4IBPA

Crystal structure of a glutathione transferase family member from pseudomonas fluorescens pf-5, target efi-900011, with bound glutathione
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
205
structure length
205
Chain Sequence
SLTLFHNPASPYVRKVMVLLHETGQLNRVALQASQLSPVAPDAALNQDNPLGKIPALRLDNGQVLYDSRVILDYLDQQHVGNPLIPRDGSARWRRLTLAALADGIMDASVLVRYELALRAPEKHWEQWLDGQRDKIRRALAVLEAEAIAELASHFDIAAISVACALGYLDFRHPDLEWRQDHPQLAAWYFEISQRPSMLATRPPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a glutathione transferase family member from Pseudomonas fluorescens Pf-5, target IFI-900011, with bound glutathione
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Pseudomonas fluorescens
molecule keywords Glutathione S-transferase-like protein YibF
total genus 67
structure length 205
sequence length 205
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4ibpA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ibpA01
4ID0A 5JCWA 2GSTA 2I4AA 1K3LA 3M9KA 2HZFA 4D73B 4ECJA 3GKXA 4FH8A 4KE3A 2MYGA 1WWJA 3IRAA 2F3MA 1E6BA 4PUFC 2R3XA 1UA5A 3KIJA 3GFKA 1TKDB 4PX1A 4AGSA 2HSMB 1SL1B 4HUAA 4L8EA 4F03A 4ZL7A 2LRCA 3NIVA 2VM1A 2GT5A 1V2AA 5A4VA 2GSSA 3E9JB 4E8HA 2MMNA 5B8BA 1GSDA 3GA4A 2KHPA 5IMFA 4DSSA 4KDUA 4GF0A 2LS5A 1FOVA 1TOFA 2VCTA 2IJYA 3F0IA 5J41A 3H79A 3DVXA 2R6KA 4BVYA 3I9V2 4O32A 4OO4A 1IYHA 4IKHA 3E3EA 2K6VA 3G7YA 2YWOA 3UMAA 4G10A 1C72A 4HQZA 2FWGA 2OADA 3EWLA 4O5RA 1XOBA 3GN3A 5D9WA 3RHBA 4K2DA 3NZNA 3GH6A 3SWLA 4IELA 5DQSA 2EIRA 2IFQB 1GTIA 4LL4B 4XIHA 2YN1A 1XWGA 1PL1A 2N5BA 1CQGA 5CAXA 4BWQA 1GNWA 1Z5YE 1TRWA 4ECIA 4JE1A 1A2JA 4HJ2A 2B5EA 3UOMA 10GSA 5E4WA 2H0IA 2LQQA 3HKRA 2R4VA 2X8GA 1LJRA 4OO5A 1GLPA 3RPPA 3KTBA 3U5RE 2WDUA 4TXOA 4EDZA 3QMXA 5IOWA 3FHKA 2YV7A 2VD0A 1S3AA 2GQKA 3J7Yk 1BEDA 4KW6A 4P3YB 4K0NA 5G2ZA 1HYUA 5B6NA 1JZDA 2V6OA 5ECHB 3KMNA 5FWGA 4PNGA 3LORA 4KUNA 1F3AA 1WE0A 3HVVA 4G0IA 1F3BA 2L5OA 6GSYA 5D9XA 2DMLA 2JSZA 1QMVA 3D0ZA 5KN2A 2O8VB 2HZEA 1OKTA 4ACSA 2IMIA 5AISA 1FVJA 1TDIA 3ZMKA 1V58A 4WBJA 1X5DA 4MK3A 1TTZA 1DE1A 1K0MA 2I9HA 2O89A 1AQXA 1T8EB 2DLXA 3R2QA 3WGXA 2L4QA 2X8CA 3F4TA 1PN9A 5JWRB 4CW9A 1U88A 4LMVA 3CXGA 4H86A 2HRKA 2B1LA 4X1UA 3M0FA 5G1LA 2YZHA 2XBIA 3ERFA 2KOKA 4MH2A 4ZL9A 2VCZA 1A2MA 4TVEA 3P90A 2GLRA 1UN2A 1R7HA 4NV2A 4AJ6A 1WJKA 2V6KA 2VM2A 1YJ6A 1WP0A 2AB6A 2PBJA 3EINA 4NAXA 5EY6A 4MJEA 1LU4A 1MDIA 2VIMA 4EL1A 2JZSA 1M2BA 2J23A 3W8SA 3KP8A 1I9DA 2AAWA 4ILFA 4G9HA 1IYIA 2KLXA 4PQ1A 4QQ7A 3QAGA 1PA3A 3GTUB 1J08A 3DEXA 4MH3A 5J9CA 2GZZA 3LG6A 4MMMA 4K6XA 5ECIB 4KH7A 2GTUA 5AIVA 4DSSB 4K7IA 1F9MA 1VF2A 1WOUA 2LJKA 3QD9A 4FYCA 1DUGA 3FKFA 1A0RP 5DAKB 3KGKA 4RQRA 1F6MC 4BVYB 1GSSA 1NM3A 2DIZA 2VL2A 3WT2A 1GUMA 2H6XA 4EO3A 1GSUA 1U6TA 1HNCA 3TUEA 1AC1A 4XHMA 2R5GA 5A5KA 1PD21 2B1KA 1VF4A 1YKCA 2H72A 2BMXA 5IO0A 3ZRDA 1A8YA 2K8SA 3KP9A 4FIWA 4TR0A 1UC7A 2HSHA 5CRWA 3DWVA 5LNKe 1O81A 3KEBA 1Q4JA 3ZREA 3LYPA 3KXOA 3TJGA 3G9BA 2H75A 3D6IA 4K0GA 17GSA 2JU5A 6GSUA 4JZQA 2YP6A 1K3OA 1DE2A 4GXZA 4RUVA 2KUCA 4Q5RA 1QUWA 1SL0B 2WB9A 3H8QA 4RI6A 3ZITA 3L9UA 1YKAA 1TI1A 1QQ2A 3A3TA 1ILOA 5IMCA 1EGRA 3IR4A 3BBYA 2DC5A 3TJKA 3GX8A 5E59A 3K8NA 5EPFA 1OKDA 3PINA 1R26A 1XOAA 4BVXA 2CZ3A 4RQXA 1HD2A 2FLSA 4MP4A 3GHAA 1K0OA 3CRUA 4EE0A 1WRYA 5HFGA 1K0NA 18GSA 3PR8A 2E0QA 4TRXA 3M1GA 1RK4A 1SL2B 3IPZA 4O92A 1M99A 2PN8A 3D21A 3FRCA 1X9WB 4EDYA 5EVOA 1XZOA 2B5YA 4HU9A 2JZRA 1GRXA 3QOUA 4POLA 5HQPA 1AQVA 3NOFA 4KCAA 3EU4A 4DVCA 3LXTA 4JRRA 3UEMA 4TR1B 3EMXA 4EF0A 1O6JA 1THXA 3VK9A 1FB6A 3HJOA 1VF1A 2GZPA 1YF1A 3WYWA 4POKA 2PVOC 7GSSA 4YAVA 4KSOA 1F37A 3GSSA 3HXSA 2XPDA 5D9VA 2DJJA 1MEKA 2OACA 4K8MA 3LSZA 2C0DA 4EUYA 3N5OA 2ZCTA 2X64A 3UVTA 3GKKA 5G31A 2M72A 4Q5NA 3P7XA 1B8XA 3EC3A 1SYRA 4XS4A 4CHSA 2MZCA 3F6DA 1OVNA 1T4YA 1V98A 3TCOA 1PGTA 3VWWA 1T1VA 1PQNA 5A4UA 4LL1B 3F4SA 5BMUA 1QGVA 1ST9A 1ZZYA 1JFUA 4V1Ap 3GKMA 4LLRA 1EOHA 2N5AA 2CQ9A 3ZTLA 3HVXA 4IS0A 1CQHA 2CAIA 1OC3A 3KCMA 1G0TA 1GUKA 5IMAA 2ES7A 3KZQA 4QL7A 4MPFA 2OE1A 2LNTA 5ID2A 3VWXA 5ECSA 1PKWA 5ECNB 1GSFA 1URMA 3Q19A 16GSA 1BAYA 1RQMA 3F63A 4WEYA 1ML6A 11GSA 1GWCA 1XPVA 2B7JA 4BWSA 5INYA 2AV4A 5AIXA 3VLNA 4G0LA 3TDGA 5IPHA 4I5QA 3WT1A 3ZFLA 2R2JA 1O73A 4HZ4A 1JLVA 3TRXA 2L6CA 1S3DA 2LSTA 2GSRA 5F8BA 4F0BA 4GRFA 1K0CA 2O85A 1FVKA 5H5QA 3WGEA 3TKSA 2CV4A 2QSIA 1TU7A 2BTOT 3C73A 1K0AA 1GUHA 2MBSA 2JL4A 4FYUA 3ERWA 2LTKA 2DSAA 2R37A 1G6YA 4N0VA 1Z6MA 3H1NA 2DJ2A 3FW2A 3VI7A 4BVXB 1AAZA 2L5LA 3BJ5A 2G2QA 2FY6A 2MMOA 2HFDA 1JLWA 3G7JA 2RLIA 2VAFA 3C7MA 3VWVA 4NPBA 3FZAA 4XRAA 1SKSB 4IGJA 4J57E 4XCSA 1ZGNA 3FZ5A 1TXXA 4PURA 6GSWA 2C0GA 2NVLA 1QK8A 4EC0A 4QL9A 2YJ7A 1ACVA 3RHCA 1OC9B 3IBHA 1T00A 2WCIA 1EEJA 3UARA 5J9BA 5GZZB 2DJ3A 4MLYA 4EVMA 1XW5A 4BL7A 1WMJA 3SBCA 4N11A 2L57A 1JZOA 2NTOA 1NHOA 2H73A 3FR6A 2CVKA 2VL9A 5J4UA 5ECKB 5COHA 2GDRA 1ZOFA 2CZ2A 2OJLA 5H5RA 5G30A 3WGDA 2YOIA 5CRGA 2KP1A 2GSQA 5ECMB 2H70A 3IAM2 1K3YA 1YEPA 5JCUA 1W89A 4HOJA 4DEJA 3IC4A 5DDLA 4HU7A 3ME7A 2MMAA 1TRUA 5IM9A 2HSYA 5AN1A 1YF0A 2LEGA 3GH9A 5G1KA 2AYTA 2H8LA 2IMEA 4I97A 4IQ1A 5IMVA 4O7HA 5CYYA 2FA8A 2MMZA 5GAND 1EOGA 3C1RA 1PMTA 1H4OA 2RUFA 4IN0A 1NW2A 1KEBA 1ZYEA 1X5CA 5IQYA 3BCKA 3I43A 3CBUA 4ZILA 3FEUA 2HI7A 3UL3A 1XCCA 1EGOA 3F4RA 5DCGA 3P8WA 2WJUA 3EURA 4L5OA 3LXZA 3DGQA 3LWAA 4ECCA 5ENUA 2IL3A 5ID2B 1B48A 8GSSA 2H6YA 4WR5A 4KNDA 3PH9A 2QGVA 1PX7A 2Z9SA 3DD3A 1FG4A 4ML6A 2NDOA 4IW9A 2DIYA 2E2GA 3P2AA 2A4VA 2D2ZA 2HSNB 3AY8A 5AGYA 1YZXA 1M7TA 2JSYA 1Z7PA 4GTUA 4MCUA 5G5FA 2H76A 5J5NA 2A2RA 4AJ7A 4WKWA 4NHWA 1VRSD 1LBKA 6GSVA 5ELGA 2I81A 3KD0A 1DSBA 4XTSA 1X5EA 1U87A 2M46A 2QKEA 2YPMA 1SKWB 2BJXA 3D22A 1QFNA 4IVFA 2DJ1A 2OE3A 4GSTA 3GUSA 1TK5B 1VF3A 3GKNA 2CVDA 4KGIA 3RDWA 4G19A 4MJCA 5HFKA 3TKSE 5DQYA 3PGTA 14GSA 3KH9A 4IP6A 4OFMA 19GSA 1SYXA 1XWKA 5DALA 4MZCA 4ZB8A 4F0CA 1TW9A 2ALBA 2H0GA 2XHFA 1M2AA 2P0GA 3VWUA 4ECBA 2ZNMA 3EMPA 3HVSA 3TJJA 3DKSA 3HZ8A 1S3CA 4V2LA 1U3IA 1BYEA 3LGCA 3ZZXA 4ZBAA 4EKZA 1QXHA 3EYTA 2VLTA 5B8AA 3TRQA 2ON5A 2H1AA 3HJMA 5F07A 4N0ZA 4BL7B 5DBQA 2X99A 4OCFA 3GRXA 4ZB6A 1GSEA 1XVWA 1YY7A 2YWNA 3ZIVA 2A2SA 4USSA 1EV9A 2C3TA 3IXRA 2PVQA 2TRXA 3RBTA 1Z6NA 1J0FA 1F2EA 1PKZA 4RI7A 3C8EA 1SJZA 1BG5A 5DJMA 1B9XC 3DVWA 1EZKA 4MF7A 4TXOB 1M9AA 1A23A 4PQHA 3M9JA 4JEDA 1HNBA 3S9FA 5CO3A 2HSMA 2DBCA 1HNAA 1XFLA 1MD3A 3FR9A 1NHYA 3PPUA 1Y6EA 1XW6A 2PGTA 3ERGA 2VL3A 1J9BA 2E2MA 2TIRA 3W6GA 5KN1A 4JBBA 4ZIJA 2H1GA 4WF4A 3IC8A 2HZEB 2HRAA 1MDKA 2G0FA 1X0RA 2V1MA 3F9UA 1SJ6A 4I6XA 6GSTA 3ED3A 1B4PA 4GLTA 4KAEA 3ZLPA 4JU5A 4PGTA 3DIEA 4MJBA 4LA1A 2WGRA 5F0GA 2FA4A 1PRXA 3BCIA 4V2MA 1KNGA 3J7Yb 4X43A 4GQCA 5B7CA 3L9VA 1ZYQB 2CT6A 4YQUA 3LEFA 4HI7A 2ZUPA 4AJ8A 1EP8A 2IFQA 2HRKB 13GSA 2C4JA 3FZ9A 3H4KA 5JWQB 2F8AA 3CSJA 2CA8A 1FHEA 5HR2A 3CSHA 3KMOA 2K18A 4MF5A 3QCPA 1EP7A 1AXDA 4ML1A 1G7OA 2HYXA 4HJMA 2LKUA 5FHIA 4K7OA 4IHUA 5HR0A 4F2IA 2K8VA 3V1WA 1RW1A 2HLSA 1O7UA 3IV4A 1XBSA 4TXVA 4PTSA 1WPIA 2L6DA 2WFCA 4KDXA 2DJ0A 2E7PA 1AQWA 4I2TA 1TK8B 2PERA 3D5JA 4GSNA 2V2GA 4OFNA 2IN3A 2RM6A 3GV1A 2UZ8A 4MF6A 2AUVA 3Q6OA 2H01A 3IK9A 5CP1A 4POMA 1SK0A 2FCHA 3R3EA 2NBSA 3Q18A 2FNOA 3G7IA 3O76A 4PQIA 4Z7XA 3VI5A 3HJPA 3EVIA 2I3YA 1XW9A 3UVHA 1M2DA 1GL8A 1ON4A 1SENA 2HRFA 3C71A 2NPBA 4V1Ag 4IP1A 2VL2C 2B6MA 1T7PB 4MZWA 4PXOA 1EEMA 6GSSA 4TKYA 3C1SA 3HYPA 1B4QA 1Y25A 2OKAA 5HR3A 3L9SA 3MSZA 3UBKA 4TR4A 3US3A 2K9FA 1GTBA 1TRSA 3HCZA 4KA0A 5FT3A 1GP1A 3HZ4A 1G7EA 2VLVA 3H93A 1OE7A 2WULA 3FYGA 4ZXGA 1ZL9A 1XWAA 2LRNA 3ZVJA 3MAKA 1VGLA 1PX6A 3E0UA 2HT9A 3ZYWA 2OBKA 2LV3A 2AJQB 2VCWA 5IO2A 1OYJA 3D4TA 1Z7RA 4E8EA 4TW5A 2I1UA 1SK2A 1R5AA 4GSSA 4NV5A 5ECLB 1USBA 1AUCA 5DVBA 2HE3A 1WIKA 1H75A 3MWHA 2FWFA 2H1DA 5IPGA 2JACA 5G5EA 4Q5QA 1SKRB 3F3RA 4F82A 3GTUA 2FWHA 1GTUA 1ERUA 4K7NA 2C3QA 2YZUA 4L5LA 3TKQA 1N8JA 3KTLA 1TRVA 4FYBA 2H6ZA 2YNXA 3LQ7A 3GL3A 4K9ZA 5CRDA 3ZL5A 1FW1A 3CRTA 4WBRD 4HDEA 4IQAA 2WRTA 3TOTA 3UJ1A 20GSA 2CX3A 4ZL8A 4HS1A 5DAKA 5C04A 4DSQA 2WZ9A 2PUKC 4KSMA 2RUEA 2X8HA 1M9BA 2PWJA 1OC8A 1A0FA 3ZFBA 3MNGA 5F06A 4WR4A 1Q98A 5CNWA 5DJLA 4I8BA 1TI3A 2C0EA 2AHEA 2WS2A 1V9WA 1ZMAA 4EXJA 2JADA 5JWOB 3F8UA 3TJFA 4AF2A 1G6WA 1GNEA 3BOAA 4NHZA 2YJHA 3ZMLA 2FHEA 5DCHA 2GGTA 1MD4A 3IOSA 2B7KA 5KN0A 1R4WA 2HQTA 3I69A 2C8UA 1K0BA 5JCGA 3QFBC 4YQMA 5GSSA 1XVQA 1SJIA 3KM6A 1NSWA 3U6VA 2HXKA 4G2EA 4XS4B 1XXUA 1XIYA 4IBPA 2C1YA 3TKPA 2GQLA 1K0DA 1GH2A 4HQSA 4NWYA 4XRDA 2XBQA 4ULXA 3IDVA 1PL2A 3IK7A 3FY7A 2LRTA 3LFLA 3ME8A 12GSA 2LUSA 3IHQA 2VUPA 5CREA 4ZBDA 1O85A 2DMMA 4OD7A 2N5FA 2JZTA 5ECQB 4MA9A 1Z9HA 1YDKA 2OE0A 1B9YC 4KX4A 3A2VA 1TJDA 2YANA 3DMLA 5IMDA 1FAAA 5B6MA 3QPMA 4KDYA 1GULA 1OE8A 3DXBA 3QFAC 1ERWA 3QDNA 1SD9A 2PU9C 3FR3A 3GMFA 1GSQA 5LD0A 2H0HA 1BJXA 3LJRA 4FQUA 3F6FA 4IJIA 4TR1A 2MBTA 3TJBA 4ZBBA 4KCEA 2EC4A 3GSTA 3GURA 3L78A 4TN8A 3L0HA 2F9SA 2LQOA 4NMUA 2FD3A 9GSSA 3GIXA 3TKSC 1T4ZA 2CVBA 2XC2A 3HDCA 4ISDA 4JR6A 3A2WA 2V41A 5CRHA 2YWIA 5GAPD 2VCQA 2YWMA 2H19A 4MDCA 1M0UA 3A2XA 3JCML 1TP9A 3HY2A 2C80A 4TR3A 3MDKA 1E2YA 2L4CA 4GQFA 1A8LA 2IWTA 2C0FA 1ZCPA 1JZWA 3IAS2 4K1FA 5HR1A 4IJ3A 5L71A 5ECRB 2REMA 1MDJA 1ERTA 2GZYA 5ECPB 1DBYA 5IOXA 2PPTA 2FWEA 3VURA 4Q5FA 2LNSA 2P5RA 1X9MB 3APOA 2HRNA 1N2AA 4OCEA 3GL5A 1V57A 1GSYA 2HNLA 4I2UA 1A24A 1BX9A 3FK8A 3APSA 2IPAA 2GS3A 2V32A 2VLUA 3GX0A 4GWRA 3O3TA 4YQVA 2P31A 2H71A 4PNFA 4FO5A 5KN3A 3DYRA 1HQOA 3UBLA 4OWYA 3VPQA 4WXTA 4XS6A 2GT6A 5H5SA 5IMZA 3HHVA 3TGZA 3QAVA 1I5GA 3QR6A 1MTCA 4G0KA 2YCDA 4MABA 4D73A 2GQMA 1SU9A 5IIZA 1XWCA 5D73A 4KB3A 4L0UA 3GNJA 4OFTA 2FUG2 2H30A 3GYKA 1T3BA 4MJAA 2GVPA 1JHBA 4POBA 1EWXA 3IE3A 3UAPA 2IIYA 3M8NA 4BPYA 3ISOA 2VO4A 1GTAA 3UIWA 1FO5A 4YAPA 2OA7A 2LJRA 2FGXA 4N30A 2B3SA 3LYKA 2IMDA 2L59A 3Q74A 1R5PA 2B5XA 3TRPA 5A4WA 2VCXA 2IMFA 5GSTA 4YH2A 2DJKA 5D96A 2CAQA 4KF9A 1PSQA 5J3RA 3BD2A 3APQA 2F8FA 5D9TA 5LCZA 3TOUA 4J2FA 1TU8A 3VFIA 1EV4A 4BA7A 1KTEA 2XPEA 4CDOA 2IMKA 1AIUA 3RPNA 3O6TA 3F3QA 3WD6A 4GCIA 3CYNA 3DRNA 1TK0B 1U3AA 3HA9A 1Z3EA 3OR5A 3CMIA 2VD1A 3L4NA 4WETA 1ERVA 1V40A 5ELAA 3CSIA 1OC9A 1GLQA 1X9SB 3I6AA 1JZRA 1YEXA 2H1BA 1THOA 1W4VA 3CTGA 1FB0A 4F9ZA 1AW9A 3ZIJA 3IA1A 4TOPA 4J56E 3KJYA 1O8WA 2VCVA 5ABRA 1BQ7A 5HFIA 6GSXA 1A2LA 3N9JA 4N10A 4PUAA 5D8IA 2EIOA 4V2NA 2ON7A 1SD8A 5D93A 2M80A 2H66A 4LMWA 2LJAA 2EIQA 3EU3A 1XWBA 2TRCP 3W8JA 2J9HA 1UVZA 2RIIA 3TKRA 2VOCA 4L0WA 4HZ2A 2CX4A 3ZVJD 1SK1A 2H74A 2PMTA 4JR4A 2KP2A 5ECOB 4MPGA 3A5WA 5EL8A 4NXIA 2F51A 3QAWA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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