4J2FA

Crystal structure of a glutathione transferase family member from ricinus communis, target efi-501866
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
b'EVLKLHGAWPSPFSCRVIWALKLKGIPYEYVEEDLFNKSPLLLQYNPVHKKIPVLVHGGKPICESTIILEYLDETWPENPLLPSDPHERAVARFWVKFIEDKGTAIWNIFRTKGEELEKAVKNCLEVLKTIEEHAMGVSDDKYFGGDKIGIVDIAFCGIAHWLGVIEEVAGVKVLESQKFPRLHAWTENFKEAPIIKENLPDRDQMTAFFKRRREMIL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glutathione s-transferase
publication title Crystal structure of a glutathione transferase family member from Ricinus communis, target EFI-501866
rcsb
source organism Ricinus communis
molecule tags Lyase, transferase
total genus 72
structure length 218
sequence length 218
ec nomenclature ec 4.4.1.5: Lactoylglutathione lyase.
pdb deposition date 2013-02-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4j2fA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4j2fA01
3VFIA 22GSA 5KN2A 3CSHA 2NDOA 2C3NA 4H86A 1A8YA 1ST9A 4MZCA 3D4TA 4USSA 2H1BA 1NHOA 5G5FA 6GSYA 1XW6A 1PGTA 5H5QA 3HYPA 3BCIA 2LV3A 2H30A 3GA4A 2CVKA 3ZLPA 1TK5B 4KF9A 2CA8A 1HYUA 1M2AA 5CNWA 1FVJA 6GSTA 3D5JA 4PQ1A 3KEBA 2H0HA 4NXIA 3D0ZA 4L5LA 1TRWA 1EOHA 5IPGA 2G2QA 1K0CA 2A2SA 2AYTA 3ZFLA 2OBKA 4EC0A 3KIJA 2C0GA 2CX4A 2HE3A 4F0CA 1YZXA 3UOMA 2D2ZA 1TRUA 3GL3A 3LGCA 2N5FA 1X9MB 5D9WA 4N10A 2WFCA 4XTSA 5A4WA 5J3RA 1THOA 2LS5A 1JHBA 1HQOA 4WF4A 3TOTA 2H1DA 2GVPA 3GKNA 1GSSA 1Z6MA 2JADA 4K2DA 2I4AA 4OD7A 2LQOA 2ALBA 3H4KA 2L6CA 2MMAA 1PA3A 2IIYA 1VGLA 2L4QA 1SL2B 2EC4A 3F6DA 1R5PA 1FOVA 5G1KA 3MSZA 5EY6A 4PNFA 3R3EA 5BMUA 2GSTA 1PKWA 2P31A 5CAXA 3F4TA 2LJAA 2X8CA 2MBSA 1SU9A 3ZTLA 2X8GA 3OR5A 1M2DA 3FRCA 5ABRA 4EKZA 2IMIA 1HNAA 2ZUPA 4J2FA 4ECJA 1KEBA 3J7Yk 1GNWA 1WE0A 4Q5RA 4OFMA 1BQ7A 1QMVA 1TW9A 3A5WA 2DJ2A 4ECCA 4MABA 1V58A 6GSXA 3IR4A 4GSNA 1KTEA 3G7IA 3IHQA 4NV2A 5JWQB 1WP0A 3GX8A 2R2JA 3HVXA 2WCIA 3M8NA 3F4SA 1PSQA 4L5OA 3NZNA 4ML6A 1MDJA 3EYTA 3GKMA 4ZL8A 1EP8A 1GLPA 1RQMA 1ZYQB 3GURA 3TJBA 2LNTA 4QL9A 2PN8A 1SK1A 1MDKA 2ES7A 3QAGA 5IO2A 5ECHB 2KLXA 4RI7A 4TOPA 2YWMA 2DJJA 4TVEA 4NHWA 1MEKA 6GSWA 5IQYA 3KH9A 3HY2A 3IXRA 3LXZA 4DVCA 3DGQA 2H74A 1FHEA 1OKTA 1NHYA 3F6FA 4KCAA 3R2QA 3LSZA 1QGVA 5J5NA 4K1FA 3ERFA 1O8XA 3F4RA 1XZOA 2GQKA 1CQGA 3KD0A 2VAFA 1U3AA 1T1VA 1Y25A 3BJ5A 4KCEA 3RBTA 5ECSA 1ZCPA 3APOA 1TP9A 3ME8A 5KN1A 2VD0A 3M9JA 1QK8A 2F8AA 4CHSA 4MJCA 2YWOA 3ZIJA 3P7XA 2DLXA 3TCOA 20GSA 2AUVA 4JR6A 4KB3A 4MJAA 5IM9A 3TUEA 2V1MA 4WKWA 2CVBA 2HZFA 5F06A 3UJ1A 3UBLA 4O92A 1AQXA 5ECQB 3W8SA 1XOBA 1SKSB 1SENA 3CBUA 3UVHA 2GQLA 3GIXA 2FWHA 4XS4B 3TKSE 1A2LA 3ZVJD 2GTUA 4KX4A 2EIOA 3ZYWA 1EOGA 3JCML 5L71A 2YZUA 3MAKA 4V1Ap 2HNLA 1O6JA 3BBYA 3MNGA 2LRTA 1KNGA 4TR0A 4TR3A 1G6WA 3C1SA 4G0KA 4KAEA 4OWYA 1TRVA 3F9UA 4E8EA 3EURA 5FT3A 5DBQA 1TKDB 2C0FA 1R26A 4KGIA 2J23A 1QFNA 5JWRB 3US3A 3UBKA 2OKAA 4PGTA 5E4WA 1O73A 4I2UA 5CRGA 4I6XA 5KN0A 4N0ZA 2VLVA 4TKYA 1EV9A 2L5OA 2VL3A 1U3IA 2I1UA 1J0FA 1LBKA 2WS2A 5D8IA 4CDOA 4PXOA 2MBTA 3DYRA 2CV4A 5CRDA 1VF2A 5DQSA 3SBCA 4RUVA 3DKSA 4EVMA 2HQTA 4KSMA 4YH2A 4ZL9A 2N5BA 1TK0B 3GRXA 2MMOA 4ZIJA 5HR2A 2GSSA 4KH7A 2IL3A 2X64A 2H19A 2JSZA 16GSA 1U88A 3FR9A 5JCUA 4V1Ag 2DIZA 5ECNB 2IN3A 4L0UA 2FLSA 1TJDA 5DAKB 3LJRA 4MF5A 1H4OA 1XVWA 2FGXA 2KHPA 4HZ4A 1XVQA 3IAM2 1SYXA 2FD3A 2M72A 1GLQA 2E2MA 3QD9A 3BCKA 3FZ9A 4IELA 3L4NA 1MD4A 3VI5A 4ILFA 1YF0A 4P3YB 4ULXA 2L4CA 4RQXA 2B5EA 2IMDA 3D4MA 2KUCA 2HSMA 4OMVA 3HXSA 1GULA 5DCHA 3KJYA 3IPZA 2VCVA 2C80A 4KE3A 2P5RA 3V1WA 2OACA 2L5LA 3TKRA 4D73A 2R5GA 1FW1A 1F37A 2PU9C 2IJYA 2GSQA 5DJLA 4CW9A 1Z6NA 4K0NA 2B7KA 2VL2A 4ZB6A 2VCXA 3EWLA 2LSTA 3DEXA 1F9MA 3NOFA 4XCSA 2H72A 4MF6A 2PPTA 2PMTA 2BTOT 4MCUA 1V40A 2VLUA 3IDVA 3M3MA 4MZWA 1PX6A 3BD2A 4LA1A 4MMMA 2HYXA 1JZDA 4GQFA 5DVBA 3ZIVA 4IKHA 2IMFA 3EU3A 3DWVA 4MP4A 1JZWA 4AJ8A 1WJKA 2CAIA 4WF5A 4JBBA 1B4QA 5JCGA 1GH2A 1GSEA 3LYKA 3KMOA 3DIEA 3KP9A 4MH3A 4X43A 2LKUA 1FAAA 4WETA 1HD2A 3O76A 5KN3A 4EXJA 2RUEA 2CT6A 2H70A 1TTZA 1QXHA 5IMZA 4IJIA 2FA8A 3BOAA 5G31A 5IMCA 1TU8A 3N9JA 1RW1A 2MMZA 3GKKA 1GUHA 5ID2A 5ELGA 2CAQA 3F0IA 5H5RA 3RDWA 4ZB8A 1ON4A 4MA9A 4IQAA 3G7JA 5B8BA 1IYHA 3SWLA 3CTGA 4YAVA 2XHFA 5G5EA 1YY7A 13GSA 4V2LA 4HQZA 2TRXA 5GAND 1BX9A 5CYYA 1A0RP 4FYBA 2X99A 5D93A 3IC8A 4TXVA 4MK3A 4PTSA 4OCFA 1EWXA 2ON7A 2P5QA 3IV4A 4PNGA 1OYJA 1ZMAA 3ED3A 2HRKA 2QC7A 4YAPA 1WIKA 1EP7A 2YZHA 2IFQB 3DD3A 1AXDA 1K0NA 1OC9A 1EGOA 2X8HA 3GKXA 1M0UA 3FZ4A 5F8BA 2GZPA 3D21A 5DJMA 2R3XA 2H6ZA 2NPBA 2H01A 3MWHA 1Y6EA 2F3MA 4ZL7A 5HR3A 3LG6A 1ERTA 1ZZYA 4G10A 5JWOB 3KM6A 4OCEA 3GUSA 1F2EA 1OAZA 3HZ4A 1Z3EA 1UN2A 3WGEA 1MDIA 4EDYA 3KH7A 4PUAA 1N2AA 4O5RA 1DSBA 4V2NA 4K7IA 3IRAA 1LJRA 1U87A 1YDKA 10GSA 5DALA 1RK4A 4G0IA 2IWTA 3VWWA 6GSVA 5D9XA 2F8FA 5LCZA 1M99A 5AIXA 4MJEA 2GT5A 2DC5A 5H5SA 1URMA 3G7YA 2QKEA 2H0GA 2LEGA 2HZEB 3KTBA 3TRPA 1A0FA 1M7TA 3C7MA 3WT2A 3UL3A 3ZFBA 14GSA 1SYRA 1YKCA 4MPGA 5HFIA 2V32A 1EEJA 1BG5A 2LRCA 2GS3A 3TJKA 2HI7A 4TXOB 4NV5A 2A2RA 2OADA 1IYIA 3WYWA 4TN8A 3EINA 4HQSA 3HD5A 1NW2A 5HFGA 4GF0A 3QAWA 5G2ZA 2WRTA 1I9DA 2CX3A 4V2MA 5IO0A 1K0OA 4KUNA 3GTUA 4ZILA 3GSSA 4POMA 3PH9A 2YWNA 4F2IA 1GP1A 1GSFA 2MZCA 4AJ7A 1NM3A 2HSHA 3G9BA 2FWFA 1XWAA 2B5XA 3PGTA 2VUPA 4Q5NA 2YN1A 2JU5A 3VWUA 2FHEA 4BA7A 1AW9A 2WGRA 4F82A 2GZZA 4OFTA 4EL1A 4JE1A 1A23A 2HFDA 2YOIA 2B6MA 3CYNA 1O8WA 4KNDA 4IBPA 2H75A 3GFKA 1W89A 1K0BA 5ECMB 1M9AA 5J9CA 4G0LA 4MLYA 1ZL9A 4GSTA 1J08A 2XBIA 2C1YA 2C3TA 4HZ2A 6GSUA 2H73A 1SL1B 1T00A 5A5KA 1GTUA 4IJ3A 4XRAA 5G30A 5J41A 4QQ7A 3C8EA 2LUSA 3VURA 4N30A 4IS0A 2RUFA 3FEUA 3TB2A 5INYA 1Z7PA 3CRTA 3IC4A 1X5DA 1GSDA 2KP2A 1V9WA 5FHIA 2EIQA 3VPQA 2C3QA 3IAS2 3L9UA 2KOKA 3ERGA 4DEJA 1OVNA 1B48A 2LJKA 2DJ1A 2YP6A 3E0UA 1ABAA 2K18A 4FIWA 2JSYA 2P0GA 3FW2A 5HQPA 2PVOC 2JACA 3HCZA 4K6XA 2FNOA 3UVTA 1F3BA 2TRCP 3TDGA 2DMMA 1YF1A 2FA4A 1ACVA 2I9HA 4AGSA 3GMFA 4XS6A 3KXOA 3QDNA 5COHA 2O89A 2AV4A 2VCTA 1Q98A 4WEYA 1HNCA 1VRSD 1YJ6A 2B7JA 2RM5A 1A8LA 1GTBA 4K7OA 2YJHA 3RHCA 3UARA 5J9BA 4EDZA 1XWCA 2B1KA 4HJ2A 4ACSA 5B7CA 3GL5A 5IMAA 3APQA 1XIYA 3GYKA 3HKRA 3PPUA 1V57A 5ECLB 3NIVA 3KZQA 3IA1A 2HXKA 1PL2A 1S3CA 1PMTA 4I97A 1OE7A 3QFAC 1GUMA 3D6IA 1SK2A 4ZBDA 3AY8A 3CSIA 5ECIB 1ZYEA 3KP8A 4AJ6A 3S9FA 1TOFA 2LJRA 1SD9A 1PN9A 3TKSA 3TRXA 1JFUA 1ZOFA 1GSUA 1Z7RA 4L0WA 1YEPA 19GSA 3GNJA 4NHZA 1DE2A 5F07A 2OA7A 3W8JA 1AQVA 1K3OA 3HA9A 4XS4A 3A2VA 3U6VA 3RPPA 1QQ2A 4GWRA 2NTOA 1W4VA 1XPVA 1FB0A 1V2AA 4MF7A 3IK9A 4DSSA 2EIRA 4KA0A 1K0MA 2DJKA 1DUGA 3O6TA 2K8VA 1UA5A 1ZGNA 5KEJA 1Z5YE 4MDCA 1AUCA 1KBNA 3ZZXA 1ERWA 2H6XA 2O85A 3F3QA 3ZRDA 4ML1A 2YV7A 3FZ5A 3VWVA 3H93A 4Q5FA 2RIIA 3E3EA 4D73B 4GCIA 1PX7A 1GRXA 2HT9A 4PX1A 4ECIA 4E8HA 2HRFA 3ZREA 1R7HA 4IQ1A 2VLTA 1TI3A 2V41A 5CO3A 2LNSA 2FY6A 5GSSA 4MH2A 6GSSA 17GSA 3GN3A 1CQHA 4OO4A 1OKDA 2WDUA 4YQUA 1VF1A 1YKAA 4WR5A 3P90A 1X5EA 2B5YA 4JU5A 2GGTA 5D9VA 2H1AA 3UIWA 5ECRB 2HRNA 2E7PA 2F9SA 3HDCA 4XRDA 2RLIA 2VCWA 2F51A 4DSRA 1ERUA 3LEFA 1C72A 1AAZA 1XXUA 2L6DA 1BAYA 3EMXA 2AAWA 3I9V2 1GWCA 1X0RA 5AIVA 3H1NA 4IHUA 4HS1A 3UAPA 4EO3A 4J56E 3GH9A 4K8MA 3A2XA 5A4UA 1R5AA 2PGTA 4EE0A 4ID0A 4RI6A 4TR1A 1DE1A 4IVFA 4IGJA 3CTFA 1YQ1A 1F3AA 2WULA 5FWGA 1EZKA 4BL7A 1E2YA 2UZ8A 3H8QA 4F9ZA 4HUAA 3A2WA 3HZ8A 1V98A 3TKQA 3N5OA 3HHVA 4RQRA 4N11A 2VD1A 3CRUA 2GQMA 2XC2A 4KDYA 2DMLA 4Z7XA 1T3BA 2DIYA 2HLSA 4BVYA 3FYGA 5DDLA 8GSSA 2YANA 1TRSA 4BWSA 1FO5A 4LL1B 3EMPA 5CRWA 1G7EA 2HRKB 4PUFC 3WD6A 9GSSA 3GV1A 1FVKA 1O85A 1OC9B 2B3SA 2BMXA 3LQ7A 2VCZA 3I69A 3DMLA 4DSQA 3VI7A 2OJLA 3HJMA 5HR0A 2Z9SA 1ML6A 1A2JA 1WOUA 3I43A 4POBA 3FY7A 1GSYA 2R4VA 3QMXA 2AB6A 4BVXA 3K8NA 2NBSA 1M9BA 1VF3A 4O7HA 3CXGA 4GSSA 4KDXA 1EGRA 5ELAA 2DBCA 4N0VA 5DALB 1PQNA 5J4UA 3QFBC 2XBQA 5LNKe 1OE8A 2O8VB 2CZ3A 4I8BA 4Q5QA 1LU4A 3QR6A 5ECKB 2V6OA 4HJMA 1F6MC 3TJGA 3TGZA 1G0TA 4TRXA 1X9SB 2IPAA 2E2GA 1GTIA 1XBSA 1K0DA 3ZMKA 4FYUA 1A24A 3CSJA 2HSYA 2IFQA 2DSAA 2YV9A 2I81A 1QUWA 3VK9A 4ZXGA 2YPMA 3GTUB 2YCDA 4ZBAA 5D96A 5CP1A 5D73A 5B6MA 5E59A 2WB9A 4HU7A 2PERA 5GSTA 3UEMA 4JR4A 2VL2C 5IOXA 1XCCA 4X0XA 2VOCA 2MYGA 4GTUA 1SJIA 4TW5A 1G7OA 1ILOA 2ZNMA 1O81A 4G2EA 2BJXA 2HSNB 3M9KA 4I5QA 1B9XC 1K0AA 1AQWA 4XIHA 1X9WB 4LMWA 5AISA 2RM6A 4MPFA 1T8EB 1TU7A 5HR1A 4FQUA 5DCGA 3QCPA 3O3TA 3LWAA 1TI1A 4O32A 2WJUA 1XWGA 5EPFA 3FKFA 5ECPB 3F63A 2CQ9A 4NMUA 2JZSA 1XW5A 4K9ZA 4F0BA 2OE1A 4KDUA 2B1LA 4K0GA 1JZRA 3PINA 4HOJA 2HZEA 5EL8A 2YJ7A 2FWEA 3LYPA 1WRYA 2GLRA 1SL0B 4GLTA 4IN0A 1SKRB 1HNBA 2L59A 2YWIA 3W6GA 2VCQA 4TXOA 4PQIA 3TRQA 4BPYA 2XPDA 3UMAA 4PQHA 3APSA 1YEXA 5HFKA 4YQMA 3C71A 2HRAA 2C8UA 2R6KA 3ZVJA 3HVVA 3H79A 2GDRA 2K6VA 1J9BA 2O7KA 2A4VA 4NAXA 1B8XA 3TOUA 3Q6OA 2H8LA 1JLVA 2LTKA 3LORA 2PUKC 3DVWA 3L9SA 4OFNA 4IP1A 2H71A 4K7NA 2KP1A 4GQCA 2M46A 2K8SA 4LL4B 1BEDA 4WBRD 2OE3A 3GX0A 1XFLA 4XHMA 1SJ6A 5IMFA 1Q4JA 1VF4A 1X5CA 3VPTA 2CVDA 1XWKA 3RHBA 4JRRA 4LMVA 4POKA 2WZ9A 4ZBBA 5A4VA 5IMVA 3EU4A 5IOWA 1TK8B 1E6BA 1PRXA 3FHKA 3KGKA 2GT6A 2IMEA 2FWGA 1K3LA 4X1UA 11GSA 2IMKA 12GSA 5AN1A 3QAVA 4PURA 4FH8A 1USBA 4JZQA 2VM1A 5G1LA 2YNXA 3M1GA 1S3AA 3EVIA 2PWJA 1UC7A 4LLRA 3A3TA 2C0EA 3ISOA 3WGXA 3IK7A 1H75A 3TJFA 2LRNA 1FG4A 3FK8A 2GSRA 1SJZA 3HJOA 4DSSB 3FR3A 1MD3A 3I6AA 4XS1A 2ON5A 3IOSA 2J9HA 2FUG2 3F3RA 1N8JA 3M0FA 1SKWB 4POLA 4JEDA 3WT1A 1AC1A 3EE2A 1PKZA 1XOAA 3RPNA 2AHEA 2CZ2A 5EVOA 2H66A 2VL9A 4HEA2 3KTLA 4KW6A 5GAPD 3L78A 1S3DA 5C00A 1U6TA 2G0FA 1A2MA 2TIRA 5DQYA 2DJ3A 3ME7A 1OC3A 4IP6A 3P8WA 4FYCA 3TJJA 1JZOA 1T4ZA 4HU9A 2JZTA 5IMDA 3P2AA 4J57E 1SK0A 4BWQA 1BYEA 1UVZA 4MZBA 3L9VA 1EV4A 4QL7A 1B9YC 4EF0A 2HSMB 3WGDA 3E9JB 3GSTA 5ENUA 1G6YA 5AGYA 5IIZA 1SD8A 2V6KA 1JLWA 1WWJA 4F03A 1I5GA 4I2TA 2L57A 1GL8A 4FO5A 4HDEA 4ECBA 2MMNA 1GNEA 1XW9A 4GXZA 4MJBA 5B8AA 4G19A 3DXBA 4ZB9A 1ERVA 1GSQA 2VIMA 5IPHA 2ZCTA 3J7Yb 4NWYA 3FZAA 1OC8A 1R4WA 2OBIA 1XWBA 1TDIA 4TR1B 3ZMLA 1Z9HA 1BJXA 2REMA 2N5AA 2H0IA 4OO5A 1MTCA 3ERWA 1WMJA 4BL7B 3PR8A 1GTAA 4ISDA 1THXA 3LXTA 4AF2A 1EEMA 2VO4A 3HJPA 1PD21 5DAKA 4HI7A 1M2BA 5D9TA 4BVYB 3ZITA 4IW9A 2VM2A 2H6YA 3Q19A 3VWXA 2OE0A 3F8UA 2K9FA 1DBYA 3C1RA 5ID2B 1K3YA 4WXTA 2JL4A 2M80A 4WBJA 2FCHA 3GHAA 2PVQA 2PBJA 4GRFA 4G9HA 5ECOB 2XPEA 3CMIA 1FB6A 5JCWA 4NPBA 1GUKA 5LD0A 3KMNA 2C0DA 3IE3A 4L8EA 1NSWA 5CRHA 4KSOA 5F05A 4TR4A 3ZL5A 2LQQA 3VLNA 4BVXB 3HVSA 3L0HA 5F0GA 1B4PA 2QGVA 2E0QA 3Q74A 3DVXA 2C4JA 2H76A 3FR6A 3LFLA 7GSSA 1T4YA 1O7UA 2O87A 3U5RE 3EC3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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