4KYEA

Partial structure of the c-terminal domain of the hpiv4b phosphoprotein, fused to mbp.
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
400
structure length
400
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPAAAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAADALKITVSEMIRDLFGDSDKSRKLLESINM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Protein domain definition should allow for conditional disorder.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, Phosphoprotein, chimeri
source organism Escherichia coli
molecule tags Binding protein, viral protein
total genus 135
structure length 400
sequence length 400
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4kyeA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4kyeA01
3N5LA 1GVCA 4WKMA 2P2AA 4RA1A 1SW2A 4GRKA 2OCUA 2HFBA 3C35A 4EF1A 3OO7A 3IO6A 3TFLA 2RC7A 5ICTA 1USYE 5CM6A 4WXJA 5AA4B 3CFLA 3JZJA 4PP0A 1FQBA 2DE2A 2WKYA 2VOZA 3V5AA 4NF4A 4ZEFA 1LCFA 1ZTYA 1S50A 2OJTA 1EZ9A 4KR5A 3VV5A 4PETA 4WEPA 1NKXA 1H3DA 4YB6A 2DE3A 3T22A 5I56B 3HHGA 2F7BA 1UIVA 3CG3A 3H6WA 2Z8DA 3PPPA 4L17A 2DE4A 3SEYA 4G2ZA 5CMMA 3U1OA 4BDOA 1BLFA 3E3KA 3T66A 1B3LA 1CE2A 5CI5A 2O7UA 2H98A 4GIZA 1LFIA 3WAEA 2XX7A 3FJ7A 4ND9A 4RY1A 4ZZAA 5KZTA 3KJTA 1B3HA 4QFNA 3H3GA 1VR5A 1KWHA 4K3FA 3G3IA 4JBZA 5KCJB 3EHUA 4AB5A 3HSTA 3M3FA 5CBSA 5I2KA 1EZPA 5AA2B 3IB1A 3O6HA 4LZ5A 5I58A 3G7WA 1LB9A 2Q9TA 3T9UA 4MFIA 2UXAA 1IZ1A 3IOWA 2DXRA 3ILUB 3D4GA 1F9BA 3MBPA 4FEBA 3TPAA 4NMYA 4HCYA 1AMFA 2ESNA 4R6HA 3K6UA 2I0CA 3EQ1A 1B3EA 3QXMA 3L6GA 1Z7NE 1QJMA 2ONKE 4H8IA 5I59B 4WEDA 1I6BA 5J1DA 3HV1A 2PVUA 2OZZA 3PPOA 1IXHA 4FJPA 2GFEA 3ONMA 1M5EA 3MJNA 3CG1A 2D5WA 2F6PA 1NH7A 1B2HA 5CMCA 3QSLA 3GBBA 4N07A 1LGBC 4F2OA 3C31A 1LBBA 3W15C 3G3KA 1IQ7A 4BDQA 4R74A 4JDFA 1URGA 3W9VA 1NH8A 1Y3PA 5A5XA 4NE4A 5AA2D 5FHMA 3T9VA 4JSOA 1N7WA 4AQ4A 5DVJA 2DP8A 4ZZEA 1JW5A 2Q8JA 1NL5A 4KHZE 4FAJA 1JEVA 3PUVE 1B58A 4EDPA 1S7YA 4G8MA 3B6QA 3DLNA 1MXZA 3MVWA 1JW4A 1SYIA 3Q25A 1ZIUA 1TT1A 1ANFA 3PU5A 4LUBA 2QJEA 4GF8A 1N04A 1GTKA 1A7LA 3TQLA 3N6UA 3N94A 1VFDA 2W7YA 1MXUA 3FUZA 3SEVA 3U72A 1MH3A 3K2DA 2PBWA 3TYHA 4JB7A 3U94A 2QS1A 4OZ9A 3GLBA 4TLMB 1RKMA 3E13X 1MQGA 3KBRA 3U92A 2V93A 1MQDA 1QVSA 2HZKA 3V83A 2QMWA 1II5A 3D4CA 4YU0A 3G3FA 1SQYA 3IOVA 2I6EA 1FQDA 4C1UA 3U93A 2OWTA 3LUYA 4KPTA 4BDLA 3MP8A 1MQHA 4OENA 5JEIA 3MZ9A 5DYHA 1XVYA 4F22A 4OERA 1A8FA 4ONYA 4NTLA 3C32A 4R6KA 3SEUA 2XXUA 5L9MA 1MH4A 4ZS9A 3VFJA 4C0RA 1Y20A 4O3AA 3ODBA 3KJ7A 1UTHB 3DP4A 3A3UA 1N3XA 2XXXA 2UVJA 1OVBA 2A5TA 3H6UA 3TCFA 1SW5A 3UP9A 1IEJA 4QRZA 2RC8A 1BTJA 2Y7KA 4C1TA 2QPQA 4LVQA 4ISUA 5TPAA 4R9GA 4H65A 4TQUQ 3S9LC 4ZEBA 2THIA 1B0HA 4LA9A 5ITPA 5DVFA 4EQ7A 3FXRA 5I2NA 4JWXA 1MPDA 3VXBA 1S9TA 5FHOA 2DVZA 3IB2A 3SDFA 3TCHA 1P1QA 1NMUA 3A3CA 4DIGA 2O84X 4U21A 1SBPA 2FYIA 5JK4A 3CVGA 4QSDA 3I6VA 2I48A 1GGGA 5M2VA 4DCYA 3OENA 1EU8A 1O63A 2DWAA 3OO6A 1MQIA 5TP9A 1Q1KA 4LP2B 4RK2A 3MVXA 1FTKA 5KDTA 1MRPA 1LFGA 3V89B 1IXCA 1TFDA 4GWOA 3WAFA 3LSLA 4GQOA 2OK2A 4YKPA 2UVHA 2NOOA 4ELRA 4MBPA 1AIVA 1I6AA 2DS9A 1R9QA 3O6IA 4GOTA 5I57B 3QIMA 4Q8RA 3EN3A 2RCBA 4RPOA 3GZGA 3IL1B 1SI0A 1FQEA 1MY2A 1NFTA 5JTYA 4F1YA 1ELJA 4H0WA 3T93B 3TCGA 4R6YA 1NNKA 4RJZA 1MDQA 2ALUA 1US4A 4G77A 2F6GA 4RPNA 4ZEKA 1ZJLA 1XC1A 3UA8A 4POWA 3OEMA 1USYH 5ELVA 1ZKBA 3OOAA 1N0TA 3TKDA 1PBPA 1ZBMA 3HO7A 3LSWA 4HTGA 3KOTA 4KCDA 5HPQA 3HN0A 3QUFA 1DPEA 4KCCA 3TTMA 3M3KA 1OQHA 2AIXA 4DCXA 4JSDA 1FTOA 4YKJA 1SD3A 3MZ1A 1N7XA 4F1VA 2XHDA 4YAHX 4YMBA 1NNTA 1B1HA 4R72A 3PD8A 1I69A 1B05A 3K00A 4PFTA 4RNSA 1A99A 3IOTA 2XXHA 3KSXA 4Z7EA 1A55A 2Q89A 4DXCA 2REGA 2I58A 2YPNA 1QW0A 4DXUA 3THIA 2X7QA 2XXQA 4U4XA 1GV8A 2I4CA 2VP1A 2V3QA 2UYFA 3S9MC 1JQFA 1OLCA 5BWJA 3EHTA 2A5SA 1LAXA 4GL0A 3W9WA 2G93A 3PGFA 5AE4A 3FXQA 4JWOA 4H8JA 4LATA 4XKQA 3FD3A 2E0SA 4PFWA 4NF8B 4GL8A 1O64A 3S9EA 1B4HA 2F5XA 1UTBA 1Y1ZA 2VD2A 2UVIA 4FEDA 2UVGA 4IY5A 4OHNA 2F7AA 4GXSB 3B7DA 3AXFA 3H06B 4OYVA 2PT2A 2Z8EA 3IK6B 4FORA 4QFPA 4LQ5A 1QKAA 4XKRA 3QK6A 1YPNA 2OBGA 4IB2A 1QKBA 4U22A 3T9HB 3KN3A 1Y1MA 3O9PA 4Q5TA 2Z22A 3CFZA 1B1XA 2QS3A 2HEUA 4U1OA 3LBSA 2DYXA 1URSA 3UIFA 2NUVA 2F8DA 3OXNA 4OQOA 2X7PA 3UORA 3FASA 1PBQA 2V3UA 1P1OA 2Z23A 1J1NA 5EYFA 3KG2A 3TODA 4QSCA 4EXKA 1MY1A 3C33A 4BDNA 2H4IA 4LZ7A 5H8HA 1JVYA 4PQJA 4X1BA 1XT8A 2HXWA 4NF6B 1N84A 4ZECA 1ZU0A 3ZKLA 3ZKKA 4Z0IA 4DDDA 4M4GA 1VSOA 3MQ9A 5AA4A 2I49A 1QUKA 4HW8A 5H8SA 1AL3A 1PB7A 4IY6A 2X26A 4G8HA 1SVXB 4I1DA 4KYSA 4TOZA 2XD2A 2RKMA 2VD3A 3MC2A 2G29A 3FIRA 2NWJA 1HSLA 1EH3A 5AA3A 2DOJA 3M8UA 5I56A 1LCTA 4OFOA 3R26A 1MXYA 1P1WA 1QUJA 2Y7IA 2KLFA 3MVZA 1B51A 3HHFA 1DTGA 3EHSA 4R2BA 3FZVA 3OO9A 4G68B 2RC9A 1YTVA 2B65A 2AL5A 2VHAA 3S9NC 5DEXB 3MWBA 3N26A 4PFYA 3PMVA 3PD9A 1D4NA 4U1ZA 5KCJA 3IJXB 3CSBA 5AA2A 2O1LA 1VFEA 1M5CA 3IJOB 5H8NB 4OEUA 3RT8A 2F78A 2OWSA 2R71A 3TZAA 1P1UA 1MY4A 4XXUA 5H8QB 3KN7A 1UQWA 3CI8A 1A40A 3S2VA 4OWDA 4YB5A 3SESA 1MXXA 1WVJA 1B3GA 1BP5A 4XKNA 3H7MA 1MY0A 3K6WA 3PMXA 1A8EA 4IO5A 5I59A 4P11A 1IXGA 2ZXTA 2PYYA 4YMAA 1B4ZA 2QS2A 2HAVA 1L5TA 3HCQA 5H8FB 3K1NA 4Q30B 3SKPA 4I8CA 3B6WA 4MF3A 2XXTA 3VLWA 2HZLA 1H43A 2Q2CA 4RYAA 2Y7RA 3TQWA 3OELA 1M5DA 2RF1A 3JV9A 2Q88A 1MPBA 1B0LA 2IA4A 3USDA 3P7IA 1B52A 1MDP1 4RXLA 1JW1A 1BKAA 1Y4TA 1B40A 3RN8A 2H99A 2O1MA 3FVNA 2ZYKA 4EUOA 3CFXA 1PC3A 1JNFA 4NF4B 5LOMA 2YJPA 4DZ1A 4BLAA 4XKPA 1R1NA 4F3GA 4EXLA 5ISUA 4GVOA 3H6TA 4KYEA 4YZZA 4LQ2A 3I3VA 1LAFE 4F3PA 1LFHA 3K4UA 3OMBA 4F3BA 1MM6A 5EHSA 1MS7A 1WDNA 1CB6A 4U4SA 4IGTA 3VLVA 4ZEIA 3BKIB 3LR1A 3Q29A 2XXVA 4HCWA 4N13A 4FIMA 4MH5A 1AH5A 3TAJA 2UYEA 1OIBA 3PUWE 3GXAA 1LLSA 3FVOA 2ANJA 1MXVA 1QULA 2PX1A 4OMBA 2O69A 3MW0A 1YCJA 3ZSFA 1PEBA 5I2KB 2F35A 3OD7A 2I3WA 3KOSA 4YKKA 1FQFA 3KEIA 1M5BA 3RTWB 5I58B 2QMXA 1PB8A 3KN8A 3IOUA 3LC8A 4H6DA 2LAOA 4ZE9A 4GXAA 2PT1A 3VDFA 4G4PA 3SEXA 5BUUA 1SI1A 1H45A 4XTCQ 3OSRA 5CMKA 1IUDA 2ZYNA 1NNFA 1B5HA 1MXWA 2DWHA 3RNNA 3QYTA 3IAZA 5IAIA 4ESXA 4N6PA 1Z7ME 3DP6A 4AB6A 3CRBA 1RYXA 3FV2A 1WODA 4EQBA 1AOVA 1UTHA 1UIUA 5CC2A 3MVYA 3K6XA 3EPEA 2F7CA 1DTZA 1LBCA 3H4ZA 3SERA 4F31B 1FTMA 3B6TA 4IO7A 5FTHA 3RQTA 2DXYA 2QS4A 2AYSA 2H5YA 4FE8A 3K0VA 2DSFA 3G3JA 1P1NA 1FQCA 2H9BA 2P1SA 2YLNA 5A5XB 3BFTA 4MLVA 5F7VA 4E0XA 1ZLQA 4KI0E 3HPIA 3TEPA 4Q0CA 1URDA 3H6VA 4YKIA 1I6QA 4R2FA 4YB7A 2E1SA 3DP8A 2R9JA 1N76A 2F97A 1B9JA 2ONRA 2NXOA 4R75A 2Y84A 4NF5B 1M5FA 1N3WA 3FJGA 2V3TA 2CZLA 3PMWA 1JEUA 1SYHA 3PV0E 2XXYA 2I3VA 2Y7PA 3LSXA 4F18A 1JETA 2H25A 1MM7A 4MLQA 2XX8A 1Y3NA 4OEVA 4FATA 1D9YA 4NWDA 1O7TA 2Y7WA 4EF2A 2F34A 3CSGA 4QFLA 3KZGA 1B7UA 2ABHA 4TLLB 5I57A 4EQ9A 2I4BA 4OESA 3QUJA 4IO3A 3UN6A 1LSTA 3SETA 1A54A 3O6GA 3VVEA 2I0BA 4F2QA 2QRYA 4GD5A 3K6VA 1Y9UA 5L8DA 4QSEA 1IXIA 3FVGA 1MPCA 1Q35A 1D3KA 4DLDA 4I62A 1ZMGA 1B6HA 3O97A 3H03A 3DELB 4G8NA 4I9DA 4OTEA 5CMBA 1EZOA 4X1DA 4FECA 3Q27A 5HM4B 3FJMA 4IO2A 2A5TB 2V25A 2XXPA 1XVXA 2D21A 2FA7A 3VVDA 1D9VA 3PPNA 4P0IA 2IEEA 3RY3A 1DPPA 1OQGA 5TPAB 1B46A 1XOCA 3C9HA 3G3GA 1OLAA 4ZEDA 2ZYMA 1MQJA 1TFAA 2GHBA 5EHMA 2QSXA 4F19A 4UA8A 5I2NB 5HBCA 3K1MA 1OMPA 4OFLA 4F3SA 3N6TA 1MY3A 1IIWA 2DVCA 3I5OA 1B5IA 5K2YA 2O68A 4F29A 3MP6A 4U23A 3MPKA 4H67A 3OSQA 5FHNA 3TELA 2ONSA 4IO6A 4QFKA 4KYDA 4KQPA 2XD3A 5TP9B 2XXRA 5DT6A 1HSEA 4E0WA 4NF5A 4OFJA 4NF8A 3E9XA 4LZ8A 1Y3QA 3JYRA 5KDTB 3EF7A 1POY1 1XS5A 5F1QA 1FW0A 2HCAA 4YICA 3KSJA 5AA1A 2HAUA 3IB0A 1FTJA 1YAEA 4ZE8A 1SW4A 3V8XB 4LONB 2RCAA 3M3LA 3TDJA 4QHQA 1GR2A 1DMBA 2BJJX 3ECRA 3PPQA 3TTLA 3IX1A 4BDMA 2Z8FA 3Q28A 4H5GA 4O3BA 5JTYB 4UACA 4GFRA 3KGCA 2B3BA 1PDAA 1JVXA 3RTFB 3PPRA 3L6HA 4ELQA 1R9LA 4OXVA 3Q26A 5ICQA 3VVFA 3FXUA 3OEKA 1VE4A 5FTIA 1DSNA 3BBRA 3T96B 3MP1A 3CIJA 3PUYE 3O66A 3PUXE 1P99A 3R6UA 4KFQA 1OVTA 1B32A 4JXIA 4ECFA 3S4UA 1TXFA 1SW1A 4KD5A 2R6GE 5ITOA 1H76A 1POTA 5K2XA 3O28A 1B3FA 3UGWA 2O51A 5B7DA 3VXCA 4DXBA 5B70A 3PUZE 4U2RA 1BIYA 2ZMBA 4NF6A 1B5JA 4M1VA 3LSFB 1FCKA 1B7HA 1QUIA 4OETA 3A09A 1Y4CA 2D3IA 5TU0A 4PFUA 4F39A 1XHYA 3RPWA 5CBRA 4NEDA 3TMGA 3FATA 3QAXA 4NWCA 1DOTA 1MG1A 3MUQA 4ELPA 2F36A 3CR9A 4QF9A 1FTLA 3MPLA 3TUSA 4RK9A 3UK4A 4BDRA 3FV1A 4R73A 3C36A 2AL4A 4DE8A 2B3FA 3C34A 3G3HA 4HS7A 2GRVA 3VLUA 2ZNTA 3SEWA 3C4MA 5DVIA 3ILTB 2ZYOA 2NVUB 4P0GA 2HQ0A 4G68A 3IORA 3K02A 4X9TA 1LAGE 3BFUA 5I84A 2V84A 3KFMA 3TTNA 3ZS6A 5DEXA 1R6ZA 1UTBB 5DTBA 1ATGA 2XX9A 2REJA 2VGQA 4IO4A 4PE5B 4ESWA 1TWYA 3FVKA 3MZBA 3F11A 2O7IA 4THIA 4R9FA 2DQVA 5H8NA 2QL3A 4H5FA 3RT6B 4IGRA 4H1XA 4GLIA 1B7ZA 3U8QA 4O3CA 4ZDMA 3RLFE 5H8QA 1LAHE 3TTRA 2P0SA 1NNPA 3O2AA 3VE1B 1HSJA 5L9OA 3K01A 4F1UA 3E4RA 4QFOA 5L9SA 4POXA 4OVJA 1H44A 2GH9A 2ZNSA 3DM0A 2Q2AA 2M8CA 2PMSA 3MAMA 5IKBA 1RYOA 3O29A 3K1PA 3R7XA 1IITA 1SDXA 2RINA 4XIGQ 3IO4A 1PB9A 2XXWA 1US5A 2CMOA 3FGSA 5CRYA 2OLBA 3RGYA 2ZNUA 4G68C 3TTKA 2GHAA 4X48A 3IR1A 3OO8A 3T9XB 2DWJA 4ELOA 1T0KA 2DWIA 5H8FA 2FNCA 3RUMA 4JWYA 2XXIA 3GBAA 1LB8A 5H8HB 2O6AA 1FQAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3N5LA 1GVCA 4WKMA 2P2AA 4RA1A 2Y5KA 1SW2A 4GRKA 2OCUA 2HFBA 2XWVA 3C35A 4EF1A 3OO7A 3IO6A 3TFLA 2RC7A 5ICTA 1USYE 5CM6A 4WXJA 5AA4B 3BIGA 3BIHA 3CFLA 1YYZA 3JZJA 4PP0A 1FQBA 1FBPA 2DE2A 2WKYA 2VOZA 4GWYA 3V5AA 4NF4A 4ZEFA 1LCFA 1ZTYA 1S50A 4GWZA 2OJTA 1CNQA 4GWSA 1EZ9A 4KR5A 3VV5A 4PETA 2WX9A 4WEPA 1NKXA 1H3DA 4YB6A 2CZHA 2DE3A 3T22A 3KC1A 5I56B 3HHGA 2F7BA 1UIVA 3CG3A 3H6WA 2Z8DA 3PPPA 4L17A 2DE4A 3SEYA 4G2ZA 5CMMA 3U1OA 4BDOA 1BLFA 3E3KA 1KA0A 2WBBA 3T66A 1B3LA 1CE2A 5CI5A 4GWXA 2O7UA 2H98A 4GIZA 1LFIA 3WAEA 2XX7A 3FJ7A 1DK4A 4ND9A 4RY1A 4ZZAA 5KZTA 3KJTA 1B3HA 4QFNA 3H3GA 1VR5A 1KWHA 4K3FA 5EYHA 5I3SA 3G3IA 4JBZA 5KCJB 5A5LA 3EHUA 4AB5A 3HSTA 3M3FA 5CBSA 5I2KA 1EZPA 5AA2B 3IB1A 3O6HA 4LZ5A 5I58A 3G7WA 1LB9A 2Q9TA 5IZ1A 3T9UA 3IFAA 4MFIA 2UXAA 1IZ1A 3IOWA 2DXRA 3ILUB 4PGPA 3D4GA 1F9BA 3B50A 3MBPA 1INPA 3NOHA 4FEBA 3TPAA 4NMYA 3IFCA 4HCYA 1AMFA 2ESNA 4R6HA 3K6UA 2I0CA 3EQ1A 1B3EA 3QXMA 3L6GA 1Z7NE 1QJMA 4OVPA 2ONKE 4H8IA 5I59B 5IGAA 4WEDA 1KZ8A 1I6BA 2FBPA 5J1DA 3HV1A 2PVUA 2OZZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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