The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
NLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| publication title |
Crystal structure of the Abl-SH3 domain at pH3
rcsb |
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase ABL1
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| total genus |
11
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| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2013-03-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4RTX A; 3UA7 A; 2JT4 A; 2ED1 A; 1ABO A; 2YSQ A; 2A08 A; 4AG2 C; 1PNJ A; 3EG3 A; 1E7O A; 1GRI A; 1JEG A; 2O31 A; 4AFQ C; 2EKH A; 2NUZ A; 1M30 A; 2J6K A; 2RNA A; 2GQI A; 4E6R A; 2W0Z A; 1OEB A; 4F14 A; 1YNZ A; 2K79 A; 2KT1 A; 2GGR A; 4HCK A; 2DMO A; 2L3S A; 3VS2 A; 2DIL A; 3EHQ A; 4RTV A; 4ESR A; 1WFW A; 2PNI A; 1MV0 B; 1M3A A; 2J06 A; 3SHW A; 2KBT A; 2ENM A; 3M0Q A; 4CC3 A; 3RNJ A; 2KNB B; 2YUN A; 1WXU A; 4KRT A; 2YUO A; 1WXT A; 4OMN A; 2VWF A; 4AG1 C; 1BBZ A; 1YP5 A; 1ZUK A; 1NM7 A; 2DL8 A; 3VS7 A; 2LJ3 A; 1AWX A; 4CC7 A; 1GFD A; 1UJ0 A; 3THK A; 5IHI A; 4JJD A; 1QLY A; 1PKS A; 2KRO A; 1JQQ A; 2PZ1 A; 2KRN A; 3VS5 A; 1NYG A; 4Y92 A; 4DEX A; 1UGV A; 1WIE A; 2HEQ A; 2GBQ A; 5FW9 A; 1AZG B; 1M3C A; 2RQR A; 2V1R A; 1X2K A; 3EG0 A; 2LQW A; 2VVK A; 1ZUY A; 1FMK A; 1V1C A; 1X43 A; 2JS0 A; 2PTK A; 1H8K A; 1NYF A; 1A0N B; 4QT7 A; 2K9G A; 1VYU A; 3REB B; 2L2P A; 2FRY A; 4ZNX A; 3VRY A; 2CUB A; 2SEM A; 1Z9Q A; 4Z89 A; 1CKB A; 1S1N A; 2EBP A; 1GCQ C; 2D8H A; 1ABQ A; 2VKN A; 3I5S A; 3UAT A; 1JU5 C; 1PRL C; 4LN2 A; 2BZX A; 4WCI A; 4JZ3 A; 2D1X A; 2JMC A; 2DVJ A; 1W70 A; 2CH4 A; 1X27 A; 4OMP A; 1N5Z A; 2YUQ A; 2D0N A; 1NG2 A; 2DL4 A; 3I9Q A; 3VS6 A; 4DEY A; 2K2M A; 1KIK A; 1WDX A; 1UJY A; 1QWF A; 1UUE A; 2J7I A; 2JW4 A; 3EGU A; 2CUD A; 1FYN A; 2LQN A; 3PVL A; 3UF4 A; 4AFU C; 1WYX A; 2D8J A; 1T3L A; 1GBQ A; 1PHT A; 1ZLM A; 1U5S A; 2RQV A; 2DBK A; 2DJQ A; 2RF0 A; 1PWT A; 1SRL A; 2JMA A; 3TSZ A; 1CKA A; 1WLP B; 2EPD A; 1MV3 A; 1UHC A; 3JV3 A; 2KRS A; 3H0F A; 4RUG A; 3CQT A; 1J3T A; 4JJC A; 2KXD A; 1K4U S; 3IQL A; 2F2X A; 5IXF A; 2EGE A; 2CSI A; 4D8K A; 2SRC A; 1X6G A; 5FWC A; 2ECZ A; 1BK2 A; 1KJW A; 2CT3 A; 2IIM A; 4OMO A; 1PRM C; 4CC2 A; 1NLP C; 1HD3 A; 3KFV A; 1OOT A; 2CDT A; 3M0P A; 3NMZ C; 4RTW A; 1AWJ A; 1RLQ C; 3VS1 A; 2L3Q A; 2YDL A; 3VS3 A; 1AEY A; 2EYZ A; 2LZ6 B; 4RTT A; 1SPK A; 2K7A A; 5HCK A; 1W6X A; 2EW3 A; 1I1J A; 3R6N A; 2C0T A; 2FPE A; 1RI9 A; 1SSH A; 1T3S A; 2GNC A; 1X6B A; 1XOV A; 2C0O A; 2ED0 A; 1QKW A; 5IHN A; 1TG0 A; 2A37 A; 4LE9 A; 2DBM A; 1U3O A; 1UE9 A; 1HJD A; 1K76 A; 1GBR A; 4JJB A; 1HSQ A; 2ROL A; 3H41 A; 4R0K A; 3I35 A; 4OMQ A; 3EHR A; 2EGA A; 2AKL A; 1AZE A; 1YWP A; 1ZSG A; 1RUW A; 2DYB A; 2EYW A; 2MOX A; 2B86 A; 2BZ8 A; 4FSS A; 3U23 A; 1B07 A; 2JS2 A; 3NPF A; 2AK5 A; 2J6O A; 1GCQ A; 2XMF A; 2K6D A; 2KYM A; 2RQW A; 2KE9 A; 1AVZ C; 1T0J A; 1UG1 A; 2FRW A; 2I0N A; 2JM9 A; 1OPK A; 2O9V A; 5GJV B; 1K1Z A; 4OMM A; 2W10 A; 1Z9Z A; 4ORZ A; 3C0C A; 3M0R A; 1WX6 A; 5I22 A; 2GTJ A; 1SHF A; 1JXO A; 2KEA A; 2KGT A; 1SHG A; 2JM8 A; 3NHN A; 4HVW A; 2MCN A; 5IH2 A; 1WA7 A; 2M51 A; 3O5Z A; 5ECA A; 1T0H A; 3SEM A; 2DLP A; 2HSP A; 4J9F A; 4JPB W; 1TUD A; 4CC4 B; 1G83 A; 3ZL7 C; 1GL5 A; 2KXC A; 4J9D A; 3EG1 A; 1M3B A; 2O2O A; 4J9E A; 1W1F A; 3H0I A; 1JO8 A; 2RN8 A; 4F16 A; 2YUP A; 1UHF A; 1AOJ A; 2H8H A; 4X1V A; 2KYB A; 2E5K A; 1Y57 A; 1AWO A; 1RLP C; 1VYV A; 2P4R A; 4AFS C; 4HVU A; 1IO6 A; 1K9A A; 2EQI A; 2FEI A; 1NEG A; 4JZ4 A; 5L23 A; 3VS4 A; 1AD5 A; 4IIM A; 4F17 A; 3REA B; 3RBB B; 2BTT A; 2DE0 X; 1LCK A; 3LH5 A; 1YCS B; 2DL3 A; 2QDL A; 2ROT A; 4RTU A; 2RQT A; 2J6F A; 2CSQ A; 2LMJ A; 3NGP A; 4J9C A; 5FWB A; 5EC7 A; 1M27 C; 1WI7 A; 2HBW A; 2LP5 A; 4J9H A; 1I07 A; 2DRM A; 1K0X A; 1UFF A; 1YWO A; 2AZS A; 4GLM A; 2LJ1 A; 2RPN A; 2DL5 A; 4RTY A; 1MUZ A; 2JTE A; 1GFC A; 1YN8 A; 1E6H A; 2X3X D; 4LUD A; 4Z8A A; 2DL7 A; 4OML A; 1K0S A; 2O9S A; 2O88 A; 1M8M A; 2RQU A; 2FPF A; 2DNU A; 1H3H A; 3I5R A; 4HVV A; 1I0C A; 4D8D A; 2NWM A; 2LJ0 A; 4HXJ A; 3PE0 A; 2F2V A; 3M0U A; 4Z88 A; 1BB9 A; 4RTZ A; 1AWW A; 2YT6 A; 5IXB A; 1JXM A; 1VA7 A; 1PKT A; 1UEC A; 1G2B A; 4M4Z A; 2F2W A; 2C0I A; 1SEM A; 2GTO A; 2KRM A; 3FJ5 A; 3M0S A; 1OPL A; 1QWE A; 2CT4 A; 2K3B A; 1EFN A; 1Y0M A; 4LNP A; 1SRM A; 1NEB A; 1NLO C; 2LCS A; 3TSW A; 2G6F X; 1U06 A; 1UDL A; 1ZUU A; 2DF6 A; 2CH4 W; 2JXB A; 1KFZ A; 1E6G A; 2FPD A; 1UTI A; 3QWX X; 2CRE A; 2MIO A; 2A36 A; 1X2Q A; 2BZY A; 1KSW A; 3PVQ A; 2EGC A; 2RMO A; 4J9B A; 2FO0 A; 2EYY A; 5IHK A; 2X3W D; 1OV3 A; 3QWY A; 3VRZ A; 2OAW A; 5GJW B; 2J05 A; 1QCF A; 1X69 A; 2V1Q A; 3VS0 A; 2LX7 A; 2AZV A; 3A98 A; 2OI3 A; 3TVT A; 2M0Y A; 2DX1 A; 2KR3 A; 4J9G A; 2ABL A; 3M0T A; 2L3P A; 2DRK A; 2FG0 A; 1ZX6 A; 4LUE A; 2DM1 A; 2ESW A; 4A63 B; 4AFZ C; 2A28 A; 2EVR A; 1VYT A; 2LNH B; 3H0H A; 1CSK A; 1BU1 A; 2KT8 A; 1ZBJ A; 1TUC A; 2L0A A; 1WXB A; 1H92 A; 4GBQ A; 2AKK A; 2DA9 A; 4EIK A; 4IIO A; 3UA6 A; 5I11 A; 1QKX A; 2HCK A; 1B3Q A; 4K11 A; 1ARK A; 2EYX A; 3EG2 A; 2OJ2 A; 3ULR B; 2HDA A; 1GCP A; 4J9I A; 3GBQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4RTX A; 1FWZ A; 2MK5 A; 1IZ6 A; 4XQ3 A; 4M7A F; 2KSS A; 2A08 A; 4X9D A; 1YCY A; 1PNJ A; 2VGM A; 1E7O A; 1GRI A; 5LL6 S; 3OW2 S; 1W4S A; 2M9U A; 3Q1J A; 5GMK i; 1JEG A; 2KQW A; 1KHI A; 2VB6 A; 2RNA A; 2GQI A; 4F14 A; 2DIG A; 2P0K A; 2EYQ A; 3BW1 A; 3G71 T; 4C5H A; 2E3I A; 3M4G A; 2KT1 A; 4C92 G; 5GAN 5; 5DLQ E; 4EMH A; 2DIL A; 2EWN A; 2QTV A; 3QXE B; 4RTV A; 3CPF A; 4PFP A; 5GAM f; 2BUD A; 3MEU A; 1Y71 A; 5LJ5 f; 1D1C A; 3F70 A; 5GAN d; 4C8Q E; 1I81 A; 4KRT A; 2EQM A; 1YHQ Q; 1VQK Q; 4N0A C; 3CC2 A; 5AT1 B; 3THK A; 1RAB B; 4A4F A; 2G3R A; 1PKS A; 2PZ1 A; 2E41 A; 4J7F A; 4OB3 B; 4C0F A; 1UEB A; 2F5T X; 3CCV T; 3M56 A; 4EDU A; 4CRI A; 3CCQ Q; 5LJ3 f; 3A8M B; 2LQW A; 2B8A A; 3L2W A; 1W2B A; 1FMK A; 1X43 A; 3N5B B; 4O6J A; 1Y7X A; 2LCL A; 2MI6 A; 3SWN A; 1A0N B; 4QT7 A; 1VQ7 T; 2K3X A; 2L2P A; 3VRY A; 1JBM A; 1CKB A; 1S1N A; 3OYY A; 2M1H A; 1GCQ C; 2VKN A; 1U1S A; 5CKH A; 4J6X A; 3CC4 T; 3I5S A; 1PRL C; 1WNL A; 8AT1 B; 3QUI A; 4LN2 A; 3M53 A; 1NJI R; 3SFM A; 5KE3 A; 2JMC A; 2FB7 A; 2HQE A; 1X27 A; 1LOJ A; 2YUQ A; 1IGU A; 3I9Q A; 4DEY A; 1QVF A; 5L8R E; 1WHK A; 3GP8 A; 3MCA B; 3OYD A; 1G5V A; 1Q86 R; 5CKD A; 3OS2 A; 3CME Q; 1K73 U; 3QHS A; 3CCS A; 1T3L A; 1HXD A; 1NPR A; 3CMA Q; 4PJL A; 1CKA A; 1MV3 A; 4L5G A; 5HKC A; 2RJD A; 4RUG A; 1BKB A; 5GAN f; 1I5O B; 3IQL A; 3L1A A; 2E3H A; 4D8K A; 5FWC A; 4X34 A; 4ZGJ B; 1PRM C; 1OOT A; 1PD0 A; 3NMZ C; 4DBQ A; 3OYM A; 5IT9 E; 3PMT A; 1I8F A; 2FZG B; 2HAX A; 1IHV A; 3I56 T; 2DK3 A; 2F1L A; 3V8J A; 3CXC P; 2K7A A; 3FEO A; 2VXE A; 3MJX A; 1KQS P; 4M7A E; 1Q7Y R; 2JOY A; 1OQK A; 3EGD B; 4PKC C; 2DZC A; 2PUO B; 1XOV A; 4F7U A; 4P5N A; 4FT4 A; 2RK1 A; 3M54 A; 5IHN A; 1TG0 A; 1QQJ A; 3CCL T; 1IRE B; 5GAM h; 2KY9 A; 5C6S A; 3FIF A; 3JB9 D; 5LJ5 h; 2DTI A; 4JJB A; 2ROL A; 4JS4 A; 4R0K A; 2H3E B; 2ZPG B; 1X75 C; 2CP6 A; 4A53 A; 2MOX A; 2X9H A; 4BUG A; 1B07 A; 4JS5 A; 3OBW A; 4IUP A; 5D7U A; 2KYM A; 3TRE A; 2P4T A; 3P8H A; 1VQN T; 4B9W A; 1WGS A; 3S3N A; 2JM9 A; 1OPK A; 4C0G A; 1UGQ B; 2DER A; 3DLL A; 2FYK A; 2CGH A; 1XTD A; 4QKU A; 2CP5 A; 1VIE A; 1VQ6 T; 5LJ3 h; 2GTJ A; 2LQK A; 1KK7 A; 2HL3 A; 2K5L A; 4PJJ A; 4XTZ A; 3UPU A; 3NHN A; 4HVW A; 2QEX A; 4PJO D; 2MCN A; 2MYS A; 2R5M A; 4J9F A; 1YIT T; 1VQ9 A; 4J9E A; 1W1F A; 3H0I A; 3S6W A; 1MGQ A; 5GAN 2; 2HD0 A; 4F16 A; 1MNE A; 2E5K A; 3HRS A; 1AWO A; 1RLP C; 4N4G A; 3G4S T; 1OYX A; 1VQM A; 1K9M C; 4AFS C; 4HVU A; 1K9A A; 1IB8 A; 2EQI A; 4M78 D; 3I55 A; 2FEI A; 3CCJ A; 4JZ4 A; 4OGE A; 3REA B; 2BTT A; 1FMV A; 1LCK A; 3LH5 A; 3OYI A; 6AT1 B; 1YCS B; 2CP3 A; 1VQ8 A; 1KC8 U; 3QJY A; 4PJM A; 2LMJ A; 2CSQ A; 4ZGD B; 4J9C A; 2YRD A; 1M27 C; 4M78 F; 1WI7 A; 5FU6 C; 5GAN h; 3QPH A; 1EX4 A; 3OW2 A; 1Y96 A; 1KQ2 A; 1IRX A; 3V7R A; 4N0A A; 4M7D D; 2AZS A; 2LJ1 A; 1YJN A; 4IUT A; 2JTE A; 3OBY A; 3OS1 A; 3CCE T; 5KYW A; 4Z8A A; 3G71 A; 1K0S A; 1V29 B; 2PQW A; 3RUX A; 4BB7 A; 5FU7 B; 4PJO B; 3EGX A; 2O4X B; 1Q82 C; 4JLG A; 3S3M A; 1RL2 A; 3FDR A; 1XNI A; 2NWM A; 2LJ0 A; 5CR2 A; 2F2V A; 4M75 A; 3MEA A; 1VQ5 T; 1AWW A; 3PMI A; 5IXB A; 2ZPE B; 1JXM A; 1VA7 A; 4FCY A; 4M4Z A; 4C92 D; 4AMC A; 3M0S A; 1OPL A; 1QWE A; 2DXT A; 4PLI A; 5D6X A; 1NLO C; 3JCM X; 2RI5 A; 5D6Y A; 2DF6 A; 2CH4 W; 1E6G A; 3GOX A; 2LRQ A; 3QWX X; 1ZHI A; 3BY7 A; 3EH2 A; 3EFO A; 2RHU A; 4A4K A; 1S72 Q; 2RMO A; 2FO0 A; 3EH1 A; 2EYY A; 1VQ7 A; 4C92 F; 4XU3 A; 4OB1 B; 5GJW B; 1QCF A; 1D09 B; 2DX1 A; 2KR3 A; 3CC4 A; 1UGS B; 5HK3 A; 1Q81 R; 4L6V 5; 4A54 A; 3CCM Q; 2HSE B; 1TS9 A; 2E64 A; 4IUV A; 2AT1 B; 2DRK A; 4WTO B; 4M7D B; 2I2L A; 3MPU B; 2ESW A; 4A63 B; 4LDV A; 5GAN 3; 3CCU A; 1R0B G; 3SWN C; 1G3S A; 4EMK B; 1BU1 A; 5CVI A; 1OU8 A; 1KD1 U; 4Y28 E; 2O01 E; 1H92 A; 2JZ2 A; 4HA8 A; 3MET A; 3M59 A; 3MEW A; 4PJO E; 2ZPF B; 2VUB A; 4ZTF A; 1VQM Q; 4KUD K; 5AYF A; 1RAF B; 2ED1 A; 5KCH A; 2YSQ A; 1BI2 A; 4ELY C; 3X26 B; 3MP8 A; 1W2B P; 3O8V A; 2NUT A; 4AFQ C; 2EKH A; 2NUZ A; 2J6K A; 1YHQ A; 1VQ8 Q; 2RO0 A; 4E47 A; 3I56 A; 1QCO A; 1VQK A; 1D0X A; 1YJW T; 4C5I A; 4M78 E; 5FLX E; 3ZFJ A; 5GAO r; 3OYK A; 2E5Q A; 3HRU A; 4RMO A; 3M58 A; 5GAM g; 1WJR A; 2F5K A; 4E7H A; 1WFW A; 1SSF A; 2AIR B; 3VYG A; 5LJ5 g; 1VQL T; 3CBP A; 3SHW A; 2ENM A; 3C95 A; 2KNB B; 4MZT A; 1WXU A; 2CP0 A; 1D3B A; 2CP2 A; 3G71 Q; 1K8A R; 1QVF P; 4OMN A; 3A5Z B; 4AG1 C; 1BBZ A; 3HRT A; 1NM7 A; 3VS7 A; 4CC7 A; 1UJ0 A; 2EIF A; 1PC0 A; 2EKO A; 3E9G A; 2OTJ T; 1TUG B; 2FZC B; 1JQQ A; 2KRN A; 3SD4 A; 3VS5 A; 2BE7 D; 4C8Q A; 1NYG A; 4QQ6 A; 1N9S A; 4Y92 A; 4M7D E; 1WHG A; 2XG8 D; 1UGV A; 7AT1 B; 1WIE A; 2VGN A; 4XTY A; 2GCX A; 3DLM A; 5GAO n; 3JCM b; 1RAC B; 2XK0 A; 3JB9 H; 1M3C A; 4BI4 A; 2RQR A; 2V1R A; 3EG0 A; 5LJ3 g; 1HYO A; 5C0M A; 5GAM j; 1ZUY A; 5LJ5 j; 1RAA B; 1ZQ1 A; 1VYU A; 1VQ6 A; 3CCV Q; 4ZNX A; 2CUB A; 1Z9Q A; 2EBP A; 2WSE E; 1NJI C; 2D8H A; 2QGF B; 3UAT A; 4M77 A; 3CME A; 2BZX A; 3OYN A; 3LX7 A; 4J6W A; 4BAC A; 3JCM J; 4M75 G; 3MHX A; 3QDR B; 3UDC A; 3PNW C; 4C92 E; 3LGF A; 1N8R R; 3CBM A; 3VUB A; 3A1P A; 5LJ3 j; 2QG9 B; 1Q86 C; 1UUE A; 2J7I A; 3CC4 Q; 1QP3 A; 4LDW A; 2DO3 A; 2JW4 A; 3PVL A; 3UF4 A; 1JJ2 S; 2EQK A; 4FYV B; 3R6O A; 2QQS A; 4ME7 A; 2FHD A; 2DBK A; 2P0P A; 2DJQ A; 3QYG B; 3PFS A; 5DLO A; 1TXQ A; 1SRL A; 1WHL A; 2JMA A; 4KH0 B; 3BDU A; 1WLP B; 3RIR A; 2XHC A; 2X51 A; 3JV3 A; 2KRS A; 4E2F B; 1FX7 A; 4KUI A; 4JJC A; 3EAE A; 2E70 A; 2LC4 A; 5GAN g; 1VQ4 T; 2F2X A; 5IXF A; 1WHJ A; 4IUQ A; 4KGV B; 2ECZ A; 1KJW A; 2IIM A; 4OMO A; 5GMK h; 4MZM A; 1KG1 A; 3CC7 T; 3P8B B; 4PJN A; 3WXM B; 4E7Z A; 4RTT A; 5GAM e; 1PSE A; 1Q7Y C; 2E4H A; 5LJ5 e; 3H9N A; 1WHH A; 5J39 A; 1LNX A; 2EW3 A; 3CCE A; 1MMN A; 2DEQ A; 5CIU A; 2C0T A; 1T3S A; 2GNC A; 5CKE A; 5HK0 A; 5DY9 A; 1X6B A; 2GF7 A; 2L89 A; 2COZ A; 3G7Z A; 1NE8 A; 2C0O A; 2ED0 A; 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