4KHQA

Ternary complex of rb69 mutant l415f wit dumpnpp
Total Genus 327
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
327
sequence length
902
structure length
899
Chain Sequence
MKEFYLTVEQIGDSIFERYIDSNGRERTREVEYKPSLFAHCPESQATKYFDIYGKPCTRKLFANMRDASQWIKRMEDIGLEALGMDDFKLAYLSDTYNYEIKYDHTKIRVANFDIEVTSPDGFPEPSQAKHPIDAITHYDSIDDRFYVFDLLNSPYGNVEEWSIEIAAKLQEQGGDEVPSEIIDKIIYMPFDNEKELLMEYLNFWQQKTPVILTGWNVESFAIPYVYNRIKNIFGESTAKRLSPHRKTRVKVIENSREIITLFGISVLDYIDLYKKFSFTNQPSYSLDYISEFELNVGKLKYDGPISKLRESNHQRYISYNIIAVYRVLQIDAKRQFINLSLDMGYYAKIQIQSVFSPIKTWDAIIFNSLKEQNKVIPQGRSHPVQPYPGAFVKEPIPNRYKYVMSFDLTSFYPSIIRQVNISPETIAGTFKVAPLHDYINAVAERPSDVYSCSPNGMMYYKDRDGVVPTEITKVFNQRKEHKGYMLAAQRNGEIIKEALHNPNLSVDEPLDVDYRFDFSDEIKEKIKKLSAKSLNEMLFRAQRTEVAGMTAQINRKLLINSLYGALGNVWFRYYDLRNATAITTFGQMALQWIERKVNEYLNEVCGTEGEAFVLYGDTDSIYVSADKIIDKVGESKFRDTNHWVDFLDKFARERMEPAIDRGFREMCEYMNNKQHLMFMDREAIAGPPLGSKGIGGFWTGKKRYALNVWDMEGTRYAEPKLKIMGLETQKSSTPKAVQKALKECIRRMLQEGEESLQEYFKEFEKEFRQLNYISIASVSSANNIAKYDVGGFPGPKCPFHIRGILTYNRAIKGNIDAPQVVEGEKVYVLPLREGNPFGDKCIAWPSGTEITDLIKDDVLHWMDYTVLLEKTFIKPLEGFTSAAKLDYEKKASLFDMFD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure-function analysis of ribonucleotide bypass by B family DNA replicases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DNA polymerase
source organism Enterobacteria phage rb69
molecule tags Transferase/dna
total genus 327
structure length 899
sequence length 902
ec nomenclature ec 2.7.7.7: DNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date 2013-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00136 DNA_pol_B DNA polymerase family B
A PF03104 DNA_pol_B_exo1 DNA polymerase family B, exonuclease domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1280.300 Mainly Alpha Up-down Bundle Monooxygenase Monooxygenase 4khqA05
3.30.342.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich DNA Polymerase; Chain A, domain 1 DNA Polymerase, chain B, domain 1 4khqA01
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 4khqA02
3.40.1820.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Ribonuclease H-like motif DnaQ-like 3'-5' exonuclease 4khqA06
3.90.1600.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Palm domain of DNA polymerase Palm domain of DNA polymerase 4khqA03
4KO0A 4KTWA 3ZSXA 4CESA 3NAEA 4EP4A 4FW1A 3K57A 4CF9A 3E01A 2GUIA 3DM2A 1D5AA 3HPGA 3O3GA 4F3TA 1VSKA 5CY4A 5CZ2A 5CYQA 5KTQA 3OYFA 2ATQA 4PA1A 4FXDA 4ICLA 3F9KA 3ZT2A 2HHVA 2OZMA 3QIOA 5K14A 2GBZA 4WE1A 1U47A 5FROA 4CEZA 2OPRA 4FJGA 3HXMA 3JYTA 3PO4A 1X9MA 4Z4IA 1S9EA 3KK3A 4FLVA 3DOLA 1JXBA 2RF2A 4CHPA 4CGIA 3K58A 1TGOA 2HVHA 2ETJA 4F3OA 1HMVA 1YVUA 4ID1A 2QXFA 4BACA 3TAEA 1SL1A 1RT6A 4DQQA 1QSLA 1QHTA 1LWCA 1BIZA 1KFSA 2OPPA 1VK0A 3OS2A 1UWBA 3ZSVA 4PWDA 1U45A 4B9NA 1BI4A 4PQUA 2YV0X 2IAJA 1L3SA 1IKVA 4FJXA 1TKXA 4O0IA 1UOCA 5J1EA 2WOMA 3KK2A 3AA4A 1ZYQA 3PUFA 2HNZA 4CIGA 2F8SA 1IKXA 2P1JA 4KV8A 1HPZA 3P1GA 4BDZA 4M45A 2YKNA 3LWLA 1U04A 4CHYA 4W5RA 1RT3A 3PV8A 4N76A 4GW6A 4IG0A 1TL1A 5D3GA 4CJWA 3I0SA 1JKHA 3KK1A 3VQ4A 1DLOA 3AVIA 5J2MA 2I5JA 4Z4CA 3L2QA 1QTMA 4N41A 4M3TA 1TAQA 4CERA 4LH4A 4HCCA 4C8KA 3QESA 3KLGA 4FK0A 4KREA 3PX6A 2JLEA 3HPHA 1RT7A 3K59A 4B9SA 2XO7A 3FFIA 3ZSQA 3SNNA 1VRUA 1C1CA 2BE2A 2RPIA 4E1MA 4CEOA 1VRTA 3VQ8A 4CJ3A 4AHSA 4YNQA 4Z4FA 4KKOA 1U4BA 3VQ7A 3S9HA 4B9UA 4M3YA 1REVA 5HRSA 3OYGA 4DQRA 4RW8A 3CG7A 3LP1A 3ASMA 4OKJA 1FK9A 2E6LA 3KD1E 1VSMA 4MQ3A 3OYAA 3OYEA 1LW2A 1EX4A 4CJLA 4FLUA 1L3TA 4OGEA 3U6FA 1LV5A 2FC0A 1BISA 3SUPA 3CFOA 1GOAA 1IO2A 5HRNA 3NDKA 3CM5A 4K8XA 1ZBFA 2DFEA 1QSSA 4IG3A 3MXMA 5FDLA 3AVFA 4CCHA 2DFHA 2P51A 3LALA 4N47A 1GOCA 3NGZA 1RBRA 1DTQA 5HRPA 1C6VA 3QO9A 3VQ9A 1KSPA 1LWEA 3BGRA 3K2PA 1Q8IA 3AVKA 3MXJA 4RW6A 3ZT4A 1NK7A 2X6NA 4BE1A 4HTUA 1WAFA 4DF4A 2F96A 4DS5A 4KAZA 4CK1A 3IG1A 4CJRA 1WAJA 1F21A 4DTMA 1TK0A 5T7BA 1TKTA 5CYMA 1MU2A 1WSJA 3PX4A 4FJIA 2IGIA 2Y1JA 4DU4A 3RR8A 2XRIA 1YTUA 4W5QA 3VN5A 1CZ9A 2HW3A 3CFPA 4DSJA 4MFBA 3OYLA 4E89A 5KRTA 2A1RA 1KFDA 3CM6A 3OYKA 3LP3A 4JS5A 3TWHA 3AA5X 1C0UA 1FXXA 4LSNA 3ZT0A 4KHWA 3K5MA 3C6UA 2Z1GA 4M3ZA 4C8MA 1I3AA 3VQAA 4J2BA 2Z1IA 4NCGA 1NK6A 3AVLA 3WNFA 4C8NA 4CJFA 1TL3A 2HMIA 3LAMA 4FJJA 1Z25A 4Y1DA 1KVBA 5HP1A 3VQ5A 4IFVA 4CGFA 1HYSA 4BE2A 4XIUA 2KFZA 3SZ2A 4HHTA 3U3YA 1SL2A 2OPQA 4FJ8A 1CZBA 3SYZA 4DQIA 3MEEA 3LAKA 4G1QA 3SPZA 5E41A 2Y1IA 3L8BA 2YNGA 3NH1A 4CFCA 3I0RA 4Z4GA 3IRXA 3TAQA 1RDDA 3NH0A 2VG5A 3OS0A 4FYDA 2YKMA 4LY7A 1NOYA 1J53A 4OPKA 1QQCA 4JS4A 1ZBHA 3VQQA 1VSLA 4DTRA 1HNVA 4DTUA 3MECA 4DFJA 2B5JA 1UA1A 3CFRA 2HHUA 1FKOA 2HNDA 3DOKA 1ZBLA 4CJKA 3IS9A 1SL0A 1EP4A 1QS4A 1TVRA 5KGXA 4KB0A 4CHQA 1HQEA 1WSGA 4JRPA 4E1NA 3K5OA 1WNSA 3UIQA 4FJHA 1VSFA 3C95A 4Y1CA 1NJXA 3V81A 3OJUA 4DLGA 4BWMA 4E7KA 5I3UA 2KFNA 3NHGA 3NE6A 2QKBA 4J2AA 1HRHA 3LWMA 1EXQA 1L3UA 4F2RA 2HHSA 1YT3A 3HVTA 3HM9A 5JS2A 3QNOA 2D0CA 3V1OA 4FZXC 3G0ZA 2G8KA 1W0HA 3MXIA 4JLHA 3RTVA 3S3NA 2X78A 2Z1HA 3DYAA 5HROA 1RT2A 3HP6A 4CJ5A 1BHLA 3OY9A 1N5YA 1BIUA 2G8FA 2PY5A 1X9SA 2P5OA 3AVCA 3AVAA 4I7FA 3VQDA 1NK5A 1ASUA 5J2PA 3VA0A 3HPOA 3AO4A 5SWMA 2EX3A 1JLGA 4CGHA 1ZBIA 4FJ9A 2YNFA 1WSIA 2RKIA 1NJYA 4H4MA 2XY7A 3LPTA 3ALYA 1RDBA 3MEGA 1RNHA 4Z0UA 3OYBA 3OYJA 2OA8A 2QK9A 4Q0BA 4KHQA 2HHWA 3ZSYA 1B9DA 5J2NA 4AHRA 1W9HA 4FVMA 1TKZA 4OLBA 1U49A 3QINA 1SKSA 1JLCA 2IS3A 3H08A 4GMJB 4RW4A 4I9LA 4DWIA 5FRNA 1D9FA 4IFYA 4AHTA 2G8HA 1HQUA 3V4IA 1RBUA 4FZZA 1NK8A 3O4NA 3DLBA 4M3RA 4FJ5A 3ZT3A 5C42A 2XHBA 4CHZA 3B6PA 3DRPA 5CZ1A 2HHXA 4CGGA 4NYFA 3OYMA 4CJQA 4N56A 3I8DA 3C6TA 2VG7A 1LAWA 3LANA 4OKEA 3NGIA 4DTSA 4RW7A 3O3FA 2O4GA 4ID5A 1TAUA 1Q9XA 4E7LA 2YHBA 4KHNA 1RDAA 4FLTA 3ISNC 4B3OA 4LSLA 4DTXA 3TABA 3QEIA 4QCLA 4B8CA 3NBPA 2AJQA 2D5RA 2BANA 3SCXA 3AVGA 5HRRA 1L3VA 3M8QA 2PYJA 4KTQA 3CYMA 2EHGA 4FJLA 4E0DA 1RT4A 5I42A 5FRMA 2HVIA 1X1PA 4IDKA 3ZT1A 2HHQA 1C1BA 4L8RB 1HYZA 4DMNA 4DTJA 1NKBA 3AV9A 3SI6A 1RT1A 3F73A 4PUOA 3DRRA 3ULDA 4M42A 4OVLA 1B9FA 4LH5A 3QEWA 4CJSA 3SV4A 4CEBA 1ITGA 4ZHRA 3T3FA 4KHUA 1L5UA 4CEEA 1SKRA 3QERA 1RDCA 4LD0A 3G10A 1NJWA 4CIFA 4FW2A 4M3WA 3V6DA 3NCIA 1C0TA 2FBXA 2ITGA 3U3GA 4ELVA 3NF6A 1DTTA 4DQPA 5J2QA 4DTNA 2DTUA 1JLQA 3NF7A 4CFAA 4NCAA 2VWJA 2KZZA 1S1UA 4GVMA 4O44A 3OYCA 3DI6A 1O1WA 3VA3A 4CJ4A 2G8WA 4OGCA 1C1AA 1Z26A 3B6OA 4FM2A 1KVAA 3IAYA 4I2QA 5C24A 4CJPA 3LP2A 1C0MA 3BDPA 4UQGA 3OYHA 4FK2A 4RW9A 3EYZA 1S6PA 4DFMA 3S3MA 1SV5A 1RILA 1IKWA 1KCFA 1Y97A 4I2PA 1XI1A 3V9UA 1KRPA 4KTZA 3KTQA 2BGGA 2OZSA 1J9AA 2IC3A 1NK0A 4B9LA 4DLEA 4BWJA 3DLHA 3VQ6A 1U48A 5JS1A 3V9ZA 1N6QA 4DG1A 1XWLA 2D0BA 3EY1A 1JL1A 3OYDA 4B9VA 4CHOA 3K5NA 2YHAA 3ZSZA 4HUFA 3CQ8A 1BQMA 3HSTB 4HCBA 3HJFA 1RBVA 2XY6A 1TK5A 4KHSA 4F4KA 4FJ7A 4FLZA 1RTHA 4PY5A 4KI6A 4I9QA 1RTIA 1FKPA 2LSNA 3T1AA 4E7HA 4CGJA 1WN7A 1VSIA 1WSEA 4B08A 4NCBA 4C8LA 1JLEA 3HP9A 3RRHA 3THVA 2HHTA 4FLXA 1ASVA 4F2SA 1IG9A 4DU1A 1JLBA 1LAVA 1G15A 1NK4A 4OKKA 4DFPA 2OYQA 4E7JA 4R5PA 2B6AA 2NUBA 3HVRA 4CEQA 3L2UA 1NK9A 2BDPA 4CEAA 3QETA 1RT5A 4CEFA 4E19A 3MAQA 4QOZB 3DLKA 2DY4A 1S6QA 3L2VA 3TARA 1BGXT 2G8VA 1S1WA 4H4OA 4K8ZA 4HVJA 1HYVA 4CJEA 1NKEA 4FM1A 3K5LA 4AH9A 2ZD1A 1S1TA 2W42A 1T7PA 3PY8A 1LWFA 4B8AB 4IKFA 3SQ1A 1JL2A 4E7IA 2XY8A 3ITHA 3V1RA 1RTJA 2G8IA 4ZTJA 1SKWA 4CEDA 1JLAA 1RBSA 3D0PA 1RCHA 3TAMA 4Q5VA 1HJRA 4FM0A 3M8PA 3V9XA 1NKCA 4CF1A 4DTOA 3OYIA 3NGYA 5HBMA 3SUNA 5HLFA 1CXUA 4O55A 4M3XA 2HB5A 3NH2A 4FK4A 4CF0A 2B4JA 1VSHA 3AVJA 4BDYA 3SJJA 4HUEA 3SPYA 4CFDA 5KGWA 3OS1A 4Z4HA 3ZSRA 3LP0A 2F8TA 3AVHA 3A2FA 4CK3A 2FBTA 1WSHA 4M3UA 1TK8A 2IOCA 4W5OA 4M41A 4FJKA 1NJZA 4EP5A 1I39A 3WNGA 2GV9A 1S5JA 3KIOA 3LPUA 4AHUA 4CF2A 2X74A 4FJMA 2VWKA 3O4QA 2QKKA 4FJNA 2R7YA 3RMBA 3DLRA 4FLWA 4DS4A 3QEVA 1YTAA 3L3UA 3SQ4A 3ZSWA 3KKRA 5C25A 3SQ0A 4RG8A 3AO5A 3QEXA 3HL8A 3OYNA 3DLEA 1ZBUA 1EKEA 5EU7A 3PO5A 1HNIA 1X9WA 5SZTA 4AILC 1XC9A 3NF8A 4HUGA 1WSFA 3ZCMA 4ELUA 4FCYA 3RWUA 2WONA 4IBNA 3V9WA 5DMRA 3AVMA 1R0AA 2KZMA 3RR7A 1K6YA 3ZSOA 1NOZA 4ZTFA 1JXEA 3DLGA 1ASWA 1S1VA 3KKSA 4ELTA 4CJTA 4CE9A 4J2EA 2FBYA 4KI4A 3LDSA 3QEPA 1UAXA 3NFAA 4O0JA 3MEDA 3TAPA 3D45A 3KJVA 4KHYA 4OJRA 4OPJA 2PYLA 2D0AA 1VSJA 4DQSA 2VG6A 3V1QA 3EZ5A 3AVNA 4CF8A 4DSLA 3LZJA 2KQ2A 4F8RA 1CLQA 4DU3A 4DSIA 1XHZA 1T05A 4Z4EA 3QIPA 3SQ2A 2E4LA 3WNHA 2A1SA 4W5TA 3TI0A 4DSKA 1Q9YA 2ZE2A 3TR8A 3QLHA 1EETA 4O5BA 4KB1A 2O4IA 4AHCA 3RMCA 1QSYA 3VQBA 1A5XA 4J2DA 1TV6A 3M8RA 2RN2A 3L2WA 4OLAA 1BCMA 3AVBA 2P5GA 5KRSA 3HT3A 4CIEA 3TANA 1S1XA 2KW4A 5DK5A 3VQEA 3KLEA 4DSFA 1JLFA 4JRQA 2YNIA 3KLHA 2Q3SA 5KI6A 4EZ9A 4CFBA 4BE0A 3TAFA 2FBVA 1VSDA 1KTQA 1SUQA 3LZIA 2X6SA 1D8YA 3KD5E 3SUQA 1BCOA 1GOBA 4H8KA 3TAGA 3RMDA 1IKYA 3P83D 1S9GA 3KLFA 2E6MA 3AA3A 4KPYA 4W5NA 4DSEA 1VSEA 1T8EA 3JSMA 1KLMA 4DFKA 1CXQA 3SV3A 4EZ6A 3RMAA 2KTQA 4E3SA 1BI4B 3V9SA 3S3OA 4C8OA 3P5JA 1J54A 3T19A 1LW0A 4NYNA 4CJVA 2DFFA 1KVCA 4QAGA 4DF8A 1UA0A 3L3VA 1A5VA 4FZYA 2HNYA 1A5WA 3HYFA 1WLJA 4O4GA 2JGUA 3OJSA 1IH7A 3AO2A 3RRGA 4CECA 4CJUA 3HK2A 2IDOA 1BL3A 1BQNA 1RBTA 3KLIA 1B92A 1XHXA 3AA2A 1RTDA 3VQPA 3AO1A 3PX0A 4TSXA 4CHNA 2G8UA 2YNHA 4CGDA 2PZSA 3O3HA 3L2RA 3AO3A 3QNNA 3SUOA 4FLYA 3OVNA 4YFUA 4B9MA 4KFBA 1T03A 4KRFA 3WNEA 4DTPA 4BDPA 2ZQBA 4AHVA 1J5OA 2OPSA 3HO1A 1QE1A 3NF9A 3VQCA 4CK2A 3DRSA 3M8SA 2XY5A 3DMJA 4B9TA 1KLNA 1TKDA 1D9DA 2Z1JA 4N5SA 3C94A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EO3A 4KTWA 3QBXA 2WC9A 3ZSXA 3NAEA 2DEBA 2A40A 4PKGA 5M1OA 5CY4A 5CZ2A 3P31A 3ZT2A 5K14A 5C2FA 4X64K 3PO4A 1O13A 2OPRA 4FLVA 3A8YA 4CGIA 2HVHA 2LF6A 1HMVA 5EVZA 2QXFA 1SL1A 3TAEA 4DQQA 4FWOA 4I6MB 1QHTA 3L2OB 1KFSA 4FWMA 2NRZA 3ZSVA 4PWDA 4ADNA 5AQNA 4DV7K 1XL3C 4PQUA 1LCUA 1GLEG 1T6DA 3MX2A 1UOCA 1QQNA 3MN5A 2IVPA 1ZYQA 2HNZA 4CIGA 1QVGM 4K0KK 1IKXA 1HPZA 3P1GA 4GV3A 2YKNA 3CCEN 1RT3A 4X5NA 5EX5A 5D3GA 4CJWA 2VWBA 1XU5E 3VESA 2NLXA 4IOXA 2O8FB 1YI2N 4CD1A 2O8DA 4C8KA 4FK0A 1FZ5E 2ZWHA 3FFIA 2RPIA 3FFKB 3L0QA 4CEOA 4YNQA 4AHSA 4KKOA 3VQ7A 4DV4K 3OYGA 2UYTA 1BG3A 1FK9A 2E6LA 1VSMA 1E3MA 3OYAA 2WTUA 4YHHK 2P1OB 1XVGE 1LV5A 2UXDK 1BISA 5HRNA 3NDKA 1QQMA 4CBUA 1FZ7E 1FZ0E 3R9PA 2UUBK 4BRFA 1DT9A 1GOCA 3BY5A 1RBRA 5HRPA 1C6VA 3QO9A 3VQ9A 3K2PA 3AVKA 5FPEA 3CCQN 1WAFA 3FZLA 1M1KO 2F96A 4KAZA 4CJRA 1WAJA 1F21A 1HX1A 4LF7K 5AQVA 5T7BA 2P1PB 1MU2A 3RR8A 2HHTA 2IGIA 2Y1JA 2NZTA 3VN5A 3OGKB 3CFPA 4MFBA 1KFDA 1SAZA 3K5MA 3C6UA 1NMNA 4B9QA 2MZWB 1NGAA 2OCEA 1I3AA 4CJFA 1TL3A 2P9PA 1KVBA 2ZGYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3EO3 A;  4KTW A;  3QBX A;  2WC9 A;  3ZSX A;  3NAE A;  2DEB A;  2A40 A;  4PKG A;  5M1O A;  5CY4 A;  5CZ2 A;  3P31 A;  3ZT2 A;  5K14 A;  5C2F A;  4X64 K;  3PO4 A;  1O13 A;  2OPR A;  4FLV A;  3A8Y A;  4CGI A;  2HVH A;  2LF6 A;  1HMV A;  5EVZ A;  2QXF A;  1SL1 A;  3TAE A;  4DQQ A;  4FWO A;  4I6M B;  1QHT A;  3L2O B;  1KFS A;  4FWM A;  2NRZ A;  3ZSV A;  4PWD A;  4ADN A;  5AQN A;  4DV7 K;  1XL3 C;  4PQU A;  1LCU A;  1GLE G;  1T6D A;  3MX2 A;  1UOC A;  1QQN A;  3MN5 A;  2IVP A;  1ZYQ A;  2HNZ A;  4CIG A;  1QVG M;  4K0K K;  1IKX A;  1HPZ A;  3P1G A;  4GV3 A;  2YKN A;  3CCE N;  1RT3 A;  4X5N A;  5EX5 A;  5D3G A;  4CJW A;  2VWB A;  1XU5 E;  3VES A;  2NLX A;  4IOX A;  2O8F B;  1YI2 N;  4CD1 A;  2O8D A;  4C8K A;  4FK0 A;  1FZ5 E;  2ZWH A;  3FFI A;  2RPI A;  3FFK B;  3L0Q A;  4CEO A;  4YNQ A;  4AHS A;  4KKO A;  3VQ7 A;  4DV4 K;  3OYG A;  2UYT A;  1BG3 A;  1FK9 A;  2E6L A;  1VSM A;  1E3M A;  3OYA A;  2WTU A;  4YHH K;  2P1O B;  1XVG E;  1LV5 A;  2UXD K;  1BIS A;  5HRN A;  3NDK A;  1QQM A;  4CBU A;  1FZ7 E; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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