4ISFA

Human glucokinase in complex with novel activator (2s)-3-cyclohexyl-2-(6-fluoro-2,4-dioxo-1,4-dihydroquinazolin-3(2h)-yl)-n-(1,3-thiazol-2-yl)propanamide
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
457
structure length
428
Chain Sequence
KPMPLTLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKACMLGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Design, synthesis and SAR of novel glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase/transferase activator
source organism Homo sapiens
total genus 159
structure length 428
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4isfA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4isfA01
3HZ6A 3ZETA 4WYBA 2YJFA 5F2RA 1E4FT 3EKSA 1G99A 2QWMA 3U9ZA 5JICA 4MO5A 3FZMA 2P9UB 5AQVA 3IFRA 2IVNA 1QQMA 2P9IA 3WQUA 3EZWA 3W3DA 1XC3A 1BO5O 1KAYA 5AQHA 4GY2B 3AY9A 2OANA 4E1JA 1YUWA 3O5BA 3VF6A 3WXIA 5LY3A 2CGLA 1NGIA 2I7NA 2NRHA 3QMLA 4JHDB 4FPAA 1GLFO 5KPRA 2A6AA 1BWFO 4CZMA 4K42A 4BRCA 3A5NC 2FF6A 2E2PA 3LM2A 3A5MC 3D2FB 2FF3B 2FXUA 3ENOA 3BUZB 2Q2RA 3FZLA 4FWQA 3VESA 3O80A 4MLHA 5EVZA 3ATVA 3O1WA 2ZGYA 1KXPA 2AA4A 4BRFA 2CH6A 2E8AA 5KPTA 3H3NO 4JNEA 4FSVA 3DXKA 3QFUA 3H46O 4JN4A 4BRLA 1NGAA 3C0BA 2P9SB 4M7YA 2E1YA 5AZJA 1TUYA 3VF2A 4B1WB 5AQNA 2YHYA 3CJ7A 4I6MA 3U8XA 3M6GA 4L3QA 4XH1A 4DQ8A 2W41A 5ELZA 3LDNA 3FZKA 3FFKB 3UE5A 3MCPA 4H0VB 3LL3A 1U6ZA 1NGJA 4RWTA 1WOQA 2Q0RA 3RSEB 3AARA 2HF4A 4ISGA 2Q0UA 2I7PA 5EY4A 1MA9B 2QXLA 5CE3A 4JD2A 3D2EA 3H45C 2FLOA 3FR0A 4BQLA 3DXMB 1BG3A 4FWSA 1RFQA 3MN7A 3EKUA 3IMXA 1T6DA 1RGIA 1DGKN 3U9DA 4BROA 3WEEA 3CJAA 5AQXA 3CIPA 4K43A 2QWLA 2GTDA 2QWNA 1V4SA 3VPZA 3FZFA 2GUPA 3QFPA 3C7NB 4BGBA 1JCEA 5AQFA 5BRDA 4KBOA 4QS7A 3GOIA 4A2BA 1ESVA 2VCPA 1GLJO 4XH4A 3AAPA 3FE1A 2FSKA 2UYTA 1KAXA 1MDUB 2Q1NA 4K25A 4BC2A 2YHXA 3VF4A 1HKBA 5AZIB 1BA1A 4O8KA 2GELA 3R9PA 1ZC6A 3ZEUB 5AQWA 2CGJA 2A41A 2E88A 3O08A 5AQJA 1HKCA 3CJ1A 4BGAA 1OKJA 3H6EA 3VGMA 3JS6A 2Q31A 3LM9A 3GE1A 4FOIA 3EL2A 2E2OA 3FGUA 2D1KA 4BC5A 4YDUA 2F9TA 3UB5A 4DHYA 1U2VA 2H3GX 3CJBA 4BRDA 1JCFA 4CD3A 5AQTA 2ASMA 4CZEA 5AQYA 5AQRA 1Y64A 2YHWA 5AQZA 3HBTA 4H5WA 1S22A 4BC4A 3BF1A 4IJNA 4FWKA 3MMVA 4FWOA 5JLHA 1BOTO 2QW9A 3ID8A 1NGEA 4BRKA 1NGBA 3OHRA 3TU5A 3HI0A 3UKRA 4PL8A 2E1ZA 2P9LA 4B1XB 4CZKA 2CGKA 1SZ2A 4QS8A 3A5OC 4FWNA 5FPEA 3VEWA 4CZJA 2GWKA 4BRPA 3L4IA 4DB3A 2FSNA 2P9UA 3EO3A 3GG4A 1C0GA 1BUPA 1BU6O 3O1BA 1R59O 1HX1A 3DXKB 3H3OB 2ASPA 2PBDA 2P9NA 3WT0A 5ADXA 1HUXA 3BP8A 1TYQB 4MLEA 1D4XA 3SLCA 5AZJB 1GLCG 5FPMA 4FOEA 4FWMA 3ULEA 1S3XA 1ATRA 3QBXA 4PKGA 5AQPA 5KPZA 2KHOA 1C0FA 4M63C 1H1VA 1LCUA 1NM1A 1ATNA 2PAVA 3ATUA 3UKUA 4F9OA 2AP1A 1HKGA 2E2NA 2BTFA 3QB0A 3O8MA 5JLFA 4CZIA 2P9PB 3ZX0A 2YI1A 4JD2B 3D2EB 4CD1A 3QICA 2D0OA 4IXCA 4BR2A 3CJCA 3WQTA 3VETA 4YDUC 1CZAN 1NLVA 5AQUA 2P9SA 3MN5A 1GLBG 3WEEB 5BREA 3VEXA 3F9MA 5KQDA 3L6QA 4XEIA 4EHTA 3B8AX 4C23A 4H0XB 4FO0A 3FZHA 4H0PA 4H0OA 1GLEG 1NGCA 3MDQA 3DWLA 5BRHA 1GLLO 5KQ8A 3MN9A 2V52B 3RSEA 5LJVA 1XQSC 4RTFD 5AQQA 3VEYA 2Q97A 1HLUA 3R8EA 2QWQA 3M3ZA 5EX5A 1MWKA 4BR7A 3BEXA 3VERA 3HM8A 3DXMA 3GL1A 4BR5A 2V7YA 1NGDA 2E2QA 5I9EB 4H5TA 2A42A 5BN8A 3GBTA 2IVPA 4BRIA 4CJ7A 4J8FA 4CZFA 3L0QA 4MO4A 3LDQA 4DCHA 3G25A 3CJ9A 3VENA 4FWPA 3D7EO 4BG9A 1K8KA 1BDGA 3VOVA 5AQGA 5BRFA 3C7NA 4FL9A 2DPNA 4BR4A 4RCHA 3CQYA 5AFUH 1Z05A 3O4WA 4XH5A 2YJEA 5BPNA 1ZXOA 2A3ZA 4FWLA 1U2VB 3ZETB 1QQOA 3SMSA 2ZF5O 3CETA 3O6WA 2P9IB 4CBWA 5AZIA 3J8AA 3IDHA 3U4LA 3CI5A 5BPMA 4IWVA 4WQ5C 4EAHD 4B1ZA 3P4IA 5AQMA 1RDWX 3IUCA 4NB4A 3ZEUA 4CZLA 2P9KA 5AQOA 2QWOA 4PKHA 5EXWA 5LJWA 5BPLA 3MK6A 4BRMA 3UKRB 3VEZA 4BR9A 2V51B 4H5RA 5E26A 1EQYA 1WUAA 4LC9B 2A40A 3CQXA 4FWRA 3VEOA 2NZTA 5AR0A 4BVPA 5AQKA 4A2AA 2Q36A 3S41A 4GNIA 2ZGZA 3VGKA 2D0PA 4CBXA 2HF3A 5F0XA 2ITMA 3SJHA 2GEMA 1NBWA 4B1VA 4AM7A 3LDOA 2P9NB 4CI6A 2VYPA 5BR9A 4B1YB 1X9JA 1DEJA 4BG8A 3MN6A 1J6ZA 3ULEB 2QWPA 3HTVA 3A5LC 3I8BA 4WQ4A 3ZX2A 2HMPA 4JAXA 1SAZA 3DJCA 4JHDA 5AQIA 3VGLA 4I6MB 2ZWHA 3CERA 2F9WA 3SK3A 4H5VA 4BVOA 2IIRA 1Q18A 2GWJA 2FSJA 3D2FA 3UKUB 5BN9A 3QBWA 3VEVA 1NGFA 5AFUA 1YXQA 4H03B 1NMDA 1QQNA 1V4TA 3SMPA 5FPDA 2CH5A 4WQ5A 1IJJA 5E84A 3LDLA 1TYQA 2W40A 4Z94A 1Z6RA 2QWRA 4BRNA 1E4GT 3H1QA 2ASOA 2EWSA 4IO8A 1SQKA 1BA0A 3I33A 4B9QA 4AM6A 4BRGA 1KAZA 3JXUA 1LOTB 2VWBA 2IVOA 1QZ5A 2D4WA 5TKYA 3LDPA 1DKGD 1JCGA 4BC3A 2P9PA 4CBUA 4FPBA 1HPMA 1XUPO 4A62A 2YCHA 4NO7A 3GDQA 3FLCO 5B8HA 1ATSA 3H1VX 2BUPA 3KVGA 3TPQA 3ENHA 4CZHA 3QDKA 1P8ZA 1T6CA 4CZGA 2J4RA 5EOYA 4A61A 4BRHA 3W0LA 5AQLA 5F1XA 4H5NA 4EHUA 4B1UB 1NGGA 3M1FA 4H0YB 4EFHA 1K8KB 1X3NA 1X3MA 3WXLA 2WUSA 3KHYA 4Y0WA 1GLAG 2A5XA 3AAQA 4WQ4C 1MWMA 1TUUA 4EIAA 4QS9A 4HWIA 4IZ9A 3A8YA 3A0IX 4BQZA 3CHWA 5ADXH 3BF3A 4H0TB 1NWKA 4K41A 4BRQA 4BRAA 3EN9A 3WXJA 1QHAA 5AQSA 4IJAA 1NGHA 5JMVA 3HSCA 3KZBA 2E20A 2P9KB 4HTLA 1ZBSA 4ISEA 4O5FA 4M7XA 1QZ6A 1HJOA 2QM1A 3DAWA 1YAGA 1T44A 2NLXA 3WXKA 1GLDG 3R6MA 2HOEA 4ISFA 4PKIA 3WUHA 3ZX3A 1IG8A 2P9LB 1YVNA 4BR0A 2V7ZA 4BREA 4PL7A 5FPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4E7LA 5F2RA 3TR8A 1CZ9A 1OH6A 3EKSA 5CY4A 1VQNN 4YOTA 3FZMA 5FLXO 1KVCA 2BE2A 4Z4GA 2ZQBA 2IS3A 3OYNA 4DV3K 1YUWA 3O5BA 3VF6A 2OPQA 4LY7A 1GLFO 1WSJA 1BWFO 2A6AA 4CZMA 3L2WA 3I0SA 3CCLN 4CHQA 3A5MC 3D2FB 4BWJA 4CHPA 4EZ6A 3ENOA 4JKAA 3AVJA 4FWQA 4OO1J 3M5RA 5SWMA 1WSFA 2FBVA 2ZGYA 4CF2A 4YY3K 1KXPA 2AA4A 3OYHA 3OYLA 2CH6A 2E8AA 3SBTA 4Q0BA 3H3NO 3OYAA 4FSVA 1S1WA 3H46O 4BRLA 1NGAA 4B3SK 5AZJA 3VF2A 4B1WB 2G8KA 4L3QA 1C1AA 1FW6A 2W41A 2O4IA 5BR8K 3S3OA 4JI2K 1NJWA 4H0VB 3KWGA 3RMDA 3RSEB 3DLRA 1Q81O 5C2FA 4FJIA 4OLAA 3HT3A 2I7PA 1MA9B 3NF6A 3EYZA 3FR0A 4CJPA 3SQ4A 1BG3A 4HUFA 3VTIA 1JXBA 1ZBIA 3CM5A 3AVKA 1DGKN 1FK9A 5HP1A 3CM6A 4CJTA 3DOLA 5HBMA 2YHAA 2XRIA 1XMQK 2QWLA 3EZ5A 4A57A 3J81O 5IT9O 4C8OA 1YF5L 1JCEA 5AQFA 5BRDA 3GOIA 3OJUA 1HYVA 2NUBA 1EP4A 5LL6Z 2UYTA 1YIJN 3MWTA 1MDUB 3TSPA 4PY5A 3VF4A 2OTJN 4I9QA 1ASVA 1BA1A 4C8KA 1JKHA 1YJ9N 1KLNA 3HOTA 5DM6L 1ZC6A 3ZEUB 3SI6A 3ZT0A 2E88A 4B9LA 2KZMA 3CJ1A 3H6EA 3JS6A 3DI6A 2DFEA 3GE1A 3T69A 1QVGM 4RW6A 3FGUA 3VQ7A 1I3AA 4BC5A 4B8AB 4YOWA 1U2VA 4OGEA 3AVHA 2ASMA 1WSGA 4CJRA 2WC9A 2YHWA 2IDOA 4H5WA 2UUAK 1C0MA 1SKWA 4RW9A 4AHCA 1RT2A 2P51A 1RDUA 4IG3A 3AGRA 4FWKA 3TABA 3PUFA 1S5JA 3KLIA 4CJEA 3TU5A 3AO4A 3HI0A 3MECA 3UKRA 3E01A 3V4IA 4CZKA 1S1TA 2CGKA 1HNIA 1JJ2M 4FWNA 3QERA 4CZJA 4TSXA 4FM2A 2GWKA 3F5TA 2Z1JA 4BRPA 1TAUA 3O1BA 2VWJA 4DFKA 4FJ9A 4DU1A 2ASPA 1C0TA 3AVIA 4ILGB 3WNGA 4NXMK 3T1HK 1VSHA 5LMNK 1WSIA 4DR2K 1ATRA 4J2BA 3QBXA 1XMOK 3A2FA 1ATNA 3QNNA 3ASMA 2BTFA 1TAQA 4BY9C 2P9PB 4KHQA 4F3TA 2UU9K 4JI5K 1BGXT 3QICA 4E7HA 4PQUA 3FFIA 1NG9A 4E3SA 1RBRA 4IEIA 1B92A 2VGNA 3THWA 3V1RA 4H0XB 3L3VA 4H0PA 3OTOK 4BE2A 1NK6A 2VG7A 3HVRA 1VSDA 3V9SA 1GLLO 1X9SA 3MN9A 3RSEA 4LSNA 3EE9A 3ZSYA 4DLGA 2OPPA 2QWQA 4I9LA 1MWKA 4M3XA 5HRRA 4KH6A 1LV5A 3L4QA 3PV8A 2A42A 5BN8A 3HOSA 4LF7K 2IVPA 1QQCA 3L2RA 4PA1A 5FRMA 3SUPA 4DQPA 2Z1HA 3EE8A 3L0QA 1S1XA 2YNFA 2OTLN 4FWPA 4BG9A 1K8KA 5AQGA 4CEBA 4CFCA 3THVA 2QI2A 4CE9A 3C6AA 4DF8A 1U4BA 4KPYA 3RMBA 2HBLA 5BPNA 4DLEA 2A3ZA 5H1SQ 1QQOA 3DLGA 4CIFA 3RRGA 1K6YA 2ZF5O 3KD1E 4DTOA 4DTXA 4CJWA 3SJJA 3J8AA 3U4LA 4IWVA 3IG1A 1TL1A 3K9JA 3ZEUA 2QKBA 3C6UA 1TKDA 1L3TA 3M8SA 3OYEA 5BPLA 3MK6A 4BRMA 3KKSA 1DLOA 4H5RA 5E26A 1QVFM 2HMIA 5HRNA 3VEOA 4LC9B 4FWRA 3CQXA 3TTCA 4FLUA 4JK7A 4BVPA 2B6AA 1HQUA 5AQKA 4GNIA 3VGKA 3RMAA 4MDBA 4CBXA 3CCEN 1YTUA 3NAEA 3B6OA 3L2QA 1ASWA 2HHUA 3SJHA 1JL1A 3M8PA 1NBWA 4FJHA 1VRUA 2P9NB 4QOZB 5JS2A 2A1RA 4EZ9A 1HYZA 3SAHA 4B08A 4JK8A 3CCRN 1J6ZA 3HTVA 3A5LC 3ZX2A 4FK2A 1Q86O 3DJCA 5AQIA 4HTUA 3CERA 3VTHA 4ELUA 4H5VA 4BVOA 3UKUB 1M90O 4CJFA 4FK0A 1NGFA 4H03B 1NMDA 3QNOA 2CH5A 4WQ5A 4JI6K 3SPZA 3DRPA 5HRPA 2HW3A 3LPUA 1CXQA 1DTQA 4DQQA 1LW0A 4Z94A 1Z6RA 4BRNA 1REVA 4DTUA 1TK0A 4Z0UA 2QKKA 1E4GT 4DV5K 3K57A 2EWSA 2KQ2A 2X6NA 4MDAA 4IO8A 1SQKA 1BA0A 4AF1A 4KTWA 3KK1A 2KFNA 2F4VK 3DOKA 2QTDA 3SNNA 2IVOA 1ZBLA 1N36K 1DKGD 1CLQA 4KREA 4IG0A 4HUGA 4E89A 2P9PA 5KRTA 2LSNA 1HNXK 1ATSA 3TPQA 4AHSA 4FLVA 3IAYA 3VQ5A 3VQEA 3DLBA 2O8BA 4LFAK 4A61A 4BRHA 3W0LA 4FXDA 5AQLA 1ZBUA 1YI2N 4B1UB 1X1PA 4IBNA 4CGGA 1I39A 3M1FA 4H0YB 4EFHA 1X3NA 3CMEN 2HVIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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