4ISGA

Human glucokinase in complex with novel activator (2s)-3-cyclohexyl-2-[4-(methylsulfonyl)-2-oxopiperazin-1-yl]-n-(1,3-thiazol-2-yl)propanamide
Total Genus 150
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
457
structure length
418
Chain Sequence
KPMPLTLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESESGRGAALVSAVACKKACMLGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Design, synthesis and SAR of novel glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase
molecule tags Transferase/transferase activator
source organism Homo sapiens
total genus 150
structure length 418
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2013-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4isgA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4isgA01
3MDQA 1YAGA 4ISFA 4EHTA 1QHAA 2P9UA 3QBXA 1BWFO 3VOVA 2VYPA 3CJCA 4A62A 3A5NC 3O08A 5AQIA 2A6AA 1HJOA 3CQXA 3MMVA 1U2VB 3KZBA 2FF3B 1BO5O 4O8KA 2V51B 3DXKA 4JNEA 1GLBG 1NGAA 2E2QA 3VEOA 2D0OA 1G99A 2GELA 2E8AA 1S3XA 3B8AX 4BRCA 2E1YA 4CZHA 2D4WA 5BREA 3MN9A 4B1YB 4I6MA 3EZWA 1GLDG 3GOIA 1NBWA 4HTLA 4BRGA 1TYQB 4DQ8A 2P9NA 4BROA 5AQLA 3FR0A 2QM1A 4H5TA 1HKCA 2D1KA 2NZTA 3FGUA 4NB4A 1RGIA 5E26A 1BA0A 1MWMA 4CI6A 3VEWA 2PBDA 1NGCA 1ZC6A 3ATVA 3FLCO 5BN9A 3ZETB 3VESA 4BC4A 4CZFA 4GY2B 3WXLA 5KQ8A 3BEXA 3FZMA 4QS8A 1KAZA 2F9WA 5KPZA 3LDQA 3CJ7A 3VF4A 3WQUA 4XH4A 1Z6RA 4BG8A 2QW9A 5AQTA 3H46O 1U2VA 2GWKA 1E4FT 2CH6A 1S22A 3HM8A 5BPNA 5AFUH 3HI0A 3D2EA 3F9MA 1T44A 5F2RA 4AM6A 3DJCA 4LC9B 2BUPA 2V52B 3IFRA 4FWPA 3VGKA 2P9UB 2UYTA 4RCHA 2E2NA 4HWIA 4PL7A 2BTFA 5BRDA 1MWKA 4JAXA 2HMPA 3C7NB 3ENOA 1YUWA 3IUCA 3RSEB 3M1FA 4XH5A 1K8KB 3H3NO 1TYQA 1MDUB 3W0LA 2D0PA 2Q1NA 3O5BA 4BRIA 4CZJA 1ZXOA 2CH5A 3VEVA 4IJAA 5BRHA 2A5XA 4BR0A 1XQSC 2QWOA 3VF6A 1QZ5A 3UKUB 4C23A 4M7XA 1BA1A 3ZETA 1TUYA 4BRFA 4BRNA 3ZX0A 4DB3A 4CZEA 3QFUA 4FWMA 4IWVA 2GWJA 3MCPA 5AQNA 5AQXA 3WQTA 4K43A 3WXJA 1ATSA 4MLEA 4WQ5C 3IDHA 4BG9A 3UKRB 3EKUA 3A5MC 2ZGZA 3VERA 4FWLA 2H3GX 4H03B 2YJFA 5FPNA 1KXPA 4NO7A 4QS9A 3A8YA 1KAYA 4RWTA 2ZWHA 4BC5A 3LDLA 3UE5A 4BGBA 5AQVA 3M3ZA 1V4TA 3VETA 1HLUA 3FZHA 3DWLA 5AQFA 4BGAA 2QXLA 2KHOA 4DHYA 4EAHD 3C7NA 5AQHA 3RSEA 3P4IA 2IIRA 1K8KA 5FPDA 2P9KA 4M7YA 2NRHA 3VPZA 4A2BA 1NGFA 2CGKA 3U9DA 3D2EB 3GG4A 3VF2A 2Q97A 1GLCG 4H5VA 4B9QA 3MN6A 4BRDA 4XH1A 3L6QA 1NWKA 4BR4A 4IZ9A 4E1JA 3TPQA 3UKUA 3ZX2A 5AR0A 1Y64A 3HBTA 3LDOA 3R6MA 1X9JA 3ZX3A 4K42A 4B1VA 5KPRA 3OHRA 5KQDA 1EQYA 4FWSA 3GBTA 5AQSA 2CGLA 2GTDA 3WUHA 5ADXH 1DEJA 5BRFA 3HZ6A 5JICA 5AQOA 3LM9A 5EX5A 4KBOA 3UKRA 4EFHA 2Q36A 3I33A 1BDGA 4IO8A 1DGKN 1LOTB 1NGJA 5AQPA 3SK3A 4FSVA 1NMDA 4MO4A 3R8EA 1QQMA 5B8HA 1J6ZA 2P9IA 4QS7A 1RFQA 2E2PA 4FWKA 1C0GA 2FSJA 2Q0UA 5E84A 4FO0A 4FPAA 4PKHA 3VGLA 1MA9B 3MK6A 4DCHA 4L3QA 3VENA 1SZ2A 1HPMA 3I8BA 3HSCA 1IG8A 5LJVA 2A40A 5BPMA 4MLHA 3ZEUB 2QWLA 3W3DA 4WQ4C 5FPEA 3SJHA 1DKGD 4CZGA 3C0BA 1NGHA 3CETA 1WOQA 4AM7A 4WQ5A 5AZIA 3QDKA 3VEYA 4ISGA 2ITMA 3AY9A 1T6DA 1XUPO 3KHYA 2AP1A 3CERA 2DPNA 3ID8A 4YDUC 1CZAN 2P9KB 2GUPA 5AQJA 2YJEA 3U9ZA 3GDQA 4A61A 1IJJA 4IXCA 1D4XA 2YHXA 5EVZA 3TU5A 4EHUA 4BRKA 2IVNA 3A0IX 2I7PA 4B1XB 4BVOA 1E4GT 2ZF5O 5KPTA 3ATUA 2J4RA 3EKSA 1Z05A 1RDWX 4CJ7A 1BUPA 3CJ9A 2QWRA 3A5OC 4B1UB 1HKBA 2QWPA 3EO3A 1YVNA 1LCUA 3GE1A 3JXUA 1GLLO 2AA4A 4H0OA 2W41A 4BR9A 2V7ZA 2W40A 2FXUA 3ZEUA 2P9LB 2P9IB 4H5WA 3VGMA 3A5LC 1BU6O 3SMSA 5EY4A 1X3NA 1ZBSA 4CD3A 1P8ZA 3UB5A 5BN8A 1SQKA 2FSNA 1HX1A 3CIPA 5AQKA 5AQWA 1ATRA 1NGGA 1QQOA 4H0XB 3O1WA 4CZLA 5LY3A 3GL1A 3IMXA 3R9PA 3CQYA 4GNIA 1BOTO 1HKGA 3G25A 3M6GA 2E2OA 3WEEB 4FWOA 3H6EA 3O80A 5JMVA 2Q2RA 4FWRA 4A2AA 5JLHA 3DAWA 5BR9A 2ZGYA 4BC3A 4CBWA 5AZIB 5AFUA 3BF3A 3O1BA 1R59O 2VWBA 2ASMA 2HF4A 2ASOA 2E88A 5AQRA 4BR5A 2YCHA 3H1QA 5BPLA 2FLOA 5AQQA 4K41A 4BR2A 4WQ4A 3J8AA 3QFPA 4MO5A 3L4IA 2OANA 4JHDB 2E1ZA 3HTVA 3DXMB 4IJNA 1JCGA 4BRPA 2VCPA 4FPBA 3LM2A 4CZKA 4O5FA 1GLJO 2V7YA 4H0TB 4WYBA 2HF3A 4YDUA 5AZJB 2QWNA 3CHWA 2I7NA 2P9LA 4CZIA 4BQZA 2P9PB 5AQMA 4B1ZA 1JCFA 3ULEB 3FZFA 5LJWA 2IVPA 4PKGA 1GLAG 1U6ZA 2PAVA 4Z94A 5JLFA 1JCEA 3O8MA 3FFKB 2GEMA 5ELZA 1X3MA 3CJBA 4BRAA 1NGDA 1V4SA 3D2FB 4BREA 1NGBA 5FPMA 3WXKA 5I9EB 3WEEA 1XC3A 1GLFO 5EOYA 1ESVA 4M63C 4H0VB 4BC2A 3AARA 4JD2B 2YHYA 4K25A 4CBUA 2WUSA 4H5NA 3KVGA 3D7EO 4FL9A 3AAQA 3U8XA 3LDPA 3BF1A 4BVPA 1C0FA 5CE3A 3H1VX 4FOEA 2E20A 2A3ZA 3MN5A 3H45C 2EWSA 3SMPA 3U4LA 2YI1A 3VEZA 5F1XA 3CJAA 1OKJA 4ISEA 3QB0A 1GLEG 1NGIA 3AAPA 3WT0A 3O4WA 4F9OA 1NM1A 2ASPA 3EL2A 2IVOA 2P9SB 4JHDA 5AQUA 4RTFD 2Q0RA 3DXMA 3JS6A 1YXQA 4BR7A 3LL3A 3FE1A 1T6CA 1KAXA 3BUZB 2A41A 4H5RA 3VEXA 3QBWA 1NLVA 4XEIA 3QICA 3QMLA 5AZJA 3BP8A 2HOEA 4JN4A 4FWQA 3H3OB 1TUUA 4CBXA 2P9PA 3S41A 3ULEA 3DXKB 4BRQA 4PKIA 4BQLA 1QQNA 4Y0WA 2YHWA 1HUXA 2QWQA 4FWNA 4BRHA 3CJ1A 3D2FA 4J8FA 1H1VA 5ADXA 3ENHA 3FZKA 2FF6A 4I6MB 4BRMA 4PL8A 5AQGA 5AQYA 1Q18A 5AQZA 2P9NB 1SAZA 5TKYA 2NLXA 4JD2A 3SLCA 3EN9A 3FZLA 4FOIA 4H0PA 1NGEA 5F0XA 3L0QA 3LDNA 5EXWA 2Q31A 4B1WB 3MN7A 4BRLA 4H0YB 1BG3A 2CGJA 2A42A 3CI5A 3O6WA 1WUAA 1ATNA 1QZ6A 4CZMA 2FSKA 2F9TA 4EIAA 3WXIA 2QWMA 2P9SA 4CD1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NMNA 1YAGA 2HNDA 3VOVA 1BWFO 2XY6A 2VYPA 4ID1A 4B9UA 1VSMA 1HJOA 3NGZA 5GAEP 3QIPA 1GOCA 4O8KA 4CECA 2V51B 3DXKA 4JNEA 3K5LA 2VG7A 3EYZA 2GELA 3OYJA 4YHHK 3V9ZA 3SNNA 4IO9L 5BR8K 3K5NA 1W9HA 4CZHA 1VAZA 4CIEA 3VQ6A 4JS5A 1GLDG 4Z4GA 4M3RA 4DQ8A 4DKWA 3CG7A 5CY4A 2P9NA 5JVGL 5M1QA 3QIOA 4IDKA 2NZTA 1BA0A 1Q7YO 4CFDA 4FJ7A 4CI6A 3VEWA 3HL8A 3RMDA 4DR7K 5C2FA 1M1KO 3KK1A 3ZETB 4FLTA 4BC4A 3BEXA 1UAXA 2WBNA 3FZMA 3JAMO 5KPZA 4JKGB 4O4GA 3LDQA 3VF4A 2QW9A 1IG9A 4DR1K 5AQTA 4WF9L 3M8QA 2XY7A 4IDHA 1U2VA 1KVCA 5J2QA 1XI1A 3HM8A 2HBKA 3QEIA 4AM6A 3ZT3A 1S1WA 2OTLN 1QVFM 3ZSZA 1RT1A 2BUPA 1KQSM 3CC7N 1VSDA 4LF8K 2UXDK 2E2NA 3THXB 4DR6K 3S3MA 4HWIA 4JI8K 4M3XA 5C10A 1VQ5N 3DRRA 4JAXA 3C7NB 3ENOA 1YUWA 2WTUA 1K8KB 3W0LA 3K59A 4ELVA 1JXBA 1NK9A 3THWA 4DUZK 1OH7A 4BRIA 2F8TA 1U47A 3VEVA 4IJAA 5KTQA 3K9JA 1J5OA 3V9SA 2A5XA 1L3TA 1WSIA 5HRRA 1YT3A 4CJ5A 1BA1A 4BRFA 1A5WA 5HRSA 4CEFA 3OS2A 4IWVA 2GWJA 4G1QA 5AQXA 3WQTA 3WXJA 1ATSA 2XRIA 4DR4K 4BG9A 3UKRB 3DM2A 1KC8O 2ZGZA 3T3FA 4DFKA 3CD6N 4FWLA 4DS4A 2VQFK 4NO7A 4E89A 1L3SA 4RWTA 4B3MK 3D45A 1RBSA 4H4OA 5AQVA 3OA9A 1HJRA 3OW2M 3SUQA 1T8EA 1HLUA 4KKOA 4DS5A 4BGAA 3D6RA 1BIZA 1DT9A 5FPDA 1NJIO 3VPZA 4A2BA 3CPWM 2DTUA 1NGFA 3ZT4A 4FLXA 3GG4A 3ZT0A 2Q97A 4CF2A 4FVUA 3IG1A 3QEPA 4CJVA 1RT6A 3VN5A 4BR4A 4B9NA 5C25A 4IZ9A 1Q86O 5AJ3K 1NK6A 3ZX2A 4DWIA 3AVFA 4C8KA 4CVNE 5KQDA 3OYKA 1G15A 1Q81O 2CGLA 3N4QA 1DEJA 3LAMA 3HZ6A 3OJSA 1UA0A 1ILYA 1VSJA 1HMVA 1TKXA 3LM9A 5EX5A 3K57A 3CCRN 2WC9A 2YHBA 1YHQN 3I33A 4IOXA 1BCOA 3VA0A 2KZMA 5FRNA 4MO4A 3R8EA 1QQMA 2OZSA 4QS7A 1VRUA 4IFVA 1S1XA 5E84A 4FO0A 2P5GA 3O9UA 3ISNC 4Y1CA 1N33K 3ZSQA 3AA3A 1TAQA 3WNGA 5BPMA 1NKCA 1LWEA 2G8WA 3ZEUB 2QWLA 3W3DA 4B3RK 1DKGD 4CW7B 2HNYA 1WOQA 5AZIA 3MEDA 3ZSWA 4ISGA 2QTDA 2AP1A 3CERA 2DPNA 3ITHA 3KJVA 1CZAN 4M41A 4CFBA 2P51A 2YJEA 3U9ZA 4C8NA 2YHXA 5EVZA 4FJKA 1WLJA 3NHGA 5M1OA 3NCIA 2Z1JA 1W2BM 4B1XB 3AVGA 4GMJB 1Z25A 1RDWX 3KKSA 4LF9K 3C6AA 4CJ7A 2UUBK 1VQNN 3V9UA 4MDAA 3LP0A 1OVQA 4OPKA 3HP6A 2O8EA 4ELTA 4JI3K 1TK0A 2VQEK 3I56N 3JXUA 1GLLO 1IKWA 2B6AA 4IKFA 3HM9A 5C42A 1IKYA 2W40A 4RW7A 3O3FA 2P9IB 1T7PA 3A5LC 3TWHA 4FYDA 4C1NI 1P8ZA 3LPTA 3UB5A 2HW3A 3C95A 5BN8A 1SQKA 1HX1A 3CIPA 4I2PA 1QQOA 3RMBA 3RR8A 4KH5A 4BWJA 2WOMA 3P83D 1HKGA 4X66K 3DRPA 1K73O 2Q2RA 4A2AA 4BC3A 4IBNA 5LL6Z 4E1MA 1LWFA 2ASMA 1ZBUA 4B3TK 5AQRA 1VK0A 2O4GA 5AQQA 4K41A 3VQPA 3QFPA 4MO5A 2D5RA 2OANA 2X74A 4JHDB 3LWLA 1ZBHA 2OTJN 3KWGA 4KH6A 3LAKA 4BRPA 3SV4A 3SYZA 5HRNA 3OS1A 3VA3A 4CZKA 3L8BA 2HHUA 2A1RA 1K6YA 3AGKA 4QAGA 2EX3A 3AVLA 2P9PB 4B1ZA 3V1QA 1RT5A 5LJWA 3KWIA 4PKGA 5JLFA 2PAVA 1FKPA 3CJBA 1KLMA 1VQPN 1EWQA 1VQ7N 3E9LA 1NGBA 5JS2A 1KVAA 5FPMA 3K58A 4KHSA 3WXKA 1SL1A 1CLQA 3WEEA 1GLFO 1BQNA 4H0VB 1IBKK 4JD2B 3E66A 5CYQA 3KVGA 2LSNA 4FL9A 4EP5A 4CGHA 5CE3A 4LH4A 1X9MA 4FOEA 4YORA 3J80O 2XHBA 3MN5A 1NKBA 3THVA 3U4LA 3TABA 3VEZA 3AVIA 1TKDA 5F1XA 3CJAA 4ISEA 3DI6A 3WT0A 1NM1A 1VSHA 1S72N 3Q7CA 3DXMA 4YOWA 4BR7A 4WFAL 2XY5A 1T6CA 4FLUA 4H5RA 4DUYK 3OVNA 2JWKA 5HLFA 3O9SA 1I94K 4CFAA 1NK0A 5C2DA 3L2WA 3AA2A 4JN4A 1HNXK 3QLHA 3S41A 4HCCA 1RBTA 1RDBA 3ZSXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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