4JWXA

Glun2a ligand-binding core in complex with propyl-nhp5g
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
280
structure length
280
Chain Sequence
b'NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGICHA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GluN2A
publication title Structural determinants of agonist efficacy at the glutamate binding site of N-methyl-d-aspartate receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Unknown function
total genus 94
structure length 280
sequence length 280
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jwxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jwxA02
1ATGA 3LBSA 4RYAA 1D9YA 4RPNA 3VLVA 1OQGA 4YICA 2M8CA 3C4MA 4YKPA 5CM6A 2YJPA 2QMWA 1WODA 3T22A 1N84A 2THIA 4EDPA 1QVSA 2Y7KA 3O66A 1LBCA 4LATA 4LUBA 5JTYB 3MBPA 3A3UA 3RT8A 3JYRA 1DOTA 4JXIA 5HM4B 1GGGA 3IOUA 2YPNA 4RNSA 3TCGA 1WDNA 5TP9A 3TTMA 1P1QA 1I6AA 2DWJA 3FD3A 4EF2A 3FIRA 3SEUA 3KOTA 5AA2A 1OVBA 2O68A 3P7IA 1B4ZA 1XOCA 3KN8A 1MDQA 4MH5A 2F7AA 1B9JA 4H0WA 2RKMA 1MQGA 3QUFA 3K1PA 1Y20A 2DVZA 2V84A 2HAUA 4U23A 3K01A 2DE3A 2I0BA 2I6EA 1T0KA 3R7XA 3PUWE 2AIXA 5DT6A 4F1YA 4U1OA 4E0XA 4R73A 1LB9A 3IB1A 1UTHB 5B70A 4JSDA 3E13X 4FECA 3M3LA 1SW4A 1LGBC 1MXZA 1PB8A 4OEUA 1II5A 3VFJA 5BUUA 3FVGA 3MP6A 2A5TB 4G8HA 3C35A 3O6IA 4ZEFA 3MC2A 4QF9A 2B3FA 3KG2A 1MDP1 4E0WA 4KR5A 4ESWA 1JW4A 1O63A 4KQPA 1Z7NE 1FQCA 5H8NB 1NFTA 2F34A 4G2ZA 2AL5A 2Z22A 5BWJA 1MQHA 4BDMA 2WKYA 3MJNA 4MF3A 4NF5B 3KJTA 1M5EA 3FVOA 2XX8A 4HS7A 4OXVA 2PVUA 5JK4A 3KSXA 1AOVA 4XKPA 5J1DA 1UTBB 3PMVA 1QUJA 3LC8A 3VXBA 3CFLA 3M8UA 4LQ2A 1UIUA 5CI5A 4O3AA 1SW1A 4HW8A 4G68A 3CSBA 2I49A 3S2VA 4DLDA 1MXWA 2PMSA 2V3UA 4OFLA 3B6WA 3AXFA 2O84X 2CMOA 2GHAA 3TQWA 3QSLA 4IY5A 3TODA 5F7VA 3TYHA 2GHBA 2X26A 2NVUB 1QUKA 1MY0A 3IAZA 4IGRA 3RTFB 1YCJA 1H45A 2Y7PA 3FATA 4G77A 4BDOA 3K00A 1SVXB 3DP8A 2QS3A 5FTIA 3C33A 2X7PA 4JDFA 2P2AA 5H8SA 4GLIA 2REJA 1ZU0A 5CMCA 3HN0A 3IB0A 4MLQA 2Z8FA 1S50A 3FXRA 1B1XA 4ND9A 3TMGA 3K4UA 2X7QA 2XXPA 3LSWA 4YB5A 1D9VA 1Y1ZA 5H8FB 4FORA 5I2NB 3R26A 5L9MA 1MY2A 4N07A 3PUXE 1IITA 4Q8RA 3CIJA 2FYIA 1B40A 3CI8A 4ZS9A 4F18A 2QS4A 4OFOA 4F1UA 3MVXA 4POXA 2DE4A 2F5XA 3H06B 2D5WA 5B7DA 1N04A 2XXWA 4BDLA 2H5YA 3PGFA 3TPAA 1IXCA 1S9TA 4QRZA 2H25A 4G68B 2ALUA 4XIGQ 3H7MA 4YB7A 1B3HA 1Q1KA 3N6TA 3K6XA 4LP2B 4FAJA 2NUVA 2F7CA 1P1UA 1XHYA 5AA3A 4O3CA 4GD5A 4BDRA 3GZGA 2ONRA 4R9GA 3OO7A 3TKDA 4ISUA 4KD5A 1URGA 1EZOA 4BDNA 1GV8A 4PFTA 4OYVA 3B6TA 1SYHA 3PUVE 1NKXA 1M5BA 4JWOA 3ZKKA 2NOOA 3G3HA 5TU0A 4M4GA 3S9LC 3SDFA 3K6UA 4IO7A 3FXUA 4ZDMA 2XXQA 2XXUA 3OD7A 3IJOB 4IB2A 4FATA 4LQ5A 3N26A 3RTWB 2UYFA 1M5DA 3CG1A 1TWYA 1HSLA 1Y3NA 2B65A 4F3PA 1I6BA 1A99A 2RC7A 1B58A 4PFUA 4R9FA 4FE8A 5CC2A 3C9HA 2YLNA 1LFHA 1EU8A 2F7BA 5M2VA 3MAMA 5JTYA 2F6PA 2F78A 5CMBA 5ICQA 4P0IA 2I3VA 4F22A 3MWBA 4F3SA 3EHTA 4K3FA 3V8XB 2ABHA 2RC9A 3TCHA 1VFEA 1B46A 3GBAA 3Q26A 3SEYA 3E4RA 5LOMA 2F8DA 3KSJA 2O6AA 2XXXA 4H8IA 4L17A 4FJPA 1MPBA 1PBPA 3PD8A 1IXIA 2XX7A 4QSCA 3IJXB 3V89B 3WAEA 3LR1A 3TAJA 5EHMA 1JW5A 4F3GA 3TTRA 1URSA 3M3FA 4LA9A 5HPQA 3RQTA 2ZYNA 4HCWA 2R71A 2AL4A 1OIBA 2V93A 1US5A 3HHFA 1OLCA 2QS2A 4RA1A 3O9PA 5AA2D 3ZS6A 2A5SA 2ZNUA 1HSEA 1UTHA 3TTLA 2XD3A 2ZYKA 2E0SA 1XC1A 2F35A 3MZBA 1SD3A 3K2DA 3L6GA 5TPAB 3DLNA 4PE5B 4YKIA 2XX9A 1ZMGA 5DYHA 4OQOA 4DCYA 4UA8A 5ISUA 2QRYA 4ZECA 2A5TA 5I59A 1HSJA 3IO6A 4R6HA 3TTKA 3KFMA 4XXUA 3G7WA 4AB5A 4JBZA 4G4PA 2IA4A 1S7YA 3VV5A 1ZIUA 3PPQA 4LZ7A 4OTEA 2D3IA 2OLBA 5DEXB 3IO4A 4EQ7A 1QUIA 1B7UA 2G29A 4QFPA 3BFUA 3G3KA 3N94A 1AL3A 4LZ8A 4OFJA 5H8NA 3MQ9A 4JB7A 4PP0A 1SW2A 4EQBA 4NF5A 4OWDA 1UQWA 4KCCA 3H6TA 4BDQA 1LAFE 1IIWA 4EUOA 3JZJA 4EXKA 2R9JA 1PDAA 1MXXA 1UTBA 1R9QA 2PBWA 3LSLA 1B7ZA 2XXRA 2PX1A 4H67A 2AYSA 3K6WA 4MFIA 3M3KA 4YMBA 1MQDA 3OSRA 1LAHE 4G8NA 2QL3A 5EYFA 1L5TA 4X9TA 1OVTA 2V3QA 1QKBA 4NF6B 4GOTA 3EHUA 4MBPA 3DM0A 1ZBMA 1NNTA 3FJGA 4H5FA 1LB8A 3KOSA 1LCFA 3CFZA 2UVJA 5ITPA 3QYTA 4LONB 3HPIA 1SI1A 5DVJA 2PT2A 4F2QA 3H6VA 4XKQA 4ONYA 5I59B 3SETA 1YTVA 4QSEA 1FQFA 3RY3A 4GIZA 2G93A 5H8HA 3FVKA 3OEMA 4H6DA 1AH5A 2OWTA 1USYE 2HEUA 5FHMA 4U22A 3G3GA 1DMBA 3VLWA 3A09A 4ZE8A 1JQFA 3PUYE 2I58A 3KJ7A 3B6QA 2ONSA 5H8FA 3T66A 3T9XB 5I2NA 3VXCA 2DSFA 3FJMA 4FEDA 3O2AA 5K2YA 4HTGA 4YU0A 1LFGA 2UYEA 3VVFA 3IX1A 3GBBA 3UIFA 3FUZA 2Y7WA 5AA1A 2DWHA 1B5IA 1SW5A 1Z7ME 3R6UA 1IXHA 5I2KB 4QFLA 4IY6A 3PPPA 1MXVA 3FXQA 5IAIA 3DELB 3MW0A 4Z7EA 3MZ9A 1GVCA 4DZ1A 2LAOA 3U1OA 3MPKA 3USDA 2GRVA 3W15C 3JV9A 4RK9A 1N7XA 1MRPA 3LSXA 3SEWA 3THIA 1FTKA 3TDJA 1JVYA 3KGCA 4KPTA 2F97A 1SYIA 1IXGA 5I56B 4ZEKA 2PT1A 1RKMA 2DXRA 3T96B 1DPPA 3TUSA 3KN7A 1EZPA 1KWHA 3ILUB 4ELRA 3RN8A 1DPEA 1R9LA 1YAEA 4R6KA 4U4XA 3KBRA 1MY1A 4YMAA 2OCUA 1SBPA 1B3LA 3HO7A 3IK6B 5H8HB 3HCQA 4N6PA 4NF8B 4ELQA 1F9BA 3V5AA 3TQLA 4PFYA 1LAXA 2I0CA 1LCTA 2RF1A 2UVIA 4IO2A 2ZXTA 1RYXA 2FNCA 5JEIA 1A54A 4Q5TA 3CR9A 2V3TA 3D4CA 1B3GA 1TXFA 2FA7A 4PETA 1AIVA 1IUDA 4HCYA 1P99A 1GTKA 3SERA 4KYEA 1D4NA 4WXJA 4ZE9A 2NXOA 2DWAA 4DIGA 4ESXA 3T9HB 4P0GA 1B3FA 3IORA 1MM6A 3O97A 4KYDA 3H4ZA 3S4UA 2UXAA 4U21A 3K1NA 5IKBA 1OQHA 1TFDA 3K1MA 2VD2A 3OEKA 4H1XA 4MLVA 4X48A 3Q25A 1VFDA 1EH3A 3VDFA 1LFIA 3K6VA 3IOWA 4KYSA 4AQ4A 5A5XB 4F29A 3SKPA 3C36A 2O7UA 1BIYA 1JNFA 1MG1A 5L9OA 3Q28A 3OO8A 1VE4A 5FTHA 2XHDA 4Q30B 3E3KA 1Q35A 1JEUA 4U4SA 3UK4A 4DXUA 2GFEA 1VSOA 3IL1B 4I62A 5TPAA 1NH7A 2Y84A 4NEDA 5DTBA 1JW1A 4IO6A 1PB7A 2XXHA 2VD3A 5I57B 4QFOA 4NF4B 2XXTA 4OETA 2E1SA 3O6GA 1IEJA 1B2HA 3DP6A 2BJJX 2RINA 4ZEDA 1LAGE 4GRKA 3ZSFA 1BP5A 1A8FA 3HHGA 4U2RA 1N3WA 1WVJA 3H03A 5DEXA 1SI0A 4RPOA 4RY1A 4TQUQ 3EQ1A 2QMXA 4BLAA 3ZKLA 3WAFA 3CSGA 3PPNA 4POWA 4JWYA 5L9SA 2DP8A 3B7DA 2OBGA 3RNNA 1H3DA 4PQJA 2Q8JA 2O51A 4OMBA 3U72A 3O29A 4GL8A 3W9WA 4OERA 4GFRA 5KDTB 2VHAA 1A7LA 4NWDA 4I9DA 3SEVA 3FV1A 1JVXA 2DE2A 4NF6A 4NMYA 2ESNA 1VR5A 5ICTA 4X1DA 1B5HA 4KHZE 1Y3PA 1MQIA 2HXWA 4GVOA 4R6YA 1URDA 1QULA 1ZTYA 4QHQA 3ONMA 3MPLA 2DVCA 2REGA 1ZKBA 3PMWA 2I4BA 3FASA 4JWXA 3UN6A 4KFQA 4WEPA 1FQBA 1FTMA 3Q29A 2Q89A 4ELOA 4KCDA 3SESA 2QJEA 1Y4TA 3EN3A 3MP1A 3OO6A 3VLUA 2I3WA 4C1UA 3IB2A 5KCJB 4Q0CA 4RJZA 4ECFA 2OZZA 3S9MC 1R6ZA 4PFWA 2DXYA 1FTJA 1XVXA 1AMFA 3PD9A 5CRYA 1BLFA 1LSTA 3RPWA 4DXBA 2XXYA 1NH8A 1B7HA 4TOZA 1MH3A 2VP1A 3CVGA 4YB6A 4GXAA 1SQYA 3GLBA 4XKNA 3QXMA 2ANJA 3G3FA 2HFBA 4UACA 1NNFA 4I1DA 1Y1MA 4R75A 3QK6A 3U93A 1D3KA 5I2KA 1DTGA 1MH4A 2B3BA 3KN3A 1PB9A 5DVFA 1IQ7A 1BTJA 4FIMA 2UVGA 4F31B 2O1MA 3H6WA 2P1SA 1O64A 1NMUA 5F1QA 5H8QB 1B52A 4TLLB 1Y4CA 5AA4B 5CMKA 1NL5A 2D21A 2R6GE 1Y9UA 1Y3QA 1XVYA 1J1NA 1NNKA 2H9BA 5I84A 4LVQA 5I56A 1ELJA 1MM7A 5CBSA 4O3BA 3K02A 3W9VA 3G3IA 1OMPA 2DYXA 1ZJLA 4R74A 1FW0A 1XS5A 3EPEA 4YKKA 4DE8A 4QSDA 4NE4A 4NF8A 4OEVA 4ZZEA 3CFXA 2ZYMA 3RT6B 3TTNA 1TT1A 4THIA 3T93B 3C34A 3PMXA 2Q9TA 4DXCA 2OWSA 3G3JA 1A8EA 2O7IA 1US4A 4ELPA 2H4IA 4XTCQ 3LUYA 5L8DA 3TFLA 2F36A 1IZ1A 3K0VA 3OMBA 4ZEBA 3KEIA 3KZGA 1EZ9A 1LBBA 4OENA 3O28A 1B32A 3Q27A 3A3CA 2QS1A 3DP4A 4RK2A 5TP9B 5ELVA 1B0HA 1N3XA 1B05A 3OELA 2O1LA 3RLFE 2PYYA 4GWOA 4GF8A 3FVNA 1ZLQA 2ZYOA 4P11A 1I69A 3EF7A 3HSTA 5AA2B 3HV1A 2ZMBA 1POTA 4WKMA 5A5XA 1MXYA 4DCXA 4F19A 1FTLA 1TFAA 3UP9A 3U8QA 2P0SA 2IEEA 4XKRA 2Z8DA 3C31A 2QPQA 1R1NA 3UORA 2H98A 4YAHX 1MPDA 3RUMA 1N76A 1SDXA 1LLSA 2HQ0A 4YZZA 1FQDA 1B1HA 3BFTA 4OVJA 3D4GA 5I57A 2RC8A 4NF4A 1P1WA 3EHSA 2V25A 4H65A 3TZAA 1CB6A 2ZNSA 5K2XA 2KLFA 1USYH 4WEDA 3U94A 2Y7IA 4OHNA 3TELA 3VVEA 1B4HA 3QIMA 2RCAA 2QSXA 3N6UA 4NWCA 3SEXA 3MVWA 3BBRA 3IOTA 3VVDA 3E9XA 1B51A 3MUQA 1MY4A 1NNPA 1MQJA 3OXNA 4R72A 3MVYA 1XT8A 2DWIA 3O6HA 4G8MA 3VE1B 3H6UA 1PC3A 4OESA 3S9EA 5FHNA 4NTLA 2OJTA 3S9NC 3L6HA 4IO3A 1RYOA 1A55A 2DQVA 3I6VA 2F6GA 2DS9A 3IR1A 4F1VA 1QJMA 3CG3A 4GXSB 2XD2A 3PUZE 2GH9A 5KDTA 4DDDA 4KI0E 3UA8A 4YKJA 5EHSA 3FZVA 3V83A 1N0TA 5I58A 2RCBA 3OO9A 1QKAA 1FCKA 1FQEA 5AE4A 4GQOA 2ZNTA 4M1VA 2XXIA 1H43A 3PPOA 3IOVA 3OSQA 4IGTA 5CMMA 3CRBA 4TLMB 2W7YA 3OOAA 4EQ9A 1POY1 1M5CA 1B5JA 2ONKE 4FEBA 1ANFA 1FQAA 2Z8EA 2Y7RA 2XXVA 4GL0A 2HZKA 3TEPA 3PPRA 3N5LA 1B6HA 2HZLA 3ODBA 4F2OA 4H5GA 5KCJA 1H76A 3FV2A 1I6QA 3F11A 3ILTB 4Z0IA 1P1OA 4R2FA 4H8JA 4OZ9A 4G68C 2O69A 1DTZA 2I4CA 4I8CA 1DSNA 3UGWA 3QUJA 3QAXA 1H44A 4QFKA 1A40A 1FTOA 4C1TA 1PBQA 5DVIA 1M5FA 4LZ5A 1MPCA 3MVZA 4EXLA 4ZZAA 1CE2A 4AB6A 2Q2CA 2HAVA 1MXUA 1PEBA 2H99A 2NWJA 3U92A 1UIVA 4EF1A 1B3EA 5CBRA 4ZEIA 1B0LA 2I48A 1MS7A 2OK2A 1OLAA 4QFNA 2HCAA 3OENA 3I3VA 5I58B 5KZTA 5H8QA 3MP8A 4F3BA 2Q2AA 1N7WA 1YPNA 2UVHA 5AA4A 1P1NA 1O7TA 5FHOA 4N13A 3PV0E 1QW0A 2VGQA 3RGYA 4U1ZA 3GXAA 3T9VA 4R2BA 3T9UA 2VOZA 4JSOA 3MZ1A 3C32A 3TCFA 1BKAA 1JEVA 3FJ7A 1MY3A 5HBCA 1GR2A 5ITOA 2CZLA 2DOJA 3I5OA 4F39A 4IO4A 4X1BA 3ECRA 4IO5A 3PU5A 3FGSA 3H3GA 2Z23A 4RXLA 4C0RA 1JETA 3BKIB 2Q88A 3LSFB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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3FVOA 2XX8A 4HS7A 4OXVA 2PVUA 5JK4A 3KSXA 1AOVA 4XKPA 5J1DA 1UTBB 1YZ0A 3PMVA 1QUJA 3LC8A 3VXBA 3CFLA 3M8UA 4LQ2A 1UIUA 5CI5A 4O3AA 2FBPA 1SW1A 4O7MA 4HW8A 4PGNA 4G68A 3CSBA 2I49A 3S2VA 4DLDA 4XFEA 1MXWA 2PMSA 2V3UA 4OFLA 3B6WA 3AXFA 4OVPA 2O84X 1IMCA 2CMOA 2GHAA 3TQWA 3QSLA 4IY5A 3TODA 2V4CA 5F7VA 3TYHA 2GHBA 1FBDA 2X26A 2NVUB 1QUKA 1MY0A 3IAZA 4IGRA 3RTFB 4N6DA 1YCJA 1H45A 2Y7PA 3FATA 4G77A 4BDOA 3K00A 3A29A 1SVXB 3DP8A 2QS3A 5FTIA 1FSAA 3C33A 2X7PA 4JDFA 2Y5KA 2P2AA 5H8SA 1FBPA 4PF6A 4GLIA 2REJA 1ZU0A 5CMCA 3HN0A 3IB0A 4MLQA 2Z8FA 1S50A 3FXRA 1B1XA 4ND9A 3TMGA 3K4UA 2X7QA 2XXPA 2Q74A 3LSWA 4YB5A 1D9VA 1Y1ZA 5H8FB 1FPFA 4FORA 2XA5A 5I2NB 3R26A 5L9MA 1MY2A 4N07A 4N81A 3PUXE 1IITA 4Q8RA 2HHMA 3CIJA 2FYIA 1B40A 3CI8A 4ZS9A 4F18A 2QS4A 4OFOA 4F1UA 1NV4A 3MVXA 4POXA 2DE4A 1K9ZA 2F5XA 3H06B 2D5WA 5B7DA 1N04A 2XXWA 4BDLA 2H5YA 3PGFA 3TPAA 1IXCA 1G0HA 1S9TA 4QRZA 2H25A 4G68B 2ALUA 4XIGQ 3H7MA 4YB7A 1B3HA 1Q1KA 3N6TA 3K6XA 4LP2B 4FAJA 2NUVA 2F7CA 1P1UA 1XHYA 5AA3A 4O3CA 4GD5A 3U65A 4BDRA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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