4KCXA

Brdt in complex with dinaciclib
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
TNQLQYLQKVVLKDLWKHSFSWPFQRPVDAVKLQLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFSNCYLYNKPGDDIVLMAQALEKLFMQKLSQMP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Cyclin-dependent kinase inhibitor dinaciclib interacts with the acetyl-lysine recognition site of bromodomains.
pubmed doi rcsb
molecule tags Cell cycle/inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Bromodomain testis-specific protein
total genus 38
structure length 106
sequence length 106
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4kcxA01
5CQAA 5CQ8A 3UV5A 4UIZA 5COIA 2I8NA 5IGMA 4O7BA 5LVRA 3QZVA 5JI8A 4N4IA 4OUFA 5ENHA 4GPJA 5F1HA 4XY9A 4A9FA 5DFDA 5F62A 4QR5A 4IOQA 4J1PA 5FB1A 1N72A 4MR3A 4TS8A 5TB6A 4QR3A 5EWHA 4J0SA 5D3PA 4QSVA 5A7CA 4QEUA 4NR8A 4CFKA 4PKLA 2I7KA 4PCEA 4O76A 5ENJA 5FB0A 5C89A 4UYFB 5DYXA 5CUCA 4MEOA 4TU6A 4O78A 4NRCA 5C4QA 4QB3A 4TT6A 3U5MA 5FDZA 5CZGA 4HBVA 4NQNA 4QSXA 5D3SA 4QSPA 4Q0NA 4QUUA 5CUAA 4YADA 3UVXA 5G4SA 4A9JA 5KTUA 4N3WA 4NUCA 5D3LA 2R10A 4YC9A 4IR4A 5HCLA 5EWCA 3JVKA 4TQNA 3HMEA 2DWWA 5D3NA 3SVFA 5HFQA 5FG5A 5CUEA 2RS9B 2E3KA 4IR5A 5A81A 4Z93A 5DKDA 4A9HA 4ALHA 5D26A 5HQ6A 2YQDA 5F2PA 4UYDA 3Q2EA 5EPBA 5EVAA 5D3JA 3AQAA 2G4AA 5FE7A 5CPEA 5FH7A 4A9MA 5C8GA 3UVDA 5E9YA 4QSWA 5F61A 4QSQA 5EI4A 5A83A 1WUMA 3MB4A 4YBTA 1EQFA 3G0JA 3ONIA 2RO1A 3ZYUA 4NYXA 2F6NA 5FE5A 5FH8A 4HBYA 5IGKA 3MUKA 5CUDA 5DW1A 5IG6A 5FFWA 5E73A 4QSTA 4QSUA 3P1CA 5CQTA 5I88A 4Y03A 5CU8A 4CLBA 5DW2A 5F1LA 5HRXA 3DWYA 4IR6A 5BT4A 5F5ZA 3U5KA 4A9NA 4QSRA 4MR5A 5II2A 5IGNA 5F3AA 4HBWA 5D3HA 4UITA 4Z6IA 3NXBA 5E3DA 3UW9A 5DLZA 5K29A 5C7NA 5FE3A 4A9IA 5EK9A 3LJWA 4Z1SA 4RVRA 3U5OA 5HJCA 5FG4A 4MENA 5L97A 5ETDA 5DYAA 5E74A 4CUTA 4WHWA 5BT5A 4LZSA 4NR6A 2DKWA 4CURA 5DBMA 4HXKA 4OGJA 5FH6A 3O33A 4N4HA 4MR6A 5E9LA 3K2JA 4UIWA 5KU3A 2L84A 4QEVA 5DKCA 2F6JA 5DFCA 5CQ3A 5LJ0A 4WHUA 4QNSA 4XY8A 2RNYA 4IORA 4QBMA 5EM3A 2DVVA 4TT4A 5G4RA 4YH3A 5E9VA 5HRWA 5E7DA 4N4FA 5HQ5A 3RCWA 3P1DA 4QY4A 4YATA 5KO4A 4UIVA 5FE1A 2MJVB 4WIVA 5CRZA 4J3IA 3S91A 5CP5A 5A5PA 4MR4A 5EV9A 5LKZA 5H1TA 5C85A 4J0RA 4XYAA 2RI7A 4NR9A 4O77A 3UVYA 5HM0A 5DLXA 4BW2A 5HENA 4NYWA 3JVMA 5D3TA 4X2IA 4UIUA 2L5EA 2LSPB 3P1EA 5EISA 5DFBA 3UV2A 3IU6A 4CUQA 5FE6A 5EWWA 5L96A 4C66A 4LRGA 3FKMX 5FBXA 4A9OA 3O35A 2D82A 5A85A 4NYVA 4CUUA 4LYSA 4HXNA 3O34A 4Z1QA 5CY9A 5HRVA 4QYLA 4BJXA 5CFWA 5D7XA 4KV4A 4UYFA 4NR7A 5DX4A 2OUOA 5II1A 3LQJA 2YYNA 2L85A 4QUTA 4UYHA 5E9MA 5FE2A 4CFLA 4CL9A 4PS5A 4NQMA 4O7FA 5J0DA 5LKUA 4XUBA 4NR5A 5F63A 4LR6A 5AMEA 5KTXA 3UVWA 1JSPB 4YYGA 4O7EA 4NXJA 4YY6A 5LJ1A 2YDWA 4O75A 3LQIA 5I86A 4Q0OA 5ENEA 4YYJA 5FE0A 5E3GA 5C87A 4O7CA 4HXMA 3SVHA 5A82A 4XUAA 4Z6HA 4NS5A 3JVJA 4HXSA 4UIXA 4YAXA 2YEKA 5H1VA 4LC2A 4NUDA 4O74A 5ENFA 5ENBA 3SVGA 4ZW1A 3MQMA 4MEQA 4NRAA 5AD3A 4CUPA 5D3RA 3G0LA 4QSSA 4TZ8A 5ENCA 5IGLA 5E0RA 4YK0A 4UYGA 3S92A 1JM4B 3QZTA 4QEWA 5CGPA 5ENGA 5EPSA 5EICA 5CUGA 2FSAA 3MB3A 2YELA 5ACYA 1E6IA 4IR3A 5DYCA 5L8TA 3MXFA 5CUBA 4NR4A 5TCMA 4LYWA 3P1FA 5A5NA 3U5NA 4BW4A 2GRCA 4PY6A 5KHMA 3Q2FA 5E9IA 1X0JA 5A5OA 5JWMA 3JVLA 5HEMA 4YYKA 5FE4A 4LYIA 4KCXA 2RNXA 5FFVA 3O37A 5H1UA 3U5LA 5A5SA 5A5RA 5FE9A 4YBSA 3HMHA 5A5QA 5CS8A 2WP2A 4YYNA 5BT3A 2KTBB 4QYDA 4ZQLA 4AKNA 5CQ4A 1ZS5A 2YW5A 4TTEA 2WP1A 5I83A 4ZC9A 4BHWA 5EWVA 2DVSA 5HFRA 5KTWA 2RNWA 5FFYA 5I40A 4IOOA 4O72A 3O36A 5D0CA 4QR4A 4UYEA 5CQ6A 2DATA 4O71A 5DY7A 5EPRA 1WUGA 5DKHA 4HXPA 4PCIA 4QC1A 3LXJA 3U5JA 3P5OA 5HELA 5LKXA 5AD2A 2DVQA 4HXOA 4YYHA 5LKTA 2N9GA 4O7AA 3DAIA 4YYIA 4A9KA 2H60A 4O70A 5FE8A 3MULA 4QC3A 4LZRA 5EA1A 4FLPA 4HXLA 3UV4A 5EQ1A 5ETBA 2E7NA 4CUSA 4YBMA 5HLSA 5AMFA 2R0VA 3HMFA 3U5PA 4LDFA 5CQ5A 4C67A 4YYDA 4TU4A 4YYMA 5HQ7A 5I29A 3QZSA 4PTBA 5F25A 3AADA 4LZ2A 5ENIA 5F60A 5CQ7A 4UIYA 4QZSA 5CTLA 2E7OA 4BW3A 5LUUA 4N4GA 5EP7A 5H85A 5E9KA 1F68A 4MEPA 2OSSA 5IBNA 5L99A 4NUEA 5EU1A 2DVRA 4YH4A 4YABA 5D24A 5DYUA 2OO1A 4E96A 5L8UA 3IU5A 2R0SA 2NXBA 2YEMA 4A9LA 5I89A 3TLPA 2R0YA 4NRBA 4YY4A 4HBXA 5I7XA 5FG6A 5LVQA 4KV1A 5EWDA 4A9EA 5I1QA 5IIDA 2RFJA 3D7CA 4HXRA 2D9EA 3GG3A 5L98A 4BW1A 5I80A 5EGUA 4F3IA 4TYLA 4ALGA 4TZ2A 4OGIA 5D25A 5LJ2A 5I7YA 3I3JA 5CRMA 4DONA 5F36A 3LQHA 4TT2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CQAA 5CQ8A 3UV5A 4UIZA 5COIA 2I8NA 5IGMA 4O7BA 5LVRA 3QZVA 5JI8A 4N4IA 4OUFA 5ENHA 4GPJA 5F1HA 4XY9A 4A9FA 5DFDA 5F62A 4QR5A 4IOQA 4J1PA 5FB1A 1N72A 4MR3A 4TS8A 5TB6A 4QR3A 5EWHA 4J0SA 5D3PA 4QSVA 5A7CA 4QEUA 4NR8A 4CFKA 4PKLA 2I7KA 4PCEA 4O76A 5ENJA 5FB0A 5C89A 4UYFB 5DYXA 5CUCA 4MEOA 4TU6A 3ERRA 4NRCA 4O78A 4QB3A 4TT6A 3U5MA 5C4QA 5FDZA 5CZGA 4HBVA 4NQNA 4QSXA 5D3SA 4QSPA 4Q0NA 4QUUA 5CUAA 4YADA 3UVXA 5G4SA 4A9JA 5KTUA 4N3WA 4NUCA 5D3LA 2R10A 4YC9A 4IR4A 5HCLA 5EWCA 3JVKA 4TQNA 4AKHA 3HMEA 2DWWA 5D3NA 3SVFA 5HFQA 5FG5A 5CUEA 2RS9B 2E3KA 4IR5A 5A81A 4Z93A 4AI6A 5DKDA 4A9HA 4ALHA 5D26A 5HQ6A 2YQDA 5F2PA 4UYDA 3Q2EA 5EPBA 5EVAA 5D3JA 3AQAA 2G4AA 5FE7A 5CPEA 5FH7A 4A9MA 5C8GA 3UVDA 5E9YA 4QSWA 5F61A 4QSQA 5EI4A 5A83A 1WUMA 3MB4A 4YBTA 1EQFA 3G0JA 3ONIA 2RO1A 3ZYUA 4NYXA 2F6NA 5FE5A 5FH8A 4HBYA 5IGKA 3MUKA 5CUDA 5DW1A 5IG6A 5FFWA 5E73A 4QSTA 4QSUA 3P1CA 5CQTA 5I88A 4Y03A 5CU8A 4CLBA 5DW2A 5F1LA 5HRXA 3DWYA 4IR6A 5BT4A 5F5ZA 3U5KA 4A9NA 4QSRA 4MR5A 5II2A 5IGNA 5F3AA 4HBWA 5D3HA 4UITA 4Z6IA 3NXBA 5E3DA 3UW9A 5DLZA 5K29A 5C7NA 5FE3A 4A9IA 5EK9A 3LJWA 4Z1SA 4RVRA 3D1DA 3U5OA 5HJCA 5FG4A 4MENA 5L97A 5ETDA 5DYAA 5E74A 4CUTA 4WHWA 5BT5A 4LZSA 4NR6A 2DKWA 4CURA 5DBMA 4HXKA 4OGJA 5FH6A 3O33A 4N4HA 4MR6A 5E9LA 3K2JA 4UIWA 5KU3A 2L84A 4QEVA 5DKCA 2F6JA 5DFCA 5CQ3A 5LJ0A 4WHUA 4QNSA 4XY8A 2RNYA 4IORA 4QBMA 5EM3A 2DVVA 4TT4A 5G4RA 4YH3A 5E9VA 5HRWA 5E7DA 4N4FA 5HQ5A 3RCWA 3P1DA 4QY4A 4YATA 5KO4A 4UIVA 3VKGA 5FE1A 2MJVB 4WIVA 5CRZA 4J3IA 3S91A 5CP5A 5A5PA 4MR4A 5EV9A 5LKZA 5H1TA 5C85A 4J0RA 4XYAA 2RI7A 4NR9A 4O77A 3UVYA 1PUOA 5HM0A 5DLXA 4BW2A 5HENA 4NYWA 3JVMA 5D3TA 4X2IA 4UIUA 2L5EA 2LSPB 3P1EA 5EISA 5DFBA 3UV2A 3IU6A 4CUQA 5FE6A 5EWWA 5L96A 4C66A 4LRGA 3FKMX 5FBXA 4A9OA 3O35A 2D82A 5A85A 4NYVA 4CUUA 4LYSA 4HXNA 3O34A 4Z1QA 5CY9A 5HRVA 4QYLA 4BJXA 5CFWA 5D7XA 4KV4A 4UYFA 4NR7A 5DX4A 2OUOA 5II1A 3LQJA 2YYNA 2L85A 4QUTA 4UYHA 5E9MA 5FE2A 4CFLA 4CL9A 4PS5A 3D1BA 4NQMA 4O7FA 5J0DA 5LKUA 4XUBA 4NR5A 5F63A 4LR6A 5AMEA 5KTXA 3UVWA 1JSPB 4YYGA 4O7EA 4NXJA 4YY6A 5LJ1A 2YDWA 4O75A 3LQIA 5I86A 4Q0OA 5ENEA 4YYJA 5FE0A 5E3GA 5C87A 4O7CA 4HXMA 3SVHA 5A82A 4XUAA 4Z6HA 4NS5A 3JVJA 4HXSA 4UIXA 4YAXA 2YEKA 5H1VA 4LC2A 4NUDA 4O74A 5ENFA 5ENBA 3SVGA 4ZW1A 3MQMA 4MEQA 4NRAA 5AD3A 4CUPA 5D3RA 3G0LA 4QSSA 4TZ8A 5ENCA 5IGLA 5E0RA 4YK0A 4UYGA 3S92A 1JM4B 3QZTA 4QEWA 5CGPA 5ENGA 5EPSA 5EICA 5CUGA 2FSAA 3MB3A 2YELA 5ACYA 1E6IA 4IR3A 5DYCA 5L8TA 3MXFA 5CUBA 4NR4A 5TCMA 4LYWA 3P1FA 5A5NA 3U5NA 4BW4A 2GRCA 4PY6A 5KHMA 3Q2FA 5E9IA 1X0JA 5A5OA 5JWMA 3JVLA 5HEMA 4YYKA 5FE4A 4LYIA 4KCXA 2RNXA 5FFVA 3O37A 5H1UA 3U5LA 5A5SA 5A5RA 5FE9A 4YBSA 3HMHA 5A5QA 5CS8A 2WP2A 4YYNA 5BT3A 2KTBB 4QYDA 4ZQLA 4AKNA 5CQ4A 1ZS5A 2YW5A 4TTEA 2WP1A 5I83A 4ZC9A 4BHWA 5EWVA 2DVSA 5HFRA 5KTWA 2RNWA 5FFYA 5I40A 4IOOA 4O72A 3O36A 5D0CA 4QR4A 4UYEA 5CQ6A 2DATA 4O71A 5DY7A 4AKIA 4AKGA 5EPRA 1WUGA 5DKHA 4HXPA 4PCIA 4QC1A 3LXJA 3U5JA 3P5OA 5HELA 5LKXA 1ZKRA 5AD2A 2DVQA 4HXOA 4YYHA 5LKTA 2N9GA 4O7AA 3DAIA 4YYIA 4A9KA 2H60A 4O70A 5FE8A 3MULA 4QC3A 3VKHA 4LZRA 5EA1A 4FLPA 4HXLA 3UV4A 5EQ1A 5ETBA 2E7NA 4CUSA 4YBMA 5HLSA 5AMFA 2R0VA 3HMFA 3U5PA 4LDFA 5CQ5A 4C67A 4YYDA 4TU4A 4YYMA 5HQ7A 5I29A 3QZSA 4PTBA 5F25A 3AADA 4LZ2A 5ENIA 5F60A 5CQ7A 4UIYA 4QZSA 5CTLA 2E7OA 4BW3A 5LUUA 4N4GA 5EP7A 5H85A 5E9KA 1F68A 4MEPA 2OSSA 5IBNA 5L99A 4NUEA 5EU1A 2DVRA 4YH4A 2EJNA 4YABA 5D24A 5DYUA 2OO1A 4E96A 5L8UA 3IU5A 2R0SA 2NXBA 2YEMA 4A9LA 5I89A 3TLPA 2R0YA 4NRBA 4YY4A 4HBXA 5I7XA 5FG6A 5LVQA 4KV1A 5EWDA 4A9EA 5I1QA 5IIDA 2RFJA 3D7CA 4HXRA 2D9EA 3GG3A 5L98A 4BW1A 5I80A 5EGUA 4F3IA 4TYLA 4ALGA 4TZ2A 4OGIA 5D25A 5LJ2A 5I7YA 3I3JA 5CRMA 4DONA 5F36A 3LQHA 4TT2A
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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