4JN4A

Allosteric opening of the polypeptide-binding site when an hsp70 binds atp
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
600
structure length
600
Chain Sequence
SGKIIGIDLGTTNSCVAIMDGTTPRVLENAEGDRTTPSIIAYTQDGETLVGQPAKRQAVTNPQNTLFAIKRLIGRRFQDEEVQRDVSIMPFKIIAADNGDAWVEVKGQKMAPPQISAEVLKKMKKTAEDYLGEPVTEAVITVPAYFNDAQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGLDKGTGNRTIAVYDLGGGAFDISIIEIDEVDGEKTFEVLATNGDTHLGGEDFDSRLINYLVEEFKKDQGIDLRNDPLAMQRLKEAAEKAKIELSSAQQTDVNLPYITADATGPKHMNIKVTRAKLESLVEDLVNRSIEPLKVALQDAGLSVSDIDDVILVGGQTRMPMVQKKVAEFFGKEPRKDVNPDEAVAIGAAVQGGVLTGDVKDVLLLDVTPLSLGIETMGGVMTTLIAKNTTIPTKHSQVFSMGGAVTIHVLQGERKRAADNKSLGQFNLDGINPAPRGMPQIEVTFDIDADGILHVSAKDKNSGKEQKITIKASSGLNEDEIQKMVRDAEANAEADRKFEELVQTRNQGDHLLHSTRKQVEEAGDKLPADDKTAIESALTALETALKGEDKAAIEAKMQELAQVSQKLMEIAQQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Chaperone
source organism Escherichia coli
publication title Allosteric opening of the polypeptide-binding site when an Hsp70 binds ATP.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chaperone protein DnaK
total genus 192
structure length 600
sequence length 600
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00012 HSP70 Hsp70 protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1270.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 Substrate Binding Domain Of Dnak; Chain:A; Domain 2 4jn4A05
2.60.34.10 Mainly Beta Sandwich Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 Substrate Binding Domain Of DNAk; Chain A, domain 1 4jn4A04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4jn4A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4jn4A01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4jn4A03
3RSEA 3HZ6A 3LL3A 4K41A 3BUZB 1SAZA 2A6AA 3T49A 1HKGA 1BDGA 3HSCA 2Q1NA 4BR0A 4HYBA 5AQNA 1MDUB 4CJ7A 4O8KA 2D4WA 4BGAA 4BRFA 2P9IB 2YJEA 4EAHD 2GWJA 4FWPA 3UB5A 3D2FB 3C0BA 4BRKA 3W3DA 4WQ4A 3CI5A 4RCHA 1NGDA 4BRQA 2QXLA 3H3OB 1P8ZA 2QM1A 1RGIA 2F9WA 2AA4A 2P9KB 4XH1A 4PL7A 1NGBA 1QQNA 3O6WA 1YXQA 3R6MA 2VWBA 1HPMA 5AQUA 1DEJA 3HI0A 2FF3B 2QWMA 5FPDA 1NBWA 3QBXA 3LDPA 2F9TA 1V4TA 2V7ZA 4EZVA 4BR7A 4JNEA 2QWLA 2ITMA 4BVOA 2E1ZA 3ZX0A 4Z94A 4YDUA 4BR2A 2P9NA 3D7EO 3ID8A 4JHDA 2D1KA 5EOYA 4DB3A 2YI1A 4JWCA 3IMXA 3U8XA 5AQTA 3VETA 4B1YB 2QWOA 3J8AA 4JNFA 4BG8A 4CZIA 4H0TB 1IJJA 3UKUB 1BOTO 4IXCA 4C23A 4J8FA 2GEMA 2FF6A 3CJ9A 2P9SB 4XH5A 2ASOA 5AQIA 4EZYA 4B1ZA 3OHRA 4EZQA 1EQYA 2P9UB 3EN9A 4MLHA 2YCHA 4MO4A 1U2VA 1S22A 2YHWA 4BRDA 3VGLA 5FPEA 2EWSA 3ATVA 3T46A 1BWFO 4JD2B 2IVOA 3QFPA 5AQOA 1E4FT 2Q36A 1WOQA 4BC4A 4BGBA 1NGHA 1K8KA 5KPTA 3VOVA 3WXLA 1C0FA 3IUCA 3VEOA 4FPAA 1YVNA 5AQVA 5AQZA 3MCPA 1BUPA 2GTDA 4BVPA 3CHWA 3GL1A 1JCFA 4CZEA 4R5IA 4A2AA 2NZTA 3CJ1A 1HKBA 1X3MA 3MN6A 5BPLA 1HJOA 3VEZA 3U4LA 1GLCG 1NGIA 2E88A 3CJCA 5AQFA 3M3ZA 2AP1A 5JMVA 4FSVA 1BO5O 1TUUA 1T6DA 2J4RA 4YDUC 3CJAA 3CJ7A 1BA1A 5AQYA 4H0VB 3A0IX 2WUSA 3WXIA 3EZWA 1MWKA 4CZHA 3H46O 4JHDB 3WT0A 5AQPA 1RDWX 4JWIA 3VESA 1GLEG 1NGAA 3MDQA 4BC5A 2UYTA 5AZJA 2CGJA 4BROA 2BPRA 1Z05A 5JLFA 4BQZA 4MO5A 4QS7A 3T48A 5AQJA 1GLJO 4F01A 3VF2A 4K42A 4IWVA 3H3NO 3FLCO 1DKYA 2H3GX 4FWRA 4FWSA 3DAWA 4A2BA 4EZXA 1YUWA 4EZOA 4L3QA 3WXJA 1WUAA 4WV5A 1NWKA 1RFQA 3GG4A 3O1BA 4FWNA 4FWMA 3UE5A 3ZETA 3QNJA 2CH6A 3R8EA 1JCEA 4H5VA 3D2EA 1K8KB 3FZFA 3SMPA 3CIPA 2E2NA 5LJVA 3O1WA 1SQKA 3SMSA 3VENA 5KQ8A 1X9JA 2IIRA 4IZ9A 4CZKA 4BR5A 4NB4A 1CZAN 1KAZA 4BRCA 3AAQA 5BN8A 4RWTA 1DKXA 1C0GA 2IVNA 3EKUA 4EHTA 5E26A 3R9PA 1GLFO 4AM6A 4JAXA 4FL9A 1S3XA 4H0PA 3DPQA 4PO2A 1QQMA 5I9EB 7HSCA 2QWQA 2YHXA 4BC2A 2KHOA 2A40A 3GOIA 4H5WA 5AQWA 4DQ8A 1XC3A 2FLOA 4E1JA 1NGEA 2A3ZA 4ISGA 2CGKA 2NRHA 3BF1A 3DXKA 4H6IA 5F0XA 1NLVA 4M7YA 4KBOA 2A41A 4GNIA 1JCGA 4K43A 3VF6A 3BEXA 2QW9A 3A5MC 4PKGA 2OANA 5AZJB 2V52B 2HMPA 1BA0A 3EO3A 2V51B 2HOEA 4JWDA 1TYQA 3CERA 3SLCA 3FGUA 3QBWA 4RTFD 5AR0A 2Q97A 1E4GT 5AQLA 3OHXM 4EZSA 2BUPA 3H1VX 3ENHA 2CGLA 4I6MA 4CD3A 3RSEB 1V4SA 3QB0A 1HUXA 2A5XA 2I7NA 4BRAA 5BPNA 1G99A 3KHYA 1NGGA 2FSJA 3UKRA 4IJNA 3L3OM 2W40A 4BRGA 4WQ5A 4FWOA 2HF3A 4FO0A 1KAYA 4WQ4C 3MMVA 3ZETB 2P9LA 5AQRA 3DPPA 2DPNA 1DGKN 2HF4A 3D2EB 3FZMA 3HBTA 4EHUA 1ZXOA 3FFKB 2E2OA 5BRDA 4BRMA 5KPZA 4H5RA 3U9DA 5EY4A 4BRNA 5BR9A 2P9IA 2Q0RA 2QWPA 3D2FA 4H0XB 3LM9A 3A5LC 3VF4A 1ZBSA 2BTFA 2Q31A 4H5NA 4M63C 2ZWHA 4EZPA 3T47A 2P9KA 5BRHA 3AY9A 1ATNA 3O5BA 4H0YB 4QS8A 2P9NB 3EL2A 3CQXA 3FZKA 5AQKA 5AFUA 3S41A 3DXKB 3KVGA 2GWKA 1KAXA 2A42A 5AFUH 4BR9A 3WQUA 3ZX2A 3U9ZA 2I7PA 4IJAA 5AQMA 3SK3A 1R59O 4EZZA 3GE1A 3P4IA 4CBXA 1QHAA 4WV7A 1U2VB 4FPBA 1DG4A 1Z6RA 4XH4A 3I8BA 4WQ5C 5CE3A 4H5TA 4LC9B 3LDQA 4EZUA 1H1VA 4FOEA 4H03B 4K25A 4Y0WA 3UKRB 4EIAA 3WEEA 5KPRA 3WQTA 5AZIA 2P9UA 2GELA 1NGFA 1KXPA 1MWMA 4NO7A 5ELZA 3H0XA 2P9LB 2OP6A 4CZFA 5B8HA 4B9QA 3I33A 5LY3A 4CZMA 4DCHA 3CJBA 4B1UB 4JD2A 3MN9A 1NGJA 1QZ5A 3BP8A 1SZ2A 3FR0A 3HM8A 4BRLA 4CBWA 3GBTA 3DWLA 1D4XA 1YAGA 2P9PA 2YHYA 4AM7A 3IFRA 4HWIA 2QWRA 3O80A 4BQLA 4R5GA 3T4AG 3AAPA 4F9OA 3HTVA 3F9MA 4BRIA 4BR4A 4BC3A 4JWEA 3FZHA 3C7NA 1TUYA 2QFFA 1QQOA 3LDNA 4DHYA 3A5OC 2ZGZA 3DXMA 2FSNA 5EXWA 3VEVA 2E20A 1T6CA 4HTLA 1GLAG 5BN9A 5BPMA 2VYPA 4CZGA 3QMLA 2Q2RA 2E2QA 3QICA 5F1XA 1LCUA 1NGCA 2ZGYA 3ULEA 2WINM 3M6GA 3N8EA 2E8AA 4PL8A 3LM2A 2ZF5O 3FZLA 3QFUA 4PKHA 4PKIA 3WUHA 2VCPA 3ZEUA 3W0LA 1MA9B 3BF3A 4CZLA 3DOBA 3ATUA 3ZX3A 4B1WB 2ASPA 3ENOA 3VGKA 1Q18A 5FPMA 3VEXA 1OKJA 4QS9A 4FWQA 3LDOA 1LOTB 2PBDA 2PAVA 4FWKA 5E84A 4EZWA 1T44A 3QDKA 5JICA 3WEEB 3G25A 3VERA 1GLLO 4M7XA 5AZIB 4GY2B 3KZBA 5FPNA 5LJWA 2QWNA 4O5FA 3EKSA 1ATRA 5AQSA 4CBUA 4A61A 3JXUA 3H1QA 4MLEA 1J6ZA 3VPZA 3M1FA 1BG3A 3IDHA 3DJCA 3VEWA 1HLUA 3TU5A 5BRFA 4EZTA 4R5JA 4B1VA 4R5KA 2Q0UA 4CI6A 2E1YA 4BRHA 4JN4A 4BRPA 3MN5A 1NMDA 3O08A 1XUPO 2P9PB 4H0OA 2D0PA 1ZC6A 4XEIA 1XQSC 5KQDA 4CZJA 1BU6O 5BREA 1HKCA 4A62A 4BREA 1NM1A 2E2PA 1CKRA 3L0QA 1U00A 1X3NA 1DKZA 4WYBA 5AQQA 1Y64A 5EX5A 5ADXA 4E81A 4FOIA 2D0OA 3L4IA 3CQYA 3VGMA 4CD1A 3C7NB 2CH5A 3WXKA 4EFHA 1Q5LA 4HY9A 3DXMB 5ADXH 3SJHA 1BPRA 3FE1A 4BG9A 5JLHA 1GLDG 2GUPA 1ESVA 3AARA 5AQXA 1ATSA 1U6ZA 2ASMA 3O4WA 2NLXA 3ULEB 3A8YA 4IO8A 1TYQB 5AQHA 1HX1A 3ZEUB 2YJFA 3DPOA 4ISEA 3TPQA 4F00A 1GLBG 3DQGA 4ISFA 2FXUA 3A5NC 3O8MA 1DKGD 1QZ6A 3H45C 4I6MB 3L6QA 3UKUA 4FWLA 2W41A 2P9SA 3MN7A 3MK6A 5EVZA 1IG8A 4EZNA 2V7YA 4R5LA 3LDLA 4EZRA 5AQGA 3H6EA 3VEYA 4H6HA 3B8AX 5F2RA 2FSKA 2IVPA 3GDQA 3JS6A 4B1XB 5TKYA 3CETA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BH1A 1T03A 3T49A 1HKGA 2NNWA 2Q1NA 3O3MB 3ZT2A 4HYBA 4KTZA 4K0KK 2KLAA 1KCFA 4F2SA 1HXKA 1OH5A 3VEAA 3QO9A 4EAHD 2GWJA 3KJVA 3UB5A 4ZHRA 4DG1A 2QXLA 3H3OB 1P8ZA 4RW6A 3SBTA 4FJNA 2RE2A 3BUQA 3B6PA 4CIGA 4XH1A 3O6WA 2WTUA 3DLKA 1YXQA 3R6MA 1ZBLA 3DOKA 4DF4A 1HPMA 1HJRA 2QKBA 4B9LA 2QWMA 3OBWA 2ZJPL 3DYTA 1NBWA 3E66A 3QBXA 3SUOA 1B9DA 2VGMA 5J1EA 4BR7A 1KRPA 2E1ZA 3DX0A 3ZSXA 4DMNA 3CCSN 4ZTJA 5EU7A 2D1KA 1N36K 4CVNE 2OO2A 4JNFA 3DRPA 4A5AA 4FW1A 2YHAA 3AO3A 3VQCA 4C23A 5MLCQ 3S9HA 3CJ9A 2QK9A 5J2NA 5AQIA 2GX9A 1X1PA 5HRNA 1R33A 2YHWA 1NNEA 1HNWK 3VGLA 5FPEA 3ATVA 4HUEA 5LL6Z 3QFPA 5AQOA 2E6LA 4B9MA 2MI7A 3IUCA 4OKKA 1YVNA 1KVAA 1ITGA 2IAJA 4JEPA 3MCPA 1BUPA 2GTDA 4BDPA 3CCRN 4UDYX 4CW7B 5JS1A 4CZEA 2OW7A 3HAJA 1HKBA 1T05A 3VEZA 1URUA 4DKWA 2PYJA 1C0TA 4B3TK 2HHHK 3SZ2A 3CJCA 3VQQA 3M3ZA 1VQ6N 4KKOA 4NXMK 1J5EK 2D0CA 4YDUC 1BA1A 2RAJA 3A0IX 2WUSA 3V9ZA 4KIKA 3QE6A 4CK2A 3KLGA 4DV3K 3EZWA 5KI6A 3RMBA 3N4PA 4KAZA 2D0BA 3WT0A 3PX6A 5AQPA 1O13A 4OPHA 1KLMA 3MDQA 4YOTA 2UYTA 1EX4A 5C5BB 2BPRA 1Z05A 5JLFA 4BQZA 3KK2A 1T7PA 1A5XA 4JI4K 4ILIA 1BQNA 4F01A 4DUZK 1SL0A 3LP3A 1VQNN 4IWVA 2O4IA 1YJWN 4JKGA 3CF5L 1DKYA 3EY1A 3DX1A 1TAQA 1HNXK 4FWSA 4CJ4A 1VHXA 3O9UA 3S3OA 4L3QA 4C8KA 4HVJA 1WUAA 4Z4CA 4I2PA 3VA3A 4FWMA 1ILYA 1NMNA 4DV1K 3TAFA 4KHPK 4DR5K 1YITN 4JKCA 2IS3A 1S1UA 3D2EA 1VQ4N 3CIPA 1RTHA 5LJVA 1S1WA 1SQKA 3SMSA 1T3VA 3VENA 3ENBA 5M1PA 1SU8A 1QSLA 1TKXA 4Z0UA 5KRSA 4CZKA 4NB4A 4BRCA 1XWLA 2WYIA 4KH5A 1C0GA 4HTUA 2IVNA 1XMQK 3DLHA 2G8WA 3R9PA 3VQ5A 4JAXA 3CPWM 4Z4GA 4FL9A 1S3XA 3CG7A 4KI4A 1U49A 1N34K 1QQMA 4DR6K 2QWQA 4O5BA 2KHOA 3PUFA 5DK5A 3OVNA 2YL8A 4E7HA 4CHOA 4LF5K 3BZCA 4KIKB 4M45A 3G10A 4HCCA 1WLJA 2CGKA 4DQQA 4Z4IA 3BVXA 4IFEA 1XC9A 4CJLA 4E72A 1VRUA 4CFCA 1NLVA 4NCGA 1N5YA 3SUQA 1IV0A 4FZSA 3I55N 3BEXA 3QETA 2OANA 3T7ZA 2O8EB 1BA0A 3BUPA 3AVIA 4JWDA 1HYZA 3FGUA 3QBWA 3ALYA 5AR0A 4CGJA 2Q97A 2OPQA 2EFKA 1N32K 3OHXM 4EZSA 3CC4N 4YOXA 2X74A 4CD3A 3ZEDA 3RSEB 4W5RA 5GAGP 1KSPA 3BVTA 1C1BA 4CJQA 1U45A 2I7NA 4BRAA 5BPNA 4WFNL 3OJSA 2HBMA 4YOUA 3KHYA 2FSJA 4CHNA 4IJNA 4MQ3A 3L3OM 2W40A 4BRGA 2HHSA 4FVUA 1Z26A 3DLGA 3PSFA 1BQMA 2JNKA 5H1SQ 4WQ4C 4FK2A 3NFAA 4CK1A 2Z1HA 3D2EB 4PQUA 2F4VK 3LANA 1TQSA 4N76A 4CEQA 5EY4A 1IH7A 4M3XA 4ICLA 2OTLN 1N8RO 2BANA 4OGEA 2JLEA 3AVAA 5I3UA 2F1BA 1TQWA 4YOVA 4GKJK 3PLTA 5C10A 4FM2A 4FJIA 3LWMA 3T19A 4OJRA 4PA1A 4WFAL 1BHLA 1B9FA 3ZCMA 4W5OA 4CJSA 2Y1JA 2AJQA 3AY9A 1ATNA 1CLQA 4IM3A 1C1AA 4B9UA 3QWEA 1PS3A 3E1YA 2P9NB 3EL2A 3K5MA 4UDXX 4DTNA 3PSIA 5AFUA 1M90O 4B3SK 4FLTA 4GV3A 5HRPA 5FLXO 3V6DA 4XIUA 3H08A 3L2UA 2A42A 4WPCA 4BR9A 3U9ZA 2HSTA 3VQ9A 1WB9A 4EZZA 3P4IA 1NG9A 3B51X 1QHAA 1U2VB 3O9TA 3TI0A 1Z6RA 4O0IA 4FK4A 4XH4A 2P5GA 4WQ5C 3V9UA 3LZJA 3HL8A 2NRWA 3LDQA 4H03B 4K25A 1NK9A 3BUBA 3WQTA 5AZIA 2GELA 1JL2A 3OYKA 1M1KO 2KZMA 1MWMA 1UPXA 3H0XA 3NH0A 4DCNC 2VGNA 4LFBK 4B9QA 5LY3A 1WAFA 2HVIA 3K0SA 4B1UB 4JD2A 1QZ5A 3MX2A 4CBWA 1SU7A 3HSTB 4CIFA 1YTAA 3PIOL 1FJGK 1RILA 4C8NA 1OH8A 1TKDA 4HUFA 4CGDA 1ZWWA 1S1XA 1KC8O 4Y1DA 2ITGA 3AAPA 4F9OA 4EZ6A 3HTVA 3K5LA 3OS0A 4BC3A 1ZYQA 3M8RA 4DV6K 2QFFA 3LDNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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