The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
|
sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
NLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the Abl-SH3 domain at pH3
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Transferase
|
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase ABL1
|
| total genus |
11
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2013-03-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3ZL7 C; 2KT1 A; 2FPF A; 2B86 A; 2G6F X; 4JJB A; 4ZNX A; 2HBW A; 1RLQ C; 1WXB A; 1A0N B; 2LQW A; 2O9V A; 1NYF A; 1K76 A; 2F2W A; 1K0X A; 2RQT A; 2BTT A; 4E6R A; 1ARK A; 1WDX A; 2KGT A; 1GBR A; 2M0Y A; 2CT4 A; 1YN8 A; 2AZS A; 2J7I A; 2LZ6 B; 3C0C A; 1I1J A; 2V1R A; 4RUG A; 2K7A A; 2A28 A; 4OML A; 2LJ0 A; 1M27 C; 2YDL A; 2PTK A; 3H0F A; 4LUE A; 2GBQ A; 1ZX6 A; 2H8H A; 4RTV A; 2O2O A; 1AWO A; 2CH4 W; 2YUP A; 4DEY A; 2HDA A; 2RPN A; 1PRM C; 2DL3 A; 1NLO C; 2YT6 A; 1NLP C; 1UE9 A; 4X1V A; 1NEB A; 2DL8 A; 3EGU A; 1UJY A; 4AFZ C; 4J9C A; 4CC4 B; 2LJ3 A; 4JJC A; 3A98 A; 2JM9 A; 4A63 B; 2C0I A; 2FG0 A; 1V1C A; 4KRT A; 2L0A A; 3VS5 A; 1LCK A; 3FJ5 A; 2J06 A; 2O9S A; 4AG2 C; 5IXF A; 5EC7 A; 1CSK A; 1GL5 A; 2YUN A; 2LMJ A; 1X2Q A; 2D8J A; 3M0U A; 1AD5 A; 2EGE A; 3NHN A; 3EHQ A; 3EG2 A; 1Y57 A; 3UF4 A; 1GRI A; 1E6H A; 4D8D A; 2DMO A; 2HCK A; 1M3A A; 1TUD A; 1KJW A; 4HCK A; 4WCI A; 1PRL C; 4EIK A; 1HSQ A; 1M30 A; 1I07 A; 2KNB B; 1WYX A; 2A36 A; 1T0J A; 1WX6 A; 1WXT A; 2CUB A; 1B3Q A; 1KSW A; 2FPD A; 1BB9 A; 5GJV B; 2KXC A; 2W10 A; 2KT8 A; 1NG2 A; 2K2M A; 1ZLM A; 2M51 A; 1OOT A; 5IHN A; 4HVU A; 2DRK A; 2LQN A; 1UTI A; 3IQL A; 4JJD A; 2F2X A; 4K11 A; 1QWF A; 1WXU A; 2VWF A; 3U23 A; 5FWB A; 2AZV A; 1UG1 A; 4GLM A; 2K9G A; 2VKN A; 2MOX A; 1AWJ A; 4J9E A; 2CT3 A; 1W70 A; 2E5K A; 3THK A; 4GBQ A; 5L23 A; 2KRM A; 1TG0 A; 2OJ2 A; 1S1N A; 4HVW A; 2PZ1 A; 1QKW A; 1JQQ A; 1G83 A; 3VS1 A; 2DM1 A; 4RTW A; 3VS2 A; 4J9I A; 4J9F A; 2SRC A; 1W1F A; 1RUW A; 1SEM A; 3VS0 A; 2DX1 A; 1NEG A; 3R6N A; 1RLP C; 3M0T A; 1AOJ A; 1EFN A; 2EGA A; 2RNA A; 2EKH A; 3VRY A; 2CRE A; 2L3Q A; 4OMP A; 2DLP A; 1ABO A; 4QT7 A; 3UA7 A; 4Z88 A; 1G2B A; 3TVT A; 1SHF A; 3QWY A; 3NGP A; 1VYV A; 4OMQ A; 1MV0 B; 4FSS A; 1YCS B; 2ECZ A; 2JT4 A; 2EVR A; 2DYB A; 1B07 A; 3PVL A; 1NM7 A; 1M3C A; 2EYW A; 4OMO A; 1H3H A; 3QWX X; 3JV3 A; 2FO0 A; 1X27 A; 1UEC A; 1YNZ A; 2HSP A; 2DL5 A; 1MV3 A; 1SRL A; 2FPE A; 2DE0 X; 1GBQ A; 2KBT A; 3NPF A; 2CUD A; 2LX7 A; 4ORZ A; 1X43 A; 4AG1 C; 2EGC A; 1M3B A; 1E7O A; 1Z9Z A; 2LCS A; 2GQI A; 2NUZ A; 3PVQ A; 2SEM A; 5IXB A; 2JM8 A; 2DA9 A; 2KRO A; 2K6D A; 1AVZ C; 4CC7 A; 1KFZ A; 1J3T A; 2GNC A; 4OMM A; 3SHW A; 4CC3 A; 1RI9 A; 4JZ4 A; 2MIO A; 4IIM A; 4JPB W; 2RQW A; 1T3S A; 4ESR A; 2RQV A; 1VYU A; 3REA B; 5IHK A; 3I5S A; 1ZUK A; 2BZY A; 4F17 A; 2AKL A; 4HVV A; 2GTO A; 4HXJ A; 5FW9 A; 2EYZ A; 2ABL A; 1PKT A; 3UAT A; 3VS6 A; 1K0S A; 1GFC A; 2DRM A; 3RNJ A; 1CKB A; 2GTJ A; 2W0Z A; 2YUO A; 1FMK A; 4Z8A A; 1U3O A; 2DL7 A; 3SEM A; 2DNU A; 3LH5 A; 2D1X A; 2J6O A; 3I9Q A; 2L3S A; 4LUD A; 3REB B; 1GFD A; 1HJD A; 2RF0 A; 1H8K A; 2JMC A; 4LE9 A; 2RQU A; 2AK5 A; 3H0I A; 3VS3 A; 3I35 A; 4J9B A; 1WI7 A; 2J6K A; 3TSZ A; 2JMA A; 4J9H A; 2OAW A; 2CSI A; 1OPK A; 1T3L A; 3VS4 A; 3M0P A; 2DIL A; 1PWT A; 3EHR A; 1VYT A; 2DBM A; 1T0H A; 2KYB A; 2DBK A; 1M8M A; 2BZ8 A; 5I11 A; 4AFQ C; 1X69 A; 1YWO A; 2DF6 A; 4JZ3 A; 2A37 A; 2GGR A; 1JXM A; 1PHT A; 4D8K A; 1KIK A; 2D0N A; 2ED0 A; 3EG0 A; 2P4R A; 1BBZ A; 4RTY A; 4Y92 A; 1OPL A; 2ENM A; 2VVK A; 2F2V A; 4LNP A; 1U06 A; 1JEG A; 1OV3 A; 1ZBJ A; 1K9A A; 1AWX A; 4F14 A; 2KE9 A; 2PNI A; 1H92 A; 5ECA A; 1ZUU A; 3O5Z A; 1IO6 A; 2MCN A; 2LP5 A; 1QCF A; 2DL4 A; 2JXB A; 1U5S A; 1K1Z A; 1UHF A; 1ABQ A; 2CH4 A; 1PNJ A; 3RBB B; 3EG1 A; 4RTT A; 4RTZ A; 2YSQ A; 2JTE A; 4CC2 A; 1X6G A; 1PKS A; 4OMN A; 1WFW A; 2XMF A; 2K79 A; 2KRS A; 1AZG B; 2X3W D; 5FWC A; 2IIM A; 2EW3 A; 2LNH B; 1CKA A; 2OI3 A; 4R0K A; 2X3X D; 2EQI A; 4RTU A; 2V1Q A; 1BK2 A; 1E6G A; 2A08 A; 2ROT A; 3M0S A; 5GJW B; 1GCQ A; 5I22 A; 4Z89 A; 1X6B A; 1JXO A; 2K3B A; 1WA7 A; 4J9G A; 4AFS C; 2KR3 A; 2KRN A; 2L3P A; 1GCP A; 4AFU C; 2FRY A; 3TSW A; 1ZSG A; 1AWW A; 5IHI A; 1HD3 A; 1JU5 C; 3GBQ A; 2EPD A; 3NMZ C; 1UJ0 A; 2O31 A; 1W6X A; 3CQT A; 2J05 A; 1QLY A; 1Z9Q A; 4RTX A; 2BZX A; 2KEA A; 2ROL A; 1I0C A; 2FEI A; 3VS7 A; 2QDL A; 2J6F A; 2JW4 A; 1QKX A; 4LN2 A; 4DEX A; 1BU1 A; 2KYM A; 2C0O A; 2L2P A; 2JS2 A; 3EG3 A; 1UDL A; 4M4Z A; 1VA7 A; 1MUZ A; 1NYG A; 2O88 A; 1FYN A; 2YUQ A; 1SSH A; 1SPK A; 1UFF A; 1TUC A; 2C0T A; 1WIE A; 2KXD A; 1YWP A; 2CDT A; 2CSQ A; 3VRZ A; 2RQR A; 1Y0M A; 2RN8 A; 1XOV A; 2ED1 A; 1N5Z A; 2D8H A; 2NWM A; 1K4U S; 2LJ1 A; 2RMO A; 2HEQ A; 1UUE A; 3H41 A; 1SHG A; 2JS0 A; 2AKK A; 3H0H A; 5HCK A; 3M0R A; 3ULR B; 2EYX A; 3UA6 A; 1AZE A; 1JO8 A; 1WLP B; 1OEB A; 4F16 A; 2I0N A; 2EBP A; 1SRM A; 1UHC A; 4J9D A; 1ZUY A; 2DVJ A; 3PE0 A; 1GCQ C; 3I5R A; 1X2K A; 2EYY A; 5IH2 A; 2FRW A; 2DJQ A; 2ESW A; 3KFV A; 4IIO A; 1QWE A; 1UGV A; 3M0Q A; 1AEY A; 1YP5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2KT1 A; 4JS5 A; 4M75 D; 3CCQ Q; 1X01 A; 4ZNX A; 2K5L A; 4LDV A; 1YIT Q; 1WHG A; 2LQW A; 4M78 C; 3OYE A; 1VQ5 A; 1QVF A; 2HMA A; 1NYF A; 4HT9 A; 2M1H A; 1D0Z A; 1RAG B; 1M8V A; 3OMG A; 2BTT A; 1ARK A; 1LVK A; 1WJS A; 2KGT A; 3CCE A; 2M0Y A; 1WJR A; 3L2R A; 3OYF A; 3G71 A; 4ATO A; 1BI1 A; 2BE7 D; 1IB8 A; 1I1J A; 2A28 A; 3HFO A; 1VIE A; 4LUE A; 5CKD A; 3QG1 A; 3X28 B; 1ZX6 A; 4IUT A; 1Q7Y U; 3V8J A; 1NLO C; 3L2U A; 2DL8 A; 3OBW A; 4AFZ C; 1TU0 B; 1B7T A; 2FG0 A; 3OSV A; 1VQ7 Q; 2AT1 B; 2O9S A; 2P4T A; 3VUB A; 5IXF A; 2YUN A; 2LMJ A; 3D7S B; 3FLG A; 3CCR Q; 4BI3 A; 2LQK A; 4J83 A; 3M54 A; 1QQJ A; 1VQ7 T; 2OTL T; 1GRI A; 1E6H A; 4D8D A; 4C5I A; 1WHH A; 2XK0 A; 4MZT A; 4VUB A; 4C8Q B; 1M3A A; 2QA4 A; 5GAN 3; 5GAO l; 1VQ4 A; 3CC2 Q; 3FB9 A; 3H6Z A; 3OBY A; 4EIK A; 3PFS A; 4M7A D; 2KNB B; 3OA6 A; 2A36 A; 2OTJ Q; 3A8L B; 2FYK A; 1B3Q A; 2FPD A; 5M9O A; 2M51 A; 1NE8 A; 1Q82 U; 2X4J A; 4FT2 A; 3FRN A; 1MND A; 3JB9 J; 2F2X A; 2FL7 A; 3QJ6 A; 1VQ9 A; 2AZV A; 3MEU A; 1UG1 A; 5GAN e; 4LD9 K; 4JRQ A; 1ACM B; 1RAH B; 1AWJ A; 1YJ9 A; 4DQ2 A; 3HHT B; 1EIF A; 2E5K A; 4X9D A; 2K2V A; 2KRM A; 1TOV A; 3HRU A; 3G4S A; 4HVW A; 3OYD A; 1NJI R; 4NL3 A; 3L2Z A; 5KYX B; 3VS1 A; 1SSF A; 2DM1 A; 4RTW A; 3VS2 A; 1YI2 A; 1TXQ A; 1W1F A; 2FHD A; 3VS0 A; 3CCQ A; 1NEG A; 3QSU A; 3MEW A; 4JRK A; 4X9C A; 4BY6 B; 3CCL A; 2EQM A; 2CRE A; 2DLP A; 2RJD A; 2X35 A; 1ABO A; 2OTL A; 4Z88 A; 3TVT A; 3LLR A; 3QWY A; 1VYV A; 1IHW A; 4OMQ A; 3M5A A; 3OB9 A; 1MV0 B; 3F70 A; 2DYI A; 1EZZ B; 2ECZ A; 3FJP A; 2HL5 C; 4XQ3 A; 4E7H A; 2EYW A; 1H3H A; 2O01 E; 2FO0 A; 4M75 F; 1VQ6 Q; 3O8V A; 4J5Y A; 1JJ2 S; 1YJ9 Q; 1VQ8 T; 2DE0 X; 2V8I A; 1GBQ A; 2KBT A; 4M7D B; 5LJ3 d; 3SDZ A; 1E7O A; 1VQ6 T; 2GQI A; 2P0P A; 3PVQ A; 4WTO B; 1YJ9 T; 1OYX A; 2K6D A; 4LDX A; 2ZAE A; 5LJ3 f; 3PIP A; 1KFZ A; 1J3T A; 3UDC A; 2CKK A; 4OMM A; 4EMG A; 1RI9 A; 2ZZD A; 2E41 A; 3JB9 D; 2HAX A; 2JUF A; 3CBM A; 2LC4 A; 5J39 A; 2RHU A; 2E1H A; 4ESR A; 2KQW A; 3OW2 A; 1KG1 A; 1MMN A; 3I5S A; 5I2S A; 2DD4 A; 1ZUK A; 4EMH A; 4C8Q E; 4HXJ A; 3SWN A; 4RMO A; 2D6F A; 1PKT A; 3UAT A; 2DRM A; 2HSE B; 2FVU A; 4KH0 B; 4ZTF A; 1CKB A; 2YUO A; 1FMK A; 1SG5 A; 1XTD A; 1U3O A; 1H3Z A; 3LH5 A; 1PD1 A; 5AT1 B; 2D1X A; 3JCM b; 1XJW B; 1XNI A; 2JNG A; 2EFI A; 1KD1 C; 4LUD A; 1VQ9 Q; 1HJD A; 1V76 A; 2VUB A; 4PJM A; 2JMC A; 2YRV A; 3I55 T; 4LE9 A; 2K3X A; 3H0I A; 3VS3 A; 2HBP A; 3I35 A; 3UWN A; 2XG8 D; 4CI0 C; 4N4H A; 3I55 Q; 3UT1 A; 1VQ8 A; 1PWT A; 4XTW A; 2MMP A; 4BY6 C; 1UGR B; 5I11 A; 1YI2 Q; 3LW5 E; 1X69 A; 1YWO A; 1Q95 G; 2DF6 A; 5FRO A; 3E9F A; 2ED0 A; 1QP3 A; 4Y92 A; 1OPL A; 3L42 A; 1U06 A; 2K5I A; 1OV3 A; 4FYW B; 4OB1 B; 5GAO n; 2QQB A; 1W2B S; 3CXC S; 2KE9 A; 2NUP B; 2RA2 A; 3ASK A; 2QAZ A; 2JTF A; 5ECA A; 2MCN A; 2KSS A; 1IO6 A; 1QCF A; 2OX7 A; 4M77 A; 2DL4 A; 1W2B A; 4XTV A; 3L2Q A; 3CEY A; 1ABQ A; 1RAA B; 3VYH B; 4CC2 A; 4TVR A; 2IVW A; 1Q82 C; 3JSC A; 1PKS A; 3A8M B; 2E65 A; 2KRS A; 2XKO C; 1VQK A; 1QW1 A; 3OYB A; 4KUI A; 1VQ7 A; 2RJE A; 4M7A F; 2XD0 A; 4A4K A; 2LNH B; 5D6Y A; 5L8R E; 4R0K A; 1WJQ A; 4KH1 B; 1VQ4 T; 3M0S A; 3V7R A; 4ZGJ B; 1SKU B; 4XTU A; 5I22 A; 2E5Q A; 5A0L A; 3E1S A; 2CZ0 B; 4KUD K; 1YFN A; 1KQ1 A; 1BIA A; 4M7D F; 4M78 E; 1MMG A; 2V8J A; 4UC4 A; 3RR6 A; 2L3P A; 1Y71 A; 1JRI A; 4M75 B; 2FRY A; 2YHT A; 1AWW A; 5IHI A; 4FSX A; 1HD3 A; 5J3B A; 1UJ0 A; 3CQT A; 4RTX A; 3NFC A; 1YJN T; 2BZX A; 2KEA A; 4A4H A; 2DEQ A; 4YTL A; 5GAN g; 2J6F A; 2JW4 A; 1QKX A; 4RCB A; 1NJI C; 3MCA B; 1BU1 A; 2KYM A; 2MPX C; 2FZC B; 1UDL A; 2DET A; 2GQV A; 3CCQ T; 1EX4 A; 2O88 A; 4B9W A; 2YUQ A; 1SSH A; 3JCM d; 2PU9 B; 3GNG A; 2KDS A; 2A3L A; 2CDT A; 1YHQ Q; 2HEQ A; 1QVF P; 5IAY A; 1SHG A; 1W2B P; 1QMC A; 3GF5 A; 1HYO A; 3EGD A; 2QAS A; 3UA6 A; 2C06 A; 1AZE A; 2E10 A; 1JO8 A; 2CP0 A; 3SWN C; 4ZGE B; 1OU8 A; 2Y4Y A; 1IHV A; 4PFZ A; 1UHC A; 5GAN f; 4J9D A; 2DVJ A; 2K4Y A; 3I5R A; 1X2K A; 1OX9 A; 3WXM B; 3KFV A; 2F5K A; 9ATC B; 4F04 B; 1QWE A; 3M0Q A; 1AEY A; 4QVC A; 1VQO A; 3ZL7 C; 1VQ6 A; 5GAO q; 1VQ5 T; 2B86 A; 2G6F X; 2K3Y A; 4JJB A; 5CKH A; 1M1K R; 3FDR A; 1WHM A; 4AT1 B; 3JB9 I; 1BIB A; 3CCV A; 3A8G B; 1VQM A; 3G71 T; 2RQT A; 1X6O A; 2QYZ A; 1OZ2 A; 3OYA A; 1BI3 A; 1IZ6 A; 2PVD B; 3OW2 P; 3L1A A; 4NS5 A; 2J7I A; 2LZ6 B; 4OMF B; 3CCS T; 2V1R A; 1MHN A; 1U1T A; 1M27 C; 2ZGW A; 3H0F A; 3CBP A; 1XQH A; 1KQS A; 2YUP A; 3CCS Q; 4DEY A; 2HDA A; 4R56 A; 4PLI A; 2DL3 A; 1IRX A; 1NLP C; 3M53 A; 1UE9 A; 3MEV A; 3VYG A; 3X24 B; 1UJY A; 4J9C A; 2A7Y A; 2LJ3 A; 2LNV A; 4MML A; 4A63 B; 2C0I A; 1V1C A; 4KRT A; 5LJ5 j; 3VS5 A; 4WF2 A; 1SF9 A; 2XID A; 1GL5 A; 3CC4 T; 2KVQ G; 1X2Q A; 5LJ3 e; 2Z0W A; 3VUZ A; 1AD5 A; 4IUQ A; 3QDF A; 1Y57 A; 3UF4 A; 3RKX A; 1F1B B; 1G3T A; 4A54 A; 2HCK A; 1VQO T; 2RHI A; 3CXC A; 3CBO A; 3MP8 A; 1TUD A; 3M56 A; 1WYX A; 2DFU A; 1BKB A; 1TTH B; 1KHC A; 1WX6 A; 2CS7 A; 2RD1 A; 4BD3 A; 4HVU A; 5GAM j; 4OF1 A; 5LJ5 f; 5KYX A; 1VQN T; 1UTI A; 2EIF A; 4C0F A; 3CXC P; 4K11 A; 2VWF A; 3U23 A; 5GAN 5; 1RAC B; 5FWB A; 1BYM A; 5LJ5 d; 1RAD B; 3FIF A; 2CGH A; 2CZ6 B; 2E64 A; 4N0A C; 1VQN Q; 2HQE A; 2MOX A; 4PJJ A; 2CT3 A; 4XTZ A; 2CP2 A; 3THK A; 4M77 G; 3CCR T; 1KHI A; 3CCL Q; 1TG0 A; 2OJ2 A; 3RKW A; 2DTI A; 4PJL A; 1R0C B; 1JQQ A; 3RDV A; 4J9F A; 4JJN K; 1QVG A; 3CCL T; 1MGQ A; 4Y28 E; 2LVM A; 2X9H A; 3R6N A; 3M0T A; 1N6A A; 3RUX A; 2EGA A; 2H3E B; 5D6X A; 2RH2 A; 2F1L A; 2L3Q A; 2QQR A; 3EH2 A; 4MMK A; 2RK2 A; 4QT7 A; 1G2B A; 3ZFJ A; 5CQX A; 3T9N A; 2ZPH B; 5KYY A; 1Q81 C; 1U8R A; 1TSF A; 1VOM A; 4HT8 A; 2WSF E; 1PG5 B; 4FIB A; 2CZ1 B; 3OW2 S; 3PVL A; 1NM7 A; 1KC8 C; 4OMO A; 3QWX X; 1X27 A; 1P92 A; 5KYW B; 1YNZ A; 1VQN A; 5J26 A; 3C94 A; 3QZ9 B; 3OYC A; 1X43 A; 2PUK B; 1IGQ A; 3JCM c; 1M3B A; 1Z9Z A; 2LCS A; 1ZSZ A; 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