4IN0A

Crystal structure of human splicing factor dim2/txnl4b
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
141
structure length
141
Chain Sequence
SFLLPKLTSKKEVDQAIKSTAEKVLVLRFGRDEDPVCLQLDDILSKTSSDLSKMAAIYLVDVDQTAVYTQYFDISYIPSTVFFFNGQHMKVDYGSPDHTKFVGSFKTKQDFIDLIEVIYRGAMRGKLIVQSPIDPKNIPKY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Thioredoxin-like protein 4B
publication title High-resolution crystal structure of human Dim2/TXNL4B.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Splicing
total genus 45
structure length 141
sequence length 141
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02966 DIM1 Mitosis protein DIM1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4in0A00
3BCIA 3F4RA 3FK8A 4WETA 1BG5A 4LMVA 1A23A 1W89A 2MZCA 5HFIA 5ECQB 1VF2A 2JADA 1EZKA 1GTAA 4FIWA 2LUSA 3F6DA 2N5FA 2L6CA 3VWWA 1SJZA 3ERWA 2FCHA 5ELAA 1EOHA 3IR4A 3PINA 1XWGA 1M99A 4JEDA 3TRXA 1K0BA 1O7UA 2E0QA 3DD3A 3EVIA 2IMIA 2WFCA 4P3YB 3C8EA 4K7IA 2OJLA 1ZYEA 2ES7A 3UVHA 4HI7A 2K8VA 3BOAA 3EURA 4TOPA 3Q19A 4L5LA 2AV4A 4YH2A 4JRRA 2CA8A 2P5QA 1TW9A 2WJUA 1WJKA 2H19A 2QSIA 17GSA 5DAKA 1I9DA 3C1SA 4MF6A 1RW1A 5DDLA 4F03A 3H1NA 4BVXA 4CW9A 2FA8A 4GSSA 5G5EA 1IYIA 2M72A 1K3OA 1PX6A 4ECIA 2MMZA 1XOBA 4N0VA 2VO4A 1NHYA 3LGCA 2PUKC 4ECJA 3GL3A 2PERA 5LCZA 1AC1A 2CVKA 4YQVA 3ZIVA 3ZMKA 3MNGA 2HT9A 4OCEA 1FO5A 5F8BA 5AIVA 3HA9A 4NMUA 13GSA 5ECIB 4OCFA 1Z9HA 2L4QA 5G5FA 1Z6NA 1I5GA 3MWHA 5ECHB 3DXBA 1GSUA 1SK2A 2PVQA 4XS1A 1AQWA 22GSA 5D96A 3ME8A 4BWSA 1XIYA 3TOTA 2AYTA 4OFTA 1YZXA 3US3A 4IGJA 3UL3A 7GSSA 3QOUA 2JZRA 1SU9A 5A4UA 2H6ZA 1UC7A 3TKSE 1PD21 3CYNA 2WRTA 5KN0A 14GSA 5D93A 2L6DA 4MZCA 2DJJA 3FR6A 2IMKA 2HZFA 2CT6A 1XFLA 2H1GA 5HR2A 3EU3A 4EE0A 2R3XA 4G19A 5CRWA 4ECBA 4L0WA 4EUYA 3CXGA 1MEKA 4BPYA 5ABRA 12GSA 5CYYA 2O89A 2B1LA 2VD0A 2M80A 4F2IA 3F4SA 4KSOA 4GF0A 4KSMA 1XWKA 1HD2A 3TB2A 3KD0A 2LRCA 3ERFA 5DAKB 4MDCA 6GSXA 3CSIA 1USBA 4KX4A 5B8BA 1FHEA 1OE7A 2WB9A 1ZL9A 4DVCA 1UA5A 1BEDA 1F3AA 5IMAA 1F6MC 4NAXA 2VD1A 4ZIJA 2KP1A 1G6WA 3CRTA 4I5QA 1ACVA 2WCIA 1KNGA 3EWLA 1PL2A 3APSA 3H8QA 1VRSD 2IPAA 4I97A 4KCEA 2RLIA 2AUVA 3D21A 3AY8A 1Z7RA 2ON7A 3LSZA 4LLRA 1AQVA 4D73A 1TRUA 3R2QA 4LL4B 2RUFA 1WWJA 3LQ7A 1O85A 3WD6A 3HHVA 1AQXA 4JE1A 2N5BA 1TJDA 1WP0A 2DSAA 2TRCP 1TDIA 4HJ2A 3DIEA 4OWYA 3APOA 1B48A 3ZMLA 2B7KA 2LQOA 5LNKe 3CBUA 1O8XA 2VCXA 3GUSA 2V2GA 5G31A 2H72A 5L71A 4WBJA 3F9UA 2I4AA 4EO3A 3NIVA 2C0FA 2KLXA 2V6KA 1HNBA 2FHEA 1X5DA 1UN2A 3Q6OA 2VCVA 4Q5NA 2FWHA 3TJFA 2XPDA 1Z5YE 3FZ5A 3VFIA 3BJ5A 4ZL9A 2K9FA 5D9WA 5E4WA 2O87A 3M0FA 3LG6A 3WGDA 4G9HA 1M7TA 1RK4A 2YN1A 4IW9A 1BYEA 4J2FA 3CSHA 3GTUA 3L78A 3GMFA 4MJEA 4AJ6A 2L5OA 1GNEA 3QMXA 16GSA 6GSWA 4HOJA 1EP7A 1B4QA 2DMMA 5E59A 4AJ7A 3Q18A 2GS3A 2PWJA 4PX1A 4K0GA 2J9HA 1VF3A 4KDUA 2H0HA 2K8SA 1U87A 3Q74A 4GWRA 2CX3A 4DSQA 2R5GA 3ZL5A 5D9XA 5A4VA 4D73B 4BA7A 3FEUA 1A8LA 2AHEA 4HQZA 4PQHA 3KGKA 4L0UA 2MBTA 2YJHA 2G0FA 2B7JA 2ON5A 1GL8A 4TR1A 1N2AA 5ELGA 4HU9A 2FWGA 3HCZA 4F82A 5JCGA 5D73A 4TKYA 4N11A 2OBIA 3FY7A 3IC4A 4MZWA 2O85A 3IRAA 4KNDA 2PGTA 1FW1A 1U6TA 3VI7A 1EEMA 2X64A 5EVOA 3ZITA 5KEJA 2NPBA 1ZOFA 2H70A 3HYPA 4X43A 4K9ZA 1YY7A 3TUEA 4K0NA 1QMVA 4TR0A 4ID0A 4GCIA 4QL7A 4MH3A 3VPTA 4PXOA 3L9SA 4V1Ap 4YQMA 1GUHA 2PBJA 4BL7A 1SKWB 2H0GA 1G7EA 4IS0A 1GTIA 1PGTA 1S3CA 2AJQB 1YDKA 4ZBBA 3F63A 4HUAA 1MD3A 2DJKA 1GP1A 3GTUB 1GSDA 4MK3A 3GIXA 3EMXA 2QGVA 1QGVA 3F0IA 2VL2A 3W8JA 1SK1A 4ISDA 3H93A 1ERUA 2CX4A 3IHQA 1FAAA 4MLYA 4KH7A 3DKSA 2WGRA 5J4UA 5IOXA 2A4VA 3M9JA 5J5NA 3UMAA 1S3DA 5IM9A 4GXZA 6GSTA 3ZFLA 1DE1A 2OKAA 1XWCA 4ZB8A 1BX9A 3QDNA 1T00A 3O3TA 2WZ9A 1V58A 5H5SA 4EVMA 1Q98A 2VL2C 4FO5A 4Z7XA 3UEMA 5COHA 3IPZA 3CRUA 1A24A 4EC0A 1H75A 2FLSA 2FGXA 5DVBA 2GQMA 1K0AA 4TR1B 3O76A 1QFNA 3LWAA 5FWGA 1A8YA 4DEJA 4X0XA 3QAGA 2NBSA 4XCSA 3FZ9A 3U6VA 4MJAA 2X8CA 3KTBA 3QFAC 1GH2A 1GSEA 2C3QA 1BAYA 2VL3A 1WIKA 2VM2A 3HZ8A 2VCZA 5IMCA 5JWRB 1EP8A 2GT5A 3RAZA 3TJJA 3L4NA 3SWLA 2XPEA 5EPFA 2YZHA 4YAVA 2NDOA 5CAXA 5JCUA 3P90A 4Q5QA 1OC3A 1MDIA 5G1LA 2C3NA 2E2MA 3I43A 2VLUA 1URMA 4V1Ag 5ID2A 3HVXA 1ML6A 4PGTA 4O92A 2H1AA 3TDGA 3FZAA 2DLXA 2N5AA 2DIZA 3GH9A 4IVFA 2LS5A 1ZYQB 1H4OA 2V1MA 1EGOA 1XXUA 4YQUA 1SK0A 3C71A 1TRWA 4ZL8A 3VPQA 2LJKA 1U3AA 2BTOT 1JZWA 5AN1A 4ML6A 2VCQA 4WR4A 3HY2A 2FUG2 1GLQA 1EEJA 3D4MA 2PVOC 4MZBA 1V57A 1TU8A 4TW5A 3LYKA 2GDRA 1T7PB 1PQNA 1WRYA 3N9JA 1V98A 3IK7A 1PRXA 3HDCA 1SYXA 1MTCA 1ZZYA 3P8WA 3RPPA 1JZDA 2L59A 2XC2A 4ZILA 2G2QA 4PNFA 4WBRD 2YPMA 3FRCA 1TK8B 1GSQA 1CQGA 1TP9A 2JL4A 2HRFA 2B3SA 2GSTA 1ST9A 2WULA 2YCDA 1GUMA 2LTKA 2VOCA 2KP2A 3I69A 2VLTA 1PX7A 1ABAA 4QQ7A 3VWUA 4I2TA 3KXOA 4ULXA 2H66A 3M1GA 2GSRA 4RQXA 2E7PA 4NXIA 3IV4A 1B4PA 5IMDA 1IYHA 4POKA 2IN3A 3KIJA 3UOMA 1OC9A 3UBLA 11GSA 4CDOA 2MMNA 1J08A 1LU4A 2YWOA 3F3QA 1ZCPA 5DCHA 3QFBC 2PN8A 4LL1B 2VIMA 2FY6A 4ECCA 1SKSB 5ID2B 4IP1A 4FYCA 9GSSA 4TR3A 3DMLA 1Z7PA 4KDXA 3WGXA 1JZRA 1QQ2A 2ZNMA 3F4TA 4WKWA 5HR0A 1T4ZA 3IDVA 1ILOA 4MABA 2I3YA 1BJXA 1HQOA 1XVQA 2LRNA 5JCWA 4KA0A 3GX8A 2P5RA 5H5RA 3FYGA 4ZB9A 5INYA 2LNSA 2TRXA 2X8HA 5KN3A 1M2BA 3FR9A 3TKPA 2LEGA 3M3MA 4AGSA 4I6XA 1T3BA 1KBNA 3KP9A 1PA3A 3EE2A 2LRTA 4NWYA 2JSZA 4K1FA 1TXXA 2GZZA 1TTZA 5CRDA 2BMXA 5B8AA 1Z6MA 2OACA 1ON4A 2HNLA 1R4WA 20GSA 5G30A 3DVXA 1M9BA 1XPVA 5DJMA 2B5EA 1SKRB 1XW9A 4GLTA 1GTUA 1R5AA 5IMZA 1E6BA 3HKRA 5H5QA 1WOUA 1O81A 3WYWA 4KW6A 2ZCTA 3EU4A 1Q4JA 1AXDA 3ISOA 3HD5A 4I8BA 2OADA 2H01A 4XHMA 1FVKA 1XBSA 3ZTLA 4E8EA 3QD9A 3D22A 2VCTA 2YWIA 2LJAA 4V2MA 1X0RA 2D2ZA 5A4WA 2C4JA 1PL1A 2LQQA 3A2WA 4MA9A 1ERWA 1OC9B 2NTOA 2CAIA 3GSSA 3VWXA 2HRNA 1J9BA 4NV5A 5ECRB 2CVBA 5FT3A 1CQHA 1QUWA 2YV7A 4X1UA 2L57A 4EDZA 4XS6A 3CMIA 4PNGA 3RDWA 1JLWA 4O32A 3NZNA 3FW2A 2K18A 2B5XA 2VL9A 3IAM2 4WF4A 4JBBA 5IO2A 2B6MA 4JR6A 1HNCA 4G10A 1B9XC 4FYBA 5KN1A 3FZ4A 4HZ4A 3KP8A 4TXOA 1OYJA 3KEBA 1A2MA 4HDEA 2B5YA 5DALA 2FWEA 2GT6A 4BVYA 1JZOA 3IAS2 2GZPA 2YANA 1PN9A 2JU5A 5CO3A 4N0ZA 4PURA 4IQ1A 1A2JA 5HR3A 1J0FA 2LJRA 1F37A 3D6IA 4NPBA 2PU9C 5GZZB 1R26A 1C72A 5HR1A 1VF1A 2HXKA 1K0CA 3IA1A 1ZGNA 2K6VA 2R6KA 3DVWA 4OFMA 2IMEA 5IMFA 1Y25A 4H86A 2R4VA 3KH9A 4QL9A 3V1WA 5EL8A 2EIQA 3KJYA 5J9BA 1HYUA 1GSSA 4RUVA 4HJMA 4F0BA 5ECNB 2H0IA 3J7Yk 3GKKA 3LEFA 3E3EA 5IIZA 2R2JA 1TRSA 3QCPA 1K3LA 4N30A 3ZIJA 4KUNA 4KE3A 2F3MA 3TGZA 3KMOA 1G7OA 3LJRA 1YF1A 1EOGA 4TVEA 1U3IA 6GSSA 1BQ7A 2V6OA 1YF0A 4I2UA 2FNOA 1DSBA 4K8MA 3L9VA 2FD3A 1AIUA 4JR4A 4YAPA 1X9WB 5HFKA 2H71A 3VI5A 1GSFA 4TXOB 4RI6A 4WEYA 3ZVJD 5ECMB 1DE2A 5C04A 6GSUA 2VCWA 1VGLA 3KMNA 3M9KA 1XVWA 2OE1A 3UVTA 1XWAA 4OO4A 5DALB 3RPNA 4KGIA 2YZUA 1PSQA 3GURA 2F51A 4DSSA 3WT2A 2GSQA 3LYPA 4O7HA 4OFNA 4HU7A 5DBQA 3GKMA 3GV1A 5D9TA 4EF0A 3CTGA 3UJ1A 4XS4A 1NW2A 1E2YA 3G7IA 3UIWA 10GSA 3VURA 5J3RA 1JFUA 1PKZA 4F0CA 5HFGA 1XWBA 3GFKA 2ALBA 4JU5A 1K0NA 3W8SA 3KM6A 4MJCA 1MD4A 2C80A 2DJ2A 1OKTA 1AW9A 1TI1A 2WDUA 4K6XA 1SJIA 3G7JA 2YWNA 1OVNA 3TKRA 2P31A 3WT1A 5F06A 4AF2A 4ZXGA 3H4KA 2I9HA 3FR3A 4PUAA 3A3TA 4J56E 2HSYA 4ML1A 4WR5A 1S3AA 2RM5A 1YKCA 5ECOB 4MF7A 4TXVA 1XZOA 2KUCA 3C1RA 1GTBA 3DYRA 1V9WA 4EKZA 2R37A 2C8UA 2H1BA 2RM6A 4IBPA 1TKDB 1YEXA 1X9MB 1LBKA 3N5OA 2CAQA 1B9YC 1SENA 1O6JA 2XBIA 1V40A 1YEPA 3LXZA 2YP6A 2KHPA 5IPGA 3DGQA 2GLRA 5D9VA 3F3RA 4KCAA 4L5OA 3TKSA 3A2XA 5DJLA 3IE3A 5DQSA 5B6MA 1R5PA 4BWQA 3HJMA 3W6GA 1EGRA 2AB6A 2A2RA 5ECKB 2HZEA 4DSSB 2H6YA 2IJYA 3ZYWA 2C3TA 1GNWA 3NOFA 2XHFA 3EYTA 5D8IA 3TRQA 3HXSA 4XS4B 3MAKA 2DMLA 4K2DA 3TKSC 1G0TA 4G2EA 4IQAA 2OBKA 3TKQA 1ERTA 2YV9A 2H74A 1F3BA 1WPIA 2ZUPA 4TRXA 4AJ8A 4MF5A 2H76A 2LNTA 3K8NA 3GL5A 4ZB6A 4CHSA 2JZSA 4OMVA 3GSTA 4MCUA 1SD9A 4NV2A 3GHAA 1NHOA 3HVSA 1SYRA 1DBYA 4IP6A 4V2NA 3C7MA 1ERVA 2EIRA 5IQYA 2LV3A 2VLVA 3FKFA 3DEXA 1W4VA 3RBTA 3GKNA 1U88A 1T4YA 3P7XA 3ERGA 3ZREA 4MPFA 4Q5RA 5B6NA 3ZRDA 2MBSA 5CRHA 6GSVA 3DWVA 3KZQA 4MH2A 4XTSA 3HJOA 4EL1A 1XCCA 1A0FA 2H1DA 1TRVA 3RHCA 2OE3A 4K7NA 2QC7A 1A2LA 3G9BA 3PR8A 3QR6A 4GQFA 2NVLA 3HZ4A 3P2AA 3TOUA 5A5KA 2HE3A 2RIIA 3D0ZA 1B8XA 2DJ3A 4IJ3A 2A2SA 3LFLA 2IIYA 4IELA 1SJ6A 2HZEB 3MDKA 2CQ9A 1O8WA 3QAVA 4RQRA 1ZMAA 4FH8A 2FA4A 2GTUA 4J57E 4F9ZA 3H79A 2P0GA 4GTUA 2EC4A 3CSJA 3F8UA 2HLSA 3OR5A 1M2DA 4GRFA 5F07A 1TK0B 1V2AA 1SL2B 2L5LA 2GSSA 3C73A 1O73A 5CNWA 4OD7A 2C0DA 4K7OA 4MPGA 1FB0A 1T8EB 2VAFA 3L9UA 3HVVA 2LSTA 3IK9A 3WGEA 4O5RA 4POLA 3APQA 2IL3A 3UBKA 2H6XA 5FHIA 3VWVA 5AIXA 3TJBA 1SL1B 4PUFC 1EV4A 1GULA 5B7CA 3G7YA 3GRXA 2PMTA 4RI7A 2H30A 1THXA 5KN2A 1XW5A 4MMMA 4PQIA 3KTLA 2L4CA 4IHUA 2MMAA 2VUPA 5ECLB 5ECPB 3LORA 2IFQA 1FVJA 1YKAA 5G2ZA 2H75A 5AISA 4ZBDA 3PH9A 1YJ6A 1GLPA 4XIHA 1M0UA 4EXJA 3MSZA 2E2GA 4IKHA 2VM1A 2V32A 2GQLA 4ZL7A 1KEBA 4HQSA 4ACSA 3LXTA 3QPMA 4KAEA 3DRNA 1F2EA 4KB3A 5GAND 2YOIA 5J41A 5JWQB 1HNAA 4V2LA 3M8NA 4XRDA 1Y6EA 5GSSA 3J7Yb 3GH6A 1DUGA 4E8HA 4TR4A 3IBHA 4IN0A 2YJ7A 3EMPA 3IXRA 3KCMA 2YNXA 3E0UA 5ECSA 1JHBA 2CZ2A 3A5WA 3D4TA 1FB6A 3F6FA 1X5CA 4MP4A 1F9MA 1M2AA 6GSYA 3O6TA 4WF5A 2GVPA 3VLNA 2WS2A 2JZTA 1GWCA 2KOKA 2I1UA 3ZZXA 1RQMA 3SBCA 3PGTA 4ILFA 4KDYA 1K0MA 3TCOA 4L8EA 1OE8A 5G1KA 1NSWA 1PMTA 2F8AA 5AGYA 1SD8A 2HSHA 3L0HA 5JWOB 2AAWA 2DC5A 3FHKA 2X99A 4OO5A 1TU7A 3HJPA 1N8JA 1K0DA 2C0GA 3ME7A 2GQKA 18GSA 2XBQA 3UARA 1WE0A 1KTEA 2TIRA 4WXTA 5LD0A 4GSNA 4DSRA 2I81A 2LKUA 1GRXA 1FG4A 2IFQB 2EIOA 4GSTA 2C1YA 1VF4A 5F05A 1TI3A 3GNJA 5CP1A 2MYGA 2PPTA 5HQPA 2RUEA 1G6YA 4HS1A 1EV9A 2IWTA 3TRPA 3KH7A 4LA1A 1LJRA 1SL0B 2M46A 4NHZA 3GYKA 3UAPA 4HEA2 2GZYA 4EDYA 2JSYA 1X5EA 4IJIA 4HZ2A 2Z9SA 5IO0A 1XW6A 3ED3A 3ZVJA 1UVZA 1QK8A 1YQ1A 4POMA 2MMOA 1MDJA 1OC8A 2FWFA 1OKDA 1MDKA 2F8FA 1A0RP 2CZ3A 3EINA 3E9JB 2DJ0A 2DIYA 3BD2A 4ZBAA 3VK9A 3GX0A 3TJGA 4XRAA 4N10A 5EY6A 1K0OA 3BBYA 19GSA 2CV4A 2O8VB 3U5RE 8GSSA 2HI7A 1AAZA 2F9SA 2DJ1A 2GGTA 4JZQA 3CTFA 3BCKA 2OA7A 1T1VA 2HFDA 3S9FA 4PQ1A 2X8GA 1Z3EA 5CREA 2REMA 1GUKA 2IMDA 3D5JA 5ENUA 1WMJA 1QXHA 5IOWA 3I9V2 5IMVA 1R7HA 5C00A 2O7KA 4Q5FA 3RHBA 5CRGA 2YWMA 5DCGA 3ZLPA 4GQCA 4TN8A 4FYUA 2HYXA 1K3YA 1TK5B 3EC3A 1PKWA 1X9SB 2DBCA 1TOFA 5F0GA 3JCML 3GA4A 3QAWA 1M9AA 5J9CA 5GAPD 2BJXA 2V41A 5GSTA 2H73A 1NM3A 2B1KA 4NHWA 2H8LA 1GSYA 2JACA 4MJBA 3IOSA 1JLVA 2IMFA 1THOA 3TJKA 3GN3A 2J23A 1XOAA 4LMWA 1FOVA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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