The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
|
sequence length |
54
|
structure length |
52
|
Chain Sequence |
DTYKLILNGGLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDGTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Protein-like Tertiary Folding Behavior from Heterogeneous Backbones.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Streptococcal Protein GB1 Backbone Modified Variant: Aib10,
|
| molecule tags |
De novo protein
|
| total genus |
13
|
| structure length |
52
|
| sequence length |
54
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-04-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2JU6 X; 1PGA A; 2ZW1 A; 1K50 A; 4KGR A; 4HJG E; 2PTL A; 1HEZ E; 4D2K A; 2GI9 A; 1XCT L; 2PLP A; 1QKZ A; 1MHH E; 1K51 A; 4HKZ E; 1PGB A; 2QMT A; 2RPV A; 1IBX A; 1GB1 A; 2QSD A; 1MVK A; 2N9K A; 4IKG A; 2N9L A; 2LHD A; 2JZP A; 1EM7 A; 1GB4 A; 2K0P A; 4KGT A; 1IGD A; 3UI3 A; 5HFY A; 2KN4 A; 2RMM A; 5JXV A; 2LGI A; 2EEL A; 2LUM A; 2KDM A; 3FIL B; 2ON8 A; 3V3X A; 4GLS C; 2I38 A; 2JWU A; 1P7F A; 2ONQ A; 2GB1 A; 1K52 A; 5BMI A; 2PW9 A; 1MPE A; 4OZA A; 2KQ4 X; 1XF5 L; 1C9F A; 1IGC A; 1MHX A; 2IGG A; 1K53 A; 2N7J A; 1P7E A; 1JML A; 2LHE A; 4MAC A; 1FD6 A; 5BMG A; 3FIL A; 1Q10 A; 2OED A; 2IGD A; 2ZW0 A; 5BMH A; 1HZ6 A; 4OZB A; 2KAC A; 2IGH A; 2J53 A; 2NMQ A; 1FCC C; 1HZ5 A; 2JXT A; 1FCL A; 1YMH E; 4IOI E; 5HG2 A; 1PGX A; 1ZXH A; 2J52 A; 1YNT E; 1F2R C; 4OZC A; 1KH0 A; 3MP9 A; 2I2Y A; 1XCQ L; 5HI1 A; 2KWD A; 3GB1 A; 5HHD G; 1UWX A; 4WH4 A; 1IBX B; 1MI0 A; 1D4B A; 4KGS A; 1F2R I; 2JSV X; #chains in the Genus database with same CATH topology 5IOI A; 1GAQ B; 4KIK B; 1UH6 A; 2GBK A; 4PYZ A; 2KMC A; 1YN5 A; 2D5G A; 2KHW B; 5JH5 C; 3WAM A; 2HJ8 A; 1JRU A; 1RWS A; 2CJN A; 2N9L A; 4OVZ A; 1Y8R C; 2LHD A; 2DAJ A; 1WZ0 A; 1YX6 B; 3DBS A; 1EF1 A; 2MEK A; 3EA6 A; 2LEK A; 5D3D A; 2K39 A; 4RGO S; 3R2I A; 4XYC A; 1SEB D; 2N9X A; 3PRZ A; 3TEX A; 1ISN A; 3L10 B; 2DWQ A; 4LNF A; 1XLP A; 2KDM A; 1WSP A; 3QK0 A; 2I38 A; 2K8B A; 2G45 B; 3U52 E; 2AL3 A; 5TR5 A; 1TS5 A; 1TY0 A; 1EUV B; 1V1O A; 3AUL A; 2KJR A; 5G5G A; 1I42 A; 2WDV B; 1YN4 A; 4ZRI A; 3MHS D; 2N7J A; 2O2V B; 1YN3 A; 4W9I A; 1N62 A; 2NPT B; 2LHE A; 5BMG A; 2M0A A; 3FIL A; 3VTV A; 2BYT A; 5AZG A; 3MC9 A; 4BBN C; 5EDS A; 1VZ8 A; 3TIX A; 2KAJ A; 3DBL I; 3KWL A; 1SB3 C; 3CMM B; 1YMH E; 3PS6 A; 5HG2 A; 3DVN U; 3ZNG C; 3NVZ A; 3HVD A; 1V8C A; 3ZQ4 A; 3BVZ A; 5L95 C; 2K3U A; 1V1P A; 1XCQ L; 2WXJ A; 4DBG A; 3ZXV A; 1UWX A; 2C7M B; 4WH4 A; 1MI0 A; 2H88 B; 1MG4 A; 1P3Q U; 2L32 A; 4OHJ A; 1LGR A; 3R7R A; 2CU3 A; 1VJK A; 2BYE A; 1XEE A; 1HEZ E; 4NJ7 A; 1V9J A; 3OAW A; 1KJT A; 3RZF A; 2KTF A; 2D2Q A; 3PT2 B; 4HEA 1; 3BK1 A; 4YTP B; 2KTR A; 2G4D B; 4ZYS A; 4BAX A; 2RPV A; 1E8Y A; 3V61 A; 4G3X B; 2K8H A; 1JRO A; 2WDT B; 5DPW A; 4NAW B; 1ET9 A; 2MQJ A; 2BPS A; 2FUG 1; 1SSN A; 1OQQ A; 4PK1 A; 3ZLZ A; 4IUM B; 2CU1 A; 3RI7 C; 4HJK A; 1ACC A; 2EEL A; 1PYW D; 4G0N B; 2ON8 A; 2KLC A; 4GXB A; 3PRE A; 4HRO A; 3P4Q B; 4AQ7 A; 1E90 A; 1TYG B; 2DAF A; 1N5W A; 1MPE A; 3AEE B; 5C2T B; 4LDT B; 1K8R B; 1D5Z C; 1WYG A; 2D3A A; 1L7Y A; 5AUI A; 2KMM A; 1A70 A; 1Q10 A; 4XWW A; 5BMH A; 4ZRK A; 4FHJ A; 2KAC A; 2HTM E; 4EKU A; 1HA5 A; 1HZ5 A; 3DPD A; 3N9Y C; 3WAO A; 4P6V F; 1TT5 B; 1OGW A; 2V3N A; 3WAL A; 2MBB B; 3EUB 2; 2HJ1 A; 1T3Q A; 3AEB B; 4CO7 A; 1J19 A; 2AQ3 B; 1ESF A; 4BFR A; 1UGJ A; 3ZDM C; 1IBX B; 3QX1 A; 5C1Z A; 2DBY A; 2G9H D; 4W9L A; 2GOW A; 1RYJ A; 3JVZ X; 2BF8 B; 2JYE A; 1VZ6 A; 4MSM B; 4D2K A; 3H1U A; 1ZDX A; 2INP E; 5EE0 A; 4TUU A; 1SF0 A; 1QOG A; 1WMH A; 2N9K A; 2J0J A; 2LRW A; 4KDI C; 4A55 A; 3H6N A; 1XT9 B; 3NS1 A; 1KTK A; 4GU2 A; 4FBJ B; 1F52 A; 4MH0 E; 4ICU A; 2O6V B; 5FR6 A; 4WJQ A; 4RF0 A; 2ZZP B; 2GLS A; 1NDD A; 1WWT A; 4I6N B; 3TEZ A; 1EU4 A; 1JWB D; 3CIR B; 5BYQ A; 4MJS B; 1E7P B; 4TV3 A; 2K1F A; 1FIQ A; 1QLB B; 4KV2 A; 1SIJ A; 1CZP A; 4JQW C; 3QWZ B; 1WXS A; 5CHV C; 1K53 A; 4WQM A; 2C60 A; 4E71 A; 3HM6 X; 2NBW B; 2V3S A; 3Q3J A; 1P1A A; 3CSF A; 1F0Z A; 4LK0 M; 2XEW A; 3NUH B; 1HZ6 A; 4DHJ B; 3UQA A; 2LD9 A; 3NVW A; 2A4Z A; 1L6V A; 4ZDV A; 4BKS A; 1CQV A; 1M94 A; 1CJE A; 2WQY B; 1MG8 A; 4FJZ A; 2YEP B; 2GRI A; 2INN E; 3AE9 B; 1F1H A; 4MGK E; 1VLB A; 3V6E B; 2IO1 B; 2JRH A; 2KQS A; 3UIP B; 3PPA A; 2D3G A; 4PT5 A; 2DZI A; 1PFD A; 5L83 A; 3Q8E A; 2JYT A; 1E10 A; 3HM3 A; 1V97 A; 3QHT A; 1GOZ A; 1I4Q A; 4ZRJ A; 3IXS A; 3LXF A; 3W5V B; 1OEY A; 3LB8 C; 2MJE A; 4II3 B; 2DX5 B; 2MW5 A; 1QT9 A; 2ZCB A; 3C0R B; 3I9V 1; 4IM2 A; 2RDB C; 1WGY A; 1WY8 A; 3IG3 A; 1XLN A; 4XC2 A; 1KM7 A; 1L0V B; 4AS1 A; 3BVG A; 1KLV A; 1TKY A; 3M3J A; 1J7B A; 2EMS A; 2JWZ A; 4WUR A; 3DVG Y; 2BS3 B; 1WZ3 A; 1QZE A; 3FIL B; 4GLS C; 3ETR A; 2ONQ A; 1V2Y A; 5AEK B; 4MGY E; 2MRP A; 1P9D U; 3BY4 B; 1V1P B; 3V6C B; 2X38 A; 1P98 A; 3X0W A; 4MAC A; 3ZKJ C; 1OTR B; 2DEN B; 3MC0 B; 3ML9 A; 4REZ A; 3AU5 A; 4H2A A; 1JQ4 A; 1FCC C; 3VHT C; 1JAL A; 2WXH A; 3A9J A; 4PYU A; 4RGM A; 3L16 A; 4A20 A; 5FKA C; 1WYW B; 1PDX A; 1N5X A; 2WX0 A; 4YTM B; 2KT7 A; 4W9H A; 3N3K B; 3AM9 A; 1JW9 D; 2LVP A; 1L5P A; 2ACZ B; 2M19 A; 4IM3 A; 4K3C A; 4GDL A; 2N1V A; 1MHH E; 1BT0 A; 3DHG C; 4W9D A; 4KKI A; 4N9F 4; 3K9P B; 2IYD B; 3SEB A; 4M0W B; 1OEY J; 3Q2A C; 1GG3 A; 1NEK B; 2L76 A; 1E7V A; 1PUT A; 3B08 A; 2MBE A; 4F7Z A; 2CS4 A; 2IO2 B; 2V0G A; 1G6J A; 2WXK A; 1EM7 A; 5J18 A; 3S2A A; 2IY1 B; 3OJ4 B; 3PGE A; 2JY6 A; 2LGY A; 1SE3 A; 4CHK A; 3HK0 A; 2C7N B; 4EE2 A; 4PS8 A; 2LUM A; 3B0A A; 2WXR A; 2L1A A; 4IG7 B; 1SGH A; 1V80 A; 3N1Z C; 4HLE A; 3NOB A; 4LTU A; 1PQS A; 5BYR A; 5FR3 A; 1V6E A; 3KUC B; 3TUO A; 3ZIM A; 2VH2 A; 3KLS X; 1WF9 A; 1FXT B; 3GS2 A; 1VCB A; 2HD5 B; 4J3O D; 2GBM A; 2PEA A; 1TZ1 A; 3RNG C; 3E9S A; 2OJR A; 1V81 A; 4ANV A; 5G2N A; 1BUI C; 1JWM D; 1PGX A; 2G4S A; 1FNV A; 1ZXH A; 1NI3 A; 3R7Q A; 4OZC A; 4G50 A; 3P42 A; 4TQ0 A; 3BZD B; 3MP9 A; 2WU2 B; 2WDR B; 4K7S A; 3GB1 A; 5HHD G; 2Y5P A; 5IKC M; 2FCN A; 1GC7 A; 1ZKH A; 4DXF A; 1ZXI A; 5FK9 C; 4AWJ A; 3HIZ A; 3PO0 A; 2KX3 A; 2MHJ A; 3NVV A; 3VRA B; 2WXL A; 4IC7 B; 2DZJ A; 4NQK E; 3NHE B; 1WI0 A; 1WGK A; 2L0T A; 4YWG G; 1J8C A; 1TZO A; 1STE A; 3LYY A; 4KX6 B; 2M0X A; 1WX8 A; 3AV8 A; 5IAA C; 2KDI A; 3W1S A; 4DXA B; 1HE8 A; 2K0P A; 3NVY A; 4BOZ B; 4FUL A; 2D11 A; 3L0W B; 1WXQ A; 2N1W A; 4II2 B; 4TMA B; 1H8C A; 2LWP A; 1I4H A; 3WA0 A; 3VQI A; 3O13 A; 4DXG A; 4MGI E; 4JWU C; 1XXG A; 1XQQ A; 3I3T B; 3C8Y A; 5MPO A; 3P4S B; 3AE1 B; 4JIO U; 3T3N A; 1UD7 A; 1WX7 A; 2D3C A; 3IAM 1; 3UF8 A; 4AJW A; 4WJP A; 1IGC A; 3DBH B; 3UQB A; 2R61 A; 4KSL C; 3L13 A; 2OHF A; 1WGR A; 5EE1 A; 1QIL A; 3B1L X; 2MBH A; 3ZJV A; 1C4P A; 2PMV A; 4PS7 A; 4HK2 A; 3VR9 B; 3PRM B; 3ECI A; 3SFE B; 3A9K A; 4LNO A; 4PS3 A; 2CJO A; 4G11 A; 4M8M A; 3R3M A; 2K6D B; 2J42 A; 3L08 A; 1RFK A; 3M62 B; 2PE6 B; 3IBE A; 3VH4 B; 3KYC D; 1KH0 A; 2I1J A; 4M00 A; 4P7I A; 5E6J A; 2IZV B; 3U30 A; 1TS4 A; 1Q1O A; 1R7S A; 2FNJ B; 1WX9 A; 4I6L B; 1C3T A; 1AW7 A; 2Z8L A; 1GUA B; 1WM3 A; 2XK5 A; 5J2R A; 4ARC A; 2DNF A; 2BS2 B; 2OOB B; 2KNB A; 3QIJ A; 2DYO A; 2ZW1 A; 3A4R A; 4KGR A; 2WXQ A; 2BWE S; 3VUX A; 3MJ5 A; 4K7W A; 2K9X A; 4NJC A; 1SIF A; 3V60 A; 2V1Y A; 2MLB A; 3RUI B; 3PRP B; 1WFY A; 3FKY A; 1DOX A; 1TBE A; 2QSD A; 4URK A; 2TSS A; 4FN2 A; 4B6W A; 5DPR A; 4WIP A; 2AYO B; 2L83 A; 1UEL A; 2KYW A; 4N59 A; 3TEW A; 3BII D; 2V4I B; 3ABV B; 3WCQ A; 1GPX A; 1UNS A; 4HCP B; 1I35 A; 5C3J B; 2LGS A; 5KHQ A; 2Y5C A; 1FRR A; 2IPK D; 2HDE A; 2VRR B; 2LMC A; 1K52 A; 3N20 C; 2SEB D; 1N60 A; 4OZA A; 3A9J B; 1WXV A; 4NPN A; 2IJ0 A; 1MHX A; 2KMA A; 1KLU D; 1H4R A; 3UIO B; 2BB5 A; 1J7A A; 1YQ4 B; 4B0E A; 4AOF A; 1Y56 A; 3MJW A; 4WWP A; 3GOE A; 3V05 A; 1HQR D; 2KOX A; 4OVV A; 2UWQ A; 2IGD A; 1I4P A; 2RPQ A; 4JWS C; 1R4N I; 2KJH B; 2WHI A; 2LJI A; 3KW5 B; 4P1C C; 3BYY B; 4K81 A; 2LRU A; 4EZL A; 1E5W A; 4WWM A; 2DYB A; 3K9O B; 2IO0 B; 3NJT A; 2DZM A; 3J9C A; 1D5X C; 1F2R I; 3ZTC A; 5G55 A; 1OQR A; 2MCN B; 2GBJ A; 4MM3 B; 1VRA B; 3M95 A; 4LJP B; 3PLU A; 4K3B A; 3P2B A; 3OWE B; 2I1K A; 4MSQ B; 2QC8 A; 2D07 B; 4S0R A; 3ZJT A; 1JWU D; 2BYV E; 2LJ5 A; 2Y5B B; 3RYT A; 2JZ3 B; 4S17 A; 3ZRC A; 2BKF A; 1HXY D; 3AE4 B; 1UZX B; 4FLH A; 4RF1 A; 1E6E B; 1RM6 C; 3AEF B; 5JXV A; 2K25 A; 2K22 A; 3MTN B; 2YVC A; 3CST A; 1XLQ A; 1EO6 A; 3BYT B; 2LAS A; 2W9N A; 2GB1 A; 5C23 A; 3VUY A; 2BVC A; 3KVF B; 3Q3F A; 3C19 A; 3DWG C; 3AMZ A; 1LXD A; 4P1B C; 2C5L C; 3H9D A; 5HKH A; 3L4P A; 2XBB C; 3KH0 A; 1E8X A; 4LLG M; 4RNA A; 3H7P A; 2VZK D; 2BQQ A; 2M1M A; 4OZB A; 3V62 A; 3OLM D; 4W9C A; 2LFI A; 4BKT A; 2WX1 A; 3HUI A; 4LJO B; 2Q5W D; 2UYZ B; 3DDC B; 1X1M A; 1M4V A; 2J7Q B; 2D10 A; 5LXI B; 1DOY A; 5E6O A; 1KOT A; 2K6Q A; 2PE9 A; 2W3S A; 1LQB A; 3IT4 B; 4GSW A; 1GNU A; 2MP2 A; 4KGS A; 4ITK A; 2JU6 X; 2W82 A; 1L0X B; 4KIK A; 3PV1 A; 3QAQ A; 4MT5 A; 5CTR C; 3VR8 B; 1K51 A; 1YJI A; 2SAK A; 3QQ8 B; 1WH3 A; 1WXM A; 3VTW A; 4WAF A; 1VR9 A; 4HXD A; 3NG0 A; 3RMK C; 3DBH I; 3IFW B; 3SD5 A; 3GE8 C; 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5CHW A; 4KGT A; 3RD2 A; 4B95 A; 2RR9 A; 4FA6 A; 4WWN A; 1R4N B; 2RMM A; 4YXD B; 2Z59 B; 4A8X C; 2D3B A; 4GN1 A; 2LGI A; 3VFK A; 2W54 A; 4MGZ E; 3H8H A; 1WR1 A; 1SJH D; 3EFC A; 3APC A; 3DVG X; 3EHV A; 3AEC B; 2PW9 A; 2FCM A; 2ZNV B; 1I4G A; 3PTF C; 4QAY A; 4ZRQ A; 1SBB B; 2KKC A; 2NVU I; 2B3A A; 2BWF A; 2IGG A; 4ANU A; 2RSU A; 2AQ1 B; 2MA9 B; 3LDZ E; 1Q0W B; 1D6E C; 2J4X A; 1AN8 A; 3TBL D; 1GJZ A; 5EE9 A; 3B2F A; 1MFW A; 2BTE A; 2BGF A; 2CHZ A; 1C1Y B; 4ASW C; 4RGN A; 2KWV B; 3B2G A; 3N32 A; 4DHZ B; 2KWU B; 2QCZ A; 4N6E B; 2KVR A; 3OG5 A; 5HI1 A; 4GGQ A; 2ZVN A; 3AE5 B; 4HPL B; 1Q5W B; 3AE2 B; 4LNN A; 2FBW B; 3PSE B; 1SE9 A; 3E56 A; 4YTN B; 1XLO A; 2DZK A; 1SJE D; 2KFJ A; 2IY0 B; 3VDZ A; 1FEH A; 2KDE B; 3AE8 B; 4NJ6 A; 3RNE C; 4AP4 C; 1K50 A; 2QIE B; 2PTL A; 2RDG A; 2ZEQ A; 3TSS A; 2GI9 A; 4KKJ A; 4GMV A; 4C00 A; 1NYR A; 2H89 B; 3N1Y C; 1QKZ A; 2L7R A; 3NRZ A; 1IP9 A; 2IND C; 2MSE D; 3VVW B; 2INC C; 2EMT A; 4BOS C; 2QMT A; 3KUZ A; 1WMH B; 2JXX A; 1WGH A; 2XN9 C; 1GC6 A; 2JZZ A; 4LDT D; 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