4IR5A

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with 1-{1-[2-(hydroxymethyl)phenyl]-7-phenoxyindolizin-3-yl}ethanone (gsk2847449a)
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Discovery and Characterization of GSK2801, a Selective Chemical Probe for the Bromodomains BAZ2A and BAZ2B.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4ir5A00
5IG6A 5D3TA 5EISA 3S91A 3JVKA 4O76A 5HELA 5DLXA 4YYNA 4TU4A 2OO1A 4NS5A 2L85A 4C67A 5HQ5A 4YH4A 5A5QA 2RNWA 3QZSA 5FFVA 3RCWA 5CZGA 1WUMA 5CFWA 3DWYA 4WHWA 5FE5A 2OUOA 3UVDA 4YC9A 4NR8A 4CUSA 1F68A 5DBMA 4PY6A 3NXBA 4QYLA 5CQ4A 5KTUA 3Q2EA 4UIYA 4NUEA 4QSWA 4Z93A 5LKZA 5F36A 4UYFB 4CFKA 4Z6HA 5F25A 2RNYA 4DONA 5HEMA 5FDZA 5LVRA 2RS9B 5A7CA 3G0JA 3QZTA 2OSSA 4QC1A 4XUAA 2DVQA 4YYKA 5ETBA 4ALHA 4NR7A 5F3AA 5H85A 4KCXA 3U5MA 5E9IA 5FG4A 5I40A 4A9LA 4HXOA 4YYIA 5FE6A 2KTBB 5CU8A 4QR5A 4A9NA 5HM0A 3TLPA 2G4AA 5FFYA 3UVWA 5EA1A 4CUUA 4NYVA 4O75A 3SVHA 5AD2A 5F62A 3UV4A 5I88A 5LJ1A 3G0LA 5CUDA 5FE2A 3U5LA 5KTXA 4NR9A 4UYHA 3ZYUA 4UIUA 2L5EA 2YDWA 3AQAA 4YADA 5C89A 5BT5A 5HQ7A 4YYJA 4YATA 4TU6A 5HFRA 2RI7A 1JM4B 5CUCA 2I7KA 3U5KA 5L96A 5J0DA 5HRWA 5A81A 4AKNA 5F63A 4A9KA 4QEWA 5D3LA 4QSUA 4NYWA 3JVLA 4A9EA 5D26A 5II2A 3FKMX 5D3HA 2F6JA 4CURA 5LJ0A 5FE4A 5LKTA 3LXJA 5JWMA 3UV2A 4NUDA 5ENJA 4MR5A 5COIA 4TTEA 4UIZA 4YY6A 5ENIA 4QSXA 5A82A 4TS8A 5D7XA 4HXLA 4XYAA 4CFLA 5CQ5A 4HXSA 4ZC9A 4C66A 5D24A 5K29A 3SVGA 3U5NA 4QSTA 4Y03A 5DLZA 5L8UA 4X2IA 5D3JA 3MB4A 4N4GA 4WHUA 3HMEA 4PCIA 4QSPA 3U5JA 4YABA 4Z6IA 4PCEA 5CP5A 5EWVA 4LRGA 3MQMA 4NR6A 5FH7A 5I7YA 5FE8A 4TT6A 5IGNA 4XY8A 4IR3A 5A5SA 5EQ1A 5A85A 2D82A 4BW3A 2E7OA 5C8GA 3O33A 5TCMA 5D3RA 2YYNA 4MEPA 3LQIA 5D0CA 5EU1A 2YW5A 2R0SA 5FE0A 4LZRA 3HMFA 4KV4A 5E0RA 4LC2A 5E9MA 4YYHA 2H60A 2RNXA 3K2JA 5EPBA 5EWWA 4UITA 5F60A 4O70A 4A9OA 4BW4A 3UVXA 4J0RA 5H1TA 3AADA 4XUBA 5ENCA 3P1DA 4TT4A 3MUKA 5DYCA 5EPSA 3GG3A 4Z1QA 5DFBA 4LZSA 4MEOA 4YYMA 4QUTA 5HLSA 2WP1A 3UW9A 4O7AA 5E3GA 3IU6A 5DW2A 5H1UA 5BT3A 5CQ3A 5KU3A 3MULA 4QC3A 5CQAA 2WP2A 3JVJA 5F2PA 4F3IA 4YYDA 5IGMA 2F6NA 4QSSA 4TZ2A 4IR6A 3SVFA 5FE1A 4BJXA 4MR4A 3O35A 2YQDA 2MJVB 5C7NA 4HBWA 4NQMA 5EICA 4HXRA 4QR4A 4QSVA 5CUEA 4BW1A 2R10A 3P1CA 4O7FA 4NRBA 2DVVA 4YK0A 5DX4A 1JSPB 2RO1A 4XY9A 4J3IA 4NXJA 4MR6A 4O74A 2FSAA 4HBXA 4QEVA 3ONIA 3JVMA 5G4RA 4CL9A 5HRVA 5ENHA 5CRZA 5CPEA 3MXFA 4FLPA 4OUFA 3U5PA 5A83A 4UYFA 4LDFA 5EVAA 4YBTA 5HCLA 5AMFA 4Q0NA 5AD3A 5ENBA 5FFWA 4TZ8A 5A5OA 4QSQA 4TT2A 5FE7A 5JI8A 4NRCA 4IORA 4PS5A 4UIWA 5CQ8A 2NXBA 5D3PA 4QUUA 4YYGA 4PTBA 5E7DA 5A5PA 4N4HA 4Q0OA 4UYEA 2YEMA 1N72A 5HQ6A 2DKWA 4A9JA 5DYUA 4OGIA 5DFDA 3U5OA 4O78A 4WIVA 4NYXA 4O7EA 4N3WA 5A5NA 4NR4A 5KHMA 5H1VA 4CUQA 3IU5A 4ZQLA 3P5OA 2E7NA 5DY7A 2L84A 4A9FA 4TQNA 5BT4A 3UVYA 5I29A 4O7CA 5EV9A 4J1PA 1ZS5A 1X0JA 4MENA 4QB3A 4LYIA 5E9VA 5C85A 5TB6A 5EWCA 4BW2A 4LYSA 3I3JA 4BHWA 5D3NA 5D25A 4Z1SA 4CLBA 4QR3A 5CQTA 5II1A 3QZVA 4QZSA 4QSRA 4MR3A 4TYLA 5DKHA 3P1FA 2YEKA 5I86A 5DW1A 4J0SA 5L97A 4YBSA 5IIDA 5I83A 4YH3A 5CUAA 4A9HA 4QY4A 5EGUA 5E3DA 5EM3A 5CQ7A 4O77A 4CUPA 5DFCA 5ENEA 3UV5A 2DVRA 5LKUA 5G4SA 5L8TA 4QYDA 5IGLA 4QEUA 4HXPA 1WUGA 5DYAA 5F1HA 4A9IA 5LKXA 4YAXA 5FE3A 4O71A 5L99A 5F1LA 5AMEA 3LJWA 4UIVA 5CY9A 4CUTA 2R0YA 4OGJA 4HBYA 5F5ZA 2E3KA 5ENGA 3O36A 2GRCA 5E9KA 5ETDA 5ENFA 5I89A 4UYDA 3LQJA 4LYWA 4GPJA 5FG5A 3LQHA 3P1EA 5DKCA 3Q2FA 5FB1A 5KTWA 4PKLA 4ALGA 4N4FA 3HMHA 5CTLA 5C87A 5EWDA 5HFQA 5A5RA 5L98A 3MB3A 4YBMA 5EI4A 4O7BA 5LUUA 5KO4A 2I8NA 5E9YA 5LVQA 4IR5A 1EQFA 4LR6A 2RFJA 5IGKA 4NRAA 4NQNA 3D7CA 4QBMA 5D3SA 3O37A 5FE9A 5CRMA 5CS8A 2DVSA 5C4QA 5I80A 1E6IA 5DYXA 2YELA 4UYGA 2LSPB 4HXMA 4IOQA 4MEQA 5EP7A 4LZ2A 3DAIA 3O34A 5CUBA 4HBVA 4QNSA 5E9LA 5EWHA 2D9EA 4O72A 5E73A 5F61A 4N4IA 3S92A 5EPRA 5CGPA 5E74A 4IOOA 4HXNA 4IR4A 4E96A 5FH6A 2R0VA 4ZW1A 5HENA 5FBXA 5HJCA 5ACYA 5CQ6A 5HRXA 4RVRA 2DATA 5FB0A 5LJ2A 4HXKA 4A9MA 5I7XA 2DWWA 4YY4A 5FG6A 5CUGA 2N9GA 4NUCA 5FH8A 4NR5A 4KV1A 4UIXA 5I1QA 5EK9A 5DKDA 5IBNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5IG6A 5D3TA 5EISA 3S91A 3JVKA 4O76A 5HELA 5DLXA 4YYNA 4TU4A 2OO1A 4NS5A 2L85A 4C67A 5HQ5A 4YH4A 5A5QA 2RNWA 3QZSA 5FFVA 3RCWA 3VKGA 5CZGA 1WUMA 5CFWA 3DWYA 4WHWA 5FE5A 2OUOA 3UVDA 4YC9A 4NR8A 4CUSA 1F68A 5DBMA 4PY6A 3NXBA 4QYLA 5CQ4A 5KTUA 3Q2EA 4UIYA 4NUEA 4QSWA 4Z93A 5LKZA 5F36A 4UYFB 4CFKA 4Z6HA 5F25A 4AKIA 2RNYA 4DONA 4AI6A 5HEMA 5FDZA 5LVRA 2RS9B 5A7CA 3G0JA 3QZTA 2OSSA 4QC1A 4XUAA 2DVQA 4YYKA 5ETBA 4ALHA 4NR7A 5F3AA 5H85A 4KCXA 3U5MA 5E9IA 5FG4A 5I40A 4A9LA 4HXOA 4YYIA 5FE6A 1PUOA 2KTBB 5CU8A 4QR5A 4A9NA 5HM0A 3TLPA 2G4AA 5FFYA 3UVWA 5EA1A 4CUUA 4NYVA 4O75A 3SVHA 5AD2A 5F62A 3UV4A 5I88A 5LJ1A 3G0LA 5CUDA 5FE2A 3U5LA 5KTXA 4NR9A 4UYHA 3ZYUA 4UIUA 2L5EA 2YDWA 3AQAA 4YADA 5C89A 5BT5A 5HQ7A 4YYJA 4YATA 4TU6A 5HFRA 2RI7A 1JM4B 5CUCA 2I7KA 3U5KA 5L96A 5J0DA 5HRWA 5A81A 4AKNA 5F63A 4A9KA 4QEWA 5D3LA 4QSUA 4NYWA 3JVLA 4A9EA 5D26A 5II2A 3FKMX 5D3HA 2F6JA 4CURA 5LJ0A 5FE4A 5LKTA 3LXJA 5JWMA 3UV2A 4NUDA 5ENJA 4MR5A 5COIA 4TTEA 4UIZA 4YY6A 5ENIA 4QSXA 5A82A 4TS8A 5D7XA 4HXLA 4XYAA 4CFLA 5CQ5A 4HXSA 4ZC9A 4C66A 5D24A 5K29A 3SVGA 3U5NA 4QSTA 4Y03A 5DLZA 5L8UA 4X2IA 5D3JA 3MB4A 4N4GA 4WHUA 3HMEA 4PCIA 4QSPA 3U5JA 4YABA 4Z6IA 4PCEA 5CP5A 5EWVA 4LRGA 3MQMA 4NR6A 5FH7A 5I7YA 4AKHA 5FE8A 4TT6A 5IGNA 3D1BA 4XY8A 4IR3A 5A5SA 5EQ1A 5A85A 2D82A 4BW3A 2E7OA 5C8GA 3O33A 5TCMA 5D3RA 2YYNA 4MEPA 3LQIA 5D0CA 5EU1A 2YW5A 2R0SA 5FE0A 4LZRA 1ZKRA 3HMFA 4KV4A 5E0RA 4LC2A 5E9MA 4YYHA 2H60A 2RNXA 3K2JA 5EPBA 5EWWA 4UITA 5F60A 4O70A 4A9OA 4BW4A 3UVXA 4J0RA 5H1TA 3AADA 4XUBA 5ENCA 3P1DA 4TT4A 3MUKA 5DYCA 5EPSA 3GG3A 4Z1QA 5DFBA 4LZSA 4MEOA 4YYMA 4QUTA 5HLSA 2WP1A 3UW9A 4O7AA 5E3GA 3IU6A 5DW2A 5H1UA 5BT3A 5CQ3A 5KU3A 3MULA 4QC3A 5CQAA 2WP2A 3JVJA 5F2PA 4F3IA 4YYDA 5IGMA 2F6NA 4QSSA 4TZ2A 4IR6A 3SVFA 5FE1A 4BJXA 4MR4A 3O35A 2YQDA 2MJVB 5C7NA 4HBWA 4NQMA 5EICA 4HXRA 4QR4A 4QSVA 5CUEA 4BW1A 2R10A 3P1CA 4O7FA 4NRBA 2DVVA 4YK0A 2EJNA 5DX4A 1JSPB 2RO1A 4XY9A 4J3IA 4NXJA 4MR6A 4O74A 2FSAA 4HBXA 4QEVA 3ONIA 3JVMA 5G4RA 4CL9A 5HRVA 5ENHA 5CRZA 5CPEA 3MXFA 4FLPA 4OUFA 3U5PA 5A83A 4UYFA 4LDFA 5EVAA 4YBTA 5HCLA 5AMFA 4Q0NA 5AD3A 5ENBA 5FFWA 4TZ8A 5A5OA 4QSQA 4TT2A 5FE7A 5JI8A 4NRCA 4IORA 4PS5A 4UIWA 5CQ8A 2NXBA 5D3PA 4QUUA 4YYGA 4PTBA 5E7DA 5A5PA 4N4HA 4Q0OA 4UYEA 3D1DA 2YEMA 1N72A 5HQ6A 2DKWA 4A9JA 5DYUA 4OGIA 5DFDA 3U5OA 4O78A 4WIVA 4NYXA 4O7EA 4N3WA 5A5NA 4NR4A 5KHMA 5H1VA 4CUQA 3IU5A 4ZQLA 3P5OA 2E7NA 5DY7A 2L84A 4A9FA 4TQNA 5BT4A 3UVYA 5I29A 4O7CA 5EV9A 4J1PA 1ZS5A 1X0JA 4MENA 4QB3A 4LYIA 5E9VA 5C85A 5TB6A 5EWCA 4BW2A 4LYSA 3I3JA 4BHWA 5D3NA 5D25A 4Z1SA 4CLBA 4QR3A 5CQTA 5II1A 3QZVA 4QZSA 4QSRA 4MR3A 4TYLA 5DKHA 3P1FA 2YEKA 5I86A 5DW1A 4J0SA 5L97A 4YBSA 5IIDA 5I83A 4YH3A 5CUAA 4A9HA 4QY4A 5EGUA 5E3DA 5EM3A 5CQ7A 4O77A 4CUPA 5DFCA 5ENEA 3UV5A 2DVRA 5LKUA 5G4SA 5L8TA 4QYDA 5IGLA 4QEUA 4HXPA 1WUGA 5DYAA 5F1HA 4A9IA 5LKXA 4YAXA 5FE3A 4O71A 5L99A 5F1LA 5AMEA 3LJWA 4UIVA 5CY9A 4CUTA 2R0YA 4OGJA 4HBYA 5F5ZA 2E3KA 5ENGA 3O36A 2GRCA 5E9KA 5ETDA 5ENFA 5I89A 3VKHA 4UYDA 3LQJA 4LYWA 4GPJA 5FG5A 3LQHA 3P1EA 5DKCA 3Q2FA 5FB1A 5KTWA 4PKLA 4ALGA 4N4FA 3HMHA 5CTLA 5C87A 5EWDA 5HFQA 5A5RA 5L98A 3MB3A 4YBMA 5EI4A 4O7BA 5LUUA 5KO4A 2I8NA 5E9YA 5LVQA 4IR5A 1EQFA 4LR6A 2RFJA 5IGKA 4AKGA 4NRAA 4NQNA 3D7CA 4QBMA 5D3SA 3O37A 5FE9A 5CRMA 5CS8A 2DVSA 5C4QA 5I80A 1E6IA 5DYXA 2YELA 4UYGA 2LSPB 4HXMA 4IOQA 4MEQA 5EP7A 4LZ2A 3DAIA 3O34A 5CUBA 4HBVA 4QNSA 5E9LA 5EWHA 2D9EA 4O72A 5E73A 5F61A 4N4IA 3S92A 5EPRA 5CGPA 5E74A 4IOOA 4HXNA 4IR4A 4E96A 5FH6A 2R0VA 4ZW1A 5HENA 5FBXA 5HJCA 5ACYA 5CQ6A 5HRXA 3ERRA 4RVRA 2DATA 5FB0A 5LJ2A 4HXKA 4A9MA 5I7XA 2DWWA 4YY4A 5FG6A 5CUGA 2N9GA 4NUCA 5FH8A 4NR5A 4KV1A 4UIXA 5I1QA 5EK9A 5DKDA 5IBNA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5IG6 A;  5D3T A;  5EIS A;  3S91 A;  3JVK A;  4O76 A;  5HEL A;  5DLX A;  4YYN A;  4TU4 A;  2OO1 A;  4NS5 A;  2L85 A;  4C67 A;  5HQ5 A;  4YH4 A;  5A5Q A;  2RNW A;  3QZS A;  5FFV A;  3RCW A;  5CZG A;  1WUM A;  5CFW A;  3DWY A;  4WHW A;  5FE5 A;  2OUO A;  3UVD A;  4YC9 A;  4NR8 A;  4CUS A;  1F68 A;  5DBM A;  4PY6 A;  3NXB A;  4QYL A;  5CQ4 A;  5KTU A;  3Q2E A;  4UIY A;  4NUE A;  4QSW A;  4Z93 A;  5LKZ A;  5F36 A;  4UYF B;  4CFK A;  4Z6H A;  5F25 A;  2RNY A;  4DON A;  5HEM A;  5FDZ A;  5LVR A;  2RS9 B;  5A7C A;  3G0J A;  3QZT A;  2OSS A;  4QC1 A;  4XUA A;  2DVQ A;  4YYK A;  5ETB A;  4ALH A;  4NR7 A;  5F3A A;  5H85 A;  4KCX A;  3U5M A;  5E9I A;  5FG4 A;  5I40 A;  4A9L A;  4HXO A;  4YYI A;  5FE6 A;  2KTB B;  5CU8 A;  4QR5 A;  4A9N A;  5HM0 A;  3TLP A;  2G4A A;  5FFY A;  3UVW A;  5EA1 A;  4CUU A;  4NYV A;  4O75 A;  3SVH A;  5AD2 A;  5F62 A;  3UV4 A;  5I88 A;  5LJ1 A;  3G0L A;  5CUD A;  5FE2 A;  3U5L A;  5KTX A;  4NR9 A;  4UYH A;  3ZYU A;  4UIU A;  2L5E A;  2YDW A;  3AQA A;  4YAD A;  5C89 A;  5BT5 A; 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