4K13A

Structure of hcaix mimic (hcaii with 5 mutations in active site) in complex with dorzolamide
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHSFQVTFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDLGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTEGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Developing isoform specific inhibitors for hCAIX using CAIX mimic
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2013-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4k13A00
4CNXA 1UGDA 4ZWIA 3S97A 3V3HB 3F4XA 4JSZA 4LU3A 4MTYA 5EH8A 3NI5A 3RYYA 5LMDA 3B4FA 1OQ5A 3OIMA 4ZWXA 5A25A 4XE1A 5JEPB 1KWRA 4YVYA 1I9OA 1YDDA 4YXIA 1TEUX 1FQLA 1IF7A 5FLRA 4Q6DA 1CA3A 3L14A 4E9OX 4BCWA 5JGSB 3RGEA 2HKKA 1I9PA 4N0XB 2EZ7A 4WUQA 2WD3A 1CAZA 3JXFA 4ZX0A 3UYQA 3IBUA 2CBAA 4KUYA 2FOQA 2NN7A 1LG5A 1CVHA 1G4JA 1ZGEA 2X7TA 1ZGFA 2NWZA 1CAHA 2HOCA 4KV0A 4MDLA 3T5ZA 5FLSA 1G0EA 1CNWA 4KNIA 5DSKA 1CVCA 1BNMA 3HKUA 4BF1A 1CVEA 5DOGA 5DSQA 4Y0JA 3U3AX 3F7BA 2WD2A 1FR4A 1G46A 3MNJA 2FOVA 5E2NA 1CCSA 5CACA 1KEQA 5AMDA 3S78B 3HKNA 4Q8XA 2OSMA 1CNJA 3T5UA 4Q0LA 3PYKA 4M2VA 5E2MA 2POVA 1CNCA 2CBEA 4YGFA 3OKVA 3JXHC 5E28A 3RJ7A 5HPJA 3V3FA 2QO8A 1FSQA 1I90A 2F14A 3KOKA 3S9TA 3HLJA 1KWQA 3M5TA 3P44A 3V3IB 3DCCA 4PQ7A 1G3ZA 1EOUA 3IGPA 1HEAA 4ETQC 3T84A 3RYZA 2WEJA 3OYQA 3ML5A 4QY3A 5C8IA 3MHIA 4HT2A 1TBTX 2FMZA 1H4NA 4YWPA 1CAIA 1URTA 3OIKA 3DD8A 2H15A 5DSRA 3RG3A 1MUAA 4Q09A 3B1BA 1I9MA 1IF6A 4L5UA 3MNIA 4CQ0A 3D8WA 4QJWA 3S76A 1CAJA 4PZHA 4QIZA 3MHMA 4QSIA 2CBCA 2H4NA 3RZ0B 5FLOA 2FMGA 1BNQA 1UGBA 1CAOA 3OKUA 1MOOA 4L5VA 3IBIA 4YGKA 5SZ7A 1CIMA 3V3JA 4Q7SA 1CVBA 3HS4A 5E5RA 1G48A 3DV7A 1G1DA 2Q1BA 1CNGA 3M5EA 4E3DA 4X5SA 4CNWA 4KUWA 1IF8A 4K0ZA 2OSFA 3RLDA 3KONA 3M40A 4R5BA 5L6KA 1FQMA 5EKJA 1CALA 3SAPA 3DVDA 5JG3B 3KOIA 4XFWA 1HEDA 1Y7WA 3MNKA 5G01A 2AW1A 4YYTA 3ML2A 4RUYA 3NB5A 1CA2A 5FLTA 3P55A 3M14A 1BNTA 2CABA 4HT0A 4KP5A 3MYQA 1OKLA 2Q1QA 4M2WA 1IF4A 3KIGA 1AVNA 1KOQA 3TVNX 4Q8ZA 4QJMA 3W6HA 2NMXA 3D9ZA 4Q90A 3MDZA 2NWPA 4FL7A 3MHCA 1ZSCA 1CAMA 9CA2A 4HBAA 1HCAA 3N4BA 4R5AA 3PJJA 3LXEA 5IPZA 3MNUA 1TH9A 5EH5A 1G45A 1RJ5A 4Q49A 4XIXA 1JD0A 3BETA 3MHLA 4Z1JA 3DVCA 4TWMA 5E5UA 2GEHA 4QK1A 1ZNCA 1XEVA 3V2MA 4YGLA 1HUHA 3P4VA 1CNXA 4QJXA 5FNIA 5BRVA 3V7XA 2EU2A 4MO8A 1YO0A 1CNBA 1RZDA 3EFIA 3NJ9A 5SZ6A 4WL4A 3MNAA 1IF9A 1CRMA 3KLDB 4RFCA 3OY0A 3DCSA 5J8ZA 2Q38A 3M96A 4K13A 2POWA 5E2RA 4QIYA 3M1QA 3RYJB 3V5GA 1YDBA 3P5LA 4PXXA 5JEGB 4YXOA 3HFPA 3P3JA 3DBUA 1H9NA 1CNKA 2HD6A 4Q7VA 4FVNA 1HEBA 4Q87A 2X7SA 3TVOX 5SZ5A 1CNYA 1G0FA 1TTMA 4XZ5A 4WW6A 4RUZA 3RZ8A 7CA2A 2HNCA 1G4OA 3K2FA 5DSLA 2NNOA 1AM6A 4YX4A 2O4ZA 4CA2A 3IEOA 2CBDA 12CAA 3K34A 4YGJA 5BNLA 4M2UA 1CVFA 3V3GB 1HECA 3DAZA 1YO1A 1V9EA 4K1QA 5EHWA 1G54A 1BICA 4MDGA 4K0SA 2NNGA 3M2NA 3P58A 4JSSA 4RIVA 3QYKA 3DD0A 1KOPA 4Q7PA 5FL6A 4ZWZA 2NWYA 4RUXA 1TE3X 1FQNA 1YDAA 3S73B 1CINA 5G03A 1A42A 2VVBX 1RZAA 1G53A 4Z1NA 4DZ9A 1DCAA 1FLJA 4JS6A 3M2XA 1CVAA 4Q9YA 1THKA 2HFWA 1BCDA 2NWOA 3M3XA 1ZH9A 3CAJA 1G52A 4Z1KA 5SZ4A 4JSWA 1BNWA 3Q31A 4TWLA 5CJFA 1CCTA 4QJOA 3DC9A 3RZ5A 1DCBA 1TEQX 3OYSA 3U7CA 1UGEA 1YDCA 4DZ7A 4QSJA 4RN4A 1I91A 5G0CA 1CAKA 1CVDA 5JQTA 4QEFA 4XIWA 1TG3A 5AMLA 3RYVB 5FNHA 3UYNA 4PYXA 5EZTX 1RZEA 2NXRA 3SBHA 5JDVB 5FLQA 3CZVA 3P3HA 3S71B 1HCBA 4QJPA 4LHIA 1CANA 4FU5A 5SZ2A 2NXSA 5JEHB 5EIJA 3U45X 2FOSA 5G0BA 1BN1A 2HL4A 3U47A 3MNHA 5DOHA 5AMGA 1TB0X 4E3HA 3PO6A 3RG4A 4L5WA 1BNNA 5FLPA 4HEWA 2POUA 3W6IA 1RAYA 4ZAOA 3IAIA 4QK3A 4LP6A 4JSAA 6CA2A 4E3FA 3S8XA 2FNMA 2NN1A 4K0TA 5L3OA 1CCUA 3N0NA 1Z93A 5EHVA 1HVAA 1CILA 3KNEA 5DSJA 1I9LA 3FE4A 4YGNA 1I9NA 4YXUA 3D92A 5EHEA 1J9WA 4M2RA 2ILIA 4FVOA 5E2SA 4GL1X 1ZFQA 1CNHA 5DSIA 4YHAA 1UGCA 4Q08A 1FR7A 3CA2A 2IT4A 4CNRA 1BNUA 4E4AA 4RH2A 4Q81A 5BRWA 5FL5A 4ZX1A 1XQ0A 3S75B 2ZNCA 3V2JA 3P5AA 4COQA 5FDCA 3CYUA 3M1WA 1ZSBA 1FQRA 3M2YA 1JCZA 4RFDA 4MLTA 3DCWA 4ZWYA 5FL4A 3KKXA 3R17B 4KUVA 5SZ0A 4Q07A 4N16A 3VBDA 2GD8A 4QTLA 1YO2A 5DVXA 3S74B 5FDIA 3T83A 1RZBA 3KS3A 4E3GA 5JESB 1OKMA 3D93A 3MMFA 3HKQA 1ZFKA 5DRSA 1TG9A 2WEGA 4G7AA 3OILA 1Z9YA 2W2JA 3M67A 3FFPX 3M5SA 4WW8A 5FNGA 1CAYA 4HEZA 3RYXB 5A6HA 3RZ1B 4Q99A 3DVBA 1H9QA 4ITOA 5CLUA 5EKMA 5EH7A 2FNNA 3GZ0A 1I9QA 4KAPA 2FOYA 3MHOA 1I8ZA 3ZNCA 2NNSA 4CACA 2ABEA 1XEGA 2WEOA 1UGAA 3M1JA 5FNMA 3T82A 4Q83A 3TMJA 5DSMA 2NXTA 3RZ7A 1CNIA 2QOAA 4KNNA 5SZ3A 4Q7WA 4Z1EA 1DMYA 1LZVA 4E5QA 3N2PA 4C3TA 3M2ZA 1OKNA 4Q06A 3EFTA 5FNJA 1V9IC 4IDRX 3SBIA 5JG5B 4MLXA 3JXGA 3DA2A 2FW4A 1ZE8A 2FOUA 4Q78A 5DSOA 4ILXA 1FSNA 5SZ1A 4FPTA 4KNJA 4G0CA 2EU3A 3HKTA 4PYYA 2FNKA 3M98A 1BNVA 5DSPA 4QK2A 4KNMA 3S77B 8CA2A 1LUGA 3IBNA 3C7PA 5BRUA 4ITPA 1CRAA 5FNLA 3SAXA 1LG6A 5BYIA 4KP8A 3D0NA 1RZCA 4FIKA 1XPZA 4QJ0A 1RJ6A 4Z0QA 4CNVA 3ZP9A 1DMXA 4WUPA 1LGDA 3BL1A 1JV0A 3FW3A 3MZCA 4R59A 1IF5A 1G6VA 4Q6EA 1BV3A 4QSBA 4E49A 1T9NA 2QP6A 1RAZA 3MWOA 2NNVA 3F7UA 1F2WA 2AX2A 1UGFA 1Z97A 2VVAX 2CBBA 1HUGA 2WEHA 5CA2A 4HU1A 3IBLA 5EKHA 1ZSAA 3K7KA 2CA2A 4HEYA 4HF3A 5JGTB 3N3JA 3M04A 1FSRA 1AZMA 1UGGA 4UOVA 1BZMA 5EOIA 3S72B 4RIUA 1BN4A 3BL0A 4WR7A 4FRCA 3KWAA 4BF6A 3DC3A 4MDMA 2X7UA 3M1KA 4Q8YA 4QSAA 5FNKA 3F8EA 1CZMA 5E2KA 1BN3A 4IWZA 3R16A 5DSNA 5JQ0A 3T85A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4CNX A;  1UGD A;  4ZWI A;  3S97 A;  3V3H B;  3F4X A;  4JSZ A;  4LU3 A;  4MTY A;  5EH8 A;  3NI5 A;  3RYY A;  5LMD A;  3B4F A;  1OQ5 A;  3OIM A;  4ZWX A;  5A25 A;  4XE1 A;  5JEP B;  1KWR A;  4YVY A;  1I9O A;  1YDD A;  4YXI A;  1TEU X;  1FQL A;  1IF7 A;  5FLR A;  4Q6D A;  1CA3 A;  3L14 A;  4E9O X;  4BCW A;  5JGS B;  3RGE A;  2HKK A;  1I9P A;  4N0X B;  2EZ7 A;  4WUQ A;  2WD3 A;  1CAZ A;  3JXF A;  4ZX0 A;  3UYQ A;  3IBU A;  2CBA A;  4KUY A;  2FOQ A;  2NN7 A;  1LG5 A;  1CVH A;  1G4J A;  1ZGE A;  2X7T A;  1ZGF A;  2NWZ A;  1CAH A;  2HOC A;  4KV0 A;  4MDL A;  3T5Z A;  5FLS A;  1G0E A;  1CNW A;  4KNI A;  5DSK A;  1CVC A;  1BNM A;  3HKU A;  4BF1 A;  1CVE A;  5DOG A;  5DSQ A;  4Y0J A;  3U3A X;  3F7B A;  2WD2 A;  1FR4 A;  1G46 A;  3MNJ A;  2FOV A;  5E2N A;  1CCS A;  5CAC A;  1KEQ A;  5AMD A;  3S78 B;  3HKN A;  4Q8X A;  2OSM A;  1CNJ A;  3T5U A;  4Q0L A;  3PYK A;  4M2V A;  5E2M A;  2POV A;  1CNC A;  2CBE A;  4YGF A;  3OKV A;  3JXH C;  5E28 A;  3RJ7 A;  5HPJ A;  3V3F A;  2QO8 A;  1FSQ A;  1I90 A;  2F14 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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