The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
57
|
structure length |
57
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Chain Sequence |
NLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase ABL1
|
| publication title |
Crystal structure of the Abl-SH3 domain at pH3
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Transferase
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| total genus |
11
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| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2013-03-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3EG0 A; 1KIK A; 1T3S A; 3I35 A; 3KFV A; 3O5Z A; 1WDX A; 3C0C A; 3EHQ A; 3EG2 A; 1NYF A; 2KRM A; 3VRZ A; 1UTI A; 2GTJ A; 1PRL C; 2D1X A; 2FO0 A; 2XMF A; 5L23 A; 4LUE A; 2BZX A; 1E6G A; 2PZ1 A; 2CUB A; 4JPB W; 4HVV A; 2HSP A; 1T3L A; 2K6D A; 1M8M A; 1XOV A; 1X27 A; 2LQW A; 2AZV A; 2GGR A; 2DA9 A; 2AKK A; 2FEI A; 4Z8A A; 4M4Z A; 2KE9 A; 1CKB A; 3H0I A; 1QWE A; 2BZY A; 4HVU A; 2H8H A; 4HVW A; 2DYB A; 3M0U A; 1ZUY A; 5I11 A; 4OMP A; 4KRT A; 3SHW A; 1KJW A; 2F2V A; 1RLP C; 2DNU A; 4J9H A; 2RQU A; 2KR3 A; 2OAW A; 1GFD A; 4EIK A; 5I22 A; 1M30 A; 2DL5 A; 2NUZ A; 1MV3 A; 1TG0 A; 1G83 A; 1AWX A; 3RNJ A; 1EFN A; 1JXM A; 4JZ4 A; 3H0F A; 2DL4 A; 1W1F A; 2MOX A; 1JU5 C; 4AFZ C; 1K76 A; 1B07 A; 3VS6 A; 2A36 A; 1H92 A; 2CSI A; 3RBB B; 2QDL A; 3CQT A; 1WXU A; 1GFC A; 1MV0 B; 1WXB A; 4E6R A; 1SSH A; 2X3W D; 2C0T A; 4AFQ C; 3VS0 A; 1KFZ A; 1PNJ A; 2K7A A; 3UF4 A; 4D8K A; 1UHC A; 2LJ1 A; 1RUW A; 5FW9 A; 1Y57 A; 2LX7 A; 3EGU A; 1Z9Z A; 1ABQ A; 2L0A A; 2LMJ A; 2E5K A; 2HBW A; 1WI7 A; 2RQR A; 4ORZ A; 3TSW A; 3VS2 A; 1M3C A; 1T0H A; 1X2K A; 4RTW A; 3TVT A; 2CT3 A; 2ROT A; 2DMO A; 2L3Q A; 1U3O A; 1X2Q A; 3M0S A; 2LJ0 A; 1SPK A; 2V1R A; 1GCP A; 2KXD A; 1PWT A; 2ED0 A; 1UGV A; 3LH5 A; 2EYZ A; 2PNI A; 3REB B; 4CC7 A; 5IXF A; 1W6X A; 2ED1 A; 4RTX A; 2EVR A; 1Z9Q A; 2YT6 A; 1NYG A; 1X6G A; 2DRM A; 1AVZ C; 1UJ0 A; 2YUP A; 1VYV A; 2W10 A; 2EGA A; 1SRL A; 2P4R A; 3SEM A; 1T0J A; 4HXJ A; 4RTT A; 1S1N A; 4CC2 A; 4DEX A; 1UDL A; 1PRM C; 4D8D A; 4WCI A; 3VS4 A; 2DX1 A; 4GBQ A; 2NWM A; 2B86 A; 4OMM A; 1W70 A; 4JJB A; 1GBR A; 2CT4 A; 2L2P A; 2OI3 A; 1SHF A; 1ZSG A; 3NMZ C; 3ULR B; 1GRI A; 3EG3 A; 1OOT A; 4J9I A; 1VYU A; 1M3A A; 1I1J A; 5HCK A; 1ZUK A; 4RTY A; 5IHK A; 4RUG A; 2K3B A; 2EKH A; 1M3B A; 1SRM A; 2KYB A; 2EBP A; 2CUD A; 2DL7 A; 2HCK A; 2V1Q A; 2SEM A; 4AFU C; 1BB9 A; 2J6O A; 2A28 A; 2LQN A; 1VA7 A; 2PTK A; 2MIO A; 4J9B A; 1BU1 A; 3U23 A; 2YSQ A; 5GJV B; 2C0O A; 5ECA A; 5EC7 A; 1OPK A; 2ENM A; 1CSK A; 1K0X A; 4OML A; 4F14 A; 2O9V A; 3REA B; 3NGP A; 2KRS A; 2EYW A; 3QWY A; 4Y92 A; 1HJD A; 1OPL A; 1VYT A; 3NPF A; 2JTE A; 2IIM A; 1Y0M A; 3M0P A; 4GLM A; 1UUE A; 4J9F A; 3TSZ A; 1ARK A; 3EHR A; 4OMO A; 2J06 A; 2DLP A; 4J9E A; 2EGC A; 4Z88 A; 1WX6 A; 2GBQ A; 2LJ3 A; 4IIM A; 1AWJ A; 2LP5 A; 2FRW A; 3VS7 A; 3VRY A; 2BTT A; 1YCS B; 2AZS A; 2HDA A; 2D8H A; 2L3S A; 2DL8 A; 1YWP A; 2EYX A; 2RNA A; 1YNZ A; 1YN8 A; 2LNH B; 3I9Q A; 2DBM A; 1YP5 A; 2SRC A; 1MUZ A; 2KT8 A; 1X6B A; 2EGE A; 2RQW A; 4FSS A; 2EPD A; 2X3X D; 2L3P A; 1I0C A; 1CKA A; 2CDT A; 4JJC A; 1K0S A; 2EQI A; 2J6K A; 1GL5 A; 1WA7 A; 2I0N A; 1A0N B; 2CRE A; 3UA6 A; 4OMQ A; 4JZ3 A; 4RTU A; 1ZX6 A; 2K79 A; 1QLY A; 2FRY A; 1IO6 A; 2KRO A; 5FWB A; 2BZ8 A; 1QKW A; 3M0Q A; 1I07 A; 4ZNX A; 4DEY A; 2G6F X; 3H0H A; 2DVJ A; 1G2B A; 4IIO A; 2A08 A; 1JEG A; 2KT1 A; 1RI9 A; 2O9S A; 2YUQ A; 2FPF A; 3THK A; 1NEB A; 4AG1 C; 1HD3 A; 2DJQ A; 2KRN A; 2YDL A; 1AZE A; 2MCN A; 3IQL A; 1RLQ C; 2ABL A; 2KXC A; 1V1C A; 4Z89 A; 4J9G A; 1UE9 A; 2GQI A; 1NEG A; 2ECZ A; 4X1V A; 2LCS A; 1B3Q A; 3NHN A; 2DBK A; 3I5S A; 2CSQ A; 4LNP A; 5IH2 A; 5IHI A; 1ZBJ A; 1U5S A; 2JXB A; 2DIL A; 2JS0 A; 2J6F A; 2D0N A; 2DE0 X; 2VWF A; 1QWF A; 3M0T A; 1E7O A; 4OMN A; 1UG1 A; 2RN8 A; 1WLP B; 1BK2 A; 2LZ6 B; 1WIE A; 2GTO A; 2F2X A; 1PKT A; 2KEA A; 2EW3 A; 4CC4 B; 2JS2 A; 4AG2 C; 1AD5 A; 4LUD A; 2VKN A; 4F17 A; 2RMO A; 4CC3 A; 3JV3 A; 1NLO C; 1UJY A; 1FYN A; 3PE0 A; 2EYY A; 2J7I A; 4ESR A; 1K9A A; 1QCF A; 2RQT A; 2W0Z A; 3VS3 A; 2O88 A; 2DRK A; 1YWO A; 3FJ5 A; 2AKL A; 3VS5 A; 1K1Z A; 3QWX X; 5GJW B; 1E6H A; 1GCQ A; 1PKS A; 4K11 A; 2RF0 A; 2JW4 A; 2CH4 A; 4JJD A; 4RTV A; 1ZLM A; 2M0Y A; 4AFS C; 1AWO A; 1QKX A; 4QT7 A; 1NM7 A; 4LN2 A; 2HEQ A; 1PHT A; 4LE9 A; 3R6N A; 2RPN A; 1HSQ A; 1GCQ C; 1UEC A; 1ABO A; 2ESW A; 1BBZ A; 3PVQ A; 1SEM A; 3M0R A; 4HCK A; 2KYM A; 2M51 A; 2ROL A; 1H3H A; 1OV3 A; 1JXO A; 2JM8 A; 2YUN A; 2KBT A; 1ZUU A; 1J3T A; 1FMK A; 1M27 C; 2DL3 A; 2F2W A; 1GBQ A; 2J05 A; 3EG1 A; 4RTZ A; 5IXB A; 1JQQ A; 2JMA A; 2JT4 A; 2O31 A; 3VS1 A; 3PVL A; 2A37 A; 3UAT A; 1X43 A; 3UA7 A; 4A63 B; 4J9C A; 2KGT A; 1TUD A; 1KSW A; 3I5R A; 1UFF A; 2VVK A; 1U06 A; 2FPD A; 4R0K A; 3ZL7 C; 2DF6 A; 3H41 A; 2FG0 A; 5FWC A; 1H8K A; 1X69 A; 2OJ2 A; 2FPE A; 1AWW A; 2CH4 W; 1LCK A; 2JM9 A; 2AK5 A; 1JO8 A; 3GBQ A; 2RQV A; 4J9D A; 1AEY A; 5IHN A; 2GNC A; 2C0I A; 1K4U S; 3A98 A; 1WYX A; 1NLP C; 1NG2 A; 2D8J A; 2O2O A; 2K2M A; 1WFW A; 1UHF A; 2YUO A; 1OEB A; 2DM1 A; 4F16 A; 1AZG B; 1N5Z A; 2K9G A; 2KNB B; 1SHG A; 2JMC A; 1TUC A; 1AOJ A; 1WXT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3EG0 A; 5GAN e; 3KFV A; 1QCO A; 3QHS A; 4J83 A; 5HKC A; 5GMK j; 2LNV A; 4FT4 A; 2GTJ A; 2RJE A; 2XMF A; 2RHZ A; 5L23 A; 3NTK A; 1ACM B; 3CPW S; 2BZX A; 4E7J A; 1E6G A; 4PNO A; 4RCC A; 3RES A; 4J7F A; 1R0C B; 4DBF A; 2CUB A; 3PTA A; 1VQO T; 1RI0 A; 2VC8 A; 2LVM A; 1VQ9 A; 4HVV A; 2E70 A; 5GMK e; 1YHQ T; 1X27 A; 4FL6 A; 2M0O A; 2KSS A; 2LDM A; 2DA9 A; 2KE9 A; 4M75 A; 1ZA1 B; 4ZN3 A; 1P92 A; 2BZY A; 5LJ5 g; 2H8H A; 4HVW A; 1PC0 A; 1WHL A; 1VQM Q; 4BI8 B; 3JB9 F; 1KQ2 A; 4KRT A; 4OF1 A; 1KC8 R; 1KJW A; 1BI1 A; 2IVW A; 1RLP C; 1FMV A; 2DNU A; 3MP6 A; 2KR3 A; 4E47 A; 3INZ A; 2ZPF B; 1YIJ T; 2X51 A; 1GFD A; 5KYN A; 3CCQ Q; 1C0M A; 5CQY A; 1OUL A; 3SWN C; 2KMT A; 3CEY A; 4KUL A; 2NUZ A; 3CCM A; 2KK4 A; 1H3Z A; 5C0M A; 1NE8 A; 2EQU A; 3CC2 Q; 2E6N A; 3H0F A; 1LPL A; 2DYI A; 2CZ6 B; 2R58 A; 4M77 D; 3VUZ A; 1B07 A; 2G3R A; 4M78 F; 5DLO A; 3VS6 A; 1Q81 R; 4XQ3 A; 3I56 T; 1GFC A; 1MV0 B; 1WXB A; 2RI3 A; 2C0T A; 3OYA A; 3VS0 A; 4R55 A; 3EFR A; 4D8K A; 1BCM A; 4CI0 C; 1UHC A; 4C5G A; 3G71 Q; 2L0A A; 2RQR A; 4ORZ A; 3JCM e; 2ZZD A; 5J26 A; 3DB3 A; 1X2K A; 3CMA T; 4J5Y A; 1KK7 A; 2L3Q A; 1YHQ A; 1U3O A; 1X2Q A; 3M0S A; 2V1R A; 2V8K A; 2X4W A; 4QVD A; 3LH5 A; 4OVA A; 2PNI A; 3C94 A; 2VUB A; 4RTX A; 2PQW A; 1NYG A; 1VQ9 Q; 3S3N A; 4N4H A; 2DRM A; 1AVZ C; 3QDR B; 1NJI R; 2MAM A; 1NPP A; 1YJN A; 4XTW A; 1RAE B; 2P4R A; 4C92 C; 4NOY A; 4D8D A; 4WCI A; 2BE9 B; 3VS4 A; 2DXB A; 2RA2 A; 4GBQ A; 4LDW A; 1YIJ A; 1W70 A; 3GIB A; 3HL8 A; 4M77 B; 2RHY A; 1KC8 C; 2OI3 A; 1BIA A; 1SHF A; 3OYH A; 1ZSG A; 1QVF P; 3EG3 A; 5C6S A; 4XTX A; 1M1K C; 1I1J A; 1VQ7 A; 3CCM Q; 4M7D E; 3HP9 A; 3LGL A; 5IHK A; 4RUG A; 4F7U E; 2XIC A; 1M3B A; 3CME Q; 4IKF A; 3MO8 A; 4QKU A; 1HYO A; 3CPW A; 4YTL A; 1XQH A; 2SEM A; 5GAO l; 2XU8 A; 2JN0 A; 1YI2 Q; 1BB9 A; 2A28 A; 1YBY A; 3SWN A; 4UC4 A; 4IUR A; 4M75 D; 3U23 A; 2YSQ A; 1LJO A; 2GF7 A; 2C0O A; 4NS5 A; 8AT1 B; 3CXC P; 3CMA A; 5M9O A; 1H64 1; 3OMC A; 4FYW B; 4OML A; 4XTV A; 3TCJ A; 3CCU T; 2O9V A; 1WHJ A; 3REA B; 4EPC A; 5KE2 A; 3NGP A; 1W4S A; 2KRS A; 5LJ5 d; 2EYW A; 2JZ2 A; 1TWB A; 4PJO F; 1I5L A; 2EQM A; 4ZTF A; 4IUP A; 3OYC A; 3FEO A; 3OYI A; 3OYL A; 3RDV A; 2M16 A; 1UGR B; 1AHJ B; 4EMK C; 3X25 B; 3MEU A; 2JTE A; 3H6Z A; 4EDU A; 1ZBX A; 4OMO A; 2X4J A; 1VIE A; 2J06 A; 3GP8 A; 3J80 E; 2EGC A; 1YJ9 T; 1WX6 A; 2QGG A; 4PFO A; 2QG9 B; 3JCM P; 1VQ4 A; 4IIM A; 1K8A U; 2HNI A; 5LJ3 f; 2HAX A; 5I21 A; 1M1K U; 2I2L A; 2PVG B; 1YJN Q; 2BTT A; 3OBW A; 2AZS A; 2JJ9 A; 2NUT A; 3MKD A; 2ATC B; 4EMG A; 4LDX A; 2EYX A; 5DY9 A; 1YNZ A; 2A3L A; 3BDU A; 1YN8 A; 3CCS T; 2LNH B; 2DBM A; 2COW A; 2OTL T; 1UB4 A; 2SRC A; 2KT8 A; 2X3X D; 2LX9 A; 3JCM J; 5GAN h; 3JCM b; 3FJP A; 3JB9 H; 3G1J A; 2HQE A; 4XU2 A; 1YJW T; 1A0N B; 1R77 A; 1HXD A; 3UA6 A; 1WQW A; 4OMQ A; 4E7K A; 2OTJ T; 2ZPE B; 4RTU A; 1QLY A; 2FRY A; 4M75 B; 5FWB A; 1FX7 A; 2L8D A; 4DBQ A; 3HHT B; 3M0Q A; 1VQ7 Q; 1I07 A; 5GMK h; 1G8X A; 3L2V A; 2DVJ A; 1JEG A; 1I81 A; 2YUQ A; 2FPF A; 5KYW A; 2K3Y A; 1NEB A; 1AZE A; 2K57 A; 3CCR Q; 1TUG B; 4Z89 A; 4MZT A; 1VQ5 T; 3NHN A; 2CSQ A; 1IGU A; 2DD5 A; 2LC4 A; 3QZ9 B; 5GMK m; 1YJ9 A; 2JXB A; 3KXT A; 2JS0 A; 2RJD A; 1W2B P; 2AT1 B; 2DE0 X; 3M0T A; 3CC7 A; 3EG9 A; 1E7O A; 1BK2 A; 2GTO A; 2F2X A; 2RHX A; 3QJY A; 3MEW A; 1VQ4 Q; 3HTR A; 1K73 R; 1MMN A; 3CCS A; 2P0K A; 2DTI A; 1FYN A; 2J7I A; 3QKJ A; 5CAI A; 1QCN A; 3RIR A; 1U8R A; 1VQ6 A; 2K3X A; 1WHM A; 2DRK A; 1I5O B; 3URG A; 3CCL A; 3QWX X; 2BIV A; 2OTJ A; 1TH7 A; 4KGV B; 1VQP A; 5CR2 A; 2JW4 A; 3JCM h; 2JUF A; 2AIR B; 4RTV A; 1ZLM A; 4AFS C; 2LRQ A; 4M7A D; 1VQL T; 2XI9 A; 4LN2 A; 1Q86 R; 4LE9 A; 1EIF A; 1HSQ A; 2VYT A; 3M5A A; 1SEM A; 5GAN 4; 3V7S A; 2MWO A; 4BAC A; 2ROL A; 2Y4X A; 4PJO C; 2JM8 A; 2YUN A; 2HQX A; 2KBT A; 2X35 A; 2NLU A; 3EG1 A; 4RTZ A; 2JMA A; 2O31 A; 3V7R A; 1X43 A; 1VOM A; 2RD1 A; 1VQ5 A; 3JB9 I; 3HRS A; 1TUD A; 1KSW A; 3MHX A; 1JJ2 A; 4M77 G; 3EFO A; 2QDY B; 4R0K A; 3QYH B; 3ZL7 C; 3H41 A; 1H8K A; 1X69 A; 4O5V A; 1AWW A; 1S72 Q; 3OYF A; 5I2S A; 2CP7 A; 4J9D A; 4DOW A; 2KY9 A; 5LJ3 j; 4HKE A; 2GNC A; 1K4U S; 2DPP B; 3M4Y A; 4HA8 A; 5IAY A; 4BI3 A; 3CC7 Q; 3I55 A; 2HBP A; 3H8Z A; 1JRI A; 1N5Z A; 1G5V A; 4PFZ A; 2YWW A; 1BI0 A; 1QP2 A; 1VQM T; 5LJ3 e; 2HD0 A; 3E2U A; 2GFU A; 1RAD B; 2A0F B; 5IXF A; 2CP5 A; 4M7A B; 1KIK A; 4B9W A; 1WDX A; 3EHQ A; 3A5Z B; 2D1X A; 2FO0 A; 1VQ6 Q; 3CCQ T; 4LUE A; 3TQ7 P; 1VQL A; 5GAM g; 3CCL Q; 3HSB A; 4RG2 A; 4Y91 A; 3CC2 T; 2K6D A; 1M8M A; 3S6W A; 1D1B A; 4KUD K; 2PVD B; 2FB7 A; 2RJC A; 5KCH A; 2AZV A; 4KGZ B; 2AKK A; 2FEI A; 3RUX A; 4M4Z A; 1Q86 C; 1M5Q 1; 3BDL A; 5GAN 6; 1QWE A; 3GNG A; 5GAO m; 3OYJ A; 3M0U A; 5GAN 3; 1ZUY A; 5I11 A; 2ZPH B; 2WSE E; 1KQS P; 2BUD A; 4M75 C; 2RQU A; 2M1H A; 3JRZ A; 4KBM B; 2FL7 A; 1NBE B; 4ELZ C; 1MNE A; 7AT1 B; 4XU3 A; 1WGS A; 2B8A A; 2DEQ A; 4M77 A; 3RER A; 1V76 A; 3UPU A; 3DKM A; 3EFS A; 2QQA A; 4QW2 A; 1M1G A; 5I22 A; 1M30 A; 5LJ5 f; 2DD4 A; 1MV3 A; 1VQ9 T; 4M75 G; 5HY6 A; 1TG0 A; 2Z0W A; 3M59 A; 1EFN A; 2P84 A; 2YRV A; 3QDF A; 4XU0 A; 1WZO A; 3NFC A; 3O8V A; 4BE1 A; 2RJF A; 4IUU A; 1WNL A; 2DZC A; 4AFZ C; 3JB9 D; 1SKU B; 5KYW B; 1D1C A; 4M7D G; 2IG0 A; 4M78 E; 3CC4 A; 1ZSZ A; 3KBG A; 3OYM A; 1H92 A; 2Y4Y A; 2CSI A; 3I55 Q; 3LGF A; 3X28 B; 1WXU A; 1D09 B; 1LNX A; 2X3W D; 5FRN A; 4MMK A; 2QEX A; 1KFZ A; 3JB9 J; 3M56 A; 1PD1 A; 3EGD B; 2OX7 A; 1OYX A; 1RAF B; 1RUW A; 1M8V A; 5FW9 A; 3DB4 A; 3EGU A; 2CZ7 B; 2E5K A; 1WI7 A; 1Q82 C; 3TSW A; 5KH6 A; 1M3C A; 4MZP A; 4C8Q D; 3AHU A; 1RAC B; 2QQ9 A; 2KVQ G; 4RTW A; 2DMO A; 4C92 F; 1FXX A; 3EG9 B; 2DEU A; 4BI4 A; 2KI7 A; 1SPK A; 4ELY C; 1SG5 A; 2KXD A; 3REB B; 3CCM T; 3OW2 P; 2EYZ A; 1W6X A; 4L59 A; 1PCX A; 3CME T; 3DLM A; 1X6G A; 3S3O A; 3G7Z A; 5KE3 A; 3JAM E; 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