4JWXA

Glun2a ligand-binding core in complex with propyl-nhp5g
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
280
structure length
280
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPLTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGICHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural determinants of agonist efficacy at the glutamate binding site of N-methyl-d-aspartate receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Unknown function
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords GluN2A
total genus 94
structure length 280
sequence length 280
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jwxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jwxA02
3MJNA 4H0WA 2R71A 4I9DA 2LAOA 2HAUA 1L5TA 4G8MA 3FV2A 5AA1A 3TKDA 3A09A 4R6YA 1ZJLA 4R73A 2RC8A 3K02A 5M2VA 3RLFE 2PMSA 4Q5TA 3FZVA 1B9JA 4TOZA 3IB2A 4IO7A 4P0IA 3IOVA 1MY2A 4OMBA 1DTZA 3TFLA 2ALUA 3ECRA 4ZEIA 2BJJX 4HW8A 3GXAA 1N84A 3T66A 3IL1B 4HCYA 3PUWE 1MXYA 3LSWA 2Z22A 1A7LA 1LB9A 2UYFA 2O84X 2A5TB 3LUYA 2NUVA 4NF4B 1LBCA 3LBSA 4NF8A 4QFLA 1NH7A 1P1OA 5TP9B 1QKBA 4YMBA 3ODBA 2B65A 3PPQA 5FHOA 4G2ZA 4F3PA 1OVBA 3VLVA 4GFRA 1S9TA 3O6GA 2THIA 1WDNA 1IQ7A 1MG1A 2F6PA 1P1WA 2ZYMA 1ZIUA 5EHMA 3EPEA 1BKAA 4N13A 5DT6A 1A8FA 3CG3A 1OVTA 4BDRA 5H8HA 1JVYA 2AYSA 1D3KA 3U72A 2DVCA 4I8CA 3TELA 1LFIA 3ZS6A 3SEVA 1D4NA 3PUZE 1UTHA 2PBWA 3EHUA 3PPRA 1BP5A 2DQVA 3DP6A 3PPPA 3MBPA 4U22A 3MUQA 5I84A 1RKMA 4Z0IA 1GVCA 3W15C 3M3FA 1SDXA 4RK2A 1EZPA 4C0RA 1GGGA 3MZBA 3QUFA 3IOWA 4NF5B 1IXHA 3V89B 4JXIA 3TEPA 2GRVA 3IOUA 5ICQA 2HEUA 3DP8A 3RN8A 1N3XA 1RYOA 3FXQA 4XIGQ 1NNTA 5I57A 3PPNA 4WXJA 3OO6A 2REJA 3SEUA 2PVUA 4U21A 4KI0E 2XXWA 1MQDA 3H3GA 4P0GA 1YTVA 1DPPA 4GOTA 5HPQA 2D5WA 4EQBA 5F7VA 4U23A 1FQDA 5I58B 2QS3A 3KOSA 5J1DA 4RXLA 5KDTA 3CG1A 4RY1A 5CBRA 2H25A 2E1SA 4M4GA 5H8NB 3K1PA 4OFLA 2Q2AA 3Q29A 1B6HA 5L9OA 1DOTA 4NF6A 1HSLA 1M5FA 4UACA 1A54A 1Y3NA 3C34A 4EXKA 5TPAA 3T9HB 5I2KA 2XXQA 4JWXA 4LUBA 2QS2A 4BDOA 3IJXB 3IX1A 1EZOA 1MQJA 1R9QA 5KCJB 2RC7A 1II5A 2QSXA 1PB8A 3A3CA 4KYDA 4DE8A 3LSLA 4QFNA 3KOTA 3K1NA 3KG2A 3VXCA 1N3WA 5DYHA 4NMYA 3SEYA 4JWOA 3QIMA 1NMUA 1VFEA 1B3GA 1A55A 1TT1A 3KN8A 2RCBA 4TLMB 3TCFA 2GFEA 1US4A 4R75A 1QUIA 1J1NA 1SI1A 3KJ7A 1LSTA 3H7MA 3MPLA 1NNKA 5CMMA 4F3BA 2XXRA 3UIFA 4DXCA 4EQ7A 2Y7RA 3E4RA 3K00A 1JEVA 1VFDA 1FCKA 2XX7A 2I6EA 4YZZA 4OQOA 3SESA 3R26A 4F3GA 3KBRA 2A5SA 1N04A 3O66A 3O6HA 1SQYA 2I4CA 3MVYA 4ZDMA 4JBZA 5JK4A 2NWJA 1URSA 2XXPA 2DWIA 2Z8FA 4EF1A 2I49A 3MC2A 3L6HA 3HHGA 5AA2B 1US5A 3LSFB 2ONKE 2XX8A 4MLVA 5I2NA 5ELVA 3N94A 5I56B 1FQEA 2I0CA 4K3FA 4G68A 3TTMA 5HM4B 3MQ9A 2ZNSA 3CR9A 5B7DA 2OCUA 1MQHA 1JW4A 2QS1A 5CI5A 3T22A 3HCQA 2O7UA 2PT2A 3EN3A 5EHSA 2AL5A 3B6QA 1POY1 2ZYOA 3OSRA 4OTEA 3KFMA 5H8FB 4YKKA 1H43A 3S9MC 3CRBA 2XD2A 3VFJA 4F1VA 2H4IA 2VHAA 4GIZA 1ZTYA 1B7ZA 1OQHA 4QSDA 3TAJA 5CRYA 1SI0A 5B70A 3PGFA 1B4ZA 4GVOA 1B3FA 1IEJA 2I48A 1OLAA 1LB8A 3N26A 3F11A 4F22A 3UK4A 1B4HA 1MPBA 5JTYA 4FECA 1P99A 1Y9UA 4U1OA 4XKQA 3FV1A 5CM6A 3V5AA 5IKBA 1OIBA 1I69A 1N76A 4H1XA 1JVXA 5TU0A 3O28A 4JB7A 3ILUB 2I3WA 1VR5A 2Y7KA 1GTKA 4GLIA 4ISUA 1JW5A 4JSOA 1XOCA 3DP4A 3CSGA 2A5TA 4XXUA 1NL5A 3C4MA 4OERA 1UTBB 3UORA 2V3QA 3QXMA 2FYIA 4NF4A 3TTLA 3MVXA 4FAJA 4F3SA 1QUKA 4X9TA 3I3VA 1VE4A 3OOAA 5TP9A 3VVDA 3FJGA 5CMCA 1QUJA 4YMAA 4O3AA 3N6TA 4F31B 4C1TA 1BIYA 3ZKLA 4U4SA 3S9LC 2DE3A 4NWCA 4AB5A 1FTLA 1OQGA 1TWYA 3UP9A 1LCFA 4QHQA 1QW0A 3O9PA 4ELPA 1POTA 4DCXA 2PT1A 1ZU0A 3BFTA 4GXAA 4KD5A 3TTRA 5L8DA 3G3IA 1MXXA 4XKRA 3U8QA 2UVGA 1SYHA 3IR1A 3KN7A 4GD5A 5DEXB 4IY6A 2E0SA 2DWJA 1H45A 3SDFA 3C9HA 2O1MA 3M3LA 4DDDA 1MDP1 4ELOA 1IUDA 3H6UA 2I3VA 3Q25A 1B7HA 4UA8A 3G7WA 1MQGA 3MVZA 4KQPA 3H06B 5LOMA 3SEXA 3IB1A 4NEDA 5H8QA 2QMWA 1LFGA 5DVIA 4FORA 3TUSA 1PDAA 4THIA 4H65A 1Y3PA 3TTKA 4EF2A 3GBBA 4WEDA 2W7YA 3JZJA 2XXXA 2O51A 4HTGA 1B1XA 3TYHA 3ZKKA 3P7IA 3M3KA 3IAZA 4IO4A 1FQAA 1XVYA 3EHTA 3MWBA 5BUUA 3FVOA 4XKPA 3R7XA 4U4XA 3V83A 3PUXE 3O29A 4LA9A 4ESWA 4YICA 5H8NA 4KHZE 3G3HA 1FQFA 4KCDA 3VVFA 3I6VA 4QFOA 3S4UA 4GQOA 5BWJA 3TODA 1TFDA 1URGA 1SW1A 3VV5A 3ONMA 3KJTA 2F97A 1NKXA 2V93A 4LATA 2O68A 1H3DA 4TLLB 3E9XA 4GRKA 1FTMA 4U1ZA 4LZ7A 4ZZAA 4G8NA 2Y7WA 2YPNA 3UA8A 5KCJA 1JETA 3OEMA 1PB7A 4NE4A 3KSXA 5DTBA 2ZYNA 3Q26A 1IZ1A 1B3EA 1N0TA 4JDFA 1T0KA 3SEWA 3RT8A 3GLBA 4I62A 1XHYA 1M5CA 3FGSA 1MDQA 1B2HA 4O3CA 2QMXA 3CI8A 4OWDA 4GWOA 2KLFA 2X7QA 4OEUA 3SKPA 1QULA 1NNFA 2OBGA 4BLAA 1CB6A 4H6DA 4FEDA 4OZ9A 2OZZA 3W9VA 2IEEA 1JW1A 1MS7A 4KYEA 2XHDA 1P1NA 1IITA 5ISUA 2RCAA 3FVKA 3H6VA 2DOJA 5H8SA 2I58A 1FTOA 1PB9A 3BFUA 1H76A 2DE4A 2O69A 3D4CA 4FIMA 3O97A 5AA2A 4YKIA 1FW0A 5I59A 5I56A 3QYTA 4ND9A 4ZECA 4FE8A 3S9NC 4GXSB 4POXA 2IA4A 2VGQA 4EDPA 1R1NA 1MY1A 3CIJA 2F36A 1NH8A 3HHFA 1TXFA 1UQWA 2Q2CA 5H8FA 5K2XA 2F7AA 4P11A 3Q28A 4KR5A 4EUOA 2Y7IA 1ATGA 2DE2A 5L9MA 4R9GA 3VLWA 1EZ9A 3MVWA 4DXBA 3UN6A 2Q89A 1A40A 1ZMGA 2AL4A 1I6BA 1IXCA 2YLNA 3LC8A 4H8JA 2XXIA 3USDA 3N6UA 4Z7EA 3RUMA 2V84A 1M5BA 4F19A 3RY3A 2XD3A 2G93A 4AB6A 2PYYA 5I57B 4WEPA 1AIVA 2F7BA 4QF9A 2REGA 3PPOA 4XTCQ 1ZBMA 3TQLA 3IO6A 4QRZA 4FJPA 3T96B 1Z7NE 2NVUB 3K2DA 3MP6A 5KDTB 2P0SA 1Y20A 3RNNA 4LVQA 1N7XA 1UTBA 1B32A 4IGTA 4OESA 5A5XA 3LR1A 2UXAA 3MP1A 4KFQA 3K6UA 4QFKA 1R6ZA 4ZEFA 2F34A 3JYRA 4R9FA 3OXNA 5K2YA 2R6GE 3Q27A 4PFTA 3MZ1A 4GF8A 2B3BA 3K6WA 5FTHA 5AA2D 1O64A 2QPQA 4JSDA 2RC9A 4IO6A 4BDQA 5FHMA 4X1DA 2OWTA 4Q0CA 4H67A 2DVZA 1S7YA 1D9VA 1H44A 3IO4A 3OENA 1A8EA 2F78A 3VLUA 4JWYA 4F39A 3PD9A 1LAGE 3GBAA 2HCAA 1MM6A 1B3HA 5DEXA 2ZNTA 4H8IA 4ZEDA 1JEUA 1FTJA 3QUJA 4PETA 3W9WA 4M1VA 4DXUA 4RPOA 1IXIA 2I4BA 3IB0A 1A99A 1SD3A 1EH3A 4X48A 2O6AA 1BLFA 5CMBA 4PQJA 5ITOA 3TTNA 2I0BA 3BBRA 2DYXA 3K6VA 3VDFA 2OJTA 4YB5A 2CMOA 3VXBA 4LZ5A 3C35A 3OEKA 3VE1B 4DLDA 4QSEA 3CFXA 2UVHA 3KZGA 5DVFA 4FATA 3S2VA 5IAIA 3ZSFA 3MP8A 2ABHA 3RGYA 4E0XA 3C31A 1QVSA 1O63A 1Y4TA 2VD3A 4ZS9A 2DP8A 1ZKBA 2UVIA 3N5LA 4PP0A 1LGBC 1MRPA 4YKJA 1WODA 2HAVA 1B46A 1Y1MA 1AMFA 1LAHE 3DLNA 3B6WA 4OYVA 4ZZEA 3FIRA 2B3FA 3QAXA 4H5GA 3FATA 3K0VA 2ZMBA 1USYE 3TMGA 5CC2A 1P1UA 2M8CA 4YB6A 1XVXA 1XT8A 1FTKA 2VD2A 1JQFA 3CFLA 1YCJA 1MPCA 1ELJA 4YB7A 2ZYKA 3OO7A 2ONSA 4LONB 3FXUA 1HSJA 3OD7A 1PBQA 3S9EA 1B3LA 2Y7PA 5JTYB 4OEVA 3IJOB 5AE4A 4QFPA 2CZLA 2DXYA 1N7WA 5CMKA 2X7PA 2DWHA 2DSFA 2V25A 4NF5A 2D21A 4OXVA 3FJ7A 5AA4B 3IOTA 2QRYA 4ELQA 1I6QA 2VOZA 4F1YA 1XC1A 4KYSA 3KSJA 3FJMA 2DS9A 3SERA 1SW4A 2Y84A 4H5FA 3ILTB 3MZ9A 4G68C 3PU5A 2VP1A 1OLCA 3E3KA 1PEBA 1MH4A 4RNSA 3FVNA 5KZTA 3B6TA 2HXWA 2HFBA 2OK2A 1MQIA 4IO3A 1PC3A 4R6KA 4RPNA 5I58A 2AIXA 2Q8JA 4PE5B 4RA1A 3U92A 4G8HA 1RYXA 2H98A 4I1DA 4HS7A 3U1OA 4IY5A 2F8DA 2XXUA 1MM7A 2QL3A 4OVJA 4EQ9A 3DM0A 1IIWA 1B0HA 5ITPA 4TQUQ 4R6HA 3RPWA 1MY3A 3PD8A 4F1UA 3H6TA 3HN0A 4GL0A 2OWSA 2H99A 1CE2A 4X1BA 3K6XA 4RK9A 4IO5A 4PFYA 1NFTA 1AOVA 4BDLA 3K1MA 4IB2A 4PFWA 2ONRA 3EF7A 3E13X 3QK6A 1SW2A 1UIVA 2F6GA 2HZLA 2Z23A 4XKNA 3MW0A 4FEBA 3TCGA 3THIA 1TFAA 2RF1A 4HCWA 3I5OA 3SETA 4KCCA 4DIGA 1PBPA 4YU0A 1LBBA 1QJMA 3L6GA 4RJZA 1B52A 2UYEA 3CVGA 4NF8B 2DWAA 5H8QB 3PMWA 3FUZA 1M5DA 3TPAA 2DXRA 1MXZA 3PMVA 1B40A 1UIUA 3M8UA 2H5YA 3OO9A 3OMBA 1B0LA 1B5HA 1R9LA 4OETA 3WAEA 1B5IA 4ZEKA 1LLSA 1BTJA 2QJEA 4QSCA 2O1LA 4MLQA 2YJPA 1DMBA 1MY0A 3RQTA 1B5JA 1MXUA 3V8XB 3U93A 2XXTA 1MY4A 2P2AA 3UGWA 3GZGA 4PFUA 1B05A 1IXGA 4IO2A 3PUVE 3O2AA 4R2FA 3O6IA 3H6WA 2XX9A 5H8HB 1B7UA 3R6UA 3HSTA 4F2OA 3TZAA 3H03A 1GV8A 5FHNA 2FA7A 3G3JA 3QSLA 4R2BA 1DPEA 1SYIA 2Z8EA 1I6AA 1UTHB 5DVJA 1FQBA 1B51A 5FTIA 2D3IA 1AH5A 2FNCA 2F35A 1Q35A 4Q30B 4LP2B 4RYAA 1FQCA 1DTGA 3EHSA 3VVEA 1B58A 4WKMA 1ANFA 1LCTA 3D4GA 3LSXA 4OFJA 3TQWA 4DCYA 3TDJA 3JV9A 2OLBA 1MXWA 1O7TA 4LZ8A 3MAMA 2F5XA 1Y1ZA 2HQ0A 1MXVA 3OO8A 1MH3A 2PX1A 1D9YA 2RKMA 4OFOA 4R74A 2H9BA 3BKIB 3KEIA 2V3TA 1ZLQA 3FXRA 3HV1A 4MFIA 4O3BA 3DELB 1DSNA 3PUYE 4ESXA 5F1QA 4YAHX 5CBSA 1XS5A 2ZNUA 1KWHA 3U94A 3RT6B 1EU8A 4R72A 4ELRA 3OELA 2NXOA 5L9SA 1LAXA 4OENA 3KGCA 2R9JA 4Q8RA 4ZE9A 3OSQA 3K01A 3KN3A 4YKPA 2Z8DA 4MH5A 4N07A 4ZEBA 3RTWB 4G4PA 3T9UA 3K4UA 1VSOA 2HZKA 5JEIA 5ICTA 4E0WA 4OHNA 1M5EA 4L17A 4NF6B 5AA3A 2O7IA 2QS4A 1S50A 1WVJA 3HPIA 5TPAB 5I2KB 2GHAA 5I59B 1USYH 3PV0E 1MPDA 4F18A 3FD3A 4GL8A 1YPNA 1LFHA 2ZXTA 4F2QA 1JNFA 4DZ1A 1URDA 3C36A 1SW5A 4LQ5A 3RTFB 4NWDA 4ZE8A 3G3KA 4C1UA 3CFZA 2Q9TA 4G77A 3FASA 2XXVA 2UVJA 2XXYA 4F29A 3C32A 1Z7ME 3T9XB 2F7CA 4AQ4A 2WKYA 2XXHA 2ESNA 4MF3A 2GHBA 3G3FA 4EXLA 1GR2A 3G3GA 4POWA 1F9BA 3B7DA 3TCHA 4U2RA 3AXFA 3MPKA 1QKAA 2RINA 3HO7A 2Q88A 3T9VA 3CSBA 1SVXB 4ECFA 2ANJA 3WAFA 4MBPA 1OMPA 3A3UA 3EQ1A 5AA4A 1AL3A 2GH9A 3IK6B 1NNPA 3H4ZA 1HSEA 4ONYA 1LAFE 1B1HA 4BDNA 2V3UA 1P1QA 5I2NB 5A5XB 2NOOA 3T93B 1SBPA 1YAEA 5HBCA 2P1SA 3C33A 1Y3QA 4G68B 3PMXA 4LQ2A 4NTLA 4KPTA 4IGRA 2G29A 1Y4CA 2X26A 3FVGA 4N6PA 5EYFA 4BDMA 3IORA 1Q1KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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