4JXIA

Directed evolution and rational design of a de novo designed esterase toward improved catalysis. northeast structural genomics consortium (nesg) target or184
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
410
structure length
410
Chain Sequence
SHMEVNLRMSWWGGNGRHQVTLKALEEFHKQHPNINVKAEYTGWDGHLSRLTTQIAGGTEPDVMQTNWNWLPIFSKDGTGFYNLFSVKEQLDLAQFDPKELQQTTVNGKLNGIPISVTAMIFYFNDATWAKAGLEYPKTWDELLAAGKVFKEKLGDQYYPVVLCAGQTLVLIRSYMTQKYNIPTIDEANKKFAYSPEQWVEFFTMYKTMVDNHVMPSTKYYASIVKSSYYEMKPWINGEWAGTYMWNSTITKYSDNLTKPAKLVLGPYPMLPGAKDAGLFFLPAQMLSIGKSTKHPQESAMLINFLLNSKEGVEALGLERGVPLSATAVTQLRASGVIKDEDPSVAGLNMALELPHPMTTSPYFLDWQIWSLFLDAIQYIDYGQKTVQETAEYFNKQGDRILKRAMRGSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Directed evolution and rational design of a de novo designed esterase toward improved catalysis. Northeast Structural Genomics Consortium (NESG) Target OR184
rcsb
molecule keywords design cystein esterase
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Synthetic construct
total genus 135
structure length 410
sequence length 410
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jxiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4jxiA02
3FUZA 4LZ7A 2I3VA 5F7VA 3FD3A 2F36A 1R9LA 4MLQA 1MS7A 4DXBA 3KZGA 1Y1ZA 1Z7ME 2QMWA 1OQHA 1M5EA 3IAZA 1AIVA 3SEXA 4OERA 4BDNA 2XXVA 2O84X 2O7UA 3OXNA 1S50A 3PMWA 1TFAA 5EHMA 2NXOA 4ZDMA 2Z8EA 1B58A 4OESA 3C34A 4IO5A 3DP6A 4RJZA 5I59A 4HCYA 3VFJA 4JSOA 4XKQA 5I2NA 3UGWA 1Y9UA 1MM7A 2ANJA 3U94A 4QFPA 1Z7NE 2F34A 2F8DA 4IY5A 2D5WA 1UTHB 4R6YA 4RPOA 4POWA 2HXWA 4XKPA 4F18A 2RCBA 4RK9A 2G93A 4GIZA 4XXUA 3O97A 2F35A 5JK4A 4ELOA 4GLIA 4YMAA 2PX1A 4UACA 4F1VA 4XIGQ 1OLCA 3O6GA 4ND9A 5B70A 2RKMA 2F78A 5ICTA 3MQ9A 2O68A 3WAEA 2FA7A 3MW0A 3CIJA 4U2RA 1NH8A 3MC2A 3FVKA 3PPPA 2NVUB 3VLVA 3ECRA 1TT1A 1QUJA 3TTLA 3TAJA 2HZKA 4ZE8A 2DE3A 1B3HA 1TWYA 4KYSA 3TCGA 2GH9A 3H4ZA 4QFLA 3B6QA 1MQIA 1RYOA 1OLAA 1I6BA 3G3KA 4IGTA 4NWDA 3VLUA 4YB6A 5AA1A 1QUKA 1H43A 1AMFA 1F9BA 3ZKKA 3SEWA 2P0SA 4OEVA 1GV8A 3VXBA 3GBBA 3DP8A 4ZEBA 5CC2A 5I59B 2ZNTA 3K1PA 1Y3QA 5I2NB 1R1NA 2HEUA 3I3VA 4OVJA 5JTYA 2ONRA 5H8FA 2IEEA 3QUJA 1ELJA 3CI8A 3QUFA 3SKPA 3U92A 1MQGA 1RYXA 2OCUA 3IO4A 1H76A 1NMUA 3IK6B 3LC8A 1Y3PA 4OXVA 4R9GA 3PUXE 3IB2A 1B32A 3G3JA 3M3KA 4X9TA 3T96B 2DXRA 3QYTA 1NH7A 2I4CA 1DPPA 1QKBA 2Z8DA 3LUYA 2ZMBA 3N26A 1PB9A 4OTEA 2Q2AA 4GVOA 3SEUA 3IOWA 3S9MC 3EHUA 4R75A 2DE2A 1FQFA 3H6WA 1T0KA 2PYYA 1B46A 3RGYA 5ITOA 2XXPA 2Q89A 1SW1A 1AH5A 4G77A 1IEJA 3CG3A 3HSTA 1US5A 4FE8A 4AB5A 1MDP1 3O9PA 4G4PA 2UVGA 1B52A 4JSDA 4ELPA 2PT1A 1B4ZA 4N13A 4HTGA 3T9XB 5TP9A 4FEBA 5I58A 3C35A 4GL0A 4FEDA 1VE4A 1JW1A 4FATA 2VOZA 2ZXTA 3HPIA 3QAXA 1L5TA 4AQ4A 3DP4A 3TYHA 2Z8FA 1A7LA 4F1UA 1PC3A 1SW4A 2THIA 3H06B 2R9JA 2KLFA 1EH3A 4YKIA 3TMGA 1P1QA 1OMPA 3G3IA 3KFMA 4IO7A 1MH4A 1ZU0A 5CBRA 5L8DA 5JTYB 1EZOA 3PUYE 4F3SA 5ICQA 1EZPA 3BFTA 4R2BA 1RKMA 5H8FB 1I6AA 1JVXA 4P0GA 4XKNA 4ECFA 2ZYNA 1Y4CA 5H8NA 3QK6A 3VVFA 2DP8A 3OSQA 5TPAA 3N94A 2GHAA 1S7YA 2AL4A 4G8NA 1MQDA 4N6PA 1SQYA 3VVEA 4LQ2A 3AXFA 4ZEDA 5ITPA 3Q28A 2H9BA 1B5JA 3KOSA 2ZNSA 1DMBA 3ZKLA 1N04A 4GXSB 2O1MA 1FQEA 4R2FA 4OFOA 2F6GA 4GWOA 4ZEFA 4H65A 4I8CA 2V93A 1MY2A 4ELQA 1BP5A 4U22A 1FTOA 5JEIA 3MVWA 3MVYA 4PETA 2Q2CA 4GL8A 2O6AA 5TP9B 4POXA 4WKMA 1B3FA 1B3GA 5I58B 1ZMGA 2O69A 1MXVA 1B5IA 3SDFA 3KSJA 4JWOA 4ELRA 5DYHA 3TODA 3U8QA 4BDMA 3KN3A 1B9JA 3A3CA 4LATA 2QSXA 3R6UA 5HPQA 4H1XA 3PPRA 3O28A 4Q5TA 1QVSA 3VLWA 2RF1A 3KSXA 1FTKA 3Q25A 2H98A 4EUOA 3RQTA 2UYEA 2ZYMA 5H8NB 3O6HA 4JDFA 2FNCA 1O64A 2Y7WA 5TPAB 1FQDA 2I49A 3KG2A 4DXUA 2XXUA 5ISUA 3SEYA 4KCCA 2OWTA 4EDPA 3K01A 3OO9A 1POY1 5CMCA 1SI1A 5L9OA 3RNNA 5DT6A 1ZLQA 3OEMA 4LZ8A 1A40A 4RYAA 3B6WA 1LAFE 3C33A 2O1LA 3TFLA 1IIWA 4NEDA 3M3FA 4DXCA 4F3BA 1MPDA 3JZJA 1OVBA 4X1DA 4P0IA 1LB8A 4M1VA 4QFKA 3V89B 4C1UA 3CR9A 3MP8A 1DTGA 5CBSA 2Z23A 2X7QA 3GLBA 4GFRA 4FJPA 4NE4A 5AA4A 1D9VA 3E9XA 4KQPA 4YAHX 3TTRA 3O29A 1SVXB 2UXAA 4O3BA 4PE5B 1IUDA 4Q30B 3N5LA 4Z0IA 3R7XA 4R6HA 1P99A 1IXGA 3LSLA 3TUSA 3TEPA 3MPKA 1GGGA 3RUMA 3S2VA 3TCFA 2ALUA 1CE2A 2DS9A 4OHNA 2ZYKA 1LBBA 1JEUA 2AYSA 2XXHA 2I6EA 1QUIA 1FQCA 1M5CA 3TQLA 4EF2A 1XOCA 3K6VA 4QSDA 5LOMA 4I1DA 5DTBA 2B3BA 4ZE9A 2ABHA 4QSCA 5I2KA 3TDJA 4BLAA 3IOUA 1QULA 4F2OA 3ILTB 1UQWA 4NF8A 2Y84A 5CM6A 4QFOA 3PMVA 3S9EA 3VXCA 3W15C 4E0WA 2DVCA 3KN8A 1Q1KA 4EXKA 2QS4A 2XX7A 3K1NA 3KBRA 2A5SA 4LA9A 4QRZA 1A54A 2HAVA 4OFLA 3JYRA 3D4CA 2QS1A 4F19A 3TZAA 2E0SA 3H03A 5F1QA 4LVQA 4NF4A 4FECA 4WEDA 5AA4B 1P1NA 1P1OA 2I3WA 4KD5A 4G8MA 3FIRA 1B0HA 4L17A 1LFIA 1AL3A 3FJMA 3OELA 4MF3A 4MLVA 1N3XA 3OO6A 1LSTA 1QJMA 1NKXA 4PFWA 2XX8A 2XXTA 3OO8A 1OIBA 1M5BA 4YZZA 1D4NA 2ONKE 4JB7A 4THIA 3S9LC 2HCAA 3S4UA 1QW0A 2DQVA 2OZZA 5H8SA 3LBSA 3K6XA 3TTNA 4LUBA 4PFTA 1LB9A 3IJOB 1MQHA 2F97A 3EN3A 4XKRA 1N84A 3FZVA 3C31A 3FXQA 1SBPA 4KPTA 3H6UA 2QS2A 1CB6A 4H6DA 5BWJA 4RY1A 1H44A 3GBAA 2DOJA 1N0TA 3H6TA 5EHSA 3KJ7A 3QXMA 1LFHA 2GFEA 3TTMA 4ONYA 4GD5A 5FHMA 2HFBA 3PV0E 3E13X 5I2KB 1Q35A 2WKYA 5AA2D 2ONSA 4H5FA 3OOAA 4M4GA 4NF8B 4BDOA 4BDLA 3V83A 5H8QA 2F5XA 3SERA 1UTBA 2YPNA 1MXYA 3A09A 5DEXA 4Q8RA 3A3UA 4H67A 3HCQA 4F31B 3MZ1A 1MM6A 3BFUA 1MPBA 1P1WA 4IO6A 3MPLA 4KYDA 2UVHA 1MPCA 3DM0A 4R72A 1XS5A 4IB2A 5CMBA 5ELVA 1HSJA 1M5FA 5AA2A 4I9DA 3G7WA 2F7BA 4NF4B 1MRPA 3K00A 1UIVA 3JV9A 2UVJA 5H8HA 3ONMA 1BIYA 3K1MA 4EQ7A 4NMYA 3T9UA 2Y7KA 4TQUQ 4WXJA 1HSEA 1A8FA 1B3EA 1B3LA 4DIGA 3UORA 1YAEA 2H4IA 4RNSA 2DXYA 4GQOA 3P7IA 4ESXA 1MXXA 2I0BA 1US4A 2H99A 5DVFA 4G8HA 3GZGA 5BUUA 2V3QA 3C36A 4EQBA 5KZTA 4BDRA 4HCWA 2ESNA 3GXAA 3IORA 2OJTA 3BKIB 3FV1A 2ZNUA 1USYH 4WEPA 1O63A 2B65A 3THIA 4O3AA 2VGQA 3KGCA 3QSLA 3W9WA 3Q27A 4H5GA 4E0XA 1PBQA 2Y7IA 1MY0A 4TLMB 3N6UA 2DSFA 4RA1A 2RC8A 1II5A 2V25A 1HSLA 1KWHA 5DVJA 4H8IA 4K3FA 4AB6A 4YMBA 4ZZAA 1N3WA 1IXCA 2A5TA 2VHAA 4F39A 1LFGA 2XXQA 4OQOA 1WVJA 2F6PA 2R6GE 3T22A 3PMXA 1ATGA 2REJA 3G3HA 3HN0A 1SYIA 1LGBC 4PP0A 5HBCA 4GOTA 3HV1A 2V3TA 2HQ0A 5I84A 1B7HA 5H8QB 3LSWA 3TKDA 2QS3A 3LR1A 1DTZA 3USDA 1SW5A 1UTBB 5DEXB 1D9YA 4N07A 5KDTA 3FXUA 3QIMA 1DPEA 1URSA 3U93A 3IB1A 3ZSFA 2HZLA 3MJNA 1IQ7A 2HAUA 1ZBMA 2I58A 3FVOA 5AA2B 1YTVA 3UP9A 1MY4A 3F11A 5H8HB 1JNFA 2CZLA 1N76A 2QRYA 1ZKBA 4X1BA 3G3GA 3V8XB 4DE8A 2Q88A 1TFDA 4O3CA 2F7AA 1DOTA 3IX1A 3PUWE 3KEIA 5M2VA 2H25A 4XTCQ 4DCXA 3MVXA 3C9HA 2YLNA 4RK2A 1ZTYA 1NNKA 5L9SA 1O7TA 1JVYA 3MP1A 1LCFA 1P1UA 4R9FA 2UVIA 2OBGA 1B4HA 1N7XA 2PBWA 3FGSA 4G68C 4NF6A 4NTLA 1LCTA 3VVDA 2NWJA 1URDA 3LSFB 3IL1B 4Q0CA 4R73A 1FW0A 2NUVA 3B6TA 5AA3A 2A5TB 1MY1A 3KOTA 4YB5A 4Z7EA 3T93B 2YJPA 5DVIA 1XHYA 1FTJA 1MY3A 3UIFA 1OVTA 3FATA 2E1SA 3E3KA 2FYIA 1JQFA 5HM4B 4QSEA 4LQ5A 1R6ZA 3VV5A 3K2DA 2X7PA 1LBCA 4RXLA 3MVZA 3S9NC 3TPAA 4KCDA 5KDTB 3B7DA 2GRVA 2QJEA 2O7IA 4G68A 1QKAA 1B05A 1R9QA 3T66A 3Q26A 3CRBA 2XXWA 3RN8A 4GXAA 3O2AA 4C1TA 5L9MA 1AOVA 4ESWA 3FJGA 4RPNA 3FXRA 3IOTA 1B1XA 1VR5A 4GF8A 3EHTA 3PD9A 3RT6B 4IO4A 2AIXA 4JXIA 1GTKA 1B51A 3U1OA 3UK4A 3MBPA 2DE4A 1B6HA 5EYFA 1EZ9A 3TELA 3PPOA 5KCJA 2RINA 1JW5A 1A8EA 4NF5A 4R74A 1VFEA 3C4MA 2RCAA 2XD3A 4OWDA 4YKKA 1XVYA 4LP2B 4PFUA 1IITA 5I57A 1TXFA 4DDDA 2QMXA 2IA4A 4NF6B 1S9TA 2V3UA 4OENA 1B1HA 2H5YA 2DWAA 4KR5A 4U4XA 3M3LA 3TCHA 3H6VA 2OK2A 3PPQA 3H3GA 1LLSA 2OLBA 1PB7A 2R71A 1I69A 2D21A 3UN6A 1NL5A 1D3KA 3D4GA 4FIMA 2RC7A 3IOVA 4U1ZA 3FVNA 4ZECA 2VD3A 4ZEKA 4R6KA 1XVXA 5I56A 3K0VA 4PFYA 2DWHA 2XX9A 4YU0A 3RTFB 3G3FA 1MH3A 4G68B 3PUZE 3TQWA 2PT2A 1FTMA 1POTA 1MXWA 3K6WA 4OYVA 4P11A 2DWIA 4ZS9A 4QF9A 2VD2A 3RLFE 1FTLA 3V5AA 3MP6A 4QHQA 1SDXA 1BKAA 3IJXB 1B40A 1WODA 3FVGA 1ZJLA 4EXLA 3MAMA 4F29A 2OWSA 1JETA 1URGA 2P1SA 4EQ9A 3CFXA 2F7CA 4H0WA 4OEUA 4OMBA 3T9VA 1VFDA 5K2YA 1MQJA 3OENA 1PBPA 2AL5A 1GR2A 4JWYA 1J1NA 2UYFA 5KCJB 3RT8A 1JW4A 4NF5B 3EHSA 1B0LA 1PB8A 3MWBA 3ODBA 4TLLB 3W9VA 4ISUA 5I57B 2Z22A 1PDAA 2D3IA 1Y20A 3HO7A 3CSGA 1WDNA 2B3FA 4U21A 3EF7A 4KHZE 2P2AA 2W7YA 2Q9TA 3LSXA 5FHNA 2Y7PA 2V84A 3IO6A 3L6HA 2REGA 5FTIA 4YKJA 1FCKA 4YB7A 4F22A 3FJ7A 4OFJA 3RTWB 3EPEA 1MG1A 3MZBA 4GRKA 2Y7RA 3OMBA 1YPNA 1USYE 1FQAA 4G2ZA 1A99A 1MDQA 5K2XA 2I4BA 3OO7A 3DELB 4JBZA 5I56B 2DYXA 3M8UA 4FORA 4HW8A 3DLNA 4OETA 4ZEIA 3UA8A 3I5OA 3IB0A 4YICA 3CG1A 3PU5A 2M8CA 3TTKA 1OQGA 4F3PA 4BDQA 4IO3A 2XXRA 1YCJA 3CSBA 1A55A 3O66A 4PQJA 4F1YA 5CI5A 1H45A 2LAOA 4OZ9A 3VDFA 1NFTA 3VE1B 4I62A 5FTHA 4U1OA 5A5XA 1LAGE 1B2HA 3MZ9A 3MUQA 4U23A 3HHFA 1B5HA 1VSOA 4JWXA 5CRYA 4ZZEA 5CMKA 2XD2A 4EF1A 3ILUB 3CFZA 1DSNA 1I6QA 2I0CA 1LAHE 3PD8A 3T9HB 4MBPA 3SETA 3CVGA 4F3GA 4DLDA 1SD3A 1BTJA 3OSRA 3SESA 4FAJA 3HHGA 3Q29A 2BJJX 5IKBA 4TOZA 4YKPA 1NNTA 3PGFA 1UIUA 4KI0E 3U72A 4C0RA 1B7UA 2I48A 2X26A 1Y3NA 5J1DA 1PEBA 1EU8A 1H3DA 4U4SA 1Y1MA 1M5DA 3FASA 4LZ5A 4MH5A 2PMSA 3IR1A 4H8JA 5AE4A 4IGRA 5B7DA 4MFIA 3OD7A 4LONB 1BLFA 2VP1A 2QPQA 3BBRA 2RC9A 4IY6A 5FHOA 3I6VA 1LAXA 3FV2A 3EQ1A 2ZYOA 3RPWA 2XHDA 1SI0A 3L6GA 2QL3A 4QFNA 4UA8A 1IXIA 3PUVE 4KYEA 1IZ1A 3WAFA 2XXXA 3KN7A 3K4UA 1SW2A 2Q8JA 2NOOA 1UTHA 2CMOA 1ZIUA 1MXZA 3KJTA 5A5XB 3N6TA 2G29A 3CFLA 4DZ1A 1XC1A 3SEVA 3C32A 5TU0A 3OEKA 2DWJA 5CMMA 2O51A 3PPNA 5IAIA 3K02A 3ZS6A 1B7ZA 1GVCA 4X48A 2DVZA 1NNFA 1IXHA 1ANFA 2XXIA 3O6IA 4IO2A 3K6UA 1MXUA 3E4RA 4DCYA 3H7MA 1NNPA 1JEVA 1XT8A 3R26A 2PVUA 4HS7A 3RY3A 2XXYA 1Y4TA 4KFQA 4NWCA 4F2QA 1FQBA 1N7WA 1SYHA 2GHBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PC9A 3FUZA 4LZ7A 2I3VA 4MJOA 5F7VA 3FD3A 2F36A 1IMDA 4P56A 1R9LA 4MLQA 1MS7A 4DXBA 3KZGA 1Y1ZA 1Z7ME 4MNCA 4PGPA 2QMWA 1OQHA 1M5EA 3IAZA 1AIVA 3SEXA 2WEFA 4OERA 4BDNA 2XXVA 2O84X 2O7UA 3OXNA 1S50A 3PMWA 2Y5LA 1TFAA 5EHMA 1FPGA 2NXOA 4ZDMA 4GBWA 5A5LA 2Z8EA 1B58A 4OESA 3C34A 4H45A 4IO5A 3DP6A 4RJZA 5I59A 4HCYA 3VFJA 4JSOA 4XKQA 5I2NA 3UGWA 1Y9UA 1MM7A 2ANJA 3U94A 4QFPA 1Z7NE 2F34A 2F8DA 4IY5A 2D5WA 1FPFA 4PAFA 1UTHB 4R6YA 4RPOA 4POWA 2HXWA 4XKPA 4F18A 2RCBA 4RK9A 2G93A 4GIZA 4XXUA 3O97A 4PDDA 2F35A 5JK4A 4ELOA 4GLIA 4YMAA 2PX1A 2MKZA 4UACA 4F1VA 4XIGQ 1OLCA 3KBZA 2XWIA 3O6GA 4ND9A 5B70A 2RKMA 2F78A 2KR0A 5ICTA 3MQ9A 2O68A 1LBVA 2FA7A 3MW0A 3WAEA 3CIJA 4U2RA 4MIJA 1NH8A 3MC2A 3FVKA 3PPPA 3T1BA 2NVUB 1DCUA 3VLVA 1YXIA 4PFBA 5EYGA 1FPJA 3ECRA 1TT1A 1QUJA 3TTLA 3TAJA 2HZKA 4ZE8A 2DE3A 4GWXA 1EYKA 1B3HA 1TWYA 4KYSA 3TCGA 3NOHA 4PF6A 2GH9A 4PF8A 3H4ZA 4QFLA 3B6QA 5FBPA 1MQIA 1RYOA 1OLAA 4O94A 5LDZA 1I6BA 3G3KA 4IGTA 4NWDA 3VLUA 4YB6A 5AA1A 1QUKA 4KXPA 3B8BA 1H43A 1AMFA 1F9BA 3HFUA 3ZKKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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