4KAE | Genus

Total Genus 78

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	78
sequence length	225
structure length	220
Chain Sequence	b'LYFQSMTLRLYSYWRSSSAWRVRLGLALKGLAYEYRAVDLLAQEQFQAAHMSQVPVLEVEEDGRTHLLVQSMAILEWLEERHPEPALLPPDLWGRARVRALAEHVNSGTQPMQNALVLRMLREKVPGWDREWARFFIARGLAALETAVRDGAGRFSHGDAPTLADCYLVPQLYNARRFGLDLEPYPTLRRVDEACAALAPFQAAHPDRQPDAPPPDRRTP'

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of Maleylacetoacetate isomerase from Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1, TARGET EFI-507175, with bound dicarboxyethyl glutathione and citrate in the active site rcsb
molecule keywords	Maleylacetoacetate isomerase
source organism	Anaeromyxobacter dehalogenans
molecule tags	Isomerase
total genus	78
structure length	220
sequence length	225
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 5.2.1.2: Maleylacetoacetate isomerase.
pdb deposition date	2013-04-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF02798	GST_N	Glutathione S-transferase, N-terminal domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1050.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	4kaeA02
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4kaeA01

2TRCP 5HFGA 2VCVA 3GN3A 3VI7A 3HZ8A 3WGDA 2WFCA 2I1UA 1MD4A 3ERGA 4JBBA 3TKSA 1SL2B 6GSWA 1YY7A 1QQ2A 1E6BA 4IP6A 4FIWA 1PD21 4MH3A 1M2BA 11GSA 4PGTA 2VL9A 2PMTA 3FKFA 4ID0A 1ZL9A 3GMFA 3LSZA 2H6XA 2KLXA 3ZYWA 4QL7A 4EDZA 1LU4A 2GS3A 1SKWB 2MYGA 3NZNA 1SK0A 1W4VA 1K3YA 3GX8A 3F63A 4OCEA 2IJYA 4IVFA 5IO0A 4ECBA 5ECPB 2LKUA 2CZ3A 3U6VA 3R2QA 3UMAA 3TJKA 1GUMA 5D73A 4RI6A 3C8EA 1OKDA 2C3TA 5ECSA 3VURA 1OAZA 1OKTA 1SJZA 3H4KA 4TXVA 3TUEA 2I3YA 4GSTA 4ECIA 5LCZA 3A3TA 2CVKA 4YAPA 4WETA 5FT3A 5G5FA 2VL2C 3KMOA 4OFMA 2GZZA 2AYTA 3V1WA 2QSIA 1X9MB 2IFQB 4L0UA 1A0RP 1A8LA 4GSSA 3IDVA 3EE2A 1TRVA 3F3QA 1YDKA 4XTSA 1PSQA 3VI5A 2DMLA 5CRDA 1GL8A 3QR6A 4TR0A 2DJ3A 4HS1A 5IMVA 4FQUA 2AV4A 2DJ1A 1X5DA 4NHZA 3P90A 2PGTA 1XZOA 2REMA 1S3DA 1ST9A 3FEUA 1LBKA 1OE8A 3CMIA 2H30A 3RDWA 1PX6A 3CTFA 1F3AA 1XOBA 2HRAA 1PL1A 2XBQA 4WBJA 2HSHA 3DVXA 1N2AA 2WCIA 1A2MA 3GYKA 3KTBA 4MP4A 4MABA 3VPTA 2PWJA 2I81A 5J4UA 1OC9A 5GAND 4NWYA 2L5OA 4Q5QA 4YQMA 3TKPA 3TJFA 3JCML 4HZ2A 1E2YA 2FNOA 5DQYA 1WE0A 1T4YA 2H0IA 2FWFA 2VLVA 3RPPA 3TB2A 2EIRA 1AQXA 1Z5YE 3ERFA 3R3EA 4JU5A 1UVZA 4NV2A 2PU9C 4PNFA 5AN1A 4MPGA 1HNAA 4G9HA 2B1LA 3CBUA 5HR2A 1WPIA 4ILFA 2XHFA 4L0WA 3CSIA 1GH2A 3L4NA 1O73A 3HDCA 4ML6A 5L71A 4KX4A 3SWLA 2OADA 3ME7A 1ACVA 5E59A 2EIOA 2DJ0A 1EZKA 4F03A 1EEMA 2F9SA 4JRRA 1GNWA 2A4VA 2LNTA 4OD7A 4ULXA 4EE0A 3HVVA 3PH9A 3E0UA 2AAWA 1KBNA 3FR9A 3ME8A 5KN0A 3KZQA 1XCCA 4O92A 3IR4A 2FWEA 4IJ3A 4JR4A 2LNSA 5KN1A 2GQKA 2GZYA 4PQ1A 3C1SA 2ALBA 2IMFA 3D4MA 5D9VA 3KP8A 3Q19A 3GX0A 1TP9A 1GRXA 1V40A 2WJUA 4HQSA 1PKZA 1DSBA 2FGXA 3FZ5A 4ZL7A 3GURA 4F9ZA 4QL9A 3LYPA 2XC2A 3OR5A 1TJDA 4KDUA 3FY7A 4N30A 4POKA 1T3BA 3EMPA 1YEPA 3EINA 2CA8A 2VM1A 5DAKB 1WOUA 2HSMA 3EMXA 3MAKA 1U3IA 2C8UA 2FA8A 5IMZA 1K0BA 5B7CA 5LD0A 4KB3A 3C1RA 5EL8A 4OMVA 2K9FA 3HCZA 2B5XA 1BG5A 1UN2A 1EV4A 4X0XA 3GIXA 3FK8A 3GTUA 1USBA 3PPUA 2NBSA 4HJ2A 4KSMA 2PVOC 1YEXA 4EUYA 3EURA 4V2MA 1TXXA 2DMMA 1C72A 2H75A 2DJ2A 5DQSA 5HFKA 1XIYA 2FY6A 5H5SA 1ILOA 3TOTA 3HVSA 1G6YA 3F0IA 2K8VA 4AF2A 4EF0A 4XS6A 4ZL8A 1MTCA 1GNEA 5J5NA 4MJCA 3QAVA 3DWVA 4ZBDA 2DJKA 3A2VA 1B8XA 3F4TA 5CP1A 2VLTA 3CYNA 4IN0A 2GT6A 4POLA 2MMOA 2P31A 4ZB9A 4CW9A 5F07A 2JSZA 2DC5A 2VUPA 2FD3A 4I97A 2IN3A 3TDGA 2H74A 2L4QA 4ECJA 3CSJA 2TIRA 1NSWA 3VWVA 4XS1A 1V9WA 1TOFA 7GSSA 5B8BA 1JZRA 2BTOT 2LJRA 1UA5A 4F2IA 2CT6A 3D22A 4J56E 4G2EA 4TKYA 3GSTA 2V1MA 1EGOA 5B6NA 4J57E 1XBSA 1JLVA 3LYKA 1SL0B 4QQ7A 3WYWA 2OBKA 3QD9A 3UARA 1BYEA 2LSTA 2F51A 3D4TA 3KIJA 2GSSA 2YWMA 3VWUA 1NM3A 1M2AA 2R4VA 2YWOA 2FUG2 5HR3A 2YV9A 2B5EA 2B7KA 2P5RA 5KN2A 2WRTA 1ON4A 4K9ZA 3F4RA 5IMDA 6GSTA 1ML6A 5G30A 4MF5A 1O8WA 2UZ8A 2GZPA 2WDUA 2ES7A 2RLIA 1FHEA 5ID2A 2GQMA 4KA0A 1NHYA 3F6FA 1AXDA 2CX3A 13GSA 2XBIA 3KH9A 3DEXA 3FZAA 2O7KA 3ZVJA 2PERA 1CQGA 1WWJA 4MJEA 1R26A 3NOFA 5J9BA 4GRFA 1OC3A 4WKWA 1Z3EA 3M9JA 3M1GA 1ZCPA 2J23A 2CQ9A 1PN9A 1GSYA 4KH7A 1K3OA 3KJYA 3UIWA 3GH6A 2I9HA 2FWGA 2VCTA 12GSA 4BL7B 5F06A 2HSYA 1RK4A 2H70A 2GLRA 4BVXB 2X8GA 2KP2A 1PX7A 3UJ1A 3QAGA 2YANA 3P2AA 4MZBA 2WULA 4TW5A 5KEJA 2CV4A 3G7IA 1R5PA 4Q5RA 2X99A 2GDRA 1O8XA 1XW5A 2C0EA 3EU4A 5DAKA 1OE7A 2E7PA 3FR6A 4XCSA 1G0TA 3DYRA 1YZXA 5D9TA 2NVLA 4OFNA 4G0KA 1SK2A 3WGEA 2Z9SA 3IOSA 4KE3A 3IAM2 2LEGA 1ZYEA 5LNKe 5CRGA 2YZUA 1SYRA 1BAYA 5D8IA 3DKSA 5F0GA 4JEDA 1F6MC 2M46A 5JWRB 4BWQA 2VCQA 2KUCA 2KP1A 3CRUA 3E9JB 4AJ8A 5DVBA 3F3RA 2IMEA 2OBIA 4KUNA 6GSXA 3APQA 1FB0A 2GVPA 3LGCA 3FW2A 2NDOA 5GSSA 2HSMB 2O8VB 1KTEA 2MMAA 2N5AA 3H1NA 2YNXA 4K0GA 1HNCA 3CSHA 2LTKA 1DE1A 2CVDA 3S9FA 4GCIA 3D21A 5AIVA 1T7PB 4YQVA 3GTUB 1M0UA 1TI3A 2C0GA 2VIMA 1F2EA 4FYCA 5HQPA 4OWYA 3HHVA 2H71A 4K7IA 2ON7A 1K0DA 2L6CA 2V41A 4X1UA 4PUAA 4IQ1A 3BOAA 4P3YB 1HYUA 3C73A 3CRTA 4EVMA 3GRXA 1GLPA 2GSRA 3TRQA 3LJRA 3KGKA 2H0HA 22GSA 4MZWA 3IA1A 2IMDA 3IC4A 3M9KA 4MF6A 4PTSA 2V32A 3K8NA 3MDKA 4I5QA 4ZXGA 2H6ZA 4I6XA 1YF0A 1GUHA 1VGLA 1BX9A 4ACSA 1QUWA 2JZRA 3TRPA 2XPDA 1X9SB 2WZ9A 5DJMA 2R37A 5ECLB 3D5JA 2R2JA 2C1YA 5AIXA 16GSA 1SKRB 1J0FA 2A2SA 5F8BA 4BWSA 1JZWA 5ENUA 3DMLA 1TRUA 2VCZA 5B6MA 3M0FA 4KF9A 1PL2A 2ZNMA 5EVOA 2J9HA 2VOCA 1G7OA 2MBTA 1XPVA 3KTLA 1Y6EA 2PBJA 4V1Ap 4HJMA 4KAEA 5DBQA 1U88A 4OO5A 2X8CA 2XPEA 3J7Yk 4F0BA 4V2LA 1O81A 2VL3A 2HZEA 1K3LA 5INYA 2HT9A 2HRNA 1R4WA 2L59A 1SD8A 4LL4B 4KW6A 3GSSA 2B5YA 2RIIA 5G1KA 1WJKA 4TXOA 4NMUA 1ZOFA 2LQQA 4XRAA 1KEBA 2HZFA 4G0IA 4RUVA 3D0ZA 3GL5A 1EP8A 2H01A 3FHKA 10GSA 1PKWA 2AJQB 4KGIA 5IOWA 2QC7A 1G6WA 3FZ4A 1X5CA 4ISDA 3DRNA 3GNJA 2IMKA 2LRCA 1EOHA 3I6AA 2L6DA 3TCOA 3G7YA 4IGJA 1LJRA 5AISA 4IP1A 4G10A 1WMJA 5ID2B 4ZB8A 1K0OA 2F3MA 4JR6A 4LMWA 3QOUA 4BL7A 3IK7A 1DUGA 4K6XA 1BQ7A 4HU9A 3ZITA 1VF4A 2CVBA 3ED3A 4DSSA 6GSVA 1MEKA 4BVXA 2LRTA 2MMZA 3VFIA 2YP6A 3KEBA 3KMNA 4YH2A 4GQFA 1GSSA 1ERTA 1PA3A 2OJLA 5G5EA 4K7NA 2FA4A 5BMUA 3MNGA 4FYBA 2WB9A 2HRFA 2PN8A 4XHMA 4IW9A 3TRXA 2M80A 1TW9A 1ERUA 4F82A 3QDNA 3P7XA 3ZVJD 1SYXA 1ZYQB 2PVQA 4FO5A 4RQRA 2JL4A 3HYPA 1GTAA 1F9MA 1AAZA 4GXZA 5ECMB 4X43A 4NAXA 1OVNA 1R7HA 4I2TA 4PQHA 4WR4A 3APSA 5C00A 2K8SA 4LMVA 1M9BA 1KNGA 2YN1A 1SU9A 3QCPA 1M7TA 2FLSA 1XW6A 4POMA 1O6JA 3F4SA 4Q5NA 4GQCA 1TU7A 2H73A 2JACA 5F05A 3VWWA 2OE1A 5CO3A 1I5GA 1XWKA 1VF1A 5GSTA 4HQZA 5IPHA 1Z6MA 5IPGA 5JCWA 3RHBA 4CHSA 4K8MA 4MK3A 3O3TA 1AUCA 1XW9A 3IXRA 5GZZB 1T1VA 3ZZXA 2AUVA 1EV9A 4BPYA 5IMAA 2TRXA 2LS5A 2JZSA 5DDLA 1EP7A 5ECQB 2D2ZA 3WGXA 4DVCA 5D93A 4Z7XA 4PXOA 4MA9A 4IHUA 3I69A 3P8WA 5J41A 1B48A 4WF4A 4MH2A 1JFUA 1EOGA 4ZBAA 2EIQA 3IRAA 3VPQA 5A5KA 3DGQA 2VO4A 3EWLA 3APOA 2PUKC 2H1AA 1U3AA 3QFBC 5FWGA 1FVJA 3LFLA 3HA9A 2DBCA 3LG6A 4KSOA 1X5EA 1TDIA 3RAZA 3Q18A 5EY6A 4ZIJA 2GGTA 4N11A 3HJPA 4HDEA 1TI1A 5IOXA 1B9YC 5DJLA 1ABAA 2RUEA 3VWXA 3RHCA 2HYXA 2AHEA 2L4CA 1X0RA 4EO3A 3DD3A 3BBYA 2ZUPA 1AQWA 2M72A 3KXOA 4N10A 2V6KA 1SK1A 4EXJA 5AGYA 3CXGA 4BVYA 3Q74A 3TKRA 1GTUA 3D6IA 4MMMA 1V2AA 1TRSA 3TKQA 1U87A 4J2FA 1PQNA 2X8HA 3UVHA 1YKAA 3NIVA 1NHOA 1GSUA 2OKAA 2QGVA 1TKDB 3L78A 3DVWA 1PGTA 3HY2A 4AGSA 3J7Yb 4ZILA 20GSA 1WP0A 1FB6A 1GLQA 3H93A 2NPBA 6GSYA 5D96A 1GSEA 3KH7A 3WT1A 5G2ZA 2HZEB 3ZLPA 3M8NA 3N5OA 1ZZYA 2YWIA 4GSNA 4JE1A 4I2UA 1A23A 4MZCA 1EEJA 1XVQA 1WIKA 4TXOB 4MPFA 5A4WA 3ZMLA 1B9XC 2K18A 4ECCA 3DIEA 3HD5A 4IJIA 2GTUA 2H1BA 5EPFA 4FH8A 2X64A 3BD2A 4TVEA 1FOVA 3ZTLA 3QPMA 4TOPA 1G7EA 3UBLA 4WBRD 2GSQA 2C0DA 2N5BA 2P0GA 4L8EA 5IMCA 3HZ4A 5ECNB 2E0QA 1URMA 3TJJA 1A2LA 2RM5A 4AJ7A 4HZ4A 2P5QA 4KNDA 3Q6OA 1Z9HA 3UVTA 3UBKA 4TRXA 5G1LA 1UC7A 4DSSB 1I9DA 1IYIA 2LJKA 2WGRA 1K0CA 1XWGA 1GP1A 1GTBA 1YF1A 1VRSD 2WS2A 4EC0A 3GKNA 3PGTA 5ELAA 4IBPA 5B8AA 1VF3A 2FHEA 3BJ5A 1Z7RA 2A2RA 3PINA 1THXA 2VD0A 2IL3A 1YKCA 2GQLA 5A4UA 4WEYA 2FCHA 2K6VA 4L5OA 1GULA 3F6DA 2L57A 1U6TA 4MJBA 4TN8A 3W6GA 4K1FA 4G0LA 3GFKA 1M99A 5ECRB 1JZDA 1M9AA 3PR8A 4GWRA 1FG4A 4E8HA 3G7JA 2B1KA 4IQAA 1JLWA 4H86A 1TTZA 4MDCA 1XWAA 2C4JA 2OA7A 3L0HA 1K0MA 1X9WB 3F9UA 2NTOA 4USSA 5C04A 1PRXA 2VCWA 2VD1A 5IM9A 2E2MA 1ZGNA 1YQ1A 2DIZA 4PUFC 4GTUA 5IQYA 2O87A 1ZMAA 3TKSE 5CAXA 1TRWA 3GHAA 4XRDA 1K0NA 4XIHA 3G9BA 2OACA 1B4PA 2LQOA 3IV4A 1Q98A 4V2NA 1O7UA 1T4ZA 4JZQA 1EWXA 2HRKA 2IIYA 1FAAA 1TK8B 3A2WA 1N8JA 2IWTA 5COHA 5D9XA 4MCUA 1J08A 4PNGA 4FYUA 1R5AA 2LJAA 5IO2A 2N5FA 1F37A 1S3AA 3C7MA 5J3RA 3IK9A 4PX1A 4DSQA 1BEDA 3GL3A 2YWNA 4KCEA 2I4AA 3L9SA 1B4QA 3RBTA 2AB6A 3L9VA 5CRWA 1Q4JA 5GAPD 1S3CA 5IIZA 2YJ7A 2VCXA 2YPMA 1SKSB 6GSSA 2LV3A 1F3BA 2C80A 2ZCTA 3ZREA 3ZMKA 1BJXA 2GSTA 2V2GA 4TR1A 4YQUA 1Y25A 4XS4A 3UOMA 4PURA 2L5LA 2LRNA 4E8EA 4V1Ag 3O6TA 2ON5A 1SJIA 4N0ZA 1GWCA 5H5RA 3TGZA 4RQXA 2IPAA 4EKZA 4WF5A 8GSSA 4WXTA 3CTGA 2H1DA 4BVYB 5HR0A 4MJAA 3GA4A 3ZRDA 3WT2A 2VL2A 1TK5B 4L5LA 1QFNA 1XWCA 4POBA 4MLYA 2VAFA 1JZOA 1IYHA 1Z7PA 4LL1B 3KD0A 4EDYA 3VK9A 4F0CA 4OO4A 1GSDA 18GSA 3VLNA 5ELGA 1GUKA 2R3XA 2H0GA 2HXKA 3FRCA 3IPZA 4Q5FA 2MZCA 1MDIA 2VM2A 3M3MA 4HU7A 1HD2A 4O32A 1A0FA 1CQHA 4GLTA 3IAS2 2FWHA 3BCKA 2R5GA 5DALA 2CAIA 1V98A 1ERWA 14GSA 2JSYA 3HJOA 2HNLA 3QAWA 3A5WA 4NHWA 2O89A 2HSNB 2KHPA 5ABRA 5D9WA 2HLSA 3GH9A 1J9BA 2PPTA 2H1GA 1XOAA 4ZB6A 1V57A 2C0FA 3LQ7A 5ECHB 2C3NA 1FW1A 3I43A 2G2QA 2MMNA 1QMVA 4OFTA 3FZ9A 5G31A 4EL1A 3TJBA 2B6MA 1OC8A 4HEA2 2V6OA 4DEJA 3EU3A 1T8EB 3ZFLA 4D73B 1EGRA 2DJJA 1MD3A 1ERVA 2H72A 2HFDA 1XVWA 1GTIA 1AQVA 1GSFA 2MBSA 5JCUA 1DE2A 3MSZA 4TR3A 3W8SA 5ECOB 3UAPA 3ISOA 3ZFBA 5KN3A 3HXSA 4KDYA 2LUSA 3MWHA 1MDJA 2F8FA 2F8AA 3TJGA 3A2XA 3UEMA 3BCIA 5CYYA 2H76A 2B3SA 1H75A 2CX4A 1VF2A 2B7JA 3ZL5A 4KDXA 4N0VA 3TOUA 2G0FA 2CAQA 4HI7A 5JCGA 2JZTA 3ZIVA 3QFAC 1W89A 3E3EA 3HVXA 2DSAA 1SJ6A 4LLRA 2JADA 4AJ6A 5DCGA 2RM6A 3GKMA 5JWOB 4IS0A 1XWBA 4NPBA 2JU5A 2H6YA 4YAVA 17GSA 2HQTA 3HJMA 3HKRA 1A24A 1GSQA 2HRKB 9GSSA 2IFQA 5FHIA 1A2JA 1A8YA 3FR3A 1AW9A 4BA7A 3AY8A 1QK8A 3IHQA 3H79A 3FYGA 19GSA 3WD6A 1H4OA 1DBYA 5JWQB 5ECIB 1TU8A 4GF0A 3KCMA 4ZL9A 2IMIA 6GSUA 2GT5A 3IE3A 1V58A 2VLUA 3US3A 1O85A 3LXTA 4LA1A 3KM6A 1NW2A 4IKHA 3I9V2 5ECKB 3O76A 1Z6NA 4NXIA 4K7OA 4WR5A 3EVIA 3GV1A 1RQMA 4TR1B 1QGVA 4ML1A 4NV5A 4XS4B 4K2DA 4RI7A 5CREA 2OE3A 1HNBA 4MF7A 2DLXA 1QXHA 1XFLA 1JHBA 3UL3A 3F8UA 1AIUA 2EC4A 3LWAA 4ZBBA 2BJXA 2HE3A 1T00A 5IMFA 4OCFA 1AC1A 3W8JA 2OE0A 5CNWA 2H8LA 1XXUA 5A4VA 3KP9A 5HR1A 2RUFA 1M2DA 2KOKA 4O5RA 1FO5A 5H5QA 3U5RE 4IELA 3IBHA 2BMXA 2YCDA 2YZHA 5HFIA 1OC9B 1HQOA 4K0NA 2R6KA 1SL1B 3N9JA 2H66A 3H8QA 2YOIA 1RW1A 1YJ6A 2C3QA 4CDOA 1K0AA 5J9CA 2YV7A 2E2GA 3IC8A 2YJHA 1WRYA 4TR4A 5DCHA 1SD9A 4KCAA 4O7HA 2QKEA 3LORA 3TKSC 3EC3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4KAEA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations