4JWXA

Glun2a ligand-binding core in complex with propyl-nhp5g
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
280
structure length
280
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGICHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GluN2A
publication title Structural determinants of agonist efficacy at the glutamate binding site of N-methyl-d-aspartate receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Unknown function
total genus 94
structure length 280
sequence length 280
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jwxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jwxA02
5FHMA 4LVQA 2ZXTA 1HSJA 3S2VA 2R9JA 2R71A 1BTJA 3IJXB 3RT8A 2Y7PA 2PT2A 3HHGA 2HCAA 1ZIUA 3RGYA 3H6UA 3D4GA 4RNSA 1VFEA 3KEIA 4LA9A 1B6HA 1AL3A 3OELA 5DT6A 4KQPA 5CRYA 2I3WA 3FVOA 3VXBA 1JW4A 3SEWA 4EXKA 3KSXA 4QFKA 1POTA 3A09A 2O69A 4I62A 1B2HA 3OXNA 5BWJA 3TCHA 4KHZE 1MY0A 4EQBA 1B46A 1LBBA 3MZBA 5TPAA 3SEVA 4M4GA 1SYHA 2QJEA 4LP2B 2UVIA 1UQWA 1NMUA 3RTFB 2PYYA 1JVXA 5L9SA 2XXIA 3QUFA 1IITA 4NWCA 5AA3A 1O7TA 1LAHE 1IXIA 1M5FA 4Q30B 5HBCA 3RPWA 4DCXA 1MPBA 4JB7A 3D4CA 2RC9A 4F39A 5ISUA 4DE8A 2E1SA 4LATA 1LB9A 5ICTA 2Q2AA 4NF5A 1GGGA 1MQGA 2ZNSA 3PUZE 3USDA 1FTKA 4Z0IA 1XVXA 3H06B 1N3WA 3CFZA 1II5A 5I2KA 3IOVA 4H67A 2XD2A 3IB1A 2Y84A 1M5CA 4EQ7A 2DWHA 3T22A 2X7QA 3R26A 1LGBC 3QSLA 3O2AA 1DPEA 1SYIA 4GVOA 1UTBB 4RXLA 3HV1A 5H8HB 3FXQA 2O1LA 2HZLA 1P1UA 4GRKA 1LAGE 4YICA 2O51A 4LUBA 5HPQA 3RUMA 2Q89A 5CBSA 3U92A 3L6HA 4DZ1A 2F97A 1SW2A 1R1NA 1ZLQA 1J1NA 4OETA 4PFUA 2ONRA 3VLUA 5K2YA 1Y1ZA 2DE4A 1MXYA 4ND9A 2I49A 5H8QB 1USYH 1HSLA 2OJTA 3RY3A 5I2NA 4U1ZA 2DWIA 4AQ4A 3OO8A 5KZTA 3TMGA 2HEUA 4YB5A 3TTNA 4ONYA 2NWJA 3ILUB 1PBQA 4RK2A 5KCJA 1IEJA 5LOMA 5FTIA 5CMKA 1LB8A 5DVIA 1AMFA 1BLFA 4OFLA 3RN8A 1O63A 1P1QA 4U23A 3O9PA 4H0WA 3PPOA 2OLBA 3MP1A 2HZKA 4EUOA 1T0KA 1SI1A 1FQEA 3IJOB 1US5A 4HTGA 2Q9TA 4NF6B 1A8EA 4U2RA 5I56B 2ZNUA 2A5TB 1LFHA 1TFAA 2V3QA 3TEPA 4YMBA 4PE5B 2I0CA 3PD8A 1B3GA 2XXWA 3M8UA 3DP8A 3TAJA 2VD2A 5I57A 1UIVA 4GIZA 1B58A 4FORA 3CR9A 5BUUA 3TELA 5TP9B 1Y3PA 5DEXB 1FTLA 1LAFE 1N84A 3MVXA 1Q1KA 1Y9UA 3C4MA 2ZNTA 3OMBA 1YTVA 4E0XA 4XKQA 3TZAA 1JW5A 4P0IA 3M3FA 3CSBA 2ONSA 5AA4A 2PBWA 3QK6A 3K6WA 5A5XB 1FQDA 3PPNA 3A3UA 2V3UA 4XKNA 3KBRA 5HM4B 3MPLA 5CMMA 1SW4A 4XXUA 3RNNA 4C1UA 2DWJA 3PUXE 1OIBA 4LZ8A 5I56A 3IO6A 4ZZEA 2HXWA 1EU8A 2XXRA 1N04A 3DLNA 1XVYA 2ZYMA 1B9JA 3PMVA 3IR1A 3TQLA 3V5AA 3W9VA 3QUJA 5I58A 2DE3A 1ZU0A 3C31A 4F1YA 4NF8B 3W9WA 4N07A 4OEVA 2XD3A 1EZ9A 3EN3A 1B5HA 1QUJA 2HFBA 2OBGA 3SEYA 3IL1B 4ZS9A 3O6GA 1UTHA 1TWYA 5ITPA 1DSNA 3KN8A 4KYEA 2YPNA 3B6TA 3FV1A 3VVFA 5IAIA 2CZLA 1QULA 3MBPA 1SBPA 2I48A 3ZS6A 3CI8A 1H43A 1PC3A 4UACA 1UIUA 2DS9A 2OWTA 2V25A 3PGFA 1OQHA 4YKPA 2GHAA 1NNKA 1RKMA 1P99A 1MY2A 1I6AA 4E0WA 5JK4A 1FQBA 3PUYE 3KN3A 1OMPA 1MH4A 4GFRA 1FTOA 1SQYA 3TDJA 3PPPA 3HSTA 2QMXA 4P0GA 3PUWE 1MPCA 3K1NA 3G3GA 1XHYA 4OEUA 1WODA 4ZEBA 3K1PA 3PPRA 1ZBMA 2NUVA 3R6UA 4R6YA 2UVJA 4YB6A 5AA2B 1H3DA 4G2ZA 3K0VA 4OENA 5I59B 3BFUA 3DELB 1WVJA 3GXAA 4ZEFA 3OSQA 3KOSA 3H7MA 2DOJA 4LQ2A 1URGA 4O3CA 5AA2D 2PT1A 4H65A 4WKMA 3O6IA 3PU5A 1GTKA 2THIA 2XXYA 4Q5TA 3ECRA 3EHSA 3C32A 5DVFA 4N13A 3FGSA 3ODBA 3N5LA 3LSFB 1QUIA 4G68C 3DP6A 2B3FA 3UORA 2F6GA 3H4ZA 4POXA 3ONMA 3KGCA 1NNTA 3CG3A 4IO7A 4ZECA 2REGA 1H45A 2Y7WA 3PMWA 5B7DA 4G8HA 3FD3A 3UP9A 2D5WA 3S9MC 2F8DA 4XTCQ 4GXAA 3V89B 5DYHA 1NKXA 5TPAB 1AOVA 3ZKLA 2H5YA 1QKBA 3LSLA 2WKYA 2B65A 1N0TA 3IAZA 3K6XA 4BDOA 1A99A 1IIWA 3I6VA 5ICQA 2XHDA 1IQ7A 4FECA 3Q25A 4IO2A 4NF5B 4IO3A 2M8CA 2O6AA 2QL3A 3G3FA 2OWSA 3KSJA 4F3PA 3LR1A 1A54A 3C33A 3V8XB 2I6EA 2V93A 3PD9A 5I2KB 4H8IA 2RCBA 3IB2A 2QS1A 5JTYA 1R9LA 1R9QA 1I6BA 3SERA 2Z8FA 1URDA 4Q0CA 2ALUA 3IORA 3OO9A 4O3BA 4YB7A 5L9OA 4JBZA 3H6VA 1MPDA 2F36A 1BKAA 2QSXA 1Y4CA 3P7IA 4NTLA 4QFNA 4XKRA 1POY1 3VVEA 4G68A 2X26A 4ELRA 1R6ZA 1JNFA 1B4HA 2QS4A 2O7IA 4GOTA 5I2NB 4DXBA 1SD3A 4KFQA 2O1MA 1MXVA 3H6WA 1USYE 4QSDA 3MUQA 1B3HA 2RC7A 3UGWA 5KCJB 4PETA 4X1DA 3EQ1A 1QKAA 4BDRA 3RTWB 4X1BA 4KI0E 1LLSA 2UYFA 2DE2A 5H8NB 4NMYA 1FW0A 1BIYA 4GF8A 3ZKKA 2YJPA 3CVGA 4ECFA 4U1OA 1RYOA 1MY3A 1D9VA 1IXHA 4P11A 4R72A 5FTHA 3IK6B 1YPNA 2DXRA 1FTJA 2QPQA 3JYRA 3B7DA 1OLAA 1GVCA 2P2AA 5I57B 1I69A 2OCUA 5JEIA 1MG1A 3MAMA 4FATA 4OFJA 4ISUA 1H76A 3E3KA 1DMBA 4DLDA 1XOCA 2Y7IA 1P1NA 3RLFE 4BDNA 4H5GA 1B05A 5L9MA 2H98A 2DYXA 3F11A 2QS3A 1B7ZA 4HCWA 1VFDA 4KCDA 1EH3A 3TCGA 1TXFA 5H8NA 5AA4B 1JW1A 2F7AA 1P1WA 3EHTA 1ZMGA 1ZJLA 4POWA 2DVCA 3SDFA 4F2QA 2XX8A 3VVDA 1OVBA 4GL0A 2Q88A 2I0BA 4OYVA 1YCJA 2PMSA 2XXXA 3K02A 1YAEA 3FV2A 3JV9A 4U21A 1SW5A 3Q28A 4DDDA 1IXGA 2UXAA 1B0HA 3L6GA 1B3FA 3S4UA 2AL4A 4AB5A 3VV5A 3TCFA 3H3GA 3E13X 3CFLA 5I58B 3ZSFA 4IO6A 2XXVA 4HCYA 2O68A 2UYEA 4Z7EA 3FXUA 1B4ZA 3GBAA 3S9NC 5ITOA 1SW1A 3KOTA 3OD7A 1RYXA 3SEUA 4IGRA 1UTHB 4PQJA 3T9UA 3CG1A 1DPPA 1A8FA 3N6TA 2GRVA 2QMWA 2GFEA 3MQ9A 3B6QA 1Y3NA 3EF7A 1LCTA 1QVSA 3VLWA 2IEEA 1CB6A 1AIVA 4O3AA 3KZGA 2CMOA 4H1XA 4ELPA 3FVKA 1MH3A 2NVUB 4ELOA 3TUSA 1B7HA 4GWOA 3A3CA 2Z8EA 3TTRA 1EZOA 3VXCA 4OERA 4TLMB 5H8FB 2DWAA 4YKIA 3PUVE 2LAOA 1FQCA 4NF4A 4KR5A 4OHNA 4YKKA 3U93A 4BDMA 1MXWA 3OSRA 2ZYKA 4N6PA 2Z22A 3AXFA 4LZ5A 3KN7A 1JVYA 4MLVA 3E9XA 4ZEDA 1B0LA 3Q27A 1A55A 1LFGA 3LSWA 4ZEKA 1IXCA 2I4BA 3FASA 4QFOA 1MS7A 3T9HB 2VOZA 4HS7A 5ELVA 1LBCA 4X48A 4F22A 2V84A 4QRZA 4IB2A 3KFMA 3U94A 1ELJA 2KLFA 3E4RA 4AB6A 4MBPA 3T9VA 4NEDA 5H8FA 4C0RA 2RC8A 4JDFA 5IKBA 4JSDA 3QYTA 3K2DA 2GHBA 4TOZA 5CC2A 1LAXA 5L8DA 3PV0E 3VLVA 3N26A 4U22A 4OFOA 2B3BA 3O6HA 1QJMA 2FYIA 1VR5A 5H8SA 3PPQA 3TTKA 2F78A 2R6GE 2V3TA 4I1DA 4F1VA 4BDLA 4LQ5A 3CIJA 1M5DA 4I8CA 4QSCA 4F31B 5CM6A 3MPKA 2Y7KA 1N76A 1B52A 2Z8DA 2XXQA 1KWHA 2G93A 3EPEA 4RA1A 3MP6A 1NNFA 2H4IA 3DP4A 3LUYA 5CI5A 5AE4A 4JWXA 4LONB 1N7XA 1QW0A 2HAVA 3FVNA 3N6UA 4XKPA 4OMBA 3MP8A 2I3VA 1PB8A 3H6TA 3SETA 4ZEIA 1GV8A 1MY1A 2F7BA 4YU0A 4YZZA 2F35A 2VGQA 4F18A 2DP8A 3G3HA 3TTMA 2H99A 3HPIA 4G4PA 1JETA 5JTYB 1A40A 5I84A 5AA1A 1DOTA 2XXUA 4WEDA 4FAJA 4DIGA 1EZPA 4PFWA 4UA8A 3QIMA 3Q29A 4R2BA 5TU0A 3IO4A 3V83A 3FUZA 2Z23A 4QF9A 1MM7A 1S50A 3H03A 5KDTA 4ZE8A 5EYFA 4F29A 1MXXA 1NH7A 4K3FA 1Z7ME 1LSTA 1SDXA 2DVZA 4OVJA 3SESA 4FJPA 1Z7NE 4ZE9A 4X9TA 1MQHA 1S9TA 3EHUA 4ZZAA 2OZZA 2QRYA 1MM6A 3WAEA 3CFXA 3IX1A 2F7CA 2XXHA 1P1OA 3LBSA 4G68B 4DXCA 2X7PA 1LCFA 3BBRA 3TODA 1QUKA 1DTZA 3TYHA 5F1QA 1NFTA 3K6VA 3MZ1A 3S9LC 4EQ9A 4LZ7A 1B5JA 1MQIA 1MY4A 5M2VA 3GZGA 5EHSA 1XC1A 4JXIA 3IB0A 4RPNA 3UA8A 4HW8A 3N94A 2ZMBA 3K1MA 2I4CA 4MLQA 5K2XA 5DVJA 4OWDA 1B3LA 3R7XA 1B7UA 2OK2A 3FJGA 4R6HA 2XXPA 1NL5A 3FZVA 1SVXB 2UVGA 4QHQA 3C9HA 3OENA 3QXMA 1Y4TA 2ZYNA 4DXUA 1LFIA 1B5IA 4TQUQ 3FXRA 4FEBA 4U4XA 4IGTA 1MDP1 4BLAA 1F9BA 4OQOA 3BFTA 1M5EA 4NE4A 2D3IA 4Q8RA 4RK9A 4F3BA 3MW0A 4F3SA 4FIMA 1GR2A 3WAFA 1CE2A 1TFDA 3FIRA 2AIXA 3I5OA 3C36A 5EHMA 2RINA 5J1DA 3O66A 3O28A 2P1SA 2ONKE 4PFYA 4R73A 4EDPA 2REJA 3DM0A 3MVZA 3HCQA 4THIA 3MC2A 4G8MA 4IO5A 4EF1A 3O97A 2NXOA 3OO6A 2AL5A 1JEUA 2YLNA 2PVUA 3THIA 1H44A 1D9YA 2A5SA 4YKJA 2UVHA 4ZDMA 3O29A 3PMXA 3T66A 1OVTA 3TFLA 3MVWA 2F6PA 1A7LA 4RY1A 1US4A 1Y20A 3ILTB 1NNPA 4EF2A 2GH9A 1ANFA 2RCAA 5CBRA 1BP5A 3SKPA 3U8QA 3VDFA 3CRBA 4OTEA 4FEDA 4PP0A 5FHNA 5F7VA 2H9BA 3T96B 3HN0A 3TPAA 1UTBA 3IOUA 5H8HA 2F5XA 4L17A 4NWDA 4MF3A 3M3LA 3UK4A 1PBPA 4NF4B 1TT1A 1N7WA 3MVYA 5H8QA 4JSOA 1JQFA 3C35A 4G77A 3OEMA 2NOOA 2AYSA 3U72A 4G8NA 1WDNA 1PB9A 4KPTA 1B3EA 1ATGA 3MJNA 2IA4A 2G29A 2FNCA 3FATA 2ESNA 3QAXA 4OESA 1O64A 4GLIA 1HSEA 4H8JA 1PB7A 2DQVA 4GL8A 3G7WA 4I9DA 4FE8A 3B6WA 3T93B 4WXJA 4EXLA 4RJZA 3RT6B 4BDQA 2W7YA 3U1OA 1FQAA 3GLBA 4M1VA 3UIFA 3CSGA 4OZ9A 2VD3A 4H5FA 3UN6A 4U4SA 4ESXA 3MWBA 2XX9A 3LC8A 2D21A 1B1XA 2O7UA 4F1UA 1IUDA 1MQJA 1OLCA 4NF6A 2H25A 2A5TA 1D3KA 3C34A 4RYAA 1M5BA 3OOAA 3K4UA 4KYDA 4IO4A 4C1TA 2HQ0A 2VHAA 1IZ1A 1MRPA 3HHFA 2QS2A 4MH5A 1XT8A 4ELQA 5TP9A 5DEXA 4QFPA 2O84X 1Y3QA 3MZ9A 1FTMA 1B40A 4H6DA 3Q26A 2ANJA 4F19A 1VE4A 1VSOA 3LSXA 1L5TA 2VP1A 2E0SA 4R74A 4GD5A 3RQTA 1AH5A 3JZJA 4TLLB 1DTGA 1FQFA 1ZTYA 4R2FA 1JEVA 1D4NA 2XX7A 1URSA 1NH8A 5A5XA 3HO7A 2HAUA 2ZYOA 4KCCA 4OXVA 3G3KA 4RPOA 5CMBA 1ZKBA 3K01A 3BKIB 3OEKA 3OO7A 1PDAA 1MQDA 1Q35A 2BJJX 3VFJA 3TKDA 4GXSB 4F2OA 3FJMA 3FJ7A 4QFLA 4R9GA 3K00A 4R75A 3FVGA 4R6KA 4JWOA 4GQOA 4NF8A 5FHOA 2Q2CA 2FA7A 3IOTA 1MXUA 3M3KA 2P0SA 3G3IA 1XS5A 3KG2A 1SI0A 2F34A 2I58A 5B70A 4XIGQ 4KD5A 5KDTB 3VE1B 1N3XA 1MXZA 3SEXA 2DXYA 2RKMA 4R9FA 4WEPA 1Y1MA 2XXTA 1S7YA 5DTBA 3T9XB 3S9EA 5CMCA 2Q8JA 1B1HA 1B32A 4F3GA 4QSEA 4YAHX 4DCYA 2ABHA 3W15C 1B51A 4KYSA 1OQGA 3KJTA 4YMAA 4MFIA 3KJ7A 2DSFA 2RF1A 1PEBA 3GBBA 4IY6A 3I3VA 2Y7RA 1MDQA 4PFTA 3TTLA 5AA2A 3K6UA 3TQWA 2PX1A 4ESWA 1FCKA 3G3JA 4IY5A 4JWYA 5I59A 3IOWA 1I6QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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