The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
b'NLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase ABL1
|
| publication title |
Crystal structure of the Abl-SH3 domain at pH3
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Transferase
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| total genus |
11
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| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2013-03-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1M30 A; 4HXJ A; 4OMQ A; 4AG1 C; 4ZNX A; 5L23 A; 1AVZ C; 4RTT A; 4IIO A; 4X1V A; 1AWO A; 5IXB A; 5IHN A; 1YP5 A; 3M0T A; 1CKA A; 1ARK A; 2KT8 A; 2DL4 A; 2XMF A; 2HEQ A; 3PVQ A; 2LZ6 B; 1QCF A; 3UA6 A; 2A36 A; 2KRN A; 2DJQ A; 2K79 A; 2CSI A; 1U5S A; 1GCP A; 1KJW A; 2LP5 A; 1MV0 B; 5GJV B; 1Y57 A; 1T0J A; 2C0T A; 2YUO A; 3EG3 A; 1N5Z A; 1WYX A; 2V1R A; 1GFC A; 1U3O A; 1M3C A; 3VS2 A; 2DL8 A; 4CC4 B; 1GBR A; 2I0N A; 2C0O A; 3M0R A; 2B86 A; 3RNJ A; 1BBZ A; 2YUP A; 2D8J A; 2GQI A; 1WLP B; 1RI9 A; 1UUE A; 2RQR A; 3EG2 A; 2KT1 A; 2J05 A; 1SRM A; 1T3S A; 3H0H A; 1Z9Z A; 1QLY A; 2FEI A; 2LQN A; 1YCS B; 3EG1 A; 2YSQ A; 2KNB B; 2JXB A; 2SEM A; 4J9B A; 4OMM A; 2ROL A; 2P4R A; 4IIM A; 4AFQ C; 4JJD A; 1V1C A; 2VKN A; 1ZUU A; 1AD5 A; 2CSQ A; 1I0C A; 2HDA A; 2MCN A; 4J9E A; 3RBB B; 2PNI A; 4OMP A; 1NYF A; 2CH4 W; 2EBP A; 1WA7 A; 4D8D A; 1TUD A; 3NMZ C; 2GTJ A; 2OJ2 A; 2BZX A; 1ZSG A; 2DVJ A; 1PKS A; 2VWF A; 3JV3 A; 4RTY A; 2HSP A; 3VS1 A; 1K1Z A; 2L2P A; 1I07 A; 4R0K A; 5I22 A; 2L3Q A; 2F2X A; 4CC7 A; 4QT7 A; 1NEG A; 1NYG A; 1ZLM A; 4FSS A; 3UAT A; 4D8K A; 1CSK A; 2DX1 A; 1MV3 A; 2KBT A; 5FW9 A; 4F17 A; 1GBQ A; 2YUQ A; 1UE9 A; 2KE9 A; 1AWX A; 4JJB A; 2J6F A; 1Y0M A; 2D8H A; 2O2O A; 1UHF A; 4RUG A; 1X43 A; 3U23 A; 1E6H A; 1WFW A; 2CT3 A; 1W70 A; 1AOJ A; 1GFD A; 1WIE A; 1EFN A; 2C0I A; 5FWC A; 2DBK A; 2KRS A; 2O31 A; 1WI7 A; 1ABO A; 1NG2 A; 1ZUY A; 4E6R A; 2FO0 A; 2DIL A; 3TSZ A; 5I11 A; 3UA7 A; 2F2W A; 4A63 B; 4Z89 A; 4F16 A; 3UF4 A; 3EG0 A; 1K76 A; 1CKB A; 5HCK A; 4HVV A; 2NUZ A; 1UJY A; 1KIK A; 3SEM A; 4J9I A; 1AWJ A; 2DM1 A; 3VS0 A; 4LN2 A; 2J6O A; 2KRM A; 4Z8A A; 3C0C A; 2VVK A; 2EQI A; 1Z9Q A; 1QWF A; 2G6F X; 2KXC A; 1M3A A; 1HJD A; 1U06 A; 2EPD A; 1SRL A; 2CDT A; 2JMA A; 2EVR A; 4WCI A; 1ABQ A; 1KSW A; 3TVT A; 2DE0 X; 1OEB A; 4DEY A; 2A08 A; 2CT4 A; 4AFZ C; 2KYB A; 2RQW A; 2KEA A; 2OAW A; 2K6D A; 4ESR A; 2DA9 A; 3LH5 A; 3EHQ A; 2HCK A; 2PTK A; 2BZ8 A; 2DYB A; 4AFS C; 4LUD A; 3EHR A; 1TUC A; 2O9V A; 1GRI A; 2W0Z A; 4Z88 A; 2DF6 A; 1OPK A; 1H3H A; 1X6G A; 1ZX6 A; 4OMN A; 2M51 A; 3M0P A; 4JZ4 A; 4KRT A; 1PRL C; 2FRW A; 3ULR B; 5IHK A; 2ED1 A; 1QKX A; 2YT6 A; 1WDX A; 2DNU A; 2FG0 A; 2E5K A; 1SEM A; 1X6B A; 1UEC A; 1K4U S; 1ZBJ A; 3QWY A; 2ECZ A; 4OML A; 1OV3 A; 2F2V A; 2AK5 A; 1XOV A; 1B3Q A; 4JZ3 A; 2RNA A; 2JT4 A; 1UFF A; 1H8K A; 1RLQ C; 1E6G A; 1FYN A; 3KFV A; 3SHW A; 2EGA A; 1UTI A; 3FJ5 A; 1K0S A; 1A0N B; 1WX6 A; 2DRM A; 2LCS A; 3M0Q A; 2CUD A; 2LMJ A; 3M0S A; 4Y92 A; 1BB9 A; 2EYX A; 2RN8 A; 3VS5 A; 4RTV A; 1X2K A; 2AZV A; 1SHF A; 2DBM A; 2X3W D; 2GBQ A; 1HD3 A; 5GJW B; 1M3B A; 2RQV A; 2RQU A; 2AKL A; 2FPE A; 1VA7 A; 1H92 A; 2GNC A; 2J7I A; 2ABL A; 1I1J A; 4GBQ A; 1X2Q A; 2FPD A; 2DRK A; 1QKW A; 4DEX A; 1NM7 A; 1X69 A; 2KYM A; 3A98 A; 3PVL A; 1PKT A; 2KGT A; 2PZ1 A; 2K7A A; 2DL3 A; 4AFU C; 3VS4 A; 3I5R A; 2GTO A; 1WXT A; 4J9C A; 1YWP A; 2ED0 A; 3M0U A; 2RF0 A; 3H41 A; 4J9H A; 1K9A A; 3NGP A; 2X3X D; 1JQQ A; 1X27 A; 1SSH A; 1GL5 A; 2MIO A; 1RLP C; 4F14 A; 2EYW A; 2KR3 A; 1RUW A; 4CC3 A; 4OMO A; 2LQW A; 2AZS A; 2K3B A; 4JPB W; 2HBW A; 1JO8 A; 2M0Y A; 1WXB A; 3CQT A; 1BK2 A; 1W6X A; 1AWW A; 3ZL7 C; 2CH4 A; 2FRY A; 3VS3 A; 1KFZ A; 2K2M A; 1GCQ C; 2JW4 A; 4AG2 C; 1QWE A; 2LX7 A; 1TG0 A; 4RTW A; 2V1Q A; 2SRC A; 4J9D A; 3REB B; 2JM8 A; 5FWB A; 4RTX A; 2O9S A; 1PWT A; 3NPF A; 1SPK A; 1YN8 A; 2LJ0 A; 2LNH B; 4HVW A; 2OI3 A; 2JS0 A; 2L0A A; 1M27 C; 4LUE A; 2ENM A; 3VRY A; 1UHC A; 2FPF A; 1UDL A; 2DL7 A; 5ECA A; 1YNZ A; 1FMK A; 1BU1 A; 4GLM A; 1UGV A; 2GGR A; 1OOT A; 2IIM A; 2ROT A; 2O88 A; 1AZE A; 3H0I A; 2LJ3 A; 2JS2 A; 3NHN A; 5EC7 A; 2W10 A; 2ESW A; 1YWO A; 2H8H A; 1G83 A; 4K11 A; 3GBQ A; 1NLP C; 1IO6 A; 1NLO C; 2A37 A; 2EYZ A; 1GCQ A; 1PHT A; 2JTE A; 3H0F A; 3QWX X; 4M4Z A; 1T3L A; 2J06 A; 1JXO A; 1AZG B; 2EKH A; 1K0X A; 1MUZ A; 2RMO A; 2KRO A; 4HVU A; 1JEG A; 1OPL A; 2D0N A; 4LNP A; 1M8M A; 4J9F A; 1J3T A; 4CC2 A; 3VS7 A; 2EGC A; 1VYV A; 2JM9 A; 2AKK A; 3PE0 A; 3EGU A; 1ZUK A; 2A28 A; 1VYT A; 2YUN A; 1W1F A; 3I5S A; 3I9Q A; 2RPN A; 4JJC A; 1G2B A; 1UJ0 A; 4J9G A; 3REA B; 4LE9 A; 5IH2 A; 1JXM A; 2DLP A; 2J6K A; 4RTZ A; 1B07 A; 3TSW A; 4ORZ A; 5IHI A; 2RQT A; 3R6N A; 1HSQ A; 3I35 A; 3IQL A; 1SHG A; 2LJ1 A; 2EW3 A; 2EYY A; 5IXF A; 2K9G A; 2CUB A; 2JMC A; 3THK A; 2QDL A; 2L3P A; 2BZY A; 2DMO A; 1E7O A; 4EIK A; 1AEY A; 2NWM A; 4RTU A; 1LCK A; 1PRM C; 1VYU A; 1T0H A; 4HCK A; 2L3S A; 3O5Z A; 2YDL A; 1UG1 A; 2BTT A; 2KXD A; 1PNJ A; 3VS6 A; 2D1X A; 1WXU A; 2MOX A; 2DL5 A; 2CRE A; 1S1N A; 2EGE A; 3VRZ A; 1NEB A; 1JU5 C; #chains in the Genus database with same CATH topology 1M30 A; 4AG1 C; 4OMQ A; 1AWO A; 5IXB A; 1YP5 A; 3QUI A; 2XMF A; 1OQK A; 2HEQ A; 2CP3 A; 1QCF A; 2NUT B; 2A36 A; 3UA6 A; 1YJ9 Q; 2K5I A; 3X28 B; 2DJQ A; 5FLX E; 2FL7 A; 5CO7 A; 1K9M C; 3FB9 A; 3S3O A; 2OAU A; 3RKW A; 4C0F A; 5GJV B; 2YUO A; 3L42 A; 2HBP A; 1GFC A; 1JB0 E; 2JTF A; 3G71 Q; 1GBR A; 2DL8 A; 2B86 A; 2AHJ B; 2RD1 A; 2JUF A; 1EIF A; 3HFN A; 1LNX A; 2QAZ A; 4HT9 A; 3FDR A; 4PJO F; 1UUE A; 1S72 A; 3EG2 A; 4QKU A; 1T3S A; 2D9T A; 2IG0 A; 2YLC A; 2KNB B; 3G7Z A; 4LDX A; 5GMK e; 2SEM A; 1X01 A; 4IIM A; 1ZBX A; 4M77 C; 4C92 G; 5LL6 S; 2VKN A; 1ZUU A; 2QA4 A; 4PJM A; 2CSQ A; 2DJZ A; 2DTO A; 5GAM h; 3X20 B; 2CH4 W; 3PNW C; 3JB9 D; 1WA7 A; 4D8D A; 4FU6 A; 3RKX A; 1QQJ A; 2OJ2 A; 3JV3 A; 4M77 D; 1BIA A; 2DPP B; 3CC7 Q; 4RTY A; 1M5Q 1; 4PJO E; 2HSP A; 1H3Z A; 1KHC A; 3ER0 A; 4R0K A; 1WQW A; 2Y90 A; 5I22 A; 4M78 A; 1FMV A; 5GMK j; 3SWN C; 2VGN A; 2ZGW A; 1NEG A; 1I8F A; 3MP6 A; 4F7U G; 4V2S A; 1ZLM A; 3JSC A; 3UAT A; 4D8K A; 2A7Y A; 5FRM A; 2KK4 A; 3ASK A; 1NZ9 A; 2M0O A; 1MV3 A; 3CBO A; 3CPF A; 1KC8 R; 2X4W A; 3G4S A; 1RAF B; 1VQ7 A; 4M78 B; 2X4X A; 2KE9 A; 2G3R A; 4FYY B; 2JZ2 A; 2D8H A; 5J3B A; 4RUG A; 1E6H A; 4BE0 A; 3QDF A; 3CME T; 3QJ6 A; 3A5Z B; 3D7S B; 3GNG A; 3CCU A; 1AOJ A; 3EFS A; 1EFN A; 4M7A A; 2DBK A; 2K3Y A; 5KYW B; 4PLL A; 1NG2 A; 1ZUY A; 1PC0 A; 3A8O B; 2FO0 A; 2V8K A; 3R6O A; 3CC4 T; 3JCM b; 1Q82 C; 3DKM A; 2DIL A; 2A0F B; 3LYI A; 4C8Q C; 3UA7 A; 3OY9 A; 4F16 A; 1UGQ B; 1CKB A; 3EFO A; 4LD6 A; 1UJY A; 2V26 A; 2QYZ A; 1QVF P; 1AWJ A; 2DM1 A; 3VS0 A; 4QVZ A; 4LN2 A; 1Y96 A; 3EFO B; 5GAM e; 1MMA A; 4C92 B; 2EPD A; 4LDY A; 1TS9 A; 4C5E A; 2RI3 A; 1Y96 B; 2E70 A; 8AT1 B; 2VYT A; 1VQN Q; 2X51 A; 4EMK C; 2DE0 X; 1OEB A; 3KBG A; 2KEA A; 1WJR A; 3CMA A; 2RO0 A; 5GAM j; 3VYG A; 4AFS C; 3VKI A; 4A4K A; 4PJJ A; 1YHQ Q; 4BDY A; 4C8Q F; 4F7U B; 3CD6 A; 2O9V A; 4XTV A; 1YI2 A; 3JCM d; 1R0C B; 2LDM A; 1QP2 A; 4QQG A; 1BI0 A; 3G6E T; 4JZ4 A; 1RAG B; 2YT6 A; 4OB1 B; 2QQS A; 2DNU A; 1G3W A; 1M90 R; 2E5K A; 2PVG B; 2E3H A; 1SEM A; 1M8V A; 1EX4 A; 1K4U S; 5AYF A; 1OV3 A; 3V8K A; 3I56 A; 2AK5 A; 5I21 A; 4M75 C; 2GF7 A; 3CC4 Q; 4HCC A; 1H8K A; 3KFV A; 2KI7 A; 1C6V X; 3CCU T; 2RHI A; 2OTL Q; 5GAN 7; 2YHT A; 2CUD A; 2KDS A; 2LMJ A; 4C8Q E; 5GAN 4; 1BB9 A; 5LJ5 f; 2P0K A; 2VGM A; 1VQ9 A; 2GBQ A; 4DBH A; 4ATO A; 1Y07 A; 4IUP A; 3JCM Q; 2OTJ A; 2RQU A; 3EG9 B; 1QW1 A; 1G5V A; 2CZ1 B; 1VQ5 A; 5D6W A; 4DEX A; 3JB9 J; 4XU0 A; 3H6Z A; 2KGT A; 1QVG S; 1W2B A; 4MML A; 3I5R A; 4BD3 A; 1WXT A; 1X75 C; 3CCR Q; 5GAN 5; 4AMC A; 3VUB A; 1BCO A; 1UGR B; 1K9A A; 4M75 F; 2CP6 A; 1VQ6 Q; 1JQQ A; 1SSH A; 1RAB B; 1U1S A; 3QPH A; 2AT1 B; 3QZ5 B; 2JVV A; 4J83 A; 5GAM g; 2DFU A; 1BK2 A; 3E2U A; 1D1B A; 2CH4 A; 3G6E Q; 1NPP A; 2JW4 A; 2LX7 A; 1KC8 C; 2V1Q A; 3REB B; 2JM8 A; 3PIO A; 2LNV A; 3C95 A; 2XDD A; 2RB6 A; 1HYO A; 3PT9 A; 1M4Z A; 1PWT A; 1ZA1 B; 3CEY A; 4OGC A; 4ZGJ B; 1YI2 T; 2LNH B; 1M27 C; 2ZPI B; 4LUE A; 4N4H A; 1VQM T; 1D09 B; 4M75 E; 2DD4 A; 3CCE A; 5KCH A; 2PVO B; 3QSU A; 1FMK A; 4RG8 A; 2L8D A; 1XQH A; 2GGR A; 2HQH A; 2IIM A; 1R77 A; 1U8R A; 3I56 T; 2QQR A; 3NHN A; 4L5G A; 4C5I A; 1M9S A; 1YWO A; 2H8H A; 2H3J A; 1G83 A; 4A4E A; 3UDC A; 1O9S A; 1NLP C; 1W2B P; 1PHT A; 2J06 A; 4M78 D; 1JXO A; 1IXD A; 1K0X A; 1MUZ A; 2KRO A; 2KAF A; 3CC2 T; 4E7H A; 1VQ9 T; 5GAO p; 4N4G A; 4QQD A; 1YJ9 A; 5I2M A; 2C06 A; 2DO3 A; 2EGC A; 2X35 A; 3PE0 A; 4C0D C; 3EGU A; 5GAM d; 3P8H A; 2X4J A; 1LOJ A; 3SDZ A; 2RPN A; 1W4S A; 4J9G A; 3G71 A; 4GY5 A; 5HK3 A; 5IH2 A; 1YFN A; 2LRQ A; 1N9S A; 4RTZ A; 3MPU B; 1OYX A; 2BUD A; 3BDL A; 1HSQ A; 2EJF A; 3T9N A; 5CKD A; 1K9M U; 4C92 C; 4A4H A; 5IXF A; 2ZCF B; 2JMC A; 2QDL A; 4DQ2 A; 2L3P A; 1OZ2 A; 1E7O A; 1G3T A; 3OB9 A; 5CKE A; 1PD1 A; 1PRM C; 3L2V A; 4FYW B; 1G3Y A; 1VYU A; 3FRN A; 4J8O A; 2MK5 A; 4FT4 A; 1I5O B; 5C0M A; 2O01 E; 3P8B B; 2DTH A; 1UG1 A; 1VQM Q; 3V7C A; 3VS6 A; 4JRQ A; 2D1X A; 4JLG A; 3OSS C; 2DL5 A; 1S1N A; 1M90 C; 2ZZD A; 3CCJ T; 1LVK A; 2FB7 A; 2QEX T; 2CZ6 B; 1K8A R; 3VRZ A; 1NEB A; 2E1H A; 1JU5 C; 2E12 A; 1QMC A; 4X1V A; 4IIO A; 5IHN A; 2M16 A; 3M0T A; 4LDV A; 1ARK A; 3CC7 A; 2PUO B; 2DL4 A; 2KVQ G; 3O8V A; 3S6W A; 4HA8 A; 2DAQ A; 3CCE T; 2CSI A; 3TCJ A; 1K8A U; 3GLX A; 4C92 F; 4O5V A; 3PMI A; 1N5Z A; 1ZQ1 A; 3CC2 Q; 2CP0 A; 1VIE A; 4CC4 B; 4E7I A; 3RNJ A; 2C0O A; 4PLI A; 1VQP T; 1BBZ A; 3QXE B; 1JJ2 A; 2IPO B; 2YUP A; 1RI9 A; 1KQ1 A; 3GNF B; 4NL2 A; 2E6Z A; 2ZPG B; 1SRM A; 5GAN f; 3H0H A; 1VQO Q; 2EQJ A; 1VOM A; 2XKO C; 2LQN A; 1YCS B; 1YJ9 T; 4F7U F; 2YSQ A; 2DXU A; 1N8R R; 3QO3 A; 2JXB A; 3V8L A; 4J9B A; 4DBQ A; 4OMM A; 4AFQ C; 4IUU A; 1LPL A; 1V1C A; 4C92 E; 1AD5 A; 1TWB A; 1I0C A; 2HDA A; 2MCN A; 2Y4Y A; 4J9E A; 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