4ISDA

Crystal structure of glutathione transferase homolog from burkholderia gl bgr1, target efi-501803, with bound glutathione
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
211
structure length
187
Chain Sequence
SQKPITLYVGADYVSAFAMSAFVVLKEKGLDFEIRTVDLKSKQQEVSLTRRVPTLQHDRFTLSESSAIAEYLDEVYPAPHYAAVLPADRETRALARQLQAWIRSDFMPLGEAAQLACEKLLSAADRLIDDERYGVFGDWCIADTDFALMLNRLVACGDPVPPKVLRYVERQWARPSVQQWVKQKRDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of GLUTATHIONE TRANSFERASE homolog from BURKHOLDERIA GL BGR1, TARGET EFI-501803, with bound glutathione
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase
molecule tags Transferase
source organism Burkholderia glumae
total genus 65
structure length 187
sequence length 211
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14834 GST_C_4 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4isdA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4isdA01
3RPNA 2FD3A 2M46A 4IGJA 5CRGA 5F05A 1SD9A 4IJIA 4TR1A 5ECPB 5D9VA 4TVEA 3EVIA 2A4VA 4JR4A 5IPGA 3HVXA 4TW5A 2RLIA 3FZAA 4XRAA 2FNOA 2IMIA 2YWIA 1GTAA 5ECQB 1FB0A 1B4QA 2BMXA 4MZCA 2VCQA 3VWWA 1ON4A 3H8QA 3QAGA 3BJ5A 1DUGA 1UVZA 5IO0A 2IMEA 3L9VA 2FCHA 1X9MB 2K18A 1R26A 3CBUA 5KN0A 4BA7A 1XWAA 3TKQA 3IK7A 1OC9B 4MJEA 4F03A 5E4WA 2VCVA 2VAFA 4WBJA 1AW9A 2YV9A 2HSYA 1K3YA 2LSTA 2VCTA 5HR0A 1KNGA 1FW1A 3CTFA 3G7YA 4LL4B 3WGDA 3DYRA 1PGTA 1ERTA 4PQ1A 3EYTA 4WR4A 1NSWA 2L57A 2IMFA 4ECBA 1ZYEA 1XVQA 5B6NA 5ENUA 2LKUA 3J7Yk 3M9KA 2PERA 3HA9A 1SKSB 2FGXA 3VLNA 1GWCA 3F4TA 4IQAA 1YQ1A 3H79A 2O8VB 2UZ8A 1C72A 2WZ9A 4WEYA 1T3BA 5A5KA 1EZKA 3HZ8A 3RBTA 4ZBAA 1J0FA 2C0DA 1PKWA 2GQLA 2M80A 2VD0A 2EIRA 1AQVA 2NDOA 4IVFA 2HXKA 17GSA 5G30A 3O3TA 2A2SA 10GSA 4QQ7A 5FHIA 2IIYA 1Y6EA 3HJOA 1X9WB 3LYKA 3IPZA 3GL3A 2GDRA 2C1YA 1XPVA 5A4UA 3F4SA 4Q5RA 1K0BA 1NW2A 5DDLA 3RHBA 2IN3A 2X8GA 1Z9HA 1A23A 3ZYWA 2B6MA 3ERGA 4MZBA 3WT2A 4J56E 4MH2A 4GRFA 4IHUA 1T8EB 3CRTA 5HFIA 4AJ8A 4N10A 5D96A 2A2RA 3PINA 5ECSA 3GYKA 2C8UA 2H73A 3JCML 1DBYA 4ILFA 11GSA 16GSA 3ME8A 1B8XA 3QAVA 3F0IA 3IXRA 3P7XA 1B48A 2VIMA 5H5QA 1SL1B 2J23A 3LG6A 5GAND 1K0MA 2YZHA 1U6TA 1FVJA 1UA5A 2LRTA 2ZUPA 1TU7A 3UOMA 1FB6A 2XHFA 4V1Ap 2O87A 4PXOA 4GCIA 1FVKA 3CTGA 4JEDA 1GTIA 2G2QA 3S9FA 1X5CA 4ISDA 2P31A 1TK5B 1GTBA 4P3YB 1O81A 4F0CA 1K0DA 4EDZA 2WULA 1BJXA 3GL5A 2WJUA 1ERWA 1XVWA 3F63A 2JSYA 2GS3A 3UAPA 3FK8A 3GKMA 2B5EA 2L6CA 2HZEB 3ZLPA 2H74A 4H86A 2IWTA 5AIVA 4J57E 1G6WA 1M2BA 4ZXGA 2C4JA 3CXGA 3F3RA 4OFTA 2HFDA 3IV4A 2AYTA 1XOBA 3QFAC 1F9MA 3HJPA 1EGRA 2FLSA 2FWFA 1AXDA 2E2GA 3N9JA 3GA4A 4OFMA 2NPBA 4ZL8A 3TKRA 2I81A 3GSTA 1JZRA 3CSIA 3C73A 5H5RA 1DSBA 1OVNA 3D5JA 3CYNA 4I8BA 3HD5A 6GSWA 4TRXA 1TJDA 5ECMB 3UVTA 2I4AA 1WP0A 2VL2A 2X64A 3EMXA 3IR4A 2H66A 3LXTA 4AJ6A 2FWEA 1TI1A 3HKRA 2OE0A 5F0GA 5IOXA 1A8LA 3DGQA 2RM5A 2GSSA 3I9V2 5CO3A 2RM6A 2EIQA 4KUNA 4FH8A 1R5PA 2DSAA 4L5LA 2HRFA 5BMUA 3E3EA 1RW1A 1XOAA 3TJJA 3KM6A 4ACSA 1TDIA 4HEA2 3NOFA 5FT3A 1GSUA 1VF3A 3Q6OA 5JCWA 1QK8A 2GSQA 1TTZA 3ZTLA 5JWOB 5C00A 3Q18A 2L59A 2H19A 4YQMA 4D73B 2H0HA 5J5NA 1A0FA 1SKRB 3TOTA 4O92A 4O5RA 3KXOA 4NHWA 4TR1B 3TDGA 3FZ4A 3I69A 3GSSA 2B7JA 1GP1A 5AIXA 4BPYA 1SJZA 2IMDA 2YWOA 1TXXA 3DKSA 2HLSA 5G5FA 1ERUA 3FW2A 4XRDA 4G2EA 4K0GA 1HYUA 1EP7A 4GSNA 3ZMLA 2GQKA 1GNWA 3IK9A 4HI7A 3M3MA 4WR5A 1AUCA 1GUMA 2B1LA 3EU4A 1I5GA 5B7CA 1O85A 2JU5A 3QMXA 3QAWA 2ON7A 2L6DA 2HRKB 2DJKA 3F8UA 2JZSA 3FZ9A 3RPPA 5IMDA 4ECIA 1V9WA 1UC7A 3VWXA 4GQFA 2C0GA 4ZBDA 4MPFA 1V40A 3KIJA 1JLWA 3V1WA 4X0XA 1K0AA 4L0WA 1CQHA 4F0BA 3RAZA 2WRTA 1JFUA 1T4YA 3TJKA 4MLYA 3BOAA 1JLVA 1NHYA 4TR3A 3ERWA 6GSSA 1SKWB 3LYPA 2QC7A 1EWXA 3GFKA 3LJRA 5AN1A 4HU9A 3DVWA 4RI7A 6GSXA 1TRSA 5D9TA 5ELGA 1O8XA 2LJAA 3IDVA 4F9ZA 4GF0A 3SWLA 2K8SA 3MWHA 2H1AA 3KMNA 2GT6A 3VPTA 1YDKA 5EVOA 3TKSA 1PD21 2B3SA 5IMAA 1THXA 3HY2A 3ZITA 2VO4A 1SL2B 3LSZA 2ZCTA 2GGTA 1USBA 4K2DA 4FO5A 4NHZA 1WMJA 2LJRA 1B9XC 1BG5A 1F2EA 2NBSA 2H70A 4HQZA 4K9ZA 3EWLA 3GN3A 1ERVA 2R3XA 1TRVA 1V98A 3IE3A 1A0RP 2X8CA 2QGVA 4I6XA 4XHMA 3KH9A 2M72A 4BVXA 4I97A 5LCZA 2YV7A 1QFNA 6GSVA 1SK2A 3DMLA 4KX4A 3UBLA 4CHSA 3TRXA 1XFLA 3U6VA 5CRWA 4IKHA 1BEDA 2CQ9A 2C0EA 2MYGA 1SU9A 4TR0A 3IAS2 2N5FA 5F8BA 4POLA 3DRNA 4G0KA 4XCSA 3A5WA 2Z9SA 1EGOA 1URMA 4OO5A 3MNGA 4LMVA 3L0HA 4TOPA 4HDEA 2YJHA 4GQCA 2H01A 1LBKA 2VUPA 2P5RA 2ZNMA 4NXIA 3TUEA 2HRKA 2K9FA 1WPIA 5ID2A 2MMOA 1A2LA 4RUVA 2XBQA 3FYGA 2AHEA 1Z6NA 5F06A 3G7JA 18GSA 3L9SA 2B7KA 2BJXA 3SBCA 3PH9A 5LNKe 3E0UA 1GSYA 1RK4A 3PR8A 2F8AA 2CX3A 4PQIA 4IELA 4TXVA 1X9SB 7GSSA 4GSTA 2K6VA 3M0FA 3AY8A 1I9DA 2MMAA 2DBCA 4FIWA 4JBBA 22GSA 1U87A 3KD0A 5DCHA 2L5OA 1GTUA 4E8HA 3DEXA 5ECIB 1Z3EA 3APSA 3QD9A 1X5DA 2TRXA 1J9BA 1VGLA 2E0QA 1BQ7A 2BTOT 5ECRB 1ABAA 3H4KA 3GTUA 3QDNA 1EOGA 1ACVA 5CAXA 5EL8A 3QOUA 3HZ4A 5J9BA 1A8YA 8GSSA 4X43A 3E9JB 2DLXA 4OCEA 1O8WA 2GLRA 5C04A 4OMVA 3ZIVA 4EVMA 4OO4A 3CMIA 2IPAA 4HJMA 2GZYA 5J41A 1SK1A 3FEUA 4XS4A 2YN1A 3GURA 4ID0A 3GX8A 2GTUA 3KCMA 1XW9A 3US3A 3GH6A 5B8BA 2PBJA 3ZREA 2PPTA 5DJMA 3ME7A 1PX6A 3TCOA 3MSZA 1AIUA 2E2MA 4HQSA 5CRHA 1X5EA 4DVCA 2IMKA 5HFKA 2E7PA 4MP4A 5E59A 3FR3A 2R37A 4FYBA 1F3AA 2VOCA 2L5LA 1VF4A 5ECOB 4LA1A 1WOUA 5CNWA 1QUWA 5HFGA 4POBA 2XC2A 1THOA 4KE3A 1SJ6A 2DJ0A 2PU9C 3LWAA 2VL3A 2OBIA 3WT1A 4YH2A 1ZOFA 4NMUA 4MF7A 1XWKA 4BWQA 2VLTA 1EEMA 5JCGA 3A2XA 2LRNA 2WFCA 1V57A 2LQOA 2LTKA 1TI3A 5AISA 1S3DA 2IFQA 3C7MA 3ZMKA 5ECKB 3WYWA 4KAEA 2P5QA 5DCGA 3KTLA 2MMZA 3BD2A 1XW5A 2VCZA 2VLUA 1FHEA 5AGYA 1EEJA 4KH7A 2CZ2A 2PVOC 2VD1A 1ZMAA 2GSTA 2I3YA 4HZ4A 2CVKA 1ZL9A 4MJBA 2F3MA 5GSSA 4KDUA 1WRYA 4EF0A 1Z7RA 2GQMA 1BAYA 2TIRA 3UVHA 2YOIA 3FY7A 1OYJA 3NZNA 4GTUA 4BVYA 1G7EA 4NV2A 1GL8A 5DAKA 1T7PB 1J08A 4OCFA 2NTOA 1KTEA 3P90A 2AV4A 1R7HA 1Z7PA 5ECNB 2PUKC 1ZYQB 3BCIA 4ZB8A 2YJ7A 5J4UA 4QL9A 4EO3A 3D0ZA 2HI7A 1ST9A 3IAM2 3FRCA 2GT5A 1R5AA 4ZL7A 1JHBA 4L0UA 4EDYA 1T4ZA 2OE3A 4ML1A 3UBKA 3LEFA 1GSFA 4JZQA 5EY6A 3LXZA 5B8AA 2VCWA 3K8NA 3GKKA 3F3QA 4ZIJA 4MH3A 2XBIA 5IMCA 2F9SA 1OKDA 3F6DA 1YEPA 4FYCA 1TRWA 3GKXA 2MZCA 1HNCA 2HRAA 1T1VA 4NWYA 4L8EA 2KHPA 4MDCA 5DQSA 1K0CA 4HZ2A 4NPBA 4WETA 2LV3A 2B5YA 4QL7A 4ML6A 5ABRA 3PGTA 5IO2A 2C80A 3ZL5A 2F51A 1EV9A 4KW6A 3W8JA 4NAXA 1KEBA 2DJ3A 1XWBA 3IRAA 1G0TA 4KNDA 3KZQA 2YP6A 3G9BA 1Q98A 4BVXB 3WD6A 5HR3A 1M0UA 4ZL9A 2HT9A 3HDCA 5D73A 2FUG2 1GNEA 5L71A 3MAKA 5HR1A 2XPEA 2AB6A 1AQXA 4MZWA 2D2ZA 1XBSA 3VWVA 4TN8A 1OKTA 2WDUA 2FWHA 2YWMA 1M9AA 2HQTA 4Q5FA 5DBQA 3GHAA 4IN0A 1RQMA 3HCZA 1V2AA 3P8WA 2VM2A 2CA8A 1W4VA 4E8EA 3VI7A 4K7NA 1JZDA 1YY7A 19GSA 4GXZA 5ID2B 2VCXA 3KP9A 3BCKA 2GZZA 1NHOA 1Z6MA 3C71A 3UEMA 4DSQA 1XWGA 3HYPA 4MPGA 4DSSA 4K8MA 5IMFA 1XWCA 3RDWA 3GKNA 4MF6A 9GSSA 5GSTA 1B9YC 1HNBA 2B5XA 4V1Ag 2X99A 2AJQB 4I2TA 3CRUA 3DWVA 4N11A 1GSDA 1S3AA 3KGKA 4KA0A 4I2UA 2LS5A 1O7UA 3UIWA 4GSSA 3F9UA 2JZRA 2RUEA 4RI6A 1EV4A 3GTUB 2KUCA 12GSA 2YANA 2NVLA 5G1KA 3W6GA 2HE3A 3I43A 3EURA 3O76A 2V32A 1H75A 4LL1B 5KN3A 1GUKA 1O6JA 5CRDA 1PQNA 2OBKA 2ES7A 1EOHA 2J9HA 2VL9A 3D22A 5KN2A 1ML6A 1YKCA 2EIOA 1QXHA 1PX7A 2V2GA 3EC3A 4MMMA 1TU8A 1K0OA 4IW9A 1GUHA 1YF1A 2LNTA 4XS4B 4KDXA 3VPQA 3A3TA 4DEJA 2TRCP 2VL2C 2FA4A 3ZVJA 2LJKA 1YEXA 4LLRA 3BBYA 2P0GA 1N8JA 3PPUA 2EC4A 2HSHA 4KCAA 2PMTA 3A2VA 4K6XA 4KSOA 4OWYA 3Q74A 5CP1A 5G1LA 5ECHB 2RUFA 2C3NA 3IBHA 2JZTA 2OJLA 4XIHA 1QQ2A 1W89A 2MBTA 2XPDA 1OC3A 2R2JA 5HQPA 1GSEA 1H4OA 2FHEA 5DALA 2H6XA 5IMVA 2V41A 4IS0A 2OADA 20GSA 1TP9A 3TJBA 3R2QA 4N0VA 1MDIA 2DC5A 1SK0A 2GZPA 3FZ5A 1TOFA 2IFQB 4PGTA 2V6KA 1LU4A 4TKYA 4K0NA 4WBRD 1WJKA 1WWJA 1YKAA 2C0FA 4IP1A 14GSA 1PRXA 1MEKA 4ULXA 4XS1A 1S3CA 5G5EA 4PQHA 4CW9A 1GLPA 1PL2A 5D93A 4G9HA 1F37A 4WF5A 5COHA 4NV5A 5D9WA 1IYIA 4BWSA 1GLQA 2H30A 4MK3A 4TXOA 4BVYB 3RHCA 5DAKB 1A24A 4PUAA 3GRXA 3GMFA 4IBPA 1SD8A 1AC1A 4G10A 3ED3A 4I5QA 4Q5QA 2LQQA 3EU3A 2B1KA 4EUYA 4J2FA 1B4PA 4ZBBA 5DQYA 2MMNA 2H6ZA 4MF5A 2YCDA 5JCUA 4KF9A 1YJ6A 1BX9A 2GSRA 3ZRDA 1Y25A 3N5OA 3ZVJD 1M7TA 3UL3A 2REMA 5F07A 3C1RA 1GH2A 3IC8A 2KLXA 4YAPA 1F3BA 2N5AA 3APQA 4USSA 1YZXA 1AAZA 2DMLA 5KEJA 2ON5A 1HQOA 3ZIJA 2H72A 1TK8B 3IOSA 3TB2A 1E6BA 3GV1A 2O7KA 2QSIA 5A4WA 4V2LA 2IJYA 3TKSC 3WGXA 3F6FA 4JU5A 4G0LA 4IP6A 2K8VA 3J7Yb 3KP8A 3HVVA 1HNAA 1XIYA 3HJMA 3W8SA 1GRXA 4AJ7A 1Z5YE 2PWJA 1OC8A 1SYRA 1MDKA 2DJJA 1U3IA 2FWGA 3VI5A 3DD3A 1FOVA 3LFLA 4YAVA 2OKAA 1MD3A 2H0GA 1UN2A 4POKA 3M9JA 4PX1A 4K1FA 5DJLA 2CT6A 3H1NA 5JWQB 5ELAA 4O7HA 2YNXA 5CREA 5IM9A 1XXUA 2YPMA 4PNGA 5IPHA 4PURA 3EINA 4AGSA 3HVSA 4MABA 5DVBA 4AF2A 2OA7A 3IA1A 1JZOA 1M2DA 3D4TA 1OE7A 1U3AA 1G7OA 1OE8A 1SENA 6GSUA 2HSNB 4OFNA 3KEBA 5EPFA 5IIZA 1TRUA 1G6YA 2DJ2A 2DJ1A 4YQVA 4V2MA 4K7OA 1K3LA 2C3QA 3IC4A 3TRPA 2HYXA 3TGZA 1WIKA 1OC9A 4HUAA 2V6OA 5J3RA 2GVPA 1E2YA 1R4WA 3TJFA 1DE2A 3UJ1A 3EE2A 1WE0A 4MJCA 2R6KA 2MBSA 4ZILA 3QR6A 4Z7XA 4WKWA 3G7IA 3TOUA 1AQWA 2JL4A 3UARA 1OAZA 5GAPD 4KGIA 2YZUA 5IOWA 4MCUA 1PN9A 1TKDB 3GX0A 4IQ1A 4DSSB 3FR9A 4FQUA 4WXTA 2CZ3A 3H93A 2CAQA 1VF2A 3GNJA 1EP8A 5IMZA 3M8NA 4ECJA 2O89A 3U5RE 3CSHA 1LJRA 3D6IA 2G0FA 1CQGA 1MTCA 1A2MA 3GIXA 3ERFA 1HD2A 2AUVA 13GSA 1TK0B 5JWRB 4XS6A 5INYA 4KCEA 3M1GA 1N2AA 2H75A 3KTBA 2H76A 3DIEA 3LORA 2PGTA 2I1UA 4N0ZA 2HRNA 2H71A 4BL7B 1BYEA 2PVQA 2HNLA 4EC0A 1FAAA 6GSTA 4EL1A 2O85A 2CVBA 3HXSA 3GH9A 4GLTA 3R3EA 1F6MC 1M99A 3ZFBA 4V2NA 3QPMA 2DMMA 1O73A 4EXJA 1TW9A 1A2JA 2HSMB 3OR5A 3VURA 4G0IA 4POMA 2LNSA 3EMPA 1SYXA 3KMOA 4WF4A 1K0NA 3D21A 2QKEA 4DSRA 5FWGA 5D9XA 3ISOA 3TRQA 1KBNA 3C1SA 3TKSE 3UMAA 3FR6A 1V58A 1VRSD 1FG4A 1QMVA 2H1DA 3DVXA 1K3OA 5KN1A 3WGEA 4YQUA 4F2IA 3FKFA 5CYYA 1ZGNA 1PKZA 4KDYA 2X8HA 5GZZB 2LEGA 1U88A 3P2AA 3GUSA 3KJYA 2WB9A 5IQYA 5G2ZA 2LRCA 4EKZA 4L5OA 5D8IA 5G31A 2WCIA 3DXBA 1SJIA 2JSZA 1FO5A 4LMWA 5H5SA 5A4VA 4GWRA 1GSQA 2FY6A 5DALB 4ZB6A 1ZCPA 1MD4A 3C8EA 3MDKA 4O32A 2H1GA 2YWNA 1PMTA 2JACA 1IYHA 1X0RA 3ZFLA 4Q5NA 4RQXA 2FA8A 4K7IA 2CX4A 3VFIA 4XTSA 3L78A 2KOKA 4X1UA 1XW6A 4JRRA 4KB3A 4IJ3A 3ZZXA 2CV4A 3QCPA 4MJAA 1QGVA 4PTSA 2HZEA 2L4CA 1T00A 2F8FA 4PNFA 4EE0A 4HOJA 3VK9A 4ZB9A 2CAIA 2OE1A 2IL3A 2R5GA 3I6AA 2CVDA 2H1BA 3KH7A 3APOA 3A2WA 1ZZYA 2KP2A 3QFBC 2H8LA 1PSQA 4TXOB 2HZFA 2N5BA 2VM1A 6GSYA 3O6TA 4HJ2A 2I9HA 2ALBA 3IHQA 5HR2A 3F4RA 5ECLB 2H6YA 1MDJA 1XCCA 1DE1A 4BL7A 1GSSA 2V1MA 4MA9A 2DIYA 3Q19A 4TR4A 1VF1A 5B6MA 2AAWA 2JADA 4PUFC 1XZOA 1PA3A 1JZWA 1SL0B 1Q4JA 2HSMA 3LGCA 4JE1A 3LQ7A 2WGRA 3FHKA 2DIZA 3HHVA 2H0IA 3TJGA 4FYUA 2LUSA 2R4VA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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