4J2FA

Crystal structure of a glutathione transferase family member from ricinus communis, target efi-501866
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
b'EVLKLHGAWPSPFSCRVIWALKLKGIPYEYVEEDLFNKSPLLLQYNPVHKKIPVLVHGGKPICESTIILEYLDETWPENPLLPSDPHERAVARFWVKFIEDKGTAIWNIFRTKGEELEKAVKNCLEVLKTIEEHAMGVSDDKYFGGDKIGIVDIAFCGIAHWLGVIEEVAGVKVLESQKFPRLHAWTENFKEAPIIKENLPDRDQMTAFFKRRREMIL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a glutathione transferase family member from Ricinus communis, target EFI-501866
rcsb
molecule keywords Glutathione s-transferase
source organism Ricinus communis
molecule tags Lyase, transferase
total genus 72
structure length 218
sequence length 218
ec nomenclature ec 4.4.1.5: Lactoylglutathione lyase.
pdb deposition date 2013-02-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4j2fA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4j2fA01
3GV1A 2GZZA 2WB9A 3GURA 4F03A 2LTKA 1JZWA 4MZCA 3QCPA 2IMIA 3NZNA 1XCCA 1PL1A 1WOUA 2BTOT 2YOIA 2VUPA 2P5QA 4AGSA 2OJLA 1UVZA 4EDYA 3IC8A 2YJ7A 4L8EA 4FH8A 1X0RA 2PBJA 2H1GA 1YDKA 3ZFLA 4NV2A 1WE0A 3ERFA 2FWGA 5A4WA 3HA9A 1SKRB 2HSMA 2KP1A 5HR0A 3GX8A 5IIZA 4XS4A 4GF0A 1CQHA 3LSZA 6GSXA 3F3RA 2HSYA 2C0GA 2K6VA 3ZTLA 2JSYA 1JFUA 2E2MA 3UEMA 1A23A 2N5AA 1O73A 2X8CA 4XIHA 1TK8B 5C04A 3IK9A 4HZ2A 3TJFA 1JLVA 4EDZA 2VL2A 4PTSA 5F8BA 5H5SA 4IGJA 4QQ7A 3ZIVA 3RBTA 3KMNA 2FWHA 2L57A 2OA7A 1OKDA 2YANA 3A2XA 1XWAA 2JL4A 3I69A 4KE3A 3CSIA 5ELGA 5J9BA 4WBJA 3D5JA 6GSTA 3MSZA 2H19A 2HXKA 4P3YB 3RPNA 11GSA 2H1AA 1SL1B 2VCQA 2HI7A 2IMDA 2E2GA 1M9AA 4OMVA 1RW1A 2DIYA 4POLA 4BVYB 4TR3A 3VI5A 5LD0A 1A2MA 3TKQA 5A5KA 3HHVA 1YKCA 4KX4A 1B9XC 1GUHA 3KEBA 4G2EA 1M2DA 5D73A 5GSTA 3C73A 2H30A 4K7NA 2K8VA 3JCML 2RIIA 5E59A 3FZAA 5CAXA 4MJBA 4F9ZA 4MH3A 1A2LA 1JZRA 1AUCA 1QXHA 2JZTA 2PMTA 1XWBA 2GTUA 1AXDA 4F0CA 3CSJA 3C71A 4J56E 1OYJA 3GL5A 3LFLA 1MEKA 2VLVA 4LL4B 3HZ4A 5EL8A 1U3AA 2LKUA 3KD0A 3FW2A 5EY6A 13GSA 2YCDA 4IJ3A 4DSSB 2X99A 4HUAA 5ECSA 2LUSA 1WMJA 2REMA 1FW1A 3DRNA 4RQXA 3GTUB 4E8EA 6GSSA 2H0HA 2V41A 5IMAA 2H70A 4AF2A 1V40A 1PMTA 1JZOA 3EURA 1N8JA 6GSYA 3L4NA 4ML1A 1MDIA 4PNGA 5IQYA 5D93A 3F8UA 1MDJA 1SK1A 3LGCA 1PGTA 1FG4A 3UBKA 1EV4A 3TJJA 4TXOB 1BX9A 3CYNA 4FYBA 1G0TA 4ZIJA 2GSTA 4POMA 4XRDA 1DUGA 3KTLA 2ALBA 1F3BA 2AAWA 4KUNA 3BBYA 4ZL8A 3LYKA 3HKRA 1ERUA 3BCKA 1EOGA 2ES7A 7GSSA 2H6ZA 3BCIA 3UMAA 1DE1A 1FAAA 5IO0A 2LRNA 1T4YA 3KP8A 2XBIA 2PGTA 4MF7A 3M9KA 2N5BA 1Z6MA 3EVIA 4V1Ap 2R3XA 4QL7A 1O85A 5CNWA 2CAQA 1GSYA 4PQHA 2YV7A 2JZRA 1Z9HA 3H8QA 1XVWA 2YPMA 4BL7B 5FT3A 2MZCA 5A4VA 1SK0A 4IW9A 1V9WA 3LXZA 3VWWA 1U88A 1XZOA 1XVQA 2CVDA 3KH9A 2YZUA 1A8YA 3HDCA 1AAZA 5KN2A 1PX7A 1GUKA 2FCHA 2H01A 2YJHA 2VO4A 2WCIA 4KDUA 3ZIJA 5ELAA 1QUWA 4L5OA 2FD3A 1QMVA 1VRSD 4ZB8A 1HYUA 1ZYQB 4G0IA 3TJKA 2LJRA 1AW9A 1YJ6A 2GQLA 1ZGNA 2GZPA 2OE3A 1GP1A 1AIUA 1R7HA 2QC7A 4F0BA 4WXTA 4V2LA 1THOA 3EWLA 1M2BA 2X64A 3VK9A 4NMUA 4IBPA 9GSSA 4I97A 2HT9A 3ZL5A 5C00A 2OBIA 2XPDA 4PURA 5GAPD 3GUSA 4MF6A 1ZOFA 3ME7A 2HNLA 3GKXA 2LS5A 4IKHA 2LNSA 2GQKA 5ID2B 3C1SA 2H73A 2BJXA 2C3TA 3HYPA 2VL2C 4TW5A 2LJKA 2LJAA 2WRTA 2B1LA 1T3BA 5D9XA 4BVXB 2B6MA 1K0OA 3FK8A 4ZILA 4CW9A 3TB2A 5DDLA 3HXSA 2KOKA 3GKNA 2X8GA 1K0MA 5AN1A 3IHQA 4KNDA 2FA8A 3KJYA 3G9BA 4LA1A 1NW2A 1TI1A 5L71A 1VF1A 3ZFBA 3F9UA 4JE1A 4AJ7A 4IS0A 3GNJA 1ZZYA 1JLWA 3E3EA 3A5WA 4I8BA 1USBA 5DJMA 3KZQA 1TTZA 1SU9A 3LWAA 2IJYA 1Z7RA 2GSSA 4Q5RA 2RM6A 1UN2A 3IPZA 2AV4A 4IP1A 1Y25A 2HRNA 2FNOA 4YQVA 1PKZA 4K9ZA 4PQIA 4ECBA 4POKA 3TJGA 4WETA 2X8HA 4ZB6A 1S3CA 3L9UA 3R3EA 4EXJA 4MMMA 4YAPA 3TRQA 2L6CA 4H86A 5INYA 4EKZA 1UC7A 1QK8A 1UA5A 1Q98A 5EPFA 3GN3A 8GSSA 3IRAA 4MA9A 3UAPA 1K3LA 4JU5A 2H66A 1PD21 4HOJA 4HS1A 2C8UA 4MK3A 5JWRB 3WT2A 2H74A 1PQNA 3TRXA 4I5QA 2LV3A 3DEXA 1ILOA 1HQOA 2F8FA 4K7OA 1B8XA 4NAXA 1QGVA 5IPHA 1C72A 2CA8A 3SBCA 3DXBA 3IAM2 5D9TA 2YWMA 1YKAA 3EU4A 4ID0A 3H93A 1EGOA 5D9VA 1EGRA 1TK5B 4RQRA 1BEDA 4WF5A 4N30A 3F6DA 4TR1B 1SD9A 4NWYA 3VLNA 2H71A 3HVXA 3ZREA 4LLRA 4GQCA 2B5XA 3HJOA 2ON5A 2YP6A 2IIYA 1GSDA 1O8XA 2V6KA 4PUFC 5DAKA 4DVCA 5DQSA 1E2YA 1A0FA 3C1RA 2DJKA 1E6BA 5F06A 3U6VA 2A2RA 4L5LA 1FHEA 1TU7A 2GLRA 4HEA2 4D73A 4RUVA 1LBKA 2G0FA 4KCAA 4HU9A 4FYUA 2HRAA 5IO2A 5G31A 2GGTA 1GLQA 1TRVA 1GSUA 1HNBA 1M9BA 5F0GA 4EC0A 2H76A 2GT6A 3TOTA 3F4SA 1WP0A 3GHAA 4WF4A 4NXIA 4KAEA 2CQ9A 3W6GA 1X9MB 1F3AA 1TRWA 1EZKA 2VL3A 1B48A 5DCHA 1NSWA 3DVWA 1FO5A 1PSQA 3APQA 4O7HA 3Q19A 2JU5A 5B8BA 3AY8A 5AIXA 4XHMA 2VLTA 6GSWA 1W4VA 4MCUA 4EF0A 3L0HA 5DVBA 4USSA 2RLIA 3GYKA 2PUKC 3EMPA 3GKMA 1O8WA 4DSRA 2XC2A 3CBUA 4WBRD 1ST9A 1Z6NA 2ON7A 4AJ6A 3UL3A 1Q4JA 3M8NA 5DALA 5G5FA 4WR4A 3D0ZA 1MD4A 3GKKA 5JCWA 3I9V2 3CMIA 4TR4A 4MH2A 3TUEA 2V1MA 4K2DA 2RM5A 3D6IA 4E8HA 1BQ7A 1MTCA 2WS2A 3DKSA 3TDGA 1V2AA 2I9HA 4MF5A 2NTOA 4ECCA 4TOPA 1A24A 2VIMA 2KHPA 16GSA 2DJ3A 2IMKA 3QD9A 3WGEA 2LRCA 2IFQA 3RDWA 1SD8A 1OKTA 2HSMB 2NPBA 2DC5A 1H75A 2K18A 4XS4B 3QAGA 2TRCP 4XS1A 5D9WA 5ECLB 2NBSA 5CYYA 4NV5A 3FZ4A 1YF0A 5G1KA 4LL1B 2P5RA 5IMFA 2GDRA 2M46A 5IMVA 4AJ8A 4BA7A 2DLXA 2K9FA 3GA4A 3ME8A 1U87A 1J08A 2VM2A 4JRRA 5KN0A 3BJ5A 4Z7XA 3IAS2 5B6MA 1DBYA 3CRUA 1EP8A 4OD7A 2BMXA 3EE2A 2L4CA 3D4TA 1Z7PA 4QL9A 3F4TA 2CZ2A 2HZEA 2I1UA 1B4QA 1XOBA 1KBNA 5E4WA 3GSTA 1K3OA 1YEPA 2B7KA 3HJPA 2VCXA 1SJIA 2MBTA 1J9BA 3DYRA 3HZ8A 1OC9A 3QOUA 3M3MA 2M72A 4HQSA 2O8VB 2R2JA 1K0DA 4IQ1A 4X1UA 2QSIA 1SYXA 4TKYA 4DSQA 4ZBAA 4I2UA 1QFNA 3MNGA 3LEFA 1XIYA 2FA4A 1GULA 14GSA 1QQ2A 4BPYA 1XW6A 2DIZA 1M0UA 2OBKA 3EMXA 2V2GA 3GFKA 2HRKA 3FR9A 2I3YA 3D21A 3N9JA 4IP6A 2H1DA 3F63A 5B8AA 2P0GA 1WWJA 2VD0A 2B1KA 2ZUPA 4OFTA 4HQZA 1FVKA 6GSVA 2JSZA 4K0GA 3KMOA 4IELA 5F07A 1O81A 5IMDA 4KW6A 3PGTA 2GVPA 19GSA 1B4PA 2IMEA 2PN8A 3IOSA 5F05A 3FEUA 3W8JA 2YV9A 2GS3A 2VCWA 2H6XA 1XFLA 5ECRB 1ERTA 1R26A 1SKSB 1GTAA 5FHIA 2GQMA 5ID2A 2EIRA 1HNCA 3N5OA 4GCIA 1GSFA 4XCSA 4KH7A 5ABRA 1SENA 2OE0A 2F8AA 4J57E 5LNKe 4JEDA 4GSTA 1G7EA 4BVXA 4IQAA 2M80A 5HFKA 4PNFA 3L9VA 4L0UA 1G7OA 4CDOA 4Q5QA 1URMA 3I6AA 2O89A 4MP4A 2TRXA 3APSA 3FR6A 3VFIA 5CRGA 4HU7A 3CTFA 1ACVA 4V2NA 2WZ9A 5IPGA 3CTGA 3ZVJD 4HJ2A 3KCMA 1EOHA 2A2SA 3UOMA 2K8SA 4HJMA 4GWRA 2EIOA 1I5GA 4OCFA 3F3QA 2C0DA 4EL1A 4ISDA 5EVOA 4PX1A 3DWVA 3TCOA 5IM9A 2WDUA 4POBA 2VCVA 5HFIA 2NVLA 1T4ZA 3NIVA 1TRSA 3O76A 1FVJA 3UVHA 2EC4A 3NOFA 1TDIA 3O3TA 1GLPA 2ZNMA 4K1FA 1X5CA 2LQOA 5B7CA 4EVMA 3M1GA 4YQMA 3E9JB 5G2ZA 4K6XA 1PL2A 2FY6A 1TK0B 1FB6A 3C8EA 1XXUA 1OC3A 3UARA 1GSEA 2A4VA 5G5EA 5J41A 3F4RA 1YF1A 2F3MA 4MPGA 1PX6A 3G7IA 3V1WA 18GSA 1SL2B 4YQUA 3FZ5A 2PVOC 2MYGA 1O6JA 1WRYA 2YN1A 2H0IA 4KGIA 1OE8A 2IN3A 3EU3A 4MJEA 4XS6A 4YH2A 3D22A 3IA1A 3TKSA 4K0NA 2QKEA 2AUVA 1XW5A 4LMWA 5AISA 2RUEA 1IYHA 1XWGA 3KGKA 1NHYA 3BD2A 4YAVA 1K0CA 1AQVA 1GWCA 5ECOB 4GQFA 4BWQA 2GSRA 1XPVA 1X5EA 3EYTA 2HFDA 2O7KA 2H0GA 4MDCA 2LNTA 3HVVA 3VWUA 3QPMA 3GL3A 1KTEA 5DCGA 2B5YA 3R2QA 1OAZA 4PGTA 4LMVA 3HCZA 5B6NA 2CX4A 1G6YA 2IWTA 4OFNA 1PN9A 2H1BA 3IBHA 3GSSA 1EP7A 3QMXA 4JZQA 4KSOA 1GRXA 1VF2A 4WEYA 4N0VA 4OFMA 4WR5A 4GXZA 2R4VA 3H4KA 3MWHA 4EUYA 1XWCA 3DD3A 2O85A 3HD5A 2L59A 1GSQA 3PR8A 2DMMA 3D4MA 2CVKA 4G10A 2L6DA 3IXRA 4JBBA 3MAKA 1SYRA 1TOFA 3US3A 1ON4A 4N10A 3TOUA 3IR4A 1ML6A 1WPIA 3E0UA 4MZWA 5J5NA 2J23A 3H79A 1M99A 3GH9A 5H5RA 3KTBA 1N2AA 2IPAA 2G2QA 4X0XA 3TJBA 3BOAA 4Q5NA 5DJLA 3IDVA 2E7PA 1S3DA 1GSSA 1DSBA 2QGVA 5BMUA 1RQMA 3J7Yk 1AC1A 4RI7A 4FIWA 2JADA 4OCEA 1ABAA 3P7XA 4BVYA 5CREA 1Z5YE 4PQ1A 1GUMA 4K7IA 5G1LA 3IV4A 2B5EA 3KXOA 3RHBA 1OC8A 2WGRA 3K8NA 4N11A 4V2MA 3ZITA 2MMAA 2JACA 4ECIA 3DMLA 4CHSA 12GSA 4O92A 3FKFA 5GZZB 3RAZA 4ULXA 3FY7A 3HY2A 1KNGA 5IOXA 4ZB9A 2HLSA 2XBQA 1FOVA 1TU8A 4OWYA 2CT6A 5JWQB 1O7UA 1ZCPA 5ECQB 1MD3A 2CX3A 3IC4A 3UIWA 3ZMKA 2E0QA 5HQPA 2LQQA 2PPTA 2IL3A 2RUFA 3A3TA 3MDKA 1EEMA 2HSNB 1V98A 2V32A 2MBSA 2YZHA 5J9CA 1X9WB 2FLSA 1Y6EA 2C0FA 2R6KA 3FZ9A 2DSAA 2CAIA 3M9JA 1U6TA 1G6WA 1THXA 3J7Yb 3CXGA 1I9DA 3ISOA 1SJ6A 5GSSA 4DSSA 1GH2A 2HSHA 2WJUA 5ECKB 4KA0A 3FHKA 4N0ZA 2DJ0A 4V1Ag 2C4JA 2KUCA 5IOWA 4HI7A 1EV9A 3GTUA 1TXXA 2PWJA 4KDYA 2TIRA 3QAVA 1ZL9A 1ERVA 5LCZA 1K0BA 1PA3A 1T1VA 4RI6A 3DIEA 1TKDB 1F9MA 1AQXA 2I4AA 3Q18A 1XWKA 2C1YA 5KN1A 4ZBDA 1TI3A 1OVNA 2MMZA 5DBQA 5ECPB 3WGDA 1ZYEA 5DAKB 1T8EB 2C0EA 1GNWA 1VGLA 4TXOA 1U3IA 3VURA 4D73B 2WFCA 2CV4A 2L5OA 3LXTA 2B7JA 1PKWA 2O87A 3VPQA 3ERWA 3IK7A 2HE3A 4HDEA 5COHA 4IN0A 1BYEA 2C3NA 2PU9C 3OR5A 4I2TA 1BJXA 1LJRA 4KF9A 4FYCA 2H8LA 5JCGA 4IHUA 4K8MA 3LQ7A 2GT5A 3LJRA 4DEJA 3ZVJA 4TR0A 5J4UA 2CVBA 1FB0A 2YWOA 3WGXA 3A2WA 5CRHA 2DMLA 4GSNA 5CRWA 6GSUA 1HD2A 3UVTA 5ECHB 5D96A 2OKAA 5JCUA 5CRDA 2YWIA 4EE0A 3Q74A 4BL7A 2AYTA 4G19A 2KLXA 2I81A 1W89A 5D8IA 1NM3A 3TGZA 4O32A 2H75A 2B3SA 3FRCA 5IMCA 4F2IA 3TKSC 3LG6A 3VWVA 2NDOA 3ZLPA 1JHBA 4KDXA 1KEBA 3ZZXA 2GZYA 2AB6A 4MPFA 1ERWA 1SK2A 2L5LA 5DALB 5IMZA 3FYGA 1YZXA 4GRFA 3PINA 2FHEA 2DJJA 3KM6A 3M0FA 4MJCA 4NHZA 2MMOA 2JZSA 2H6YA 3EINA 4NPBA 4FO5A 2J9HA 1HNAA 2VD1A 4GLTA 3H1NA 3P2AA 5HR2A 3KH7A 3QDNA 3TKSE 2P31A 3C7MA 4KSMA 2FUG2 2VL9A 2L4QA 1TP9A 2IFQB 1IYIA 3FR3A 3CRTA 3KIJA 10GSA 2PERA 2VCZA 4MJAA 1A0RP 3ED3A 4XTSA 1JZDA 4NHWA 4ECJA 3Q6OA 4ILFA 3LYPA 2DBCA 1T7PB 3WD6A 5KEJA 2HRFA 4GSSA 2YWNA 4PXOA 3L78A 2WULA 2FGXA 1S3AA 3F0IA 1GNEA 1DE2A 1M2AA 4TXVA 1F2EA 1TRUA 3VWXA 1GTUA 2YNXA 1K3YA 2HZFA 2LRTA 3TKPA 1H4OA 2V6OA 5HR3A 5HR1A 5KN3A 1F6MC 1VF3A 4O5RA 4JR6A 4G9HA 4J2FA 2GSQA 1SJZA 2HZEB 5AGYA 3PH9A 4G0LA 1T00A 5AIVA 2EIQA 2ZCTA 1EEJA 3G7JA 1OC9B 3HJMA 2F51A 3VPTA 2AJQB 1EWXA 3APOA 3GRXA 4Q5FA 3W8SA 5ECIB 2HYXA 2MMNA 3KP9A 1WJKA 3PPUA 1SL0B 5J3RA 3CSHA 5HFGA 2D2ZA 2H72A 4MABA 2LEGA 5CP1A 1XBSA 2XPEA 4G0KA 4ML6A 17GSA 2HRKB 1M7TA 4X43A 5A4UA 4WKWA 2R37A 1AQWA 3I43A 3GH6A 1X5DA 3DGQA 1F37A 5G30A 3ZYWA 1R5AA 2C80A 2PVQA 1A8LA 1OE7A 4ZBBA 4F82A 2FWFA 20GSA 2VM1A 2VCTA 3O6TA 1PRXA 4KCEA 1VF4A 4I6XA 2OACA 4HZ4A 3U5RE 1K0NA 1SKWB 2UZ8A 4OO5A 3WYWA 3TKRA 4TVEA 4TRXA 2OADA 3RHCA 4ACSA 3RPPA 3VI7A 4TR1A 22GSA 1GTIA 3ZRDA 3F6FA 2HQTA 1YQ1A 3GX0A 3QFAC 1A2JA 3QFBC 1R5PA 2AHEA 4ZL9A 1NHOA 3HVSA 5GAND 2CZ3A 1V58A 2Z9SA 2VOCA 3GMFA 5ENUA 3A2VA 3IE3A 3S9FA 3QAWA 4TN8A 5FWGA 5JWOB 2FWEA 3UJ1A 1K0AA 2F9SA 1GTBA 4MLYA 3DVXA 4XRAA 1B9YC 2C3QA 2VLUA 3L9SA 3TRPA 4L0WA 2OE1A 3ERGA 4KB3A 5ECNB 1CQGA 4ZL7A 4MZBA 1LU4A 3G7YA 4BWSA 1R4WA 3ZMLA 2VAFA 4JR4A 2KP2A 5CO3A 1ZMAA 1TJDA 4GTUA 3P8WA 1Z3EA 4OO4A 1XOAA 1RK4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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