The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
b'NLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVN'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the Abl-SH3 domain at pH3
rcsb |
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase ABL1
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Transferase
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| total genus |
11
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2013-03-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1UUE A; 3QWY A; 2KT1 A; 1BBZ A; 2VWF A; 2LZ6 B; 2CSI A; 2J6O A; 2EYX A; 3PVQ A; 1GBQ A; 3SHW A; 1RI9 A; 1M27 C; 1WXB A; 1UE9 A; 2DMO A; 2E5K A; 1GL5 A; 2QDL A; 2DM1 A; 5GJW B; 4HVW A; 1ABO A; 2RQR A; 2JMC A; 2ROL A; 1B3Q A; 1M3A A; 4F17 A; 4F14 A; 2P4R A; 4CC2 A; 1VYU A; 1AWJ A; 1UG1 A; 1BU1 A; 3UF4 A; 1WLP B; 2GTJ A; 4RTT A; 4AFZ C; 2DNU A; 2DRK A; 1X2Q A; 1KJW A; 2K6D A; 2EPD A; 2DRM A; 2KRS A; 5FWB A; 1VYT A; 1MV0 B; 2DL4 A; 2J6K A; 2ECZ A; 1I1J A; 4Z89 A; 4AFS C; 1NLO C; 5L23 A; 2A08 A; 1MV3 A; 4DEY A; 2LMJ A; 2O9S A; 3VS0 A; 1Y0M A; 3EGU A; 1PKT A; 1QWE A; 3EG0 A; 1AD5 A; 5HCK A; 2AKK A; 3IQL A; 4EIK A; 4AG2 C; 2EBP A; 1HJD A; 2DL8 A; 3A98 A; 1WIE A; 3EHQ A; 4JJD A; 1AWO A; 1GCP A; 2ED1 A; 2GTO A; 1QKX A; 4RTZ A; 2LJ1 A; 5IXF A; 4ZNX A; 1AEY A; 1AOJ A; 1CKA A; 2K7A A; 3ULR B; 2EYY A; 2A36 A; 2AK5 A; 2EYZ A; 3I35 A; 1I0C A; 1K4U S; 4J9F A; 5IHI A; 4Z8A A; 1JU5 C; 3VS7 A; 2YT6 A; 4LNP A; 1UFF A; 2DF6 A; 2OI3 A; 2D1X A; 3QWX X; 2JMA A; 1GRI A; 1ZUK A; 1M30 A; 1M3C A; 2FRY A; 4Z88 A; 1SRM A; 1K9A A; 1PKS A; 1QKW A; 1PRL C; 2H8H A; 1UHC A; 4F16 A; 2VVK A; 1HD3 A; 3KFV A; 3M0T A; 1T0J A; 1KIK A; 3H41 A; 1OPK A; 2PZ1 A; 3VS2 A; 4IIO A; 2AKL A; 1KSW A; 1X2K A; 5FWC A; 1JXM A; 1UHF A; 1X43 A; 3I9Q A; 2F2V A; 2LJ0 A; 3CQT A; 4FSS A; 1FYN A; 3NHN A; 2KYB A; 1UDL A; 4OMO A; 2C0T A; 1UTI A; 1E6H A; 1E7O A; 2O9V A; 1TUC A; 4AFQ C; 3UA7 A; 2DJQ A; 1WDX A; 2FO0 A; 4HVU A; 2DL5 A; 4Y92 A; 5FW9 A; 4HVV A; 3U23 A; 1U3O A; 4LE9 A; 4R0K A; 1AWX A; 2RQT A; 3REB B; 1X27 A; 5EC7 A; 2HBW A; 1CSK A; 2IIM A; 2O2O A; 2J05 A; 2EYW A; 4LUD A; 2LP5 A; 3PE0 A; 1SPK A; 2FPD A; 4JZ3 A; 1WI7 A; 2MIO A; 1J3T A; 2RMO A; 3EG1 A; 4OMN A; 2VKN A; 2J7I A; 2EGE A; 2MCN A; 1BB9 A; 2F2X A; 2FPE A; 3LH5 A; 2CT3 A; 2FG0 A; 3TSZ A; 4HCK A; 3VRZ A; 2L3Q A; 2ESW A; 3C0C A; 1U06 A; 2DL3 A; 2DLP A; 1VYV A; 2LCS A; 2JXB A; 2NWM A; 3EG3 A; 3THK A; 1PHT A; 1XOV A; 2RF0 A; 3M0R A; 1NLP C; 1TG0 A; 1RLQ C; 2JM9 A; 2BZY A; 3JV3 A; 3GBQ A; 4M4Z A; 4RUG A; 3VS3 A; 1Z9Q A; 2K9G A; 3EHR A; 2XMF A; 2EKH A; 1BK2 A; 2LQN A; 1RUW A; 1W6X A; 1B07 A; 2KT8 A; 3M0U A; 1JXO A; 3ZL7 C; 3M0Q A; 1OEB A; 1A0N B; 4OML A; 2AZV A; 2ROT A; 2KEA A; 2JS0 A; 2M51 A; 2D0N A; 4LUE A; 5IHN A; 1YNZ A; 3H0F A; 2M0Y A; 3VS1 A; 2W0Z A; 2GBQ A; 1PRM C; 1T3L A; 4LN2 A; 4RTU A; 1W1F A; 1S1N A; 3I5S A; 4GLM A; 2CH4 W; 2EW3 A; 3VS4 A; 1GCQ A; 2ABL A; 4D8D A; 4J9G A; 1PWT A; 4KRT A; 1QLY A; 1TUD A; 3M0S A; 4RTW A; 2KXC A; 5IXB A; 2JTE A; 2KRO A; 2DE0 X; 2J06 A; 1GBR A; 2A28 A; 1T0H A; 2JS2 A; 3UA6 A; 1QCF A; 2ED0 A; 1EFN A; 2SRC A; 2EGC A; 2I0N A; 1X6B A; 1NEB A; 2KR3 A; 4JPB W; 4CC4 B; 1H92 A; 4QT7 A; 1I07 A; 2D8H A; 1U5S A; 1V1C A; 5I11 A; 1M8M A; 4J9D A; 2V1R A; 2PNI A; 2CUD A; 2KRN A; 1H8K A; 3SEM A; 2HEQ A; 1ZBJ A; 1K1Z A; 1N5Z A; 3PVL A; 2CSQ A; 2EVR A; 2C0O A; 2CDT A; 1RLP C; 4K11 A; 3REA B; 1X6G A; 2G6F X; 2YUO A; 1WX6 A; 1UGV A; 4OMQ A; 1IO6 A; 3UAT A; 1MUZ A; 2HCK A; 2EQI A; 2C0I A; 2LNH B; 1ABQ A; 1YWP A; 4OMP A; 2ENM A; 1CKB A; 4A63 B; 2YUN A; 2KYM A; 2RQV A; 1GFD A; 1M3B A; 2K79 A; 1ZUU A; 2D8J A; 1NG2 A; 3H0H A; 4J9I A; 4DEX A; 4D8K A; 2GQI A; 1WXU A; 2DBM A; 2JT4 A; 1JEG A; 1UEC A; 1H3H A; 3H0I A; 1G2B A; 1OOT A; 1W70 A; 1PNJ A; 2RN8 A; 3RNJ A; 1UJ0 A; 3VRY A; 2RPN A; 4JJC A; 1AZG B; 2CUB A; 2KGT A; 1WXT A; 1SHF A; 1WFW A; 3O5Z A; 1ZUY A; 2LJ3 A; 1YP5 A; 2KNB B; 1ZLM A; 4JZ4 A; 2NUZ A; 2L3S A; 1ARK A; 2KXD A; 2BZ8 A; 2X3X D; 3TVT A; 1KFZ A; 1OV3 A; 2DL7 A; 1AVZ C; 1YN8 A; 2CT4 A; 4GBQ A; 2HDA A; 4IIM A; 1K0S A; 1NM7 A; 2RQU A; 1Y57 A; 5I22 A; 2OAW A; 4J9E A; 3EG2 A; 4ORZ A; 3FJ5 A; 2FEI A; 2J6F A; 4WCI A; 2DYB A; 2DBK A; 2B86 A; 1X69 A; 1OPL A; 2V1Q A; 3R6N A; 2JM8 A; 2YUP A; 2CRE A; 4AFU C; 3M0P A; 2FPF A; 2PTK A; 2L0A A; 4RTX A; 2KE9 A; 1ZSG A; 2YDL A; 1QWF A; 2O88 A; 2LX7 A; 2K3B A; 2JW4 A; 2KBT A; 2YSQ A; 4ESR A; 3NMZ C; 2SEM A; 1LCK A; 4OMM A; 2CH4 A; 2X3W D; 2MOX A; 2AZS A; 4RTV A; 1NYF A; 2F2W A; 2DA9 A; 4CC7 A; 2DIL A; 1E6G A; 4J9H A; 1UJY A; 5ECA A; 1VA7 A; 3NGP A; 1FMK A; 1NYG A; 4JJB A; 2FRW A; 1JQQ A; 2GNC A; 2K2M A; 4AG1 C; 2DX1 A; 1WYX A; 2RNA A; 1SHG A; 2GGR A; 4X1V A; 5GJV B; 4HXJ A; 1GFC A; 2RQW A; 1YWO A; 1AZE A; 2BZX A; 1AWW A; 2L2P A; 1YCS B; 3VS5 A; 3TSW A; 4J9B A; 1K0X A; 1JO8 A; 4RTY A; 3RBB B; 2BTT A; 1Z9Z A; 1T3S A; 1G83 A; 2HSP A; 2A37 A; 2O31 A; 4CC3 A; 3I5R A; 2LQW A; 1K76 A; 1SSH A; 1GCQ C; 1SRL A; 2KRM A; 2YUQ A; 1ZX6 A; 1SEM A; 1NEG A; 4E6R A; 2W10 A; 4J9C A; 2OJ2 A; 5IHK A; 1HSQ A; 2EGA A; 3VS6 A; 2DVJ A; 2L3P A; 1WA7 A; 5IH2 A; 3NPF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3M58 A; 4EPC A; 1WPY A; 3OYC A; 3EFO B; 2LNV A; 4DBF A; 1AT1 B; 3CPF A; 1OQK A; 2VWF A; 3QJY A; 2CSI A; 1BI3 A; 3MEV A; 2J6O A; 3M4G A; 2EYX A; 3PVQ A; 2RHZ A; 2X4W A; 3HPW A; 4IUT A; 5A0G A; 3CD6 T; 2K2V A; 2HMA A; 2RB6 A; 2RHX A; 1UE9 A; 4C92 B; 9ATC B; 1GL5 A; 5CR2 A; 5GJW B; 4OGC A; 4DQ2 A; 4F14 A; 1N8R U; 2ZZD A; 1KD1 C; 2VXE A; 1K8A U; 4PJO D; 1WHG A; 3A1P A; 1OU9 A; 4QQD A; 1QVF S; 1WZO A; 3UF4 A; 1NZ9 A; 1LPL A; 4KH1 B; 4AFZ C; 2QA4 T; 1OX8 A; 3OYE A; 1QCN A; 5CIU A; 5FWB A; 2R5M A; 1RL2 A; 3RKW A; 2HSE B; 4BE0 A; 3JCM W; 3QJ6 A; 2HZY A; 5HK3 A; 4M7D G; 1R0C B; 1VQ9 Q; 5L23 A; 2LMJ A; 2O9S A; 3VS0 A; 2K5L A; 4PKC C; 3OYD A; 1KQS A; 3VYG A; 3UPU A; 1VQK T; 4A4G A; 5HCK A; 4KUD K; 4F7U G; 2CZ0 B; 4L5G A; 2EBP A; 3A98 A; 1GXI E; 3CCM A; 4JJD A; 4XU3 A; 3EG9 B; 2O01 E; 1GCP A; 2LJ1 A; 4FW2 A; 1CKA A; 3LLR A; 2M0O A; 2Y4Y A; 5LJ3 d; 3HRS A; 4J6Y A; 4DBR A; 1D0Y A; 3CCE A; 1K4U S; 3M53 A; 2CP3 A; 5CKH A; 3MPU B; 4BY6 C; 2DJZ A; 3CC7 T; 3V7C A; 3VS7 A; 3EGX B; 2YT6 A; 2PVD B; 3CCV A; 3A8H B; 1RAA B; 1VQM A; 2D1X A; 1M3C A; 4M78 B; 2FRY A; 1WHH A; 3CCL T; 2YLC A; 1K9A A; 1QKW A; 1UHC A; 2HQH A; 1QCO A; 2M02 A; 3H41 A; 3JCM b; 4LDW A; 1IHV A; 4IIO A; 3L42 A; 1KSW A; 1X2K A; 2XIC A; 5D6X A; 1X43 A; 4HCB A; 2F2V A; 4FSS A; 3CCQ A; 2P0P A; 4AFQ C; 3UA7 A; 5LJ5 j; 5LL6 S; 2YRC A; 5DLO A; 2DJQ A; 3NTK A; 4Y92 A; 4HVV A; 1QVG P; 3OBY A; 1RAG B; 2MF2 A; 4LE9 A; 2RQT A; 2HBW A; 3L2U A; 4FT4 A; 2O2O A; 2J05 A; 2EYW A; 2ATC B; 2LP5 A; 1M2V A; 1SPK A; 2FPD A; 4JZ3 A; 4KGV B; 4R55 A; 3DLL A; 2RMO A; 2JNG A; 1U8R A; 2VKN A; 1ACM B; 1RAI B; 4C5G A; 1BB9 A; 2F2X A; 4OMF B; 3PMT A; 3LH5 A; 2FG0 A; 2L8D A; 2KVQ G; 4HCK A; 4X9C A; 2ESW A; 2P0Q A; 4M7D F; 1U06 A; 2DLP A; 1VYV A; 4WF2 A; 2LCS A; 2NWM A; 3JCM f; 1HK9 A; 1JB0 E; 1QP2 A; 1TG0 A; 3HTR A; 2JM9 A; 4M7A D; 2BZY A; 3GBQ A; 1UB4 A; 4XTZ A; 1Z9Q A; 3HFO A; 4C5E A; 2K9G A; 2X4J A; 1C0M A; 5GAM h; 2EKH A; 1BK2 A; 1VQ6 A; 2LQN A; 1JBM A; 1VQ4 T; 4MDX A; 1D1B A; 3M0Q A; 4OML A; 2AZV A; 2ROT A; 2M51 A; 2DTH A; 1BI2 A; 3H0F A; 2CZ6 B; 2W0Z A; 4C8Q A; 1M8V A; 3UT1 A; 1S1N A; 3TEE A; 2EW3 A; 1QQJ A; 4BI4 A; 2LVM A; 1VQ7 T; 2ABL A; 3CCJ T; 2EQJ A; 4PJM A; 4F04 B; 2Y4X A; 4ZGE B; 3M0S A; 4RTW A; 2KXC A; 2KRO A; 5GAN g; 1PSF A; 2A28 A; 1SF9 A; 5C6S A; 1OYX A; 2E4H A; 5LJ5 f; 3UA6 A; 2ED0 A; 4D6W A; 1IB8 A; 4VUB A; 1NEB A; 3F70 A; 4FYV B; 1YJW A; 4QT7 A; 1WJQ A; 4MZT A; 2VC8 A; 3SD4 A; 2O4X B; 1V1C A; 4XTU A; 2FZC B; 2VB6 A; 2E12 A; 3MO8 A; 3G4S T; 1MMN A; 3CC4 Q; 4C8Q C; 3MP1 A; 2D0Q B; 2CSQ A; 3S3O A; 2JTM A; 1W2B A; 4DOV A; 2YUO A; 3QHS A; 1NJI R; 2C0I A; 2LNH B; 4J6W A; 1ABQ A; 1WJR A; 3OYN A; 2ENM A; 1OU8 A; 4J7I A; 4A63 B; 1Q86 R; 3OA6 A; 2KYM A; 2RQV A; 3UDC A; 2D8J A; 3P8D A; 4J9I A; 5LJ3 g; 4D8K A; 3OYG A; 2RK2 A; 2GQI A; 1ZSZ B; 2JT4 A; 2K3Y A; 1UGS B; 1UEC A; 3FRN A; 2EQU A; 1G2B A; 4FL6 A; 3G6E T; 1PCX A; 4XU0 A; 4BUG A; 1UJ0 A; 3UWN A; 5GAO l; 1YI2 A; 1LOJ A; 2X35 A; 1MGQ A; 1ZUY A; 4XAX B; 5D7U A; 3OQ5 A; 4JZ4 A; 2NUZ A; 3BW1 A; 1SG5 A; 2X3X D; 1YHQ T; 3TVT A; 1KFZ A; 4E2F B; 2OTL Q; 2K4Y A; 3QPH A; 1YN8 A; 4M75 G; 4GBQ A; 4PJO F; 1TH7 A; 2WSE E; 3QSU A; 3I55 A; 1TXQ A; 2CYZ B; 4N0A A; 2M16 A; 3M59 A; 3L2V A; 4R56 A; 1VQO A; 3QDR B; 2OAW A; 3EG2 A; 1N9R A; 4ORZ A; 1RI0 A; 4WCI A; 3V7R A; 1VIF A; 3VU3 C; 3WVD B; 8ATC B; 2V1Q A; 2YUP A; 2CRE A; 1NPP A; 5CK9 A; 1LJO A; 2F1L A; 4XTX A; 5GAM e; 4F7U B; 2PTK A; 1OI1 A; 2BUD A; 4PJO C; 2F5T X; 1VQP T; 2L0A A; 4RTX A; 3I56 A; 1KQ2 A; 5GMK l; 2YRV A; 5KYX B; 2JW4 A; 2KBT A; 4KUL A; 2YSQ A; 3NMZ C; 2QI2 A; 2FB7 A; 3OW2 S; 1NBE B; 4E7J A; 4PJL A; 2PQW A; 2LRQ A; 3AHU A; 4PK4 A; 4EMK B; 1M90 R; 2F2W A; 3CD6 Q; 3GLX A; 4RG8 A; 1VA7 A; 4ZGJ B; 1FMK A; 4JJB A; 1SSF A; 1JQQ A; 2E65 A; 1YJN A; 2DD4 A; 2K2M A; 4AG1 C; 3EGD A; 1WYX A; 2RK1 A; 1I81 A; 2KAF A; 2COW A; 2X51 A; 2GGR A; 4X1V A; 1AHJ B; 2QQR A; 3X28 B; 2BZX A; 2QA4 Q; 1VQ8 T; 2YXY A; 1NJI C; 2DIQ A; 4PL6 A; 1VQN T; 3CCR T; 3GIB A; 2BTT A; 1Z9Z A; 1Q86 C; 4ELY C; 4PJO E; 2O31 A; 3I5R A; 4OGE A; 4A54 A; 2QEX A; 1SSH A; 4KH0 B; 1YIT A; 1M9S A; 3EFO A; 4FSX A; 2JJ9 A; 2W10 A; 5DLQ E; 1VQK Q; 4JUV A; 2DFU A; 5IHK A; 4JRK A; 5IH2 A; 2D6F A; 4LDV A; 2XDB A; 3KUF A; 2GFA A; 1UUE A; 3JCM d; 5GAN 5; 4C92 A; 1ZQ1 A; 4JS5 A; 2RI3 A; 2GFU A; 4HKE A; 3OYA A; 4MDW A; 3SDZ A; 3JAM E; 2LZ6 B; 4JS4 A; 3NTI A; 1GBQ A; 3CMA T; 1M27 C; 3CC7 Q; 2QDL A; 2DM1 A; 4BD3 A; 2ZPI B; 4HVW A; 4LD6 A; 1ABO A; 2RQR A; 2JMC A; 1M3A A; 1Q82 R; 2P4R A; 4QQG A; 1XJW B; 1RAE B; 2NUP B; 3CCL Q; 3M5A A; 3L2R A; 3OSV A; 5D6Y A; 3FJP A; 5AYF A; 1MV0 B; 2WAC A; 3VV0 A; 5IT9 E; 1K73 R; 1QVG A; 1IRE B; 4AFS C; 3CCU T; 1MV3 A; 4DEY A; 2CP5 A; 1TOV A; 2EWN A; 1BIA A; 2QDY B; 3EG9 A; 4B6M A; 1M90 C; 4JRQ A; 1QWE A; 3EG0 A; 5LJ5 d; 4M7A F; 2KMT A; 2QQB A; 2AKK A; 3CPW S; 3JCM J; 1QVF P; 2QTX A; 4AG2 C; 1HJD A; 2DL8 A; 4O6J A; 1ZBX A; 3EHQ A; 4FYY B; 5GAO r; 3WXM B; 3QII A; 2V26 A; 5IXF A; 5M9O A; 4FYW B; 1AEY A; 4C8Q D; 2VGM A; 3EGX A; 3VUB A; 4M77 A; 3MCA B; 3ULR B; 2LCL A; 5KE3 A; 1Y96 A; 2EYY A; 2EYZ A; 2QQS A; 3V8K A; 4M7A C; 4M78 A; 2MWO A; 4OB3 B; 2X4X A; 4B9W A; 3E1S A; 4Z8A A; 1YIJ T; 1IHW A; 2JMA A; 1GRI A; 1I5O B; 5FU7 B; 2A0F B; 4PFP A; 1SRM A; 2FL7 A; 2KQW A; 3JB9 D; 2EYQ A; 1PRL C; 3G1J A; 4BI8 B; 1M4Z A; 1VQ9 A; 3M0T A; 1T0J A; 2LX9 A; 4OB1 B; 1KIK A; 1OPK A; 2ZAE A; 2PZ1 A; 3VS2 A; 4EMH A; 2AKL A; 3LW5 E; 1DJ7 B; 4J7F A; 3JB9 J; 1KHI A; 2LJ0 A; 3BDU A; 1TSF A; 4II1 A; 1VQ4 Q; 1FYN A; 2KYB A; 1UDL A; 4OMO A; 2M1H A; 2C0T A; 4IUV A; 2O9V A; 2RHI A; 1WDX A; 4M7A E; 2FO0 A; 1Q82 C; 4O5V A; 4ZN1 A; 2EAY A; 1PSE A; 2XID A; 1Q7Y R; 2Z0W A; 5CQX A; 3OS1 A; 2ZGW A; 1OZ3 A; 1VQ7 Q; 4GLK A; 2IIM A; 3CCJ Q; 5GAN h; 4LUD A; 2OTJ T; 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