4J2FA

Crystal structure of a glutathione transferase family member from ricinus communis, target efi-501866
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
EVLKLHGAWPSPFSCRVIWALKLKGIPYEYVEEDLFNKSPLLLQYNPVHKKIPVLVHGGKPICESTIILEYLDETWPENPLLPSDPHERAVARFWVKFIEDKGTAIWNIFRTKGEELEKAVKNCLEVLKTIEEHAMGVSDDKYFGGDKIGIVDIAFCGIAHWLGVIEEVAGVKVLESQKFPRLHAWTENFKEAPIIKENLPDRDQMTAFFKRRREMIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a glutathione transferase family member from Ricinus communis, target EFI-501866
rcsb
molecule keywords Glutathione s-transferase
molecule tags Lyase, transferase
source organism Ricinus communis
total genus 72
structure length 218
sequence length 218
ec nomenclature ec 4.4.1.5: Lactoylglutathione lyase.
pdb deposition date 2013-02-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4j2fA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4j2fA01
2AJQB 1QMVA 1T4YA 4BWSA 1JZOA 3FZ9A 3HHVA 2C8UA 3ZVJD 3I9V2 3J7Yk 3GV1A 1GSUA 4L0WA 4AGSA 1K0NA 1Y6EA 1XWBA 4I6XA 4TXVA 4HJMA 3C73A 2FY6A 4ZBDA 3EE2A 3TJJA 5AIXA 3UMAA 5FT3A 3ZIJA 2QC7A 4NPBA 2H6ZA 3FR3A 2OACA 2RM5A 2WJUA 4OFTA 2OE3A 2IMEA 4MJCA 4I8BA 1WE0A 3ZFBA 2H72A 2NPBA 4GQCA 2V32A 2BMXA 3TDGA 2ON5A 1XWAA 1O8XA 4XIHA 1XBSA 1V58A 1PX7A 3IPZA 5DQSA 5COHA 2J9HA 3H1NA 2OKAA 2CVDA 2L4CA 3DD3A 1TRSA 3M3MA 1RQMA 5CYYA 4ZILA 3F9UA 5HFIA 3HA9A 2TRCP 3N5OA 4WXTA 3CTGA 1DUGA 5LD0A 2P5QA 5ECHB 3G7JA 3GSTA 2HRKB 5G30A 2LRCA 4G0KA 4IQ1A 5EPFA 3F4SA 1T00A 2AHEA 6GSVA 4NHWA 2PERA 2VLUA 1X9MB 1AIUA 2K9FA 4QQ7A 2H8LA 1SL0B 5CO3A 4MZCA 2VL2A 3A2WA 5AGYA 4HDEA 1G0TA 5IOXA 4MABA 4Q5RA 1HNAA 2WFCA 3TB2A 4EVMA 4OCEA 1U3IA 5IPGA 4RUVA 4POKA 4LL4B 4D73A 4DSSB 5HFGA 5AN1A 2V41A 1G7EA 2GZPA 2KUCA 2K6VA 3LFLA 4HEA2 3M0FA 5JWQB 5CRHA 4O5RA 2H6YA 1GRXA 5J9BA 5FHIA 2MMNA 2OE1A 4IN0A 4N30A 1XW9A 4KF9A 7GSSA 1GNWA 3GKNA 3A2VA 2H1DA 2VM2A 2LRTA 2VOCA 2B7KA 1X5CA 1F3AA 2PWJA 2CVBA 1CQGA 4BVYB 1NHYA 3FRCA 3DEXA 4GSNA 1ZMAA 1PKZA 4F03A 1UA5A 1T1VA 3GKXA 1N8JA 4WKWA 1SENA 5ECOB 5JCUA 1IYHA 2O89A 1GTAA 2YWIA 4MF6A 2M80A 2KP1A 3RHBA 4LL1B 2PMTA 2OADA 2OBIA 3LGCA 3HD5A 1PL2A 4TR3A 2NBSA 1TK0B 3TRQA 4TKYA 2G0FA 2VCZA 1XPVA 5ELGA 1DE1A 4MH2A 1UN2A 5ABRA 3HZ4A 3IOSA 2IFQB 3J7Yb 4QL9A 2VCWA 4BL7A 2AYTA 1THXA 3G9BA 5KN1A 1EV9A 2F9SA 2ALBA 4EDZA 3PR8A 5IMVA 12GSA 1LJRA 3I69A 3RBTA 3E9JB 3VWWA 2VUPA 3IK9A 1SYXA 4X1UA 1SK1A 1TRUA 1THOA 1GLPA 1PQNA 2B7JA 4PURA 1XW6A 5IOWA 2FLSA 5D9WA 1PKWA 4PQHA 3H79A 4PXOA 2XC2A 5CAXA 2C4JA 1V9WA 2LJAA 2O85A 6GSTA 3DMLA 5DJLA 2DJKA 2GT5A 4IELA 5HFKA 1EZKA 1UVZA 3KTLA 8GSSA 4PGTA 2FWEA 3H93A 1BX9A 1G7OA 5H5QA 5A4WA 1HD2A 3HZ8A 3G7YA 3BCIA 1EP8A 2RUEA 2H75A 2CQ9A 2JSYA 3EMPA 2CX3A 2MMOA 2HT9A 1PX6A 2WULA 3UL3A 1Z3EA 3JCML 2K18A 3KJYA 1AXDA 1MD3A 2H71A 1OC8A 3Q19A 1V57A 2HFDA 1R4WA 5G1LA 2H19A 2XPDA 4KB3A 1GLQA 2HRKA 3BCKA 2VCQA 2WZ9A 2PVOC 2NVLA 3F3RA 3F63A 3QDNA 5IMDA 3DYRA 3D4MA 4OWYA 2X8GA 3KH9A 4BA7A 2GTUA 4TR0A 4O92A 1A8YA 2KHPA 2JL4A 1Z6NA 3N9JA 3HCZA 3M1GA 3FEUA 4NXIA 3WYWA 2REMA 2G2QA 3QMXA 3D22A 3QAWA 5B8AA 3VWUA 3C1SA 4DSSA 1M9AA 1Z5YE 2JACA 1R26A 4MJBA 5B8BA 4MH3A 3UBKA 2N5FA 4ZL8A 3EU3A 1Q4JA 4Q5FA 2P5RA 3HY2A 2R3XA 4MK3A 2VL3A 2H0IA 5FWGA 4O7HA 5D8IA 4AJ7A 3E3EA 3ME7A 1FB6A 4KDUA 4X43A 3W8JA 2Z9SA 5AIVA 3SWLA 1XFLA 4J56E 4IW9A 5CRWA 2EIOA 2GQKA 2EC4A 2FWHA 3V1WA 5ID2B 3FZAA 2GSSA 5J41A 3FR6A 5DJMA 1PRXA 5HR0A 4BVYA 2P31A 5G31A 4YAPA 1XOAA 1TK8B 3TRXA 1YKAA 1JLWA 1X9SB 3R2QA 4GSSA 4E8EA 3TOUA 1J9BA 3FKFA 4I97A 4MJEA 2GGTA 2FUG2 2KOKA 3A5WA 2UZ8A 1IYIA 1EEMA 2B1LA 1QGVA 1FG4A 1ZZYA 1OKDA 2J23A 1X9WB 3IHQA 2HLSA 3HVSA 20GSA 1KTEA 4GXZA 4PNGA 1K3OA 3AY8A 22GSA 2IFQA 5A5KA 5B6NA 4MJAA 1K0AA 3WGEA 4XCSA 1LU4A 2H66A 3EWLA 4LMWA 1Z7RA 4XS1A 4N0VA 4N0ZA 4TOPA 4K0NA 4ZBAA 2C0EA 1SKRB 3W8SA 2DJJA 1B9YC 4ILFA 3BJ5A 3F4TA 3OR5A 1GTUA 4NV2A 2IL3A 3TKSA 4OFMA 2R37A 3FYGA 3DGQA 5D9VA 2DMMA 4XRAA 5J9CA 1GWCA 4MPGA 1M9BA 4XTSA 1B4PA 2ZNMA 1AC1A 3UVHA 4K0GA 1AW9A 3KP8A 1GULA 1ERTA 2CAIA 3UEMA 1ZYQB 4MPFA 2P0GA 2HSMA 1R5PA 2QGVA 14GSA 5C04A 1YZXA 4ZBBA 2JZSA 5DVBA 3HKRA 2B5YA 1XZOA 2PVQA 1M2AA 5IMCA 1S3DA 1XWKA 5E59A 3ZMKA 4KDYA 5F07A 2LTKA 1N2AA 2DLXA 1X5EA 3QPMA 4HI7A 1XXUA 2BJXA 2TIRA 5GSTA 3QR6A 3VI7A 4XHMA 2L57A 2XPEA 1EP7A 3GUSA 2LRNA 1E6BA 5D9XA 4G19A 2V2GA 2LSTA 1EEJA 4NWYA 4IS0A 3MDKA 3IAM2 2HSHA 3IA1A 1SD8A 5ECQB 5A4UA 4PQIA 1DE2A 2YZUA 4GSTA 4K7NA 5DBQA 1OC3A 2C0FA 3GNJA 2H76A 2L5OA 3KTBA 3ZL5A 1TKDB 4JZQA 5JCWA 3QFBC 4PNFA 3GHAA 2WRTA 4MP4A 2KP2A 4GQFA 3LG6A 3NIVA 2H0HA 16GSA 3IC4A 5DALB 2B6MA 1MDKA 3CRTA 4G10A 2I9HA 2F8AA 3R3EA 2PUKC 2CT6A 2H30A 3DKSA 2VL9A 2HSYA 3WT1A 5IO2A 1OC9B 4NAXA 4EC0A 1F2EA 4XS4B 1O85A 2JADA 3L0HA 2ON7A 2BTOT 4BVXB 4KA0A 3HXSA 1F37A 3EYTA 4MF5A 1URMA 4FYCA 4PX1A 5HR3A 4YQVA 2LUSA 2XHFA 4KCAA 1MTCA 5G1KA 3IC8A 4CHSA 4ECJA 1RW1A 1X0RA 1BQ7A 5ID2A 2A2RA 2FNOA 4OFNA 1PN9A 4WR5A 2AAWA 3HDCA 4MZBA 3CSHA 3PPUA 1TXXA 3TKPA 3L4NA 1WRYA 3PINA 4L5OA 2YN1A 3UARA 4EUYA 4FO5A 5JCGA 2JZTA 4OO4A 5ECMB 1GSDA 3Q6OA 5KEJA 2LV3A 3EU4A 1H4OA 4TR4A 4WF5A 2I81A 2C3QA 2VLVA 3IV4A 3ZRDA 3ERGA 1XOBA 4K1FA 3W6GA 3GA4A 1U87A 3GURA 1TI3A 3F0IA 2YWMA 1SU9A 4NV5A 5GSSA 4YQUA 1TW9A 4K8MA 1PL1A 4F9ZA 3HVVA 5IMZA 2FA4A 4J57E 2ZCTA 4ZB8A 1PGTA 2JZRA 2H01A 3L9SA 1K0BA 3TKRA 2GS3A 2XBQA 3FZ5A 1A24A 3KZQA 3FK8A 3BOAA 2H73A 1QXHA 3GL5A 2PBJA 1Z9HA 1XWCA 5ECSA 2IN3A 1NM3A 3TJFA 1V40A 3D21A 2DJ0A 2KLXA 5JWOB 3G7IA 4IQAA 3LEFA 1DBYA 4FIWA 2CZ2A 4PQ1A 5HR2A 1EWXA 2VCVA 1U3AA 5LCZA 3ZIVA 1Y25A 2C3NA 1AUCA 2M46A 1A8LA 5HR1A 2GZYA 1T8EB 3KMNA 2C3TA 3Q74A 4Q5NA 2N5BA 4IBPA 4KDXA 4K2DA 4OD7A 2H6XA 2HSMB 1OE7A 1NHOA 4J2FA 1EOHA 4IP6A 4EL1A 1SJ6A 1LBKA 1ABAA 2YV7A 4HQSA 3LWAA 4HZ4A 1TRWA 2WCIA 1XVQA 4LLRA 1H75A 3O3TA 3PH9A 1GSYA 4HOJA 4LA1A 2F8FA 4ECIA 3M9JA 4KNDA 3P8WA 2FD3A 1AAZA 4JR4A 1W89A 2HZEB 4ML6A 2C0DA 2VIMA 4PUFC 3MSZA 4ZXGA 1ML6A 4P3YB 3VLNA 5IO0A 4WBJA 4HU7A 4HJ2A 5KN2A 2DBCA 1ILOA 3WD6A 4GWRA 3TOTA 3C8EA 3RAZA 3VPTA 2QSIA 3WT2A 5D9TA 5DALA 2HXKA 1DSBA 2O8VB 4POLA 4G0IA 2MYGA 1FW1A 1B8XA 2GZZA 4CDOA 1GH2A 1SKWB 3FZ4A 1AQVA 1OC9A 1HNCA 1A0RP 3APOA 4OMVA 4I2TA 4XS4A 1JHBA 4BVXA 4WF4A 1S3AA 1XCCA 1QK8A 1OE8A 1ERVA 1XIYA 4YQMA 5ECRB 3MWHA 6GSXA 1FO5A 3M8NA 5F8BA 1KEBA 1ZL9A 5ECNB 3CSJA 2E0QA 4USSA 3DWVA 4G2EA 4GLTA 3TJBA 2YJHA 5L71A 1MD4A 4MDCA 5G5EA 3S9FA 2R6KA 3HJMA 3ZLPA 3F8UA 2R2JA 2VO4A 3EVIA 3GSSA 2H1GA 2F3MA 3SBCA 5IIZA 1ZYEA 3LJRA 1ACVA 1VF4A 2I3YA 4G9HA 5G5FA 1YF1A 1R7HA 4MA9A 1SD9A 1TP9A 3H4KA 3U5RE 1YQ1A 4ECBA 4FYUA 2DJ1A 5D73A 2DMLA 2E2GA 2WS2A 2GSQA 2H1AA 2EIQA 3LORA 1U6TA 5GAND 5CRDA 3ERFA 4FH8A 2VD1A 1V98A 1BG5A 4V2LA 1B9XC 1WIKA 4H86A 5EY6A 3TRPA 5IMAA 2OBKA 3APQA 3GH9A 1B4QA 4IHUA 1GUMA 5EL8A 3BD2A 5C00A 3CXGA 2JU5A 1MDIA 2GQMA 1A2LA 1VF2A 5IM9A 2VD0A 2FWGA 2DSAA 2AB6A 1MDJA 3F3QA 2FCHA 1KBNA 4MLYA 1O73A 3HYPA 2C1YA 4ECCA 2LNSA 4POBA 4JEDA 3D6IA 2TRXA 1GTBA 3TKSE 1F3BA 2LJRA 3KGKA 1BEDA 2DC5A 4AF2A 1OAZA 2HNLA 2DIYA 4Q5QA 1T7PB 4MZWA 1FAAA 1G6YA 4WETA 5EVOA 1HYUA 2L59A 1M99A 3TKSC 9GSSA 3FHKA 2HI7A 4GTUA 1M2DA 3QOUA 1K0DA 2LKUA 1T3BA 1GNEA 1YF0A 2HE3A 1SL1B 5B6MA 2WGRA 1ERWA 4IGJA 5DQYA 5H5SA 4V2MA 3MAKA 1OYJA 3GTUB 2YPMA 1V2AA 2B3SA 1JZDA 4ZB6A 3ZFLA 1O6JA 2ES7A 4KUNA 1WMJA 4DSQA 3PGTA 4JR6A 3KIJA 1WOUA 1A2MA 1QUWA 5DAKB 2C80A 4POMA 1WWJA 4ULXA 1PD21 5IPHA 5GAPD 5DCHA 2DJ3A 2VLTA 5DDLA 2LNTA 3F6DA 1NW2A 1U88A 3KD0A 4MMMA 2CZ3A 1GTIA 3LXTA 3P2AA 4EO3A 3O76A 4L8EA 2HZEA 1GL8A 1TJDA 4TN8A 1S3CA 3VWXA 3LXZA 2GDRA 2GSRA 4K6XA 2AUVA 1RK4A 2HRFA 4FYBA 2QKEA 1FOVA 2YCDA 1JZWA 3H8QA 1AQXA 3IAS2 3GL3A 1A0FA 4TXOA 4OCFA 4WR4A 1K0OA 3MNGA 4G0LA 3GH6A 3EC3A 5D96A 4I5QA 4V2NA 2V6KA 3CBUA 1TDIA 5ENUA 1QFNA 4TR1B 1BAYA 2PU9C 1YDKA 4HUAA 2PPTA 1CQHA 1ZCPA 3WGDA 4ZL9A 2VL2C 1GUKA 2I4AA 3GX0A 3VK9A 2HYXA 5D93A 1G6WA 1NSWA 4YAVA 2H74A 2LQQA 1B48A 3IR4A 4KW6A 1XWGA 3ZTLA 4ISDA 3ZYWA 4YH2A 2CVKA 2A4VA 1FVJA 2GT6A 5ECKB 3VFIA 2FGXA 1SK0A 4JE1A 2IMDA 2VCXA 3GFKA 5H5RA 4ZB9A 1PA3A 3GX8A 1AQWA 4N11A 3VWVA 2ZUPA 3C7MA 4X0XA 3KEBA 5F0GA 5G2ZA 3FR9A 1Z6MA 4L5LA 1E2YA 2GLRA 4KH7A 3UAPA 3K8NA 2XBIA 2F51A 3CTFA 1OKTA 5IQYA 2DIZA 3DVXA 3TGZA 3UIWA 1Z7PA 2CA8A 1TTZA 4ID0A 3F4RA 1TI1A 3GIXA 1FVKA 4GRFA 17GSA 5ECPB 2PN8A 2NTOA 3ZITA 3F6FA 5CREA 1R5AA 2X64A 6GSWA 1VGLA 1J08A 1SL2B 4JBBA 5J4UA 1M0UA 4KGIA 2YZHA 3GRXA 3RPPA 2O7KA 2OA7A 4IJ3A 1SKSB 19GSA 3HVXA 1A2JA 2HZFA 1GUHA 3KCMA 3IBHA 1T4ZA 4HU9A 2K8SA 2RLIA 4DVCA 2YV9A 2H70A 10GSA 1FB0A 3VPQA 5DCGA 3TKQA 2OJLA 3IXRA 4GCIA 3DIEA 3D5JA 4DSRA 3CRUA 1TOFA 3L9UA 1SJIA 5IMFA 3GMFA 4KAEA 3WGXA 1ZGNA 3ZVJA 1SYRA 4KE3A 4IKHA 3QAGA 1JLVA 3QAVA 4IP1A 1K0CA 1TU7A 3LYPA 2VAFA 1FHEA 3A3TA 2WDUA 3NZNA 3UOMA 2R4VA 5B7CA 2V1MA 1OVNA 1YJ6A 5CRGA 1O7UA 3GKKA 3GTUA 5KN3A 4TVEA 1USBA 4L0UA 4O32A 4F82A 2X99A 5INYA 3CYNA 2AV4A 13GSA 2FWFA 2YP6A 4WBRD 3C71A 2X8CA 4ACSA 4KX4A 1HQOA 4RI7A 2IIYA 3GKMA 5DAKA 2HQTA 5KN0A 4GF0A 3VURA 2LS5A 1I9DA 1C72A 3UJ1A 18GSA 2I1UA 1Q98A 2A2SA 2MMZA 3KM6A 4K9ZA 3FW2A 5ELAA 1F6MC 4KCEA 2FHEA 1ERUA 3QD9A 1UC7A 2CAQA 4PTSA 3KMOA 3GN3A 4BPYA 4RQXA 4V1Ap 5LNKe 2LEGA 1ON4A 2R5GA 5ECLB 4TW5A 4F0CA 3TJKA 4V1Ag 4JRRA 4XRDA 1K0MA 3TJGA 1QQ2A 3ZREA 3IE3A 5CP1A 1SJZA 3ME8A 2MBSA 1PMTA 2PGTA 4QL7A 4MF7A 3I43A 1GSSA 4JU5A 3EMXA 3IK7A 1ZOFA 2YJ7A 4BWQA 1W4VA 2MZCA 2MMAA 1TRVA 4NMUA 3CMIA 4K7OA 2C0GA 4TXOB 2FA8A 2IWTA 3QFAC 4TR1A 3QCPA 2YANA 2E7PA 3KH7A 3ISOA 1WJKA 1VF3A 2YNXA 4ZL7A 3RDWA 2YWOA 3U6VA 1SK2A 3EURA 4EF0A 1MEKA 2YWNA 4Z7XA 4N10A 3APSA 1EGOA 1EGRA 2B5EA 3LQ7A 1KNGA 1K3YA 4KSMA 1M2BA 3P7XA 4HS1A 2GQLA 1GP1A 3L9VA 2JSZA 2LQOA 5J3RA 5HQPA 1EOGA 5BMUA 3IRAA 3VI5A 1M7TA 4ML1A 1YKCA 3UVTA 6GSUA 1ST9A 3LYKA 4MCUA 3BBYA 3Q18A 2D2ZA 4RQRA 4LMVA 3HJPA 4OO5A 2RM6A 3RHCA 4AJ6A 3IDVA 4EE0A 3KP9A 5JWRB 4D73B 1F9MA 1EV4A 3HJOA 2MBTA 1VRSD 4EKZA 3M9KA 1O81A 1PSQA 2B1KA 1A23A 4EDYA 4F2IA 3GYKA 4TRXA 2NDOA 3KXOA 4CW9A 2HSNB 3ZZXA 3ERWA 2HRNA 1HNBA 5J5NA 6GSYA 1XVWA 2IPAA 2L4QA 1X5DA 2IMFA 2CV4A 5F06A 2K8VA 3NOFA 4ZIJA 2O87A 3I6AA 1WP0A 2B5XA 1BJXA 3DRNA 2DJ2A 3DVWA 3UBLA 2IMIA 2CX4A 3P90A 1J0FA 2IMKA 2H0GA 1GSQA 4IJIA 3US3A 1WPIA 4AJ8A 3DXBA 1VF1A 3ZMLA 1I5GA 1YEXA 5ECIB 4EXJA 4PUAA 2EIRA 2X8HA 4K7IA 2WB9A 2GVPA 3LSZA 1K3LA 3FY7A 4RI6A 1GSEA 5AISA 1YY7A 2V6OA 2H1BA 5CNWA 2YOIA 3D4TA 2M72A 5GZZB 3L78A 5E4WA 1TU8A 3D0ZA 1JFUA 4FQUA 4E8HA 3O6TA 3EINA 6GSSA 2IJYA 4XS6A 5F05A 4WEYA 1XW5A 3TCOA 4F0BA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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