4ISGA

Human glucokinase in complex with novel activator (2s)-3-cyclohexyl-2-[4-(methylsulfonyl)-2-oxopiperazin-1-yl]-n-(1,3-thiazol-2-yl)propanamide
Total Genus 150
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
457
structure length
418
Chain Sequence
KPMPLTLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESESGRGAALVSAVACKKACMLGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase
publication title Design, synthesis and SAR of novel glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase/transferase activator
total genus 150
structure length 418
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4isgA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4isgA01
1KAXA 4RCHA 1NGIA 4XEIA 5AQXA 3KZBA 3ZX2A 5AQZA 5ADXA 4BGAA 4A2BA 2OANA 2UYTA 1S3XA 3CETA 4NO7A 3W0LA 1XQSC 4FPAA 3EZWA 3UKUB 3D2FB 4BR9A 4QS9A 5AQHA 4BRDA 1U2VB 3MN5A 4AM7A 3VF6A 3WQUA 1KAZA 4FWPA 4WQ4A 1T6DA 3GL1A 5AQWA 5E84A 2FLOA 3VESA 1DKGD 2DPNA 2GUPA 3W3DA 4BQLA 5BRDA 4H5TA 1QQNA 1WUAA 1NMDA 3BF3A 3CIPA 3WUHA 3EKSA 3H1VX 1GLCG 2QWRA 4ISGA 5JLFA 3IFRA 3JS6A 1YUWA 4DCHA 2A5XA 4FSVA 3SMSA 1MWMA 1YVNA 2CGLA 3D7EO 1G99A 2QWLA 4RTFD 1QQOA 3VEOA 3LDOA 4E1JA 2J4RA 3QB0A 3A8YA 4PKHA 5AR0A 3MN6A 1LCUA 3O1BA 1D4XA 3BF1A 4B1YB 3DXKB 1NGDA 4H0VB 4BRKA 2CGKA 1GLLO 4BR4A 5LY3A 5EVZA 4PKGA 1BA1A 4BR5A 3ATVA 4RWTA 2FF6A 2BUPA 4H0YB 3ID8A 4HWIA 3UE5A 3MN7A 2P9SA 5AQFA 4BR2A 4MLEA 5ELZA 4WQ5A 5LJVA 3FZLA 4A2AA 2CGJA 4BRGA 3IUCA 4XH1A 4BRPA 4A61A 2ASPA 2GELA 3VENA 4CZJA 1E4FT 3I8BA 4BRMA 4FWOA 2P9SB 4MLHA 3MK6A 4M7XA 3WXIA 3WEEB 3ULEB 3FZFA 5AQUA 3WXLA 1NGCA 4A62A 4J8FA 4I6MA 3HTVA 3O08A 1DEJA 2KHOA 3ZX0A 4CBXA 1NGJA 2PAVA 2Q0RA 4CZHA 2Q31A 2QWOA 3U4LA 4BGBA 1BG3A 2E20A 2IVNA 1TUYA 2Q0UA 5F2RA 1U6ZA 5B8HA 5AFUH 3O4WA 3I33A 3C7NA 2GEMA 2CH5A 3VEXA 4CZMA 5F1XA 3FLCO 4I6MB 5I9EB 4DB3A 3M3ZA 2ASMA 1MA9B 4IZ9A 4H5VA 4C23A 1HLUA 5BN9A 1HKGA 4LC9B 3RSEA 3GE1A 1KAYA 3ENOA 3A0IX 3C7NB 4FWKA 2A41A 2FXUA 4YDUA 3O5BA 2Q36A 3J8AA 4Y0WA 5AQGA 3GBTA 1LOTB 1EQYA 2V7YA 3R6MA 1NLVA 3VEYA 2QWMA 1GLEG 3CERA 3FFKB 3G25A 1H1VA 3RSEB 3SJHA 3EL2A 3VGMA 3LM2A 3FZKA 2FSNA 4B1ZA 3ZETA 4PL8A 2FSKA 4JD2A 4FWSA 2E88A 3A5LC 4FWNA 1C0FA 1SZ2A 4M7YA 3CQYA 2D4WA 1NGFA 3JXUA 4B1XB 2QWPA 3O1WA 4PKIA 3O8MA 3H3OB 1CZAN 4BRAA 1TUUA 1J6ZA 1DGKN 2P9KA 4FWRA 2W41A 4JD2B 4FOEA 2P9IA 4BC5A 5AZJA 4BG9A 4M63C 4CZIA 1KXPA 4FOIA 5KPRA 1ATRA 3FGUA 5AQTA 3P4IA 3ENHA 2IIRA 2YHYA 5ADXH 2I7PA 2F9WA 3HBTA 1GLDG 1X3NA 3A5OC 3OHRA 3AY9A 5AQKA 5JMVA 1GLAG 3QFUA 3DJCA 3A5NC 3SMPA 4Z94A 3FE1A 2VCPA 2QXLA 2V7ZA 3MMVA 4BG8A 2P9IB 5AQPA 2I7NA 3LM9A 2ZF5O 5AZJB 4AM6A 4CI6A 2IVPA 5BN8A 1BUPA 1QZ6A 1MWKA 1HPMA 5F0XA 4H03B 3O80A 4IJAA 4GY2B 1HUXA 4KBOA 2HOEA 1Z6RA 2D0OA 1K8KA 3QFPA 1S22A 3UKRA 1YAGA 3IDHA 3ATUA 3VPZA 4WYBA 2BTFA 3CHWA 4CZKA 2NLXA 4EIAA 4H0TB 4PL7A 3WQTA 1BOTO 3CJ7A 4B1WB 3S41A 5BPLA 4O5FA 3R8EA 3CJ1A 3UKRB 2P9NA 2ASOA 1ZBSA 1NGHA 4BRHA 1RDWX 5AQNA 3VF2A 4CZLA 5KPTA 4BRNA 4BVOA 4JHDA 2Q97A 4EFHA 2HF3A 5AZIA 3VEWA 1BA0A 3LL3A 4H5WA 2IVOA 3H46O 4ISFA 2P9PA 4BRFA 5EY4A 1NGEA 1T6CA 4MO5A 2V51B 3R9PA 3FZMA 3VEZA 3LDLA 2CH6A 1BWFO 4BC4A 2W40A 3WXKA 3KHYA 1P8ZA 1GLJO 1RFQA 4H0XB 1HKCA 3MDQA 1E4GT 4K43A 3CQXA 1R59O 1WOQA 2E2OA 3CJCA 2P9PB 1MDUB 4FWLA 1V4SA 3L0QA 2YJEA 3L6QA 3F9MA 4EAHD 4JNEA 1SQKA 1ATSA 2D0PA 3FR0A 3VERA 3LDPA 2QWNA 3ZEUA 3VGKA 4L3QA 3CJ9A 3EN9A 5EXWA 5FPDA 3BEXA 1QQMA 1Z05A 4CZGA 1JCEA 3UB5A 5FPEA 3O6WA 4H5NA 3LDQA 4NB4A 3VEVA 4BRIA 3SLCA 2QWQA 1QHAA 1ZXOA 2FSJA 2A42A 3TPQA 2WUSA 1NGAA 2Q1NA 5AQMA 3WXJA 2AA4A 4XH4A 5FPNA 4BR0A 5BRHA 1NGGA 2P9LA 1C0GA 2E2PA 4EHTA 3HI0A 4ISEA 3D2FA 3QBXA 3M6GA 2V52B 1U2VA 4H5RA 4IXCA 4H0PA 4XH5A 3DXMA 1V4TA 5EOYA 3CI5A 4CD3A 4WQ5C 2YHXA 3ZETB 2P9LB 4K25A 3CJAA 2QM1A 5AQVA 2E8AA 3MN9A 3QBWA 4K41A 4BROA 1BU6O 5AQYA 4BRQA 2YCHA 1TYQA 2GTDA 3DXMB 2E1ZA 4BRLA 3U8XA 3QDKA 2P9KB 2H3GX 3HSCA 3QICA 1BDGA 4IJNA 3U9ZA 4FWMA 1HJOA 4IO8A 3VOVA 4DQ8A 3FZHA 4MO4A 3IMXA 2ZGYA 3AARA 2NZTA 4FO0A 3B8AX 1TYQB 2AP1A 1SAZA 3KVGA 1QZ5A 4BQZA 1XC3A 2FF3B 3D2EA 1JCFA 4BR7A 5AQOA 5AQRA 3DWLA 4QS8A 4CJ7A 3DXKA 5JICA 1Y64A 4BREA 2F9TA 5EX5A 2ZGZA 2A6AA 2ZWHA 2GWKA 1YXQA 1K8KB 5AQIA 4F9OA 4GNIA 3BP8A 3D2EB 5KQDA 1XUPO 4YDUC 4DHYA 4O8KA 5FPMA 1OKJA 5E26A 3VGLA 3SK3A 3GDQA 1GLFO 5BPMA 1NWKA 4H0OA 1HX1A 1NM1A 2ITMA 3H1QA 3GOIA 5AQJA 4B1VA 2EWSA 2HF4A 2P9NB 5KQ8A 3VETA 3MCPA 2E2QA 4B9QA 5AFUA 3LDNA 3BUZB 3H45C 3M1FA 3WT0A 2VYPA 2D1KA 3EO3A 3CJBA 4JHDB 5KPZA 3WEEA 3ULEA 4K42A 2GWJA 2YHWA 5AZIB 4CBWA 5LJWA 2E2NA 5TKYA 4WQ4C 1X3MA 3VF4A 1ZC6A 4FL9A 2YI1A 3TU5A 2A3ZA 3HZ6A 4EHUA 1RGIA 1NBWA 4IWVA 4CD1A 3ZX3A 2P9UA 4JAXA 4BVPA 4BRCA 4HTLA 5BPNA 1HKBA 3GG4A 3HM8A 1NGBA 4FPBA 3C0BA 3QMLA 2YJFA 1GLBG 4CBUA 5BREA 4BC3A 3U9DA 5BRFA 1T44A 4BC2A 2A40A 4CZFA 1IG8A 2P9UB 5AQQA 1Q18A 3H6EA 5AQLA 2VWBA 1ESVA 2HMPA 4FWQA 1BO5O 3H3NO 5JLHA 1JCGA 5BR9A 5AQSA 4QS7A 5CE3A 3ZEUB 2E1YA 3AAPA 4CZEA 1X9JA 3AAQA 2NRHA 2Q2RA 3UKUA 3EKUA 3A5MC 2QW9A 1ATNA 3DAWA 4B1UB 3L4IA 1IJJA 4JN4A 2PBDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RCHA 3LPTA 5AQXA 3ZX2A 5AQZA 3P31A 4BGAA 2XY5A 2OANA 1S3XA 4NO7A 3HVRA 4K0KK 3TTFA 3OYHA 4DLGA 4QS9A 3CCVN 4CHZA 1U2VB 1RTDA 3MN5A 4QOZB 4JI3K 4JK9A 4HHTA 4DV4K 2BANA 3SZ2A 3QERA 3JSMA 2YNFA 2DPNA 3W3DA 4BQLA 3NH2A 3SBGA 3AO5A 4H5TA 1N5YA 1WBDA 4X62K 3CCEN 4F8RA 4KPYA 2UU9K 2D0AA 1QE1A 4BACA 5M1FA 4B9UA 4KB0A 3NF7A 3LP0A 1HNXK 4F3TA 2A5XA 3DLLL 2G8KA 4E0DA 1VRUA 4B9SA 4CFAA 2G8IA 4HTUA 1G99A 1KTQA 2F7TA 4E1JA 3U6FA 4BWJA 3K9JA 4PKHA 3MN6A 2JWLA 1D5AA 1NK6A 1D4XA 1W2BM 3HJFA 3BF1A 1L3UA 4CGGA 3CXCM 2O8EA 1NJIO 2G8VA 3DXKB 4CJEA 4BRKA 2CGKA 3OBWA 1N8RO 4BR4A 5LY3A 5EVZA 1XMQK 4PKGA 4BR5A 5GIOA 4RW9A 2UXCK 4JKEA 2BGGA 4H0YB 3TARA 2KW4A 4B3RK 3AO1A 1UWBA 4BR2A 1T05A 1W0HA 3HL8A 2RN2A 5LJVA 4A59A 4FJ8A 4E3SA 2HB5A 3MEGA 4XH1A 3DMJA 3VENA 2WTUA 3WXIA 3FZFA 3MECA 1S6QA 3WXLA 1NNEA 4A62A 4J8FA 4I6MA 3AVBA 2O8FB 1DEJA 4CHNA 1HNIA 1BISA 4FM1A 3BDPA 4CIGA 3PO5A 3IKMA 4CZHA 3EYZA 1TKZA 5F2RA 5AFUH 4DTOA 4I2QA 3VEXA 4NYFA 3FLCO 3KKSA 5I9EB 3M3ZA 1MA9B 4IZ9A 4EZ9A 3RSEA 1TK5A 3HSTB 3U3YA 3WXMB 3AGKA 2Q36A 4KB1A 4I9QA 4Y0WA 2V7YA 3MX5A 4PQUA 5JS1A 2HHTA 1IV0A 1KRPA 3R6MA 2HHQA 1KSPA 4RW8A 3AGRA 4QCLA 2QA4N 1KC8O 1LV5A 2YX6A 1VSHA 1I39A 1VSJA 4GV9A 3OYGA 4FWSA 1RBRA 1C0FA 3CQYA 3PIPL 4CJRA 2QKBA 3JXUA 4B1XB 3O1WA 3OYNA 3RR8A 1CZAN 2HBKA 3B6PA 3NH0A 4G1QA 1TKDA 1DGKN 2HW3A 1N36K 2W41A 3AVFA 4BC5A 4LH5A 1KXPA 4FOIA 5KPRA 3DLKA 3ENHA 5ADXH 1X3NA 2WOMA 3BY5A 5AQKA 1SL1A 2OTJN 3A5NC 3SMPA 3TAQA 4BG8A 2P9IB 3ZSWA 2I7NA 5AZJB 2HBJA 1KVCA 4U67L 1NMNA 1HR0K 4CCHA 2KZZA 3M8PA 4DSEA 4LFAK 1QHTA 1HPMA 1U45A 3O80A 5M1NA 1ASVA 1HUXA 4GY2B 3VMFB 2W6LA 4KBOA 1Z6RA 5CHIA 2KZMA 3CMEN 3TABA 4DTXA 1JLGA 3DRPA 5I3UA 3TTDA 4I7FA 1C0MA 4FLTA 2IS3A 4B1WB 1W7AA 5BPLA 4B3TK 2DFFA 1SV5A 3VF2A 4CZLA 2Q97A 4DV5K 4GW6A 3DOLA 1KVBA 4CJ4A 3VA3A 2XY6A 4CVNE 1T8EA 2UUBK 4B9TA 3V9SA 1NGEA 3L4QA 3C6AA 3CYMA 4BC4A 1N34K 1N32K 1P8ZA 3EEQA 5HRRA 4GV3A 4IOXA 1WOQA 4Z4GA 5GIPA 3F5TA 1C6VA 4FWLA 1V4SA 3L6QA 1DT9A 3VQ4A 4KHYA 4B9MA 3T1AA 2PY5A 2E4LA 3KKRA 2UUAK 1QSLA 4GKKK 2YKNA 2QWNA 3B6OA 1JLEA 3U3GA 3VN5A 3EN9A 4HCCA 3TSQA 4YOXA 1XC9A 1QQMA 1WN7A 4CHQA 5FPEA 4BRIA 1QHAA 1ZXOA 2BE2A 3TPQA 1S1UA 2WUSA 3AVMA 3TAEA 3M8QA 2OPQA 2AA4A 4Z4IA 2KKZA 4K8ZA 3LWMA 1C0GA 1QTMA 3M6GA 3VQ6A 1U2VA 4H5RA 4XH5A 4Y1CA 1YJWN 4YY3K 5HRPA 3S3NA 4K25A 5FLXO 3KK7A 1A5WA 3K5LA 5DM7L 2X74A 5AQYA 2YCHA 3QEXA 1S1TA 2HNDA 2GTDA 2RPIA 5CZ1A 2E1ZA 2PFUA 4ZTJA 3U8XA 3SQ1A 4CHYA 3OBYA 4DR4K 3QICA 1BDGA 4IJNA 4WCEL 1B92A 3EZ5A 4OLAA 4IO8A 3FZHA 3AO2A 4GKJK 5H1SQ 1S72N 5HROA 3QEPA 2FBTA 4N56A 4O55A 1SAZA 4CERA 2FF3B 1JXEA 1YI2N 3OW2M 3SAGA 3DXKA 1JJ2M 2P5OA 1Y64A 2F9TA 5EX5A 5LMUK 2A6AA 5AJ3K 3Q7CA 1WSGA 2G8FA 4DTSA 2P51A 3WNHA 4YDUC 4CK2A 1U4BA 4DR3K 1J53A 3OYAA 4DTMA 1HX1A 3H1QA 2IAJA 5AQJA 4B1VA 4FM2A 5AFUA 3WT0A 1IBLK 2VYPA 1VQKN 3CCMN 3V4IA 3EE8A 3PX6A 5IT9O 1TV6A 1YIJN 1LAVA 3T19A 4CBWA 5LJWA 1YTAA 3THYA 4GVEA 3SQ4A 1X3MA 3CFRA 4KHWA 2OCEA 4E7HA 1XNQK 3THWA 1SL0A 3O3HA 4CF1A 3ZX3A 2B5JA 1Q7YO 1A5XA 3LAMA 5BPNA 1B9FA 2ZE2A 3ZSXA 5JVHL 4KH6A 5C42A 1YHQN 3ZT0A 1GLBG 1CLQA 3AV9A 2VWKA 4JKGA 4CJLA 3PIOL 4CZFA 1RT4A 4CF2A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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