4ISGA

Human glucokinase in complex with novel activator (2s)-3-cyclohexyl-2-[4-(methylsulfonyl)-2-oxopiperazin-1-yl]-n-(1,3-thiazol-2-yl)propanamide
Total Genus 150
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
457
structure length
418
Chain Sequence
KPMPLTLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESESGRGAALVSAVACKKACMLGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase
publication title Design, synthesis and SAR of novel glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase activator
total genus 150
structure length 418
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4isgA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4isgA01
5JICA 3HBTA 3O1BA 5LY3A 4GNIA 3L6QA 4I6MB 3MN5A 2YJFA 1K8KA 1X3MA 2CH5A 1HLUA 3VEOA 3CQXA 4J8FA 3VGKA 1X9JA 3FZHA 1TYQB 3LDOA 4QS7A 3EL2A 1G99A 3H3NO 2A6AA 5AZIB 5BPNA 5BN9A 2DPNA 2E2NA 2FXUA 4FSVA 2V7YA 4RWTA 2FSKA 2Q1NA 2QWOA 3GE1A 3C7NB 2AA4A 1R59O 5AQIA 3GG4A 1BWFO 3CHWA 1HUXA 3MDQA 2QM1A 4AM7A 3LDPA 3O08A 4FWMA 5F1XA 3R8EA 3WXKA 1U2VA 1ZC6A 5EXWA 1KXPA 2EWSA 2P9PB 4XH4A 3QICA 3EKSA 1ZXOA 4H0PA 4O8KA 4BRGA 3MN9A 4IXCA 3FFKB 4H0XB 4JN4A 1KAZA 3ZEUB 1TYQA 1S22A 4BRFA 5BPMA 4FWLA 2E2QA 5AQXA 2YJEA 4MO4A 3H45C 2CGLA 4MLHA 2IVOA 1MDUB 1GLAG 3U9DA 3ENHA 1TUYA 4FWRA 4H0YB 2ZF5O 3I8BA 3LM9A 1JCEA 1P8ZA 1YXQA 3C7NA 4H0VB 4QS9A 5EX5A 3VGLA 5AQMA 3ATUA 4CZGA 4BGBA 3WT0A 1X3NA 1HPMA 3BF3A 5AQYA 5FPMA 4NO7A 2H3GX 2P9PA 3WXIA 5BN8A 3O5BA 5AQFA 5AQHA 1T6CA 3AY9A 4FWPA 4M63C 3UKUB 3VF6A 5AQWA 1KAYA 1T6DA 3VGMA 4IJAA 2FSJA 4PKGA 3MN6A 5BRFA 1ZBSA 2NZTA 4H5WA 3B8AX 4BR2A 4ISGA 2KHOA 4JHDA 3W0LA 2E1YA 1NGIA 4QS8A 3VENA 2AP1A 4RTFD 3FLCO 3A5MC 1IG8A 1NGBA 4FL9A 1LCUA 3DWLA 4BRMA 3SMSA 3FE1A 4CZMA 3RSEB 2CGKA 2ASPA 1NM1A 1GLEG 3SMPA 2ZGYA 4IJNA 2CH6A 3WQTA 4DCHA 4F9OA 4L3QA 3AARA 1DKGD 2V51B 1E4FT 5BR9A 2ZGZA 3FZMA 5F2RA 5EOYA 5AQJA 3VEXA 3IUCA 1QHAA 3ENOA 3QBWA 1MA9B 3BF1A 1Z6RA 2P9SA 3U9ZA 2V52B 2FF6A 4CZIA 2P9LB 3HTVA 4H03B 2GWJA 1BUPA 1XQSC 3M1FA 5ADXH 3ZETA 3BP8A 1NGHA 4WQ5C 2W41A 1RGIA 1NGDA 2P9UB 4MLEA 3MK6A 4BRQA 3S41A 1NLVA 1OKJA 4Y0WA 3MMVA 4BC5A 3QFUA 1QQNA 3VEYA 3U4LA 4FWOA 3ATVA 1ATRA 2D4WA 2E88A 5JLHA 3WEEB 2HF4A 4IO8A 5AZJB 3CQYA 4BR5A 2GELA 2BTFA 3DXMA 2QXLA 5AQSA 5I9EB 1NGCA 4BG9A 2P9LA 1DGKN 4FWSA 5B8HA 3EKUA 4PL7A 1BDGA 1V4SA 3C0BA 3D2FB 4FOIA 1BOTO 4I6MA 3EZWA 4E1JA 3QB0A 3CJ7A 3LL3A 2PBDA 3IFRA 3G25A 4FOEA 2OANA 2V7ZA 3F9MA 3QFPA 4AM6A 1YVNA 2A41A 3LDNA 2VCPA 3CJ9A 3ZX3A 5AZIA 4H5TA 5EY4A 3U8XA 3VERA 1BA1A 3CJBA 3R6MA 5FPEA 3D2EB 3D7EO 3HSCA 3ID8A 4KBOA 5AQOA 3VEWA 1DEJA 1HKGA 1SZ2A 4B1VA 4B9QA 2FF3B 5KPZA 3WEEA 3FZKA 4CZFA 5AZJA 1GLCG 4HTLA 2J4RA 2Q31A 2ASOA 2QWPA 4CD1A 5KQDA 5E26A 4MO5A 3VETA 4BRAA 3D2FA 3JXUA 5FPDA 4PKHA 4EHTA 5KPTA 1ATNA 2P9NB 3FZFA 3H1QA 4FPBA 5AQNA 3GL1A 3DXKB 2Q2RA 2E20A 4C23A 3O6WA 3MN7A 3J8AA 4XH1A 2ITMA 1NBWA 1MWKA 1BG3A 3LDQA 3ZEUA 5ADXA 4BG8A 1CZAN 2HF3A 4A62A 2Q0UA 3QBXA 4M7XA 4FO0A 2P9KB 4CJ7A 2D0PA 3WXJA 2FSNA 3CJCA 1BA0A 3VPZA 3A5OC 3WQUA 2A3ZA 4EIAA 1MWMA 2QW9A 4BREA 4BR7A 2E1ZA 3SLCA 1NGJA 1QQOA 1ESVA 1JCFA 1XC3A 3KZBA 4IZ9A 2GTDA 3EN9A 2I7NA 5AQPA 4DHYA 2IIRA 4H5VA 1IJJA 5AQGA 3HI0A 1LOTB 4BR0A 3VEZA 3O4WA 5BREA 5JLFA 3M6GA 1NGFA 2YCHA 1GLDG 4K41A 5CE3A 3P4IA 1Q18A 2P9NA 3ZX2A 5BPLA 3UKUA 3I33A 4NB4A 2IVPA 3GDQA 4BR9A 3O1WA 4B1WB 5FPNA 3FR0A 4GY2B 1YUWA 2QWNA 4A61A 1Z05A 3KHYA 4Z94A 3HM8A 1D4XA 4BRCA 5AR0A 2GUPA 2A40A 2P9KA 4BRNA 2PAVA 4H5NA 1NGEA 4ISEA 2QWLA 4K42A 4EFHA 1NGAA 1BU6O 1NGGA 2YHYA 4DB3A 4BROA 4BRLA 1HKCA 3MCPA 3A8YA 3FGUA 4CZKA 2VWBA 4WQ5A 3LM2A 3TPQA 3W3DA 1TUUA 1WOQA 1HKBA 3RSEA 2F9TA 2YI1A 1U2VB 1WUAA 2HMPA 3O8MA 2D0OA 5BRDA 4A2BA 1V4TA 3M3ZA 4RCHA 4CZEA 4H5RA 2GWKA 3UKRB 3DAWA 5AQQA 4FWKA 2I7PA 4A2AA 4H0TB 2Q36A 4BC4A 3BEXA 4BC2A 2YHWA 4JNEA 3KVGA 4XEIA 3OHRA 4JAXA 3SJHA 1XUPO 3IMXA 4BRPA 5AQVA 1H1VA 2Q97A 4BRKA 4CBWA 2P9UA 4BRDA 3VF4A 3BUZB 4BRHA 3H3OB 1C0GA 5AFUH 3TU5A 3ULEB 2W40A 1NWKA 5ELZA 4IWVA 4K43A 2QWMA 3CJAA 2BUPA 2WUSA 3SK3A 1KAXA 4BVOA 4ISFA 2NRHA 1GLLO 4LC9B 4XH5A 4CZJA 2GEMA 3ZX0A 4CBUA 1U6ZA 1QZ6A 3CIPA 1Y64A 3VESA 4B1XB 3UB5A 2E2OA 5BRHA 2Q0RA 3UKRA 5KPRA 4PL8A 5LJWA 1EQYA 1GLBG 1T44A 3CETA 3VF2A 2F9WA 3VEVA 2P9IB 3UE5A 2D1KA 2E8AA 1NMDA 4K25A 4JHDB 4BGAA 4CI6A 2IVNA 2E2PA 1HX1A 4EHUA 4JD2B 2FLOA 5LJVA 4CZLA 3DJCA 2A5XA 1BO5O 1GLJO 1GLFO 4FPAA 1HJOA 3GBTA 3WXLA 3CJ1A 3ULEA 2QWQA 5AQZA 1YAGA 4CD3A 1QZ5A 4FWNA 4BRIA 4FWQA 5AQUA 1RDWX 3JS6A 1J6ZA 3CI5A 4B1UB 4M7YA 5F0XA 2UYTA 3D2EA 4BC3A 2QWRA 3AAPA 3A5NC 4H0OA 3FZLA 2HOEA 4O5FA 2NLXA 3A0IX 1QQMA 2CGJA 3H46O 4EAHD 4CBXA 2ZWHA 2P9SB 1ATSA 5AQRA 4WQ4C 3WUHA 5AQTA 1E4GT 5KQ8A 2P9IA 3QDKA 5AQKA 1JCGA 4BVPA 4YDUC 4WYBA 1RFQA 5AQLA 3ZETB 3AAQA 5EVZA 4WQ4A 1K8KB 3EO3A 3H1VX 4JD2A 3GOIA 3DXKA 5E84A 1SAZA 5TKYA 2ASMA 4YDUA 3HZ6A 3IDHA 3CERA 4BQZA 3QMLA 5JMVA 2YHXA 4B1ZA 3L4IA 4DQ8A 3R9PA 4B1YB 3O80A 1S3XA 5AFUA 4HWIA 4BQLA 1SQKA 4PKIA 1C0FA 3L0QA 3DXMB 2VYPA 3VOVA 3LDLA 4CZHA 2A42A 4BR4A 3H6EA 3A5LC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DSKA 4AILC 4CJPA 1NJIO 1NK8A 3MN5A 2YJFA 5AJ3K 2F96A 4FM1A 1S1XA 3VEOA 3RR8A 4BE1A 4DR5K 1UA0A 4DQPA 3K5OA 3T1HK 2X6NA 3LDOA 3NBPA 3EL2A 4QS7A 3NH0A 4DFMA 2HHTA 3OBWA 3F2KA 4GV3A 3OS2A 3SBGA 2DPNA 4JKCA 3AVNA 2ATQA 3O3FA 5K14A 4FLZA 5J1EA 3TSUA 2QWOA 2AA4A 4ELUA 3VQ7A 1WAJA 3NF8A 4AH9A 2XHBA 2B4JA 3CHWA 3O08A 3LAMA 4LF4K 3WXKA 1M1KO 2WTUA 1S5JA 1RDCA 4TSXA 1SL2A 1ZXOA 1XWLA 5CYQA 3PY8A 2VGNA 2FBTA 4YFUA 5BPMA 3QEIA 4IFVA 5JS2A 2YX6A 4MLHA 2IVOA 1DTTA 3ENHA 4DFPA 2QI2A 1VQ8N 2QXFA 1JL2A 4H0VB 4L8RB 1HPMA 4QCLA 3BF3A 4B9VA 3QNOA 3B6PA 1TK8A 1T6CA 4M63C 3VF6A 3SUPA 3ZSZA 4IEIA 3MN6A 3EEQA 5BRFA 2NZTA 3O9TA 3SNNA 3ZT3A 3QNNA 4IFYA 4JHDA 4LSNA 1TGOA 2BANA 3VENA 3CFOA 3TI0A 2ZM6K 3LAKA 1N5YA 1SV5A 3K57A 1LCUA 3DWLA 1RT4A 4X62K 4BRMA 1LWCA 2HHUA 4CZMA 2CGKA 3BZKA 3IRXA 1GLEG 4FJIA 4IJNA 4DCHA 1RT3A 2VQFK 1IBLK 4DR3K 3LWLA 1E4FT 5F2RA 3VTHA 5AQJA 3H08A 3ZT4A 3IUCA 1QHAA 4DV0K 4MDAA 3VQAA 3QBWA 1MA9B 3BF1A 1ZBIA 4FM2A 4F2SA 2BGGA 1VSMA 3MCAB 1FK9A 3CQ8A 4BE0A 1KRPA 3PUFA 2HHVA 4LH5A 1NK0A 4KV8A 1NGHA 5SZTA 4B9UA 4B9MA 1RGIA 3BY5A 3QINA 3PSIA 2AJQA 4HCCA 1D9FA 5HOOA 3F9KA 4XIUA 4FK4A 3AVKA 3E1YA 3AVFA 3PIPL 3QEVA 3ATVA 2E88A 1TKTA 5JLHA 2HF4A 1VQNN 3AVCA 3MXJA 3DXMA 5AQSA 5I9EB 1Q82O 4CF0A 1OH5A 3EKUA 2F8TA 3E66A 1BDGA 2OZSA 3D2FB 4FOIA 4A5BA 3QB0A 2OTLN 3L2VA 3CJ7A 4W5RA 4CK3A 2PBDA 3IFRA 1QHTA 4F3OA 2V7ZA 3F9MA 4B8AB 3ITHA 2VCPA 3VQBA 2BH1A 2GUIA 5C2FA 3NCIA 1TKDA 1N36K 4H5TA 1L3SA 3VN5A 2G8WA 3NH1A 1BA1A 4Z4IA 3D2EB 3ID8A 4CD3A 3OYJA 4DFJA 4B1VA 4J2DA 4C8MA 1B9FA 4HTLA 2J4RA 1P90A 1XMQK 3P83D 2R7YA 2QWPA 4BRAA 1NK7A 1GOCA 2YNFA 3D2FA 4FZZA 1C6VA 2D0BA 1KSPA 3CMEN 1CXUA 4B3SK 3QESA 5KPTA 1ATNA 3OTOK 3H1QA 2QKKA 3DXKB 2HNYA 1JLQA 3MN7A 3ZSXA 4XH1A 4DUYK 3ZEUA 3LDQA 5FROA 4N47A 4BG8A 5M1NA 4A62A 3V9ZA 3M8PA 3N4QA 2UUBK 3TWHA 3OBYA 4DF4A 1MWMA 2Z1JA 2E1ZA 1WLJA 4B9LA 4I9LA 3VQDA 4E7KA 3SLCA 1ESVA 2IAJA 3OYFA 2GTDA 3RMBA 2HVHA 4KHUA 3IS9A 4H5VA 4Q0BA 5AQGA 1LOTB 3O4WA 2I5JA 1X9MA 1GLDG 4KAZA 4FZXC 3UIQA 3ZX2A 5BPLA 3UKUA 3V81A 2XY6A 4NB4A 3U3YA 3DLBA 4B1WB 3NVMA 5FPNA 4LFAK 3HM8A 1D4XA 5KI6A 3ZSQA 1L5UA 4BRNA 4DS4A 4FJJA 4H5NA 4DV7K 4UQGA 1QSSA 1BU6O 1VQON 1NGGA 4CGIA 3PX6A 2HMIA 1BQNA 4ICLA 1NJWA 4DF8A 3TAQA 4CZKA 4NXMK 2O8EA 4BWJA 4BWMA 3LM2A 4JKBA 1YTUA 3VQ9A 3VA3A 1U2VB 3O8MA 3DRPA 4IFEA 3THVA 3DLKA 2WOMA 1V4TA 4CJSA 3I56N 1NJXA 3KJVA 5AQQA 4J2AA 4WF9L 2ZJPL 4GV9A 2YHWA 3VTIA 3OHRA 1EETA 3CCVN 4E19A 1S1TA 1H1VA 4NCGA 4Y1CA 3CFRA 4DSLA 3KLEA 2P9UA 1QSLA 1Y97A 4CF1A 3J81O 3CCMN 1T3VA 3H3OB 4GV6A 1C0GA 5AFUH 3TU5A 3ULEB 2X78A 3PV8A 1NJZA 2HBJA 2YKNA 2BUPA 4HUFA 2X74A 3OJUA 3C65A 4LC9B 1VQMN 4CBUA 3O3HA 1QZ6A 3VESA 3K2PA 2E2OA 3HOTA 1LAWA 5CY4A 3CETA 3VQPA 1HNVA 3VF2A 3VEVA 1VSIA 4FLWA 2E8AA 4WCEL 4BGAA 4CI6A 3K5MA 1L3VA 2E2PA 3SI6A 4W5TA 1KLNA 4EHUA 2FLOA 3T7ZA 1IKYA 2F7TA 1GLJO 1GLFO 4FPAA 1HJOA 2PYLA 3ULEA 1NG9A 1QZ5A 4FWNA 4FWQA 4M7YA 3TAGA 1ZBFA 4M3XA 3ZSWA 1A5XA 2RF2A 2NLXA 4PY5A 1QQMA 1WSFA 3H46O 4EAHD 2ZWHA 4IEEA 1WB9A 3RRHA 5JS1A 4E1NA 1ZBLA 3QDKA 3E9PA 4YDUC 5AQLA 1J53A 1K8KB 4C1NK 1NK9A 3C6TA 4V19S 2HW3A 5E84A 4YDUA 1HNWK 1KQSM 1IBMK 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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