4JWXA

Glun2a ligand-binding core in complex with propyl-nhp5g
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
280
structure length
280
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGICHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural determinants of agonist efficacy at the glutamate binding site of N-methyl-d-aspartate receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Unknown function
molecule keywords GluN2A
total genus 94
structure length 280
sequence length 280
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jwxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jwxA02
4OWDA 2HEUA 3TELA 3H7MA 2F6GA 4U4SA 1LFGA 4JBZA 3LSXA 3N26A 1GGGA 4YAHX 2HFBA 1A8EA 3MPKA 3MW0A 3VV5A 1OLAA 2ZNTA 1B9JA 4DXUA 3MZ9A 3TCGA 1Y9UA 4F1UA 1LAFE 1QW0A 3VLVA 4IO7A 4AB5A 1LAXA 4MF3A 1FQFA 2VHAA 4FEBA 1N84A 2I3WA 1KWHA 4DE8A 3A09A 2DWJA 2ZYKA 1B5HA 2XXUA 1DPEA 1QKBA 3TTMA 2QS1A 4MLVA 3Q26A 1OIBA 4OFOA 2DE2A 1NFTA 2AL5A 3DM0A 3KZGA 4RY1A 4U1ZA 5H8QB 4R75A 3TTNA 3DLNA 4FATA 4PQJA 2UYEA 3QSLA 3G3KA 3CSBA 1B0LA 2B3BA 2XX7A 1QUJA 1S9TA 2H98A 4PFUA 4EXLA 3PD9A 5KDTB 3TZAA 3ILTB 2A5SA 3JYRA 3S9EA 1OMPA 3G3FA 2P1SA 4NF8B 4KI0E 1ANFA 2RKMA 3LC8A 3C9HA 1OQGA 1ELJA 2Q89A 3HN0A 5K2XA 3VFJA 4F31B 5H8NB 3IJXB 2HAVA 4QFNA 4G2ZA 4QHQA 4R74A 3VLWA 1QULA 2QS4A 4KYEA 5I2KA 3T9XB 2QSXA 4OXVA 4Q5TA 1B5JA 2F34A 2H25A 3FZVA 4THIA 3ZS6A 3E13X 2F7CA 2E1SA 1MDP1 4ECFA 2I0BA 3HSTA 2DXRA 2G29A 4KD5A 3DP4A 1EZOA 3RUMA 3IO4A 4UACA 2D3IA 3Q28A 2D21A 4RJZA 1QUIA 3EN3A 1ZTYA 2XXPA 4JWXA 1IUDA 1ZMGA 2NVUB 3O6GA 4H8IA 2R71A 1HSJA 2D5WA 4HTGA 3KBRA 1UIVA 1B3GA 1NNPA 2VD3A 2A5TB 1M5DA 3GLBA 2F7AA 3K0VA 4PFYA 5TP9A 1O7TA 4QSEA 2F5XA 2DSFA 1LBCA 1B0HA 3THIA 3OELA 1DSNA 1PBQA 1Q1KA 1SQYA 3OSRA 3UGWA 2XXWA 3IOUA 1JNFA 2DE3A 2P2AA 3UP9A 3K00A 3HHFA 3TDJA 3RNNA 3P7IA 3QK6A 4PFTA 1L5TA 4F3BA 3H6TA 5I2KB 2V3TA 3U72A 4F3PA 2DP8A 3DELB 4M4GA 2QS2A 1GVCA 5H8SA 1MRPA 2YJPA 3ONMA 3PUWE 2ABHA 4ELRA 3N94A 3T93B 1A55A 2OWSA 2I49A 4K3FA 3GXAA 4LQ2A 1FQDA 1UIUA 3K6WA 5H8FA 1CB6A 5I2NB 1DTZA 3N6UA 1JW5A 3I6VA 2YLNA 1FTMA 3OO7A 1D4NA 5TP9B 3VLUA 4F1YA 4BDMA 5I59A 5DT6A 3I5OA 3OEKA 5EHSA 3TFLA 5ISUA 5CM6A 3GBBA 5AA2D 4LZ8A 2V25A 1OVTA 1HSEA 3KGCA 3CFZA 2GFEA 5DTBA 4KYDA 1T0KA 3TTLA 1XC1A 2I48A 1R9LA 2VD2A 2QS3A 2ZYNA 2ZNSA 3IB0A 3IJOB 2F6PA 4JWOA 4NEDA 2FA7A 2O7IA 2Z8EA 4OYVA 1N7WA 4RXLA 3IOWA 1M5FA 3UA8A 4POWA 4C1TA 3MQ9A 3T22A 5I2NA 4R2FA 4FORA 5B7DA 3H03A 3KG2A 3I3VA 2NWJA 3CFXA 1JEVA 3EF7A 3KN8A 4OFJA 5H8NA 2Q8JA 4YICA 3UORA 3ZKLA 4F39A 4I8CA 4LZ5A 3T9HB 1P1NA 1WVJA 2QL3A 3EQ1A 4PP0A 5CI5A 4R6KA 2DWIA 3GZGA 3H4ZA 2XD2A 2ONRA 4ZE8A 4JB7A 1B51A 5CMCA 5BWJA 4WEPA 2O1MA 1NNTA 1SDXA 4YB6A 1B3EA 2P0SA 4R73A 3KFMA 3QYTA 2F8DA 2X7PA 4NF6B 4ZEFA 1B58A 1Y3PA 5KZTA 5H8QA 2I0CA 4OVJA 4Q0CA 1B3LA 4GFRA 1JETA 1II5A 1P1OA 4RK9A 1N3XA 1YCJA 3ZKKA 5AA2B 1MQIA 1MXUA 2F7BA 2Q2CA 4NWDA 1LSTA 1RYOA 1B3HA 3IO6A 3QAXA 3TYHA 3VDFA 4GL8A 4OHNA 4HCYA 1MG1A 4EF1A 3FJGA 2G93A 2H5YA 1D3KA 4NF4A 5EHMA 3D4CA 2OK2A 4IB2A 4BDQA 1FQAA 2DQVA 1Z7ME 3MVWA 4F18A 4R6YA 4X48A 2ZYMA 1LCFA 1YAEA 4GVOA 3G3GA 1Y3NA 1A7LA 1EZ9A 2W7YA 2Y7KA 3PUYE 4XKQA 4ND9A 5F1QA 4P0IA 4EQ9A 2IA4A 3E3KA 3K02A 4G68A 4ESWA 4OENA 2OJTA 4OERA 1DMBA 3PMVA 3CIJA 4YKPA 1MPBA 1SW4A 3UIFA 1B6HA 1ZBMA 1SW5A 2XXXA 3MP1A 4H5GA 4H6DA 4MH5A 4Q30B 3K2DA 4TOZA 3PU5A 4FJPA 4IGRA 4KR5A 4MLQA 2HXWA 2V93A 4U22A 3TEPA 2PVUA 2X7QA 2Z8FA 3K4UA 4ZDMA 1N7XA 2UVJA 3FV1A 3OMBA 1VFEA 4TLLB 3SEVA 3MUQA 3FVGA 1RKMA 3MVXA 4O3AA 2R9JA 1TWYA 4OFLA 4IGTA 1LCTA 2QRYA 1AIVA 4LP2B 3RY3A 4YKJA 1JQFA 3G3IA 3ODBA 5ICQA 1P1UA 4F1VA 1FW0A 5A5XA 1RYXA 1XVXA 4H8JA 4QF9A 5I58B 1MH3A 1AH5A 3FVNA 3O2AA 5CBRA 5HM4B 2NXOA 3FGSA 5I57B 3T9VA 1MY0A 4Z7EA 3F11A 3CRBA 3KOTA 3SEWA 2CZLA 4F19A 4PETA 4WEDA 3SKPA 4E0WA 3H6VA 4KCCA 4U4XA 3K6VA 1B1XA 3TUSA 1TXFA 3SETA 1MPCA 1JW4A 4RA1A 3M8UA 1SI0A 3QXMA 3TQWA 2DVZA 4G8MA 4FIMA 1FQEA 4NF4B 2UVIA 3S2VA 1NNKA 3VE1B 4C1UA 4I9DA 1LFIA 2VP1A 4R6HA 3RPWA 1S7YA 5TU0A 1SI1A 1PB8A 1N0TA 5JK4A 1B2HA 3C36A 1B7ZA 2UYFA 1SYHA 3SDFA 2I3VA 2CMOA 2Q9TA 4R72A 4OESA 4YKKA 1A54A 1ZJLA 5H8FB 3OO6A 1M5BA 3OEMA 1SBPA 5M2VA 4IO4A 4MBPA 3PUZE 1URSA 1UTBB 1ZKBA 2RCBA 1VFDA 2VOZA 3RN8A 3TTKA 4ZE9A 3ILUB 3LSLA 5DEXB 4YU0A 2Q88A 3CR9A 3IB2A 4WKMA 5EYFA 1O63A 1XHYA 3MZ1A 3S9LC 3L6HA 4DCXA 4H5FA 4XXUA 4ZZEA 1N3WA 3SERA 3LUYA 3LR1A 1UTBA 3H6WA 1XVYA 2I58A 3IOVA 4IY6A 4X9TA 3Q25A 3TAJA 3TPAA 5AA3A 1PC3A 1LFHA 1QVSA 2QMXA 4JSOA 3M3LA 1N76A 5CMKA 2ZYOA 2KLFA 2XXYA 2Z8DA 3IK6B 3Q29A 1M5CA 2V84A 3PPPA 3QUJA 5CMBA 3TCFA 1LLSA 4EF2A 2ANJA 3B7DA 3GBAA 4KFQA 5DVJA 3KSJA 1XS5A 2VGQA 4O3CA 3W9WA 2Q2AA 4OZ9A 1ZLQA 4NF5A 5LOMA 4ONYA 2V3UA 1Y1ZA 3OO9A 1A99A 1NL5A 3V89B 1MY3A 4KCDA 3A3CA 4LVQA 4U1OA 5CMMA 1MQHA 3U1OA 1GR2A 3LSFB 4IY5A 1B52A 4GL0A 5ELVA 2OZZA 3S4UA 1Q35A 1H44A 1LGBC 4R9GA 3SESA 3W9VA 1ATGA 1IXIA 2LAOA 2RINA 1B4HA 2DS9A 3FASA 4NF8A 2PX1A 4GXAA 5BUUA 1GV8A 1R9QA 5DVFA 5KDTA 3T66A 2XXRA 5DVIA 3M3KA 3IR1A 1B7HA 3FJ7A 4FEDA 4POXA 1PB7A 3N6TA 5TPAB 3FIRA 4JDFA 4ESXA 2XHDA 1N04A 3IAZA 3OXNA 5H8HB 4DXBA 4E0XA 1XOCA 2PT1A 1BKAA 5CC2A 3TODA 4HW8A 3PPNA 1MXYA 1YPNA 2PBWA 4ZEKA 2O6AA 3EHTA 3K01A 2ZMBA 3B6QA 1MXXA 3KJ7A 2REGA 1POTA 1MM6A 1NNFA 4OQOA 1QKAA 3C33A 1JVXA 1LB9A 1URGA 2HAUA 1TT1A 2RC8A 3EPEA 3G7WA 1LAGE 4H0WA 2DXYA 1H43A 4IO3A 5ICTA 4R2BA 2FNCA 3IX1A 4OEUA 1MXWA 3RTFB 2OWTA 3O9PA 4TLMB 3RT6B 1B46A 3V5AA 5HPQA 1UQWA 3MBPA 1Y3QA 3DP6A 1AOVA 3RT8A 3QUFA 1MQDA 1PB9A 2XXQA 3C32A 4BDNA 4DCYA 1TFDA 4XTCQ 4GQOA 4KPTA 1FCKA 1NH8A 2RC7A 4YMBA 1B05A 3O97A 4XIGQ 4GF8A 5L9MA 5AA4B 3KN7A 3ZSFA 4GWOA 1Z7NE 4OEVA 1I69A 3PMWA 2B3FA 4BDRA 1D9VA 2I6EA 4ZS9A 1USYE 2OBGA 3V83A 3HO7A 1WDNA 1IXHA 1H3DA 4RPNA 4KHZE 3H6UA 3CSGA 3LSWA 1BLFA 4OMBA 3UN6A 1AL3A 4PE5B 5DYHA 3IL1B 4U2RA 1M5EA 3PV0E 1WODA 4GOTA 5A5XB 5I58A 4YKIA 5ITOA 1VE4A 2NUVA 3FV2A 1OQHA 1SYIA 3HV1A 4LUBA 4OTEA 5FHMA 3VVFA 2O84X 2DOJA 5CRYA 2THIA 3WAFA 4WXJA 3KSXA 3IOTA 2O1LA 3B6TA 4JSDA 5FHOA 2F35A 2XXVA 2BJJX 2HZLA 3HCQA 2DVCA 4IO2A 1POY1 2I4BA 1CE2A 3QIMA 4GXSB 3FXQA 3TMGA 2HCAA 3W15C 2RF1A 1D9YA 3C4MA 1P1WA 3L6GA 2QPQA 1TFAA 2ZXTA 3MAMA 3O6HA 3O66A 3R26A 4DZ1A 3PMXA 4R9FA 1R1NA 4EQ7A 4I1DA 5KCJB 1BIYA 1MXZA 2UXAA 1MPDA 5AA4A 1FTJA 1MS7A 3K1MA 1F9BA 2M8CA 3OOAA 4G68B 4ZZAA 5JTYA 2UVHA 3CFLA 3O29A 4H1XA 2Y7WA 4LZ7A 5AA1A 3TTRA 4F2OA 3S9NC 1JVYA 3KN3A 3T96B 4ELQA 3G3JA 1NH7A 3DP8A 2I4CA 3M3FA 4LQ5A 4ZEIA 3RLFE 3RTWB 3PD8A 3U92A 4NF5B 3C31A 1LB8A 4GIZA 1FQCA 1SVXB 3LBSA 2RCAA 3BFUA 3PGFA 4L17A 1DTGA 2DE4A 1BTJA 1OLCA 2XD3A 4PFWA 3KJTA 4F3SA 3MC2A 4RNSA 2ALUA 4YB7A 1A8FA 4ELOA 3O28A 1MM7A 2FYIA 4ZEDA 2O68A 1JEUA 2DWHA 1B7UA 1YTVA 2XX8A 1US4A 3H3GA 2H99A 2PT2A 5AA2A 3AXFA 3O6IA 4HS7A 4U23A 4EQBA 3U94A 5I59B 3EHSA 4KYSA 4XKNA 5TPAA 4BDLA 1H45A 1OVBA 2Z22A 3IB1A 3KOSA 2O7UA 4HCWA 4H65A 1FTKA 3RQTA 2Y7PA 2ZNUA 3U8QA 1NKXA 3E9XA 3D4GA 4DIGA 4KQPA 1UTHB 1Y4CA 3JZJA 4MFIA 4AB6A 4FAJA 2R6GE 3CG1A 2RC9A 4BLAA 1URDA 2XX9A 4EDPA 1IITA 3ECRA 4FECA 4QFPA 5B70A 1EZPA 2Z23A 5L9SA 1P99A 3MP6A 3MWBA 2ONSA 4TQUQ 3SEYA 1R6ZA 4N6PA 4X1DA 3TKDA 3MPLA 4DXCA 3VVEA 4N07A 4QRZA 4G4PA 4XKPA 2XXHA 4DDDA 3OD7A 4I62A 1XT8A 1I6BA 3MP8A 4O3BA 4F3GA 4F2QA 4ZECA 3BBRA 4JWYA 1QUKA 1QJMA 1US5A 3RGYA 3SEXA 5IAIA 1GTKA 1MY4A 2V3QA 1PDAA 1S50A 2OLBA 4F29A 1VSOA 3V8XB 1FTLA 1Y4TA 2DWAA 2GHBA 3K1PA 4G77A 2QMWA 4XKRA 4C0RA 5AE4A 1DPPA 5I56B 5H8HA 3BFTA 4NMYA 5IKBA 3HHGA 1I6AA 4LONB 1IQ7A 1B4ZA 2GH9A 3UK4A 1B1HA 2E0SA 3FD3A 3E4RA 3KEIA 4NTLA 5FHNA 2X26A 3IORA 4FE8A 4G68C 2Y84A 4OETA 1EU8A 3PPRA 3WAEA 3R6UA 3A3UA 4X1BA 3C34A 1UTHA 1Y20A 2O69A 4QSDA 5DEXA 1BP5A 3FXUA 4EUOA 4AQ4A 2ONKE 3FVKA 3SEUA 4H67A 5I57A 5JEIA 1MH4A 3MJNA 1O64A 2AL4A 3K6UA 3N5LA 1MDQA 3CVGA 2O51A 2GRVA 1A40A 3CG3A 3PUXE 4NE4A 2F36A 3FUZA 1JW1A 1B5IA 2PMSA 4UA8A 3TCHA 1EH3A 1FTOA 2WKYA 3OO8A 3T9UA 1PBPA 4M1VA 1NMUA 1FQBA 5I56A 1SW2A 5I84A 1Y1MA 4LA9A 1PEBA 4ELPA 2A5TA 3VXCA 4QFKA 3G3HA 3PUVE 4Q8RA 4P0GA 3TQLA 4RPOA 1B32A 1ZIUA 3MZBA 2H4IA 2DYXA 2YPNA 5F7VA 1IIWA 1HSLA 1MY1A 4IO5A 3MVYA 4G8NA 1MQJA 4GLIA 4P11A 3USDA 4F22A 2XXTA 3S9MC 2Y7RA 4QSCA 4QFOA 4ZEBA 4RYAA 3C35A 4ISUA 1P1QA 2AYSA 2H9BA 2HQ0A 1MY2A 2OCUA 4DLDA 1H76A 5FTHA 4IO6A 1MXVA 1AMFA 3FVOA 2B65A 3PPQA 5JTYB 2PYYA 5FTIA 1SW1A 2REJA 3FXRA 2UVGA 2F97A 1DOTA 4U21A 5KCJA 2AIXA 5L9OA 1IXGA 3Q27A 1B40A 4YMAA 5K2YA 4G8HA 1IZ1A 5CBSA 3JV9A 3K1NA 1IXCA 2F78A 3VXBA 2GHAA 1VR5A 2Y7IA 3FATA 2QJEA 4JXIA 4GRKA 4NWCA 3VVDA 4EXKA 1LBBA 3FJMA 5ITPA 1LAHE 3OENA 3H06B 3U93A 4BDOA 4LATA 1J1NA 1USYH 3K6XA 2IEEA 1IEJA 2NOOA 4RK2A 3MVZA 1MQGA 3HPIA 2XXIA 5J1DA 2ESNA 4NF6A 3CI8A 3BKIB 3OSQA 1B3FA 2HZKA 4GD5A 4Z0IA 3R7XA 1SD3A 3B6WA 4YB5A 3EHUA 5L8DA 4YZZA 4QFLA 3PPOA 5HBCA 4N13A 1ZU0A 1I6QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4U4SA 1FPEA 1GGGA 2HFBA 3VV5A 1QW0A 4IO7A 4AB5A 4MF3A 2VHAA 2Q8MA 3T1BA 5LDZA 2DWJA 2QS1A 3Q26A 1OIBA 2OWZA 2DE2A 3TTNA 3DLNA 2UYEA 3G3KA 3CSBA 4PBHA 3TZAA 3ILTB 3E79A 3JYRA 1ANFA 3LC8A 1OQGA 4O94A 3HN0A 3VFJA 4GX4A 2OX3A 4QFNA 4R74A 2QS4A 3T9XB 2QSXA 2F34A 2F7CA 4PGPA 4ECFA 3T0JA 1EZOA 1FPLA 2D3IA 2R71A 1B3GA 2A5TB 4PAFA 2HHMA 1LBCA 4P8BA 1DSNA 1Q1KA 3UGWA 1JNFA 4I3YA 2V3TA 4PBQA 1MRPA 4F31B 2OWSA 4LQ2A 1Q9DA 1DTZA 1FTMA 4HE2A 1LBWA 5DT6A 3GYYA 4LZ8A 3KGCA 3PTYA 1XC1A 2VD2A 1R9LA 4NEDA 5BUUA 4OYVA 2ZZVA 5I2NA 1M5FA 4XEQA 3T22A 4FORA 3H03A 3CFXA 1JEVA 3ZKLA 4I8CA 2CZIA 4LZ5A 4UABA 3H4ZA 5BWJA 4WEPA 1NNTA 4GFRA 1LSTA 4OHNA 5EQ7A 3FJGA 2G93A 3D4CA 4IB2A 4BDQA 2DQVA 3MVWA 4R6YA 4X48A 2W7YA 3PUYE 5F1QA 2IA4A 3E3KA 4ESWA 4OERA 3PMVA 3CIJA 1SW4A 2XXXA 4H6DA 4FJPA 5IM2A 4KR5A 4MLQA 2HXWA 4U22A 2PVUA 4ZDMA 2UVJA 1VFEA 4IGTA 2FHYA 1FPDA 4YKJA 2Q74A 3G3IA 3ODBA 4F1VA 5A5XA 1XVXA 4H8JA 1MH3A 5EQAA 5I57B 4MX6A 4WEDA 3TUSA 1TXFA 3SETA 4RA1A 2DVZA 4G8MA 4NF4B 1LFIA 5F24A 1SI1A 1BK4A 3SDFA 1IMFA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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