4KB8A

Ck1d in complex with 1-{4-[3-(4-fluorophenyl)-1-methyl-1h-pyrazol-4-yl]pyridin-2-yl}-n-methylmethanamine ligand
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
291
structure length
265
Chain Sequence
LRVGNRYRLGRKIGSGSFGDIYLGTDIAAGEEVAIKLECVKTKHPQLHIESKIYKMMQGGVGIPTIRWCGAEGDYNVMVMELLGPSLEDLFNFCSRKFSLKTVLLLADQMISRIEYIHSKNFIHRDVKPDNFLMGLGKKGNLVYIIDFGLAKKYGTARYASINTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFNLGSLPWQGLKERISEKKMSTPIEVLCKGYPSEFATYLNFCRSLRFDDKPDYSYLRQLFRNLFHRQGFSYDYVFDWNML
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Ligand-protein interactions of selective casein kinase 1 delta inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Casein kinase I isoform delta
total genus 92
structure length 265
sequence length 291
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4kb8A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4kb8A01
2XNGA 3VULA 2WMAA 3BU5A 5D7AA 4BDEA 3CTQA 5L8JA 3QKLA 3IECA 5C01A 5BVFA 3R7GA 4YJVA 4F6SA 3FLNC 3RHXA 4I6QA 2R7IA 2UW4A 2JD5A 1GZ8A 2WQEA 2ZB1A 3EQPA 4QMVA 4X2NA 4L43A 4JRNA 4ALVA 1QPDA 2Y6OA 3DAJA 3FI3A 4EYJA 1NT2A 2B9FA 2ITOA 2UW9A 2UZWE 1G5SA 3C13A 2OG8A 5BVNA 2QU6A 3KXXA 2RGPA 3HDMA 4EUTA 1KWPA 1SM2A 4FL3A 4FSWA 1TQMA 2YM6A 3NDMA 3E8EA 3V8WA 3NUXA 2RF9A 3FHRA 4IX6A 3QLFA 4G3EA 5FEQA 2R3JA 5LVNA 2ZM4A 4JDJA 3ZUTA 4G17A 3OXTA 4X2KA 4IX4A 2IW9A 2C3JA 3R8MA 5JKGA 5C27A 3TT0A 4V0GB 5ANJA 2C1BA 4DINA 4EH6A 3MVMA 4NEUA 1RDQE 2OO8X 4M66A 4O38A 4ANOA 2ITPA 2OWBA 1XBCA 3VN9A 4PDYA 5HG7A 4I0SA 1BX6A 5ANEA 4FSRA 4DLIA 4O2PA 2QOFA 4ZIMA 2A27A 3R0TA 1JOWB 3UODA 1T45A 4BHNA 3DBFA 1OZ1A 1T46A 4U79A 5KUPA 5EFQA 3EQCA 4FICA 2HW7A 4I0RA 2Z7QA 4IAIA 1ZMUA 4P4CA 3EFWA 1G8AA 4JXFA 3VNTA 3SDJA 3UBDA 1JKTA 3EL7A 4FTNA 5EG3A 4IDTA 5EM7A 4LRKA 1U54B 2WQMA 3BQCA 4RRVA 4J97A 4FGBA 1KE5A 2PUUA 4MXCA 1UU7A 3DXQA 1R3CA 1KE7A 3BRBA 4WKQA 4UMPA 2VWVA 3H10A 4LL0A 3TNHA 4H3BA 4OBOA 4YSJA 3LMGA 3HMNA 3PA3A 2W5BA 1SNXA 5IQFA 5GNKA 4RIYB 4U8ZA 4YZ9A 2HCKA 4N6ZA 3KF7A 4TXCA 3FI2A 3RM7A 4BDIA 4AW2A 4DT9A 1VJYA 4J96A 3R6XA 1YDTE 2QQ7A 4IFCA 3OP5A 4BYJA 1H0WA 3FXZA 5A14A 4QP1A 2WOUA 4I6BA 5I9VA 1YWNA 3PSDA 4S30A 3NNUA 3BQRA 4V01A 1ZXEA 4X3FB 3MFUA 2CLXA 5HE2A 5GZ9A 4PPCA 4EOPA 4OGRA 4PQNA 2Y9QA 3D5XA 5CENA 4DEDA 3QQFA 5LCJA 5FUTA 2OGVA 3PPZA 4BKJA 4HPTE 2J9MA 4A9YA 3FQEA 4HCTA 4RC3A 1ATPE 5IH4A 3DJ6A 3IW6A 2IZTA 4ZJIA 4P7EA 4FK3A 3TV6A 3WF8A 3DCVA 1H07A 2BZHB 3ROCA 4YC3A 2PE0A 5HCYA 5HNGA 2HWPA 3JY0A 5DBXA 4ZTLA 3CEKA 4M97A 2GNHA 4RJ6A 4AFJA 4F7JA 4C4IA 2XZSA 2RSVA 4UYAA 3QYWA 4E4NA 3EL8A 4CCBA 2XF0A 1H26A 1Q97A 2CLQA 3DAKA 2C0TA 3Q32A 4NIFA 5J7BA 5AUTA 3S00A 1REJA 4YGAA 3QRTA 1M52A 2PUNA 4KB8A 5JFWA 3FMKA 4P5ZA 5A6OA 4E3CA 2YIRA 3E62A 2GNGA 5AR7A 4YTCA 4FIHA 3ZONA 3EZRA 4UEUA 4MD7E 1ZYLA 1G8SA 4TWNA 5AR8A 4FTLA 1XJDA 2GQGA 3BHTA 3LPBA 1KUTA 3R7IA 3RNYA 4PNKA 2UZLA 1QCFA 4FKVA 1VYZA 5DVRA 1ZRZA 4EK8A 2ETMA 4FK6A 1J7IA 4D2WA 3KMMA 4FTRA 2ITUA 4YTIA 5E91A 3OMVA 5JRQA 3KULA 2YERA 4PDOA 1HOWA 5AP5A 5EYCA 4EOIA 1H27A 3VWAA 3PJ2A 4HVHA 4PPBA 3ZO4A 4GFOA 3FMDA 3DLSA 4FSNA 4FT5A 5JZJA 5B2KA 4XCUA 4ACDA 4ASDA 4BHZA 1UWHA 3UVRA 3VRZA 1M17A 4ANBA 1WVYA 2VWZA 3CD3A 2E9UA 2WELA 3DJ7A 4AT4A 4MF1A 2YWVA 4ZMFA 4CCUA 3NMUF 3E3PA 5FQDC 2GHMA 2UW0A 3FZSA 3O96A 3TJDA 3WBLA 4O84A 1GJOA 2B54A 3DAEA 5IQAA 2BVAA 1G3NA 4QMYA 2OIQA 1QPJA 3RPYA 4AG8A 3N4TA 1YQJA 3COHA 3IGOA 2VTPA 2FH9A 2QC6A 3PA5A 4R7IA 4O7LA 4AZSA 1JPAA 1YXSA 3F5PA 2G2HA 2JDVA 5K4IA 5KBQA 1P14A 4R7BA 5A4EA 3QQLA 3QZHA 4DBXA 4USDA 4BKZA 4RLKA 4U97A 3EQHA 4DH3A 4UV0A 3QCQA 4OUCA 5A54A 3MB6A 2KTYA 2XKEA 3CGFA 3NZ0A 4A07A 4AZTA 3FKLA 4EONA 4IXPA 4JDIA 5IEYA 1J7UA 2IVSA 3A4PA 5I5ZA 5C8MA 5IPJA 4LRJA 5DNRA 2BTSA 5JZNA 2LAVA 5IH5A 2BDWA 4FNXA 4C37A 4GEOA 3JUHA 2I0HA 2VGOA 2BHHA 3BLHA 2OLCA 4NL0A 4PRJA 5IQEA 2WFYA 3SXSA 2HXQA 4TYIA 4TYJA 4UN0C 3KC3A 3M42A 2GS2A 3PIXA 4ZXTA 1GZOA 2GU8A 4FG7A 4RX7A 4A4XA 2C6EA 3DKCA 4IAYA 2PVNA 4W4WA 4F7NA 5FRIA 5J95A 3UO5A 1AD5A 2QHNA 4LUDA 4GVJA 5CEPA 4L01A 2JIUA 2NP8A 2RG6A 3D7TA 3FMHA 4MK0A 2KULA 3UC3A 3W8LA 5HD4A 3COIA 5T3QA 3VUTA 4JNWA 3MIYA 5KX8A 3O7LB 1LP4A 1NY3A 5KZ0A 2OF4A 3KRWA 2G2IA 1OKZA 5AUUA 3DB6A 4FODA 5IQIA 3TKIA 4S32A 4Z7GA 3HRBA 4QD6A 4K0YA 4CGAA 2GHLA 4GSBA 2C6OA 3GEQA 3Q60A 4BDKA 3IO7A 4FKTA 4W4VA 2Y7JA 1PF8A 3FZOA 3DA6A 4CFWA 3LFDA 1XH5A 2WMXA 3K5UA 3P7AA 4XG3A 4B7TA 4C36A 4EKLA 5A4TA 4Q5EA 3TZ9A 4APPA 2REIA 5M4UA 4RIWB 3VUMA 1Q5KA 4YJRA 3PRFA 1NVSA 3AT3A 3MVHA 3OWKA 5DYJA 2QKWB 3I1AA 5JQ8A 1STCE 3MS9A 1JKSA 5CXHA 2I0VA 3VS4A 4AU8A 4O1PA 2QCSA 2UUEA 3RCDA 5IA5A 5KKRB 2ZV7A 3OBJA 5IUGA 1Y91A 2HZIA 5C9CA 4XH6A 5HO6A 5LVOA 1MRYA 4FKJA 5HO8A 3EN4A 2VTTA 4ARKA 4YURA 2R3PA 1XH8A 2VU3A 2PE1A 2C6MA 4NM3A 2ACXA 5ACKA 1K3AA 5GJDA 4F6WA 3WZJA 3EIDA 4O82A 2GSFA 4PWNA 5JSMA 4BIBA 4W4XA 3WZKA 3MTFA 4RFMA 3ITZA 1LEZA 2QOLA 4JQ8A 4BCQA 4O7VA 3KKVA 2Z7LA 3E7OA 3AMYA 3NIZA 4IM3A 4ASEA 4C4EA 2J50A 3WE4A 4EK6A 5KMMA 3H0YA 3NNVA 3NPCA 4E4LA 2Z2WA 4LUEA 2BKZA 4L6QA 4L68A 3AC2A 4IJ9A 4R5YA 4XEYA 3FWQA 3JYAA 5FDXA 4DHFA 4F0GA 4YTHA 4M67A 4B6LA 4D1ZA 1BUHA 3FY2A 4EYMA 3OWPA 4RQVA 3OCGA 4AF3A 3LKMA 3A7JA 1ZOGA 2VWYA 2W99B 5DH3A 1LUFA 3G15A 5AIRA 3C5IA 1JWHA 4MXOA 3KN6A 4TY1A 3UQCA 4EZ5A 4OLIA 4OT6A 4N4SA 1WBOA 5HTIA 3FEGA 1YHSA 5J8IA 4AZFA 1WFCA 2OI4X 2BKKA 5AWMA 3ATTA 5ITAA 4HZRA 2YM3A 4NTTA 3WARA 4FT0A 3TUBA 1H1RA 3WF7A 3RM6A 3W1FA 1OIRA 1ZMWA 3R8ZA 4CZTA 4BCOA 4IZAA 3UZTA 2WHBA 4EJNA 1OIYA 3W32A 3CTHA 4G3CA 5EYKA 3GGFA 1AQ1A 3LMHA 2Q0NA 5AP1A 3PY3A 4M12A 3ZDUA 2RIOA 1XH7A 1OL1A 4GFMA 2C1AA 3H9RA 4FVRA 5CSXA 2Z7RA 4M69A 5LMAA 5HGIA 5C8KA 4G3FA 4MYGA 3EYGA 4BDGA 2VTHA 5FBOA 4KRDA 1PXIA 3G2FA 3ORXA 4RLLA 3K54A 4UBAA 3ZSGA 5AAEA 4B8MA 4BDBA 3OHTA 5DT4A 5JGAA 4R3RA 1U5RA 4PTCA 3V3VA 4EK3A 3NVKI 3MA6A 3QTRA 3VHKA 1P4OA 3QTSA 2BUJA 5I3OA 2B55A 2VTJA 2XIZA 4I5HA 1R0EA 4QNYA 3MESA 4TT7A 2VV9A 1CDKA 3DPKA 3VQHA 3E63A 3MV5A 4A9UA 2DWBA 4D2TA 4BCFA 2XA4A 4RWJA 3ZO1A 4BKYA 3PG1A 2J0KA 1UNLA 3E8NA 4IFGA 4TZRA 5M06A 1OMWA 2OK1A 3PXRA 4QQCA 3SQQA 5F20A 1P2AA 3PLAE 3DKOA 4FIEA 4YJTA 1O6YA 2C3IB 2BALA 3VS3A 2GFSA 2R3KA 4FSQA 2W1HA 3QX2A 1UNGA 1CKIA 3G33A 4GCJA 4JBOA 2QOKA 4DEEA 4DC2A 5EQEA 4AZWA 4BDJA 2F7ZE 2CNQA 4QMUA 2UZEA 3FMEA 2FA2A 2PL0A 3ZO3A 5JRSA 3TTJA 4HGTA 3KY2A 1Q8YA 2JLDA 5EYDA 4AOIA 4DH1A 3VW8A 3VBWA 3KVXA 2R0IA 3PVGA 1NXKA 1OPLA 4I4EA 4I3ZA 5BYYA 3IOPA 5M08A 4PPAA 3D0EA 4FI1A 4FSYA 4YHTA 4UMRA 4YJOA 5H3QA 3EQRA 3F2NA 1P5EA 4ITJA 4NWMA 2R3NA 4EK5A 3E92A 4FL1A 3ROYA 4WUNA 3AC1A 3KN5A 5IA3A 1S9JA 2I6LA 4FT9A 3NW6A 2XNEA 4KA3A 4KIPA 2ZYBA 4JDKA 5DRDA 2BIYA 4LFIA 2YIXA 4O7TA 4ITIA 2CGVA 4IAFA 1QL6A 2QOOA 4YU2A 3WI6A 2UZTA 3UYTA 1K2PA 1KV1A 2EUFB 1H28A 3GOKA 4IWQA 1ZY5A 2WOTA 4ZSLA 3RTPA 4AA0A 4AP7A 2YACA 4NH1A 3MJ1A 2NNWB 2EWAA 3L8PA 4GT3A 3SKCA 3R21A 3LM5A 4BFMA 4CV9A 3W2RA 2QG7A 3ODYX 4JL9A 2PUIA 3R00A 4L42A 5KMKA 2O0UA 2P33A 3R7EA 3R8LA 5FXQA 1E9HA 3A7HA 1SYKA 4AQCA 1XWSA 5AP3A 1YKRA 2WMVA 4HGSA 3SAYA 4P5QA 5DHJA 3V5QA 5J79A 4EH9A 4RIXA 2RL5A 5IEVA 3O50A 1NW1A 4CV8A 4BBEA 1OUYA 3CGOA 3H0ZA 4ZJVA 5BNJA 4PL4A 3AC4A 2NPQA 4U81A 1OGUA 3H9FA 2E9OA 4QMSA 3O8TA 3BLRA 2WTKB 5CSHA 4RJ4A 4EORA 2W1FA 2W06A 2X81A 2JKQA 3O17A 4C3PA 4C2VA 4PDSA 4EC8A 1KE9A 4ZZNA 5CF6A 3E3BX 2VTIA 4JDHA 1A06A 2XEYA 4YLJA 4RWIA 4ZOGA 1FMOE 5EI2A 5BVOA 1BMKA 1Q3DA 3KRJA 4QP4A 3UO6A 5CF4A 3TG1A 3Q04A 4IM0A 4IEBA 4YSMA 2CGXA 3HNGA 5BVKA 4GKIA 2R3MA 1KE8A 4AOJA 4JRVA 5EOLA 4FV6A 3PLSA 5TKDA 4DG2E 3QBNA 3ZRLA 4FKLA 3HAVA 2OF2A 3MY5A 2VD5A 2WIPA 3DXNA 3R9DA 5M4CA 3EN6A 3GCQA 3I60A 4U80A 4O7NA 2WTCA 3NSZA 2PVLA 5LWNA 1YXUA 3FAAA 5JMSA 3MVLA 5CTPA 5CEKA 4EH8A 4JG7A 3BYUA 4IC7A 4DN5A 3MBLA 2OFUA 2XK6A 3MIAA 5DA3A 2JKMA 3BGQA 5IMXA 3QRKA 4PY1A 5FEEA 3QQGA 2J6MA 4ERWA 5DEWA 3DFAA 2J51A 3AC3A 3AMAA 5FG8A 4DCAA 2F7EE 2BTRA 2P3GX 3VS0A 4ZS4A 1UU3A 5EYMA 4YPDA 3CC6A 4QPAA 4ZTHA 5AUVA 3FMMA 4FTUA 3DS6A 3QWJA 4RWLA 2R5TA 2O3PA 4PDPA 1HCKA 1Q61A 3QZFA 1JAMA 2PWLA 4GJ3A 2AUHA 3C4FA 4HYUA 2JFMA 5BMMA 3GBZA 3ATSA 4RGJA 4I92A 3O7LD 3ZEWA 3HMIA 3KXZA 3THBA 3RAWA 4DFBA 3ENMA 4C33A 3S2PA 3FZ1A 4FL2A 4CKJA 3IW4A 3A7FA 1H1WA 1IAJA 3L9MA 3E87A 4OTFA 4RPVA 3E5AA 2IPXA 3CJGA 1OL5A 4RJ5A 4F9AA 4PMPA 3AC5A 4QYYA 2OZAA 2X7GA 3BBWA 4IACA 4S34A 1PXNA 2JIIA 3ACJA 3DV3A 3HLLA 3OS3A 4U40A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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