4IR5A

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with 1-{1-[2-(hydroxymethyl)phenyl]-7-phenoxyindolizin-3-yl}ethanone (gsk2847449a)
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Discovery and Characterization of GSK2801, a Selective Chemical Probe for the Bromodomains BAZ2A and BAZ2B.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 40
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4ir5A00
4XUBA 4QNSA 5FG6A 5EPSA 5DYCA 5A5OA 5FE0A 5CQ8A 5D3LA 5DKDA 4CUSA 3SVFA 4TQNA 4O71A 4UIZA 5F1LA 4IR4A 3JVJA 5D3TA 5IIDA 4Y03A 2R10A 4YYGA 4HXMA 4GPJA 4HXNA 4PKLA 4DONA 5K29A 4NUDA 2L85A 4ALHA 5I29A 5DBMA 4YABA 5E9MA 4CL9A 5FG5A 4O72A 4LR6A 4TT4A 5CQ7A 4LYWA 3U5KA 4YC9A 5A5SA 5I7XA 4A9OA 4TU4A 5ENEA 3RCWA 4QSTA 4Z6HA 4MENA 4YADA 4QZSA 3TLPA 5F62A 4BW4A 2KTBB 5G4RA 4A9IA 4BW1A 3S91A 2WP1A 5D3JA 4NYVA 5FE1A 5A83A 5KTWA 5E9IA 3LQJA 4HBXA 5DFCA 2I7KA 3UV4A 5IGLA 4N4GA 2DATA 5DFBA 5D0CA 5EWDA 4NR7A 3ONIA 4J0SA 5AMFA 4UIWA 3S92A 5LKXA 5E7DA 5FH7A 5DFDA 5CRMA 4YYKA 3NXBA 4CURA 5LJ2A 3D7CA 4HXPA 4TTEA 5E9YA 5LJ0A 5II1A 5H1TA 4MR3A 2RNWA 4O7EA 5DW2A 4YY6A 4IR6A 4NUCA 4BW3A 2YDWA 4QSSA 4QSQA 5IGKA 2YELA 2H60A 4QC3A 1JM4B 4MEPA 4NS5A 3I3JA 2NXBA 4ALGA 5EA1A 5C87A 4UYGA 2GRCA 4O70A 3U5JA 4FLPA 5ENGA 5F63A 5FDZA 2OO1A 2DVVA 2DKWA 4LYIA 4KV4A 4NR5A 4A9KA 5AD3A 3UVYA 5ENHA 3ZYUA 4CFLA 5EV9A 2R0SA 5E9VA 5FFYA 4ZW1A 4LC2A 5FE6A 4QUUA 4OGIA 5C89A 3U5NA 5I80A 3FKMX 4BW2A 4KCXA 2YW5A 5LJ1A 3G0JA 3O33A 3K2JA 5DW1A 3G0LA 3LQHA 4UITA 5DLXA 5IG6A 4Z6IA 5COIA 4HBYA 4QR4A 3DAIA 2DVQA 5HQ6A 5JWMA 4NQMA 4NRBA 5DKCA 4A9NA 5FE2A 4O7FA 4NUEA 5J0DA 4YATA 5EM3A 5FE4A 5D25A 3AADA 3HMFA 4NR4A 5FG4A 2I8NA 4MR4A 1N72A 5KO4A 3U5LA 4F3IA 5FE9A 4UYFA 4IOOA 4YH3A 5I88A 5E3GA 5ETBA 2DWWA 5CGPA 5C7NA 4UYEA 4N4IA 5HENA 2RO1A 4YY4A 5LKUA 5KTXA 5EWVA 3U5PA 3MB3A 2R0VA 5L8TA 4O74A 5L97A 3O34A 4HBWA 3HMEA 5IGMA 3P5OA 4YYHA 2YQDA 4PCEA 5A81A 5FE5A 1EQFA 4ZQLA 5ETDA 4Q0OA 3P1DA 5CRZA 2RNXA 4UIUA 4LZSA 5EGUA 5F1HA 5F60A 4YYDA 2E3KA 3U5MA 5D26A 4O7CA 5CUDA 5C85A 5CP5A 4YYNA 5EI4A 5F36A 5A82A 5A7CA 4ZC9A 4XY9A 5BT5A 4MEOA 4HXLA 5HRVA 5KTUA 3IU5A 5LVRA 4YYJA 3UV2A 2RS9B 5C4QA 5CU8A 4IR5A 2MJVB 2E7OA 4YBTA 5CQ4A 4CUQA 4HXRA 4NQNA 5CTLA 4O75A 4QEUA 5E9LA 4LDFA 5A5QA 4N4HA 5FH8A 5HRXA 2DVRA 5HFQA 2L5EA 5FB1A 3UVXA 4YBMA 5LKZA 5LUUA 4PS5A 5CZGA 5EICA 2E7NA 4O7BA 5H1VA 4NRCA 4QC1A 5CQ3A 2F6JA 5FB0A 5FFVA 4E96A 4TYLA 5FE8A 4YK0A 4QR3A 5EWHA 4NR8A 4XUAA 5CUGA 4QSWA 4QY4A 3QZVA 3UVDA 4QSXA 3Q2FA 4CUPA 2L84A 5EK9A 5D3SA 4YH4A 5G4SA 4XY8A 5EU1A 4CLBA 2D9EA 4HXOA 4KV1A 4UIYA 4LYSA 5DYAA 4OGJA 3LQIA 4LZRA 1ZS5A 4TT2A 4CUTA 4NR9A 3LJWA 2R0YA 4YBSA 2F6NA 4OUFA 4PTBA 5BT3A 5FBXA 4MEQA 5KHMA 5F61A 3AQAA 5L8UA 5AD2A 4QYLA 4LRGA 5CPEA 3MQMA 5CQAA 4PCIA 5CY9A 3IU6A 5DLZA 4LZ2A 3LXJA 4WHUA 5EPRA 3MXFA 4N4FA 5HELA 3O36A 5II2A 4QB3A 5HLSA 5EP7A 4QSRA 5A85A 5EVAA 3U5OA 5LKTA 4HXSA 5FE3A 5DYUA 5I89A 4TZ2A 5CUCA 5A5RA 4HBVA 4YYMA 5HQ5A 4TT6A 4MR5A 4QSUA 5DYXA 5HFRA 3O35A 4NXJA 5D7XA 2N9GA 2RNYA 3QZTA 4A9MA 1E6IA 5E0RA 3HMHA 4N3WA 5CQ5A 5ENFA 1WUGA 5F3AA 5ENBA 1WUMA 5LVQA 4TU6A 3O37A 3SVHA 4A9JA 4BHWA 2DVSA 4J0RA 2FSAA 5I86A 5ENCA 4YAXA 5H85A 2RFJA 4QSVA 5EISA 5D24A 4CUUA 5A5PA 4Q0NA 5F25A 4A9LA 4A9EA 5TCMA 4O78A 2YEKA 5HCLA 5FH6A 4A9HA 4C66A 2WP2A 2OSSA 4J3IA 4RVRA 2G4AA 5E9KA 2LSPB 3P1CA 3GG3A 4TZ8A 5I40A 4O76A 5DY7A 4X2IA 5AMEA 5CFWA 4A9FA 3UVWA 5E73A 4UIVA 5TB6A 4CFKA 5E3DA 2OUOA 4O77A 5HJCA 4QR5A 5IGNA 5FFWA 4XYAA 4J1PA 5FE7A 5KU3A 4WHWA 4UYHA 3Q2EA 5EQ1A 4Z93A 2D82A 5F5ZA 5CQTA 2YEMA 5JI8A 3MB4A 3MULA 4QYDA 4NR6A 5D3HA 3JVKA 4IOQA 1X0JA 5CQ6A 4NYWA 3P1EA 5HM0A 4TS8A 5DX4A 5I7YA 4UYDA 4PY6A 4AKNA 5I1QA 3JVLA 3DWYA 5CUEA 5CS8A 4YYIA 5D3RA 3UW9A 5ENIA 4QBMA 4Z1QA 5CUAA 5EPBA 5L98A 4HXKA 5F2PA 4IORA 4NYXA 5HEMA 4C67A 5DKHA 5EWCA 4MR6A 4QSPA 4BJXA 4Z1SA 2YYNA 5ENJA 3JVMA 5L96A 5ACYA 3QZSA 5H1UA 5E74A 5HRWA 5CUBA 3SVGA 4NRAA 4QEWA 4QEVA 5HQ7A 4WIVA 4UIXA 1F68A 4UYFB 5L99A 3P1FA 3MUKA 5BT4A 5A5NA 4O7AA 5D3PA 4QUTA 5IBNA 3UV5A 5I83A 4IR3A 5C8GA 2RI7A 5EWWA 1JSPB 5D3NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4XUBA 3ERRA 4QNSA 5FG6A 5EPSA 5DYCA 5A5OA 5FE0A 5CQ8A 5D3LA 5DKDA 4CUSA 3SVFA 4TQNA 4O71A 4UIZA 5F1LA 4IR4A 3JVJA 5D3TA 5IIDA 4Y03A 2R10A 4YYGA 4HXMA 4GPJA 4HXNA 4PKLA 4DONA 5K29A 4NUDA 2L85A 4ALHA 5I29A 5DBMA 4YABA 5E9MA 4CL9A 5FG5A 4O72A 4LR6A 4TT4A 5CQ7A 4LYWA 3U5KA 4YC9A 5A5SA 5I7XA 4A9OA 4TU4A 5ENEA 3RCWA 4QSTA 4Z6HA 4MENA 4YADA 4QZSA 3TLPA 5F62A 4BW4A 2KTBB 5G4RA 4A9IA 4BW1A 3S91A 2WP1A 5D3JA 4NYVA 5FE1A 5A83A 5KTWA 5E9IA 3LQJA 4HBXA 5DFCA 2I7KA 3UV4A 5IGLA 4N4GA 2DATA 5DFBA 5D0CA 5EWDA 4NR7A 3ONIA 4J0SA 5AMFA 4UIWA 3S92A 5LKXA 5E7DA 5FH7A 5DFDA 5CRMA 4YYKA 3NXBA 4CURA 5LJ2A 3D7CA 4HXPA 4TTEA 5E9YA 5LJ0A 5II1A 5H1TA 4MR3A 2RNWA 4O7EA 5DW2A 4YY6A 4IR6A 4NUCA 4BW3A 2YDWA 4QSSA 4QSQA 5IGKA 2YELA 2H60A 4QC3A 1JM4B 4MEPA 4NS5A 3I3JA 2NXBA 4ALGA 5EA1A 5C87A 4UYGA 2GRCA 4O70A 3U5JA 4FLPA 5ENGA 5F63A 5FDZA 2OO1A 2DVVA 2DKWA 4LYIA 4KV4A 4NR5A 4A9KA 5AD3A 3UVYA 5ENHA 3ZYUA 4CFLA 5EV9A 2R0SA 5E9VA 5FFYA 4ZW1A 4LC2A 5FE6A 4QUUA 4OGIA 5C89A 3U5NA 5I80A 3FKMX 4BW2A 4KCXA 2YW5A 5LJ1A 3D1BA 3G0JA 3O33A 3K2JA 5DW1A 3G0LA 3LQHA 4UITA 5DLXA 5IG6A 4Z6IA 5COIA 4HBYA 4QR4A 3DAIA 2DVQA 5HQ6A 5JWMA 4NQMA 4NRBA 5DKCA 4A9NA 5FE2A 4O7FA 4NUEA 5J0DA 4YATA 5EM3A 5FE4A 5D25A 3AADA 3HMFA 4NR4A 5FG4A 2I8NA 4MR4A 1N72A 5KO4A 3U5LA 4F3IA 5FE9A 4UYFA 4IOOA 4YH3A 5I88A 5E3GA 5ETBA 2DWWA 5CGPA 5C7NA 4UYEA 4N4IA 5HENA 2RO1A 4YY4A 5LKUA 5KTXA 5EWVA 3U5PA 3MB3A 2R0VA 5L8TA 4O74A 5L97A 3O34A 4HBWA 3HMEA 5IGMA 3P5OA 4YYHA 2YQDA 4PCEA 5A81A 5FE5A 1EQFA 4ZQLA 5ETDA 4Q0OA 3P1DA 5CRZA 2RNXA 4UIUA 4LZSA 5EGUA 5F1HA 5F60A 4YYDA 2E3KA 3U5MA 5D26A 4O7CA 5CUDA 5C85A 5CP5A 4YYNA 5EI4A 5F36A 5A82A 5A7CA 4ZC9A 4XY9A 5BT5A 4MEOA 4HXLA 5HRVA 5KTUA 3IU5A 5LVRA 4YYJA 3UV2A 2RS9B 5C4QA 5CU8A 4IR5A 2MJVB 2E7OA 4YBTA 5CQ4A 4CUQA 4AKHA 4HXRA 4NQNA 5CTLA 4O75A 4QEUA 5E9LA 4LDFA 5A5QA 4N4HA 5FH8A 5HRXA 3VKGA 2DVRA 5HFQA 2L5EA 5FB1A 3UVXA 4YBMA 5LKZA 5LUUA 4PS5A 5CZGA 5EICA 2E7NA 4O7BA 5H1VA 4NRCA 4QC1A 5CQ3A 2F6JA 5FB0A 5FFVA 4E96A 4TYLA 5FE8A 4YK0A 4QR3A 5EWHA 4NR8A 4XUAA 5CUGA 4QSWA 4QY4A 3QZVA 3UVDA 4QSXA 3Q2FA 4CUPA 2L84A 5EK9A 5D3SA 4YH4A 5G4SA 4XY8A 5EU1A 4CLBA 2D9EA 4HXOA 4KV1A 4UIYA 4LYSA 5DYAA 4OGJA 3LQIA 4LZRA 1ZS5A 4TT2A 4CUTA 4NR9A 3LJWA 2R0YA 4YBSA 2F6NA 4OUFA 4PTBA 5BT3A 5FBXA 4MEQA 5KHMA 5F61A 3AQAA 5L8UA 5AD2A 4QYLA 4LRGA 5CPEA 3MQMA 5CQAA 4PCIA 5CY9A 3IU6A 5DLZA 4LZ2A 3LXJA 4WHUA 5EPRA 3MXFA 4N4FA 5HELA 3O36A 5II2A 4QB3A 5HLSA 5EP7A 4QSRA 5A85A 5EVAA 3U5OA 5LKTA 4HXSA 5FE3A 5DYUA 5I89A 3D1DA 4TZ2A 5CUCA 5A5RA 4HBVA 4YYMA 5HQ5A 4TT6A 4MR5A 4QSUA 5DYXA 5HFRA 3O35A 4NXJA 5D7XA 2N9GA 2RNYA 3QZTA 4A9MA 1E6IA 5E0RA 3HMHA 4N3WA 5CQ5A 5ENFA 1WUGA 5F3AA 5ENBA 1WUMA 5LVQA 1ZKRA 4TU6A 3O37A 3SVHA 4A9JA 4BHWA 2DVSA 4J0RA 2FSAA 5I86A 5ENCA 4YAXA 5H85A 2RFJA 4QSVA 5EISA 5D24A 4CUUA 5A5PA 4Q0NA 5F25A 4A9LA 4A9EA 5TCMA 4O78A 2YEKA 5HCLA 5FH6A 4A9HA 4C66A 2WP2A 2OSSA 4J3IA 4RVRA 2G4AA 5E9KA 2LSPB 3P1CA 3GG3A 4TZ8A 5I40A 4O76A 5DY7A 4AKIA 4X2IA 5AMEA 5CFWA 4A9FA 3UVWA 5E73A 4UIVA 5TB6A 4CFKA 5E3DA 2OUOA 4O77A 5HJCA 4QR5A 5IGNA 5FFWA 4XYAA 2EJNA 4J1PA 5FE7A 5KU3A 4WHWA 4UYHA 3Q2EA 5EQ1A 3VKHA 4Z93A 2D82A 5F5ZA 5CQTA 2YEMA 5JI8A 3MB4A 3MULA 4QYDA 4NR6A 5D3HA 3JVKA 4IOQA 1X0JA 5CQ6A 4NYWA 3P1EA 5HM0A 4TS8A 5DX4A 5I7YA 4UYDA 4PY6A 4AKNA 5I1QA 3JVLA 3DWYA 4AKGA 5CUEA 5CS8A 4YYIA 5D3RA 3UW9A 5ENIA 4QBMA 4Z1QA 5CUAA 5EPBA 1PUOA 5L98A 4HXKA 5F2PA 4IORA 4NYXA 5HEMA 4C67A 5DKHA 5EWCA 4MR6A 4QSPA 4BJXA 4Z1SA 2YYNA 5ENJA 3JVMA 5L96A 5ACYA 3QZSA 5H1UA 5E74A 5HRWA 5CUBA 3SVGA 4NRAA 4QEWA 4QEVA 5HQ7A 4WIVA 4UIXA 1F68A 4UYFB 5L99A 3P1FA 3MUKA 5BT4A 5A5NA 4O7AA 5D3PA 4QUTA 5IBNA 3UV5A 5I83A 4IR3A 4AI6A 5C8GA 2RI7A 5EWWA 1JSPB 5D3NA
chains in the Genus database with same CATH topology
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