4JD4A

Structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with mii-4-065
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
publication title Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-4-065
rcsb
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 106
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2013-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 4jd4A02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4jd4A01
2A4AA 4EOUA 3R13A 1SO3A 4GNJA 1VHCA 4MJMA 5EBUA 4IX0A 3DI1A 2R91A 5DY2A 3P7YA 1KM1A 4N6FA 3YPIA 1WQ5A 1KFLA 4UFIA 3W1TA 2QCHA 2NX3A 3HPSA 5G1TA 2WPBA 2TPSA 4O15A 4NNCA 4AF0B 4AWSA 5HUOA 3KVMA 2J27A 1K7XA 3P82A 4UMCA 3R2GA 3PAJA 1DJNA 5KMYA 1VLIA 4ZQMA 5U4NA 2E6AA 4ADTA 3W76A 2FPYA 3GK0A 3M0ZA 4JTIA 1MXSA 3BW3A 5K4XA 2I1OA 4JTGA 2W6RA 4XKYB 3TR2A 5K9CA 4MY9A 5K2ZA 3CM4A 5CPOA 2C14A 2TRSA 3I7QA 2B7QA 4A21A 4GE8A 1LYXA 1H1ZA 3FJ6A 1KFEA 3NQ8A 1BTMA 1JCYA 4O19A 5D30A 1YXCA 1F76A 1E51A 1X1OA 3NZRA 4HT3A 5C54A 1TPEA 1THFD 3RF9A 1OHLA 2C13A 4Q33A 2OZ0A 3TAOA 4O1BA 3MP3A 1EP2A 1TRDA 4UMAA 1Z42A 1VZWA 4OE7A 3F1QA 3O16A 3ZWTA 2QJIA 3GNNA 3NQGA 2VENA 4M7SA 4J9JA 1MZHA 4WUIA 3MO7A 1G4SA 4ZZ9A 3W1XA 3HQ1A 2ISVA 4O17A 1YPIA 5FF0A 2DZTA 1KM5A 5AHMA 5TIMA 3LV6A 2VC6A 4RJEA 3UWQA 3VE7A 4WXYA 1VYRA 2DZWA 3RFAA 3QFEA 3R8RA 2B4GA 1OFEA 1TV7A 5KZMA 3N9SA 3GDLA 2NWRA 1KA9F 3FA5A 3RU6A 1XBYA 3W7PA 2YGYA 2C16A 1FBAA 1DKWA 5EL1A 5EY5A 1YDVA 3C2EA 4LC8A 2Y63A 3NDOA 3C3NA 5K9DA 3UY8A 1N7KA 3PBYA 1KW1A 3LXBA 4WQ6A 2GVJA 8TIMA 1N8FA 4Y90A 1F6PA 4QJ1A 1BEUA 1OFAA 5EMUA 4JTLA 3O6YX 1OX4B 4NQ1A 3NZ1A 5LHEA 4AMAA 3ZWSA 3OHIA 5AOUA 1EA0A 3UWWA 3S8HA 3G1YA 3UWZA 4JTUA 4X2RA 2GQAA 3BG3A 2NWSA 3C2OA 2G5WA 1MO0A 4MLJA 4TR9A 1M5WA 3WK3A 1XDMA 4WY0A 4P61A 4ONVA 1ZAJA 4PA8A 3UPWA 3P62A 1L9WA 3LCLA 3S5ZA 4HNUA 1LLZA 4FNRA 5G2IA 2WOQA 2C1HA 2ZZ3A 1YYAA 4JY8A 3LOTA 1JCNA 2Z2UA 2YXGA 3E9AA 3W7JA 4KFPA 1W3TA 4NJKA 2YDAA 1G69A 4Y6GA 3WK2A 1V7YA 4BI5A 3PVFA 1D3HA 1K8YA 4JX6A 1KM3A 1EWDA 3PUDA 3DXIA 3OA3A 3UWVA 3MBFA 3W2MA 1C8VA 5K3VA 1XKYA 3N2MA 1OG0A 3E49A 2CZEA 2RKXA 4TX9A 3W7EA 1VQTA 4TMCA 4FNQA 3GXPA 1B9BA 2Q8LA 5AHIA 1TREA 3LV5A 2NV2A 3PY2A 5LKYA 4GC4A 3K30A 4N2YA 1FXPA 3W1LA 3P61A 3USBA 1DORA 3GDTA 1LRQA 5F1UA 4O28A 2Z1BA 3AO0A 1OFBA 3FOKA 4JN6A 5H91A 3U8GA 4FX6M 1TJPA 3PSVA 4DXVA 3G24A 3GLCA 4O0KA 1EP1A 5FI8A 3W73A 5AC8A 3W6YA 5IBXC 2CZ5A 1IIHA 5C2XA 1VGAA 3NQFA 1OF6A 5AHNA 3W7IA 1R2SA 3DFPA 3HMJG 3Q94A 4U28A 3W7RA 4AWUA 2OT1A 3EX6A 3SGUA 3OVRA 3IIPA 3MI3A 5EYWA 1JUKA 3ATZA 4H4IA 2FQIA 5D2TA 1XL9A 2E1DA 5A5WA 5DY3A 1W37A 4LRSA 1QPOA 3HG5A 4ZQCA 4FIRA 1OX5A 3LCIA 3E12A 2ABBA 3EXTA 3V1PA 2A5HA 5EPDA 1ICPA 3LI0A 5HR7A 1VR6A 3LCFA 1WBJA 5CZ0A 4ADUA 1DOSA 3QYQA 3QEZA 3W86A 2DU2A 2QAFA 4MPQA 1Y0EA 1Z48A 3T78A 5F2GA 1XUUA 1O4UA 2JKPA 1HG3A 1R30A 4O57A 3TH6A 3OVPA 4UR7A 2ATMA 2QCLA 4EWND 2Y7GA 3C56A 1TQXA 2C0AA 3TQKA 1PHQA 4MZYA 2WO5A 3M5YA 4AHOA 4HSNA 3TK7A 5IM51 3GYEA 6TIMA 2O7SA 5E93A 5DLCA 2VFIA 2V2DA 1W5NA 4KFOA 4GUHA 1LBMA 1TB3A 1TYGA 3NQ7A 4IMCA 2GPTA 3DZ1A 3C2VA 4O50A 2H8XA 2X1SA 4IXHA 3F03K 5F4XA 4LC6A 4UTHA 3LLFA 2TYSA 2V5LA 2NXGA 4LWWA 3LCXA 5IBXA 2ZZ4A 1QO5A 5HULA 1S3HA 4N9EA 2YFOA 2FFCA 5FEZA 2ZA3A 4MFDA 4HPJA 2ZQ0A 4LU0A 1A50A 4UNLA 1K8XA 1VCFA 2OJPA 3QH2A 1QDSA 3G1SA 3KRUA 4ZQNA 4MY1A 3DGRA 3SZ8A 2ZYFA 4JIPA 3B4UA 4POCA 2WNZA 3N2XA 1FWSA 1EEPA 5KSWA 2E5BA 2J88A 2PE4A 3DFSA 5AC7A 4S2BA 3S0CA 2V30A 1YXDA 2FPTA 4UTUA 3DFNA 2CFFA 3LDVA 4FNSA 3PS7A 3WJZA 3NQMA 3GAYA 3N9RA 1SQ7A 1AMKA 2ZZ1A 1XFBA 5H2ZA 1FQ0A 3R12A 1ALDA 2D73A 3IIOA 1LBLA 4LW7A 4UTJA 1LOSA 1JRCA 3QQ0A 3A21A 3G18A 1G6CA 2CLOA 2VEPA 3ABQA 2OCZA 2JKEA 3QJAA 3CIWA 4FXRA 2ZZ5A 4GUIA 5L9FA 3GAKA 1TPUA 2VKZG 2ZCGA 1PV8A 4RCXA 4JX5A 4B5NA 2Z6IA 4GBUA 4KKXA 3LBCA 2OT0A 4OV9A 1T96A 1RD5A 2ZTKA 5DCEA 1DBTA 5BNKA 1OVDA 5DBTA 2E68A 1CW2A 3TIMA 2NX1A 1SO6A 3QW3A 2PRLA 2TSYA 3QSRA 2ZFAA 5HWJA 4UTKA 1EX5A 5HJLA 2DZXA 4YL2A 2W0UA 2ZZ7A 2CW6A 2R14A 4LTSA 1CI1A 4NVTA 4PC8A 4QSHA 3TAKA 1R46A 1O5KA 5F4SA 3W83A 2EAWA 2X2GA 5HNRA 3SR7A 1IXQA 2J9YA 1IGSA 3PWAA 1RZMA 2E09A 3BGJA 4KFNA 3HGJA 1SZEA 3W88A 3B04A 3M41A 5D02A 4FX8A 4BF9A 4IJBA 1GZGA 4A22A 3O8AA 3RK8A 2A2IA 4FHAA 3OBKA 2ZRWA 4WY0B 3TC7A 1VCVA 3C6CA 3LXAA 2A21A 3KVLA 5LHFA 3TU9A 5AB3A 1W5QA 4NNAA 2XN2A 1W1ZA 4ADSA 5D38A 3W7KA 4FB7A 1TTJA 1T8XA 1XBXA 4N02A 3A5FA 1H61A 1QPNA 4RKAA 4DELA 1SW0A 1MEIA 5KZEA 2DORA 4PL2A 1ZAIA 3LTYA 4UC5A 3QMTA 4A2RA 4CNOA 3LGEA 2Y62A 4CLMA 1OYCA 2ZZ6A 4YMZA 4HPXA 3I7RA 2ISSA 5CPLA 3TQVA 4WZHA 3TA6A 4HKPA 3H53A 1GVFA 3HOJA 3LRMA 1GVRA 4IOTA 4JTTA 1M6JA 4E2BA 3HGRA 3JRKA 2ZZ2A 4QAIA 4C1KA 1NF7A 5AYZA 2A7PA 2CZDA 2Y70A 3HB9A 3B0UX 2NXHA 3G3DA 3W71A 1SZNA 4JS3A 5LSMA 4PFMA 3S5YA 5D03A 1RV8A 4UTMA 3GXTA 4O52A 2R8WA 1WDWA 1K3UA 2Y6ZA 1RQBA 3FKRA 4NJGA 2A6NA 3DI0A 5G4EA 3EB2A 5E1QA 4O1DA 1H7PA 4N9DA 4RX0A 3CEPA 1NVMA 3GR7A 4O0ZA 3STEA 1F74A 3PBWA 1QOPA 2A0NA 2WQPA 4A29A 1RVGA 2ZRVA 2RH9A 1HO4A 4O8RA 3QF0A 1KFBA 3ELFA 3LHZA 4A2SA 3GDKA 4DF1A 1H63A 1UB3A 3I68A 5EA9A 3NPWA 2CWNA 2G97A 3P8JA 3HIJA 5LZLA 3NL2A 1W3IA 1J2WA 2QJHA 4FIQA 3P74A 3CHVA 2ZRUA 4QNEA 4LVGA 3O05A 6ALDA 4LS2A 2H90A 3EEGA 1YDOA 4LS1A 4MFEA 3MI6A 4LUIA 3N73A 3LB0A 4MYAA 1SUXA 5BMWA 4BK9A 1OFOA 5E0KA 3CEUA 3ZFHA 3M9YA 3RLVA 2Y89A 3VCRA 3PUEA 3KRSA 2BX7A 3KFTA 2Q3RA 3W1RA 1FDYA 3A23A 4G1KA 4X3ZA 5D32A 5FF4A 3BG9A 1BKSA 3O1NA 3TV8A 1JCMP 3MWAA 4O12A 4CNNA 3W2KA 1QOQA 4ZQOA 3O6CA 3W85A 2DJLA 1CX9A 2DP3A 4X9SA 1LZOA 3NXFA 2J24A 1VHNA 3NYZA 2GOUA 1DV7A 4K8EA 3TUUA 3GKFA 5D2WA 5L6UA 4JY9A 3PB0A 2CLKA 3OVQA 5HUPA 4NU7A 5G2WA 2Y61A 4Y9AA 3I7SA 4XZ9A 2NZLA 3LRLA 5D2XA 5DCDA 3BV4A 4M6VA 4JNMA 2YSWA 3ANYA 5AN7A 4BI6A 2JBMA 3PG9A 2AGKA 2QR6A 3W72A 1F7BA 1JQVA 2HTMA 3WJSA 1C9DA 2WNNA 3CPRA 4JTJA 3GVGA 4UTTC 1RQHA 3BW2A 4JYFA 3L9CA 3L67A 3HBLA 4LOCA 3TW7A 4JDBA 3T4CA 4TU1A 3NO5A 3A24A 3MMTA 3PBVA 3WJWA 1J4EA 5F1VA 3MHFA 4ML9A 3HG2A 1GQNA 4DBEA 3QW4B 1BWLA 1FXQA 1KFKA 2QDHA 5I3IA 4RZ6A 1KM0A 4UTIA 3LHVA 3FFSA 3VKJA 4M5PA 1XXXA 3O15A 4AHQA 2O7QA 4ORIA 4EF8A 4IXXA 2EHHA 4MJZA 1I4NA 3NR0A 4XWUA 3DAQA 2YYTA 3LTSA 4LT9A 5D2VA 2Z6JA 3NA8A 3PUOA 1I2OA 1W5PA 1AG1O 4X22A 3M5ZA 3TJXA 4M7TA 2QCGA 4PL1A 1L6WA 5D37A 1JQXA 1WXJA 2QUUA 2Q8ZA 1YADA 1ME7A 3AJXA 3FIGA 1SSDA 4NXKA 4IMEA 1EP3A 3QPZA 4OBTA 1U5JA 4H6KA 3PB2A 2ZRYA 4DF2A 5G1YA 1LRNA 3NQCA 5DELA 4JYDA 3TXVA 4XTIA 3NQEA 2Y85A 4BI7A 2OX1A 4UTTA 4CCCA 3A22A 2QCDB 3TQ0A 2NUXA 1YDNA 3GR8A 3QRHA 3NQ2A 5K7JA 4LVAA 3L0KA 3W2NA 3UWYA 1H7NA 3UD6A 3L0GA 4ZQRA 4LS0A 3TROA 4AXKA 2ALDA 4RXFA 3W1QA 4ICNA 4FF7A 3TXZA 5LNUA 5D04C 3BGGA 4L4LA 1VJIA 3SIZA 3TFCA 3L5MA 3ABSA 2JGQA 2VEMA 3UZ5A 3G8RA 1ZCOA 3Q58A 4UFJA 3NM3A 5AHFA 1VCGA 4Q4KA 3UNDA 1KTCA 3NAVA 2I14A 4C1LA 3DENA 1F05A 3EX2A 1HO1A 1KBIA 1XUZA 3PF3A 1JRBA 1R2TA 3GX9A 4AHPA 3P84A 4L4MA 4WY0F 5KTLA 4Z0JA 3GKAA 2C3ZA 4JX4A 3GNDA 4YCOA 2P10A 5LNRA 4K37A 3FLUA 2FPVA 5G5IA 4MLRA 1MSSA 3LXCA 1ZJIA 2GJNA 3FYOA 3CT7A 3LTPA 1WAUA 2BWGA 3VI2A 5CPNA 3STFA 4N4QA 1RQEA 3DHFA 4O4WA 1Z41A 3TSMA 2E77A 1KFCA 2VFGA 2JK2A 4I7UA 1Q45A 5CZJA 1K8ZA 1DHPA 2X16A 4FX7A 2VFEA 4AF0A 4GRSA 3MBDA 5BMXA 1KFJA 1UASA 4WD0A 5AFDA 2YCEA 4WOQA 1FWTA 4RR4A 2XFWA 3JS3A 3CQ0A 4ZMGA 1Q6RA 2VFDA 1A5CA 2V81A 3DBPA 4U4MA 3R5EA 2GVLA 1LDCA 1T99A 3QQ1A 3G1HA 1X1ZA 3C52A 1TPB1 4AAJA 3ZS4A 1OFDA 4UNKA 2NUWA 3OEXA 1I8JA 3W75A 4CQ8A 4EVZA 4IMFA 4MY8A 1YLVA 4O54A 3S42A 1JVNA 1NF0A 3TDFA 3EX1A 4NJJA 2QEZA 4NT0A 3UYCA 1LTDA 1B4KA 3P60A 3SW6A 3Q2DA 3A9IA 3S1UA 1GOXA 3KXQA 5TQLA 2VEIA 5D09A 5DCBA 5LGXA 3BK0A 1W54A 3SI9A 4W9TA 1UUOA 2JKAA 3BPWA 3W70A 1IXPA 1GVSA 2ZRZA 3NM1A 1ZAHA 3VFLA 3G1XA 4FNPA 4WOZA 1PE1A 5I3HA 4RLIA 1PVNA 1B3OA 3LX9A 4UCGA 2CLFA 5FEPA 4M6QA 1F73A 4GUJA 2XN1A 1T0OA 3MP4A 4D2JA 1K7EA 2QUVA 1PIIA 2YZRA 4KWWA 3W87A 3I6RA 3THAA 4LUJA 2UV8G 4IPJA 1IXOA 3UXAA 2EF9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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