4ISGA

Human glucokinase in complex with novel activator (2s)-3-cyclohexyl-2-[4-(methylsulfonyl)-2-oxopiperazin-1-yl]-n-(1,3-thiazol-2-yl)propanamide
Total Genus 150
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
457
structure length
418
Chain Sequence
KPMPLTLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESESGRGAALVSAVACKKACMLGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Design, synthesis and SAR of novel glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase activator
total genus 150
structure length 418
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4isgA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4isgA01
2HF4A 1MDUB 4MO5A 1RFQA 1U2VB 4GNIA 5JICA 4JHDB 1XQSC 4CZFA 5EX5A 2IIRA 3C7NA 4MLHA 3WXLA 3IMXA 4BRAA 1YUWA 1HKGA 2V51B 3MCPA 4EAHD 3VGKA 3UKUB 2YJFA 4DB3A 1LOTB 3O08A 1GLLO 5EOYA 2E88A 1QQNA 5BREA 5FPDA 2BTFA 2YJEA 1BG3A 4BRCA 3P4IA 3SK3A 4FWMA 5EY4A 3FZLA 3DJCA 5AQOA 2ASOA 4BVPA 4EHUA 4MO4A 3VESA 5LJVA 3SMSA 4BGBA 1KAZA 2FF3B 3CQXA 4ISFA 4WQ5C 2QWPA 4BRMA 1XC3A 5AQJA 2Q36A 3DAWA 4A61A 3A5LC 5LY3A 1C0GA 3ENOA 3VERA 3R9PA 1QQOA 1NGIA 3VF6A 3WXJA 4IO8A 4WQ4A 4XH5A 2W41A 3WEEA 5TKYA 4FWPA 5ELZA 2UYTA 5F0XA 3O1BA 3GE1A 1YVNA 3TU5A 2GTDA 4QS8A 3GG4A 5I9EB 1D4XA 3HI0A 3OHRA 4LC9B 3FR0A 3HBTA 1HKCA 5AQQA 4BQLA 4EIAA 3EKSA 3L4IA 4I6MB 2P9LA 4BQZA 4FOIA 4CZJA 5KQDA 1E4FT 2V7YA 2Q2RA 1X3NA 1X3MA 3S41A 3VEVA 4PL8A 2QWOA 3C0BA 5FPMA 4CBWA 2E1YA 1BWFO 5KPRA 2P9SA 4CBUA 3SMPA 4K25A 4YDUA 1Z05A 3ZETA 1ZC6A 4HTLA 1GLCG 1NLVA 3DXKB 4B9QA 2E1ZA 4DQ8A 3D2EB 2AP1A 3M1FA 5BRFA 3ZX0A 2P9IB 2E2PA 4RCHA 2FLOA 2P9NA 3DXKA 3M6GA 2DPNA 3W3DA 3UB5A 3QFUA 4K41A 4Z94A 5E26A 1GLBG 4CJ7A 4BRHA 3H46O 2ZWHA 2Q0UA 3RSEA 2VYPA 1T6DA 3I33A 4MLEA 2P9KB 4H0VB 5EVZA 4H0YB 2Q0RA 4XH1A 2D0OA 1BA0A 1XUPO 1NM1A 3A5NC 3L6QA 1ZBSA 3QB0A 2GWJA 4EHTA 2V52B 3VENA 2WUSA 1TUYA 4BC5A 4H0PA 4NB4A 2CH6A 2QWRA 4FOEA 3QBXA 3D2FB 4FWQA 5AZIA 2FSKA 3UE5A 4BGAA 3DWLA 1GLEG 5AFUA 3LM2A 2QXLA 3UKRB 3CI5A 1NGBA 1GLAG 4Y0WA 3JXUA 1ZXOA 2E8AA 3L0QA 3JS6A 3VF2A 4FWSA 5LJWA 4BR0A 4CZLA 3CERA 3KVGA 4PKHA 2FXUA 3LDLA 3C7NB 1QZ6A 4IXCA 4BRGA 4FWNA 4IZ9A 4GY2B 4K42A 5BPNA 1HLUA 2YCHA 1Y64A 3VF4A 2QWMA 1YXQA 5E84A 4FL9A 4YDUC 4CD3A 5JLHA 3AAPA 3GBTA 3VEWA 2CGKA 1NGFA 3VOVA 2HOEA 5AQKA 3CJAA 3LDNA 4HWIA 1X9JA 4BRFA 5AQNA 1V4SA 3IFRA 3EL2A 2Q97A 5FPEA 3CIPA 3MN9A 1KAXA 2OANA 2ITMA 2E2OA 4XEIA 1MWMA 2GUPA 5AQZA 1K8KA 2A42A 3WQUA 3GL1A 4H5VA 3VEZA 4B1YB 4DHYA 3QICA 3WEEB 1OKJA 4BREA 5AQRA 1RDWX 4RWTA 3MK6A 3G25A 2F9TA 4F9OA 1G99A 4FPAA 5AQTA 1R59O 2P9LB 4B1VA 1P8ZA 1KAYA 1GLFO 3HTVA 4CZGA 3AARA 3FE1A 4B1UB 4A2BA 4IJNA 3VEXA 3GOIA 3FGUA 3VPZA 2IVPA 1DKGD 2A41A 3CJ1A 1BUPA 4JN4A 2P9SB 4NO7A 3U8XA 3ATVA 4BRPA 1JCGA 2I7PA 3ZETB 4BRLA 5JLFA 3FZKA 4BC3A 2QWQA 5AQPA 1IG8A 4FWKA 4FWLA 2ZF5O 2I7NA 4KBOA 1V4TA 2P9NB 1WOQA 2J4RA 3KHYA 4PKIA 1NGEA 1TYQA 5AQLA 3EZWA 4AM6A 3RSEB 3WT0A 4C23A 2CH5A 2Q31A 2V7ZA 2ASPA 3U4LA 4BC2A 4CBXA 3WUHA 3KZBA 3H45C 1ATSA 4BRKA 4JAXA 1DGKN 3HZ6A 5FPNA 3LDQA 4J8FA 5AQXA 2PBDA 3IUCA 3QMLA 5JMVA 2ZGYA 4CZKA 2NZTA 5BN8A 2FSJA 1NBWA 3HSCA 5AR0A 4BVOA 5AZIB 1BDGA 3W0LA 5AFUH 4B1WB 3A8YA 1NGHA 4WYBA 2HF3A 1WUAA 3LDOA 3ZEUA 4FWRA 3O5BA 1QZ5A 4CZMA 5AQSA 1MWKA 4H5NA 2YI1A 4FO0A 2D4WA 1QQMA 5BRHA 1KXPA 2FSNA 5AQHA 3VEYA 1ATRA 2P9UA 4WQ4C 3MN6A 3U9DA 3MN5A 1NGGA 2GELA 5F2RA 1MA9B 4BRQA 2E2QA 4ISGA 5BPMA 3ATUA 3TPQA 3ULEA 2VCPA 3LL3A 1DEJA 3MMVA 3O80A 2A5XA 1GLDG 2P9PB 1H1VA 2E2NA 2IVOA 2QWNA 3LDPA 3QBWA 4RTFD 2PAVA 2P9PA 4QS9A 5AQWA 3I8BA 4B1ZA 1CZAN 3QFPA 3IDHA 4FWOA 3WXKA 1SZ2A 3H1QA 3SLCA 3HM8A 3VGMA 3AAQA 4EFHA 1E4GT 4FPBA 5AQUA 5CE3A 3A5OC 3BP8A 1U2VA 2ZGZA 1BOTO 4E1JA 1YAGA 4JHDA 5AQVA 3R6MA 1NGJA 2GWKA 3H1VX 3H6EA 1IJJA 4M7YA 3A5MC 4BR2A 4O5FA 2NLXA 2VWBA 3FFKB 1K8KB 3QDKA 4PKGA 3UKUA 5AZJB 3CQYA 3FZFA 4CZIA 3ZX2A 4DCHA 5ADXH 3VETA 4BR7A 1NMDA 3SJHA 4H5TA 5AZJA 3O8MA 1HUXA 4B1XB 1HJOA 5ADXA 3LM9A 2EWSA 2H3GX 2QWLA 4CD1A 3A0IX 3H3OB 3MN7A 4H0OA 4A2AA 4H03B 4BG9A 4CZHA 2ASMA 3F9MA 4CI6A 1BA1A 1T6CA 1BU6O 4IWVA 5BPLA 3O4WA 2AA4A 2A6AA 2D1KA 1J6ZA 3M3ZA 3VGLA 5KPZA 3BEXA 4JD2B 3BF3A 1TUUA 1EQYA 4JD2A 3BUZB 4M63C 4H0TB 1U6ZA 2W40A 4BRIA 5BN9A 1NGCA 1Z6RA 2QW9A 1LCUA 3D7EO 5BR9A 4QS7A 2F9WA 4O8KA 1JCFA 3J8AA 1TYQB 3AY9A 1S22A 3CJ9A 1T44A 2A40A 1ESVA 4I6MA 3CETA 2YHXA 2D0PA 1QHAA 4K43A 4PL7A 3U9ZA 3VEOA 4BR5A 3CJ7A 1NGDA 2IVNA 3FZMA 2QM1A 1C0FA 2Q1NA 1GLJO 1Q18A 3BF1A 4BR4A 1ATNA 2YHWA 3WQTA 4AM7A 3H3NO 4BR9A 2E20A 2KHOA 1JCEA 4M7XA 2NRHA 2HMPA 5B8HA 5AQFA 4WQ5A 1RGIA 4XH4A 3D2EA 3DXMB 4IJAA 5EXWA 3ZEUB 1NWKA 1BO5O 2P9IA 1SAZA 5AQYA 4FSVA 5AQGA 3WXIA 3DXMA 3EN9A 4H5WA 2BUPA 3EO3A 5KQ8A 4H0XB 3R8EA 1HKBA 1SQKA 2P9KA 2P9UB 4L3QA 3GDQA 2CGJA 3B8AX 1HX1A 1NGAA 2FF6A 4A62A 4BG8A 4BROA 3MDQA 1HPMA 2CGLA 4CZEA 4H5RA 4BC4A 4BRDA 5BRDA 4JNEA 1S3XA 5F1XA 3CJBA 5AQIA 5AQMA 3ULEB 3ZX3A 3FLCO 3D2FA 3CJCA 3EKUA 2GEMA 2YHYA 3UKRA 3FZHA 5KPTA 2A3ZA 3O6WA 3ENHA 4ISEA 4BRNA 3ID8A 3O1WA 3CHWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MO5A 1U2VB 4B08A 3KJVA 2Y1JA 3SV3A 4JHDB 1XQSC 4X62K 2D5RA 3N4QA 3THXB 1HKGA 1JLBA 3LALA 3HP6A 3V9ZA 2HBMA 3PO4A 1KC8O 5DM7L 3C6TA 5EOYA 3OYAA 3L2WA 3QNOA 5BREA 3V81A 1C0UA 1NKCA 2ZQBA 4CJFA 3MX5A 4X66K 4YOUA 3PV8A 5HRPA 2VWKA 4BRCA 1U47A 3G6EN 4FWMA 1NJWA 4FZZA 2ASOA 3AVGA 3VESA 1NNEA 2FF3B 2Q36A 2KQ2A 3AVKA 3J80O 1WSFA 2XO7A 3TANA 5JS1A 2YV0X 3ENOA 3NF8A 4JV5K 3KIOA 4CFDA 1Q82O 2HVHA 3OTOK 3CCQN 1T05A 4I2QA 3LDSA 2NNWA 4RW7A 4XH5A 3WEEA 3KK7A 5TKYA 2O8EA 4FWPA 3JYTA 4IBNA 1JL1A 3QEWA 3O1BA 3GE1A 1WBDA 1TKDA 3GG4A 1NJIO 3RMDA 4X65K 4DR2K 3HI0A 3FR0A 3CCMN 3L4IA 4I6MB 4O55A 1E4FT 1RILA 4O4GA 2NRWA 3PIPL 2HMIA 4FJJA 1C0MA 2JWLA 2ITGA 4CBUA 2B5JA 3M8QA 2D0BA 4K25A 4YDUA 4C8LA 2UUBK 1Z05A 1BCMA 2E5LK 1GLCG 3DXKB 2E1ZA 2G8VA 4V19S 1HJRA 4B9MA 3DXKA 3RVCA 1RDDA 3O3FA 4FJXA 2DPNA 4K41A 3TARA 3T1HK 2HVIA 2Q0UA 1T6DA 5EVZA 2P9KB 4AILC 4NXNK 4BWMA 4DV2K 2D0OA 2HHVA 3QB0A 4CJVA 4YOYA 4ELTA 4O0IA 3VENA 2WUSA 4BC5A 3E01A 1FJGK 4H0PA 3RRGA 3OYFA 3F9KA 1K9MO 2KFZA 2CH6A 4IOCL 4FWQA 5JS2A 4B9TA 4CF0A 5KRSA 2OZMA 3ZT4A 4BGAA 5AFUA 2QXLA 4JYAK 1RBTA 3VF2A 4FWSA 2HHWA 4DSLA 2BH1A 4GV9A 4CZLA 1XNQK 1JLCA 3KKRA 3KVGA 3OYJA 3NF7A 3PLAA 3OYDA 4KHPK 4E3SA 4BRGA 4FWNA 4EP4A 2GUIA 4N56A 4B9UA 3K9JA 3KLGA 2OPSA 4FJ7A 4M3WA 3AA2A 1EO1A 5KRTA 1Y64A 3O9SA 1YXQA 5E84A 3M5RA 1VSIA 3AAPA 3TTCA 5GAHP 1HNWK 1CZ9A 3O3GA 4OPKA 5AQKA 3SI6A 1X9JA 3S3MA 4FK4A 1N36K 2Q97A 3LANA 3CIPA 5GADP 3MN9A 1LW0A 4CJLA 3LZIA 3OYHA 1YJWN 1SV5A 4XEIA 4DQIA 3IG1A 1K8KA 3WQUA 1SKSA 4B1YB 2HHXA 2OCEA 4CEBA 1BQNA 4JI3K 2A1RA 3AVBA 2OPQA 3ZSRA 1R59O 4LH4A 1KAYA 4MDBA 4FM1A 3HTVA 1C1CA 4CJWA 5CR4A 2ZD1A 1RT4A 3TSUA 1WSIA 2A41A 3CJ1A 3CFOA 4NO7A 3U8XA 4KI4A 4N5SA 4GVEA 4M45A 2JLEA 2I7PA 2E6LA 5JLFA 2G8IA 3ZCMA 1LWCA 1IG8A 4FWKA 2OPPA 4L8RB 1YI2N 1WOQA 3NVKA 2J4RA 3AO2A 2Z1IA 2O8CA 3KHYA 4PKIA 3VQBA 4ILHA 3DM2A 3WNFA 3RSEB 4C23A 4A5AA 2CH5A 4PHTX 1ZBFA 3K0SA 3C6UA 1VQMN 3D0PA 3KZBA 1M1KO 4B9SA 4BRKA 1DGKN 3HZ6A 5AQXA 1QVFM 4DR4K 4OLAA 4JI7K 3MWTA 5CYMA 3OVNA 2FSJA 2HHUA 2DTUA 2W6LA 3P1GA 3ENBA 1BGXT 4CGIA 1QTMA 4C8MA 1RNHA 1NGHA 1I94K 1RCHA 3LDOA 3ZSYA 1HQEA 3O5BA 1QZ5A 5AQSA 5T7BA 4H5NA 5BRHA 3AVHA 3HL8A 3VEYA 3QEPA 1WBBA 1ATRA 3LP3A 3MN6A 3TAEA 3ZSOA 3U9DA 1VQLN 1U04A 4WF9L 3I56N 3SNNA 3V1RA 1YTUA 4LFBK 5FRMA 2E2QA 2HNYA 4H4OA 3TPQA 3LL3A 1VQ9N 4CEZA 1TVRA 4DKWA 2A5XA 1VSKA 2E2NA 2IVOA 4WFNL 4RTFD 2PAVA 5M1FA 1WLJA 4CGHA 1IKVA 3LPUA 1FK9A 4FWOA 4QOZB 3KWGA 1HNXK 4KB0A 5J2NA 5AQUA 1XC9A 4CHZA 3A5OC 3PY8A 2ZGZA 1BOTO 2LSNA 2RE2A 3CCRN 3V1OA 3NMUA 5AQVA 2UUCK 3R6MA 4ICLA 2WFBA 3K5NA 2PYJA 3QIPA 3HVTA 4O5FA 1J53A 4B3OA 3QDKA 3OYCA 5AZJB 1Q8IA 2NRTA 3KKSA 1NMDA 1LWEA 5AZJA 3SAHA 1VQON 1KSPA 4CE9A 3J7AP 3BZCA 4BG9A 2X74A 5GIOA 2O8FB 3RR7A 3MEGA 5DM6L 3O4WA 4IG0A 1VRUA 4FVUA 3BEXA 2KKZA 3CC4N 3BF3A 2DFEA 3ZSWA 2P5GA 2IOCA 3B6OA 4KHQA 2E6MA 3THWB 3BUZB 4DQQA 2VGNA 2JGUA 1N32K 4BRIA 3VQ9A 2QW9A 1Z6RA 3D7EO 1LCUA 1RBVA 3ALYA 2F9WA 4FJHA 4Z4EA 3CM5A 1TYQB 3OYMA 4NXMK 4C1NI 4DTPA 3KD1E 3OS0A 2D0PA 2UUAK 1NGDA 1NG9A 1YHQN 3OBWA 1KCFA 3KK1A 1L3SA 1S6QA 3H3NO 3V9WA 4QAGA 4M7XA 2NRHA 1YT3A 4NLCA 2HSTA 1SKWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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