4JWXA

Glun2a ligand-binding core in complex with propyl-nhp5g
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
280
structure length
280
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGICHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural determinants of agonist efficacy at the glutamate binding site of N-methyl-d-aspartate receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GluN2A
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Unknown function
total genus 94
structure length 280
sequence length 280
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jwxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jwxA02
2V3TA 2XXPA 1N76A 4X9TA 2PT2A 4GL0A 1S9TA 2DP8A 3UGWA 1SW4A 3MP1A 2DQVA 1Y3NA 2ONKE 2ANJA 2QS3A 1FTLA 3ILUB 3M8UA 4G8NA 3EF7A 3MP6A 3QAXA 4EF1A 4ONYA 4POXA 1B1XA 4BDOA 3E3KA 3OEMA 4RY1A 1B3GA 5CM6A 2V84A 3ODBA 3DP8A 2NWJA 5TP9B 1MDP1 3OO8A 3K01A 2Y7PA 3MVXA 1WDNA 1B0HA 4OESA 1H76A 5H8HB 1B3HA 4H5GA 3CR9A 2VP1A 1SW2A 3IORA 2ZMBA 2ZYKA 4TOZA 4DZ1A 4OFJA 3RN8A 2DWIA 2R71A 1BLFA 3CG3A 3K6VA 1FTKA 3MP8A 4P11A 3PPNA 3E9XA 3RT8A 2P1SA 5CBRA 2O69A 2I3VA 5L8DA 2DWHA 3QIMA 3HHFA 3GXAA 3M3KA 3K1NA 1JEVA 3MBPA 4GWOA 3TQWA 3MVYA 4HTGA 3G3KA 3RQTA 2H5YA 1GR2A 5I2NB 3TMGA 1FW0A 4H6DA 2B3BA 4QHQA 5EYFA 5I57B 1MM6A 4H67A 3OSQA 2RC8A 3TUSA 2QS4A 3MUQA 2F78A 3RNNA 4YKPA 1DOTA 2QRYA 4Q30B 1SVXB 4IGRA 4I9DA 3FJMA 3SEUA 2A5SA 3SEYA 1JNFA 1DPPA 1M5CA 2OJTA 3T22A 2GHAA 4ECFA 1B5HA 3DELB 4G68B 4P0IA 3G3JA 3KG2A 3PPOA 4OXVA 3PV0E 3RTWB 3VVEA 4U22A 1NH7A 1M5DA 3OXNA 5AA4B 4RK2A 3N6UA 2Z8DA 2A5TB 3T96B 1NMUA 3S9NC 4YKJA 3N6TA 2FYIA 4JXIA 3G3GA 2DE3A 1POY1 4I62A 1JW5A 2DXYA 5CMKA 1OQHA 1A8FA 3O9PA 3S9EA 4OHNA 3PD9A 3OSRA 2OK2A 3OD7A 3E13X 5TPAB 2UVGA 4C1UA 5JTYA 4F1UA 4ZEIA 4KHZE 3TODA 1QVSA 1ATGA 3O6GA 1OQGA 2GH9A 3KOSA 3O29A 1YTVA 1MY2A 2ZNTA 2HAUA 1KWHA 5JEIA 3TCHA 4NTLA 3PUWE 4OFOA 1UQWA 4GOTA 1D4NA 1HSJA 5FHNA 1FTMA 5K2XA 4PFTA 1B52A 3MJNA 3T93B 4OYVA 2F36A 1B3FA 3HO7A 3MZBA 5I59A 2V3QA 1Y9UA 4WEPA 3KBRA 3IL1B 2I3WA 3FJ7A 1MXXA 2O68A 3WAFA 2XXVA 4X1BA 1US4A 4EQBA 2F7CA 2YLNA 3O66A 1ZKBA 4NF4A 3C36A 1B05A 2HXWA 3FZVA 1SBPA 1MQIA 5AA1A 1GGGA 4R2FA 4LZ8A 4X1DA 4Z7EA 2DYXA 2XXWA 2QMWA 1S7YA 2ONSA 3TDJA 2ZYMA 2G93A 5DTBA 3IOTA 4THIA 3AXFA 1MRPA 2VGQA 2I58A 1PB7A 3PUZE 1FTJA 3IJOB 2BJJX 3A09A 4E0WA 4EDPA 3EHSA 1VE4A 1I69A 2CZLA 2AIXA 3PPRA 1S50A 1FQAA 3TEPA 3K1MA 1Y20A 4WKMA 1I6AA 4OMBA 3U8QA 4JB7A 4R75A 2Q8JA 4BDLA 3SESA 3E4RA 4XKPA 3OENA 4QSDA 1P1OA 2H99A 1NNPA 3HHGA 3BKIB 1IQ7A 2F8DA 3W9VA 2HCAA 4GF8A 1N04A 3TTRA 3K6XA 1Z7ME 3TTLA 4U23A 2I0BA 3UIFA 4OEVA 4WEDA 3BBRA 3G3FA 1LFHA 3CSBA 1EZPA 4I8CA 4R2BA 1UTBA 2I49A 1MPBA 1H43A 1L5TA 3RPWA 2X26A 3H6UA 1TFDA 1LLSA 5L9SA 3V89B 2RCAA 1JVXA 3KFMA 3O6HA 1SD3A 4ZZEA 2M8CA 4LP2B 4QSEA 1BP5A 4N6PA 1UTHB 2I4BA 3TYHA 4AQ4A 3UK4A 1TXFA 4IO6A 5H8NB 3M3FA 4R6KA 3IOVA 5M2VA 3O28A 5AA2B 4YKIA 1A40A 1IUDA 3OO9A 4Q8RA 1IXHA 2ONRA 2I6EA 3M3LA 3ZS6A 2ZNSA 3C34A 1FQCA 4KD5A 4OFLA 3LR1A 4DCYA 5TP9A 3KOTA 1JVYA 3KN3A 5ITOA 4OETA 2HZLA 1YAEA 3IX1A 5H8HA 1EH3A 3VXCA 4IY6A 5BUUA 4NF8B 1OVTA 2FNCA 2Y84A 3PUXE 3T9VA 4F39A 3B6TA 5HM4B 1B0LA 4RPOA 1M5BA 4R73A 1AIVA 1PDAA 3PMXA 2XXTA 4N13A 1MXYA 3S9MC 2HQ0A 2V93A 1PC3A 4F18A 3Q26A 4YMAA 2V25A 5H8SA 1Y1MA 2O6AA 3CG1A 4XIGQ 4EQ9A 4MLQA 4U2RA 4RK9A 1M5FA 4F1VA 2DE2A 5I2NA 1PBQA 3L6GA 2XD3A 4TLLB 1B46A 3OO6A 2Y7KA 4NF6B 3VFJA 3O97A 5A5XB 5CRYA 4LQ5A 4NWDA 2X7PA 1AOVA 1MG1A 3LUYA 2OBGA 2QSXA 3OOAA 4IO2A 4G68A 2ZXTA 4ZEDA 2WKYA 5I58A 3HN0A 3QK6A 3EHTA 3PPPA 3TCGA 3DM0A 4F3BA 4G4PA 2DSFA 1IITA 4L17A 1B7HA 5KZTA 1XHYA 3VVDA 4GD5A 1Y4TA 1YPNA 4UACA 3KSJA 4G68C 3OELA 2PYYA 4ZECA 3FV2A 1HSLA 4OENA 3DP6A 2I4CA 3KEIA 1VFDA 3FXQA 4ZEKA 4M4GA 2PBWA 3TTMA 1O63A 2Z23A 2DVZA 4YB5A 2Y7WA 4OVJA 4F1YA 5F7VA 4PFYA 1P99A 4ESWA 2F7BA 3HPIA 1P1WA 3PPQA 1A7LA 1LCFA 4MFIA 3N5LA 3FUZA 1JEUA 4BDRA 3FASA 3CFZA 3LSWA 3JV9A 2GFEA 1FTOA 4NE4A 3IB0A 3U72A 1LAXA 1B5IA 3IR1A 3IO6A 1RYOA 3RT6B 1MY1A 4OEUA 4QFNA 5ICQA 1EZOA 2Z22A 4G77A 1RYXA 2QMXA 4HW8A 2D3IA 3VLWA 4UA8A 4KFQA 1UIVA 4F2OA 4KYDA 1R9QA 2HAVA 4LZ7A 3DP4A 3CVGA 2XHDA 4F3SA 2RC9A 4KYEA 1N84A 1MQGA 4RJZA 1FQBA 4OWDA 2UVJA 1MY3A 3B6QA 1NNKA 4GQOA 4RA1A 3RUMA 1US5A 1B58A 3FXUA 1GTKA 1B4ZA 4OERA 3LSXA 2H25A 3BFTA 1FQFA 1H45A 2IEEA 4R6HA 4DIGA 4ZE8A 2VOZA 1QUIA 4X48A 1B51A 3D4GA 3S2VA 4JWYA 4ZEFA 2NXOA 2UVHA 4KPTA 3VXBA 2DWAA 3FATA 2KLFA 1SQYA 2V3UA 2O1MA 3CFXA 4LUBA 2YPNA 3LSLA 4YB6A 4FEBA 3TQLA 1A54A 2VD2A 4KYSA 3V83A 2GHBA 1N7XA 3FV1A 1IXCA 5ITPA 3Q25A 4EXKA 4HCYA 2RC7A 3FGSA 4GIZA 1A8EA 4QFLA 4QF9A 4JDFA 5DVIA 3USDA 2ALUA 4PETA 2F7AA 1ZU0A 1A55A 1JW1A 2OCUA 2Q9TA 1LGBC 3CIJA 1USYH 4MF3A 2XXHA 3CFLA 4YB7A 1NFTA 3EHUA 2PX1A 5FTHA 4AB5A 4IY5A 5IAIA 5DYHA 1MDQA 4XXUA 3T66A 4DXUA 2PT1A 4ISUA 3RGYA 2ESNA 5I84A 3PUVE 2O7IA 4QFPA 4H65A 3UP9A 4FORA 3GZGA 3SEVA 3U93A 1UTHA 4BLAA 1GV8A 1SI1A 4G8HA 3U94A 5EHSA 3KSXA 3HCQA 4IO3A 4GFRA 5H8NA 1D9YA 4LATA 2O84X 2RINA 1MXUA 3L6HA 3FVNA 3EN3A 2QPQA 5AA2A 2OWSA 1BKAA 1ZMGA 3FVOA 2RF1A 1LAHE 5F1QA 3SKPA 4R72A 3R7XA 2XX7A 1B6HA 2ZYOA 4ELOA 4F2QA 3A3UA 2F97A 4C0RA 1MY0A 4R9FA 2DS9A 1VR5A 1DTZA 5DEXB 2RKMA 4YAHX 1B9JA 2FA7A 5AA3A 1MXVA 1O64A 3VE1B 4POWA 1XOCA 3MW0A 3VV5A 4XKQA 4RPNA 3SEWA 4ZDMA 1NNTA 5I2KB 2HFBA 3TCFA 2DOJA 3ONMA 3IJXB 3MC2A 3U92A 2E1SA 4O3BA 1N0TA 4PE5B 4U1ZA 3A3CA 3C33A 3ECRA 1IXGA 1MQHA 5DT6A 4KR5A 3IB1A 1SW1A 4NF6A 3N26A 2Q89A 1CE2A 5A5XA 1QW0A 1NH8A 4ZE9A 2E0SA 1PB8A 5LOMA 3THIA 3H4ZA 2AL5A 3QYTA 2I48A 2XD2A 1B3EA 4IO5A 3UN6A 2XXQA 2ABHA 1XVXA 3Q28A 4Q0CA 3SDFA 3C9HA 1Y3QA 1LSTA 4F22A 1LCTA 4FAJA 1DPEA 2REGA 1QJMA 5TU0A 1NL5A 1BIYA 3ZKKA 2D5WA 3JYRA 1II5A 3I6VA 3TELA 4N07A 3GBAA 2XXUA 4R9GA 1LAGE 4F29A 1FQDA 4LZ5A 3JZJA 4FECA 1MH3A 1Q1KA 5ICTA 2UVIA 3R26A 4IB2A 4BDQA 3B7DA 5CBSA 2B65A 2GRVA 5KDTB 3U1OA 2Q88A 1R9LA 4FIMA 4MLVA 1I6QA 1Z7NE 1B3LA 3KGCA 3CSGA 5CC2A 2XXRA 1OMPA 2CMOA 1AH5A 4LA9A 3ZKLA 1ZLQA 4QFOA 5I57A 5I56B 1MXWA 4FJPA 2DXRA 3W15C 2P2AA 5H8QB 1P1QA 1Y4CA 3C35A 1AL3A 3D4CA 1JW4A 2UYFA 3W9WA 3QUJA 4NF5B 3KN7A 4LONB 3TTKA 4BDNA 1B2HA 2QS2A 2R6GE 1IIWA 1LBBA 5CMBA 2I0CA 5AA4A 4GVOA 2A5TA 4YICA 4YMBA 1IXIA 3H6TA 3RY3A 4LQ2A 2XXXA 4GXAA 1MQJA 2Z8FA 4DXCA 3TFLA 1MM7A 3HV1A 5J1DA 3T9UA 4DXBA 4TQUQ 1XT8A 4H8IA 1B7UA 1MH4A 3IK6B 4FE8A 4DCXA 3UORA 3IAZA 1SYIA 1ZBMA 2ZNUA 4H1XA 3O6IA 5TPAA 1YCJA 4KQPA 5K2YA 1SI0A 4U21A 3KN8A 5HBCA 3EPEA 4NMYA 2QS1A 3FXRA 2NUVA 3S9LC 2F6PA 1N3WA 3MAMA 2DVCA 2Q2CA 4FEDA 3V8XB 2Z8EA 5ELVA 4F3PA 1JQFA 4F31B 3MVZA 5FHMA 1PB9A 1BTJA 1ANFA 2O1LA 4GLIA 4TLMB 3T9HB 1SDXA 3VLUA 5B70A 3UA8A 1URDA 2X7QA 1IZ1A 3LSFB 5KCJB 1N3XA 1B40A 1M5EA 3MZ1A 4GL8A 4QSCA 5H8FB 5AA2D 1NKXA 3V5AA 4FATA 3TAJA 4DLDA 1QKBA 1R6ZA 1B1HA 1HSEA 1JETA 2F5XA 4U4XA 3MQ9A 2B3FA 2R9JA 3KJ7A 4YZZA 3G3HA 4K3FA 1FQEA 2DE4A 5I58B 2THIA 3K4UA 4IGTA 2Y7IA 2W7YA 1VSOA 3K0VA 2IA4A 4H8JA 2YJPA 1O7TA 2DWJA 3FVKA 3IOUA 3ZSFA 1AMFA 5B7DA 5BWJA 1PBPA 2AL4A 4EF2A 2UYEA 3TZAA 5DEXA 1ZJLA 4Q5TA 3KZGA 3WAEA 2Y7RA 4I1DA 1WODA 4EXLA 3HSTA 3TKDA 3K02A 1DMBA 3LC8A 4IO7A 3PMWA 5I2KA 4HS7A 2AYSA 2PVUA 1XVYA 3B6WA 3VLVA 4NEDA 1ZTYA 3F11A 2NOOA 4HCWA 3GLBA 5DVFA 2XXYA 1F9BA 2VD3A 5ISUA 4MH5A 2G29A 3G3IA 2P0SA 4ELQA 3VVFA 2NVUB 3RLFE 3S4UA 5JK4A 1MS7A 1GVCA 2ZYNA 4KCCA 1D3KA 1OLCA 5CI5A 3MVWA 2UXAA 3IB2A 1SYHA 1I6BA 4PFWA 2PMSA 1XC1A 3H6WA 4DDDA 3OEKA 3VDFA 3R6UA 4ELRA 3I3VA 4OQOA 1A99A 4QRZA 4H5FA 3N94A 3LBSA 2O7UA 1B32A 4OZ9A 3Q27A 4AB6A 1MQDA 1ZIUA 5CMCA 3MPKA 3KJTA 3FVGA 1SW5A 2OWTA 4RXLA 2RCBA 3BFUA 3SETA 1MY4A 1NNFA 1D9VA 2H9BA 1B7ZA 5L9OA 1DTGA 4NF8A 1ELJA 3CI8A 4U1OA 3SERA 5JTYB 4YU0A 3RTFB 4C1TA 1EZ9A 3PUYE 2H98A 3G7WA 3C4MA 3IO4A 3H03A 5KDTA 4IO4A 1QUKA 4GXSB 1QUJA 3FIRA 3QUFA 4PFUA 2HEUA 1QKAA 4GRKA 4ND9A 1IEJA 3QSLA 1OIBA 4BDMA 1Q35A 1PEBA 1URGA 1TT1A 4M1VA 4JSDA 2F35A 5I59B 2H4IA 3PD8A 5I56A 1OVBA 3TTNA 1P1UA 1H3DA 5H8QA 3MWBA 3FD3A 4RYAA 3IOWA 3SEXA 4NF5A 1N7WA 1FCKA 4OTEA 4NF4B 3O2AA 4DE8A 4JWOA 1T0KA 1XS5A 4PQJA 5FHOA 4F3GA 4ZZAA 5EHMA 4G2ZA 1MPCA 2QJEA 3H6VA 1LAFE 3PMVA 3OMBA 1TWYA 2REJA 4Z0IA 4EQ7A 4WXJA 3H7MA 2F6GA 4E0XA 4O3CA 1H44A 3P7IA 1LB9A 2OLBA 1QULA 1TFAA 4R6YA 3OO7A 4MBPA 1LBCA 2XX8A 5L9MA 4H0WA 2F34A 1CB6A 1MXZA 4O3AA 4XTCQ 3PU5A 4ZS9A 5FTIA 1B4HA 4ESXA 4ELPA 3MPLA 2D21A 3GBBA 3PGFA 2HZKA 1MPDA 1EU8A 4F19A 2O51A 3MZ9A 1DSNA 3TPAA 2XXIA 4ZEBA 5DVJA 2OZZA 1B5JA 3ILTB 1OLAA 4G8MA 1VFEA 3K2DA 1LFGA 4JSOA 4XKRA 4XKNA 1RKMA 3H06B 3K1PA 5HPQA 3QXMA 1P1NA 4KI0E 2QL3A 3T9XB 4EUOA 1UTBB 1WVJA 2Q2AA 3C32A 4KCDA 2LAOA 4U4SA 1Y1ZA 1UIUA 1R1NA 1J1NA 1LB8A 2XX9A 3CRBA 3K6UA 4R74A 5KCJA 5AE4A 2VHAA 1USYE 5CMMA 4LVQA 3DLNA 4RNSA 4JWXA 3I5OA 5H8FA 3EQ1A 3K00A 5IKBA 3H3GA 3Q29A 4QFKA 4NWCA 3C31A 4YKKA 4P0GA 3FJGA 1Y3PA 1LFIA 3K6WA 4PP0A 1POTA 4JBZA 1URSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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