4KWV | Genus

Total Genus 80

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	80
sequence length	285
structure length	285
Chain Sequence	DAEGLALLLPPVTLAALVDSWLREDCPGLNYAALVSGAGPSQAALWAKSPGVLAGQPFFDAIFTQLNCQVSWFLPEGSKLVPVARVAEVRGPAHCLLLGERVALNTLARCSGIASAAAAAVEAARGAGWTGHVAGTRKTTPGFRLVEKYGLLVGGAASHRYDLGGLVMVKDNHVVAAGGVEKAVRAARQAADFTLKVEVECSSLQEAVQAAEAGADLVLLDNFKPEELHPTATVLKAQFPSVAVEASGGITLDNLPQFCGPHIDVISMGMLTQAAPALDFSLKLF

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	The crystal structure of human quinolinic acid phosphoribosyltransferase in complex with its inhibitor phthalic acid. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]
molecule tags	Transferase
source organism	Homo sapiens
total genus	80
structure length	285
sequence length	285
chains with identical sequence	B, C, D, E, F
ec nomenclature	ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date	2013-05-24

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01729	QRPTase_C	Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A	PF02749	QRPTase_N	Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4kwvA02
3.90.1170.20	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Aldehyde Oxidoreductase; domain 3	Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain	4kwvA01

4BWLC 1K02A 1JR1A 4MKNA 4JTSA 3NR0A 2AQWA 2V81A 2CLEA 2X1RA 1T8XA 4HHPA 3AO0A 3EXTA 4ZQOA 2HS8A 3GNDA 1K8YA 4Q4KA 2EF9A 3UD6A 3LOTA 4GUIA 4AWTA 4FNQA 1F2JA 3PUEA 2ZZ1A 3W7OA 5C2XA 3P60A 3MHUA 1NEYA 1S5TA 2E6YA 3W7KA 4O52A 1DV7A 2GVGA 2QJIA 3C56A 3NPWA 5D02A 4QQ3A 4RCXA 3U6WA 2ATMA 3NGJA 3W2KA 3CQ0A 2WOQA 1W5PA 3STGA 5F2MA 4Y90A 4HKPA 4MZ1A 4UR7A 4FHAA 1PL9A 2Q8LA 2QKFA 3W86A 5I3GA 1JQXA 4LS0A 4RK8A 4CQ9A 5F4SA 4NU7A 4Z1AA 4B5NA 4UTKA 1LP6A 5FF2A 1X6UA 3HIJA 3EX4A 4GWEA 3HQ1A 1IXNA 4MY8A 4HPXA 1W1ZA 3E49A 4JX4A 3W73A 4QM1A 4UFKA 1GQNA 4MOZA 2R91A 4O11A 3L0GA 3NQCA 3P67A 5G2HA 4FNSA 3LCWA 3FKRA 1OX5A 4JY9A 3P80A 5TBOA 1T99A 3M16A 2B4GA 2GJLA 3RK8A 1K7XA 1XXXA 2VEKA 5AYZA 2YR1A 3O16A 3LLDA 2DZPA 2Z1BA 3M5YA 1GJPA 4WX2A 2ZYFA 3UZ5A 5K3VA 1SO5A 4O16A 4DF0A 1DJNA 1MEWA 3MBFA 4M7SA 5KTLA 4OV9A 3QSRA 3G22A 2F7FA 5D04C 2V82A 3EWBX 3M41A 1XBZA 3W88A 1XM3A 1GPWA 3USBA 1AL7A 2E6FA 2WV8A 5T26A 3R89A 4YLWA 4RX0A 3QQ1A 2WJZA 2NUXA 3L0NA 2Z6JA 1WQ5A 2FJKA 3MI2A 3HPXA 3NEVA 2DZSA 3H55A 3CIXA 4JTIA 4AVFA 1AW1A 1VGAA 4RLIA 2Y7GA 2X1TA 5I3JA 3BG9A 2C15A 5KZDA 2ZTKA 2C1HA 3C2VA 3B0UX 2ISWA 3FFSA 2ZRXA 3PBVA 5D2VA 1GTHA 2Y7DA 2NX3A 5G4WA 2FDSA 4NUWA 1W3NA 5CZTA 1G4SA 2EHHA 3LB0A 4KWVA 4K7YA 2PURA 3MYOA 3A5FA 1JCLA 1THFD 3N73A 3MO7A 4BI7A 3KXQA 5LNWA 1ZAIA 3GB6A 5EPDA 2XFWA 2H8ZA 4WD0A 3QMRA 4WOZA 4BF9A 4NNAA 2Y7EA 3UWUA 1DL3A 4JYEA 5I3KA 3GXPA 3L5AA 5J5DA 5KITA 4FO4A 3NYZA 3HB9A 3HO8A 1UB3A 3FYPA 5CPLA 3UWWA 3DFSA 3FKKA 4I7WA 4UXDA 3N9SA 2NZLA 2DP3A 3IGUA 4Y9AA 5AHMA 3HPSA 4ALDA 1H1YA 2YSWA 1W31A 4JYDA 3NDOA 4RJEA 2CLFA 2QR6A 2CLKA 4O4VA 6TIMA 1TRDA 2QF7A 1JCXA 1F73A 2QDHA 3G8EA 1VCVA 3KAOA 3RLVA 5C5YA 2JKPA 3W6YA 4M6VA 1NSJA 3MP4A 1KM2A 3EXSA 3G3DA 3EX2A 3WK3A 5BOOA 2A6NA 3HOJA 4YCOA 1HG3A 2J6XA 2QCLA 1QAPA 3G1VA 1Q6RA 3TSMA 5CZSA 2I14A 4RXGA 4UTWC 1W54A 3W2UA 5G1YA 4BI6A 3KFTA 5AHLA 1KTCA 5DXXA 3EX1A 4K37A 1IGSA 1QPOA 3EWYA 5FF3A 3W2JA 4ZZ9A 4QSHA 5K7JA 2TPSA 3IRDA 1KW1A 4YWIA 3W72A 2H3DA 3LCHA 5TQLA 3W1PA 3PF3A 5D2TA 3GIYA 1TJRA 3DH7A 2VFHA 2XN1A 4JTKA 3NPVA 5K9DA 1DKWA 3W7PA 1VYRA 1JUBA 2E77A 1O5XA 3P5ZA 3W7NA 5D05A 1J4EA 1H50A 2B0MA 3L67A 4XWUA 1U83A 3N19B 3CC1A 3GDKA 4JR5A 1D3GA 3P5YA 3EWZA 1R30A 5EA9A 3P8JA 3W1TA 3CEPA 2FIQA 1EX5A 2FFCA 4FEZA 1JCYA 4ML9A 5LNRA 1BEUA 3U8GA 1LCOA 2TSYA 2Q3RA 1SPQA 4KFOA 5CPMA 5L6UA 4CCEA 5BNKA 2AAMA 3RU6A 2C19A 3NQDA 3S5OA 5J5RA 1OG0A 3BGJA 3N3MA 3JS3A 4K36A 2FB3A 1JVNA 3MYPA 3CWNA 1Q6QA 4K8HA 3NL2A 1Y0EA 4KFPA 3Q58A 3OHIA 3DHFA 3BVJA 4ADUA 4O17A 4FB7A 4O12A 3STCA 3LLFA 3W7MA 1HO1A 3HPZA 3O07A 3OVRA 3G1DA 3EKLA 3P81A 1KBIA 1EP2A 1JQVA 2Y7FA 4N02A 1Z42A 4MUZA 4NJKA 1OK4A 2DZTA 2RFGA 2WNZA 3DKLA 4O10A 3CHVA 1S5WA 1GG1A 4DBDA 3W23A 1QOPA 1G7VA 1F6PA 2BZNA 3M44A 4XKYB 4DBEA 3P84A 1WYIA 3KVLA 2ZQ0A 1G69A 1FCVA 3SZ8A 3MHFA 3GKFA 4M6QA 1JCNA 2CFFA 4XUGA 4Y6GA 3VNDA 1H60A 4BFAA 5DBTA 4Z0SA 2G96A 1GVFA 4PC8A 3BK0A 5FEZA 4JTEA 1KFEA 3NOEA 5CSRA 4BR1A 4O1CA 4O19A 1FWWA 3SECA 2JGYA 4OBTA 1H7PA 3MW7A 1O60A 1VR6A 4NX5A 2QJGA 1OFRA 3LV5A 4RV8A 2CZEA 1XDMA 5KMYA 4PL1A 1TTIA 4LC8A 3NQFA 1TPDA 4LOCA 3DAQA 3HBLA 3NO5A 1ZCOA 3DENA 3GK0A 1OYCA 4H6KA 5AYYA 4ADSA 4IMEA 2P10A 1XUZA 5BRBA 4N6FA 4AB4A 1TTQA 4FIQA 5U4NA 1H5YA 1LBFA 2E09A 3ABOA 1AW5A 4MY9A 1KFLA 4JN6A 3LCXA 1FCQA 1XDLA 1XBVA 4O50A 2VFEA 1KLZA 1NFBA 5D2YA 2R94A 3LCFA 1N55A 2G97A 1B3OA 4H4IA 4YCPA 3GYEA 4OHQA 4N9DA 3N2MA 1FX6A 1XL9A 4UTTC 4JYFA 1FXQA 1ZHAA 2ZZ2A 3O8AA 5BMWA 2BWGA 4FX7A 4U28A 3KX6A 3TROA 4NZJA 1JCJA 3M6YA 1KM4A 3EWWA 3N9RA 1M5WA 2ISVA 3W75A 2P1FA 2XN0A 3IVTA 1XBYA 2YFNA 1NVMA 5HINA 3P7YA 2IQTA 1UUMA 1FDYA 4FX8A 3SGZA 2ATSA 3T44A 4RKAA 5CZJA 4UFJA 1L6YA 1SZEA 1WA3A 1TPFA 3BGGA 3DFPA 5G4EA 1H61A 1QO2A 3W71A 4DELA 1IXQA 5EY5A 1GG0A 1F7BA 1R46A 3ATZA 3PUOA 4O53A 4O15A 1YDNA 3R2GA 4PODA 1SQ7A 2V2DA 4KWWA 1FY6A 3C4UA 1XC4A 4NXKA 3O6YX 1QPNA 3O1NA 4JY8A 2TYSA 3LRMA 2R14A 3BV4A 4WJEA 5HWMA 5KINA 3G0UA 4LY8A 3TAOA 1PIIA 5DCBA 4AWUA 1TTJA 1QDSA 4EVZA 2EGZA 4GUJA 3B03A 5LGZA 1W8SA 3JRKA 5CZ0A 4AH7A 3HG3A 1L2UA 4UTJA 4WOQA 3T55A 1DJQA 2VOMA 2NV1A 1U5JA 3GZ3A 1K03A 1G7UA 1KM6A 1X1ZA 1E51A 2ZFAA 4UMCA 3QSTA 1RVGA 1FCBA 3MUXA 3DFQA 1F6KA 2B7QA 2OMAA 3V1PA 3QQ0A 1GOXA 1RQEA 4UTIA 5K2ZA 3UY8A 4E2BA 4I9AA 2FPYA 1AW2A 1YLVA 4DO4A 4UFHA 4AHOA 2G5WA 4ZQMA 4HNUA 5FI8A 3DI0A 1RZMA 2W0UA 3EWUA 3W87A 3C6CA 1QOQA 4I7UA 2GUUA 3GXTA 4MLRA 1EIXA 2DZUA 4Z1BA 1OF6A 3TQKA 2ABAA 3C8FA 3G1SA 3R13A 1PV8A 3I65A 3PSVA 3G0XA 3CWOX 4LUJA 1PCKA 3IIXA 4JTUA 2QCDA 3TNOA 3TMLA 4QISA 4TR9A 3GDLA 4LNYA 5HQEA 3TC6A 2CLMA 3PC0A 4Z1DA 2FLIA 2QCEA 2E5BA 4GC4A 1JRBA 5HNRA 1SZNA 6ALDA 3PBUA 4UCGA 3KRSA 3KOFA 4N2YA 3TA6A 1JULA 4IOTA 2JBMA 3DGRA 3GAKA 1ZNNA 1Q6LA 3QRHA 2A6LA 3A24A 2NX9A 4A21A 2Z0IA 5U7SA 4NJIA 4GUFA 3W85A 1ME7A 3QC3A 4L4MA 1TPWA 1GVRA 4R33A 3S0CA 1H7OA 3JR2A 1RQHA 3WJXA 4XBKA 5LSMA 4IX0A 3GR7A 1OFPA 5I3FA 3LTYA 2VKZG 1P4CA 2E68A 3LHVA 5DCDA 4OWGA 2V30A 4AWSA 1F74A 3NQVA 3C2EA 4Y96A 2YDAA 3S1UA 5F2GA 1JJKA 1Q45A 1VHNA 1VH7A 3G8RA 2ZA1A 4O13A 3G1AA 2VFDA 2DZVA 4M5PA 4JICA 4X22A 3MP3A 4JIPA 1SSDA 1TPVA 4UMBA 1A5CA 2O7QA 1W3TA 2DJXA 4RZ4A 2VEPA 4FF7A 4LTSA 3UWYA 4RR4A 3NQAA 4BWLA 3T7VA 1WXJA 5L9FA 3TK7A 3FIGA 3ZFHA 4Z1CA 4PCFA 3V75A 1OYBA 5DXYA 1KV5A 2QCHA 3LHZA 4YMZA 4CLMA 4QAIA 3W1AA 1TPB1 4N9EA 1LYXA 1VS1A 3R8RA 1VLIA 3O6CA 5DN1A 2GQ9A 2PRLA 1IIGA 1QNVA 2GJNA 3O05A 1O5KA 3RF9A 1VJIA 3PVFA 4IQLA 5A8GA 3G1FA 4HSNA 5AHFA 1AL8A 3PAJA 4UTMA 2Y63A 3S5NA 3MI6A 3BLIA 3M43A 1NF0A 3BG5A 3MHGA 3TMQA 3M7WA 1D9EA 4PEKA 1GT8A 3ATYA 3NPUA 4NX0A 1H1ZA 3W7GA 3LRLA 5AHIA 4OQVA 4PTNA 5LHFA 3O63A 1EWDA 2ISSA 3DBPA 1YPFA 2OZ0A 4QJ1A 1J2WA 1FDJA 5E93A 1TB3A 1A5AA 2B7PA 1TCDA 2A7RA 4OE7A 3G0SA 4DXVA 3B4UA 2H8XA 4C1LA 1ME8A 3CM4A 2OT0A 3FYOA 3TQ0A 5F4WA 1TQJA 3LRKA 4MIMA 2ZZ6A 1MEIA 4TMBA 1ICPA 1PHWA 2BLEA 5TIMA 3A23A 5IM51 3VKJA 4WZHA 1C29A 2RDUA 5CKSA 1QR7A 4N4QA 3DFOA 3LHWA 4AAJA 3KRZA 1HL2A 1LLZA 3W1NA 1TPEA 4Y8FA 1GVOA 2A7PA 5DBUA 4LVGA 2XN2A 4IX2A 3UXAA 2A0NA 3W1LA 3TCEA 1EPXA 3VI2A 1O95A 3LI1A 3N14A 4Z0JA 1IXOA 3DU0A 4O1AA 1RV8A 2X30A 5AC6A 2ZRZA 3NQMA 3HGRA 4UUIA 3FJ6A 3C2OA 1LOSA 3WK1A 1C8VA 5LKYA 3NM3A 1YYAA 1S3HA 3RMJA 4JDYA 2RDTA 3P74A 2TRSA 5H2ZA 5HMSA 3NL5A 3N2XA 3NQ7A 1TJPA 3WK0A 5G2IA 1DOSA 3KVJA 2Y62A 1GZGA 3L65A 2WPBA 4CNPA 3LBMA 3CB8A 2JKAA 1LRNA 4CCDA 1QWGA 2YPIA 1GTEA 5DY3A 1SU5A 5EYWA 3W7IA 4EIVA 2HMCA 2C0AA 3HGSA 3NVTA 4IJBA 2J24A 4HSOA 4K6AA 4O14A 4FNTA 2CLHA 3QMTA 3IIPA 2V9DA 3STEA 3UWQA 4ONVA 2Y61A 5F4XA 1FWNA 1PHQA 3LHUA 3QF0A 4S2CA 4BI5A 1LBMA 2C3ZA 5EL1A 2VELA 3W2LA 5BW6A 5FEWA 2NWRA 4ORIA 2YYUA 3DKJA 3T78A 3LCGA 3IIOA 3QJAA 2RDWA 1LROA 4IMFA 1GVSA 4R53A 1YXYA 3TW6A 2VEMA 1TIMA 4DEFA 1BWLA 3YPIA 1W5MA 1UASA 3MJYA 3ELFA 3PBWA 4WXYA 2A85A 4O0KA 3PBYA 1UJPA 2X16A 4BK9A 1A5SA 4HT3A 3TAKA 4POCA 3FA5A 1FCUA 4UTWA 1YADA 1I2RA 2NLIA 2Y70A 1UUOA 4PH6A 4LW7A 3TU9A 3OVQA 2J9XA 3GX9A 4GNJA 4CCCA 5K4ZA 3G24A 3KRUA 3L9CA 3W83A 1TSIA 4MPQA 2Z2UA 3BPWA 3E96A 2NV2A 3DI1A 3W7HA 3RNDA 5I3HA 2NUYA 3NZ1A 5CGQA 4DF2A 2YGYA 3VE7A 1SSGA 3TSDA 4A2SA 4MZ8A 4EOUA 5LNVA 4UIOA 3TDFA 1OK6A 3H53A 3W1QA 3T4CA 1LRTA 2A2IA 5LHEA 5FEPA 5F2LA 3ABSA 3W9ZA 1FDZA 3CLMA 5C6MA 4PA8A 3PSWA 1XKYA 5KZMA 5K4XA 2WNNA 1JUKA 1W3IA 4O0ZA 5KZEA 4JX6A 2RKXA 4LS2A 4PFMA 1LZOA 4JXCA 3LDVA 3FEMA 5IBXC 4MJMA 2Y85A 1EP3A 1LM1A 3UWVA 1H62A 3S1VA 1ICQA 3W7EA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4FOU A;  1UKT A;  3PM6 A;  1X96 A;  5FJI A;  4QIU A;  3CU2 A;  3M0Z A;  2A21 A;  4GD0 A;  4MPK A;  1H63 A;  1WO2 A;  3ARV A;  4EPB C;  1QNR A;  4F0S A;  1SW3 A;  2Y5J A;  5DLC A;  3P3B A;  4JPG A;  1T7L A;  5F2I A;  2P5N A;  2NWS A;  3VIN A;  5CJM A;  3VTR A;  4KQN A;  2J25 A;  4ZTY A;  3ZQ9 A;  1NDV A;  3WD1 A;  1V7Y A;  4M7T A;  3AZR A;  3U0H A;  2OZ8 A;  2XYL A;  4JL1 A;  5C55 A;  2D2G A;  2FMN A;  4AY7 A;  2XIJ A;  4MUP A;  4BF5 A;  3VXG A;  1VP5 A;  4HNT A;  2OSX A;  2DOR A;  2IXU A;  3M9Y A;  2DEP A;  5ECV A;  3BW3 A;  1O4U A;  3GG8 A;  2CWX A;  2V3E A;  4DO6 A;  3ZWS A;  4HHM A;  2OOF A;  4GA5 A;  5T91 A;  4PR4 A;  3P6L A;  1PYM A;  3QGA C;  1VF8 A;  3ENL A;  3LXC A;  3RJY A;  3VA8 A;  3AIS A;  4PUE A;  4YHG A;  4PBE A;  1D3C A;  4UFM A;  3SI9 A;  3KE0 A;  5FJU A;  1KTN A;  1XLJ A;  1H1N A;  2ON3 A;  3UYC A;  1NWR A;  2WLZ A;  3N15 A;  4Z2L A;  3A22 A;  3GR4 A;  4B3K A;  4KET A;  2XVG A;  2GVY A;  1ADO A;  2BGS A;  5SWU A;  3ZLG A;  3KVK A;  2WKL A;  5DRI A;  3OYX A;  3GTN A;  3HV8 A; 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 3NOY A;  3TUU A;  4XD4 A;  4GFS A;  3ITT A;  7PTD A;  2VJX A;  2E5C A;  2PRM A;  3IVU A;  5GPR A;  4IMC A;  3UGR A;  3BAR A;  3AIE A;  2WZT A;  2GL5 A;  1OC7 A;  4X3Z A;  4QTG A;  2W6R A;  3SSJ A;  3Q65 A;  1SO4 A;  2O9T A;  3PB2 A;  4LWW A;  2CW6 A;  1TV4 A;  1PZ0 A;  3W7C A;  3GTF A;  4R27 A;  2J88 A;  3WMB A;  4N42 A;  4QX4 A;  4MG4 A;  1UIO A;  4GCX A;  2BTM A;  4TTG A;  3DHD A;  5LZL A;  1UR9 A;  4AHQ A;  2QF8 A;  4AMA A;  1GPF A;  2J7G A;  1OBA A;  4LVB A;  1V0L A;  3N4F A;  3I3E A;  1HP5 A;  1SO6 A;  2ALD A;  4QG8 A;  3QW3 A;  3WJW A;  4XK2 A;  2ZID A;  4W86 A;  3C2Y A;  2Y88 A;  4AF0 A;  5JMU A;  3QH2 A;  4US5 D;  3WJZ A;  5LIW X;  3B3D A;  4GUH A;  4F9J A;  2DIK A;  2B7N A;  1HJS A;  4JQ3 A;  2ZDS A;  2GVL A;  2QAF A;  2I7G A;  4XAZ A;  3WNK A;  3BGA A;  4FXF A;  4QHR A;  4IGN A;  1V77 A;  1WBH A;  2E8Z A;  1UKP A;  3AMC A;  2PA6 A;  4HME A;  3GLC A;  4XTI A;  4HK5 A;  3T8Q A;  2F2K A;  4A22 A;  2WB5 A;  4Q8M A;  4L4P A;  4J3Z A;  5ABG A;  2J78 A;  4DQW A;  4A3U A;  4L6H A;  1RY0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4KWVA

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations