4ISFA

Human glucokinase in complex with novel activator (2s)-3-cyclohexyl-2-(6-fluoro-2,4-dioxo-1,4-dihydroquinazolin-3(2h)-yl)-n-(1,3-thiazol-2-yl)propanamide
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
457
structure length
428
Chain Sequence
KPMPLTLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKACMLGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Design, synthesis and SAR of novel glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase activator
total genus 159
structure length 428
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4isfA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4isfA01
1NWKA 3J8AA 4H0YB 4KBOA 4CZHA 4RCHA 4BQLA 1JCEA 3EL2A 1KAZA 5AQGA 1X3MA 1XC3A 2P9LA 3VOVA 4FO0A 2CH5A 2P9NA 4YDUA 5BPLA 3O5BA 5ADXA 3ZEUA 3LDLA 3BF1A 4CZKA 1C0GA 4K25A 3VF6A 4H5RA 1DEJA 4CZMA 5LY3A 4H0TB 4FOEA 3ZX3A 3A5OC 3VPZA 2GTDA 1H1VA 5BPNA 1CZAN 2E2QA 4IJNA 5BREA 5AQFA 3WXIA 2P9KA 4Z94A 3W3DA 4B1UB 1GLAG 2P9LB 5FPEA 3B8AX 3FZHA 3LDNA 4BVOA 2P9NB 3LDQA 3EZWA 4C23A 2Q1NA 5EY4A 3QBXA 1JCGA 4GNIA 3ZEUB 4DCHA 2ZGZA 4H5WA 2NLXA 3WQTA 1KXPA 4CZJA 3W0LA 2Q36A 3KZBA 2YCHA 2A42A 4XH4A 2F9WA 3VETA 3RSEA 1NGIA 3GOIA 4FSVA 4EHTA 3ID8A 5EVZA 3GDQA 3FLCO 5AQXA 3FGUA 4H5TA 4M7YA 4DHYA 2P9KB 5EXWA 4IWVA 4FWMA 2W41A 2V7YA 4JNEA 4B1WB 4B9QA 4BG8A 1BOTO 2ASMA 1MDUB 1Z05A 2W40A 3H6EA 1DGKN 2WUSA 3MCPA 4BR7A 5JMVA 2D1KA 2PAVA 1Q18A 5AQTA 4FL9A 3FFKB 3MMVA 5JLHA 3UE5A 5AQJA 4CI6A 1BUPA 5AQZA 1QQOA 4BRIA 4BC4A 2FSJA 5BN9A 3SJHA 3HI0A 3O08A 3IDHA 4FPBA 5I9EB 4RWTA 3GBTA 4K43A 2QWPA 4BG9A 3P4IA 4WYBA 4B1YB 3BUZB 4MLHA 4XEIA 4M7XA 5F0XA 3O8MA 1BG3A 2E1YA 1EQYA 5E26A 5AQLA 4ISEA 3ENOA 4MLEA 3HTVA 1NGJA 4I6MA 5BRHA 2HOEA 3H46O 5CE3A 4K41A 5FPMA 3R9PA 1BU6O 3CERA 3WT0A 5AQVA 1J6ZA 4WQ4C 3VEVA 2H3GX 3WXLA 2YI1A 1BDGA 1R59O 2GEMA 3KHYA 1U2VA 4PKGA 2QW9A 1HKBA 3EKSA 1GLEG 3S41A 3O4WA 2VCPA 3WUHA 5LJVA 3L4IA 4BR4A 5F1XA 3ATVA 2F9TA 3VEXA 1HJOA 1MWMA 1NGGA 4BC3A 3FZLA 5KQDA 2J4RA 1HX1A 3ZX0A 3D2FA 3O1BA 1QQMA 4QS9A 4I6MB 4J8FA 2HF3A 2A40A 5AQUA 3QICA 4B1XB 2HMPA 3LL3A 2QWQA 2E1ZA 1QZ6A 1TUYA 2QM1A 2UYTA 3H3NO 5EOYA 4BC5A 1QQNA 3UKRA 4CD1A 3F9MA 1HUXA 4FWPA 4CD3A 1NGCA 1U2VB 3A5NC 3R6MA 5ELZA 5BN8A 3ENHA 3I33A 3CIPA 1GLFO 3CJ1A 3JS6A 1X3NA 3TPQA 1G99A 1P8ZA 4H0PA 1T6CA 2QWRA 1E4GT 2V51B 3KVGA 3C0BA 3CQYA 1ZXOA 3D2FB 3OHRA 1ESVA 2NRHA 3BEXA 1YUWA 4H0VB 1NLVA 4XH1A 1T6DA 2P9SB 2Q97A 3UKRB 1NGDA 3HSCA 1GLCG 3GL1A 2QWLA 2V7ZA 3VGKA 4FWNA 3U9ZA 4CZGA 1OKJA 2FF3B 2DPNA 3DXKA 4IZ9A 4O8KA 3HZ6A 1MWKA 1WUAA 1JCFA 3SK3A 2IIRA 4CJ7A 1T44A 3EN9A 4CZFA 3O1WA 3CQXA 3HBTA 1HLUA 4LC9B 1IJJA 1S3XA 3AAQA 3L6QA 2ZWHA 3EO3A 4PL7A 3MK6A 2YJFA 2I7NA 5AQIA 4A61A 4CZEA 4BRNA 4FWSA 1BO5O 4BRHA 3A5LC 4FWKA 1NGAA 4Y0WA 3CHWA 3DXKB 4BGBA 4CZIA 3C7NA 2VWBA 4RTFD 4WQ5C 1QHAA 4BRQA 1LOTB 4WQ5A 4BRAA 4BRFA 2V52B 3AAPA 4PL8A 3VESA 3UB5A 1LCUA 3H3OB 3O80A 4GY2B 2P9IA 5JICA 3D7EO 2D0PA 1E4FT 5BR9A 3WXJA 3G25A 1NM1A 1V4SA 4FOIA 1NGEA 5AQMA 4BC2A 4QS8A 1Y64A 3LM9A 3C7NB 3H1QA 3QB0A 5KPRA 4BR5A 1NGBA 5AZIA 4H03B 3SMPA 3UKUA 2OANA 4DB3A 4IJAA 2GWKA 2FSKA 2KHOA 3ZX2A 3EKUA 3CJ7A 3CJCA 4H5NA 2P9IB 5AQRA 1S22A 4FWRA 3QBWA 1YXQA 4WQ4A 1K8KB 2BTFA 5AQSA 2D4WA 2A3ZA 4NO7A 2P9UA 3M1FA 3A5MC 4JD2A 2CGKA 1ZC6A 1NGHA 3FZFA 5EX5A 3QFPA 3CJBA 5AQNA 3VEZA 5AZIB 2E2PA 3UKUB 3IFRA 1SQKA 5LJWA 1KAYA 1GLJO 3JXUA 1RFQA 4ISFA 1YAGA 1BA0A 3O6WA 5BRFA 3CI5A 2P9SA 5AFUH 3WEEA 3GE1A 4BVPA 1RGIA 3R8EA 2P9UB 1Z6RA 4JD2B 4BRLA 2Q0UA 4MO5A 5KPTA 5AQQA 4IO8A 3FR0A 2I7PA 4A62A 4O5FA 5AQKA 3ZETA 4FWOA 3MN9A 3VEOA 3MN5A 4PKHA 2QXLA 4YDUC 2P9PB 1ZBSA 5AQWA 3WQUA 4L3QA 4BR9A 1NBWA 1GLLO 3AY9A 3IMXA 2CGJA 1TUUA 2ASPA 2FF6A 2QWNA 3WEEB 3D2EA 3A0IX 1XUPO 1NGFA 5ADXH 3A8YA 2CGLA 2Q0RA 1MA9B 1YVNA 3WXKA 1C0FA 1HPMA 3VF2A 4DQ8A 2FXUA 3M3ZA 3ZETB 2YHWA 3LDPA 4E1JA 4AM7A 4H5VA 1D4XA 4BQZA 1X9JA 3DJCA 4MO4A 3TU5A 1QZ5A 4ISGA 3FZMA 5B8HA 4JHDA 3HM8A 3QDKA 2IVPA 3CETA 5KQ8A 2QWOA 2CH6A 4BR2A 3U8XA 2IVOA 4A2AA 3DXMA 3D2EB 4HWIA 5JLFA 1DKGD 2YJEA 3VEYA 4BRMA 1KAXA 3IUCA 4QS7A 4H0XB 4XH5A 2YHYA 1BWFO 2E8AA 3MN7A 4BGAA 4CZLA 4AM6A 4EIAA 3DWLA 3GG4A 4FWLA 2D0OA 3SMSA 2QWMA 4BRCA 1ATNA 3VENA 4BREA 4H0OA 2HF4A 2A6AA 4BRPA 4EAHD 1HKGA 2NZTA 3BP8A 4JHDB 4BRGA 3ATUA 5TKYA 3QMLA 3MN6A 1GLDG 3CJAA 3DXMB 4JAXA 4BROA 1HKCA 4PKIA 2AP1A 1K8KA 1TYQA 2E88A 3QFUA 2VYPA 4FPAA 3RSEB 2BUPA 1IG8A 4CBUA 3M6GA 2PBDA 2YHXA 3L0QA 2GELA 3AARA 4BRKA 3LM2A 3U4LA 1NMDA 5BRDA 2GWJA 2ITMA 2A41A 1GLBG 2E20A 5AR0A 2ZF5O 1U6ZA 3CJ9A 3I8BA 1V4TA 5AZJA 3LDOA 3MDQA 4BR0A 4CBWA 4IXCA 4CBXA 4BRDA 2IVNA 4K42A 2Q2RA 4F9OA 3VGMA 3VERA 5AQHA 1TYQB 3ULEA 3U9DA 5AQYA 4EFHA 1ATRA 2E2NA 1XQSC 3FZKA 5E84A 3VEWA 4M63C 4B1VA 3VF4A 2GUPA 5AQPA 2FSNA 3BF3A 2FLOA 5AZJB 2P9PA 4A2BA 5AFUA 2ASOA 2EWSA 3DAWA 2AA4A 5BPMA 5AQOA 1BA1A 1RDWX 3FE1A 3H1VX 2Q31A 5FPDA 3H45C 1SZ2A 4JN4A 4NB4A 4HTLA 2A5XA 3ULEB 3VGLA 4EHUA 1WOQA 2E2OA 5KPZA 4B1ZA 2ZGYA 3SLCA 5F2RA 1ATSA 5FPNA 1SAZA 4FWQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H0YB 3LWLA 3L2RA 1ZYQA 4CZHA 3TAQA 4FJNA 1YHQN 1JCEA 3E9LA 4JKCA 2VWJA 1X3MA 2P9LA 1RBRA 1QE1A 4DQPA 4CZKA 4K25A 3VF6A 3KLFA 1NJIO 1X9MA 4FOEA 3SJJA 3VPZA 4CIGA 1W2BM 1Q9YA 1CZAN 3P39A 1ZBIA 3AVBA 5AQFA 2P9KA 1S72N 4CF0A 1S1WA 2O8BB 1GLAG 3B8AX 3FZHA 4L8RB 2P9NB 3BZKA 3C94A 1QVGM 3ZEUB 3EY1A 4DCHA 4H5WA 4LY7A 2NLXA 3LP3A 2XHBA 3WQTA 4E89A 1KXPA 4CZJA 4FJKA 2YCHA 2A42A 2F9WA 3VETA 3RSEA 2YNHA 4B8AB 1BCOA 3VQ9A 3ID8A 1S9EA 1WAJA 4DR2K 3CC7N 4E19A 3FLCO 1YVUA 1M90O 5M1FA 1BIUA 2V7YA 3J7YP 2ASMA 3MCPA 4B3OA 4BR7A 1U48A 1DGKN 1T03A 5JMVA 3MECA 1I39A 3D0PA 4NXNK 5JLHA 2NUBA 1I94K 2DFFA 4EZ9A 1EXQA 4R5PA 4NLBA 1RTDA 4YHHK 4DV0K 1BUPA 3S3MA 4BRIA 4E7KA 4LFBK 1TKDA 1N5YA 2VQEK 4FPBA 4ID1A 1VQ7N 1A5VA 3LAMA 3OYMA 2HHUA 5M1PA 4FJJA 1X9WA 5HBMA 1TK5A 3VQAA 1LW0A 5CYQA 4XEIA 3K5NA 4JI2K 5KRTA 4E7LA 3IS9A 1NOYA 3KIOA 5AQLA 4KO0A 3CFOA 3DLHA 3QO9A 2VGNA 1N8RO 2HOEA 4FK0A 1QQCA 4IOXA 5FPMA 4BACA 3CERA 3WT0A 1J6ZA 4WQ4C 2ZQBA 4CIEA 2QXFA 3NF8A 4AHTA 3TWHA 3VTHA 1HKBA 1GLEG 4BR4A 3ATVA 4KH5A 2F9TA 3VEXA 3LALA 4CECA 2EHGA 2ITGA 4DR5K 4DUYK 3SUOA 4H4MA 4O44A 3PX4A 4J8FA 2A40A 3QICA 4B1XB 4CF2A 5EOYA 5I42A 1QZ6A 1TUYA 4DLGA 3H3NO 3AVKA 4FVMA 1SL0A 4CD1A 3UKRA 4J2AA 4FVUA 1HUXA 1RT5A 2VG6A 4FWPA 1RDUA 4CD3A 4BE2A 5BN8A 4FM0A 4KREA 1GLFO 1NK7A 3JS6A 2ZM6K 4H0PA 2GBZA 1T6CA 2QWRA 3EZ5A 4DTJA 4GKKK 4FJXA 1E4GT 4HCBA 1ZXOA 2IGIA 3BY5A 3OHRA 4YORA 4F2SA 3QEXA 1D9FA 3BEXA 2HB5A 4H0VB 4W5OA 1NLVA 4CJKA 1NGDA 3J81O 1GLCG 1KC8O 2QWLA 2IAJA 1FK9A 3DLRA 2KQ2A 3U9ZA 4CZGA 1OKJA 3V9WA 2HHVA 4DU4A 4DSIA 4DUZK 3T1HK 3DXKA 5HRNA 4FLZA 4O8KA 1CLQA 1M1KO 1VQPN 1T44A 1J5OA 3OYHA 3WNHA 2WBNA 3CQXA 1RT7A 1HLUA 3P38A 4LC9B 1KD1O 3CXCM 4JEPA 3SNNA 2I5JA 1IG9A 3I0SA 4DSLA 3CCEN 4BRNA 1NKEA 1NK0A 1TK0A 2UU9K 1LWFA 1VK0A 3VQCA 1XHZA 1ZBLA 4ELUA 4RTFD 1HYSA 4KTZA 1D5AA 1LV5A 3ZT3A 3LP0A 4DLEA 1LOTB 1ASUA 3CD6N 3VESA 1RTIA 3THWA 3SPYA 3UB5A 3R1XA 4AILC 1WAFA 2JWKA 2P9IA 5CR4A 1E4FT 5BR9A 3WXJA 4ZTJA 1V4SA 1RT4A 4U67L 2O4GA 3G6EN 4BC2A 3H1QA 3CCUN 1JL2A 3QB0A 1NGBA 3L2UA 4DU1A 3CFPA 4B3MK 2W42A 3PLAA 4KAZA 4JKHA 2GWKA 5C24A 4KTQA 3ZSQA 3K9KA 2OTLN 4OVLA 3CMEN 1RBUA 2O8CA 4DKWA 4FWRA 3OYEA 4PA1A 5JVGL 1YXQA 3B6PA 5AQSA 3MXJA 2P9UA 4CEFA 3A5MC 1NK6A 3QFPA 4IFEA 1VSKA 3SBGA 3F9KA 2E2PA 3O9QA 3UKUB 3FFIA 1SQKA 4C8OA 1KAYA 1GOCA 3DOKA 1RFQA 4NYNA 3KD5E 1SKWA 4LFCK 3TTCA 3AA5X 4LSLA 3NAEA 3R8EA 2VG7A 4JD2B 5SWMA 2Q0UA 4MO5A 3HP6A 5C15A 3FR0A 2I7PA 3NDKA 1WLJA 3CQ8A 4FWOA 3AO2A 3MN5A 4OKEA 1TVRA 3I0RA 5GAHP 1NNEA 4HVJA 3V9SA 3DLGA 3CC4N 2HNZA 3PO4A 4ILHA 3SI6A 3TAGA 3WEEB 4DTOA 3KLEA 1RTHA 2Q0RA 3N4QA 1KLNA 3KD1E 3VF2A 3ZSVA 3CCRN 3THVA 3M3ZA 3ZETB 3SAHA 2ZJQL 4E1JA 1IO2A 1Q81O 3TSUA 3DJCA 4MO4A 3TU5A 1HNWK 1QZ5A 1RDBA 1JJ2M 3QDKA 3RMAA 3CETA 4ILGB 2QWOA 4DQQA 4JK9A 4BR2A 4A2AA 3DXMA 4FJMA 5LL6Z 1W7AA 1DKGD 4KB0A 4AF1A 1KAXA 4BRMA 2HW3A 1VQON 4Q5VA 4CHNA 2O8EA 1J9AA 1U47A 3O9RA 2ATQA 3MN7A 1VAZA 4AM6A 4BGAA 4CE9A 1HPZA 3SMSA 3SQ1A 2YHBA 2XY7A 1HYVA 3VA0A 4N56A 3LZJA 1SL1A 2HF4A 2A6AA 4F3TA 5C0YA 4EP4A 4DTRA 4JHDB 4CGJA 4E1NA 5T7BA 2WTUA 5EU7A 3E9PA 4Z4HA 3SAGA 2OPQA 4PKIA 2AP1A 2VYPA 4FPAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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