4KBBA

Structure of botulinum neurotoxin b binding domain in complex with both synaptotagmin ii and gd1a
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
430
structure length
417
Chain Sequence
NNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Signaling protein/toxin
source organism Clostridium botulinum
publication title Structure of dual receptor binding to botulinum neurotoxin B.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type B
total genus 103
structure length 417
sequence length 430
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2013-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4kbbA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4kbbA02
2ZQNA 4Q9GA 3BODA 1TFMB 3BAHA 1MS9A 5T55A 1PUUB 2ES3A 5F5QA 4I96A 3UJ0A 3M3EA 1AX2A 1JT5A 1S0LA 2F2FC 1JW6A 1MR5A 1N3QA 4ITCA 4Q8LA 1C4RA 4H9WA 3FBYA 5JOZA 1CE7B 4I37A 1LODA 4JP0A 4QD2C 3SNMA 3T1LA 3AH1A 3A07A 1YF8B 2EXHA 1C57A 1IRAX 1DFQA 1LULA 3AXEA 1LOGA 1SLAA 2EIGA 1V6XA 3Q9OA 4I4YA 3AKFA 2QN4A 2P37A 1ISWA 1AJKA 1QNWA 2VLCA 3QR5A 3M3CA 4DRVA 3H6RA 1WCSA 4I8MA 4IY8A 4J2XA 4QBVA 1U0AA 3PMEA 3O5WB 1G82A 2X2TA 1S0FA 5CB7A 3TC2A 4EFRA 2D6KA 4L4IA 2R1DA 2ZHKA 4BOWA 5BXTA 1SR4A 2WNEA 3V64A 1N3OA 4YM0A 4FPCA 1WW4A 5E89A 4AN6A 4GAIA 1Z78A 3NWKA 5I1BA 3KQRA 1FX5A 1BFGA 3A22A 3CQAA 2JKBA 4DCKC 1DHKB 5H9SA 1Q56A 4YM2A 3LTQA 3AJ5A 4FGFA 5GZEA 5HCBA 2VUAA 3RS6A 5BVPI 1CN1A 2Z49A 4PF5A 5HCAA 2OUJA 4GA9A 3AFKA 3U4XA 21BIA 4I4PA 1FQ9A 3FLRA 3WOGA 1YXWA 2G4IA 4LBKA 4CZSA 4TYSA 3B3QE 1GANA 3HALA 1ULEA 5T5OA 1RITA 3BAVA 1CIWA 5FREA 2NYYA 1LGNA 2CNAA 1FYUA 3WG2A 1C1LA 1TIEA 4JKXB 2A7AA 4ZFWB 2PHXA 1FWUA 3SITA 3O0XA 1CVSA 2IHOA 4Q1PA 4FOQA 1V6KA 1BJQA 3H6SE 3BA5A 5EXOA 4AVVA 4YM3A 4I4OA 3HN1A 5DG1A 1XYFA 1C1FA 2DRZA 2K43A 1EV2A 4G1RA 5GZGA 4P0KA 1LJ7A 2AAIB 4XOGA 1LHOA 1H9PA 4AGVA 2E6VA 1HLCA 3FJEA 1MZ6A 3FJKA 4EFPA 3AP4A 4M3CF 5JOXA 4L8QA 4G9NA 1G7YA 4Z9WB 3MPPG 4IZEA 5LK5A 2EAKA 2RQ9A 1BKZA 5EWSA 5GLUA 1R8NA 3PVEA 3T1MA 1A78A 4XBQA 1JOJA 4LO7B 1VAMA 3SLIA 3O5SA 4M01A 1WBFA 3IPVA 2ZGTA 3O0VA 2PHTA 3CRHA 4XBNA 1JHNA 5D61A 1JN2P 3PJQA 3IKWA 4USOA 4FPFA 1J0SA 4I1EA 4R9CA 4YZ1A 2D43A 2WT2A 1LOAA 3S8JA 1AVUA 1WW7A 3IIRA 4FOYA 3F1RA 1RINA 4XJWA 5T54A 3USUB 4YLZA 4Q27A 1QOOA 4XXAA 5GZFA 5HCFA 2W68A 3BAQA 1UAIA 2WKKA 3P6JA 2AFGA 4LBQB 3AX4A 4YGBA 1FMZA 4XXPA 5DZFA 1S0BA 2OVUA 2LIEA 2WSVA 3MW4A 4GOVA 2V73A 4KEKA 5GLZA 3FJ8A 2ZGKA 4YFWA 3C9ZA 3M2MA 4I4RA 41BIA 5EG6C 1V00A 4Y1UA 1RZOB 2HW9A 4XJUA 3BAOA 1V6UA 3P6IA 2A6WA 1NZKA 2NN8A 3OJ2A 2A75A 4KEIA 4BMEA 3N7KA 5T52A 4F83A 2FHRA 3B01A 5DUVA 4LO2A 1XZZA 2UWAA 3OGFA 3O4CA 1W6NA 1ONKB 3RTIB 1W0PA 1FN0A 1MS4A 4U36A 1GSLA 3WDWA 1FATA 1W6QA 4CJMA 2DU1A 1FMMS 5EC5A 4FOVA 3CA6A 4XFSA 1MS1A 2ZMNA 4LBMA 2Q5TA 2M49A 2ZABA 3UD9A 3ZC8A 3Q7XA 2NMNA 3NV2A 4QD2B 3BADA 3OBRA 1SCSA 4DENA 3V79C 2ZGSA 3UDAA 1LHUA 3FJIA 5GLVA 3VKFC 2D24A 1IKPA 2D6LX 3ILAA 2ZACA 4Y1YA 3CA4A 2R16A 2VSEA 3ZXLA 1N47A 2AGSA 3VSZA 3O3QA 4ZFYB 3OY8A 1G9DA 2A6XA 1LTEA 1FGAA 4I4XA 3AP6A 3FJAA 4C1WA 3CA0A 1P63A 2JJ6A 4FVVA 3AZXA 4HA2A 2RSTA 4G6MA 3V65A 2E7TA 4QALA 2DRYA 5DSSB 5D63A 3FLTA 4H55A 1WUVA 5BXPA 3WO2A 3WNXA 1R8OA 4FPGA 2RG9B 1SLBA 2SBAA 1G9FA 1ILR1 3BX1C 2CYFA 4WV8A 1OQ1A 1F5FA 2C5DA 1BARA 2KI6B 3BRGC 4YW4A 1GBGA 1VIWB 4Q91A 4ENDA 3A21A 2A3XA 1HIBA 1XHBA 3BRDA 1JT4A 4K21A 4Y1XA 1LHNA 1JBCA 1GZ9A 1GYKA 2HZ9A 4OEGA 3HOMA 1ENQA 3WA1A 3V0AA 2UWCA 1RY7A 4XFTA 3QYDA 3I8TA 3SNVA 1JYCA 4I2SA 1M16A 1JXNA 3A0KA 2W52A 4IONA 3IN9A 1WBAA 1WLDA 4P9YA 4IYBA 4C1XA 1ISVA 1AZDA 1RMLA 3SH3A 5BQUC 4XJ9A 3LSEA 1LHWA 3QCWA 1TP0A 2P2KA 4YW5A 1QMJA 1ISZA 1DZDA 3WG3A 3WO4A 5F90A 3ZVXA 4ZLBB 1EYLA 1HWPB 4UW3A 3ZSJA 2ET2A 4ASMB 2KI4A 3RSJA 1L2HA 1N1TA 1YO8A 4BPZA 4PC4A 1OQLB 1LEDA 1KITA 1AVWB 2D44A 3CU1B 2VH9A 4ISQA 5KXBA 2DVFA 2DUOA 1G86A 1XG6A 3POKA 3ZPYA 3A4UA 1GZWA 5H9PA 2VW0A 1Q8OA 4EFQA 1WW6A 1LGBA 2GNMA 3BA4A 3CRIA 1AVBA 5FZUA 4XIKA 3O44A 3POYA 4I0YA 2JD4A 1LOFA 4ZA3B 3IMNA 4I4UA 4R9BA 4LBLA 3O4BA 3FJ9A 4FPEA 2A70A 4XMAA 1Z2VA 4YM1A 3ILRA 2ZZJA 4FPKA 1JTCA 2D23A 4LBJA 3KMVA 5DUYA 3VKMA 1FV3A 3B9UA 4CRQA 2DTYA 1JUIA 2D7RA 2CWSA 4YFZA 2A6YA 3CNAA 1MS5A 4QBCA 4BM8A 1V6NA 2FDBM 2VXRA 3UK9A 1BLAA 2FFUA 2EXIA 3JU9A 2CWMA 5JLVA 1W6MB 4JRAA 2E4MA 5D62A 1SR4C 5DVHA 4XDQA 1SLIA 3IM6A 2R49A 4LO0A 3AYEA 2YXSA 1JY0A 3IM7A 2WT0A 4XKIA 3BTAA 1ENSA 4JKQA 1UZYA 3W59A 3CRGA 4FQ4A 4DS0A 1DIWA 1Q8PA 5G00A 4XE9A 2HWMA 2P3JA 4Q26A 1BA7A 3A23A 1HWNB 1WLCA 3ZXDA 1BFBA 2E51A 2ZBJA 3MW3A 5BP5A 4OWKA 3P53A 3NBNA 3WDXA 2JE7A 4FP2A 4AN7B 4EEEB 4JCKA 2Y9XE 3UJQA 1QU0A 4FP3A 4Y26A 3WV6A 3WHTA 1IOBA 1YI7A 4YGCA 2ZMLA 4Y20B 1O4ZA 2WBCA 5GM0A 3TAYA 2XB6C 1KQRA 3PHZA 1ZA4A 4X37A 3LLPA 4M3CA 2D3PA 4YG6A 3MW2A 2V5YA 2YZ4A 4M3CE 1W6OA 2YROA 3FJFA 4GP3A 4W65A 1TTUA 2GN3A 1LECA 4H04A 4Y22B 3W58A 2JDZA 5DZEA 1LOCA 4IQPA 1CPMA 4YGDA 4Q1RA 4AVSA 1T9FA 3I4IA 1JT7A 1S0CA 3AZVA 1ISYA 2FFVA 2H0BA 1J1TA 1ULGA 3FJCA 2OW4A 4NO4A 1EPWA 1PZ8A 3AYCA 2AUYA 2XOAA 1UPSA 4FQZA 2ZAAA 3BOPA 2WRYA 3I29B 3JUTA 3GALA 3WUDA 3PVNA 4GOYA 3O4OA 1HQWA 3T8SA 1IRPA 3ZSKA 4WBCA 3APBA 4AWDA 4AVTA 1PZZA 4WZFA 2ZGPA 4FPYA 4TZDA 2DV9A 3OYWB 1Q04A 5GZDA 2EALA 3PVOA 4FPHA 5KXEA 3ZXFA 4A7ZA 3O12A 2C9AA 1V6IA 3WINA 3WUCA 1N1YA 3WDYA 3FUQA 4Y1ZA 1JQZA 2D3SA 4LBNA 2YV8A 1AX1A 5GALA 2KLLA 1TOOA 5BOWA 1FNZA 2P23A 3T2TA 2AENA 3AJZA 1BFCA 1W6PB 2OUHA 2D6OX 1WW5A 6I1BA 1H30A 1S0JA 4KC3A 3AZWA 3AXDA 3NJ5A 1IS6A 4XMIA 4P14A 3GNEA 3V0BB 1BZWA 2GZBA 2DWRA 1OKQA 1HQLA 3RQ0A 4GXLA 4NOTA 3VEQA 4P0JA 7I1BA 2D6PA 4FPJA 1AVAC 2Q9XA 1RIRA 4OWJA 4GALA 1UL9A 3OGGA 4QO3A 4I6IA 3BAGA 1Q8SA 2HWAA 3ZXKA 4LO2C 2RHPA 4ATEA 4ATFA 3R4UA 1MD6A 3O4AA 3INAA 3WDUA 3UD8A 1ABRB 2ARBA 5IUQA 2A3WA 1KDMA 2DVGA 1DQ1A 1ULFA 2WJSA 1Y7BA 5BYNA 1I3HA 5DG2A 3M1HA 4F34A 1Q03A 2PHUA 4J2YA 1IS5A 1WLWA 5BXSA 3AKIA 4XTMA 5JOWA 2FGFA 5F9TA 5DZGA 3WG1A 1S0EA 2VXTI 2VSAA 1SFYA 1YBIA 1EVTA 1X50A 4L4HA 5IK5A 4LO1A 1ENRA 3NBCA 2VU9A 5JDBA 1QDOA 4A7YA 3ASIA 3FFZA 3WLUA 1SLCA 1VAVA 1KRIA 5E24E 3ZC9A 4XJZA 5GZCA 4PQ9A 3H6RB 4I1BA 1G8WA 2NMOA 1BLDA 3C2UA 4K1YA 2EXJA 3E8LC 3N7MA 1E0OA 1V6LA 3L2YA 2E7QA 2KH2A 1CR7A 1DQ5A 1ISXA 1BQPA 3KM5A 2GMMA 3R05A 4ZXKA 1DQ6A 3ZYRA 3FJJA 1GICA 5FNXA 1W3GA 4Z8SB 1LESA 5B2HA 2R0HA 4XBLA 1IS3A 2VW1A 1DQGA 4DQAA 2DURA 2A71A 3HSMA 2SLIA 1AXZA 3N36A 1JLXA 5KXDA 1AFCA 1S0DA 5GLWA 1QDCA 4YZ5A 4OEEA 1LGCA 2PHRA 5E88A 3ZX7A 2DTWA 4R9AA 2R9KB 3RMYA 5HPZA 1CESA 5H9RA 1XQNA 4P9WA 1W6OB 2WT1A 3WG4A 2NZ9A 4Q2FA 5EHAA 4R9DA 3MEPA 4QKSA 3AYAA 5BXRA 1HWOB 3B69A 3ZXEA 4Q9PA 4UW4A 4XTPA 2KM2A 4YG0A 2GALA 5DUWA 4WVWA 1G9BA 1H9WA 4FOWA 1NLSA 1VCLA 4D0TA 3AJYA 5F8WA 3IM5A 3O49A 3VV1A 5EYXA 1SACA 4I4VA 4PBOA 1TWMA 4BLIA 3WMUA 4DRRA 4J2SA 3NBEA 1UKGA 4P0LA 1QOTA 2AYHA 1AXMA 2CY6A 2ZHNA 3O0WA 4YW2A 3D4KA 2ZGLA 2UUSA 3TB0A 4ZOTA 4JC1A 4HJJA 2W08A 1S0GA 2DVDA 4JAWA 1CVNA 1Z4SA 2Y9WC 3SH4A 3CA5A 1URXA 4XFUA 3RRDA 5CA6A 2Z42A 1HWMB 1IOAA 2GMPA 4K1ZA 1W3AA 4GWNA 4USPA 2MIBA 2BEAA 2HYKA 2MLLB 3FLPA 2PHFA 4UW5A 3MALA 4XYXA 5FZYA 3AZYA 1FAYA 1LOFC 4BLJA 2CTVA 3IPVB 1OFSA 3OBTA 3VKNA 4YW3A 1BXHA 4OUJA 2J3PA 3VWCA 3WCSA 2LALA 3VUOA 1MVQA 3D6EA 4GKYA 3USUA 2UWBA 1ZM1A 2QYIB 4DPNA 3VKOA 1GV9A 4JPZA 3N7LA 4LBQA 2E4MC 2DU0A 2GO2A 2VY0A 1LU2A 4DFSA 4M00A 1YRZA 3HMYA 3WHUA 2ZR1B 4D0ZA 3ZYPA 1IKQA 2B7YA 1GNHA 4XJAA 4LO0C 4FPLA 2DS0A 1V6VA 1SCRA 1V6WA 2D22A 3N35A 3ILNA 1W0OA 1AX0A 4LO3A 4P6AA 4JQ0A 4ISRA 3OPZA 3AKHA 3LSDA 2ZGQA 2PELA 2KKIA 4II0A 3UJ4A 2ZHMA 5FRAA 4Y1VA 1MVEA 3ENRA 1UMZA 5BP5C 1QQKA 4G9MA 1VLNA 1W6NB 1K5VA 1QQLA 1ITBA 4KEJA 1YYNA 5IK8A 2ZGMA 1DYPA 3BA7A 1KJRA 1MS8A 1W6QB 2R0FA 4QC4A 2F2FA 1NXD1 1MS3A 2AREA 1D0HA 2ERMA 3D5OA 3RTJB 4MYEA 4YOLA 1Q8VA 3M3OA 4UW6A 5L73A 2L5XA 3VT1A 1DZQA 1DLLA 1A3KA 1SLTA 3OJMA 4SLIA 5SV8A 1M2TB 5AVAA 4Z8BA 3RMXA 3BAUA 4X39A 4BMBA 3S8KA 1CONA 1UN1A 3WO3A 4YG3A 4OEFA 2Y9FA 1R1ZA 2WQZC 4GAFA 1WD4A 4FPOB 1LCLA 3CA3A 5CNAA 2LIQA 3ILFA 1IS4A 2ARXA 2PHWA 5DUUA 4RL7A 2BEBA 3D7WB 3OY8B 1RG8A 3FUOA 1VALA 4XIOA 1DBNA 5CAZA 4DEPA 4EB2B 4AGGA 3AH4A 2UURA 3WDTA 1IJTA 4OZXA 3IAGC 1MS0A 2YY1A 5DXDA 3O4DA 3PG0A 1AF9A 1QF3A 4KBBA 2P34A 3H6QA 1DJSB 4K20A 4D8HA 4ZFUB 3WINC 3ZXGA 2A5ZA 4HR6C 1LEMA 2ZGNA 2I2SA 1AXYA 3JUUA 1HKDA 5IK7A 1UX6A 1YIFA 2Q3NB 3WMVA 3N0KA 3FGMA 1Q8QA 1FV2A 3I2XA 2TEPA 1ULCA 2DYCA 5EYYA 3H0OA 2FO1A 4Q8KA 3V0AB 2IWTB 2ENRA 4YW1A 2MC2A 4IHZA 2DUPA 1DYKA 2GNDA 4YZ3A 1V6OA 2P39A 4XJ8A 1G9CA 1FWVA 2D1ZA 3WVJA 4BQ1A 4A7KA 3ZSMA 2A3YA 2D3RA 3QLQA 4I7IA 1MZ5A 5T5JA 3RG0A 5F8YA 2GN7A 2JECA 3W9TA 4AYUA 4OWLA 3VT0A 1PZ7A 2D7FA 4I30A 1N1VA 2NVHA 1B09A 4WVVA 2AH2A 2ZKNA 1SLLA 3OJVA 2WLQA 3FJHA 1AXKA 3IM0A 1HCEA 2K4AB 3CAHA 3N7JA 4RA0A 4Y24A 1JT3A 1BFFA 2EXKA 2AR6A 1K5UA 1JYIA 1GZWB 2Y9GA 1BYHA 4X3AA 2NTDA 1GGPB 1UZZA 1N1SA 1D2SA 2F8XC 1SZ6B 1TWEA 3FJBA 1S0IA 4EKXB 2YUGA 1II4A 5H9QA 4LO1C 4IZXA 1CQ9A 4AGRA 4I4SA 1PZ9A 1O4YA 2LTNA 3FJDA 4OW4A 1AVXB 1DQ0A 1MACA 2DUQA 4XILA 1HKNA 3PUBA 3JRRA 2E53A 4ZBVB 4ZKTB 3F62B 3ZSLA 5FNWA 2ZQOA 3VKLA 3HR9A 3AH2A 1IHKA 2D7IA 1W6MA 4LBQD 4QKRA 1QNYA 1IT0A 5GJ6A 1S1AA 1HDKA 4U2AA 3OJBA 1DQ4A 1FNYA 2R1BA 3N3HA 3Q7WA 3SH5A 3NV3A 3ZXJA 5E8AA 2BQPA 3Q7YA 3UD7A 1V6MA 1A8DA 1I1EA 1PUMB 1JLYA 4LO8B 2P3IA 4XZPA 1APNA 5GAQA 2W39A 1DZCA 4J2KA 3DUIA 3AZZA 5T5LA 4XHBA 1F31A 2GNTA 3B9CA 1MC9A 4CTEA 5CBLA 4X38A 4D69A 4ZGRB 2YMZA 3NBDA 1ULDA 2Z48A 3AYDA 1WBCA 3I2AA 1PC8B 2NP0A 2GNBA 1DGLA 3SISA 1YTOA 3AP7A 5IT6A 1W3FA 2D6MA 2DVBA 2ZHLA 1Q1UA 1N4KA 4Y20A 4IY9A 1GLHA 1SBDA 2GDFA 1DFCA 1NUNA 2XG3A 1QOSA 3EF2A 1KJLA 1G9AA 4M3CB 1QXMA 1QKQA 3UL2A 3AP9A 8I1BA 3POSA 1N3PA 1BASA 1GNZA 2ZMKA 2K8RA 4GWMA 4Y22A 1LOEA 1DQOA 3DGTA 3UJOA 4HANA 3LCPA 5JMCA 3AKGA 2AQZA 1LOBA 9ILBA 1SBFA 2EF6A 3BRFA 1Z0HA 1CPNA 5FZZA 3B00A 4PCRA 2P3KA 3HBWA 4GP0A 2JE9A 4PBPA 2FMDA 2I1BA 3AK0A 5T5PA 4YZ4A 1DQ2A 1HCDA 3VSFA 4P9XA 5DUXA 5GLTA 1SBEA 2ZGOA 1TEIA 4XHXA 4LO7C 3WDVA 2ESUA 1GKBA 1IILA 3OYWA 1PWAA 2CL2A 3POWA 5DZUA 1F9KA 2ZGUA 2ERFA 3R4SA 2D20A 4I4QA 1QGLA 2AXMA 3AP5A 4G6JA 1LU1A 4R6UB 2ZGRA 3ATGA 1WBLA 3BB2A 31BIA 1KDKA 3NV1A 3K1XA 2D6NA 1LENA 4HL0A 2VW2A 5F8SA 2BFHA 2ZA9A 3NV4A 1WD3A 1W6PA 3WZ1A 5JOYA 1AJOA 1KNMA 2DVAA 3M3QA 1GZCA 4J23B 1T4QA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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