4JE1A

Crystal structure of thiol peroxidase from burkholderia cenocepacia j2315
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
174
structure length
174
Chain Sequence
AHHHHHHMSKVTLGGNPIDLAGTFPAVGAQAADFKLVGKDLADLSLASFAGKRKVLNIVPSLDTPTCATSTRKFNEAASSLDNTVVIVVSADLPFAATRFCTTEGLANVVTASTFRTGRAFANAYGVDVTSGPLNGLTARAVVVLDAQDKVIHAELVGEIKDEPNYDAALAALK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of thiol peroxidase from BURKHOLDERIA CENOCEPACIA J2315
rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Burkholderia cenocepacia
molecule keywords Probable thiol peroxidase
total genus 53
structure length 174
sequence length 174
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.-:
pdb deposition date 2013-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4je1A00
2E2GA 2B7KA 1PMTA 3VURA 1G7OA 1XVQA 1TRSA 2C3NA 2LQOA 5IPHA 3ZITA 11GSA 1GL8A 4L0UA 4MZCA 1AIUA 1GUKA 1V9WA 3GTUA 4ZL9A 3F6FA 3CSJA 2N5FA 3GMFA 2OJLA 1OC9A 3D6IA 3DVXA 2CAIA 1ZZYA 1M2BA 6GSYA 3DGQA 3HJPA 4ZBDA 1GSEA 5CO3A 3FZ9A 2MYGA 3DMLA 4NHZA 2H75A 4DSSA 1F3AA 2EC4A 5IO0A 2KLXA 1HYUA 4DSQA 2H1GA 3MSZA 5IO2A 4TR1A 2LUSA 4X1UA 1HNCA 2E0QA 4I5QA 2RUFA 4NHWA 3DVWA 2OACA 4KDYA 5EL8A 5E4WA 4O5RA 1XOAA 2VLUA 2CAQA 2YP6A 3HZ8A 1A2JA 2FUG2 2WCIA 2KP2A 3GV1A 1B8XA 3ZIJA 1AC1A 3M1GA 4MJEA 2JSYA 4GRFA 4XRAA 1XWAA 3Q6OA 3TJBA 1W4VA 2JU5A 3P2AA 1GTBA 1GNWA 2IMDA 5CRWA 2WZ9A 1TXXA 5IMVA 1URMA 1A0RP 1TOFA 4N30A 1BEDA 4GSTA 1PKWA 3BD2A 6GSSA 5ECSA 5D96A 1WWJA 4O7HA 1ZL9A 3DYRA 1UA5A 3ISOA 2WFCA 3IAM2 3APQA 4FH8A 4TN8A 2LRNA 3F8UA 2XPEA 1DSBA 1SU9A 2V2GA 4TR4A 1K0BA 2DLXA 2IMIA 1TP9A 3ZVJA 5IMCA 3UIWA 3MNGA 1FO5A 6GSXA 1LJRA 4ECBA 4MF5A 2M80A 1HNAA 4KX4A 4BWQA 1T7PB 2M72A 4FYUA 2LNTA 3UJ1A 4ZL7A 3A3TA 3UVHA 2EIOA 2VM1A 3VWVA 4HU7A 2H73A 1OE7A 3RHCA 2V41A 14GSA 5HR2A 2F51A 3GN3A 1JZDA 1RW1A 5GSSA 1ILOA 1SYXA 4MLYA 4ISDA 4HJ2A 4GTUA 3EVIA 2DJ1A 1XPVA 2JZRA 2VAFA 2J9HA 1MDJA 2NVLA 1AQVA 3ZIVA 1VGLA 1EEMA 1I9DA 2GSSA 2AHEA 2LV3A 1NSWA 2YJHA 3GTUB 2H76A 4OCEA 2MMNA 3D0ZA 3GFKA 4TW5A 2X8HA 1OC9B 3GUSA 4V2LA 2F9SA 3KGKA 3R2QA 4EKZA 3PR8A 1CQHA 2IMFA 2V1MA 2TRCP 2YZUA 3H93A 5FWGA 5H5QA 2BTOT 2VCWA 5GSTA 3I69A 3KXOA 4HOJA 4DSSB 3NIVA 3F6DA 2DJKA 2JZSA 3WD6A 1K0OA 3TKSC 1A23A 4YH2A 4KE3A 2WGRA 4TR1B 2K6VA 3KCMA 4GWRA 3GKXA 1U3IA 3VWWA 2ON7A 4FYCA 1XVWA 3QR6A 4POLA 1TU7A 3EYTA 5G1LA 4EDZA 3TOTA 3I6AA 1WPIA 1THOA 3VK9A 5DVBA 12GSA 2PBJA 4K1FA 4H86A 4ZB6A 4KH7A 1JFUA 3ME7A 2L4QA 4BA7A 5J5NA 5HFKA 3FYGA 4IN0A 2R4VA 1XIYA 1SKSB 4NMUA 3WT1A 5EVOA 1XWBA 2X99A 4P3YB 4Q5QA 5CREA 1GH2A 2QSIA 4ZIJA 3TKSA 2GT6A 1J08A 2CT6A 2LJAA 2ALBA 3GKMA 3QMXA 2HZEA 3HJMA 2I4AA 3D4TA 3CRUA 4OCFA 1GTUA 2H19A 4PUAA 3DWVA 5IOWA 1MDKA 3LGCA 3KP8A 3OR5A 2MMOA 13GSA 2HNLA 2MMAA 2V6KA 4OO5A 1VF2A 3PINA 4XS4A 5G5FA 3NOFA 5DALA 5H5RA 2L4CA 1GSYA 3HVVA 5B6MA 5IMFA 1EOHA 2AV4A 5E59A 3SWLA 3KH7A 4XIHA 3P8WA 1G6YA 4NV5A 4G2EA 5ECQB 3UBLA 2CVDA 2YV7A 2GSTA 3EU3A 4LMVA 1O85A 3QAWA 4Z7XA 3RAZA 5IQYA 4G9HA 2JACA 4XCSA 1XWKA 4JU5A 3H79A 2B5EA 5AISA 9GSSA 2KHPA 3HKRA 2XPDA 5HQPA 3QDNA 5ECLB 4PX1A 4AJ6A 2P5RA 1U87A 1A2MA 3UOMA 2AB6A 2PMTA 2C1YA 4AJ8A 4EF0A 3KZQA 4WBJA 2H0IA 2TIRA 4BVXA 2VLVA 2N5BA 3HA9A 5ECMB 4WETA 1XOBA 2IMKA 4KB3A 1T8EB 3E0UA 3UL3A 4POMA 3HDCA 1PQNA 1GTIA 4WR5A 1MTCA 1A0FA 1R5PA 5ECIB 4F82A 1QFNA 2V6OA 2CVKA 3IE3A 1R7HA 1G7EA 3ZFBA 4ZILA 2K8VA 2YZHA 1XW6A 2HT9A 4HUAA 4YAPA 3VLNA 1TK5B 5DCHA 4QQ7A 2PERA 4GXZA 2YJ7A 6GSTA 2RUEA 3M3MA 1G0TA 4IS0A 2HE3A 1X5CA 1OKDA 3C1SA 4RQXA 1M9AA 2FLSA 3HY2A 4CHSA 1THXA 1GLPA 1B9XC 3CXGA 1JHBA 3F4TA 3EINA 3H1NA 2LSTA 3JCML 2H6XA 4ZB9A 3M9KA 3EWLA 3QOUA 3LYKA 5HFGA 3TRQA 3CRTA 3LJRA 5B6NA 2O7KA 2L57A 2O87A 2YWNA 5F06A 4MZBA 4NAXA 3HD5A 4OFMA 5IIZA 1YQ1A 4RUVA 5J4UA 4PNFA 1VF3A 1ZCPA 3M9JA 2PVQA 4GCIA 4DEJA 2I81A 2H74A 3EURA 3C8EA 3KM6A 8GSSA 1WP0A 1FW1A 4XS4B 4O32A 1R4WA 5DALB 2V32A 2GZZA 4F0CA 2LJRA 1M9BA 1J9BA 2H0GA 2PPTA 1H4OA 2VD1A 3LYPA 5AN1A 1Z6NA 1KNGA 1W89A 1NHYA 4MK3A 3ZL5A 4MF7A 2IIYA 1SJZA 2C0GA 1SD8A 1BAYA 2RLIA 1EWXA 3RDWA 4IGJA 5DCGA 4TR3A 2FD3A 2RIIA 3F4RA 1F3BA 2FNOA 3E9JB 4Q5FA 2VCXA 5J3RA 4IKHA 2H66A 2B7JA 5KN3A 5DAKA 2D2ZA 5DDLA 1HQOA 3DXBA 4AF2A 5IPGA 3IBHA 5ENUA 2FCHA 2HI7A 1B4PA 3APSA 1EGRA 4OFNA 1EP7A 4K2DA 1R26A 2H1DA 1K3LA 2YANA 2H01A 3O76A 2LQQA 3GKNA 4PUFC 5C00A 4XHMA 2HRNA 3SBCA 2GTUA 4NV2A 1OKTA 3PH9A 1SK1A 1Q98A 4I2TA 2ON5A 4F03A 3KTBA 1QQ2A 2P0GA 3KMNA 1NM3A 4YQUA 1ERVA 2F8FA 2OADA 3CSIA 4WKWA 2L5LA 1Z6MA 1V40A 3A2XA 1ERTA 3W6GA 3J7Yb 3L9UA 3G7YA 3N5OA 3RHBA 1M2DA 5ELAA 3FY7A 1PA3A 3H4KA 2K18A 3KH9A 1S3AA 2L59A 3QFBC 2FHEA 3W8SA 5INYA 1SENA 16GSA 3TRXA 5GZZB 2WJUA 3TJGA 2GVPA 5KN0A 2LJKA 2X8CA 4ZBBA 2LS5A 3IV4A 1BQ7A 4FYBA 1IYIA 5DJMA 2MBSA 1WRYA 1LU4A 4GQFA 2CX4A 2NBSA 4XS1A 5G2ZA 2DJ0A 4K6XA 2G2QA 1Z3EA 1OYJA 1VF4A 2LEGA 5J9BA 3TJFA 1LBKA 4KDXA 4ML6A 1NW2A 2HXKA 1M0UA 4KGIA 3IR4A 4EL1A 3FW2A 4BL7A 2JSZA 2LRTA 3FHKA 5ECOB 2ES7A 2PGTA 2VCVA 3U5RE 1H75A 4J56E 5A4WA 2CQ9A 4KA0A 4FIWA 4ML1A 4HZ2A 2KUCA 5A4VA 3UVTA 5A5KA 1GUMA 2PU9C 1JZWA 5CRDA 2HSHA 1X0RA 3IPZA 4MP4A 1Z5YE 3Q74A 5G1KA 5B8AA 2YWOA 1PL1A 1ACVA 2E2MA 7GSSA 3HHVA 1AW9A 1ZYEA 3L9VA 4V2MA 5DAKB 1BG5A 3QFAC 3ZMLA 4DVCA 3EMPA 4I6XA 5AIVA 2QGVA 1MD4A 4RI6A 2M46A 1GSSA 4IJIA 5ECRB 3CTFA 2DJ2A 3QPMA 1EEJA 4YQMA 2WDUA 4QL9A 3F3QA 1ZYQB 10GSA 1SK2A 4PGTA 2C80A 1TRUA 1T4ZA 2VOCA 4KSOA 4ZXGA 4KCAA 2Z9SA 4EE0A 1GP1A 2YOIA 2L5OA 4TXVA 3TJKA 5DJLA 4L5OA 4V2NA 2FWFA 4TKYA 2NDOA 22GSA 1A8YA 2WRTA 2LTKA 3M0FA 3WGXA 5IMAA 2F8AA 1DE2A 4MJAA 4XTSA 3ZFLA 4ZL8A 4MPGA 1V98A 1OC8A 2DIYA 2KP1A 5EY6A 5FHIA 1TRWA 5D9WA 2OE0A 3EE2A 4IJ3A 4IW9A 3VI5A 18GSA 3DIEA 1Y25A 1GTAA 3DD3A 2YWIA 1QUWA 3KJYA 1A2LA 2I3YA 4PQ1A 4CW9A 2XBIA 1Z7PA 4K7NA 1N2AA 4KAEA 1S3DA 2REMA 1TTZA 3ZYWA 4DSRA 2H0HA 5HR1A 2B1KA 4HQZA 4RI7A 2R6KA 5G30A 2I9HA 2H6ZA 3BOAA 4HEA2 2H72A 4K8MA 1XBSA 1ML6A 5D93A 1PD21 4HDEA 3ED3A 5JWOB 4MF6A 4G10A 1MD3A 2OE3A 1ABAA 3LXZA 3IRAA 1Y6EA 1K0MA 3U6VA 2O89A 2H6YA 3IHQA 2CX3A 2ZUPA 3GRXA 1GSQA 2VO4A 3GA4A 4GLTA 3F9UA 4JRRA 3US3A 2EIQA 4GSNA 3LSZA 2PWJA 2GGTA 2OBKA 3A5WA 3FZAA 2FWHA 2AUVA 4Q5NA 3UAPA 1E2YA 3DKSA 4L5LA 4LA1A 2GSRA 1TW9A 3IA1A 3MAKA 5D9XA 4GSSA 4MH3A 2AAWA 2IMEA 4F9ZA 3IC4A 5G31A 2AYTA 1JZRA 5DQYA 3WGEA 5AIXA 1XCCA 2H8LA 1AQWA 1EV4A 1NHOA 1YZXA 2HRFA 1I5GA 1U6TA 5JCWA 2R37A 5G5EA 3GYKA 4YQVA 5JCUA 3CTGA 1SKRB 4JR4A 3LORA 1GUHA 3GIXA 4D73A 2WS2A 4V1Ap 1K0CA 1PRXA 3WGDA 1X9SB 2C0EA 4NPBA 1V57A 3HVSA 4XRDA 1BX9A 4N10A 2B5YA 1K3OA 2H1BA 2CV4A 1USBA 1TRVA 2WULA 4OD7A 5HR0A 2O85A 2IPAA 3EU4A 4G19A 1J0FA 1OE8A 4WEYA 1Z7RA 3CSHA 4HS1A 2GSQA 1PX7A 2H1AA 5F07A 5KN1A 1EOGA 2CZ3A 3ZVJD 1FVJA 1ERUA 1O73A 4WF4A 3TOUA 3IXRA 1KTEA 2B1LA 2VL3A 1FB6A 1HNBA 1TI3A 4HQSA 2EIRA 2R5GA 1T4YA 5LD0A 4JR6A 3D4MA 3VPQA 5HR3A 5A4UA 3ERFA 5LCZA 4X0XA 3QAVA 2OA7A 2DIZA 1XXUA 3KTLA 2AJQB 1YF0A 1T3BA 1N8JA 4LL1B 1FB0A 1TKDB 3TB2A 5FT3A 3TKSE 1K0AA 1M99A 1QK8A 3BBYA 4I2UA 2HZEB 5F0GA 3LG6A 1FVKA 20GSA 2OE1A 3APOA 5ABRA 4HJMA 3HZ4A 1V58A 5DQSA 3HYPA 1OC3A 1FHEA 5IMZA 4OFTA 2QC7A 2RM5A 6GSVA 4L0WA 2I1UA 1XW5A 2MMZA 4EUYA 4F2IA 1YKCA 3MWHA 3LXTA 2FWGA 4TXOA 1PN9A 2JZTA 5D9VA 2R2JA 1SYRA 3ZTLA 2GZYA 2B5XA 3C7MA 1T00A 1TDIA 3ZREA 1SL1B 1ST9A 2K8SA 5C04A 5F8BA 1IYHA 4MMMA 1O6JA 2G0FA 3QD9A 1V2AA 4ILFA 4PQIA 5D9TA 4I8BA 1B48A 2DBCA 5IM9A 5KN2A 3GHAA 1OVNA 4PQHA 4EC0A 2L6CA 3WT2A 5JWRB 2XBQA 1YDKA 2MBTA 3LEFA 3UEMA 3FR3A 1TI1A 2DC5A 1TU8A 2FWEA 4IHUA 4L8EA 3FZ5A 3W8JA 1AAZA 4D73B 3PGTA 1GSUA 4KNDA 3C73A 2C3TA 2IWTA 3E3EA 3O3TA 3BCKA 4KSMA 3LWAA 3TKRA 4TRXA 2LRCA 4IP1A 4JBBA 1O8XA 2HYXA 4N0ZA 3GKKA 3V1WA 3BCIA 4LMWA 1PGTA 2H71A 2CA8A 2QKEA 2JL4A 2VL2C 3TCOA 1F2EA 3C71A 4ID0A 5JWQB 1F6MC 2IFQA 3TGZA 3RPPA 2C0FA 5IOXA 2YCDA 2C8UA 3HXSA 3GNJA 3FR6A 3TUEA 2BMXA 3FEUA 2X64A 5IMDA 1ZMAA 4MABA 3FKFA 3BJ5A 1UN2A 3K8NA 4OWYA 5ECNB 5ID2A 4JZQA 1TK8B 4HU9A 3LQ7A 3IAS2 3GX0A 4TOPA 1CQGA 2GDRA 2PUKC 1UVZA 1WIKA 4POBA 1EP8A 2VL2A 3I9V2 3L78A 4TVEA 4AJ7A 2YV9A 4K0NA 2GS3A 2N5AA 4JE1A 3KP9A 3ZRDA 4EXJA 3Q19A 1GSFA 1WMJA 3CMIA 4EVMA 3WYWA 3P7XA 4FO5A 2OKAA 4TXOB 1QMVA 4ECIA 5B7CA 1YKAA 2VUPA 4MJCA 5DBQA 1KEBA 3KIJA 1JZOA 2O8VB 1QXHA 3IK9A 2A4VA 3L4NA 1GRXA 1WJKA 1YF1A 1PX6A 2XHFA 4LLRA 2FGXA 1R5AA 1EV9A 3F0IA 4KW6A 3UARA 1EZKA 2VM2A 3G7IA 2KOKA 17GSA 3G7JA 5D73A 4MDCA 3RBTA 1FG4A 1PL2A 3H8QA 1XZOA 5GAPD 5B8BA 1K3YA 4MZWA 3KD0A 2L6DA 3TDGA 2BJXA 3VWXA 4PURA 2YN1A 2VCTA 1ZGNA 3F3RA 3VFIA 5KEJA 2GT5A 1FOVA 2PVOC 3UMAA 2J23A 2P31A 4WBRD 3AY8A 4GQCA 2DJJA 1WE0A 1BJXA 3DRNA 3FZ4A 1U88A 5J9CA 1XW9A 2H70A 3D5JA 1YEXA 2DJ3A 3HJOA 4ULXA 2IFQB 3D21A 5ECKB 5ELGA 2MZCA 4E8HA 2PN8A 2NTOA 3HVXA 2CVBA 3GH6A 4KCEA 2DMLA 5CYYA 1SL2B 3GURA 3EMXA 2LNSA 5CAXA 3C1RA 4MCUA 3RPNA 1DBYA 3IK7A 1O81A 3ZZXA 2ZCTA 1K0NA 1X5DA 4AGSA 5ID2B 2HSYA 2E7PA 1S3CA 4K7IA 3KMOA 2B6MA 3UBKA 2FA4A 2C4JA 4IP6A 2YNXA 4WXTA 1HD2A 1SL0B 1AQXA 1M2AA 1X9WB 4ZB8A 3CBUA 4E8EA 6GSWA 4MPFA 2IN3A 3KEBA 1PSQA 1ON4A 2OBIA 2R3XA 2P5QA 1F37A 2K9FA 2DSAA 1XWCA 2H30A 1KBNA 3ZLPA 4X43A 5F05A 2XC2A 5HFIA 1FAAA 3FK8A 3EC3A 1DE1A 2C0DA 4PXOA 3VWUA 2GQLA 2GQKA 1E6BA 4IBPA 1BYEA 4GF0A 5CP1A 4XS6A 1F9MA 1XFLA 3P90A 1X5EA 4EDYA 5JCGA 3GL5A 2IL3A 4MJBA 1ERWA 2VCZA 2JADA 5CRGA 1K0DA 5GAND 1B9YC 1EGOA 4NXIA 1UC7A 4O92A 1XWGA 6GSUA 1JLWA 2RM6A 2A2RA 4OO4A 2B3SA 4WF5A 1ZOFA 1GLQA 4J57E 3TJJA 3FRCA 1G6WA 2VIMA 3ME8A 1QGVA 4K9ZA 4HZ4A 4Q5RA 3N9JA 4N0VA 3GH9A 5ECHB 2YPMA 3LFLA 2VL9A 5ECPB 4RQRA 3L0HA 1M7TA 1RK4A 1GWCA 3FR9A 3D22A 2TRXA 3I43A 1O8WA 3CYNA 1JLVA 3DEXA 5AGYA 1U3AA 4ZBAA 4I97A 4MA9A 2GZPA 1MDIA 1T1VA 4PNGA 3S9FA 3GSSA 1C72A 4JEDA 2WB9A 1VRSD 4K0GA 1WOUA 3IDVA 4BVYA 2GLRA 4IELA 4ECCA 1GNEA 4IQAA 4K7OA 3F4SA 3F63A 1AUCA 4J2FA 1SK0A 4TR0A 4YAVA 1TJDA 1SKWB 1A24A 2IJYA 4QL7A 2FY6A 1TK0B 3NZNA 2F3MA 5CNWA 1X9MB 5J41A 3HCZA 3GSTA 1YY7A 1A8LA 3M8NA 2A2SA 4NWYA 1SD9A 4HI7A 2VD0A 2GQMA 1Z9HA 3O6TA 3J7Yk 1GSDA 2C3QA 1SJIA 2HLSA 1RQMA 1O7UA 19GSA 1PKZA 1YEPA 3ERWA 4V1Ag 5H5SA 4BPYA 4BWSA 2VLTA 2CZ2A 5LNKe 2NPBA 3TKPA 3Q18A 1Q4JA 2LKUA 2DMMA 4OMVA 3ERGA 5EPFA 3TRPA 3VI7A 4LL4B 1OAZA 2HFDA 1MEKA 3A2WA 4KUNA 1SJ6A 2X8GA 4ACSA 4KDUA 5COHA 1VF1A 3IOSA 3L9SA 1YJ6A 3GX8A 3ZMKA 3QCPA 4N11A 2FA8A 4WR4A 4POKA 2VCQA 3G9BA 4F0BA 4MH2A 5L71A 4ECJA 4CDOA 1B4QA 1AXDA 1DUGA 3A2VA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite