4K0GA

Crystal structure of human clic1 c24s mutant
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
b'QPQVELFVKAGSDGAKIGNSPFSQRLFMVLWLKGVTFNVTTVDTKRRTETVQKLCPGGQLPFLLYGTEVHTDTNKIEEFLEAVLCPPRYPKLAALNPESNTAGLDIFAKFSAYIKNSNPALNDNLEKGLLKALKVLDNYLTSPLPEEVDETSAEDEGVSQRKFLDGNELTLADCNLLPKLHIVQVVCKKYRGFTIPEAFRGVHRYLSNAYAREEFASTCPDDEEIELAYEQVAKALK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure analysis of CLIC1 C24 mutants
rcsb
molecule keywords Chloride intracellular channel protein 1
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
total genus 80
structure length 237
sequence length 237
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13409 GST_N_2 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4k0gA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4k0gA01
1I9DA 4V1Ag 4KDXA 1XWKA 1SJIA 1ERUA 4PNFA 3CYNA 1PMTA 2PGTA 5IOWA 1PQNA 3HZ8A 2B6MA 3HY2A 1X9WB 3FKFA 5ECLB 2K6VA 1WWJA 4ULXA 2JSYA 3ZVJA 4FYUA 1T4YA 1GNEA 3PR8A 3LXZA 3PGTA 5ECOB 3IHQA 2LTKA 3HVVA 2B1KA 1SKSB 1TI3A 4TVEA 1ST9A 16GSA 3H93A 3UBKA 4MZCA 2ALBA 5HFGA 1THOA 1GUHA 3LQ7A 4POMA 1O8XA 1WPIA 2MBSA 2VM1A 3KCMA 3C71A 4PQ1A 2R37A 1TK5B 6GSWA 3A3TA 3GA4A 2WRTA 4ML1A 4V2MA 5G1KA 4JR4A 1LU4A 4EE0A 3W8SA 1F37A 1T8EB 3QFBC 4HI7A 3RHBA 3D0ZA 4TXVA 2YJHA 1I5GA 5IPHA 1FW1A 2V6OA 3VWUA 3FZ9A 1DUGA 3TKSC 1YJ6A 3FY7A 3IV4A 2R4VA 5A4VA 2FWEA 3MNGA 4L0WA 5A4WA 1M7TA 1U87A 1F2EA 3KTLA 4ILFA 1NSWA 3PINA 5J9CA 4GQCA 1ML6A 3F3QA 3ZRDA 1VF2A 3CMIA 3M1GA 3F63A 3KXOA 4E8HA 3ZVJD 4HOJA 3WGDA 3C73A 4ZILA 1B4PA 2B7JA 1MEKA 3TCOA 1ACVA 5ID2B 1OKTA 2PVQA 5C04A 2RM6A 1ON4A 2R3XA 3GKXA 1XWBA 3UJ1A 1G7OA 2LV3A 5F07A 5IMFA 4BVXA 4TN8A 5ABRA 1R5AA 4KSOA 2JSZA 2VL2A 2HSNB 2YWOA 3GX0A 1XCCA 4TKYA 1TK0B 4ECIA 1FOVA 1CQHA 1V98A 2R6KA 5J41A 22GSA 2EIQA 3EURA 4XRDA 2DJ1A 1SKWB 2L5OA 4XHMA 3ERWA 3ZTLA 2VCTA 4GTUA 2FY6A 2H71A 1XVWA 1AUCA 4XRAA 3K8NA 2LRCA 2E2GA 2GZPA 2A2RA 3M9KA 2VO4A 4FIWA 3IE3A 4O32A 1S3DA 3LXTA 1VF4A 3TJJA 3FYGA 2NBSA 4JZQA 3EVIA 3BJ5A 1SJZA 3A5WA 4OMVA 5HFKA 4K2DA 1SENA 2C0GA 3DWVA 3US3A 3PPUA 3O6TA 2H8LA 14GSA 3QD9A 3ZREA 2CA8A 5ECSA 3TRQA 3APOA 1LJRA 3MSZA 4IVFA 4J57E 3ME7A 4MH2A 3W8JA 4G0IA 4ZBAA 4FYCA 2AJQB 5A5KA 1PD21 1PX7A 4K0GA 2O85A 2C8UA 5C00A 2K8VA 1GL8A 5CRDA 2H6ZA 4IP1A 4EL1A 2YOIA 3QDNA 2H1BA 1X9SB 4BWQA 1T3BA 2DJJA 4I8BA 4YH2A 3WD6A 3IRAA 1O6JA 4P3YB 7GSSA 3E0UA 19GSA 4EDZA 5HR0A 3FZAA 4K0NA 5HQPA 2VAFA 2C4JA 4IS0A 2ON5A 4PX1A 5DAKB 4F9ZA 5G2ZA 2IMDA 3HJOA 3M8NA 3ZIJA 1ILOA 4Q5RA 2VL3A 2MBTA 2QC7A 4IELA 2PERA 2HZFA 1JZRA 4Q5FA 4IJ3A 5EVOA 1VRSD 2HFDA 2C3QA 5DDLA 4XS4B 3UARA 2VM2A 1N2AA 1FVKA 1B8XA 2H30A 3Q6OA 2VD0A 1N8JA 1OAZA 3EU3A 4NV2A 1QQ2A 4IQAA 2C1YA 3O76A 3EU4A 4D73A 1WRYA 2TRCP 2L59A 3DD3A 2DMLA 3GX8A 2PVOC 1IYHA 2AUVA 2L57A 3KMOA 3L78A 1M2DA 3HVSA 4DSQA 2MYGA 2LSTA 2H6YA 2GSTA 1ZYEA 3FR3A 2LJAA 1U6TA 2MMZA 1SU9A 1LBKA 10GSA 4OFNA 2XBQA 2IN3A 3UIWA 2HZEB 4OD7A 2FWGA 2TIRA 3BD2A 1GNWA 6GSSA 4POBA 4PGTA 2H66A 3TRXA 2FNOA 2H1GA 3QPMA 1KTEA 3KTBA 2L5LA 1T7PB 1JFUA 1OYJA 1A0FA 5ENUA 4FH8A 5H5QA 3J7Yk 5IO2A 5G1LA 3TKSA 1TW9A 3CSHA 4G10A 2HRKA 3A2VA 2ZCTA 4TR3A 2YNXA 1V57A 5D93A 3UVTA 5J9BA 4EO3A 4MF5A 5CAXA 3DMLA 1FB0A 1TTZA 3NZNA 5L71A 5IMZA 5AGYA 3EMPA 4MZBA 4GXZA 2LEGA 3QFAC 4AGSA 1GULA 3BOAA 4KE3A 2HSYA 5G5EA 4J56E 4HZ2A 5JCWA 3GH6A 2PUKC 2DSAA 5DBQA 4MA9A 3CTGA 1UN2A 5B8BA 3F8UA 4K9ZA 4N11A 1SD9A 2H70A 4EUYA 2VCZA 3ZFLA 4JBBA 4E8EA 1AXDA 3I6AA 4PUAA 1U3AA 5EL8A 4PURA 4HS1A 1EV4A 2HNLA 3VWWA 2WDUA 1VF3A 3FZ4A 3W6GA 2GT5A 3D4MA 5GZZB 3KP8A 3DYRA 2L6DA 2CVBA 1YEPA 3GFKA 3KIJA 5CNWA 4F82A 1XBSA 1GLPA 4LMWA 2VLTA 1XOAA 2JZSA 1YY7A 2WFCA 2WULA 5EPFA 1ZZYA 4K7IA 1J08A 5KN0A 3ZIVA 1NM3A 1WJKA 3J7Yb 3ME8A 1RQMA 3HKRA 2VLVA 1EP8A 2LRNA 1BQ7A 5D96A 3AY8A 4RQXA 3WT1A 3RPPA 3GMFA 3LWAA 1MDKA 3DVWA 2FWFA 5BMUA 2DIZA 2N5FA 3CXGA 1RW1A 2IJYA 4BVXB 5CO3A 3N9JA 1TRVA 2I4AA 2LRTA 2VIMA 2KHPA 3HVXA 3JCML 2HRNA 2LNTA 2E7PA 2VCXA 5AISA 2M72A 2ZNMA 2HZEA 4HQZA 2I81A 2MZCA 3UAPA 3IK9A 5B6MA 1XW6A 1O7UA 1XIYA 1K0OA 4ZB8A 3FW2A 3LYKA 5CREA 18GSA 3P2AA 1XWGA 1O73A 1T00A 4MABA 2GZYA 4NWYA 4G0KA 1FO5A 1K3OA 1GSFA 1GSYA 2HYXA 4IKHA 3UL3A 1BJXA 3Q74A 1TU7A 3KH7A 2PU9C 3RHCA 1GSEA 4XS6A 4FQUA 2P0GA 3CRTA 4MJBA 2ZUPA 5IO0A 5LCZA 4N0VA 2FA8A 4GWRA 6GSVA 4ZL8A 2O89A 4O7HA 4KCEA 2HT9A 3ZYWA 3VPTA 2VLUA 1ZMAA 4EVMA 1Z7PA 2H73A 1DE2A 3DXBA 3GN3A 3QAGA 3F4TA 3D22A 3LSZA 3GKNA 5FHIA 1PN9A 4MK3A 1AW9A 4JU5A 3LEFA 1HYUA 1ERTA 5KEJA 4LA1A 4H86A 1EEMA 5B7CA 5ELGA 3GNJA 3C8EA 1AQXA 4MJEA 2IL3A 3KEBA 5DALA 4WR4A 3QMXA 2MMNA 1WIKA 5JWQB 4MF7A 1GSQA 1A2MA 4JEDA 11GSA 4TR4A 2LUSA 2YCDA 2YN1A 4HU7A 2H74A 1YKAA 1EOGA 4IP6A 4TOPA 4XS1A 3QCPA 3H79A 3TKSE 2C3TA 3IAS2 4QQ7A 1M0UA 2NPBA 1S3CA 4MZWA 2EIRA 3LGCA 1GSDA 5AIVA 4EDYA 3DGQA 2YJ7A 3ZLPA 3HYPA 3IBHA 1XVQA 2DBCA 1SL1B 1AQVA 4POKA 5DQSA 1X9MB 2V32A 4MH3A 2YZUA 3FHKA 3UOMA 4D73B 2N5BA 2X8GA 1TOFA 3D4TA 2XBIA 2JZRA 3C1RA 1GUMA 2GSQA 2WJUA 3M0FA 4CHSA 3TOTA 5KN2A 4TRXA 2UZ8A 2R2JA 1V2AA 2DMMA 3HA9A 4POLA 4WETA 2H76A 5ECKB 1H75A 3BBYA 2YWIA 4V2LA 4GLTA 2RM5A 4MJCA 2F3MA 3GHAA 2YWMA 4GSSA 4KGIA 5HFIA 4L0UA 1JLWA 3C7MA 1R4WA 3LYPA 1K0NA 3KM6A 2DJKA 2FGXA 3Q18A 2GT6A 4F0BA 4V1Ap 4AF2A 1NHOA 1GP1A 4JRRA 2LQQA 3ZL5A 2WS2A 2WGRA 2GLRA 13GSA 4RQRA 4KW6A 1PA3A 4WF4A 1Y6EA 2F9SA 1QGVA 3VWVA 4PXOA 4L5OA 2R5GA 1QMVA 2HRKB 3KD0A 3IR4A 1B4QA 2HRAA 3ERFA 5DCGA 1JZWA 3CBUA 2K9FA 1K0DA 1GUKA 1UVZA 3L9VA 5COHA 2QKEA 4I6XA 3TRPA 2H0IA 3TJBA 2GSSA 2XPDA 1W89A 3KP9A 1QK8A 1URMA 1G6WA 1IYIA 1VF1A 3CTFA 4JR6A 3ISOA 2MMOA 2L4QA 4NXIA 4EC0A 4FYBA 3DKSA 3H4KA 2NTOA 2QGVA 1G0TA 3M3MA 4WR5A 5D9XA 3EE2A 1JLVA 3IDVA 3GH9A 1F3AA 1MTCA 4DSRA 4GSNA 5IMDA 1AIUA 1Y25A 2OBIA 1K0AA 1UC7A 1USBA 2IMKA 2IIYA 3GKKA 4AJ6A 1PSQA 1M9BA 4ECCA 1G6YA 1TP9A 2YANA 3APQA 1PX6A 1ZL9A 4OO5A 2JZTA 3NIVA 1B48A 2XC2A 2GGTA 1WOUA 2REMA 3F6FA 1A0RP 3RBTA 2Z9SA 1ZCPA 3KMNA 1M2AA 3F3RA 3IPZA 4OFMA 3ZITA 4CW9A 5B8AA 1AQWA 4ZB9A 1BEDA 3H1NA 4KDYA 2OADA 1OKDA 4OCEA 4USSA 1FHEA 1OVNA 3SBCA 3NOFA 5IOXA 1X5EA 2JU5A 2M80A 1XXUA 3O3TA 5GSTA 3L9UA 1YQ1A 2L6CA 3RAZA 2YPMA 3EYTA 3TKQA 3FRCA 4ML6A 5D9TA 2HI7A 2OE0A 4NHWA 4OFTA 2GQMA 4YQVA 2I1UA 2H1AA 3V1WA 1GTUA 2H0GA 1A2JA 1W4VA 2EIOA 1TU8A 2HSHA 2B5XA 4IBPA 3GTUB 1C72A 3P90A 3P8WA 4YAPA 2KP2A 3GSSA 3WYWA 4EKZA 2VCVA 4MMMA 3KZQA 2D2ZA 3IK7A 5FT3A 3KJYA 1HNBA 1Z6NA 2HXKA 3QAVA 1EV9A 2IWTA 3F4RA 1J9BA 5DVBA 3HJMA 1JZOA 6GSXA 1NHYA 1B9XC 2YV7A 3MDKA 3VI5A 2VD1A 1TDIA 4HJ2A 4J2FA 2K18A 2WCIA 2O87A 2OE1A 3L9SA 3I9V2 2DLXA 4BL7B 4MLYA 1A24A 3LORA 3CRUA 2GQLA 3GURA 2AHEA 4PQIA 1GSUA 1GLQA 4K7OA 4LL1B 4I97A 2RIIA 3VI7A 1BX9A 1EWXA 2CZ3A 1K0MA 1U88A 4WBRD 1FB6A 5DALB 4TR1B 1SYRA 2A4VA 1THXA 4ZL7A 1ERWA 4IQ1A 4WXTA 3TKPA 2H72A 2XHFA 1F3BA 1B9YC 4EF0A 2X8HA 4L5LA 5EY6A 4JE1A 4IJIA 5ECNB 1XPVA 1PL2A 3DRNA 2OJLA 5FWGA 3VWXA 4HJMA 2FD3A 2P5QA 3KGKA 2L4CA 5INYA 3QAWA 2H75A 2WB9A 1U3IA 2CV4A 3WT2A 1YZXA 5G31A 1WMJA 2OE3A 1QXHA 4ISDA 1JHBA 5CRWA 2ON7A 4L8EA 2C3NA 2I9HA 5CYYA 1G7EA 2CX4A 1TXXA 5DJMA 5HR1A 5CRGA 2FWHA 1ERVA 2MMAA 3IAM2 3G7YA 5E4WA 4NPBA 1V9WA 1SYXA 2DIYA 1EGOA 2PMTA 1TJDA 3UVHA 2B5YA 1S3AA 4OO4A 3QR6A 2DJ3A 3A2XA 3G9BA 2V6KA 2P5RA 4V2NA 1TRSA 4G9HA 3BCIA 1QFNA 4EXJA 2DJ2A 3VURA 3APSA 1R7HA 2B3SA 2FUG2 1SL0B 4KF9A 3GTUA 5IPGA 3WGXA 3I69A 2TRXA 1K0BA 2VOCA 3TJGA 4MCUA 4QL7A 1FG4A 3UMAA 1X5CA 4GF0A 2N5AA 4K1FA 4HU9A 3EMXA 2JL4A 1TRUA 4LL4B 4LMVA 1OE8A 2BMXA 3MWHA 4YQMA 5IM9A 3LFLA 3R3EA 4Q5NA 4YQUA 4O92A 5D9VA 3L4NA 1XWCA 4BL7A 5HR2A 3U6VA 1X5DA 4MDCA 2FA4A 5F05A 1YF0A 4K8MA 3GUSA 4HZ4A 3ZMLA 1Z5YE 1BYEA 4KA0A 3GV1A 2X64A 2GSRA 1J0FA 5ECMB 2JACA 3HCZA 2KLXA 6GSYA 2H0HA 5IMCA 2GQKA 5GAPD 5JWOB 3F0IA 4X0XA 4TR1A 1ZGNA 4NV5A 3RPNA 4N0ZA 1V40A 2A2SA 4G19A 4I5QA 1HNCA 1GSSA 1GTBA 1XFLA 2CVKA 4HQSA 4MP4A 1PGTA 5ECHB 1OC9B 4PTSA 1UA5A 2X8CA 3GIXA 3RDWA 1OE7A 3FK8A 2BTOT 2NDOA 4KH7A 3EC3A 1PKZA 2OBKA 3IC8A 3FEUA 12GSA 1XW5A 4MF6A 3TB2A 3GL3A 5DQYA 4BVYB 1EZKA 5KN3A 4PUFC 2C0EA 3SWLA 3DVXA 3R2QA 1A2LA 1HD2A 5DCHA 4GCIA 5LNKe 4CDOA 1GH2A 3TJFA 5H5RA 3WGEA 4TR0A 1DSBA 2AAWA 1A23A 2J23A 4I2TA 3GRXA 1HNAA 4RUVA 5GSSA 2RUFA 2C0DA 4X1UA 5JCGA 4ECJA 1K3LA 3ERGA 1R5PA 4KSMA 4HEA2 1MDIA 2V1MA 1O85A 6GSTA 3C1SA 3F9UA 4TXOA 3P7XA 2GTUA 1FAAA 1EGRA 2CAQA 2RLIA 3LG6A 1XOBA 5CP1A 4RI6A 2M46A 2AB6A 2C0FA 1A8LA 1ZOFA 3KH9A 3DIEA 5ELAA 1KEBA 5F0GA 4IN0A 2IMEA 1JZDA 4WBJA 2YWNA 2KUCA 3PH9A 2BJXA 17GSA 3M9JA 3G7IA 4OWYA 5LD0A 4KX4A 2CZ2A 2XPEA 1Z9HA 5AN1A 1XW9A 2H6XA 2YP6A 1NW2A 4DSSB 4NAXA 1M9AA 4Q5QA 1DBYA 5HR3A 2AV4A 3CSIA 1TRWA 2O8VB 3VLNA 4ID0A 4AJ8A 2O7KA 3IA1A 1GRXA 4KUNA 4ZL9A 1Z3EA 2GZZA 2GDRA 3VK9A 4DEJA 2LJRA 3UBLA 4MPFA 1XWAA 1TK8B 4G0LA 3ZFBA 4TW5A 5ECPB 2HE3A 4NHZA 5CRHA 2X99A 2E0QA 5F06A 3TUEA 2HQTA 1YKCA 1GTAA 4XTSA 4GSTA 5D9WA 4GRFA 3TKRA 1CQGA 2K8SA 20GSA 3D6IA 4XCSA 3HJPA 2OA7A 2HRFA 4OCFA 4ZXGA 2H1DA 2VCWA 1F9MA 3MAKA 9GSSA 5IQYA 4ZB6A 1OC9A 3E9JB 2LNSA 4X43A 3F4SA 5H5SA 2IFQB 2NVLA 4IW9A 4KCAA 2YZHA 1EOHA 3G7JA 2GS3A 2IMIA 1KBNA 5F8BA 1BAYA 1SL2B 4BVYA 2GVPA 2B5EA 6GSUA 5E59A 5A4UA 2LKUA 2YV9A 3OR5A 3D21A 5DJLA 2HSMB 2VUPA 1M99A 1T4ZA 3FZ5A 4F0CA 4IGJA 4Z7XA 3I43A 3HD5A 4YAVA 4WF5A 2CQ9A 3E3EA 3A2WA 1SK2A 4HDEA 1SJ6A 4K7NA 4KDUA 5IMAA 5ID2A 4N30A 5IMVA 1WE0A 4KB3A 4BA7A 2FHEA 2PPTA 2F8FA 1V58A 3CSJA 5J3RA 3IC4A 2DC5A 1SK1A 4ZBDA 3TJKA 4XIHA 4KAEA 3TOUA 2OKAA 2B7KA 4I2UA 3ZMKA 1MDJA 3L0HA 1F6MC 4ZBBA 1BG5A 4RI7A 1PRXA 2OACA 1YDKA 2WZ9A 3EWLA 2IPAA 3VPQA 1EP7A 1E6BA 5JWRB 8GSSA 2J9HA 3VFIA 2RUEA 3LJRA 4DSSA 3IOSA 1R26A 4ZIJA 4HUAA 4WKWA 1SD8A 2LS5A 2IMFA 4NMUA 5J5NA 5G5FA 4AJ7A 1OC3A 2CVDA 1XZOA 1KNGA 4QL9A 3F6DA 5IIZA 3FR9A 1QUWA 4GQFA 1PKWA 1ABAA 5GAND 1A8YA 2KOKA 2KP1A 3H8QA 4IHUA 4LLRA 2HLSA 3BCKA 2VL2C 2CAIA 1E2YA 1Q98A 1GTIA 1MD3A 1AC1A 2ES7A 1RK4A 3D5JA 3QOUA 1OC8A 2LJKA 1Q4JA 1EEJA 2CT6A 5G30A 2PWJA 2AYTA 3ZZXA 1GWCA 2FLSA 2P31A 1YEXA 3TDGA 2B1LA 4F2IA 3HHVA 1WP0A 1O8WA 1TKDB 2IFQA 3GKMA 3UEMA 1T1VA 1M2BA 4G2EA 5J4UA 3N5OA 3DEXA 1FVJA 1Z6MA 1ZYQB 3TGZA 4KNDA 5D8IA 5DAKA 3HXSA 2C80A 1HQOA 1AAZA 2V41A 5ECQB 2H01A 5D73A 2PN8A 5AIXA 1Z7RA 2CX3A 4O5RA 1SKRB 3S9FA 1K0CA 2G2QA 2HSMA 2EC4A 5ECRB 2PBJA 3HDCA 2JADA 1VGLA 4ACSA 4ECBA 3GSTA 4XS4A 2FCHA 1TI1A 1O81A 2VCQA 2F8AA 3ED3A 4DVCA 2H19A 5JCUA 2E2MA 1H4OA 3FR6A 1SK0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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