4IQ1 | Genus

Total Genus 75

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	75
sequence length	209
structure length	209
Chain Sequence	SMKLYGLTGACSFVPHVALEWVKLRANQDYAFQAVSREFIKSAEYLALNPRGNVPLLVDGDLALTQNQAIVHYLDELYPEAKLFGSKTARDKAKAARWLAFFNSDVHKSFVPLFRLPSYAEGNETLTKTIRQQSAEQILEQLAFANAHLENHIFFGEEISVADAYLYIMLNWCRLLGLDFSHLSQLSAFMQRVEADQGVDNVREQEGLK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of probable glutathione s-transferase MHA_0454 (TARGET EFI-507015) FROM Mannheimia haemolytica, Substrate-free rcsb
molecule keywords	Glutathione transferase
molecule tags	Transferase
source organism	Mannheimia haemolytica phl213
total genus	75
structure length	209
sequence length	209
chains with identical sequence	B, C
ec nomenclature	ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date	2013-01-10

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1050.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	4iq1A02
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4iq1A01

1O85A 4LLRA 2KOKA 5IM9A 3EWLA 2M80A 3CRUA 5C00A 1ABAA 3VI5A 3N5OA 3J7Yk 2EIOA 2HRFA 4GLTA 3RBTA 4Q5RA 3F6FA 2FGXA 3P7XA 2N5BA 2P0GA 5HR2A 4GSTA 4FH8A 1V40A 3HJMA 6GSWA 2IPAA 1S3AA 1X9MB 3J7Yb 2VOCA 3P90A 5JWOB 3DRNA 2WCIA 3EYTA 4KCEA 4TKYA 2GVPA 4WETA 2GZPA 4AJ6A 1JZWA 4PQIA 4JR6A 3A5WA 1EEMA 1B48A 3U6VA 4XCSA 1M0UA 4POKA 3NIVA 1QQ2A 1R4WA 2OADA 1WPIA 1R7HA 4LA1A 3EU4A 1PX6A 4AJ8A 3KM6A 4EO3A 5IMFA 3WYWA 3GNJA 2MMNA 4RI7A 4FYBA 2LEGA 1EOHA 4POBA 3QFBC 2CX3A 2OBIA 2HRAA 1XOAA 3GH6A 4IGJA 2C3QA 3ISOA 4O32A 3TKSC 4EL1A 1A2MA 1KBNA 2K8SA 1GSFA 1K0OA 3RDWA 4OWYA 2R3XA 2PWJA 3RAZA 2C0GA 1XWAA 2G2QA 3EMXA 4HI7A 3IDVA 1GUKA 3G7JA 2TRCP 4HUAA 1GLQA 1Y6EA 2VAFA 3CXGA 3IOSA 1C72A 4IP6A 4OFTA 5HR0A 2GTUA 2GGTA 4BWSA 2E0QA 10GSA 3IAS2 4TN8A 2RM6A 3ME8A 2DJ2A 4MMMA 4XRAA 3LWAA 3TKSA 1K0BA 4CW9A 5G1LA 3O3TA 2IMEA 5IMZA 2VD0A 2H76A 2H0HA 4WBRD 2VIMA 2V1MA 2DBCA 4JR4A 1EP7A 5G5FA 1EV9A 4K0GA 2YZUA 2CX4A 4MJAA 3TJJA 2QSIA 3TDGA 2ON7A 4KAEA 1Z9HA 1UN2A 1J0FA 2YANA 3ZVJD 5ECHB 1DE2A 2JL4A 4N0ZA 4N30A 2ES7A 3VURA 4TR1B 1PRXA 2VCVA 4IHUA 2AB6A 4ML1A 5IQYA 4RQXA 5ECPB 5GSSA 1W89A 1HNCA 5F05A 1SKWB 4MF6A 1GUHA 1TU8A 1ERTA 2FWHA 1YZXA 3Q74A 1YEPA 5D96A 4RI6A 2C3TA 2H70A 3WT1A 2DMLA 2NPBA 3VWVA 3FKFA 1UC7A 3ZVJA 2HRKB 3KP8A 1TK8B 2OACA 2R2JA 2L59A 1BYEA 2JZRA 4QL7A 3BD2A 4BWQA 2LJRA 1GH2A 4KDYA 1TRVA 3QAGA 3FYGA 4V2NA 5FT3A 2M46A 1GSUA 4WF5A 1GNEA 1KTEA 6GSXA 3LORA 2L6DA 1K0CA 1K3OA 1FVKA 1V98A 2H1DA 1GLPA 1SD8A 4DSQA 3F4SA 3W8SA 1FVJA 4ZL7A 2CAIA 1VGLA 3GX8A 3FR6A 1TOFA 1M99A 1O8WA 3TJKA 4HOJA 4OFNA 5J9CA 2I9HA 2X8GA 3TKRA 4K7NA 4Z7XA 3JCML 5LNKe 2MMAA 22GSA 3UBKA 4MJCA 1GP1A 2O87A 2XBIA 2HRKA 2AHEA 2B5YA 2VCXA 2YCDA 1XVQA 1FW1A 4G0LA 2LJAA 4FIWA 2LV3A 1AQVA 4HZ4A 2V2GA 2LQOA 1GTBA 3GKKA 1ILOA 2TRXA 5ENUA 4XS4B 2A2SA 2EC4A 1AXDA 5IMDA 3LEFA 3TKSE 5ECMB 3ZL5A 3CSIA 4WR5A 3GL5A 3KTBA 2B1KA 2VCWA 3M1GA 2PU9C 5HR3A 4ZB6A 5G30A 3EU3A 4E8EA 4EF0A 3DYRA 4CHSA 2L4CA 3TUEA 3M0FA 14GSA 3D22A 2BMXA 4YQVA 3CSHA 3HVXA 5J5NA 1PGTA 4PX1A 4F82A 3LQ7A 1GWCA 2K8VA 3GKNA 3APOA 2RUFA 2C0DA 1V9WA 4HJMA 3TJBA 4NV2A 4AF2A 2VM1A 1S3DA 4IN0A 1YF1A 1WIKA 6GSYA 3KH9A 3FZ9A 1XWKA 1FB0A 3FZ5A 5F0GA 4OMVA 3TJFA 1EGOA 3CBUA 2IMIA 3ZFLA 1SK1A 5GAND 2CA8A 2B5EA 2IIYA 4BVYB 5DBQA 3KZQA 4ZBAA 1DSBA 3C7MA 4ZXGA 4HU9A 3QCPA 1U88A 6GSTA 5E4WA 3TRPA 3DVXA 1M7TA 3VWWA 2GZZA 1K3LA 3FZAA 4FO5A 2YZHA 3CRTA 2CZ2A 3TJGA 5A4VA 4ML6A 3UOMA 3C8EA 2OE3A 4I8BA 4EVMA 2QC7A 2IMDA 1XBSA 3ZIVA 5CRDA 3LG6A 4NV5A 5IPGA 2AV4A 1XW9A 4WKWA 3UIWA 4ZBBA 2R4VA 1THXA 3EVIA 4KH7A 2C8UA 4KSMA 3CTFA 3FZ4A 3FR9A 4BVYA 2VUPA 3GTUA 4L8EA 4WBJA 3MDKA 5CREA 1XXUA 1TW9A 2GQKA 1U87A 3F4TA 5IMVA 5ELGA 1YJ6A 4K1FA 3LYPA 1KNGA 4GXZA 3CYNA 1TRWA 3HZ8A 1OVNA 3C71A 4IJ3A 4XTSA 5J4UA 2OKAA 2VD1A 3H8QA 3GMFA 1NHYA 4OCEA 1F6MC 2IFQB 1K0DA 1X5CA 4JE1A 2GZYA 3GKMA 2N5AA 4GQCA 2WS2A 1XWGA 1WWJA 3OR5A 3HY2A 2XPEA 3Q6OA 4YH2A 4GSSA 2HSMA 2IMKA 1O8XA 4K9ZA 7GSSA 4P3YB 5ECLB 5ID2B 5COHA 4V1Ap 3HVSA 1PN9A 4MPGA 3L9VA 2E2GA 4QL9A 3M9KA 2V41A 5IMCA 3UARA 3FEUA 3IHQA 2JZTA 4MZBA 4N10A 4PGTA 3F8UA 4MP4A 2DJ3A 2YWIA 1VF1A 4ILFA 2GSSA 1VF4A 4XS6A 3APSA 5EPFA 2QGVA 2FWEA 2PGTA 2CAQA 1XIYA 1AAZA 3ERWA 2GS3A 2HLSA 2GSRA 3ED3A 1GSYA 4G0KA 4CDOA 2F9SA 8GSSA 2LSTA 6GSVA 1JLVA 1O6JA 1K0NA 1MDJA 3M9JA 2DMMA 2VO4A 5HR1A 2GSTA 2H6XA 1CQHA 20GSA 1NHOA 1ON4A 4MJBA 3M3MA 3TKQA 1T4YA 1XCCA 1RW1A 1ERUA 1T8EB 1NM3A 5ID2A 4KE3A 2HE3A 1USBA 2PN8A 6GSUA 3HA9A 2CVBA 5CRGA 4MZWA 1SYXA 3CSJA 2FLSA 1XWCA 1YQ1A 2H71A 2DJ0A 4DSSB 3H1NA 1ERWA 2B6MA 5G1KA 2RLIA 4NMUA 4YAVA 1FG4A 1AW9A 3M8NA 1U6TA 1ZMAA 4V2LA 4PUAA 3UVHA 1WE0A 4N0VA 5CYYA 1K3YA 4GF0A 4PURA 4TR0A 5C04A 3D21A 2L5LA 2EIRA 3HYPA 5CAXA 5AISA 2P5QA 2JU5A 3HHVA 2B3SA 4HQZA 3TOTA 1MEKA 3QAVA 4F03A 1SJIA 3KJYA 1WOUA 5D9WA 2FD3A 1FAAA 2L4QA 1M2DA 4Q5QA 4GSNA 3BBYA 4NHWA 3FR3A 2RM5A 4EKZA 4FQUA 4KX4A 2LKUA 3KGKA 2M72A 2VLUA 5DALB 5DCHA 3H4KA 4MJEA 4I2TA 3HDCA 12GSA 5IMAA 1WP0A 2MZCA 3G7YA 4TVEA 2V6KA 2DC5A 2F3MA 2H1GA 16GSA 1PL1A 3GFKA 5J9BA 1MDKA 2HQTA 3KTLA 2VL9A 5KN3A 3VLNA 2VLVA 4MA9A 1X9SB 2GQLA 1AUCA 1SL0B 3I69A 1O7UA 1A8YA 3N9JA 3UMAA 3F6DA 3GUSA 2IN3A 3GSSA 5EVOA 1QUWA 1DE1A 1JZRA 1TKDB 3P2AA 5ABRA 4MLYA 2FA8A 3BCKA 3E3EA 4MK3A 2YWMA 4H86A 1F3AA 2V32A 4XRDA 1R5AA 1BX9A 2VL3A 2I81A 5D73A 4GRFA 2YNXA 4IQ1A 4WXTA 2C80A 4KNDA 3US3A 1H75A 3KIJA 5G31A 5B6NA 5DQSA 1YEXA 4NHZA 4GCIA 4JBBA 1TK5B 2O89A 4YAPA 3TRQA 4KDXA 5DVBA 2GT5A 1AQXA 4HDEA 5D9TA 1GRXA 1F2EA 2B7KA 1IYIA 1HD2A 3GKXA 1QMVA 1O81A 4PXOA 2IJYA 1KEBA 11GSA 4HEA2 5DCGA 4PNGA 2K18A 2C0FA 2OBKA 3MAKA 1BAYA 1W4VA 2VL2C 1OKDA 1Q4JA 5DJLA 4G9HA 1ACVA 1SL1B 5KN0A 2HRNA 1T1VA 2B7JA 1T3BA 2JADA 2WZ9A 5ECQB 4WR4A 5EL8A 3EMPA 3GX0A 2GT6A 3VI7A 3LXZA 2CVKA 3SBCA 2PBJA 2CT6A 2EIQA 3L4NA 3VK9A 4TR1A 3D4MA 2C0EA 2JZSA 2NVLA 1SD9A 3FW2A 3W6GA 5IO0A 5D9VA 4IQAA 3I9V2 3PPUA 4L5OA 5AIXA 2DIYA 3CTGA 1PX7A 2DSAA 2VL2A 3UEMA 2C4JA 3VWXA 4F9ZA 4EC0A 4BPYA 4JZQA 1B4PA 1GTAA 3KXOA 4ZILA 3F63A 3VFIA 2FWGA 2BTOT 3S9FA 2YWNA 1PQNA 1XVWA 1GSSA 2NBSA 4GQFA 3UL3A 4GWRA 1HNAA 5H5SA 3QPMA 3ZRDA 4MZCA 2LS5A 2IMFA 1TI3A 2IWTA 1URMA 1XW5A 3KMNA 5J3RA 1OE7A 4LL4B 2YWOA 3ZREA 4FYCA 4ECCA 1SYRA 3IR4A 3ZMLA 4V2MA 1Z6NA 2O85A 2OA7A 3HXSA 3WGEA 1ST9A 1G0TA 3KP9A 1X5EA 5ECSA 2YOIA 1RK4A 4BVXB 5FWGA 3BJ5A 3TGZA 5ECRB 3E9JB 3C1RA 3AY8A 2OE0A 1PKWA 2WJUA 3IA1A 1CQGA 4IKHA 2VCQA 3ERFA 1ZOFA 3GURA 1RQMA 2PVQA 4KUNA 4EUYA 4L5LA 3ZITA 4G2EA 3GRXA 3UJ1A 5D9XA 2WGRA 9GSSA 4GTUA 2ZUPA 4XS4A 1ZYQB 1FO5A 4BL7B 5H5QA 2AYTA 2KHPA 19GSA 1TRSA 4XIHA 2A4VA 3D5JA 5KEJA 3HJPA 4IP1A 3TRXA 1GTUA 2UZ8A 4OFMA 1Z7RA 3O6TA 1J9BA 3FRCA 3HJOA 1A8LA 1TRUA 3DMLA 2DJKA 4X1UA 4YQMA 3IBHA 2YV7A 3IE3A 3HCZA 2H30A 1F9MA 2C1YA 2KUCA 4Q5FA 1EV4A 1QGVA 3EC3A 2DIZA 4NWYA 2H0GA 4MABA 2AUVA 4PQHA 3LXTA 3G7IA 1A2JA 2HI7A 1EP8A 4NPBA 1ML6A 2GDRA 1GSQA 2WFCA 4WEYA 4BL7A 2HT9A 3RHCA 5J41A 3LFLA 1JHBA 3LYKA 5KN1A 3F3QA 1BG5A 5HFIA 1TDIA 1OC9B 2B1LA 4OD7A 1AIUA 2R6KA 17GSA 18GSA 4DSRA 2H6ZA 3F0IA 2G0FA 1Z7PA 2WDUA 2MBSA 3GL3A 2O7KA 2YJ7A 2PMTA 3IK9A 1TP9A 2B5XA 4ZIJA 2H73A 2X99A 3QFAC 2FHEA 1X9WB 1SJ6A 3APQA 5F07A 2LRCA 1A23A 5JWQB 1YDKA 4G0IA 2HZEB 1VF3A 3RPNA 5JCGA 5HFGA 2HSHA 1FHEA 1GNWA 4AJ7A 2JACA 5JCUA 4WF4A 3QAWA 3DKSA 5FHIA 3GYKA 2Z9SA 3F3RA 2X8HA 4HU7A 2NDOA 4IBPA 5IPHA 5H5RA 1ZL9A 4K7IA 2HSYA 3GV1A 2AAWA 1PKZA 2FUG2 4ID0A 4TXOB 4KF9A 3MSZA 2H01A 5GSTA 2CQ9A 2DJ1A 2HZFA 1B4QA 2H0IA 1S3CA 2FNOA 3TKPA 1EWXA 1SU9A 2LQQA 1HYUA 5INYA 3FHKA 2H19A 1UVZA 4G10A 2YP6A 3UVTA 2H6YA 5B8AA 1JZOA 2IFQA 1SKSB 5ECKB 1R5PA 4Q5NA 1ERVA 2K6VA 2WULA 5A4WA 4MDCA 1MTCA 3C73A 2MYGA 2R37A 1XW6A 1AC1A 4RQRA 1PMTA 3A3TA 1N2AA 2E2MA 1PSQA 4F0CA 4TXOA 5JCWA 1EEJA 3EURA 3KCMA 4POMA 2ON5A 3GH9A 1MDIA 3IC4A 2VCZA 1QFNA 4I6XA 2H66A 3BCIA 3FY7A 1VRSD 4TRXA 1XPVA 2YN1A 5DDLA 4ZB8A 3K8NA 1MD3A 4MCUA 4FYUA 5AGYA 2FWFA 1LBKA 2FA4A 3UBLA 1MD4A 1F3BA 4N11A 1A2LA 3IC8A 2HFDA 4KB3A 2LNSA 1SK0A 4EDYA 5A4UA 1WJKA 4ZL8A 2LRNA 1BEDA 2H1AA 3GSTA 1M9BA 3I43A 2KP1A 3H79A 3H93A 4X0XA 4F0BA 2I4AA 1YKCA 1VF2A 5EY6A 3DEXA 3SWLA 3MWHA 2H1BA 2L57A 4DSSA 2KLXA 3TOUA 1QK8A 4JRRA 1FOVA 4ZBDA 1O73A 5D8IA 4L0WA 1JFUA 3DD3A 3IK7A 2P5RA 1T4ZA 4LMVA 2F8AA 3IRAA 2ZCTA 2CVDA 2CZ3A 1OC3A 4KGIA 2J9HA 4PQ1A 3L9UA 1PL2A 4L0UA 1YY7A 5ECOB 1K0AA 5IIZA 3EINA 1T7PB 4IJIA 5ECIB 4XS1A 2GLRA 2L5OA 1LU4A 1XWBA 5B6MA 3QOUA 3QD9A 3HD5A 3GA4A 6GSSA 1ZZYA 2H74A 1EZKA 5ECNB 4EXJA 2XHFA 1IYHA 4HJ2A 4ECJA 1OC8A 4EDZA 3ZLPA 2DLXA 4D73B 3ZFBA 1QXHA 1XOBA 2JSYA 3IXRA 1YF0A 1TK0B 3VPTA 2CV4A 2GQMA 4NXIA 5DALA 4I97A 3WGXA 1GSDA 2P31A 4IELA 2VCTA 2VM2A 1BJXA 3DIEA 1TXXA 3L78A 1TJDA 1YKAA 4KSOA 2X8CA 1Z3EA 4LMWA 5G5EA 2PUKC 2RUEA 2V6OA 2PVOC 3PH9A 4YQUA 3I6AA 1HNBA 3O76A 2YV9A 5JWRB 1ZYEA 3TB2A 2KP2A 3A2VA 2O8VB 1B9XC 4IVFA 3UAPA 4KA0A 4MF7A 2REMA 3RPPA 3EE2A 4DVCA 4ECBA 5L71A 4K8MA 4PUFC 1NW2A 5CO3A 4D73A 4JU5A 2NTOA 2ALBA 2HNLA 4G19A 2WRTA 2HXKA 2ZNMA 2E7PA 1TU7A 4X43A 4ZL9A 3KMOA 3W8JA 3IV4A 4ZB9A 3RHBA 1XZOA 4MH2A 1JZDA 2MMZA 3VWUA 2L6CA 1H4OA 1M2BA 1GL8A 3A2WA 3R2QA 3IPZA 2HYXA 4RUVA 5HQPA 13GSA 1X0RA 3KEBA 2LUSA 4QQ7A 1TI1A 4HZ2A 4E8HA 2H75A 3Q18A 2XBQA 4IW9A 1SJZA 2X64A 1T00A 2XPDA 3GHAA 4K6XA 4MPFA 2MMOA 2I1UA 4AGSA 1DUGA 4ULXA 3ZIJA 1V57A 4NAXA 4POLA 1SENA 4J2FA 1A24A 3CMIA 2PERA 4USSA 1DBYA 3HVVA 1V2AA 4PNFA 3C1SA 3PR8A 2FCHA 3F4RA 2TIRA 4HQSA 3G9BA 5DJMA 4J56E 1E2YA 3DVWA 5B7CA 4DEJA 4HS1A 3QMXA 3QDNA 1THOA 1AQWA 4TR4A 1PA3A 3ERGA 1G6WA 1BQ7A 1J08A 3VPQA 4KW6A 1GULA 5DAKB 2XC2A 2F51A 3L9SA 1TTZA 4LL1B 5CNWA 5F8BA 2VLTA 2I3YA 1V58A 5LD0A 4TR3A 5B8BA 4J57E 3L0HA 3ZZXA 1G6YA 1GSEA 1XFLA 1OKTA 5AIVA 2DJJA 3A2XA 5GZZB 4KCAA 1A0RP 1SK2A 2FY6A 1JLWA 4BVXA 3QR6A 2QKEA 5AN1A 5IO2A 4OO5A 5HFKA 5E59A 3U5RE 3BOAA 1LJRA 4V1Ag 3KH7A 3D0ZA 1EOGA 1U3IA 5CRWA 4OO4A 5DAKA 4PTSA 1WMJA 4I5QA 1E6BA 1ZGNA 3DXBA 4TXVA 3GTUB 3P8WA 5BMUA 4MH3A 4TOPA 2C3NA 3ZYWA 1NSWA 1SKRB 1WRYA 1M2AA 3D6IA 4BA7A 2GSQA 2YJHA 2RIIA 2K9FA 3NOFA 2LRTA 1I9DA 5CP1A 3GIXA 3WD6A 3GN3A 3ZTLA 5DQYA 3WGDA 1HQOA 2R5GA 1G7EA 2IL3A 5IOWA 1B9YC 1OAZA 2LNTA 1Z6MA 2N5FA 1FB6A 2HSNB 4MF5A 3PINA 5D93A 2F8FA 5LCZA 1X5DA 4JEDA 5KN2A 2HSMB 4K7OA 3Q19A 4O92A 3FK8A 1F37A 1GUMA 3NZNA 4IS0A 3WT2A 4KDUA 4F2IA 2BJXA 2LJKA 3DWVA 2MBTA 2OE1A 4ECIA 1I5GA 1R26A 4K2DA 4XHMA 4ACSA 1K0MA 1ZCPA 4K0NA 3HKRA 1UA5A 2WB9A 1Y25A 2PPTA 2A2RA 1U3AA 1EGRA 2D2ZA 1B8XA 3HZ4A 3F9UA 5IOXA 4O7HA 1OC9A 2YPMA 1OYJA 1PD21 3IAM2 2J23A 5CRHA 3KD0A 1M9AA 5ELAA 2LTKA 1OE8A 3MNGA 1Q98A 4I2UA 3V1WA 3D4TA 3DGQA 3R3EA 5GAPD 3TCOA 1GTIA 1A0FA 3LSZA 4EE0A 1SL2B 4TW5A 2H72A 5G2ZA 4OCFA 1N8JA 2HZEA 1Z5YE 3E0UA 3ME7A 4O5RA 5F06A 3PGTA 2AJQB 1G7OA 2OJLA 4ISDA 3LJRA 3ZMKA 5A5KA 2JSZA 2H8LA 3LGCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4IQ1A

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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