4K5YA

Crystal structure of human corticotropin-releasing factor receptor 1 (crf1r) in complex with the antagonist cp-376395
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
411
structure length
407
Chain Sequence
HYHVAAIINYLGHCISLVALLVAFVLFLRARSIRCLRNIIHANLIAAFILRNATWFVVQLTMSPEVHQSNVGWCRLVTAAYNYFHVTNFFWMFGEGCYLHTAIVLTNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLSVAKSELDKAIGRNSNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRSALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVIATFRTGTWDAYDRLRAWMFICIGWGVPFPIIVAWAIGKLYYDNEKCWAGKRPGVYTDYIYQGPMALVLLINFIFLFNIVRILMTKLRASTTSETIQARKAVKATLVLLPLLGITYMLAFVNEVSRVVFIYFNAFLESFQGFFVSVFACFLNS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein, receptor
molecule keywords Corticotropin-releasing factor receptor 1, T4-Lysozyme chime
publication title Structure of class B GPCR corticotropin-releasing factor receptor 1.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 148
structure length 407
sequence length 411
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4k5yA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4k5yA01
227LA 1L20A 1C66A 1QTVA 5AZDA 4EPIA 1L22A 2RB2X 1L54A 1G1VA 1JTNA 211LA 155LA 2ANVA 1QT6A 224LA 5H2NA 2HUKA 3C81A 2L78A 1JTMA 4I7JA 4QI1A 1PXRA 3SB5A 2AT9A 4HWLA 137LA 200LA 4OO9A 1C62A 1C6CA 3FI5A 3L2XA 1JQUA 5H2MA 4UHRA 161LA 1QKPA 2Z73A 5B6XA 259LA 1SWYA 2QARC 164LA 4OV0A 4G7QB 3C82A 240LA 1WTHA 1G0JA 1D2YA 3DN1A 1S52A 2L6XA 175LA 1C6QA 242LA 163LA 1EHKB 1C61A 1E12A 1L9HA 2OTZX 2YCXA 3G3WA 3HT9A 4IAQA 4I7OA 4L35A 3QJRB 1X0I1 3V2WA 1UCQA 2IGCA 1M0LA 1SSWA 1C69A 3NSBA 3QJTB 119LA 1SX2A 1KMEA 4AMJA 1P2LA 3SB9A 3VW7A 1L13A 1L99A 236LA 1GZMA 158LA 180LA 1XJIA 2KSYA 149LA 1P6YA 5AX0A 3UG9A 2RBPA 262LA 142LA 1L51A 3FA0A 4JR8A 1QUHA 4W56A 2OE4X 1C64A 166LA 4LZMA 2PEDA 1D3NA 1L45A 4E97A 4I7KA 2B73A 217LA 3DN3A 1L40A 198LA 1LGUA 230LA 1PQDA 1DYAA 1L63A 1L42A 1L09A 2B70A 4EXMA 1OWYA 1L53A 1QSQA 4EKQA 1L08A 4MBSA 1SSYA 3PBLA 4BWBA 3OAXA 1L34A 1KNIA 195LA 170LA 1OVHA 1C6TA 4G70B 4X32A 3GUPA 3MBVA 3UZAA 3PXOA 4XT1A 1TLAA 201LA 162LA 152LA 1C6IA 1L85A 1XJUA 2RBQA 243LA 4G71B 1P46A 1ZYTA 1BM1A 1C6NA 1LYEA 1LI3A 1X0K1 102LA 1DYFA 1CU0A 1G0QA 4LDEA 2I20A 4GP5B 1G0LA 114LA 1L28A 2O79A 1S54A 3T45A 2R4RA 1L93A 1L06A 226LA 108LA 1OWZA 1T6HA 1C68A 2HULA 1OYUA 1QKOA 1S8JA 3HUAA 1DYBA 1XMEB 3CODA 235LA 1QTDA 1L57A 214LA 2X72A 5G2DA 3AM6A 1L26A 3DMXA 1C6HA 2EI4A 2Y03A 255LA 231LA 2WJKA 1G07A 5AWZA 1ZWNA 1PQJA 1G0GA 4DJHA 2OU0X 4GP4B 3HANA 3HDEA 258LA 3KJ6A 107LA 157LA 1L31A 5A44A 181LA 1S8LA 1X0SA 1L84A 247LA 238LA 1L73A 4L6RA 1L15A 4PXKA 1XEPA 4ARMB 1C3WA 4KNFA 213LA 1QTCA 2OU9A 1L21A 4JQ6A 1L66A 1L98A 219LA 3UONA 3DMVA 5ETZA 5H2JA 1OVKA 4WW3A 1SX7A 2BRDA 3DKEX 4GP8B 145LA 1L05A 6LZMA 1LW9A 245LA 2F2QA 2NTWA 169LA 5H2OA 1C6JA 1KGBA 3HARA 2RH1A 5LWEA 1LWKA 4G7SB 129LA 1CV1A 1L67A 3PWHA 2NTHA 1L65A 218LA 1P8UA 4YX7C 1F88A 1L72A 3HUKA 1QSBA 2Z6BA 2JAGA 1CX7A 1AP9A 4W54A 1QS9A 1TN5A 5AX1A 4EIYA 241LA 1DZEA 5AHYA 1C8SA 1QUDA 4PK0A 205LA 3P0GA 3ZEVA 1L07A 1U19A 1QS5A 2OU8A 2F95A 1C6KA 239LA 3BVDB 1L61A 4W57A 2YDVA 1CUPA 1L68A 1LN6A 1VJMA 187LA 1L86A 1P5CA 3ODUA 4S0WA 3S3BB 232LA 1DYGA 1L38A 3HDFA 2B75A 1L96A 3C9MA 1C63A 233LA 3QBLA 1L83A 3HH4A 3AYMA 3QAPA 1P8HA 1C6FA 138LA 4K5YA 4BEZA 2ZIYA 5H2LA 1CU3A 2ZFEA 1GU8A 3QJVB 1CV3A 1L44A 2KSAA 1L19A 2OE7X 209LA 2CUUA 3DN8A 172LA 151LA 3C8SA 216LA 4ARMA 1P7SA 1D3MA 2QPEB 3S3CB 3AYNA 1Q5IA 5G36A 1XJTA 1GUEA 1D2WA 3C80A 3C9LA 4GYCA 5FJGA 1L18A 1QUOA 1C6DA 249LA 1L81A 3V2YA 1L59A 1L16A 1CVKA 1L58A 1H68A 5G28A 1CV4A 1QTBA 4MD1A 1LI6A 4PJZA 4NC3A 1C60A 5H2IA 3EH5B 160LA 2RB1X 3HTGA 4N4WA 3OE8A 1LYDA 173LA 1KG8A 3CAPA 5JJJA 1L23A 4AQNA 3EMLA 1IW9A 2Y01A 5DYSA 1NHBA 143LA 1KW7A 3VHZA 3EH3B 2KS9A 3VG9A 3HTFA 3NY9A 260LA 1JV6A 4GRVA 3VVKA 3S8FB 1L41A 4QIDA 1E0PA 130LA 252LA 2YCYA 3DN6A 1G0KA 3HT8A 3FADA 1M0MA 127LA 141LA 1QUGA 1O0AA 2O4WA 4XTLA 4BVNA 1L12A 4DKLA 123LA 1L36A 1C6GA 2RBOA 3CDRA 3HH3A 1G0MA 1TN0A 220LA 2B72A 5BR2A 1QTHA 2LC9A 1LYHA 3RFMA 3HWLA 1CUQA 1EPYA 1XIOA 1LLHA 184LA 2YCWA 3A7KA 1L0JA 3HASA 1DYCA 222LA 4IARA 1QT4A 1MGYA 2Z55A 4AMIA 4I7MA 3S3DB 185LA 1L50A 1L76A 2WJLA 256LA 2OTYX 2B7XA 4MD2A 4UG2A 5A45A 1L0KA 3C7WA 1LYIA 1P3NA 2QPDB 2B6TA 5F8UA 2HUMA 4EPFA 150LA 1L46A 4W59A 206LA 3QJQB 4I7SA 1PQKA 1C6PA 3PDSA 3HAPA 5G53A 1P8IA 1OVJA 3HUQA 3DN0A 1QT8A 112LA 3UZCA 2F93A 3PQRA 261LA 1FBBA 168LA 221LA 171LA 3C8QA 3JR6A 1C67A 4I7LA 4ARLA 4GBRB 3VI0A 1L69A 1G0PA 244LA 1D3FA 3GUOA 4I7PA 196LA 3HAOA 4N6HA 3QBKA 3RZEA 1BRXA 4G7RB 188LA 2I35A 1HZXA 3HH6A 5B6VA 4ARJA 4EJ4A 5J7AA 3QJUB 3RUNA 178LA 7LZMA 118LA 174LA 146LA 4EKPA 3QAKA 1L49A 183LA 3DN2A 3S8GB 5AHZA 1L30A 4I7QA 5B6WA 182LA 1DYDA 250LA 1L03A 3C8RA 4X1HA 4FBZA 1P37A 3UTYA 1OV7A 3NYAA 104LA 3CDQA 4PXFA 2F32A 1L35A 1PQIA 1LYJA 225LA 1G06A 1JGJA 1L87A 2I21A 2LNLA 4G72B 3UTXA 3SB8A 3ABWA 1T8AA 2O7AA 2Y00A 4HYJA 4W55A 3ZPQA 1L17A 1S51A 1L11A 3DN4A 5B2NA 2F47A 1CWQA 2B6WA 3GUMA 1C6MA 1LGWA 5JJEA 210LA 144LA 2NTGA 120LA 237LA 223LA 1LYGA 5DHGA 1L56A 212LA 3C7YA 1L0MA 5B35A 1KY0A 115LA 1L33A 1L80A 5G54A 5B0WA 109LA 1L55A 4I7RA 103LA 1I6SA 165LA 2LZMA 229LA 4YXAC 2KSBA 4EA3A 2M3GA 1QTZA 2LCBA 122LA 1L79A 3OE0A 1L77A 3QJSB 2RBNA 3L64A 4EKRA 1UAZA 251LA 1L94A 1L89A 113LA 234LA 3ZPRA 1G1WA 1P36A 5G2CA 2G87A 253LA 1K28A 1L25A 5ITCA 3F8VA 2RBRA 148LE 3D4SA 4ZPUA 3QDCA 191LA 4GBRA 4EKSA 1QM8A 3HT7A 156LA 4FAAB 1ZURA 4A4MA 246LA 3K2RA 1F4ZA 1PQOA 3SBBC 1KG9A 257LA 248LA 4YXCA 1L92A 3NY8A 2R4SA 192LA 5G2AA 5B6ZA 1L95A 3LZMA 1P2RA 5A8EA 2Y02A 1JFPA 1LYFA 1CV5A 3HTBA 4X31A 4ARQB 3HU9A 3OE6A 1D3JA 3DDLA 131LA 1IW6A 2HPYA 1SWZA 1IXFA 2VT4A 1L97A 4DAJA 1S53A 139LA 2Q9EA 1L02A 2OE9X 4MQSA 3CDVA 254LA 4I7NA 4N4YB 197LA 3QBIA 3GUKA 1CV6A 1L88A 3GUJA 5I14A 1C8RA 1C65A 1FBKA 1L75A 2J4YA 1CTWA 2OEAX 4W52A 140LA 2RAZX 3UTWA 4XTOA 1L14A 1C6BA 1L70A 1C6AA 4BEYA 228LA 3F9LA 5C1MA 3HAQA 4BUOA 1L24A 3G3VA 1L90A 3DMZA 2Q9DA 147LA 2B6XA 4XT3A 1LGXA 3COCA 1L10A 4W58A 2I1XA 2ZZLA 1PXSA 4FA7B 1L48A 4MQTA 4LDOA 4KLYA 3HH5A 3WQJA 2NTUA 177LA 1CU6A 3REYA 5LZMA 167LA 1PY6A 1BRRA 4W51A 1KY1A 2RBSA 4I7TA 1LWGA 111LA 1T8FA 5H2KA 1T97A 1H2SA 1P56A 3SB7A 1CX6A 3X3CA 1QT5A 2B74A 3DNAA 1R84A 3C7ZA 1B6IA 2Y04A 3QBGA 4HYXA 1JV7A 2A4TA 5JJNA 4GPOA 3CDOA 2YCZA 1L37A 2QB0B 4Y9HA 126LA 1L74A 4J4QA 3SB6A 2JAFA 1L47A 1L52A 5TGZA 1CU5A 1OV5A 4FPDA 3G3XA 1CV0A 189LA 4ARQA 3GUNA 3EH4B 1KS3A 128LA 3SN6R 1QHJA 1R2NA 3VGAA 5H2PA 4ARPA 1QT3A 3DQBA 1L39A 1L64A 3SBAA 4W53A 4JKVA 4QRYA 4BV0A 3GUIA 4IAPA 5H2HA 125LA 5B6YA 1AT9A 1C6EA 5EN0A 1L29A 186LA 1L00A 1L32A 1L82A 2B6ZA 215LA 3GULA 1D9WA 1L71A 3HTDA 159LA 1P64A 1Q5JA 3HT6A 1L43A 1L62A 1T8GA 1BRDA 4IB4A 1KW5A 1L01A 3OE9A 5BR5A 1QT7A 199LA 190LA 1LI2A 1M0KA 4XXJA 1LPYA 3CDTA 3NS0A 2B6YA 1PQMA 3C83A 2YDOA 5DHHA 5KKHA 4LDLA 4WAVA 3X3BA 176LA 3UTVA 4TL3A 5B34A 3HU8A 5ITEA 1C6LA 1L60A 2RAYX 1CU2A 110LA 1L04A 1L27A 1VGOA 4XTNA 2ANXA 2RB0X 1F50A 1L91A 1DYEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BVKC 211LA 1NWGA 2HUKA 3C81A 4GN3A 4QI1A 2I26L 4B1AA 1C62A 1C6CA 1JQUA 4UHRA 1BWIA 5FELA 259LA 1HC0A 3RT5X 2X0AA 3AZ5A 1D2YA 175LA 1AZFA 1JISA 242LA 1EHKB 2LHMA 1L9HA 3WL2A 5DN5A 135LA 1EL1A 1DXJA 3V2WA 1M0LA 1REZA 1KMEA 1IWTA 4LFPA 3VW7A 2ZYPA 1LAAA 2KSYA 3AZ6A 149LA 4DDBA 2MECA 4XJFA 1QUHA 1GXV2 1XGTC 1GFVA 2OE4X 1D3NA 4WM4A 2B73A 3DN3A 1L40A 198LA 1DYAA 1L63A 1L42A 1NDGC 1GBWA 3PBLA 4H9AA 1YKXX 1C6TA 4G70B 5KXZA 2ZILA 3GUPA 3CQLA 3PXOA 4C3WA 1LYOA 3RU5A 1RE2A 1IP7A 2RBQA 1IOTA 4ANRA 5KXWA 3WMKA 1ZYTA 4NSJA 3T45A 1IY4A 1L28A 2O79A 3G3BB 1L06A 1XGRC 3WVXA 1QKOA 5KXKA 3CODA 3HUAA 5LVKA 1A2YC 3AM6A 1L26A 3WYHA 5IELA 4HV2A 1G07A 1PQJA 4DJHA 5C6LA 2OU0X 2ZIJA 3HANA 3HDEA 4WOAA 258LA 1C46A 1LZTA 3P65A 181LA 1CKHA 2I25L 1X0SA 247LA 4X3BA 238LA 1LHKA 4WLDA 2BQNA 4KNFA 1GF5A 1BWHA 2EQLA 4DD1A 1L98A 2HEFA 219LA 3UONA 5H2JA 1OVKA 4HJZA 3A6BY 4QDNA 4A7DA 1PS5A 245LA 2F2QA 2NTWA 3VWOA 1KGBA 3TXIA 4G7SB 1EQEA 1O23A 1C10A 4NWEA 1YKYX 1CJ9A 1AP9A 4W54A 5AX1A 1QUDA 4PK0A 1NDMC 2OU8A 2F95A 1LZEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1PXS A;  4FA7 B;  1L48 A;  4MQT A;  4LDO A;  4KLY A;  3HH5 A;  3WQJ A;  2NTU A;  177L A;  1CU6 A;  3REY A;  5LZM A;  167L A;  1PY6 A;  1BRR A;  4W51 A;  1KY1 A;  2RBS A;  4I7T A;  1LWG A;  111L A;  1T8F A;  5H2K A;  1T97 A;  1H2S A;  1P56 A;  3SB7 A;  1CX6 A;  3X3C A;  1QT5 A;  2B74 A;  3DNA A;  1R84 A;  3C7Z A;  1B6I A;  2Y04 A;  3QBG A;  4HYX A;  1JV7 A;  2A4T A;  5JJN A;  4GPO A;  3CDO A;  2YCZ A;  1L37 A;  2QB0 B;  4Y9H A;  126L A;  1L74 A;  4J4Q A;  3SB6 A;  2JAF A;  1L47 A;  1L52 A;  5TGZ A;  1CU5 A;  1OV5 A;  4FPD A;  3G3X A;  1CV0 A;  189L A;  4ARQ A;  3GUN A;  3EH4 B;  1KS3 A;  128L A;  3SN6 R;  1QHJ A;  1R2N A;  3VGA A;  5H2P A;  4ARP A;  1QT3 A;  3DQB A;  1L39 A;  1L64 A;  3SBA A;  4W53 A;  4JKV A;  4QRY A;  4BV0 A;  3GUI A;  4IAP A;  5H2H A;  125L A;  5B6Y A;  1AT9 A;  1C6E A;  5EN0 A;  1L29 A;  186L A;  1L00 A;  1L32 A;  1L82 A;  2B6Z A;  215L A;  3GUL A;  1D9W A;  1L71 A;  3HTD A;  159L A;  1P64 A;  1Q5J A;  3HT6 A;  1L43 A;  1L62 A;  1T8G A;  1BRD A;  4IB4 A;  1KW5 A;  1L01 A;  3OE9 A;  5BR5 A;  1QT7 A;  199L A;  190L A;  1LI2 A;  1M0K A;  4XXJ A;  1LPY A;  3CDT A;  3NS0 A;  2B6Y A;  1PQM A;  3C83 A;  2YDO A;  5DHH A;  5KKH A;  4LDL A;  4WAV A;  3X3B A;  176L A;  3UTV A;  4TL3 A;  5B34 A;  3HU8 A;  5ITE A;  1C6L A;  1L60 A;  2RAY X;  1CU2 A;  110L A;  1L04 A;  1L27 A;  1VGO A;  4XTN A;  2ANX A;  2RB0 X;  1F50 A;  1L91 A;  1DYE A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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