4ISRA

Binding domain of botulinum neurotoxin dc in complex with rat synaptotagmin ii
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
422
structure length
414
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNDNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYWFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal Structures of Botulinum Neurotoxin DC in Complex with Its Protein Receptors Synaptotagmin I and II.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Neurotoxin
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 94
structure length 414
sequence length 422
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4isrA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4isrA02
3NV3A 3BAGA 1AJKA 2XOAA 4JQ0A 5B2HA 4BM8A 5CB7A 5JDBA 1R1ZA 4ZGRB 4YM0A 4XBQA 3AH2A 4IY8A 1II4A 3IPVB 3OBRA 4XXPA 2C9AA 9ILBA 4GALA 4I4SA 5FNWA 2ZGTA 3N7KA 4GP3A 3AJYA 4HA2A 2ZGPA 2JE7A 1JN2P 4J2SA 3PMEA 4UW6A 4GXLA 1KDKA 2AQZA 1HCEA 3AKFA 1LECA 3ZPYA 2BQPA 4FQ4A 4LBJA 1V6UA 1RIRA 3CRHA 2UWCA 4H9WA 1QDCA 2A6YA 1S0CA 1YI7A 2WSUA 4I0YA 4QALA 3WG4A 2M49A 1LOBA 2KI4A 4I30A 1FX5A 4XFSA 2WQZC 3OBTA 1G9BA 4LO2C 4DCKC 1FWUA 1FNZA 3M3OA 1G9CA 1FQ9A 5G00A 4XJ9A 1SLTA 2HW9A 4EFQA 3AZXA 2ZGOA 3NBEA 3AP7A 3WDVA 1MD6A 4Y20A 3WINC 1UN1A 3WO3A 1Q8OA 1GSLA 2YROA 1M16A 3RTJB 5DSSB 3ZX7A 4P9YA 3NWKA 4GA9A 1TWMA 2WJSA 1ABRB 2VY0A 3RMXA 1ENQA 3N0KA 4I37A 3N36A 4YM3A 1JY0A 1NUNA 3Q7XA 1QQLA 4YW1A 3QR5A 1Y7BA 4LO0C 1IRPA 1LOFA 1BXHA 1W0OA 3C2UA 2Z48A 3QYDA 2WT1A 5T5OA 3ENRA 3WO2A 1A8DA 4GKXA 2FMDA 5DZUA 3HSMA 4I4UA 1KJRA 1EVTA 3T1LA 3UD7A 1WD3A 4XE9A 2MC2A 1V6IA 3B9CA 4FPLA 4QKSA 2D6LX 1EV2A 1FWVA 3L2YA 4I8MA 3A22A 5DUXA 3ZVXA 1I3HA 1AVBA 3ZXEA 4AYUA 1S0EA 4AWDA 4JAWA 4M01A 3NV2A 3NBCA 1CN1A 1I1EA 1G7YA 4FPEA 1WLCA 2AUYA 2GNTA 2AREA 3ZSLA 3H6RA 3WCRA 1Q03A 4QC4A 1AVUA 1JHNA 3O0VA 4JP0A 2NP0A 4XZPA 1N1SA 3VWCA 3AYEA 3SNVA 3S8KA 1B09A 1DYKA 4GWNA 4PCRA 1VIWB 1YYNA 1BASA 3W9TA 4OWJA 5GLVA 3VKFC 1ENRA 1WCSA 2JE9A 2P3KA 1JTCA 2NMNA 1MZ6A 4GOYA 3PUBA 4G6JA 3T8SA 4ZLBB 1AXMA 3QCWA 5BOWA 1XZZA 3UJ0A 2SLIA 4HJJA 5AVAA 1HCDA 2D22A 2K8RA 1SZ6B 4J2YA 4XFTA 4L4IA 1OQLB 1T4QA 2KI6B 1JYCA 5CAZA 2VUAA 1LGCA 2W52A 2ZHMA 4MYEA 5EG6C 4PF5A 3FJBA 3PHZA 3AYCA 5KXDA 1LOGA 5FRAA 3FBYA 3UD9A 5CA6A 3UL2A 1G9AA 2FFVA 4KBBA 3CA1A 4EEEB 4JC1A 5DUWA 2R9KB 1IOBA 3IM6A 5HCBA 1WW4A 3VKNA 2QN4A 1CJPA 5EHAA 1KITA 4YGCA 1UKGA 3LSDA 3N7MA 5GZCA 1RG8A 5BP5C 2FGFA 5FZZA 4HANA 1QOSA 2ZHLA 4J2KA 4CZSA 3O49A 1SLBA 3P53A 1T9FA 2P2KA 2D3RA 1P63A 5E24E 2Q9XA 1GLHA 2I1BA 2MIBA 4A7KA 4WZFA 3TAYA 5E89A 2ES3A 5T52A 5H9PA 4IZEA 1DQ1A 1JQZA 3FLTA 2G4IA 3A0NA 3EF2A 2VSAA 4I96A 1W6MB 1CVNA 3MEPA 3BAHA 1BKZA 2EXKA 4ZXKA 4JCKA 1H9PA 2A7AA 2OUHA 2A6WA 3H6QA 3ILAA 1DQ6A 4FPOB 3WO4A 4CJMA 3N3HA 5FZUA 2VLCA 1PZ7A 1UPSA 2ZABA 5DG2A 4YFZA 5BXPA 4Y22A 4GAFA 1PZZA 2E4MA 5DUVA 3M3EA 4XXAA 2ZGSA 4DRRA 3O3QA 2JKBA 1WUVA 1OKQA 1PC8B 5DXDA 3ILFA 3ASIA 3INAA 3AP6A 1F5FA 2CWSA 3S8JA 3ILRA 5F8WA 2GMMA 4YZ4A 2D24A 5GALA 3T2TA 2VXTI 5IK4A 1EYLA 3WNXA 4GWMA 1Q56A 2NM1A 3LTQA 2OVUA 1JT4A 3V0AA 4DS0A 1BA7A 3IM5A 1LU2A 1AXZA 1ITBA 1W3AA 1FYUA 4YZ1A 3FJIA 1S1AA 4FVVA 5E8AA 1F31A 3M3CA 4BMBA 3WA1A 2F8XC 3ZXDA 4LO7C 3W58A 2PHXA 4QO3A 1LJ7A 3I2XA 4XJWA 3O12A 1S0JA 1S0LA 1WD4A 3O5WB 1Q8QA 3AYAA 3VT0A 3RQ0A 4R9BA 4P0JA 1WW7A 2R0FA 3BODA 2DRYA 4LBQB 3ZXKA 2UUSA 2GNMA 1ISWA 3WDUA 1SBEA 1NZKA 1GKBA 2PHRA 4JPZA 2GN7A 4QBVA 5KXEA 1URXA 6I1BA 2KKIA 3A23A 4XIOA 1Z0HA 3RS6A 3SH3A 3AXDA 2NVHA 3NV1A 2DRZA 3IN9A 2ZGLA 1K5UA 3RRDA 3FGMA 1GZWB 1ULDA 2EAKA 5F8SA 1QNWA 1LHVA 2RQ9A 4YG6A 2Q5TA 1WBFA 2LIQA 4C1XA 4G9NA 3OJ2A 2ERMA 2PHFA 4AN6A 1PZ9A 1IKPA 3BA5A 1MS9A 4YGEA 2EXJA 2GALA 5L73A 1C4RA 1X50A 2VXRA 2DUQA 3BA4A 4YFWA 4BQ1A 2OUJA 4QD2B 3V79C 2ERFA 1S0GA 4LO7B 2CTVA 5DUUA 2JJ6A 2ZR1B 4LBOA 1FN0A 1AX1A 4M3CA 2ARBA 2GMPA 1V6VA 1F9KA 2D6MA 4Q9PA 4FPFA 1PUUB 4EKXB 3BAQA 1XQNA 1ISYA 5DVHA 2DVDA 4FPHA 2D44A 3JRRA 2ZMLA 2YMZA 1ILR1 5GLUA 4YW2A 3H0OA 3SH5A 1Q1UA 3FJFA 5BVPI 4R9DA 1G8WA 41BIA 2AR6A 2BFHA 4J2XA 3MW3A 3VSFA 2E7QA 4LO3C 1QGLA 1DFQA 4Q1PA 5IK5A 1YBIA 3RTIB 1BFBA 2NN8A 4YM1A 1FNYA 4Y20B 3BIWE 3ATGA 5GM0A 5FZYA 3USUA 1QF3A 4F34A 2WBCA 2A6ZA 5EYYA 3ZC9A 1HKNA 2K43A 7I1BA 2UURA 1ONKB 3BAUA 4XHBA 2C5DA 4EB2B 2HWAA 1MR5A 2ENRA 2LTNA 1DQOA 1HQLA 2NYYA 2Z42A 4ZKTB 3FJJA 4XYXA 4AVVA 3R05A 4IHZA 1ONAA 2WSVA 3MW2A 2DYCA 5EWSA 3AYDA 3PVOA 3APBA 5GLTA 3WV6A 2W39A 1V6KA 5H9QA 5T5LA 2P34A 3SH4A 3SITA 3FJKA 4ZFYB 5JLVA 3CA5A 1R8NA 3WDXA 4K20A 5F5QA 4EFRA 3V64A 1V6OA 1LCLA 1GZCA 4P0KA 3POWA 1E0OA 2PHTA 5DZEA 1BJQA 4Q91A 1A78A 3I29B 1ZA4A 1AFCA 2Y9XE 2D20A 5JOXA 3BAOA 4Q26A 4IZXA 1W3GA 3BRFA 2D3SA 1LGBA 1S0IA 1XHBA 3H6RB 2ZGQA 4FOWA 1VAVA 4LO8B 3Q7WA 4USPA 1LHOA 5GJ6A 2RHPA 1WBCA 1AX2A 1HQWA 1Q8PA 4PBPA 2ZHKA 3BTAA 4JKXB 1I1BA 2DUPA 1RY7A 1IS3A 3UJ4A 1KJLA 4J23B 1CVSA 1ULGA 2XG3A 2GN3A 2ZGKA 1AX0A 3WUCA 2D6PA 2P3IA 3LSEA 2BEBA 4OWKA 4LO3A 3BOPA 4X37A 2HZ9A 1SFYA 1SLLA 3AXEA 4IYBA 4FQZA 4P9XA 3AP9A 1RZOB 2ZMNA 1W6OA 3JUUA 5CBLA 2Y9FA 5DZGA 4AGRA 1AVWB 3E8LC 4Y26A 3C9ZA 2TEPA 3I8TA 2D7FA 3O0WA 3NBNA 2E4MC 1VCLA 5FREA 4OW4A 3V0BA 4YW4A 5GZFA 1A3KA 2JDZA 3WMUA 1FMZA 1OQ1A 3LLPA 1LTEA 4R9CA 1GNHA 4WVWA 5JOWA 2EF6A 2HWMA 2E7TA 4OEEA 3VEQA 4K1YA 3MALA 2DVBA 2GNDA 2A3YA 5JMCA 1IS4A 2ZHNA 1IRAX 2AXMA 4XKIA 1QOOA 3CNAA 1NLSA 4KEIA 3O4CA 4G1RA 3WZ1A 1XG6A 1EPWA 3AP4A 3WDWA 3TC2A 3FJCA 1J0SA 1Q8SA 3AP5A 1JXNA 4XTPA 4I4YA 3POSA 4Y1ZA 1GBGA 2GMEA 2R0HA 2D23A 4XJ8A 4DPNA 1ENSA 1LENA 3AZWA 2ET2A 4K1ZA 1PUMB 3HOMA 4AVTA 1N47A 1FATA 3BA7A 2CWMA 3ZXLA 4M00A 2WRYA 4DQAA 1CIWA 4FPCA 3A0KA 2Y9WC 1GGPB 4FP3A 4PBOA 1DQ0A 4FPYA 1JLYA 1N1YA 2ZMKA 1RINA 1GICA 1W6PA 3IM0A 3D6EA 4Y22B 1UMZA 3AJ5A 4HR6C 1Z78A 1BYHA 5GLZA 3AZYA 1QQKA 3HN1A 3ZXJA 3OJMA 3UDAA 4Q9GA 1DQ4A 1GANA 1GYKA 2BEAA 1V6MA 4F83A 4D69A 3HALA 1LHNA 1JT3A 4UW5A 1C1FA 1JBCA 4XMIA 1UX6A 2X2SA 2ZGUA 1VLNA 1SBFA 4GKYA 1W6NA 1FAYA 3VKOA 4YZ2A 1CR7A 1G9FA 2D43A 3PJQA 3BX1C 3FUQA 3A4UA 2R1DA 4DEPA 4NOTA 4USOA 1WBLA 2PELA 3V0AB 3D4KA 2NTDA 1ULEA 3NJ5A 4H04A 5BXSA 3OPZA 3BAVA 3O4DA 1QOTA 4QKRA 2JECA 4XMAA 3VKMA 1SCSA 2FHRA 2D7RA 1V6JA 1HLCA 3WDYA 4BLJA 3VT2A 1YRZA 1O4ZA 1DZCA 2YXSA 1AXKA 3P6IA 4YZ3A 2A71A 4OEGA 3CRIA 3UJQA 1VAMA 5KXCA 2W68A 3WOGA 1KQRA 4Q8LA 1GV9A 2ZQOA 3M1HA 4FOQA 1DJSB 1RITA 4XJUA 2F2FA 3JUTA 3V65A 4UW4A 1H9WA 3N7LA 5D63A 1UL9A 3LCPA 3BRDA 1MS5A 1V00A 4PC4A 3BADA 2R49A 1CESA 1YXWA 4X39A 2WLQA 3OYWA 4FOYA 4TYSA 1CE7B 4XHXA 4L4HA 1CONA 1BFGA 8I1BA 1IS6A 4Y24A 4OUJA 3DUIA 2V73A 3QLQA 5EXOA 2GZBA 3OY8A 4NO4A 3ZYPA 4D0ZA 3TB0A 3AJ6A 2VU9A 3FJHA 3RSJA 3IIRA 1QKQA 3B00A 4II0A 4L8QA 4CTEA 1DQGA 1AZDA 1S0BA 1L2HA 1V6XA 4U36A 4ITCA 5IUQA 4IY9A 2AFGA 1QMJA 5KXBA 1DBNA 1JW6A 3ZSMA 2GNBA 3HMYA 1C57A 2J3PA 3O4OA 2XB6C 1Q8VA 4XJZA 4XJAA 1DHKB 4AGGA 5IK8A 4KEKA 5T50A 1TIEA 1WLDA 1W6QA 3H6SE 5IT6A 3F62B 3AKGA 4M3CB 2ARXA 4Z9WB 1HWMB 4R9AA 5D62A 3T1MA 4U2AA 2ZBJA 4PQ9A 4KEJA 3WG2A 5D61A 3D5OA 2D6KA 1JUIA 4ASMB 5GZDA 3FJAA 1IHKA 3AKHA 4TLPA 1ULCA 3MPPG 2A75A 1LU1A 5H9SA 3POKA 1JT7A 2ZGMA 4I2SA 2YV8A 4EFPA 2CYFA 2ZACA 5CNAA 4Q1RA 2X2TA 1KRIA 3WMVA 3FLRA 1J1TA 1H30A 5JOZA 4LO1A 3CU1B 2RG9B 3U4XA 1HWOB 3AX4A 1JLXA 3AZVA 5BXTA 2QYIB 4I4QA 2ZKNA 3ZSJA 4KC3A 1BLAA 1U0AA 4LBLA 3USUB 4ISQA 5LK5A 2A6XA 3WHTA 5DG1A 2GO2A 3OGGA 3OJBA 2Q3NB 2E51A 3VV1A 4AGVA 2MLLB 4XFUA 1QU0A 2YZ4A 4JKQA 2DU1A 1K5VA 1R8OA 1GNZA 1LULA 1BLDA 1ULFA 4YW3A 2P37A 3CA6A 3AFKA 3IPVA 2KM2A 1PWAA 3CQAA 1KNMA 1DIWA 1OFSA 2GDFA 2R16A 2ZZJA 4X3AA 3B9UA 4XIKA 1APNA 2VSEA 4P9WA 1HKDA 3GALA 5BQUA 2NZ9A 3IM7A 2LIEA 3AJZA 4YGDA 4P14A 4X38A 2HYKA 4I4RA 3O4BA 3I2AA 1MS3A 4OWLA 1FV3A 4ATEA 1N1TA 4WBCA 4R6UB 3Q7YA 3IAGC 3ZXGA 2UU8A 1SR4A 3KM5A 4P0LA 3ZC8A 4AVSA 1TEIA 1WW5A 2CNAA 5F9TA 2AH2A 2YY1A 1MZ5A 3CAHA 1SACA 3ZXFA 4Y1VA 1ISZA 1N3QA 3R4UA 4CRQA 4YGBA 5JOYA 1IILA 1FMMS 1KDMA 3NBDA 1SLIA 3CA0A 4Z8BA 1N4KA 1D0HA 5SV8A 1MS8A 5EYXA 3PVEA 4D8HA 4Q8KA 5IK7A 1NXD1 5E88A 4A7ZA 1TFMB 1SCRA 3O4AA 2EALA 1LEDA 3AKIA 3WG1A 4YW5A 3PVNA 3IMNA 4WV8A 2SBAA 1SLCA 4Y1UA 1BFFA 2A70A 4Q2FA 1W6OB 2VH9A 2CL2A 3R4SA 4A7YA 2NMOA 4M3CF 3N35A 2D1ZA 2FDBM 4FGFA 4YZ5A 1AF9A 4Q27A 2PHUA 5JVVA 1UAIA 3V0BB 1JT5A 4GAIA 2AGSA 1V6WA 2EXIA 4ZA3B 2AYHA 5BYNA 3O0XA 2D6NA 1UZYA 3O5SA 1IT0A 1MS4A 1S0FA 3B3QE 4I3NA 4XBNA 3VUOA 4FP2A 4WVVA 4XTMA 4I7IA 1QDOA 5DUYA 1DYPA 4I4XA 1HIBA 3D7WB 4IONA 4IQPA 3SNMA 1YO8A 2WKKA 3ZSKA 4LO2A 4GOVA 1WBAA 1XYFA 1YIFA 3A07A 1QXMA 4FPJA 4BPZA 4UW3A 5HPZA 2A5ZA 4H55A 2ZAAA 4OEFA 2DTYA 3WINA 1Z2VA 4I4VA 4D0TA 4M3CE 1Z4SA 4ZBVB 1AJOA 2ZGNA 4TZDA 5HCFA 4YM2A 4I1EA 3AH4A 1CPMA 5EC5A 2DWRA 4ISRA 3O44A 3SLIA 1UZZA 1TP0A 1ISXA 5I1BA 2DTWA 4DFSA 2PHWA 2K4AB 1MC9A 3HBWA 4I6IA 3P6JA 4LO0A 1CPNA 2F2FC 1LOAA 1WW6A 1DGLA 1ISVA 2RSTA 2FFUA 4AN7B 1BZWA 2WT2A 5H9RA 4XOGA 3I4IA 5T55A 1QNYA 3VKLA 1W6PB 5T5JA 2D6OX 2R1BA 1M2TB 31BIA 1AVXB 4K21A 3BRGC 2KH2A 2KLLA 3RG0A 3M3QA 2LALA 3WDTA 3FJDA 3FJ9A 2D3PA 4YG0A 2L5XA 3WLUA 1FGAA 3FUOA 5T54A 2DV9A 1HWPB 4GP0A 1C1LA 3WUDA 3IKWA 3WCSA 2ZGRA 1VALA 4DENA 4BOWA 3MW4A 1W6NB 4LBNA 4ENDA 5BXRA 3FLPA 4OZXA 1Q04A 1LGNA 1HDKA 3UK9A 3B69A 2DVFA 2W08A 1W3FA 1S0DA 2EIGA 1TTUA 4G6MA 3BB2A 1DLLA 2E6VA 4RA0A 3AK0A 3FFZA 1AVAC 2AAIB 3OGFA 1GZ9A 4G9MA 1MS1A 1IS5A 3PG0A 3N7JA 1BQPA 5GZGA 5DZFA 4FPGA 1LOEA 2OW4A 1LEMA 2DUOA 1SLAA 1W6MA 3CA3A 3B01A 3ILNA 4Y1YA 4XBLA 1LHWA 5FNXA 3WVJA 1AXYA 1DQ5A 4HL0A 2A3XA 2DU0A 1HWNB 2VW0A 3K1XA 1DZDA 2DREA 2Y9GA 4BLIA 1MACA 5GZEA 3FJ8A 2DS0A 3RMYA 2WNEA 3A21A 2DURA 5HCAA 3M2MA 4Z8SB 4ZFWB 4ZFUB 4YG3A 4LO1C 1DZQA 4SLIA 4JRAA 3GNEA 3OYWB 1MS0A 1N1VA 2JD4A 1LHUA 3OJVA 2H0BA 1N3OA 2P23A 2D7IA 1IOAA 1G86A 1CQ9A 1SBDA 2V5YA 1JYIA 4FOVA 4LBMA 4BMEA 3UD8A 3OY8B 3AH1A 4QD2C 1MVEA 1D2SA 2FO1A 5BP5A 2CY6A 5GLWA 4ZOTA 1DFCA 2IWTB 1G9DA 1LODA 1TWEA 2DVAA 1YTOA 2DVGA 4I4OA 1N3PA 3WG3A 4I1BA 5F90A 2P39A 3KMVA 2YUGA 2ESUA 2AENA 4P6AA 4C1WA 4RL7A 1RMLA 5T5PA 1O4YA 1BFCA 2ZQNA 3JU9A 3W59A 2IHOA 4QBCA 2VW1A 3KQRA 4YLZA 3WHUA 3CRGA 2E53A 1BARA 5BQUC 3POYA 1IJTA 1ZM1A 4LBKA 1LOCA 1W6QB 3HR9A 3VSZA 3ZYRA 3CA4A 1YF8B 3AZZA 2VW2A 1IKQA 3VT1A 2I2SA 1TOOA 4W65A 2WT0A 1V6NA 2B7YA 4LBQA 1JOJA 1MVQA 5F8YA 2A6VA 4Y1XA 1FV2A 4DRVA 1W0PA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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