4IP6A

C-terminal domain of the thiol:disulfide interchange protein dsbd, q488a mutant
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
HLNFTQIKTVDELNQALVEAKGKPVMLDLYADWCVACKEFEKYTFSDPQVQKALADTVLLAANVTANDAQDVALLKHLNVLGLPTILFFDGQGQEHPQARVTGFMDAETFSAHLRDRQPGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title An Extended Active-site Motif Controls the Reactivity of the Thioredoxin Fold.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbD
source organism Escherichia coli
molecule tags Oxidoreductase
total genus 42
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature ec 1.8.1.8: Protein-disulfide reductase.
pdb deposition date 2013-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13899 Thioredoxin_7 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ip6A00
4ZILA 4FYCA 3GX8A 3VI7A 4D73A 2NBSA 1F3AA 3QPMA 4ISDA 4XIHA 2C3QA 2LRCA 1Y25A 5CAXA 4POKA 2ZUPA 1NSWA 1YEPA 4MJBA 4WF5A 4ZBBA 5KEJA 4WETA 2JACA 3APSA 1SYXA 1X9MB 3WT1A 3IV4A 3UL3A 1VF2A 3HVXA 4TXVA 1OC9A 1OVNA 2OBKA 2VAFA 5HFIA 2L4QA 2Z9SA 3LJRA 1YZXA 5DJLA 2CA8A 6GSYA 2GT6A 2JSZA 4I2UA 1SENA 4O32A 4AF2A 3HDCA 5ABRA 2VCVA 3TKSA 3GURA 1GTIA 1R5PA 2B3SA 4OMVA 1OKDA 4J57E 3EVIA 2VCQA 1NM3A 5DAKA 2DBCA 2H66A 4OWYA 3E0UA 1FB0A 1MEKA 2GVPA 3C7MA 1QXHA 2VM2A 4MP4A 1GTBA 2BJXA 2K9FA 1GWCA 2OJLA 2CX3A 2C1YA 2RIIA 2IWTA 4HU7A 2V6KA 4LA1A 2ZNMA 1SL0B 5A4UA 1TK0B 1DE1A 5G1LA 2HSYA 3IDVA 2NVLA 4CDOA 4KSOA 4POBA 1PKZA 4LMVA 3QFAC 3J7Yk 4K6XA 1JZWA 1PQNA 3M9KA 2H30A 3D4MA 1F9MA 4HQZA 2TRCP 1ST9A 1XWKA 5C00A 1MDIA 1Z6NA 3H79A 2GSSA 4MPFA 5IMDA 1EOGA 3ME8A 3HY2A 4L5OA 3TKPA 4MF6A 3UEMA 4K7NA 2MMNA 5IM9A 1GULA 3P90A 2CVDA 4XRDA 4PQHA 4X1UA 3ZITA 2VM1A 3MAKA 4KE3A 1I9DA 1M2DA 2GSRA 3KM6A 2L5LA 3N5OA 2OADA 2AAWA 1BQ7A 3ZYWA 3F3QA 3TCOA 1A0RP 2VL2C 1AQWA 4IVFA 2EIOA 3M0FA 4L8EA 5ECKB 5ECNB 2O85A 4TXOA 3D5JA 3CBUA 3GHAA 4XS6A 3LSZA 3GKKA 4MF7A 5GSSA 2IPAA 4ID0A 3MNGA 4JR6A 1M2AA 5AGYA 16GSA 1RK4A 1AQVA 2FA4A 5D9TA 1T4ZA 4HOJA 4J56E 2B7JA 3SBCA 2X8HA 1Z9HA 2G0FA 4IP6A 1B4QA 3H1NA 4X43A 1BEDA 3HYPA 1PSQA 2FA8A 2DC5A 1WP0A 3GIXA 4HDEA 2FLSA 1X5CA 3EMXA 4DSQA 4Q5FA 3IA1A 2B1LA 1XWAA 5F06A 1A24A 1HQOA 2MBSA 1ML6A 2DSAA 2F8AA 1WMJA 4XS4A 1OE8A 5KN2A 4ECJA 1GP1A 3W6GA 2VLUA 3KMNA 4V1Ag 3DVXA 14GSA 2LRTA 2VIMA 1S3AA 2E2GA 4WF4A 4QL9A 2CZ2A 5EVOA 1V58A 3VWUA 1JLWA 5D9VA 4LLRA 5LCZA 1G7EA 2HRFA 4EVMA 3KH9A 4WXTA 5ECPB 2L6CA 3IE3A 2R4VA 1JFUA 2YWNA 1HYUA 2HFDA 1K3YA 3TDGA 2H76A 2C3NA 2HZEB 3L9SA 2R5GA 2LJRA 3ERGA 3HZ8A 1O8WA 5H5QA 5HFKA 2ON5A 1SJZA 5FHIA 2FHEA 3A5WA 2KHPA 4HJ2A 3E9JB 1M2BA 3CMIA 1TU7A 2LEGA 2QC7A 2YANA 2AYTA 3UVTA 1ABAA 3F6DA 1SYRA 4L5LA 2DIZA 1GRXA 4XS1A 1EGRA 1V40A 2IMDA 3NZNA 4ZL9A 2NPBA 5IIZA 2P0GA 1T1VA 5JWQB 5ECMB 1BYEA 5A5KA 3U6VA 2HLSA 4Q5NA 4MH3A 2HNLA 1TDIA 5KN0A 2F8FA 3KJYA 5IOXA 2V32A 4TR3A 1ZOFA 4ML6A 5IMAA 4POLA 3KIJA 4HUAA 3ZIJA 4KGIA 2FWEA 3IBHA 1IYIA 2CVBA 4KUNA 2X8CA 1SK1A 4ZBAA 5ECHB 4MDCA 5IO2A 3LXTA 4ZBDA 1GTUA 2VO4A 2HXKA 2R2JA 4XHMA 4HS1A 2YN1A 1F3BA 5LNKe 3RAZA 4BWQA 4GXZA 4OO4A 3RDWA 5KN1A 5E59A 1FVJA 1URMA 4YQUA 3DGQA 2XPDA 3TRPA 3G7YA 1A23A 3TRXA 2GDRA 4KAEA 5H5SA 4FYBA 4NMUA 1XVQA 3O3TA 2YPMA 2RM6A 1PL1A 5DQYA 2I9HA 5EY6A 2A2SA 1N2AA 4FIWA 2H19A 4G19A 2LJKA 1OE7A 2H73A 2B6MA 4MZBA 2YWIA 2CAIA 4DEJA 1PRXA 1TRUA 1YQ1A 1N8JA 1FB6A 2FWFA 5EPFA 3RHBA 3F4TA 3TKSE 4PQIA 1J9BA 2H6XA 2DLXA 1SJ6A 3FR6A 4ECIA 2NTOA 1K0MA 4NXIA 2YZUA 2P5QA 2LQOA 4O5RA 2D2ZA 1HNBA 1A8YA 4IJ3A 3QCPA 5IMZA 3TUEA 3F3RA 3GSSA 2C0EA 1DUGA 1Z7RA 4K0GA 3WT2A 3IHQA 1PD21 4F0CA 4FH8A 3M8NA 1TK8B 5ECOB 1JLVA 3DYRA 1SKRB 4TOPA 1PX6A 4RUVA 4GWRA 1GUKA 2GQLA 1GSUA 2PBJA 4IQ1A 3VWVA 5IOWA 2CVKA 1TJDA 2YWOA 4GRFA 5HR3A 2DJ2A 5J5NA 3L9UA 3M1GA 3L9VA 2VL9A 5ECLB 3JCML 4N30A 1BAYA 3WGEA 1CQHA 1WIKA 3ZREA 4BPYA 1VGLA 4F9ZA 2YCDA 3UMAA 5D93A 3CSJA 4XCSA 4MJEA 5JCWA 4HZ2A 2HI7A 3F63A 2H1DA 2GSQA 1GLQA 5H5RA 4NV5A 2JZSA 2WZ9A 2MYGA 4LMWA 5G30A 3CXGA 2O7KA 2K8VA 2B5YA 1V9WA 2VD0A 2VD1A 3KP8A 3CRTA 2M46A 3IK7A 4X0XA 1RW1A 2HZEA 3GH6A 6GSTA 3KZQA 1V98A 1SK2A 2FWHA 1TXXA 3KEBA 3GFKA 3CSHA 1DSBA 2H74A 5ELAA 5ENUA 2OE1A 1AUCA 3TJBA 1UVZA 1IYHA 5A4VA 2PU9C 4MF5A 1SKWB 2VLVA 1TRSA 2JL4A 3LQ7A 1TI3A 3D6IA 3LFLA 5D8IA 4MZWA 1G0TA 2C0GA 1XCCA 4NWYA 2PN8A 3KH7A 2K8SA 3FRCA 1ILOA 4K9ZA 4K8MA 1XPVA 1O85A 4NAXA 2IFQB 4IS0A 3O6TA 4V2LA 4JZQA 4MJAA 4KCEA 1J0FA 3L4NA 4NV2A 1YF1A 5AIVA 3ZIVA 4OFMA 2FGXA 3EYTA 2I81A 2CQ9A 4AJ7A 2BTOT 1EV9A 4G2EA 2YNXA 1YDKA 2B7KA 2WFCA 2H6YA 3R2QA 3UVHA 4RQRA 4O92A 3PH9A 4ZXGA 1BX9A 2L6DA 8GSSA 1TTZA 1XXUA 4I6XA 4PXOA 3LEFA 1LJRA 5B8AA 6GSWA 2MMOA 1GH2A 3IAS2 3VURA 1EP8A 3GN3A 2V41A 3GKMA 3FKFA 3HZ4A 1NHYA 2LKUA 1K0OA 4ZB8A 1HD2A 2H0IA 3KTBA 1QQ2A 5DCHA 3F0IA 1M0UA 3IK9A 1Q98A 1V2AA 4BVYA 2B1KA 4JE1A 3N9JA 2IMKA 4FYUA 1GSEA 5ID2A 2WRTA 2RUEA 1DBYA 1A2JA 1EZKA 2OBIA 3IRAA 3US3A 3KD0A 3GUSA 4EC0A 1YJ6A 2HT9A 20GSA 5EL8A 2O8VB 4HU9A 1X5DA 3OR5A 5DCGA 5IQYA 3P8WA 4L0WA 1VRSD 3ZFLA 1GNEA 3DIEA 4OO5A 1XFLA 4YH2A 5B7CA 2PMTA 4N0ZA 1ERVA 1U88A 2GT5A 1FHEA 2H0GA 3ZL5A 2VL3A 1WE0A 1OYJA 2GS3A 3A2VA 2LNTA 5FWGA 4GF0A 3ZFBA 2OKAA 3CSIA 3IR4A 1T4YA 1U3IA 4G10A 2E7PA 4MJCA 1R26A 3FW2A 2QGVA 3C73A 4RI7A 1VF4A 4JR4A 4IQAA 2R6KA 2RUFA 1TRWA 4TKYA 4LL1B 3PR8A 3D22A 3VWXA 1J08A 3I69A 3TJJA 4HI7A 2LNSA 4JBBA 5ECSA 2I4AA 3ERWA 3VI5A 1JHBA 1GTAA 4NPBA 2QKEA 1PX7A 1K0DA 2EIRA 2YV7A 3DKSA 3I6AA 4KDUA 3TRQA 4EDZA 3P2AA 4PX1A 5FT3A 1FOVA 2J9HA 3LYPA 2KP1A 1ACVA 2FCHA 5J9CA 3DRNA 2YWMA 1TI1A 3I9V2 4IBPA 3W8SA 3HHVA 2IMEA 5CRGA 1WWJA 1Z6MA 3TJGA 2X64A 3IXRA 3FZ9A 4OFNA 4KA0A 4YAVA 4YQMA 4H86A 4MK3A 5G1KA 2H1GA 2I1UA 1QK8A 5ECQB 2O87A 1R4WA 4OCEA 2M72A 6GSXA 2R3XA 3TKSC 1NHOA 1TU8A 4TR1B 2J23A 1S3DA 4LL4B 1FVKA 1X0RA 4GLTA 1EEJA 1ZYEA 1M9AA 4BA7A 2FD3A 3L78A 4WR4A 1XWBA 3QDNA 1PN9A 4QQ7A 1XOBA 4BWSA 2AV4A 2C0DA 1MTCA 3LG6A 1USBA 1QFNA 1FAAA 1ON4A 1XVWA 1XWCA 3FZ5A 3VLNA 3EU4A 1A0FA 3QMXA 22GSA 1OAZA 3RPNA 3GNJA 2QSIA 1RQMA 5IMVA 3FR3A 3QFBC 1W89A 2L4CA 1CQGA 1U3AA 4Q5QA 1B48A 2E0QA 4ML1A 3KTLA 4F82A 3QD9A 4GQCA 4TN8A 2CV4A 2CT6A 2E2MA 1F6MC 3NIVA 4ULXA 3G9BA 4FO5A 4CW9A 3GTUB 2R37A 2I3YA 1I5GA 2B5EA 6GSUA 5IMCA 5DAKB 3EWLA 2N5AA 4EUYA 2F51A 1JZRA 3LWAA 2O89A 3QAVA 2GQKA 3UBKA 2P31A 4GSNA 1GSYA 1AXDA 1XIYA 4JU5A 2WGRA 2C0FA 5AN1A 4IHUA 3C8EA 3F4RA 2ON7A 3IC4A 1O81A 1TKDB 2DJ1A 4HJMA 2VCWA 4IELA 3WGXA 5F0GA 5DALB 11GSA 1SJIA 2VCXA 4K7IA 4XTSA 1WJKA 5E4WA 2V6OA 1BG5A 4MPGA 2HZFA 2XPEA 5F8BA 5G31A 1B8XA 4JRRA 1XZOA 3BCIA 3G7IA 4ECBA 4DSRA 1WOUA 4KW6A 4MMMA 3MDKA 3GX0A 13GSA 3KXOA 3A2XA 1K0NA 5AISA 4J2FA 2OA7A 2GZPA 4AJ6A 2YJ7A 1MDJA 1AC1A 4PURA 2OE3A 2IN3A 4GQFA 3GRXA 1YY7A 3FY7A 1SL1B 4TW5A 5LD0A 1PL2A 4KB3A 2LRNA 5IO0A 1V57A 2JZTA 4BL7A 1F37A 1ZGNA 4TXOB 1B9YC 2H1AA 2WDUA 1TK5B 4Z7XA 3F4SA 5F05A 2JU5A 1SD8A 2IJYA 5DVBA 1M99A 3L0HA 2LUSA 3VPQA 4ZL8A 3DWVA 2JSYA 4WKWA 2EIQA 1AW9A 4WBJA 2LTKA 5CRDA 3FYGA 3TKQA 2CZ3A 2VL2A 4I97A 2H1BA 3F8UA 2MMAA 3DD3A 3V1WA 2IMIA 1TRVA 1BJXA 2V2GA 2PVOC 2HE3A 1Z5YE 2VOCA 5GSTA 1XW6A 1H75A 3HXSA 5J4UA 4L0UA 3P7XA 1AQXA 1GSFA 1S3CA 2YOIA 2LV3A 5JCUA 2DJ3A 2P5RA 3LXZA 4BVXA 4IW9A 1W4VA 4F03A 3UIWA 5COHA 3H93A 1GL8A 5HR1A 3C1SA 2X8GA 2YJHA 4Q5RA 5D96A 1EP7A 5KN3A 2LJAA 5A4WA 4PGTA 4WEYA 2H70A 1F2EA 3TGZA 5CRHA 4NHZA 5CREA 1THXA 2PWJA 1O8XA 3APOA 4F2IA 4TRXA 1M9BA 1HNCA 4QL7A 5D9XA 4I8BA 2PERA 2REMA 3HD5A 3HVSA 1OC3A 3WD6A 3RBTA 4HEA2 4ZB6A 5L71A 5DDLA 4I2TA 1ZYQB 4G9HA 3Q18A 2C4JA 3NOFA 3FZAA 1EGOA 2K18A 1U87A 1Z3EA 4JEDA 1FW1A 4IP1A 3IAM2 4EO3A 2HRNA 2KLXA 1QGVA 2YV9A 1GSQA 4DSSB 5D9WA 4KNDA 5G5EA 4KX4A 3MSZA 3GTUA 4MLYA 2FNOA 3APQA 2AB6A 1T8EB 5B6MA 5DBQA 5G2ZA 1WRYA 2H8LA 3HJOA 3GMFA 5G5FA 1X5EA 3ISOA 1KEBA 4KDXA 3UOMA 1UC7A 3EMPA 4IJIA 4EE0A 1GLPA 5DQSA 2VCZA 3ZVJA 2HSHA 3ED3A 3SWLA 1T00A 3M3MA 4V1Ap 3U5RE 4AJ8A 3C71A 5C04A 2N5FA 2VUPA 4MH2A 3S9FA 4IN0A 3Q6OA 1PKWA 3M9JA 2M80A 1PMTA 5DALA 3FK8A 1SU9A 1XBSA 5J3RA 2PPTA 4MA9A 4IKHA 3RHCA 3FHKA 1SD9A 4N0VA 1LU4A 4OD7A 3DXBA 3C1RA 2H6ZA 1A2MA 3GV1A 3TJFA 2PUKC 4ZB9A 3WYWA 3GKNA 1ZMAA 3BJ5A 5DJMA 1XW5A 2NDOA 4AGSA 2XBQA 4I5QA 3GKXA 1OC8A 5ECIB 3FR9A 1TP9A 2AHEA 3QAGA 1EWXA 3PINA 2KOKA 3KP9A 3ME7A 3F6FA 2ES7A 4KDYA 1EV4A 3G7JA 1E2YA 1G7OA 12GSA 4V2MA 1C72A 2WULA 1OKTA 5CRWA 3DVWA 3E3EA 4YAPA 3HVVA 1K0AA 3Q74A 2H75A 3VPTA 1M7TA 1SL2B 4PUAA 4MABA 1ERUA 4P3YB 1QMVA 3LGCA 2GGTA 5F07A 2OACA 5B6NA 3D0ZA 5CO3A 3BCKA 1SK0A 2GSTA 2GLRA 4N10A 3Q19A 1KTEA 1Y6EA 5INYA 2FY6A 1ZZYA 3EINA 1AIUA 3ZMLA 1GNWA 5IMFA 1KNGA 1TOFA 1XOAA 3UARA 2OE0A 1GSDA 4E8EA 1PGTA 9GSSA 4DVCA 2MMZA 3HJPA 2LS5A 2L5OA 3GH9A 2XBIA 2TRXA 4NHWA 3AY8A 1A2LA 2DJKA 2A4VA 5GZZB 2F9SA 1Z7PA 2BMXA 5ELGA 4K7OA 2B5XA 2WS2A 4KH7A 3O76A 1YKCA 2KUCA 2HYXA 4IGJA 2IIYA 4TVEA 3EURA 1YF0A 1KBNA 4GSTA 10GSA 2CAQA 1R5AA 1JZDA 1R7HA 4D73B 3MWHA 3H4KA 5J41A 3TJKA 3GA4A 2L59A 3ZRDA 2H72A 4ZL7A 4RI6A 3LORA 2EC4A 3ZLPA 4HQSA 4KCAA 1G6WA 4POMA 4EXJA 1ERWA 3KGKA 3WGDA 3I43A 3FEUA 1VF3A 2L57A 1T7PB 4PNFA 2IFQA 4EDYA 1O6JA 4V2NA 2XC2A 2H01A 1U6TA 3QAWA 2DJJA 3GSTA 2GTUA 3H8QA 3CTGA 19GSA 1XWGA 4PNGA 1OC9B 4XRAA 2IL3A 3F9UA 4ZIJA 5JWRB 3BD2A 4DSSA 1T3BA 2PVQA 2ZCTA 3ZTLA 4CHSA 3BOAA 1FO5A 4EKZA 4K0NA 2C80A 4EL1A 2DMLA 2DMMA 5B8BA 4HZ4A 3D21A 3KCMA 1ERTA 5JWOB 5GAND 4EF0A 5IPHA 3QOUA 3PGTA 2V1MA 2LSTA 3D4TA 1SKSB 1B4PA 7GSSA 3GL3A 3FZ4A 5ECRB 2GQMA 4GCIA 3GL5A 3VK9A 5CP1A 3CTFA 1NW2A 2JADA 3TKRA 3TOTA 4F0BA 1UN2A 5AIXA 2F3MA 4MCUA 1THOA 2AJQB 3A2WA 3VFIA 1LBKA 5HFGA 1TW9A 2VLTA 1H4OA 1GSSA 2IMFA 1MD3A 2XHFA 5JCGA 3UBLA 1A8LA 2K6VA 1PA3A 2ALBA 1G6YA 1ZL9A 2FWGA 2PGTA 3ZZXA 4YQVA 2AUVA 3RPPA 3J7Yb 3GYKA 4WR5A 2DIYA 1GUMA 5J9BA 6GSVA 4WBRD 4PUFC 2FUG2 5ID2B 5IPGA 1UA5A 1EOHA 1YEXA 4N11A 2YP6A 5HQPA 3ZVJD 5HR0A 3TOUA 3KMOA 2C3TA 1GUHA 2VCTA 1WPIA 1B9XC 3A3TA 2CX4A 1QUWA 2DJ0A 4PQ1A 1ZCPA 3DMLA 1E6BA 2WB9A 2N5BA 1Q4JA 2RM5A 4OCFA 4K2DA 3EE2A 4O7HA 1K3OA 4GTUA 3BBYA 2G2QA 1K0BA 1EEMA 3CYNA 1YKAA 2X99A 3QR6A 3HKRA 1VF1A 1K0CA 1MD4A 1FG4A 3HA9A 1XW9A 1HNAA 1O73A 3IPZA 2WCIA 3EU3A 4E8HA 1MDKA 1X9SB 3UAPA 3CRUA 3W8JA 4K1FA 5HR2A 3ZMKA 3ERFA 2YZHA 2RLIA 2JZRA 4TR4A 4RQXA 2MZCA 3UJ1A 5D73A 1O7UA 4ECCA 17GSA 3EC3A 3TB2A 4TR0A 3LYKA 18GSA 2A2RA 2GZZA 5CYYA 4ACSA 5GAPD 2WJUA 4KSMA 1X9WB 2GZYA 2LQQA 1K3LA 3HJMA 4GSSA 2C8UA 4MZCA 4OFTA 3IOSA 1AAZA 2TIRA 4XS4B 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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