4IJ3A

Oxidoreductase fragment of human qsox1 in complex with a fab fragment from an anti- human qsox1 antibody
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
b'LYSPSDPLTLLQADTVRGAVLGSRSAWAVEFFASWCGHCIAFAPTWKALAEDVKAWRPALYLAALDCAEETNSAVCRDFNIPGFPTVRFFKAFTKNGSGAVFPVAGADVQTLRERLIDALESHHDTWPPACPPLEPAKLEEIDGFFARNNEEYLALIFEKGGSYLGREVALDLSQHKGVAVRRVLNTEANVVRKFGVTDFPSCYLLFRNGSVSRVPVLMESRSFYTAYLQRLSGLTR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title An Inhibitory Antibody Blocks the First Step in the Dithiol/Disulfide Relay Mechanism of the Enzyme QSOX1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Sulfhydryl oxidase 1
source organism Homo sapiens
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
total genus 76
structure length 237
sequence length 237
ec nomenclature ec 1.8.3.2: Thiol oxidase.
pdb deposition date 2012-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
A PF18108 QSOX_Trx1 QSOX Trx-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ij3A01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ij3A02
4MABA 4F82A 4ZBDA 5DAKB 2H0IA 3S9FA 5JCGA 2LJRA 3FR3A 1PKWA 4K0NA 2IFQB 5HR1A 3UMAA 5IOWA 4WR4A 4EO3A 2HYXA 4OFNA 2H75A 2YCDA 2AHEA 5C04A 1TRWA 4DSSA 2H1GA 1OKDA 1ZGNA 1GSYA 2H30A 2RLIA 3L9UA 3VI7A 2HFDA 4Q5NA 1WMJA 1Z6MA 3GKMA 4GQFA 3O3TA 4EKZA 3P7XA 5KN1A 4GWRA 2H0GA 3EMXA 3TRPA 3TJJA 5KEJA 3UOMA 4HS1A 4L0WA 3IK7A 1XVWA 3ZMLA 5B8AA 2KP2A 4ZB9A 2A4VA 1QK8A 1B4QA 4HZ2A 2K8SA 3VWVA 3M8NA 2GT6A 4ACSA 5DJMA 3WT2A 1JZOA 3MDKA 1GH2A 4ML1A 3L0HA 4IELA 2I9HA 2M46A 2F3MA 1ERTA 4V2NA 2LNSA 4YQVA 4QL9A 2FD3A 4G2EA 4PXOA 3EU3A 1LBKA 2PVOC 2QGVA 2C80A 4GLTA 4ULXA 1WPIA 4ECCA 4FIWA 4KSMA 2J23A 1VGLA 4OFTA 5G5EA 3QAWA 1GUKA 4N30A 2B1KA 2XC2A 1F3AA 2C0EA 2RUFA 4CHSA 3QFBC 1HQOA 4IP6A 4TR4A 5IO2A 3UVHA 4NHWA 2GSSA 4LLRA 4IHUA 1PL2A 2J9HA 1PX7A 4TKYA 3TJKA 4HZ4A 3KTBA 2FWHA 2PVQA 3A5WA 2TRXA 3FEUA 2CT6A 1O8XA 4N10A 4GSTA 3KTLA 4GF0A 2B6MA 8GSSA 3RAZA 3RPNA 1JHBA 4LMVA 1T4YA 2B5EA 1Z6NA 4DEJA 3TCOA 3TKPA 4P3YB 2DJ1A 2P5RA 2HE3A 3KP8A 1SK0A 3DVWA 3F8UA 4IKHA 1VF3A 2YWIA 3DXBA 3IHQA 2C3QA 3LFLA 1ZCPA 1SJIA 3CXGA 1GUMA 1SD9A 5FHIA 1A2MA 1THXA 1PA3A 1T1VA 2CVDA 5ABRA 4XRDA 3KXOA 1WE0A 2I1UA 4FYBA 2MBTA 4IBPA 4KDUA 5DQSA 2GDRA 3HXSA 1QFNA 4I2UA 5CP1A 2G0FA 5CRDA 2F51A 3KH9A 3TB2A 1T7PB 2H70A 3WD6A 5ECNB 3QAVA 1UA5A 2HZEB 3UARA 4NMUA 3APSA 4POKA 3VLNA 2JU5A 1DUGA 4GRFA 2GZYA 3LEFA 1TOFA 1XZOA 3WGEA 3K8NA 2YP6A 1XW9A 1M99A 2IMKA 4MF7A 4XCSA 5IO0A 1YKCA 2O89A 5KN0A 2XPDA 2IMDA 3IA1A 1M9BA 1W4VA 4V2LA 4TXVA 5D9TA 3GH9A 2CVKA 5ECIB 2L59A 4XS6A 3GKNA 4XS4B 2V2GA 2YZHA 4RI6A 2FWFA 1SU9A 1GTIA 5GZZB 2O7KA 1OE8A 2DJ2A 2AYTA 1EEMA 3HA9A 3LXTA 1JZRA 2B7JA 1K0AA 4NV5A 3NIVA 4I6XA 5ECKB 3IBHA 16GSA 4IW9A 3HDCA 2L6DA 4QQ7A 1EV4A 3HJMA 3HD5A 3ZIJA 3F3RA 1KEBA 3ME8A 3N9JA 2V32A 1O7UA 3E3EA 4E8HA 1OYJA 1PD21 3CRUA 3HYPA 1ZZYA 5ECQB 2JZRA 4V1Ag 1PMTA 3I43A 4KNDA 4KUNA 2LQOA 1OVNA 2OACA 1WP0A 3NOFA 5ECHB 1HNCA 4EDZA 3LGCA 1C72A 4XS1A 3HKRA 1V98A 2OE3A 4E8EA 1R5PA 1CQGA 2VIMA 3P8WA 5IMVA 4TR3A 4KCAA 3KM6A 4EL1A 1OE7A 3TRXA 3ME7A 4JZQA 1SJZA 1R4WA 4JU5A 4WBJA 4XIHA 4GTUA 2I4AA 1B4PA 4MF6A 3FW2A 3TOUA 3A2WA 3BOAA 2MZCA 2AB6A 3P90A 2CAIA 1K0DA 4BVXA 2WCIA 2VL2A 1GTBA 3H4KA 3M3MA 1GUHA 3O6TA 5D9XA 1WJKA 1GTAA 4KW6A 4NAXA 1XVQA 4ECJA 2OJLA 1GRXA 1M2AA 1O6JA 3RBTA 1YDKA 2K18A 2JADA 1J08A 2WRTA 3ZREA 2AJQB 2DMMA 1EZKA 2GSQA 2X8CA 2HZFA 5CYYA 2C0DA 1U6TA 1Z5YE 3TKQA 1WRYA 1DE2A 2VCVA 1AAZA 3ERGA 2R3XA 3O76A 1M9AA 1OC9B 4MP4A 3N5OA 4QL7A 5IM9A 2H6ZA 3DVXA 5ECLB 1ERUA 5ELGA 1V40A 2TRCP 1X5CA 4GSSA 3IDVA 5HFIA 4MJEA 5IMAA 5JWOB 3D5JA 3W8SA 13GSA 1X0RA 4TR1B 1X5DA 3F4SA 2IPAA 1B48A 2YWOA 5ENUA 2I3YA 4OMVA 3UBLA 2GSTA 4ECIA 1A2JA 3ISOA 2VCTA 4FH8A 2LNTA 3QCPA 4MJBA 2RM6A 4HOJA 1JLWA 2C4JA 4JR4A 2R5GA 3IK9A 2XBIA 5G1LA 1SK2A 4MZWA 4G10A 1XBSA 1M2BA 2CZ3A 1ZMAA 1AC1A 3GUSA 3LORA 4TR0A 2PGTA 3CRTA 2F8AA 3GX0A 3D0ZA 2R4VA 1SYXA 4TRXA 1Q4JA 3Q6OA 3UJ1A 1H75A 5DAKA 1TK0B 1KBNA 2JSYA 2HRFA 2OE0A 1VRSD 14GSA 1BAYA 4GQCA 2VCWA 1SKWB 4TN8A 2L57A 4O32A 3AY8A 5DALB 4BVYA 2XBQA 2GS3A 2YOIA 4L5LA 5DBQA 5ECOB 5A4UA 1TU7A 4MJAA 1EOHA 5GAND 3F3QA 2G2QA 3RDWA 5B6NA 17GSA 2AV4A 3I69A 2H74A 3HZ4A 2RIIA 2B5YA 2YWNA 3G7IA 3HY2A 3GSSA 1SD8A 3H8QA 1JFUA 4HU9A 4MMMA 4EE0A 1GLQA 1X9WB 1AXDA 2O87A 4WF5A 3CSHA 5LNKe 2ZNMA 5INYA 3G7JA 2H72A 5B8BA 1Z7RA 5HFGA 4K2DA 3G7YA 1X9SB 1F6MC 1ZL9A 2MMOA 2DLXA 3PH9A 5IMFA 5IMDA 2H1DA 3KZQA 2DIZA 5AISA 3HJPA 5HFKA 5F8BA 5IPHA 5AIXA 3C7MA 3MAKA 4O92A 2PERA 3C71A 5H5QA 3F6FA 4ZBBA 1J9BA 3L78A 6GSTA 1TRVA 2FHEA 1F2EA 3CSJA 1HYUA 2HNLA 3FR6A 3GYKA 1KNGA 5FWGA 3UBKA 1ERWA 3BCKA 4K8MA 5IQYA 5IIZA 2IMFA 3GL5A 4MPFA 1W89A 3U5RE 5D93A 1MDJA 2DIYA 2GTUA 1GP1A 4X0XA 3F4RA 3C1RA 3C1SA 3GURA 2VOCA 2F8FA 5AN1A 2VAFA 1DBYA 4AJ6A 4OCFA 1A8YA 4ML6A 2VCZA 1U3AA 2MYGA 3ZRDA 5CAXA 3A3TA 3DEXA 4WETA 4ZL9A 4AJ7A 4L0UA 1M2DA 5C00A 1K0BA 1O81A 3F0IA 2WFCA 1TI3A 2CA8A 4HDEA 4HJMA 1DE1A 2LRCA 5J9BA 1BQ7A 1YJ6A 2ES7A 2OA7A 5JCWA 3D4TA 3FKFA 2K9FA 1MD3A 3QFAC 1JZWA 4MCUA 2LSTA 3ZTLA 5ECSA 2HI7A 2YV9A 4HUAA 3UL3A 1WWJA 2EIQA 3D22A 5HR0A 1PL1A 4DVCA 3L9SA 2VL9A 2IIYA 2V41A 1MD4A 3BCIA 2ZCTA 3CTFA 4PNFA 3ZZXA 4LMWA 5D73A 3Q19A 2VUPA 2GLRA 3ZFBA 1ML6A 4G9HA 1XFLA 2H6XA 2RM5A 2DJ3A 1XIYA 3VWXA 3FZ4A 4ISDA 1K0MA 5F06A 3HVXA 1XCCA 1TRSA 5E4WA 2KUCA 1GL8A 1J0FA 1FVJA 3GNJA 3J7Yb 3OR5A 3HHVA 2L4CA 2VL3A 1PSQA 2HZEA 1ACVA 2GQKA 1MDKA 1N2AA 6GSXA 1AW9A 5G31A 4Q5RA 4TVEA 4IGJA 2H01A 4IJIA 4JR6A 3Q74A 1QXHA 1Q98A 2OE1A 3Q18A 2B5XA 2HSYA 4HI7A 2NVLA 2C3NA 1F3BA 3DYRA 2VLUA 1AUCA 1XOAA 4K7NA 3VFIA 2V1MA 3TJFA 1M0UA 3RHCA 5GSTA 1GSQA 1GULA 1VF2A 2YN1A 2OBIA 1B8XA 4EDYA 4OWYA 1JZDA 2E2MA 2HLSA 4K6XA 1FO5A 4XS4A 1ERVA 3ZFLA 5J5NA 4DSRA 4IQAA 3EINA 4WXTA 2M80A 5J41A 1QUWA 4MZCA 1PN9A 1Y6EA 3CBUA 1R5AA 2FWGA 1BYEA 1ILOA 2LKUA 2A2SA 4TXOA 2HT9A 3FZAA 2PN8A 3PINA 1XPVA 3WGXA 4ZIJA 2NPBA 1ABAA 1V9WA 1E6BA 3IPZA 3EVIA 3GSTA 1F37A 6GSVA 4RUVA 3D4MA 1DSBA 3TKRA 4TXOB 2P31A 5CRGA 3KMOA 4NV2A 1V58A 3ZYWA 3EE2A 1SL0B 1OC8A 3DIEA 4J56E 2LRNA 3IXRA 3KH7A 3DMLA 2VM1A 4LL1B 2N5AA 2PMTA 2ON7A 1RK4A 1R7HA 2H8LA 4EXJA 3L9VA 1TRUA 1SENA 5COHA 1GSEA 2PUKC 3CMIA 4BL7A 4ZXGA 3A2XA 5ECPB 4AGSA 4XTSA 5D96A 2EC4A 1KTEA 5IMZA 3V1WA 5EL8A 4EC0A 4CDOA 4Z7XA 1XXUA 2GQMA 1GNWA 1WIKA 4BWSA 1A0RP 5JWQB 3DRNA 1T4ZA 1XWCA 2CX3A 2YWMA 4F03A 3GRXA 3M1GA 2KLXA 4YAVA 1B9XC 3TGZA 4N0ZA 4XHMA 4RI7A 2DSAA 2MMNA 2WULA 5ECRB 4XRAA 3WYWA 1EGOA 4BPYA 1YF1A 2FA8A 2WZ9A 2B7KA 4FO5A 5AIVA 4BA7A 4MK3A 2IJYA 2H76A 1SJ6A 4K7IA 4KGIA 4J57E 1UC7A 2MBSA 3VWUA 2D2ZA 4IQ1A 1XWKA 2M72A 2L5LA 1TDIA 2CX4A 3C73A 3TOTA 2PPTA 2DJJA 2MMAA 5ID2B 3F4TA 3L4NA 1B9YC 4JE1A 4K7OA 2VCXA 1ST9A 6GSSA 3TKSC 5A4VA 2K6VA 2B3SA 1A0FA 1U87A 3H1NA 1OC9A 3I9V2 2X99A 1H4OA 2BTOT 1LU4A 5L71A 1TXXA 1OKTA 3FZ5A 3PGTA 1I5GA 2L5OA 1A24A 5A4WA 2JZTA 5J4UA 3FHKA 2H1BA 3MNGA 1MTCA 4I5QA 5DCGA 4TR1A 1BG5A 4K9ZA 3JCML 7GSSA 3LXZA 2I81A 2IN3A 5G5FA 6GSWA 3KD0A 2QC7A 2HXKA 2YANA 3DKSA 1U88A 4NHZA 3VPTA 3VURA 2VD0A 4N0VA 1A23A 1NW2A 2QSIA 3SBCA 1K3YA 2JSZA 2LV3A 3APQA 1MDIA 2FGXA 3IV4A 4X43A 3F6DA 4N11A 3APOA 3GTUB 4NWYA 2PU9C 3TKSE 3KCMA 4CW9A 3US3A 3MSZA 4KB3A 4V1Ap 3ZVJD 1K0OA 3IE3A 1FOVA 4WEYA 1Z9HA 2FA4A 1YZXA 2VO4A 3EYTA 1PX6A 4ZB6A 5CO3A 2XHFA 2YV7A 1SKSB 1K0NA 3GHAA 2EIRA 3GV1A 2OBKA 1TU8A 3LG6A 2H0HA 2OKAA 4PUAA 2VM2A 3WGDA 4HQSA 3UAPA 4WBRD 2OADA 4MLYA 5DALA 9GSSA 2FLSA 2FUG2 4FYUA 2E7PA 3BJ5A 1PQNA 2L4QA 4X1UA 3GKKA 5CREA 1XWBA 3GH6A 2LJKA 2B1LA 4L8EA 4PNGA 3FRCA 4F0BA 1RQMA 1HD2A 10GSA 3P2AA 2GZZA 1BEDA 4ZL8A 4KSOA 3KP9A 4WF4A 3G9BA 1FVKA 3LWAA 3EC3A 11GSA 2YJ7A 4O7HA 3J7Yk 4J2FA 1OC3A 1VF4A 1IYIA 1XW5A 3UVTA 3VK9A 4MJCA 4ZILA 2KP1A 3KGKA 1G7EA 1TK5B 5FT3A 3R2QA 1PGTA 1Z3EA 3IAM2 2BJXA 3ERWA 2IWTA 4D73A 1URMA 5F07A 1GTUA 2PBJA 4ILFA 2L6CA 3W6GA 4ZBAA 1QMVA 12GSA 2E0QA 3VI5A 1EP7A 4PX1A 6GSUA 3IC4A 4DSSB 5G2ZA 1S3AA 5A5KA 3W8JA 4H86A 4MH3A 4D73B 2LQQA 4GCIA 22GSA 5JWRB 1FB6A 4YQMA 2ALBA 2GVPA 3HVVA 2AAWA 4WKWA 5GAPD 3M0FA 2C0GA 2HSHA 3FR9A 1TTZA 2GSRA 2C0FA 1U3IA 2JL4A 4YAPA 4POBA 3FYGA 5J9CA 2JACA 4MPGA 3UEMA 1TJDA 2FY6A 4KCEA 4BWQA 3GMFA 4KH7A 1XOBA 1K3LA 3TJGA 3GKXA 1ZOFA 1PKZA 2XPEA 2NTOA 2X8GA 4ID0A 3MWHA 3CSIA 3E9JB 1G7OA 5KN3A 3QR6A 1Z7PA 4MH2A 5CNWA 2YPMA 3FZ9A 4MF5A 5DQYA 1TK8B 1XWGA 3KIJA 4G19A 1YEXA 1ZYQB 3RPPA 1R26A 1EV9A 4AF2A 5KN2A 4EF0A 4PGTA 1K3OA 2WB9A 4KA0A 2HRNA 3EMPA 2GGTA 1YY7A 4YQUA 4K1FA 4F9ZA 1ON4A 2K8VA 4EUYA 3RHBA 5D9VA 1FW1A 1AIUA 3VPQA 3F63A 2N5FA 4O5RA 3IAS2 3LSZA 2WS2A 1VF1A 5GSSA 3GFKA 1SL2B 3FK8A 4WR5A 5AGYA 3GIXA 3KMNA 1EEJA 1EGRA 4OFMA 1G6YA 1AQVA 1X9MB 1FB0A 3HVSA 5D8IA 1NHYA 4PQHA 5LD0A 2FNOA 2H71A 2H1AA 1ZYEA 3LQ7A 2NDOA 5G30A 1SL1B 1QQ2A 2CQ9A 6GSYA 1AQXA 1N8JA 5G1KA 1SK1A 5J3RA 2EIOA 3ED3A 1SKRB 2H19A 5IPGA 2KHPA 3GA4A 1XW6A 19GSA 2DBCA 3KEBA 3M9KA 4HJ2A 2C3TA 4F0CA 4L5OA 2V6KA 5CRHA 1G0TA 3A2VA 2GQLA 4HU7A 1EP8A 2VLTA 18GSA 3EU4A 1LJRA 1HNAA 3QPMA 3SWLA 1FG4A 3ZLPA 4EVMA 4IP1A 1GSSA 1A8LA 3LJRA 4FYCA 5D9WA 2P0GA 2IL3A 5F05A 3E0UA 1YKAA 4IJ3A 2GT5A 3EWLA 3TDGA 1GSUA 2YNXA 2DMLA 3HJOA 2CV4A 3C8EA 1QGVA 4RQXA 2H66A 4NXIA 1V2AA 2LJAA 4MDCA 3LYPA 3M9JA 2LTKA 3QD9A 4POMA 5EPFA 1S3DA 4I97A 5JCUA 4F2IA 1BJXA 1RW1A 1G6WA 3TUEA 4OCEA 4OD7A 5CRWA 2PWJA 2CZ2A 4RQRA 1UN2A 2VD1A 1GWCA 4ZB8A 1X5EA 2FCHA 4KE3A 4MA9A 5B6MA 2VL2C 4IS0A 4GXZA 2H6YA 1XWAA 3ZIVA 3ZL5A 5EY6A 2C8UA 3VWWA 2MMZA 3GN3A 5EVOA 2X8HA 1I9DA 1YEPA 4OO5A 2AUVA 4PUFC 2O8VB 3D21A 3DD3A 4TW5A 3UIWA 1O85A 1Y25A 2IMIA 4MZBA 2N5BA 1TP9A 2WGRA 2LUSA 3GL3A 5E59A 4PQ1A 2Z9SA 4KDXA 5DJLA 2VCQA 3IRAA 3KJYA 4V2MA 3U6VA 2YZUA 3BD2A 1NSWA 1IYHA 1PRXA 2QKEA 3HCZA 1CQHA 3GX8A 3ZVJA 3QDNA 1UVZA 2LRTA 2ON5A 4NPBA 5B7CA 1E2YA 1GSFA 5ID2A 3CYNA 5IOXA 2DC5A 2RUEA 4AJ8A 5LCZA 2F9SA 2FWEA 4YH2A 2P5QA 3ERFA 1V57A 5DDLA 4LA1A 4KAEA 3H79A 2A2RA 1AQWA 1TI1A 1T8EB 3H93A 5IMCA 2DJ0A 4IN0A 1BX9A 3F9UA 1MEKA 3QOUA 4Q5QA 4Q5FA 2VLVA 2ZUPA 1S3CA 2LS5A 4GSNA 4JRRA 2E2GA 2YJHA 1GLPA 1SYRA 1NM3A 4I2TA 2TIRA 5H5SA 4PURA 1TKDB 1USBA 2R2JA 4K0GA 2R37A 2LEGA 2O85A 2V6OA 2BMXA 4JEDA 5F0GA 5HR2A 4I8BA 5HQPA 4LL4B 3GTUA 1JLVA 1K0CA 1GSDA 4PQIA 1NHOA 3HZ8A 1GNEA 3ZITA 2CVBA 1YF0A 1THOA 1O8WA 3DWVA 1YQ1A 5H5RA 3WT1A 4DSQA 1FHEA 2C1YA 1O73A 1HNBA 3EURA 3PR8A 1TW9A 2CAQA 4JBBA 4KDYA 4IVFA 3DGQA 1EWXA 4POLA 20GSA 3D6IA 1EOGA 3LYKA 3BBYA 5DVBA 3QMXA 2IMEA 5HR3A 3IOSA 2JZSA 2H73A 2R6KA 3QAGA 3ZMKA 2X64A 3FY7A 1T00A 3CTGA 2REMA 3NZNA 2WJUA 4HQZA 5ECMB 2DJKA 1M7TA 3TRQA 1FAAA 4HEA2 1F9MA 2KOKA 3TKSA 3TJBA 2GZPA 1A2LA 4ZL7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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