4ISFA

Human glucokinase in complex with novel activator (2s)-3-cyclohexyl-2-(6-fluoro-2,4-dioxo-1,4-dihydroquinazolin-3(2h)-yl)-n-(1,3-thiazol-2-yl)propanamide
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
457
structure length
428
Chain Sequence
KPMPLTLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKACMLGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase activator
molecule keywords Glucokinase
publication title Design, synthesis and SAR of novel glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 159
structure length 428
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4isfA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4isfA01
4I6MB 3FZKA 4IXCA 2P9NB 1RGIA 5JLFA 1QQOA 4WQ5A 3VERA 4A62A 3L6QA 4ISFA 1XQSC 1S3XA 3QFPA 3IMXA 1YAGA 3BF1A 3KVGA 2GUPA 3O1WA 2VWBA 3L4IA 2Q0RA 2P9LB 1T6CA 4FPAA 4H03B 3VETA 3VEZA 5AQKA 2VYPA 3D2EA 4BR9A 1LCUA 1BA0A 3WXLA 3VF2A 4IWVA 4JD2B 5AZIB 5AQJA 3CQYA 4QS9A 3A0IX 4BROA 4QS7A 2Q2RA 4J8FA 3WT0A 4B1UB 1QHAA 4FOIA 4MO4A 3BUZB 5FPEA 3CJ7A 2F9WA 3QMLA 4DB3A 4H5RA 2GWJA 2HOEA 1S22A 1C0GA 4BRHA 3VEWA 2AA4A 4O8KA 1K8KB 4PKHA 4JHDB 3ZETB 2P9PA 3WQUA 3VENA 1QZ5A 3H46O 5AQTA 3KZBA 1BO5O 3CIPA 4XH1A 5AZJB 3ULEA 5EX5A 2FLOA 3VGKA 2NRHA 4BVOA 1NGBA 2FSNA 4BRGA 2QWQA 1RDWX 2V7ZA 1HPMA 2PAVA 1OKJA 4BC3A 4BQZA 1WOQA 4BVPA 2FF3B 1SAZA 2QWNA 1EQYA 5AQRA 4B1ZA 1H1VA 2E2NA 1DEJA 2OANA 5F0XA 2ZGZA 3GE1A 2E88A 4FSVA 1NGJA 3GOIA 5BPLA 2A3ZA 3O1BA 2QWLA 1ATSA 5AR0A 4H5VA 4AM6A 5BRHA 3H45C 3O4WA 3VGMA 3ID8A 3DXMA 3ENOA 3O6WA 4M7YA 3FZHA 3QICA 3D2FA 4XH4A 3VEXA 2J4RA 1TUYA 3FLCO 3UKRB 5I9EB 3IDHA 4L3QA 3WUHA 2QM1A 5BPMA 1NGEA 3CJCA 3O8MA 2ITMA 2FXUA 3R6MA 3C7NA 3CETA 1QQNA 3GL1A 1X3NA 4JN4A 1Y64A 3U4LA 1BWFO 5EOYA 3VESA 1U2VA 1ATRA 2YHWA 4CBWA 4BG9A 4CZGA 1D4XA 2V51B 4BR7A 4NO7A 4FWQA 4MLHA 2A41A 4CBXA 3LDQA 2D4WA 2GEMA 3O08A 4CZFA 4BC5A 5LJWA 1BA1A 3ULEB 3UE5A 1DKGD 1GLBG 1TUUA 2CGJA 3VPZA 3ZX0A 4CZKA 3HI0A 5AQNA 4K25A 4BGAA 4H0PA 2QXLA 4A61A 1MWMA 2FSJA 3RSEA 4B1WB 4CJ7A 3HTVA 4A2AA 5JMVA 1NWKA 5AQMA 3LM2A 3QBWA 4M63C 4M7XA 5AQXA 3QBXA 1R59O 4BRFA 2GWKA 3G25A 1IG8A 3VEYA 3AY9A 5AQSA 3VEVA 4DHYA 3ATVA 4BRMA 2I7PA 3L0QA 3A5OC 3ATUA 1T6DA 3MDQA 3O80A 4K43A 5EXWA 5F1XA 4YDUC 5AQFA 1BDGA 3GBTA 5AQLA 1V4SA 4NB4A 4WQ4C 1NM1A 4CZMA 3AARA 4C23A 3TU5A 5FPDA 4BREA 5ADXH 2I7NA 2YI1A 3ENHA 1QQMA 4BG8A 3C7NB 5AQWA 1KXPA 3U9ZA 3A5MC 1BU6O 1E4GT 1MA9B 2QW9A 1Z6RA 1NGCA 4IJNA 5KPRA 1HLUA 5AQQA 1YUWA 4CD3A 1U2VB 4HWIA 4ISGA 2CH6A 2D0OA 5EVZA 2P9SA 4O5FA 4YDUA 5AQZA 2Q31A 1KAZA 1JCGA 2IVOA 4ISEA 4KBOA 3GG4A 3BF3A 4BRCA 1SZ2A 4Y0WA 4CZJA 3SJHA 3M6GA 2VCPA 3VGLA 3VEOA 3EL2A 3FGUA 4EHTA 5BR9A 2P9IA 5KPTA 3ZEUA 3LM9A 2P9KB 1YVNA 5AFUH 2YCHA 1ZC6A 4BRQA 4I6MA 1NGDA 3GDQA 3DXKA 2AP1A 3IUCA 5AQPA 2KHOA 5JLHA 4HTLA 4IJAA 3JXUA 4B1VA 3H6EA 4IO8A 5LJVA 3KHYA 3I8BA 4BR4A 5KPZA 5ELZA 1JCFA 1Q18A 3VF6A 4FWMA 2A5XA 2YHXA 3H1VX 4BR0A 3J8AA 3D2EB 3IFRA 4CBUA 5BN9A 2ASPA 4CZHA 2CH5A 4BC2A 3CJBA 2ZGYA 3A5LC 3H3OB 2GTDA 3H3NO 4LC9B 1IJJA 4EIAA 3QFUA 3ZX2A 3QB0A 3U8XA 4FWOA 3SLCA 4BRLA 3FR0A 2E2OA 4BC4A 2W41A 1XUPO 3I33A 4Z94A 2YJEA 1BG3A 3FZLA 3CHWA 5EY4A 2ZF5O 4DQ8A 3DWLA 3F9MA 3DJCA 2QWOA 4RTFD 3QDKA 3MMVA 1QZ6A 5ADXA 2YJFA 2H3GX 1NGFA 2NLXA 4JNEA 5B8HA 3HBTA 1HUXA 2P9PB 4JHDA 2QWRA 3LL3A 4FOEA 3ZETA 3UKUA 5CE3A 2CGLA 3SMPA 5KQDA 2YHYA 5AZJA 3W3DA 1C0FA 1G99A 4H5NA 2A42A 2P9SB 3AAPA 4BGBA 4H0VB 3FE1A 1GLEG 5BN8A 4BRDA 1GLDG 5AQGA 1P8ZA 2V52B 3MK6A 2QWMA 1HKGA 3CI5A 3HM8A 2ASMA 2P9IB 3ZEUB 4PL7A 3DAWA 5AQOA 5AFUA 5AQVA 4DCHA 1NLVA 3WXJA 2PBDA 1GLFO 1Z05A 3DXKB 4MO5A 1NGAA 2Q36A 4PKGA 2Q1NA 3DXMB 4H5TA 4BRIA 4RWTA 5BPNA 2E1YA 3VF4A 3D2FB 2P9UA 3WXKA 4RCHA 3WXIA 4PL8A 3UKRA 1ZBSA 2Q0UA 1RFQA 1BUPA 1LOTB 3MN6A 1JCEA 2DPNA 3MN5A 4BRPA 4B1XB 4BQLA 3U9DA 1V4TA 3P4IA 4CD1A 1NGIA 3B8AX 1DGKN 2GELA 3CQXA 1ESVA 2BUPA 2WUSA 1KAYA 4WYBA 3S41A 4BRNA 4JAXA 2NZTA 3FFKB 1X3MA 5JICA 1NGGA 1GLLO 3CJ1A 4B9QA 2FSKA 2IVPA 2E8AA 2EWSA 3C0BA 3TPQA 3AAQA 3ZX3A 3HZ6A 3R9PA 2D1KA 3O5BA 3VOVA 4CZEA 3LDPA 4F9OA 3BP8A 4H0OA 2E20A 1TYQA 4FWNA 5LY3A 2V7YA 4CI6A 4BR5A 1SQKA 3MN9A 4WQ4A 4H0TB 3UKUB 3WEEA 1MWKA 1CZAN 4BR2A 1KAXA 2D0PA 1XC3A 4FO0A 4H5WA 5TKYA 5BREA 4FPBA 4EAHD 3M3ZA 5FPNA 2P9NA 3LDOA 1GLCG 3MCPA 1NBWA 4BRKA 1NGHA 1ZXOA 2IIRA 3D7EO 3EO3A 3EN9A 3EKSA 4QS8A 5AQIA 5FPMA 3RSEB 3EZWA 3SK3A 4B1YB 1X9JA 3CJ9A 2E2PA 1MDUB 2P9LA 4GY2B 2A40A 3FZFA 2HF4A 1HJOA 4IZ9A 4EHUA 4XEIA 3A5NC 4EFHA 5BRFA 3LDLA 1NMDA 3JS6A 1HKBA 4JD2A 2QWPA 3R8EA 5F2RA 2ZWHA 5AZIA 4FWRA 3FZMA 5KQ8A 5E84A 2HMPA 2E2QA 2FF6A 5AQHA 2P9UB 4H0YB 4E1JA 1J6ZA 3H1QA 4CZIA 1GLAG 1ATNA 1T44A 2F9TA 3CJAA 1GLJO 2UYTA 3SMSA 1E4FT 2E1ZA 5E26A 3WQTA 1BOTO 4CZLA 4BRAA 1U6ZA 3BEXA 3MN7A 4FWKA 3A8YA 1HKCA 2HF3A 1K8KA 1HX1A 4FWSA 3M1FA 4A2BA 4WQ5C 2A6AA 4H0XB 4AM7A 2CGKA 4PKIA 5AQYA 2ASOA 4FWLA 3CERA 3EKUA 2BTFA 4GNIA 5AQUA 3LDNA 4MLEA 2W40A 3HSCA 3OHRA 1TYQB 2Q97A 4FWPA 5BRDA 4XH5A 3WEEB 4K41A 1WUAA 1YXQA 2IVNA 4K42A 3UB5A 4FL9A 3W0LA 2P9KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I6MB 1U4BA 3FZKA 1RGIA 3K9JA 1EP4A 4KHSA 3CFRA 2ITGA 4ISFA 4CJWA 4B9MA 3BZCA 2VQFK 4IDKA 5FRMA 3O1WA 2HNDA 2Q0RA 3HVTA 4H03B 4FPAA 3C6UA 4CGGA 3OS2A 3D2EA 4JK8A 3KK1A 1T7PA 3WXLA 3LALA 3VF2A 1QSLA 2G8KA 1OH6A 3O9RA 5AZIB 3TANA 3AA5X 3OYAA 4HTUA 2NRTA 4OPHA 1UOCA 2QTDA 3N4QA 4AHTA 3SPYA 3M8QA 1FKOA 4DMNA 3I56N 3THYB 1XNQK 3DM2A 4QAGA 1WSEA 1EKEA 2PFUA 2XRIA 3QIPA 3CJ7A 1VQKN 3QMLA 4DB3A 5MLCQ 4J2DA 2O8FA 3VEWA 1WNSA 3DLEA 3ZETB 2R7YA 3VENA 1LWEA 2W6LA 3CIPA 4XH1A 3ULEA 4JS4A 1VSEA 2FLOA 3AA2A 3VGKA 1NGBA 4BRGA 3CQ8A 3MX2A 2QWQA 4BC3A 1OKJA 5C12A 3O4NA 4YFUA 1C0UA 5CZ2A 4JLHA 2UUAK 3AO1A 1H1VA 5HRRA 1L3SA 2ZJQL 5F0XA 4HHTA 3MECA 4DG1A 4B8CA 3ZYYX 3GOIA 4B08A 4JI4K 4LFAK 3HL8A 3O1BA 4C1NI 2DFEA 5M1PA 4FYDA 5AR0A 4HUGA 2G8WA 3O4WA 5C42A 3VGMA 3ID8A 4QCLA 4M7YA 4CFBA 3TAGA 4FJ8A 3NVMA 4FLXA 1OH8A 1FXXA 4LF7K 3J7YP 2QM1A 5BPMA 1FJGK 3WXMB 2KTQA 3TTFA 4FJGA 3ZSOA 5BR8K 4FZZA 3KD1E 4M3ZA 2KFNA 4B9VA 3NBPA 4FJJA 1XC9A 3HPHA 2F8SA 4JN4A 1Y64A 4CJKA 5GADP 2D0CA 1BWFO 5LMUK 1VQ5N 3ZT3A 1HQEA 3VESA 2A1RA 2YHWA 2Q3SA 5C15A 5C10A 4NO7A 1REVA 2OPSA 2YNGA 3F73A 4BDZA 1S72N 2W6KA 5LJWA 4N47A 3THVA 3UIQA 3AVHA 1BA1A 1U45A 4GV9A 3IS9A 2QI2A 1ZBFA 3UE5A 1DKGD 2CGJA 4Q5VA 4FLTA 4BGAA 4H0PA 2QKBA 4A61A 4FK4A 4CJSA 2E6LA 3C6HA 1MWMA 2FSJA 4JKDA 3F5TA 3HTVA 4B9LA 4ID1A 3I8DA 3LM2A 4M63C 5AQXA 2F96A 3AY9A 5AQSA 3PIPL 2G8VA 4TSXA 4A5AA 4KPYA 3SUQA 1HYSA 3MDQA 5EXWA 5F1XA 1YI2N 4YDUC 3O9QA 4CERA 1IO2A 4NB4A 1CLQA 1VRUA 4C23A 1KCFA 3B6OA 3O9TA 3QIOA 3VQDA 2YI1A 2QEXN 3BGRA 4KB1A 1QQMA 4BG8A 2FBXA 4DFMA 1KXPA 3U9ZA 1SUQA 3TAQA 3MAQA 1Z6RA 3DLHA 4IJNA 2YX6A 4CK3A 5KPRA 1HLUA 3S3OA 1YUWA 3IAYA 4OKKA 1GOCA 4DSKA 1U2VB 4HWIA 3O3GA 5DM7L 3SQ0A 4CEEA 3TABA 2HBLA 5AQZA 4YDUA 1JCGA 1ZBHA 3NGYA 3GG4A 3OJSA 3ZT1A 1TV6A 3V6DA 3KWGA 1WSHA 1IBKK 4I2QA 4CZJA 3RRGA 4BDPA 4B3SK 3VEOA 5BR9A 2O8DB 2OTLN 3LM9A 2P9KB 5AFUH 2XO7A 2YCHA 2DFFA 3T3FA 4O55A 2IOCA 3DXKA 1D8YA 4JI5K 2I5JA 5JLHA 4HTLA 1SL0A 3KHYA 3I8BA 5KPZA 4CFAA 1Q82O 4KKOA 2VWJA 2A5XA 3L2VA 4RG8A 1ZYQA 4CBUA 3IFRA 5BN9A 3AVLA 2VWKA 1TAUA 2CH5A 4CHNA 5HOOA 4LC9B 1J5EK 1YVUA 3OS0A 2ZJRL 4M3YA 4KHQA 2ZQBA 2JGUA 4I9LA 3ZX2A 4DV5K 3VTHA 3SBGA 3DLBA 4Z4IA 2ZF5O 1BIZA 3ASMA 3VQ6A 1QVFM 3DJCA 1N5YA 4RTFD 3QDKA 1HYVA 5B8HA 3HBTA 1JL2A 1HUXA 1RT2A 4ZTFA 4JHDA 1LV5A 2QWRA 4FOEA 1JL1A 2CGLA 1K8AO 2O8EA 4RW9A 5AZJA 4BY9C 1KQSM 4R5PA 4DLGA 3W3DA 4B3RK 3VQAA 4LY7A 5KI6A 2A42A 5KGWA 4HCBA 3OYNA 1P90A 1JLGA 1NK0A 4NXNK 3BDPA 1HKGA 4AF1A 3THXB 3ZEUB 1Q8IA 4DCHA 4LF5K 3WXJA 3LANA 1Z05A 4KHNA 2F4VK 1NGAA 1SL1A 2Q36A 4PKGA 3DXMB 3L3UA 5BPNA 3VF4A 4UQGA 4C8KA 1LWCA 1TKTA 2NRXA 2PYJA 4DUZK 1VSMA 1BUPA 3IRXA 5J2NA 1C0TA 4WFAL 4E3SA 4JRPA 3SUOA 5A2QO 1B92A 4DR7K 4HVJA 3C6TA 1KVCA 1X9WA 1NJIO 2PY5A 2HBMA 2GELA 3ZT0A 2BUPA 4WYBA 5T7BA 2UXDK 1RTJA 4PHTX 3OTOK 3VQ5A 3Q7CA 3LAMA 3ITHA 4F8RA 2HHTA 3LDPA 1RBRA 1A5XA 1S9EA 4H0OA 1TYQA 5GIOA 5LY3A 4W5QA 3C6AA 3P31A 2Z1HA 4WQ4A 3PUFA 3UKUB 1MWKA 3AVNA 4FO0A 5BREA 1FKPA 1RTHA 3QO9A 4NLCA 3OYEA 1BQNA 1VQ7N 1SV5A 4W5RA 2D0BA 1UAXA 4IOCL 3NH1A 2FC0A 3EN9A 4EP4A 1N8RO 3PLAA 3KLIA 4OPJA 4B1YB 4CEBA 4X64K 4M45A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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