA 156LA 4W52A 1CV4A 192LA 3DMZA 188LA 1PQMA 1D9WA 3HUAA 1QS9A 4DAJA 1KNIA 1C6MA 1TLAA 3FADA 3HU9A 3DNAA 4W57A 1LLHA 240LA 1L15A 1L20A 2O79A 150LA 189LA 2RAYX 3C81A 212LA 1KY1A 3HT9A 3CDTA 2OE9X 1CU6A 2CUUA 1P56A 4ARQA 260LA 1C68A 1L87A 1QSQA 1QT8A 4PJZA 1L47A 1LYFA 1L77A 146LA 1L39A 1L35A 1OV7A 1L89A 2B7XA 211LA 3L2XA 3SB7A 1D2YA 4I7OA 1XJUA 2B6ZA 1L21A 1EPYA 205LA 2F32A 2OTYX 3CDOA 1L80A 1L28A 206LA 1L96A 1L34A 242LA 4LDOA 3G3XA 103LA 3VW7A 2Q9EA 4I7PA 3EMLA 113LA 102LA 3C7ZA 4I7TA 2HUMA 3DN4A 217LA 2B6XA 2LCBA 1L48A 1C6IA 183LA 3PDSA 4YXCA 1B6IA 119LA 1L95A 4GRVA 3C83A 3DN3A 144LA 4W55A 1L93A 1P7SA 3FA0A 243LA 1DYFA 1L62A 1T8GA 4YX7C 1L90A 1L05A 2NTHA 1L38A 3GUPA 3G3WA 3V2YA 253LA 1C6QA 3DN2A 108LA 3HH4A 4ARLA 4EPIA 1L56A 3HTBA 3F9LA 115LA 2B74A 1PQOA 3C7WA 5LZMA 1C6NA 1DYBA 155LA 4AQNA 4W56A 1L29A 1C67A 1LYGA 4W53A 182LA 1I6SA 4ARJA 3FI5A 1C6TA 1KS3A 1PQIA 4K5YA 1ZURA 110LA 252LA 4EKSA 137LA 107LA 178LA 201LA 2OEAX 1G0PA 1C6DA 2LC9A 2HUKA 1L45A 1LW9A 2B70A 4EKQA 209LA 114LA 1L82A 1OWYA 3CDVA 1L68A 223LA 3SBAA 159LA 2RBOA 2Z6BA 1D2WA 1L92A 1QT7A 3HUKA 7LZMA 3NY8A 226LA 216LA 1D3JA 3DMXA 3DN8A 2ANXA 1C6LA 248LA 2RB1X 249LA 2RBPA 104LA 176LA 3C8SA 1L83A 173LA 3C7YA 152LA 3GUNA 1L14A 4EJ4A 1C6JA 1LYEA 1L04A 3HTFA 1L61A 191LA 184LA 196LA 1PQJA 1L67A 244LA 245LA 3QAKA 237LA 158LA 1C62A 1CUQA 4EKPA 3DN6A 3HH3A 1SSYA 3OE0A 1G06A 1L88A 3C82A 164LA 3HH6A 1G1VA 2F47A 1CX7A 228LA 232LA 1G07A 1L85A 2OU8A 3HDEA 3OE9A 3ODUA 1L43A 1OVHA 1K28A 4E97A 1QT3A 3RUNA 1CVKA 1SWYA 1QT6A 141LA 1LYDA 1P46A 1KY0A 1G0JA 1D3MA 175LA 4W58A 1L02A 1T6HA 151LA 1QTCA 1QTHA 3LZMA 1L16A 147LA 1L54A 1L60A 2B6WA 1CUPA 185LA 1L57A 1L17A 1CV6A 246LA 1ZYTA 1L40A 166LA 1L97A 1L12A 1CU2A 1OVKA 4EPFA 195LA 1CU5A 3SB6A 139LA 2B6TA 254LA 215LA 1CU0A 1G1WA 261LA 1L00A 1L70A 1L75A 1XJTA 2RBNA 1L18A 1CTWA 233LA 130LA 3CDQA 138LA 1L08A 163LA 4YXAC 239LA 1C61A 1L58A 1L66A 3C8QA 3HDFA 1C65A 1D3NA 1CV3A 2B6YA 186LA 4LZMA 187LA 174LA 1L91A 3HT6A 145LA 1QTZA 167LA 1C60A 1L36A 2RAZX 229LA 1OYUA 1OV5A 4ARMA 236LA 1L23A 1LYHA 1L46A 1DYDA 1LGXA 3SB8A 1L09A 1P3NA 258LA 2OE7X 3K2RA 2RBQA 157LA 200LA 1OWZA 1CV5A 4I7QA 1P6YA 3RZEA 169LA 1LI3A 4I7NA 4W59A 4I7RA 3DN1A 1C6FA 1L30A 1LI6A 6LZMA 2A4TA 3GUOA 140LA 1L63A 1L37A 2ANVA 1KW7A 1L52A 3DN0A 1L51A 127LA 1LI2A 180LA 1SX2A 214LA 4I7MA 219LA 3F8VA 218LA 112LA 1C6HA 3CDRA 1PQKA 1L53A 3HH5A 2B72A 2Q9DA 255LA 1L44A 3L64A 2O4WA 4EXMA 224LA 3HTGA 3SN6R 1P5CA 1C66A 1LPYA 1C63A 1DYCA 3DKEX 170LA 1P64A 225LA 129LA 3C80A 1LWKA 142LA 3HUQA 2O7AA 4GBRB 4I7JA 1QS5A 1L99A 190LA 1QTVA 1L64A 1ZWNA 3HT7A 3GUJA 1L22A 4DKLA 2B73A 2OE4X 1QT5A 125LA 126LA 111LA 3SB9A 1P37A 2NTGA 148LE 1C6PA 181LA 1LYJA 1CX6A 172LA 1QT4A 1L41A 1QTBA 123LA 1L98A 241LA 1G0MA 1L31A 3PBLA 1CU3A 3D4SA 4EKRA 1LGUA 118LA 1QSBA 1L0JA 4I7LA 1QUDA 1L27A 2RB2X 1XEPA 1L79A 2RB0X 221LA 1KW5A 1G0GA 2B75A 1SWZA 1OVJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L24A 1AZFA 1GFGA 131LA 1HEOA 4WM1A 1L50A 1L76A 3TXJA 4N8ZA 220LA 2MECA 3A96A 250LA 251LA 1FLYA 1L07A 5APDA 177LA 1YIKA 1L81A 4UWVA 135LA 1L84A 1IORA 171LA 1BWIA 1WVVA 3OE6A 1T8AA 198LA 262LA 256LA 3WMKA 2BQAA 3A91A 1LGWA 1ZV5L 3W6FA 2LHMA 1LZ9A 1T6VL 1GE3A 1L01A 1NHBA 1P2RA 1SSWA 1D0MA 1QUOA 3NY9A 4ZPUA 3V2WA 2QARC 2QB0B 1P2LA 1WTHA 1BVKC 5C6IA 2DBTA 1JTNA 1OUAA 1IOCA 1JPOA 3TXFA 1T97A 1L71A 210LA 1UIHA 5FEKA 4DJHA 4HTKA 5LINA 1KXYA 5LAGA 1GFJA 1LZSA 1C6GA 1W6ZA 3WVYA 2LZ2A 3OE8A 2RH1A 143LA 247LA 1DYAA 2YBNA 4G4CA 4G9SA 1QUHA 1P36A 1IVMA 4A7DA 4XJGA 2DKVA 1L69A 1C6AA 1VDQA 4XJFA 3LHMA 1JQUA 1LSDA 1B7MA 4N5RA 2RBSA 1L11A 1CV0A 1IX0A 122LA 5IELA 4DD1A 1G0KA 2CWIA 3DMZA 188LA 1DKKA 2AUBA 3ATOA 1NMMA 4ETAA 2XBSA 1HEMA 3A92A 2BQHA 1L15A 1BWJA 2O79A 1YQVY 2DQDY 3D9AC 3N9CA 3WVXA 4H9CA 1XSFA 3ULRA 1C68A 1L87A 1QSQA 1QT8A 1GB9A 1L77A 146LA 1LMCA 1L35A 1L89A 1GB3A 211LA 4WL7A 2YBHA 4WLDA 2BAAA 2H9JA 1O23A 4PGJB 5L3HA 3WUNA 1GBZA 134LA 1L21A 1EPYA 1D0KA 1D0LA 4RW1A 2OTYX 1EQEA 1L80A 2G4QA 4LDOA 3WUAA 103LA 4I7PA 113LA 1V7SA 5JENB 8LYZA 4DD0A 2B6XA 183LA 3PDSA 4NHPA 2LYOA 3AZ6A 1REXA 4W55A 4H9AA 1LSGA 3M18B 3FA0A 243LA 4YENA 2ZILA 5LXWA 1IC5Y 1L62A 4N0JA 1LZNA 4GN4A 1IC7Y 1OUGA 3AGHA 2NTHA 5LVJA 2G4NA 5IHGA 1C10A 4I8SA 5L3IA 3A3RX 4ARLA 4EPIA 1L56A 3F9LA 5KXOA 1LMNA 4PRQA 1XFPL 1QQYA 4LYBA 182LA 3FI5A 1JKDA 1VAUA 2HU3A 4K5YA 2BQKA 110LA 1V7TA 1FDLY 4EKSA 4BAPA 2ZYPA 1BWHA 1G0PA 4RDSA 1LKSA 2HUKA 2DQAA 4C3WA 1LW9A 1N4FA 2B70A 1WQMA 114LA 1L82A 1IP3A 3CDVA 1GE4A 5C6JA 2GV0A 3HBDA 3TMUA 3HUKA 2Z18A 4MSTA 3DMXA 3ZEKA 4WG7A 1GF7A 6LYTA 2RBPA 4KL7A 1UIGA 3C7YA 1XEJA 1LMAA 1YAPA 5LA5A 1BB6A 4EJ4A 1C6JA 2ZWBA 1LYEA 5KXKA 1L61A 1LMOA 1OUIA 4BADA 1L67A 2YVBA 1IO5A 3WPJA 1LJEA 1EQ4A 2C8PA 1OUJA 1JTPL 1FLQA 4HTNA 2F47A 1LZYA 1KXWA 1YAMA 5HNCA 3WPKA 3ODUA 1B5XA 3QY4A 1JTOL 1K28A 4H8ZA 1G7MC 4B4JA 4NHQA 3TMXA 4CJ2A 1GF8A 4LT2A 3W6EA 1T6HA 1WQQA 2B6WA 1A4VA 1CKCA 3K3TA 1VFBC 4PPOA 1IC4Y 1CV6A 3D3DA 1J1PY 4XJDA 1GFUA 1KIQC 2YBIA 1LHKA 1IEEA 1C43A 1CU2A 1GF6A 1LSPA 139LA 4OWBA 2B6TA 1JJ3A 1L00A 1OUBA 2RBNA 4DDBA 1QTEA 2I6ZA 3WPLA 130LA 1J1OY 138LA 1GEZA 1WVUA 2YSSC 6LYZA 1TCYA 4I0CA 1L58A 3HDFA 5J7CA 5FSTA 187LA 1KIRC 153LA 3LYZA 1LZ4A 3AB6A 229LA 1OV5A 3N9EA 1B5UA 1L46A 2F2NA 1DYDA 1L09A 3OK0A 2OE7X 3B0OA 157LA 1OWZA 1CV5A 4I7QA 4CGEA 4DD9A 1XGUC 4UWNA 3RT5X 1IWUA 1LI6A 2A4TA 3GUOA 140LA 2ANVA 5HNLA 1B7NA 1OUEA 1SX2A 3WXUA 1LJFA 1JITA 4OW1A 2BQLA 1PQKA 2D91A 4EXMA 4M4OA 3SN6R 3HTGA 4J1BA 1C66A 1DYCA 1C63A 2HEDA 2BLXA 3C80A 1D6QA 142LA 2O7AA 5FCPA 5B07A 4PHIA 3FI7A 4H90A 1L64A 1ZWNA 3HT7A 3GUJA 4DKLA 1AM7A 5DN5A 4WLTA 111LA 1LJJA 3N9AA 5ILFA 2NTGA 208LA 4ETEA 1JJ0A 4ETCA 5LVHA 1QTBA 123LA 1L31A 3PBLA 4NWEA 4WM5A 3P68A 4XYYA 2RB2X 1GF3A 4DDCA 1GWDA 1L79A 1L32A 162LA 4ARPA 1IOSA 2NWDX 4AGAA 1D3FA 4LT0A 1QUGA 2EQLA 4UWUA 2LZMA 1GFVA 5KXTA 4DQ7A 5B59A 3AZ5A 5LYTA 1LJKA 1HFXA 2BQCA 1YKYX 1L06A 1CJ6A 3HBHA 4HPEA 3C8RA 4W54A 4ARQB 2Z2EA 2EKSC 2XQOA 2ZNXY 1LSMA 1CKFA 3GULA 4I7SA 1QTKA 2ZIKA 4WM3A 1JEFA 1RJCB 4ETDA 1PQDA 1L55A 4EOFA 5E4PA 2DQIY 4GN5C 1LWGA 4I7KA 149LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L24 A;  1AZF A;  1GFG A;  131L A;  1HEO A;  4WM1 A;  1L50 A;  1L76 A;  3TXJ A;  4N8Z A;  220L A;  2MEC A;  3A96 A;  250L A;  251L A;  1FLY A;  1L07 A;  5APD A;  177L A;  1YIK A;  1L81 A;  4UWV A;  135L A;  1L84 A;  1IOR A;  171L A;  1BWI A;  1WVV A;  3OE6 A;  1T8A A;  198L A;  262L A;  256L A;  3WMK A;  2BQA A;  3A91 A;  1LGW A;  1ZV5 L;  3W6F A;  2LHM A;  1LZ9 A;  1T6V L;  1GE3 A;  1L01 A;  1NHB A;  1P2R A;  1SSW A;  1D0M A;  1QUO A;  3NY9 A;  4ZPU A;  3V2W A;  2QAR C;  2QB0 B;  1P2L A;  1WTH A;  1BVK C;  5C6I A;  2DBT A;  1JTN A;  1OUA A;  1IOC A;  1JPO A;  3TXF A;  1T97 A;  1L71 A;  210L A;  1UIH A;  5FEK A;  4DJH A;  4HTK A;  5LIN A;  1KXY A;  5LAG A;  1GFJ A;  1LZS A;  1C6G A;  1W6Z A;  3WVY A;  2LZ2 A;  3OE8 A;  2RH1 A;  143L A;  247L A;  1DYA A;  2YBN A;  4G4C A;  4G9S A;  1QUH A;  1P36 A;  1IVM A;  4A7D A;  4XJG A;  2DKV A;  1L69 A;  1C6A A;  1VDQ A;  4XJF A;  3LHM A;  1JQU A;  1LSD A;  1B7M A;  4N5R A;  2RBS A;  1L11 A;  1CV0 A;  1IX0 A;  122L A;  5IEL A;  4DD1 A;  1G0K A;  2CWI A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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