4JN6A

Crystal structure of the aldolase-dehydrogenase complex from mycobacterium tuberculosis hrv37
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
338
structure length
338
Chain Sequence
MWDVRITDTSLRDGSHHKRHQFTKDEVGAIVAALDAAGVPVIEVTHGDGLGGSSFNYGFSKTPEQELIKLAAATAKEARIAFLMLPGVGTKDDIKEARDNGGSICRIATHCTEADVSIQHFGLARELGLETVGFLMMAHTIAPEKLAAQARIMADAGCQCVYVVDSAGALVLDGVADRVSALVAELGEDAQVGFHGHENLGLGVANSVAAVRAGAKQIDGSCRRFGAGAGNAPVEALIGVFDKIGVKTGIDFFDIADAAEDVVRPAMPAECLLDRNALIMGYSGVYSSFLKHAVRQAERYGVPASALLHRAGQRKLIGGQEDQLIDIALEIKRELDSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title Characterization of an Aldolase-Dehydrogenase Complex from the Cholesterol Degradation Pathway of Mycobacterium tuberculosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase
total genus 140
structure length 338
sequence length 338
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.1.3.39: 4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase.
pdb deposition date 2013-03-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00682 HMGL-like HMGL-like
A PF07836 DmpG_comm DmpG-like communication domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 Helicase, Ruva Protein; domain 3 4jn6A02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4jn6A01
3LLDA 1JR3D 1K8ZA 1DVJA 4PH6A 2G96A 2YZRA 3DFNA 3P7YA 2BZNA 2NUWA 3W7JA 4GUFA 1G6CA 5IBXC 3O63A 4NQ1A 1D9EA 3W73A 1FDJA 1YADA 3TUUA 3MHFA 3FYOA 3QPYA 4OT7A 3PBVA 1PS9A 5LHEA 3NOEA 2CHGA 4HN4A 3K1JA 4E38A 4O4WA 1OF6A 2DZUA 4RCXA 3R8RA 3A5FA 3SR7A 1YXDA 3EWZA 3RLUA 5TQLA 1C29A 4LTSA 3G1FA 3LHUA 5D37A 3GXTA 3W76A 4K37A 4RV8A 2NXGA 3DH7A 3CU2A 1NJFA 4IPJA 1R2SA 5TBOA 1JULA 1XXHB 1W5TA 3SC3A 1VCVA 4Y6GA 1KBJA 2EHHA 3MHUA 1UASA 4I9AA 3U61B 5CPLA 5LSMA 4Z8XA 2JKAA 5C18A 1W3IA 3ZR4A 4GNJA 4I4LA 5K2ZA 3PWAA 4A22A 1QFEA 4TMBA 3CM4A 4RK8A 3PUDA 4CNNA 1W5PA 3GLHB 1E94E 1OFQA 1TRIA 2JGYA 1NY5A 1JCXA 4L4UA 3DFOA 4UMCA 4JX4A 4K7VA 4IOTA 1Q3NA 3WK0A 3NQMA 4UFIA 1TPUA 3EB2A 4O19A 5FTKA 3GLIB 3NPVA 1VCFA 3A5VA 1UJPA 3P82A 3MYPA 4UTJA 1HL2A 3E96A 2DZNB 4C1LA 3TIMA 3BV4A 1EB3A 1IXQA 1FWWA 3WJZA 4DF2A 5HR7A 2C0AA 1F2JA 1R46A 5K9DA 1PE1A 1VZWA 4CNPA 4L4LA 1BTMA 3EWWA 3W1XA 1TREA 1H7NA 3G1HA 3MHGA 5FTJA 2YR1A 5H91A 3UPWA 2ZAOA 4IX2A 1W37A 4WW0A 2ZQ0A 3PG8A 3W3OA 1JUKA 3NO5A 2WQPA 3FA5A 3GLGA 3QH2A 4K8EA 2ZZ2A 4MYAA 2CLIA 3LB0A 1KTBA 2QKFA 3HGJA 4XUGA 4LVGA 3KVKA 2DZTA 3EKZA 1A50A 1FWNA 1WOAA 4D82A 3W1PA 4TR9A 5HWNA 1PL9A 1O4UA 1ZAJA 3OVQA 4DPQA 3R13A 3WJYA 4E0CA 3TV8A 3P60A 1A53A 3E0IA 3HPXA 3P8IA 1H63A 4NZFA 4O16A 4MUZA 1NF0A 1QPOA 4RZ6A 1TRDA 1SQ7A 3MUXA 1NY6A 5G1TA 3KRSA 8TIMA 4AF0A 3UZ5A 4ONVA 4BWLC 3PR2A 4BFAA 4DO4A 1ML1A 2QF7A 4QHSA 3THQA 4ZZ9A 1DHPA 3MWAA 4YCPA 5AHNA 3EXRA 3QZEA 4ADSA 1G7UA 1SSDA 1XKYA 3O6DA 3TH6A 3ZS4A 3NPWA 3FFSA 5DCDA 4JICA 3PF3A 1ZAIA 1L9WA 2QJGA 1YPFA 1ZJIA 4QITA 5LKYA 4PFMA 2GQ8A 5D04C 3W2UA 1HG3A 4LVFA 1JCNA 3TJXA 3EX4A 2HCBA 4LOCA 4HNUA 1W5SA 5GVJA 3QEZA 7TIMA 3G8EA 4GITA 3W83A 3R12A 4R7JA 4QAIA 2A7RA 3VNDA 3LERA 5D30A 4O18A 3TNOA 1KTNA 5A8GA 3INPA 3BLIA 4K8HA 3ATYA 4MYXA 1SZNA 2EF9A 3C2EA 3F1QA 2PRHA 3NL6A 4NJKA 1X1ZA 4QNRA 1P1XA 2Z2UA 2I9EA 4ADUA 2VFIA 4QIUA 3M6AA 3DKLA 4NX5A 4RZ5A 3OBKA 1ZFJA 2JK2A 3UXDA 1RR2A 4JTKA 2VFGA 3LI1A 3G22A 5I3HA 1Q45A 3KVLA 4UTUA 4NNBA 4KKXA 4K7YA 1QAPA 3EX2A 5LGXA 3WHLA 2DJXA 2BSLA 2J6XA 3CQ0A 1PVNA 1SPQA 1VQTA 3R89A 1FWRA 1M5WA 5FTNA 1TTPA 4PC8A 3W22A 5I3JA 2TSYA 4LVAA 2Y6ZA 1K8YA 5AHEA 1FDYA 3FS2A 3GR7A 5EXTA 4KFPA 5FF2A 4XTIA 5I3KA 3NQ7A 3STFA 2Y7FA 5I3IA 4LJ5A 1YDOA 4U4MA 4P2VA 1I45A 3HJZA 5LNWA 3LTSA 3W1MA 4OE7A 5BNKA 1SO6A 3HQ1A 3LXBA 5DBUA 4ZQNA 4YXGA 5IM51 1ZALA 3W7MA 1SFLA 4O1BA 1TYGA 4HIBA 1FY6A 2Z6JA 4D81A 1HUVA 4CQ9A 3UXAA 3F4NA 3SYLA 4FF7A 1WA3A 3M9YA 3GAKA 2XN1A 4Z1DA 4QOSA 1MEIA 1KV8A 1QWGA 4N02A 2E1DA 4XKYB 3HWSA 2VFEA 4ORIA 4Z1AA 2V1UA 1I8JA 1IM2A 3W7IA 3QW4B 1K03A 3CB8A 2YPIA 5LZLA 2WNNA 1XXHA 4O53A 3IGUA 2YW4A 4XWUA 1TV7A 3W7LA 1OFRA 4X22A 2HSAA 2H6RA 1TPVA 2A21A 3W7CA 4AB4A 1YTEA 1LLWA 1GYNA 3D8BA 5ABTA 3W70A 4LZZA 3GLHA 4FXRA 2DZVA 1LBMA 4A29A 1C9DA 3VFDA 4K6AA 2ZANA 3BARA 4L16A 3T44A 3TQKA 5E93A 5K4ZA 4IMDA 4PL2A 2V0TA 1KBIA 4YLWA 4K39A 3GLIA 5EP2A 1RPXA 1CW2A 1U83A 2CLOA 2DZSA 2PURA 2Z4SA 2VEMA 3W86A 4M6VA 4IXXA 2H3BA 4AWTA 3BGJA 2OJPA 4LS1A 2DU2A 4XQ6A 4FXSA 3MI3A 4MFEA 4JTJA 4ZMGA 1OHLA 1WX0A 3EX6A 4DBDA 1G4PA 3HG4A 3GDMA 1B4EA 3BVJA 3G18A 3N34A 3W2KA 1SO5A 2Q8ZA 5AHMA 3LI0A 5D03A 2CU0A 1NEYA 3I6RA 1GOXA 1LYXA 1RV8A 3UK6A 4O28A 2WO5A 4UMAA 4O0ZA 5FEWA 2QCDB 5D2XA 3T4CA 1AMKA 3CT7A 1JUBA 1IIHA 1IXRC 3RF9A 1T96A 2QUUA 3GDTA 1EP1A 1O5XA 3W7QA 2NWRA 4HSNA 4Z08A 1ALDA 4Z1CA 3GDRA 2V9DA 3L65A 4NJGA 1ME8A 4XBSA 3CC1A 3TC7A 4H3DA 3LHVA 1VR6A 2QCFA 3PAJA 3QMSA 1OYAA 3UWZA 3LBMA 3BLFA 4WJEA 4LU0A 2A7NA 1W1ZA 4JX6A 1PV8A 3RMJA 3CWNA 3W85A 4GUIA 3EX1A 2ZRXA 2WV8A 5LNRA 1L6SA 5K3VA 4LGMA 3BW4A 4MZ8A 3ABQA 2BX7A 2BJVA 2FLIA 3NQEA 3V75A 3P81A 4A3UA 2CZ5A 3NDOA 2TYSA 3KVMA 4WOQA 3W1TA 1A5SA 4RR4A 2QCLA 4JDBA 2ZZ6A 1FCBA 3WK1A 5D38A 2J9ZA 4QSHA 4AAJA 5CPOA 4MOZA 4IMEA 3TFXA 3UWWA 3M43A 1U5JA 4QNMA 4JX5A 2E5DA 5FF4A 3TR2A 5C2XA 2A1YA 1KM0A 5J5DA 3NPXA 4HNNA 5JI2E 3W7EA 3LXAA 2ISWA 4NNAA 3GK0A 4AWSA 5K4XA 3LRKA 1GWJA 3M5ZA 4LJ6A 1VJIA 3GDKA 4KWVA 2FFCA 4L4MA 3T78A 4R34A 2HS6A 4JTGA 3IVUA 4QJ1A 3TJLA 3V1PA 4OHQA 4FX8A 4IQLA 4UNKA 5L6UA 3P8JA 3C2RA 2VFFA 4M5PA 3KVJA 1S3SA 3HU3A 2X16A 3A24A 5D32A 4JYDA 1TMHA 4N4PA 4FCWA 3W1QA 1W56A 4NNCA 2YSWA 4N9BA 3O6YX 3TE9A 1PCKA 3MI6A 5EA9A 4IUOA 5AYXA 5EBUA 1FCUA 3NVTA 1GG1A 4LJ4A 4HT3A 2V30A 4LY6A 4JTIA 3W7OA 1Q6RA 5DXYA 3UWQA 3HO8A 4CNOA 1E32A 2WKJA 3UNDA 5D2YA 3EX3A 2KZHA 5AC6A 2ZRUA 3LHYA 2H8ZA 4DPPA 3SY5A 3DHFA 4NU7A 2X1RA 3FKRA 3NM3A 3A22A 5BRBA 2DHRA 2ABBA 2QCCA 1RQBA 4L15A 1IXOA 3MBDA 1BWKA 1OYBA 1Q6OA 1W5OA 3IIOA 2BTMA 3W07A 4B5NA 5D2VA 3LRMA 1K8XA 1DL3A 4MVAA 1GVQA 4Z0JA 2CZFA 3BG9A 3IVTA 4M6PA 2HS8A 4UFLA 4GWEA 4JY9A 3UWYA 2WNQA 2XFWA 4EOUA 4LVBA 2CHVA 1O5KA 3P61A 2V5BA 2O7SA 2RDWA 4M6QA 4AEOA 4XKYA 3I7QA 4R33A 2Q3OA 3DZ1A 3JRKA 3THAA 1TPWA 3M5XA 4E2DA 3Q2DA 3QW3A 3E02A 3LCWA 3OVPA 2FPYA 2QP9X 3LX9A 1FCVA 3ABSA 4JD4A 4Q32A 5EP4A 1I4NA 4MY8A 3PB2A 5D2TA 3HF3A 1P0KA 2I1OA 4PODA 3W7GA 1QO2A 2IQTA 4PCFA 1QOQA 2VKZG 1W54A 2V8ZA 1SZGA 1I2PA 3CIXA 4QHTA 2ZAMA 5I3FA 3G1SA 2ZZ5A 2CE7A 3DENA 2XN2A 3BLEA 1GZGA 4CCDA 2GQAA 3VCRA 2CZDA 1TTQA 2ZRZA 1KLYA 4AMAA 3L2IA 2OMAA 5LNSA 2DP3A 5LHFA 1VH7A 1Z48A 3G1DA 1TQXA 3BG3A 3KXQA 1HT2E 5HINA 3NQGA 3PXGA 2EGZA 1KTCA 2V5LA 3HGRA 1PIIA 1X7FA 1YXYA 3SYKA 1ICPA 3DBPA 3W87A 4JR5A 3G0UA 5H2ZA 3D0CA 3HIJA 3OG3A 4D2JA 4N2YA 1JQXA 3CF2A 5FESA 3C2VA 4M7SA 5AHFA 3L5MA 1D3GA 1GPWA 3U6WA 4JTFA 4FX6M 4DELA 1GJPA 4LC8A 3B04A 1YTDA 2QCDA 4BK9A 4A3VB 4X3ZA 2GJNA 1A5CA 1G3IA 3TFCA 3G0XA 2NUYA 2Q3RA 1KM4A 4EVZA 5CKSA 3QRHA 3TDFA 3NYZA 4ZQRA 4LY8A 4LT9A 1SO3A 1EP3A 3PUEA 2X1TA 2X1SA 3BO9A 1TPFA 3R8FA 1ZY9A 4ICNA 4WD0A 4O12A 2V2HA 1TTIA 1RD5A 5LNUA 2QZ4A 4UTTA 3W1NA 3S5ZA 1LDCA 3EWUA 4W9TA 2XSZA 4A2RA 3L66A 3LCGA 4Q4KA 3E12A 1XI3A 1DORA 1IN5A 4FWHA 1AW1A 3P84A 1X6UA 1W31A 3LM7A 2QCHA 3CTLA 1W5MA 3EKLA 5IBXA 2NX1A 1R2RA 3NNTA 3G1XA 3ZFHA 2E6FA 2YX0A 2Q8LA 3ELFA 3UYCA 3EIEA 4O4VA 2NZLA 3LTYA 4N9DA 1T0OA 3NR0A 4E2BA 1TIMA 2DZWA 3TAKA 1QZMA 1DJNA 2GQ9A 1LRNA 5HUPA 2Z6IA 1HTIA 1OFOA 3FEMA 3PY2A 3UWVA 5I3GA 2QDHA 5AN7A 2ZA1A 2RDUA 3S1UA 4MLJA 4UNLA 4MZYA 3S5OA 2J88A 1K7EA 4NUWA 2XSZD 4NXKA 1DO0A 3KAOA 3LDVA 2VIIA 4D80A 4UC5A 1YPIA 3W7NA 5JI3E 1JVNA 4UR8A 5DXXA 3QM3A 5E1QA 2B7OA 4NXSA 4Y8FA 4LNYA 3OEXA 4TMCA 3TAOA 5DYGA 2RKOA 3PUOA 1QOPA 1SSGA 3LV6A 4LVDA 4S1FA 5KITA 2CLKA 3HU2A 3M0ZA 3M6YA 3O1NA 2ATSA 3GKAA 5KSWA 4RZ4A 3LCHA 3VLFB 3I7SA 3DFTA 5EMUA 3PVFA 4PTNA 3PS7A 4FIQA 1NJGA 2CLEA 4LV9A 1O94A 1VS1A 2C18A 2RKXA 2ZRYA 1H61A 4TIMA 1LP6A 2FB3A 2P1FA 4RKAA 1C1KA 1HQCA 1PHWA 1H7OA 5HQEA 2C16A 3W71A 1I2RA 1LOSA 1QNVA 2PRMA 2CZEA 3R5EA 3TW7A 1FXPA 3EWXA 3O6CA 4GRSA 5C55A 3N9SA 1WDWA 4AXKA 3M0EA 3PBUA 3HPZA 1Z41A 3GR8A 3CF0A 1FDZA 4N4QA 3BOSA 3KDSE 3HG5A 4GXMA 1F5ZA 2H90A 1MXSA 1OX4B 3W84A 1H51A 2ZCGA 5AOUA 3HG3A 2CHQA 1GVOA 5G2HA 3DGRA 5AFDA 4BI5A 2E5CA 4HNTA 3C56A 3U2OA 1FQ0A 1XDMA 4N6FA 3QSRA 1KFKA 5FF0A 3IGXA 5HUOA 5DY3A 2A85A 5MHBA 3Q37A 1EX5A 2A6NA 3TQVA 4KFNA 1KFJA 4BWLA 2ZRVA 3G1YA 3NQ8A 2ZDRA 4GE8A 5KTLA 3UY7A 3C4UA 1OF8A 1BKSA 3LXCA 3NQDA 3W1AA 3GB6A 4UTWC 2WSQA 3GAYA 5HR6A 5KINA 4WUIA 3C61A 2QCEA 3ABRA 1XBVA 5G5IA 1OFIA 3M16A 3NQCA 4DO5A 3G24A 1R2TA 3HGOA 4WXYA 2R91A 3L5AA 1F76A 1TJRA 3IIVA 2QCNA 3PM6A 4FEZA 3DAQA 3W2MA 2FNAA 5BOOA 1DBTA 3SGZA 1BWLA 3MYOA 2D73A 1NSJA 3BPWA 3NM1A 3TW6A 3SJ3A 3S42A 1FBAA 3MP4A 2E68A 2QDGA 2ZTKA 1QPNA 1KM3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1MU5 A;  4KIR A;  3DXI A;  2UXC M;  1J0Y A;  2IXU A;  3QGK C;  3ATZ A;  1IT8 A;  2P3E A;  2ZBT A;  4IP7 A;  2E5L M;  1UWA A;  2CWN A;  1UWR A;  4PEE A;  5EU9 A;  2ZOX A;  2BVY A;  1REQ A;  4BI6 A;  3A3W A;  3H7V A;  2R6O A;  3TSM A;  5A2B A;  4FNS A;  2G95 A;  3VGB A;  5CPT A;  3HG2 A;  1FWA C;  4MAZ A;  1TX2 A;  4EPD C;  2GVL A;  2QF8 A;  4FOJ A;  3BMW A;  1QAN A;  1FH7 A;  3L0K A;  1TA3 A;  4GC9 A;  3PJX A;  4LW7 A;  3TQP A;  4GMQ A;  1UWS A;  4K8G A;  4AVO A;  3QWL A;  1OFP A;  3EEZ A;  1JFX A;  1XCF A;  1LCO A;  3S4T A;  3LK6 A;  1YXC A;  3UR8 A;  4GI9 A;  3W23 A;  4GI8 A;  3TCE A;  4L4P A;  5HJL A;  1EF3 A;  4PSP A;  1TV8 A;  3GDB A;  1RUS A;  2BWG A;  3ZXW A;  3P5Y A;  5LA1 A;  2YXO A;  4FO4 A;  3C6C A;  4XD3 A;  3PC0 A;  2VRQ A;  4DY1 A;  5D05 A;  2VCA A;  3HTW A;  3ANY A;  3VUP A;  2PZN A;  4NC6 A;  4ZOE A;  2VR2 A;  3W2J A;  2PDF A;  4LB3 A;  3BDK A;  3GQY A;  3IS4 A;  3EGJ A;  3SN0 A;  2NQH A;  1O6I A;  2IUZ A;  5EFF A;  3C3D A;  4RDV A;  4G2D A;  3MTW A;  3CZG A;  1QVB A;  4IJC A;  4OQV A;  4UTI A;  4QJ5 B;  3SFK A;  2EEX A;  2C9C A;  3NL2 A;  4GYP C;  4NZJ A;  3SSJ A;  1MX0 A;  4LYP A;  1SW0 A;  1KKO A;  3WO8 A;  1XV8 A;  3QMR A;  1PIF A;  2J27 A;  4S39 A;  2PDP A;  4CQA A;  4MGH A;  2WZI A;  3P14 A;  1P4C A;  2IPG A;  2HAK A;  4IGM A;  2CV0 A;  4MWA C;  2BG5 A;  4JTU A;  3GNN A;  4DHG A;  1XWI A;  3B89 A;  1SJA A;  5HAT A;  4UXD A;  4O1F A;  1PTD A;  1SXJ D;  2Y70 A;  5AY7 A;  4ML4 A;  3MSD A;  3SGU A;  1OAD A;  3SBF A;  4YN5 A;  2YBU A;  1PZ1 A;  2Y61 A;  5DCE A;  1DXI A;  3N25 A;  3W75 A;  3BAX A;  3FV9 A;  4C6C A;  4O50 A;  1QR7 A;  2R44 A;  4S3K A;  3Q67 A;  3QVQ A;  3QYQ A;  2R82 A;  1ADD A;  1UR1 A;  4US5 D;  4Q4P A;  5I02 A;  3AUJ A;  3P74 A;  2W66 A;  1ONX A;  4XD4 A;  5ITR A;  2OWC A;  1CXH A;  2X42 A;  1JR3 A;  3FYY A;  4M56 A;  4Q7N A;  3QHM A;  2UY5 A;  5H8U A;  1K3X A;  3O16 A;  4KGJ A;  1VHN A;  4ES4 A;  2NV9 A;  1NU5 A;  1VYP X;  3WF1 A;  1WHC A;  4NAS A;  2ZA3 A;  4ACZ B;  3FUU A;  1XDL A;  4LV4 A;  2N35 A;  2FJK A;  3GRI A;  2J8F A;  4PUD A;  1G4A E;  3UXL A;  2D0G A;  1HP5 A;  4GIS A;  4XX6 A;  4UZS A;  4L6D A;  2CWB A;  3EPN A;  4LF4 M;  3THG A;  2AQO A;  3POC A;  3QYE A;  5EP3 A;  1QW9 A;  2E6Y A;  5CSR A;  3CEP A;  4IMG A;  3GVG A;  4BY3 A;  4D72 A;  3WK3 A;  4YU1 A;  2EUC A;  3I68 A;  4G4N A;  2O9O A;  3MI2 A;  1CEC A;  2PC4 A;  2RRU A;  1IY2 A;  1RY8 A;  1PKN A;  2DEP A;  1DJZ A;  2F84 A;  1NDZ A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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