The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
NLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the Abl-SH3 domain at pH3
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Transferase
|
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase ABL1
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| total genus |
11
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2013-03-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4CC4 B; 3VRZ A; 4LE9 A; 4OML A; 2D8H A; 2ECZ A; 2YUP A; 4R0K A; 3JV3 A; 5GJW B; 2DLP A; 4RTY A; 2CUD A; 1H3H A; 2KT8 A; 1FYN A; 4CC3 A; 4J9E A; 1T3L A; 1Y57 A; 2KEA A; 1VYT A; 4JPB W; 2FPF A; 1JXO A; 2EYY A; 1BU1 A; 2RQU A; 2PNI A; 1X43 A; 1JEG A; 3QWX X; 3R6N A; 2LQW A; 5FWC A; 4J9F A; 5L23 A; 1EFN A; 1JQQ A; 1X69 A; 5FW9 A; 1WXT A; 2RQW A; 4AG1 C; 2J6K A; 2CH4 W; 1UE9 A; 1ZSG A; 1AWJ A; 1PNJ A; 1AWW A; 2DL7 A; 1X6G A; 2O9S A; 3VS5 A; 4LNP A; 1PRL C; 1QKX A; 3TSZ A; 1E6H A; 2GBQ A; 1ZUY A; 2FEI A; 5HCK A; 1HD3 A; 4CC2 A; 2C0I A; 2YUN A; 3VS3 A; 2KRN A; 2A28 A; 1ARK A; 1YWO A; 1Y0M A; 1X2Q A; 1X2K A; 2X3W D; 4ORZ A; 1GFD A; 3NMZ C; 3I35 A; 2K9G A; 5EC7 A; 1VYU A; 4OMM A; 1M3C A; 3VS0 A; 1K0X A; 2J06 A; 1JXM A; 2KYB A; 2E5K A; 2EW3 A; 2RF0 A; 2K2M A; 2DE0 X; 4J9I A; 1ZX6 A; 2GNC A; 3M0Q A; 1X27 A; 2HDA A; 2ROT A; 2EYZ A; 1GCQ C; 4ESR A; 2AZS A; 3ZL7 C; 3FJ5 A; 2VWF A; 2BZX A; 1T3S A; 1G2B A; 4HVU A; 2FRY A; 2VVK A; 4F16 A; 1AVZ C; 1UJY A; 2J6F A; 2VKN A; 2HSP A; 2F2X A; 2A37 A; 3M0P A; 1WA7 A; 1BB9 A; 4AFQ C; 1NYF A; 4CC7 A; 2BZY A; 2DL5 A; 3NGP A; 2AKL A; 2DBK A; 2L3Q A; 1AWX A; 2KRO A; 3H0F A; 4KRT A; 2JMA A; 2RQV A; 2CT3 A; 1UHC A; 1K76 A; 1OOT A; 4D8D A; 2C0O A; 2DIL A; 1A0N B; 2LCS A; 1B3Q A; 4K11 A; 1ZUU A; 2F2W A; 1U3O A; 1YWP A; 2A08 A; 2DMO A; 1SHG A; 3NHN A; 1WDX A; 1WXB A; 3RNJ A; 1V1C A; 3EGU A; 4D8K A; 3SHW A; 2FRW A; 3SEM A; 1E7O A; 1VYV A; 4QT7 A; 4J9H A; 2AK5 A; 1NM7 A; 4GLM A; 4OMP A; 1M27 C; 2JT4 A; 3EHR A; 2L3P A; 4F14 A; 1MV3 A; 1J3T A; 1ZLM A; 4HVW A; 2OJ2 A; 1GBR A; 2RMO A; 5I11 A; 2K3B A; 1Z9Q A; 2H8H A; 5IHK A; 4RTX A; 2DYB A; 1K1Z A; 1MUZ A; 2YSQ A; 2KE9 A; 2ESW A; 1K4U S; 1QKW A; 2EQI A; 4LN2 A; 4OMO A; 2W10 A; 3M0U A; 3VS2 A; 1GCP A; 1ZUK A; 2RNA A; 1NEG A; 2ED0 A; 3I9Q A; 4J9B A; 1GCQ A; 2O9V A; 2J05 A; 1PHT A; 1E6G A; 2D8J A; 2G6F X; 1WFW A; 2RN8 A; 2D0N A; 1AWO A; 2W0Z A; 1GFC A; 1UEC A; 4GBQ A; 1N5Z A; 3H0H A; 1K0S A; 1KSW A; 1SPK A; 1QWF A; 1HJD A; 2DF6 A; 3VS4 A; 5IHN A; 1BK2 A; 4JZ4 A; 1PKS A; 2HCK A; 2B86 A; 2YDL A; 3VS6 A; 3REA B; 3U23 A; 1W70 A; 4M4Z A; 2AZV A; 3TVT A; 2DNU A; 3UF4 A; 3QWY A; 1HSQ A; 2LX7 A; 1UDL A; 1NLO C; 1YN8 A; 2YUQ A; 4AFU C; 2YT6 A; 4HXJ A; 1Z9Z A; 2JS2 A; 4ZNX A; 3UA7 A; 5IXB A; 2RQT A; 1SRM A; 4RUG A; 2FO0 A; 2KBT A; 2OI3 A; 2O2O A; 1QLY A; 1NG2 A; 3O5Z A; 2V1Q A; 2K79 A; 1S1N A; 2L3S A; 4HVV A; 1PWT A; 1T0H A; 2JTE A; 4LUE A; 2KXD A; 1RUW A; 2DL8 A; 2J6O A; 4RTW A; 2V1R A; 4RTZ A; 1JU5 C; 2J7I A; 2GTJ A; 2PTK A; 3ULR B; 2LZ6 B; 2BZ8 A; 2NWM A; 1RI9 A; 3H41 A; 2RPN A; 1PKT A; 2CUB A; 3VS7 A; 1GRI A; 2KGT A; 5IH2 A; 1X6B A; 5FWB A; 2MIO A; 4JJB A; 1LCK A; 1YCS B; 2EGE A; 1WIE A; 1VA7 A; 1M3B A; 2NUZ A; 3EG2 A; 3EG3 A; 1TG0 A; 1SHF A; 1RLP C; 2OAW A; 1OV3 A; 1GL5 A; 1AD5 A; 1WX6 A; 1ZBJ A; 1H8K A; 1AZE A; 2QDL A; 3PE0 A; 4RTT A; 2K7A A; 4RTV A; 5GJV B; 1KFZ A; 1SEM A; 1NYG A; 2KR3 A; 2ENM A; 2GQI A; 1GBQ A; 2KRM A; 1NEB A; 2FPD A; 1OPK A; 3CQT A; 3EG1 A; 1WI7 A; 1SSH A; 2KXC A; 2JMC A; 1CKB A; 2F2V A; 1PRM C; 1TUD A; 1B07 A; 2JS0 A; 3PVL A; 2YUO A; 2LP5 A; 2HEQ A; 1UHF A; 2LJ0 A; 2X3X D; 2CSI A; 4A63 B; 2DX1 A; 2DRM A; 2JM8 A; 1K9A A; 4EIK A; 4X1V A; 2KNB B; 5IXF A; 2SEM A; 1KJW A; 2FPE A; 2L2P A; 1H92 A; 3EG0 A; 3REB B; 1WLP B; 2KYM A; 1WXU A; 1FMK A; 2M0Y A; 1UTI A; 2DVJ A; 3NPF A; 1AOJ A; 2O31 A; 2ROL A; 1CKA A; 4JJD A; 4IIM A; 1M30 A; 3TSW A; 4IIO A; 1UUE A; 2MCN A; 5I22 A; 2CDT A; 2RQR A; 3M0S A; 2ED1 A; 1I07 A; 2PZ1 A; 2JXB A; 4Z8A A; 3IQL A; 3LH5 A; 1OPL A; 4J9C A; 4RTU A; 1UJ0 A; 2DM1 A; 4AG2 C; 1TUC A; 4AFZ C; 2K6D A; 1JO8 A; 2I0N A; 1W6X A; 2IIM A; 1KIK A; 2CRE A; 3M0T A; 3KFV A; 2JM9 A; 4AFS C; 2DA9 A; 4JZ3 A; 1OEB A; 2HBW A; 1WYX A; 1UFF A; 2KT1 A; 2LNH B; 3THK A; 1CSK A; 4OMN A; 4HCK A; 1U5S A; 1UGV A; 3C0C A; 4DEX A; 2CT4 A; 2LMJ A; 1YNZ A; 1SRL A; 2D1X A; 3H0I A; 2DJQ A; 1AEY A; 2GGR A; 1I0C A; 2DRK A; 4OMQ A; 3EHQ A; 2EPD A; 2DL4 A; 2M51 A; 2EKH A; 2KRS A; 2EGA A; 3PVQ A; 2AKK A; 2LQN A; 1XOV A; 1QCF A; 3UA6 A; 2CH4 A; 3A98 A; 1AZG B; 4E6R A; 2SRC A; 2DL3 A; 1W1F A; 2XMF A; 1BBZ A; 2LJ3 A; 2EVR A; 2CSQ A; 4JJC A; 3M0R A; 3VS1 A; 4DEY A; 1ABO A; 4Y92 A; 1RLQ C; 1ABQ A; 1M8M A; 1NLP C; 2GTO A; 3I5S A; 2MOX A; 2O88 A; 4F17 A; 3I5R A; 5IHI A; 2BTT A; 4Z88 A; 1IO6 A; 1I1J A; 2DBM A; 1QWE A; 2EGC A; 4LUD A; 2A36 A; 2JW4 A; 5ECA A; 4WCI A; 1YP5 A; 3UAT A; 4J9G A; 4FSS A; 1UG1 A; 2ABL A; 1MV0 B; 4J9D A; 2L0A A; 2EYW A; 3GBQ A; 2EBP A; 3RBB B; 4Z89 A; 2LJ1 A; 2EYX A; 1G83 A; 1T0J A; 2P4R A; 2C0T A; 1U06 A; 2FG0 A; 3VRY A; 1M3A A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2V26 A; 4PJL A; 4II1 A; 4CC4 B; 4OP0 A; 4OGC A; 1YI2 A; 4XTW A; 4JUV A; 2QG9 B; 2XHC A; 3JCM d; 1FYN A; 4A4E A; 3CXC S; 3FJP A; 1T3L A; 1VYT A; 2F1L A; 1YIT Q; 2PVO B; 2E3H A; 5FRO A; 1X43 A; 4PLI A; 4M75 F; 3CCL T; 2LQW A; 5FWC A; 3SD4 A; 2C06 A; 1JQQ A; 5FW9 A; 1SF9 A; 1VQO T; 4BI4 A; 4PFP A; 5LL6 S; 1JB0 E; 1AWJ A; 1PRL C; 1QKX A; 3VJP A; 1E6H A; 3BDU A; 3CCR Q; 2WSF E; 4NL2 A; 2AIR B; 1AT1 B; 3EFO B; 3E9F A; 4CC2 A; 2O4X A; 3CD6 T; 3VS3 A; 2VUB A; 1OYX A; 5CKF A; 2HMA A; 1WHJ A; 1Q82 R; 3TEE A; 1G8X A; 5M9O A; 3BW1 A; 1UGQ B; 4M75 C; 5LJ5 j; 2VC8 A; 1BIA A; 1M3C A; 1W4S A; 2J06 A; 3FB9 A; 3KBG A; 1B7T A; 1PCX A; 2RF0 A; 4JRI A; 2RK1 A; 1RAG B; 2AZS A; 5LJ5 f; 4KH1 B; 4M77 D; 2BZX A; 4E7J A; 1YHQ Q; 2KVQ G; 1T3S A; 1G2B A; 2FRY A; 1AVZ C; 2H3E B; 5LJ5 d; 2HSP A; 4NOY A; 1KHI A; 2F2X A; 3E2U A; 2X35 A; 2X9H A; 2BZY A; 5FU6 B; 3GF5 A; 1LVK A; 1BKB A; 4KRT A; 1VQ4 T; 2M9U A; 4B9W A; 1YI2 Q; 2VYT A; 4LD9 K; 1UHC A; 2X4W A; 1N8R C; 1D1C A; 2IVW A; 3QJY A; 3JAM E; 2C0O A; 2BKD N; 2LCS A; 3X24 B; 1YJW T; 1ZUU A; 5GAM h; 1YWP A; 2A08 A; 2XDB A; 3CCR A; 1WDX A; 1WXB A; 5FU7 C; 1V1C A; 3EGU A; 4PJO F; 3SHW A; 3HPW A; 4QT7 A; 2AK5 A; 2NUT B; 2JT4 A; 2L3P A; 1J3T A; 4GLK A; 1ZLM A; 5A0D A; 4HVW A; 2OJ2 A; 3CCU T; 2RMO A; 2K3B A; 2H8H A; 4OB3 B; 3CCS A; 2R57 A; 4RTX A; 5LJ3 e; 5DLQ E; 4EMK A; 2ESW A; 1QKW A; 2L3R A; 1Y96 B; 4OMO A; 1JJ2 S; 2W10 A; 1X75 C; 2E3I A; 1MND A; 3V7C A; 1F1B B; 2E4H A; 3J81 E; 1R0B G; 6AT1 B; 5LJ3 d; 1N5Z A; 2YRC A; 2D6F A; 4ATO A; 2XI9 A; 3H0H A; 1QVF A; 2FVU A; 3VKI A; 3L2Q A; 1QWF A; 2DXC A; 4XU3 A; 2K5F A; 4BUG A; 2COW A; 1WHG A; 1BK2 A; 4JZ4 A; 1PKS A; 1PSF A; 4F7U G; 2YDL A; 3U23 A; 3CPW A; 2AZV A; 2LC4 A; 4C0Z A; 3CXC A; 1YJN A; 3QWY A; 1HSQ A; 3S3O A; 3L2Z A; 2YT6 A; 3CPF A; 4J8O A; 3VU3 C; 3CC4 Q; 4OF1 A; 5GAN h; 3CCM Q; 2CZ1 B; 2RQT A; 4XQ3 A; 1QVG A; 4JRQ A; 3O5Z A; 2K79 A; 3E9G A; 3GPL A; 3CCE T; 1S1N A; 4HVV A; 1VQM T; 2JTE A; 4LUE A; 1K8A R; 3MPU B; 4RTZ A; 3MEA A; 1JU5 C; 2J7I A; 1VQ5 Q; 1WNL A; 2BZ8 A; 3X28 B; 1YJN T; 4PK4 A; 2EJF A; 1RI9 A; 1QCO A; 2RPN A; 2KI7 A; 5HK3 A; 1YIT T; 1BCM A; 3M56 A; 1C6V X; 5CVI A; 5IH2 A; 1WJQ A; 4R55 A; 5FWB A; 2EQM A; 4XTU A; 4HKE A; 1WIE A; 1M3B A; 3CCV Q; 3L2W A; 4DOV A; 4M7A B; 1RLP C; 3EH1 A; 2OAW A; 5DLO A; 1H8K A; 2QDL A; 4J83 A; 3PE0 A; 4RTT A; 4RTV A; 3PIP A; 3PNW C; 2KR3 A; 3GOX A; 3J7A F; 1KQS S; 1BCO A; 5CQY A; 2FPD A; 1OPK A; 3EG1 A; 3G6E A; 3A8G B; 4F7U E; 4PJM A; 2RJF A; 1ZSZ A; 1CKB A; 1WZO A; 3M54 A; 4ZGD B; 1QVG S; 1M8V A; 5AT1 B; 2F5T X; 1PRM C; 1VQ6 T; 1DJ7 B; 2YUO A; 2G3R A; 2LP5 A; 3CBO A; 2X3X D; 5CAI A; 5LJ3 f; 2CSI A; 2F5K A; 5EG2 A; 1JBM A; 4X1V A; 3RR6 A; 2CP7 A; 4LDY A; 3CPW S; 2VXE A; 3OW2 P; 3SDZ A; 3DKM A; 3V8L A; 4MML A; 2WSC E; 4A4K A; 1NBE B; 4QKU A; 4V2S A; 3EG0 A; 3REB B; 1QVF S; 1VQ8 Q; 5HKC A; 5DM7 R; 9ATC B; 2M0Y A; 3RER A; 4M7D G; 2DVJ A; 5KYY B; 2RHY A; 2E6Z A; 3CCQ T; 3CCS Q; 1VQ6 Q; 1UGS B; 5J3B A; 4IIO A; 1UUE A; 1S72 A; 3OYY A; 2PZ1 A; 2ZCF B; 3F70 A; 2L5Q A; 3V8K A; 4PJO B; 2LDM A; 3LH5 A; 4J9C A; 4AG2 C; 3M4Y A; 2HAX A; 2QTX A; 5CR2 A; 4A4G A; 3HFO A; 2I0N A; 2IIM A; 3HRU A; 4MDX A; 4BI8 B; 4AFS C; 3OYL A; 2HZY A; 3MEV A; 1LPL A; 3C4S A; 2HBW A; 5CKD A; 4J7F A; 4M7A C; 3L42 A; 4OVA A; 1UFF A; 2KT1 A; 4JS5 A; 1KC8 U; 1WQ7 A; 3OYN A; 1CSK A; 2ZPE B; 5GAN 4; 3N5B B; 4X9C A; 2CT4 A; 3OB9 A; 1X01 A; 3JCM J; 2F69 A; 3WVE B; 2MWP A; 1AEY A; 2Y4X A; 3PTA A; 1I0C A; 3H9N A; 2X4Y A; 4FYY B; 2DVE A; 3EHQ A; 3M53 A; 5KYX B; 2EPD A; 1Q81 C; 1JJ2 P; 2DEU A; 3QO3 A; 3V7R A; 2AKK A; 3LGL A; 1N9R A; 3JCM Q; 3CC7 Q; 2E64 A; 1XOV A; 1BI2 A; 5FRN A; 3ASK A; 1AZG B; 2PVG B; 4E6R A; 2CZ7 B; 4LDU A; 1P92 A; 2BIV A; 2DL3 A; 1RAB B; 5HK0 A; 1IGQ A; 3MO8 A; 4D6W A; 3CME T; 3CMA T; 4Y92 A; 4XU1 A; 2Z0W A; 1NLP C; 5GAM g; 3I5R A; 2QYZ A; 4Z88 A; 3H6Z A; 1IO6 A; 4YTL A; 1M90 R; 1VQK Q; 2YHT A; 4PL6 A; 2FB7 A; 1YIJ Q; 2A36 A; 2JW4 A; 3UAT A; 3CPW P; 3OW2 S; 1M90 U; 1VQP T; 4FSS A; 3CXC P; 3I55 T; 3AT1 B; 1H64 1; 2ABL A; 4J9D A; 4PFZ A; 4DQ2 A; 3M59 A; 2P4R A; 1U06 A; 4O5V A; 1NJI R; 1UGR B; 3JRZ A; 3VRZ A; 2ECZ A; 4HCB A; 3EGD B; 4OB0 B; 3I56 Q; 2K2V A; 4RTY A; 1UGP B; 2CUD A; 3KUF A; 1EZZ B; 4M7D E; 5KYW A; 3JB9 D; 1QMC A; 2EQJ A; 5KE3 A; 3M55 A; 4J9E A; 4FM4 B; 2RI5 A; 4A4F A; 3MET A; 5GAO q; 4M78 C; 5IT9 E; 1IHW A; 2PNI A; 4PJO G; 3PMT A; 2XD0 A; 4CRI A; 1JEG A; 3R6N A; 3JCM g; 3CCL A; 4M7D C; 1RAC B; 3KXT A; 3OMG A; 2ZPB B; 3T9N A; 4AG1 C; 5KYU A; 3JCM f; 5GAN 2; 3MEW A; 4IUU A; 1PC0 A; 2DL7 A; 2O9S A; 4QQD A; 3JB9 I; 3CME A; 1VQ7 A; 1ZUY A; 4BE1 A; 1M1K R; 1HD3 A; 5LJ5 g; 3MP6 A; 5GAO l; 1RAA B; 2K57 A; 1QP2 A; 1I8F A; 2XU8 A; 3QDR B; 1RAH B; 4ORZ A; 4EMG A; 3UPU A; 1K0X A; 5GAO p; 4F7U A; 3HFN A; 1B34 A; 1VQ7 T; 2EW3 A; 1K73 U; 2OTL Q; 1NPR A; 2DE0 X; 3CMA Q; 1ZX6 A; 1PG5 B; 4QW2 A; 2XK0 A; 4ESR A; 2QGF B; 2IPO B; 4XAX B; 1U1S A; 1X6O A; 4JRK A; 2VXF A; 5LJ3 h; 2LCC A; 2Y4Y A; 1G3T A; 4BE0 A; 2P0K A; 2VKN A; 3GIB A; 1WA7 A; 4AFQ C; 1MGQ A; 2OAU A; 1NYF A; 4CC7 A; 3CCU Q; 1YFN A; 5GAN d; 2DBK A; 5GAM f; 2XDD A; 2A3L A; 5IN1 A; 2JMA A; 2RQV A; 1K76 A; 1OOT A; 4RG8 A; 4E7I A; 1Q7Y U; 1M1G A; 2E70 A; 3A8H B; 4QVD A; 1B3Q A; 2GFU A; 1U3O A; 2DMO A; 2AT1 B; 5GAN 6; 3L2R A; 3CME Q; 1XTD A; 3Q1J A; 1RAF B; 3LWI A; 1WHM A; 4C8Q D; 1VYV A; 1NM7 A; 4GLM A; 1LOJ A; 5FLX E; 3HL8 A; 2JN0 A; 4BI3 A; 3JB9 F; 2RHI A; 3AHU A; 2DYB A; 2RA2 A; 1K1Z A; 1MUZ A; 2YSQ A; 4IUT A; 3EGX A; 2KE9 A; 1VOM A; 1TU0 B; 4C8Q B; 2EQI A; 2RHU A; 4LN2 A; 1MMA A; 1JJ2 A; 3VS2 A; 4QQ6 A; 3EFS A; 1GCP A; 1ZUK A; 5KYY A; 2RNA A; 2P0P A; 3CEY A; 5FU6 C; 1IB8 A; 2A7Y A; 4XU2 A; 2J05 A; 2O9V A; 3QKJ A; 3GP8 A; 1PHT A; 3QYH B; 2D8J A; 2G6F X; 2KSS A; 1GFC A; 2W0Z A; 3BDL A; 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