4K1F | Genus

Total Genus 66

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	66
sequence length	198
structure length	198
Chain Sequence	SCGNAKINSPAPSFEEVALMPNGSFKKISLSSYKGKWVVLFFYPLDFTFVCPTEVIAFSDSVSRFNELNCEVLACSIDSEYAHLQWTLQDRKKGGLGTMAIPILADKTKNIARSYGVLEESQGVAYRGLFIIDPHGMLRQITVNDMPVGRSVEEVLRLLEAFQFVEKHGEVCPANWKKGDPGMKPEPNASVEGYFSKQ

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	Tryparedoxin peroxidase
publication title	Structure-based discovery of the first non-covalent inhibitors of Leishmania major tryparedoxin peroxidase by high throughput docking pubmed doi rcsb
source organism	Leishmania major
molecule tags	Oxidoreductase
total genus	66
structure length	198
sequence length	198
chains with identical sequence	B, C, D, E
ec nomenclature	ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date	2013-04-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00578	AhpC-TSA	AhpC/TSA family
A	PF10417	1-cysPrx_C	C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4k1fA00

4POMA 2WZ9A 1U3AA 1XPVA 4PGTA 1GSSA 2O8VB 3GL5A 5IMAA 2O7KA 2BTOT 1SJZA 4K2DA 5J9BA 5B6NA 2RIIA 4TN8A 4MLYA 3VWWA 3EU3A 2H8LA 1QUWA 2FWEA 2DJ1A 3GTUB 4DSSA 2H6YA 4IKHA 3CRTA 2FWHA 3LG6A 10GSA 5B6MA 2YV7A 4MABA 2V1MA 3D0ZA 2DJJA 2DBCA 2OKAA 2F51A 3UBKA 4MPFA 4OD7A 4I97A 2M46A 2O87A 3TKPA 4AJ7A 5LNKe 2FNOA 22GSA 3FZ5A 3GRXA 3CXGA 2H74A 1TOFA 2LV3A 3ZRDA 3SWLA 3LFLA 3D4MA 3TB2A 1OC9A 2XC2A 3KZQA 5G1LA 1DSBA 5CO3A 3A5WA 3VFIA 3A3TA 3GX0A 4JE1A 3HZ4A 1I5GA 2E0QA 4MK3A 1VGLA 1W89A 1U87A 1H75A 2CZ2A 4NHZA 1H4OA 4ECJA 4WXTA 2H01A 2LJRA 3HVVA 2V6OA 3L0HA 4I2TA 1ACVA 1Y6EA 3KJYA 2PVOC 5AGYA 3F6DA 1SD8A 2KP2A 3RDWA 4RQRA 4WETA 3EWLA 3LXTA 1GULA 2HXKA 5J9CA 3F8UA 3HDCA 3IHQA 1Q4JA 5ECRB 3D22A 2GSSA 4MH3A 1QMVA 5CP1A 1QXHA 1YKCA 2LRCA 4L5LA 6GSXA 16GSA 4ZBBA 2OACA 2C0DA 2B6MA 3ME7A 3MSZA 3IV4A 1RQMA 4IGJA 1GUKA 2X8CA 2GT5A 2XBQA 4E8EA 1HNBA 2N5AA 2RLIA 2VL9A 5DALB 3DVXA 5IOXA 1O6JA 1FW1A 1O8WA 5D96A 4J56E 4ZB8A 2H1DA 5FT3A 1K0MA 1T1VA 1SKSB 4AJ8A 3DKSA 18GSA 3WGDA 4N0ZA 2X8HA 3APOA 3EC3A 1PMTA 1TU7A 4J57E 9GSSA 1AQXA 3HJPA 2GTUA 4IHUA 4HOJA 3HKRA 3LSZA 3GSTA 2H0HA 3ZTLA 1NSWA 5L71A 2I3YA 5JWRB 4XS4A 1EEJA 1T00A 2BJXA 3L9VA 4I8BA 5E59A 1XXUA 2VUPA 5ELAA 5F05A 1XIYA 1M9BA 1YF0A 5A5KA 4HI7A 3O6TA 2XPEA 2YV9A 3DRNA 1VF1A 3IAM2 3O76A 5JCGA 4EC0A 1XWCA 3GUSA 3ZL5A 1K0CA 4N11A 4ZBDA 2YWOA 1TKDB 5ECLB 2IMDA 3N5OA 1JLVA 2AUVA 5ID2A 1ZYQB 4PXOA 4XTSA 2C80A 1ERUA 4F0BA 3ZYWA 4CW9A 2B1LA 4RQXA 3UVTA 3WD6A 1M7TA 1O85A 2MMOA 3QCPA 4KCEA 2CAQA 4JR6A 4MJEA 1Z6MA 3DXBA 5IMZA 2IFQB 5J4UA 1MEKA 3FR6A 4KDYA 1BEDA 1M9AA 5G31A 1A2LA 4NV5A 3ZVJA 2LS5A 2YZHA 2CVDA 4JEDA 1XVQA 3US3A 4LLRA 5H5SA 2E2MA 3FR9A 1FB6A 4KNDA 1TRVA 1U88A 2H70A 4FO5A 5D93A 1T4YA 2PBJA 3ERFA 4WBRD 1KNGA 4X43A 3TKRA 1XW9A 4PNFA 5JCWA 2FA8A 4TXOA 3ED3A 5IQYA 1PX7A 4O5RA 3F3RA 1ILOA 1X5CA 1DE2A 1K3OA 1WOUA 1VRSD 2B1KA 2H1GA 3NIVA 3GMFA 3TJFA 2KOKA 4K7OA 2RUFA 2PUKC 2B3SA 4LL1B 3ZFBA 2HT9A 1AUCA 1J08A 4IQAA 4RUVA 5DJMA 3KP8A 1G7OA 1OAZA 3E3EA 3I69A 2OE0A 2PMTA 1OC8A 3RHCA 1RK4A 4KH7A 4K7IA 1SYXA 2WGRA 2B5XA 1K0AA 1XFLA 2WRTA 2PGTA 2DJKA 2IN3A 3DVWA 2PN8A 1YQ1A 3UL3A 1G6YA 1WJKA 3ZITA 2AHEA 1W4VA 1UA5A 5D9TA 4EDZA 5HR3A 3A2XA 2HZEA 2CV4A 2B5EA 3F9UA 3ZREA 5DBQA 1AC1A 3C71A 4BA7A 2C4JA 4GTUA 3N9JA 2VL3A 4OO5A 1VF4A 1TRUA 4E8HA 3GH6A 4LMVA 2H0IA 4KB3A 2DLXA 3DEXA 1Z5YE 1ERVA 3LORA 5JCUA 2MMNA 3LXZA 2EIRA 1R4WA 3IK7A 1NHYA 4RI7A 4K0GA 1ST9A 5KN0A 1IYIA 4BPYA 2C0EA 4HU9A 2OA7A 1B4QA 2CT6A 4LMWA 4TVEA 6GSVA 5IMVA 3GV1A 2V32A 4ACSA 1AIUA 3CSIA 3KM6A 3Q6OA 4YQUA 4MZCA 4DSSB 1Z9HA 3LWAA 2F3MA 4KSOA 2J23A 2MMAA 1NW2A 1EWXA 1JLWA 2E7PA 3U6VA 4L8EA 3F63A 4X0XA 1X5DA 2VL2A 2H75A 1KTEA 3KIJA 5GAND 1QGVA 2DIYA 1V40A 1T7PB 4ECBA 1FVKA 4XRDA 4HQZA 4IS0A 5KN2A 4HJ2A 2Z9SA 1TI1A 4OCFA 4GSSA 2YZUA 1XWKA 4NXIA 1MD3A 5ECSA 3HA9A 3RAZA 1EGRA 2DJ3A 2LSTA 4EXJA 4IW9A 2H19A 2VM2A 1USBA 2HNLA 3TOUA 2QKEA 5GAPD 1OKTA 1MTCA 4BWSA 3D21A 2JZTA 3M3MA 3HD5A 3CRUA 1AQVA 3TKQA 1B9XC 5GSTA 3I9V2 1WE0A 1SENA 4MH2A 2NDOA 4D73A 5IOWA 4J2FA 3WYWA 3QFBC 1OE8A 4KSMA 1PD21 1PSQA 4EVMA 4F82A 2X99A 2R37A 4L5OA 3IR4A 1JZDA 4GQFA 4ZBAA 2R2JA 1A2JA 3RBTA 3FR3A 3IC4A 2IMKA 4MZBA 3E0UA 2VCXA 1GSYA 3IOSA 3IK9A 4HQSA 5G2ZA 3IRAA 3GA4A 3BCKA 5G5EA 3TJGA 1G6WA 4DSQA 1TK0B 2MYGA 2FCHA 2H71A 4EE0A 5H5RA 2QC7A 3L4NA 1XOBA 1LJRA 3UARA 3LGCA 2TIRA 3TJJA 3VURA 4ECCA 1EOGA 1F6MC 3GN3A 2JU5A 5ECOB 5ECHB 4ML6A 5ECPB 4IVFA 2NTOA 1ERWA 4Q5RA 2L5OA 1V9WA 3O3TA 13GSA 1M0UA 1T4ZA 3OR5A 1PRXA 3KMOA 2K18A 2KP1A 4CDOA 4HZ2A 5C04A 3ZIJA 2VL2C 4PQ1A 4ILFA 2LTKA 1ZCPA 1E6BA 3IAS2 2CA8A 1SL0B 4WF4A 1F9MA 1T3BA 4XS4B 3HYPA 1GUHA 3PH9A 5LD0A 5IPHA 2DMLA 2VCWA 3M1GA 1YY7A 5HR2A 3VWUA 4O7HA 2VCTA 2JZRA 4POBA 3UBLA 1AQWA 5HR0A 2F8AA 1LU4A 1K3YA 3GH9A 5HQPA 1KBNA 4BVYA 4EL1A 1MDKA 2R5GA 2N5FA 5D8IA 2C0GA 2M80A 1S3CA 2YCDA 1XWAA 4HJMA 2XPDA 1TP9A 4QL7A 2F8FA 2YANA 5G5FA 2HZFA 5G1KA 1JZRA 1XVWA 2YWMA 3KMNA 1VF3A 2YWNA 4OFNA 2H6XA 5ID2B 1K3LA 2VD0A 2H1AA 2HLSA 4FYCA 5DJLA 6GSTA 1TDIA 3GIXA 5IO2A 1CQGA 2L6CA 1PN9A 2VO4A 1R7HA 3HZ8A 2LNTA 2IWTA 1YZXA 4IBPA 3GNJA 2RM5A 4KDUA 3FHKA 3EURA 1EP8A 2LNSA 4TKYA 1Z7RA 4MZWA 4X1UA 5IMCA 2I9HA 4AF2A 3RHBA 4V1Ap 1HD2A 1YDKA 1SKRB 1A8LA 2H72A 3TUEA 3ZMLA 5A4WA 1GTUA 4AGSA 2CAIA 2I4AA 1GLPA 5EPFA 1A0FA 2IMFA 2WS2A 1TXXA 1N8JA 2PU9C 1EP7A 2I1UA 4TOPA 2LQQA 4KUNA 4PUAA 4K6XA 4TXOB 1XW6A 5B8BA 3GTUA 2A4VA 3IPZA 5FHIA 4EKZA 1QQ2A 4F9ZA 1K0OA 5ECKB 1B48A 1GSQA 4PUFC 3S9FA 3L9SA 4F03A 2LJKA 6GSSA 3ERGA 5EY6A 2MMZA 1V2AA 2H6ZA 3FK8A 4Q5FA 3JCML 4POKA 3CYNA 5HFGA 2ZUPA 4L0WA 4XCSA 3HVSA 1F2EA 1XWGA 3RPPA 4FIWA 5DCHA 2OADA 1QK8A 2HZEB 1XOAA 3QOUA 2VOCA 3ZVJD 5GSSA 1ABAA 1A8YA 19GSA 1E2YA 1OE7A 2F9SA 5H5QA 2X64A 5DQYA 2VCVA 3ISOA 2XBIA 4GSTA 3UOMA 4I2UA 2HYXA 1PGTA 5KN1A 3TRPA 3TGZA 1HYUA 2LRNA 1PX6A 2YNXA 4GF0A 4I5QA 1J9BA 5DCGA 4GQCA 1JZOA 2O89A 5ECIB 1BX9A 2AAWA 1SK1A 3DGQA 2VLVA 4G9HA 1GP1A 2A2RA 2FWGA 3C7MA 3KGKA 2A2SA 5ABRA 1V57A 5IMDA 2C1YA 3W6GA 3UIWA 3W8JA 4F2IA 1SYRA 3HCZA 2HRFA 4MP4A 1NM3A 5CRWA 2REMA 3GX8A 4DEJA 2CZ3A 4WF5A 4HU7A 4LA1A 4JRRA 3UAPA 5J5NA 5FWGA 4ML1A 1YEPA 1PKZA 1GSFA 3GL3A 2P31A 5DALA 3PGTA 5DAKB 2GLRA 2IMIA 1SJ6A 2L4QA 3LJRA 1FAAA 4KW6A 1EV4A 4XS1A 2KLXA 5LCZA 4ZILA 2M72A 2JL4A 2MBSA 4HUAA 2V41A 1HNAA 2XHFA 4YH2A 1MDIA 6GSYA 1EZKA 2WDUA 3VLNA 4FYUA 4V2MA 4KCAA 4EO3A 2VIMA 2IPAA 4XIHA 2I81A 1B9YC 1RW1A 3KD0A 4D73B 2D2ZA 2OBKA 3GYKA 1O81A 1OYJA 3WGXA 2L5LA 4KGIA 1C72A 2H1BA 3WGEA 2CVBA 4WKWA 4HS1A 2E2GA 2CX4A 1M2BA 3LEFA 1R5AA 1TTZA 1TRWA 1GLQA 1WIKA 4TR4A 1PKWA 3L78A 8GSSA 2H0GA 1FOVA 2LEGA 3M8NA 3FW2A 3ME8A 1M2DA 2IL3A 3TJBA 5JWQB 2L57A 1BG5A 2WJUA 2JZSA 4IJIA 1F3AA 2VCZA 3MAKA 2C0FA 2J9HA 1THOA 2GGTA 4H86A 2HI7A 4LL4B 5AIVA 5COHA 1BAYA 1GWCA 3PR8A 5J41A 4ZL8A 2LJAA 2BMXA 2FHEA 3EYTA 1GUMA 1EGOA 1DE1A 4TR0A 4OCEA 7GSSA 4K9ZA 3QAGA 1TRSA 1GTAA 4N30A 5C00A 2HSHA 5IO0A 3TKSE 2FD3A 2ON5A 4G10A 4P3YB 1PA3A 1EV9A 2GSRA 3PINA 4O32A 2VLTA 3EE2A 1O8XA 1B8XA 1KEBA 3P8WA 1OC9B 3FZAA 2C3TA 3TRQA 1AXDA 2R6KA 3VK9A 4MF6A 5HR1A 2GZZA 1JZWA 1BYEA 3MDKA 1ERTA 2B5YA 1WPIA 4IELA 2IMEA 4OFTA 3GKMA 2EIQA 4V1Ag 3GSSA 1FVJA 2HSYA 2OBIA 2HFDA 3LYKA 1DUGA 2WB9A 2MZCA 4RI6A 4IJ3A 3CSHA 2ON7A 3H79A 2DC5A 2GSQA 3HVXA 2N5BA 4EF0A 3Q74A 3BJ5A 4GCIA 4HDEA 1TK8B 2RUEA 3SBCA 4XRAA 1HNCA 4MF7A 1PQNA 2YJHA 4K1FA 1TW9A 2FLSA 3G7YA 3GKNA 2H76A 5KEJA 1I9DA 2FUG2 4NWYA 2L6DA 1B4PA 3F3QA 4MJAA 5JWOB 3VPQA 3IBHA 1OVNA 2LQOA 1T8EB 3F4TA 2AV4A 4IP1A 2G0FA 2GQMA 4PQHA 2FGXA 2JACA 1EEMA 4GLTA 3ZMKA 1K0NA 5A4UA 1S3AA 3FRCA 3GKXA 2K8SA 2VM1A 4HEA2 3R2QA 2FWFA 3BOAA 4MA9A 4NV2A 5CREA 3APQA 1JHBA 3I6AA 3K8NA 3VI5A 1URMA 2WULA 4N10A 2OE1A 3W8SA 4JZQA 2JSYA 4TR1A 2P0GA 3BD2A 3DWVA 3MNGA 3H8QA 5B8AA 5EL8A 4O92A 1BQ7A 1GTIA 1VF2A 2NBSA 2OE3A 5DVBA 2MBTA 3ERWA 4PQIA 5D9XA 4BWQA 4ZB9A 3DYRA 1WRYA 5HFIA 1ZL9A 2YOIA 4OWYA 2CX3A 3H4KA 3FEUA 5J3RA 1YJ6A 3NZNA 4TW5A 4KX4A 1U6TA 2QSIA 3ZLPA 3P7XA 1K0BA 2GS3A 4V2NA 2GVPA 3BCIA 3TKSC 1XBSA 1SJIA 5HFKA 5DQSA 3I43A 5F8BA 5CRDA 5DDLA 3DIEA 3C1SA 4I6XA 4KA0A 2HRNA 3EVIA 3FZ9A 4JU5A 1ZOFA 1YKAA 1XZOA 4ZIJA 1NHOA 3C8EA 5A4VA 2R4VA 5D9WA 1XCCA 4JR4A 1Y25A 1G0TA 3UVHA 3E9JB 3CTFA 2YJ7A 3KP9A 2G2QA 3F6FA 2CQ9A 1F3BA 5IPGA 1MD4A 5ENUA 3M9KA 4OO4A 6GSWA 3KXOA 3TJKA 1R26A 5F06A 5CRHA 2V2GA 4F0CA 4MPGA 4TR3A 1N2AA 4BL7A 4K7NA 1X5EA 3IDVA 2GDRA 4HZ4A 4GWRA 4WEYA 4G2EA 4Z7XA 4YQMA 3J7Yk 3HY2A 5CRGA 4DVCA 1A2MA 4MDCA 3KTBA 1YF1A 3GHAA 1UN2A 4PX1A 4ULXA 3L9UA 5ELGA 3HJMA 4YQVA 4OFMA 1SK2A 1PL1A 4GSNA 1WWJA 1YEXA 2B7JA 3A2VA 3MWHA 3BBYA 3NOFA 4IP6A 2EC4A 2C3NA 4IQ1A 4QL9A 2P5QA 2TRCP 4MJBA 1O7UA 1A24A 1Z6NA 4POLA 3VWXA 1GTBA 5IIZA 2H66A 3FY7A 2H30A 2VCQA 3DD3A 3EU4A 1JFUA 5D9VA 4JBBA 2CVKA 1THXA 5E4WA 5IM9A 3UEMA 1O73A 4L0UA 3WT1A 1V58A 14GSA 1GRXA 2QGVA 2DIZA 2C3QA 1UVZA 4DSRA 3Q19A 4NPBA 2AB6A 4ZXGA 4BVXA 2EIOA 1ML6A 4PURA 3WT2A 6GSUA 3QDNA 3TCOA 4MCUA 1MDJA 4QQ7A 2YN1A 3HXSA 1ZGNA 2OJLA 5G30A 5ECNB 3CMIA 3GFKA 2VD1A 4MMMA 1GSDA 1X9SB 3V1WA 3APSA 3GKKA 4WR5A 2VAFA 1FO5A 3CSJA 1GNWA 2O85A 2P5RA 3QR6A 5GZZB 5IMFA 3C73A 20GSA 4ZL7A 3J7Yb 4PNGA 5AISA 3EMPA 2WCIA 1J0FA 1R5PA 2PWJA 2YP6A 3Q18A 5B7CA 3TRXA 3D6IA 4YAPA 1TK5B 2GT6A 3IXRA 4ZL9A 5CYYA 2B7KA 5F0GA 3QFAC 1DBYA 2X8GA 2PVQA 1TU8A 4XS6A 1GL8A 1S3DA 4Q5QA 2R3XA 1F37A 3RPNA 3ZFLA 2LUSA 4IN0A 5AIXA 4GXZA 2IIYA 1SU9A 3HHVA 2JADA 4GRFA 2ALBA 3F4SA 2V6KA 3EINA 4G19A 1XW5A 2JSZA 3VI7A 3M9JA 4WR4A 1BJXA 1UC7A 2LKUA 3H93A 1EOHA 3D4TA 3P90A 2K8VA 4KE3A 3F0IA 1XWBA 1PL2A 2AJQB 2AYTA 3FKFA 1Z3EA 3F4RA 2FY6A 3CTGA 1AW9A 2PPTA 4MJCA 4EDYA 1FG4A 3QAWA 5EVOA 1A0RP 4Q5NA 1TJDA 2TRXA 2ES7A 3DMLA 2K6VA 3A2WA 2GZPA 2GQKA 4ECIA 1QFNA 2C8UA 2RM6A 4AJ6A 3H1NA 3P2AA 2ZNMA 2VLUA 4CHSA 2ZCTA 4EUYA 4TRXA 1G7EA 3M0FA 1WMJA 5ECMB 3VPTA 3AY8A 1GNEA 3KEBA 3G9BA 3ZIVA 1TI3A 1SK0A 3GURA 1GSEA 2DJ0A 4ZB6A 1WP0A 3D5JA 1GH2A 1ZMAA 1ZYEA 2LRTA 3QD9A 2H73A 4TR1B 1ZZYA 2KHPA 1M2AA 1V98A 3EMXA 3UMAA 2DJ2A 4FH8A 1Z7PA 1LBKA 2IFQA 3TKSA 1ON4A 3LQ7A 2HE3A 4ISDA 1OC3A 2GQLA 4KAEA 5KN3A 2YPMA 3LYPA 1FHEA 2GZYA 4K8MA 5F07A 2WFCA 4NMUA 1X9MB 2GSTA 3IA1A 1SKWB 4OMVA 3IE3A 2DSAA 3KH7A 1OKDA 3KTLA 1SD9A 4FYBA 3UJ1A 3KCMA 3HJOA 4NHWA 5DAKA 2IJYA 3VWVA 1X9WB 4V2LA 1M99A 4TXVA 5D73A 3QAVA 1X0RA 3TOTA 4ID0A 4KDXA 5INYA 1CQHA 5CAXA 1K0DA 4WBJA 4MF5A 3CBUA 3FZ4A 17GSA 3G7IA 2NPBA 11GSA 4N0VA 1HQOA 4XHMA 2YWIA 3KH9A 3QPMA 4K0NA 3G7JA 2DMMA 1Q98A 2KUCA 12GSA 1A23A 2FA4A 3TDGA 1SL2B 4NAXA 2NVLA 3U5RE 5AN1A 1FB0A 3C1RA 4YAVA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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Chord Diagram

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