4KYEA

Partial structure of the c-terminal domain of the hpiv4b phosphoprotein, fused to mbp.
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
400
structure length
400
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPAAAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAADALKITVSEMIRDLFGDSDKSRKLLESINM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Protein domain definition should allow for conditional disorder.
pubmed doi rcsb
molecule tags Binding protein, viral protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, Phosphoprotein, chimeri
total genus 135
structure length 400
sequence length 400
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4kyeA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4kyeA01
1S9TA 1EZPA 2XXRA 2R6GE 5TP9B 2HXWA 1MH3A 5I59B 1HSJA 3SKPA 4EDPA 3QAXA 3G3JA 2QRYA 2B65A 5JTYB 2VD2A 2QSXA 2WKYA 1SW4A 1MPDA 4KI0E 3KJ7A 1LFGA 1J1NA 3PGFA 1O63A 1WVJA 4Z0IA 4NF6A 2F5XA 5L8DA 1M5BA 1MXWA 1Q35A 2NXOA 1JETA 4R75A 2PT2A 5L9OA 3TELA 1TFAA 4H1XA 1ZMGA 5KZTA 4EF2A 2YPNA 1Y9UA 1T0KA 3B6WA 2DSFA 3FXRA 5B7DA 3M3FA 5IKBA 2XXYA 3G3KA 5CBRA 3V83A 1VR5A 1AMFA 4JSOA 4THIA 1PB9A 1QKBA 1B51A 3FGSA 2ANJA 3IOVA 3LSLA 2F35A 4G8MA 3RTFB 4NF8B 3IJXB 1XHYA 3O6HA 2I6EA 3PUYE 3FV1A 3T96B 1UQWA 4P0GA 4NEDA 4RPNA 4Z7EA 4Q5TA 2Q2CA 3H06B 2YLNA 4ZEBA 4BDLA 2V84A 4QHQA 4DLDA 1MRPA 4ZE9A 4IGTA 2QJEA 4IO7A 3TQWA 5F1QA 4OTEA 4G8NA 1FTOA 4Q30B 3D4CA 1QUIA 4EXLA 3EQ1A 3W15C 3PPOA 5AA2B 3LUYA 3IX1A 3RNNA 4LQ2A 1Q1KA 1B7ZA 4GLIA 3MZ1A 1Y20A 1R1NA 1TFDA 4RJZA 2UVJA 5I2NA 1VFEA 3T9HB 3UN6A 4YKPA 1PEBA 5H8HA 1UTHA 5TPAA 2Q89A 4KD5A 1MY0A 3N94A 1SDXA 5CM6A 4JWOA 1UTBB 3QIMA 3O2AA 4OHNA 4F39A 2X26A 1NNKA 4KHZE 1ZU0A 4ELPA 2DXYA 1EZOA 4I9DA 5I2KB 3VLUA 2OJTA 3FD3A 3H3GA 3PD9A 4GXAA 3LR1A 3N6UA 2O7UA 5HM4B 2XX9A 3MPLA 5ICTA 1B1HA 3HPIA 5A5XA 3CSBA 1F9BA 3Q26A 2X7QA 3L6GA 4OQOA 4QRZA 2ZNUA 1Y1ZA 3MW0A 3DM0A 2Q8JA 1B32A 3G3FA 1QW0A 1ZIUA 2HCAA 3DELB 1JNFA 2E0SA 2DXRA 4C1TA 2CZLA 2FNCA 1MY2A 4I8CA 1LBBA 1P1QA 4XXUA 4O3AA 2IA4A 3B7DA 4R74A 2P1SA 1H44A 1MQJA 5AA3A 3EF7A 2Z8FA 3TZAA 2XXPA 4OMBA 5DTBA 1SI1A 3PUVE 3O28A 2VP1A 3VLWA 1PC3A 2VD3A 3T9VA 4R73A 1NNFA 2G93A 4RNSA 1LCTA 3CG3A 1IUDA 2REJA 5CMCA 1POY1 3CIJA 1Y3QA 2DE2A 2ESNA 3IB1A 4RXLA 3PMWA 1N7XA 3T93B 4HTGA 2ABHA 4PQJA 1B7UA 2I58A 4F1UA 1B3EA 2ZNSA 1RYOA 3MQ9A 4OFOA 5EHMA 1CE2A 3KJTA 1LGBC 4FATA 1SVXB 4RK2A 2H99A 1PDAA 1QULA 1A8FA 3OSRA 2V3TA 2RC8A 4R6YA 1USYH 5DEXB 2O1MA 3I6VA 5H8QA 4PETA 3VVEA 1LB8A 1A8EA 3GLBA 3H6VA 4F1YA 3MVXA 5AE4A 3O6GA 2I49A 4ONYA 4IO2A 1Z7NE 2XX7A 3M8UA 3RT8A 3G3HA 1P1WA 1B3GA 5CRYA 2GFEA 1IZ1A 3N6TA 1ZTYA 2DVCA 1FQCA 3FXQA 4OEVA 2Y7RA 4GF8A 3K6WA 3K00A 1MQGA 1ZJLA 1LBCA 1VE4A 2RC7A 5CC2A 5JK4A 3TKDA 3R6UA 3A09A 1FCKA 3MP8A 4PFYA 3U92A 2ALUA 4YB6A 3MBPA 1URGA 3TEPA 2FYIA 2VGQA 3K02A 4H5GA 1MQIA 4H6DA 2M8CA 1IEJA 3H03A 1GV8A 1MS7A 3FVOA 4IO3A 2ZYMA 1B3FA 5L9SA 4NWCA 3VXCA 3CFZA 4QFNA 2QMXA 1NFTA 3HO7A 2I48A 3S4UA 1Y3PA 2BJJX 3VFJA 4F2OA 4X9TA 4H5FA 2ZYNA 4I1DA 1LSTA 2Q9TA 4C0RA 2O1LA 3MC2A 4KR5A 3CFLA 4H65A 3IK6B 1QVSA 1S7YA 1H3DA 1OLAA 5BWJA 2HFBA 3C32A 2DQVA 3PPRA 5I84A 1FTLA 1RYXA 5J1DA 4N07A 3PMVA 5KDTB 3TCHA 2HZKA 4R2FA 1VFDA 4F31B 3GBAA 3EHUA 1NKXA 1MPBA 2GRVA 5JTYA 4BDNA 2XX8A 3F11A 1AIVA 5I56B 5KCJB 4IY5A 3BKIB 2V3UA 4L17A 4OXVA 4KPTA 3SEUA 3MWBA 4OFJA 3TDJA 2LAOA 3PMXA 4GWOA 4PFUA 4OENA 3S9NC 1QJMA 3VXBA 3USDA 1UIVA 1MXXA 1POTA 3OENA 4HCWA 1YTVA 1PBQA 2I3VA 5H8NA 2XD2A 1KWHA 4LZ7A 3RTWB 2DWAA 3FATA 4EF1A 2HZLA 1B5JA 4GIZA 4IB2A 4XIGQ 3ZSFA 3E4RA 5AA4B 5I57B 3O29A 5I58A 1OIBA 3K0VA 4F3SA 2OCUA 1B0LA 5H8FB 1SQYA 1II5A 4ECFA 3E3KA 5ITPA 1JVXA 1B46A 3IL1B 3C34A 4POXA 4X48A 1P1UA 3GZGA 4K3FA 2I3WA 1A40A 3C36A 3I5OA 4OETA 1M5EA 4GOTA 2Z8DA 4NF4B 2RF1A 1NNTA 2O68A 4ZS9A 3R26A 4WEDA 2Z23A 4EQ7A 4OWDA 3K4UA 3TTLA 1H45A 1RKMA 1LAFE 5JEIA 1O64A 1SD3A 1A55A 3VVDA 2F78A 1PB8A 4MBPA 3OEMA 1YPNA 3PUWE 5FHNA 1ZLQA 3HSTA 2GH9A 4YICA 1JW1A 1M5DA 4RA1A 3VE1B 2UVGA 4FEDA 4F3GA 5CMBA 4DCXA 4G77A 2ONRA 3ZKLA 3O6IA 4ZZAA 1US4A 3CRBA 3OO7A 3FASA 1MPCA 3VVFA 2UVIA 1HSLA 3KN3A 3WAFA 3BBRA 3H7MA 3FV2A 3K6UA 4PFTA 5DT6A 4OZ9A 4NF6B 3N5LA 4QFPA 3C9HA 5K2YA 4KQPA 3MP1A 1B52A 2DP8A 1MY3A 4LATA 3H4ZA 4EXKA 1MM6A 1VSOA 4GL8A 2VHAA 4LQ5A 1B58A 1LAGE 2QS3A 4IGRA 4GD5A 5DYHA 3TFLA 1NH7A 3UP9A 4FIMA 4XKPA 4XKNA 4ZEIA 4FEBA 2F34A 4R2BA 5CMMA 1DTGA 3TTRA 3ZS6A 2QMWA 4F2QA 3RT6B 1NNPA 4QSEA 1JEVA 2PBWA 3SESA 5FHMA 3FIRA 1D3KA 3LSFB 5H8SA 4MF3A 4HCYA 4O3CA 3CFXA 1PB7A 5EYFA 4HS7A 1M5FA 5L9MA 3LSWA 3SDFA 4H67A 2O6AA 1BKAA 3TTKA 2UYEA 4BDQA 2Y7IA 5ISUA 4TOZA 4ESXA 3MP6A 5HPQA 4FJPA 1OQHA 2ZYOA 2Z8EA 3MZBA 4EQ9A 1A7LA 2ZXTA 3SEWA 1D4NA 3Q27A 3TCGA 3PV0E 1JVYA 4G68C 1XS5A 2DWJA 5I2NB 4DE8A 3TQLA 2O84X 4R72A 2HAVA 1IXIA 2PYYA 3UIFA 1MXUA 2YJPA 1UTHB 4UACA 2AYSA 2A5TA 2F97A 3K6VA 1N04A 4NTLA 1R9QA 4GRKA 1AH5A 3OMBA 1QUKA 1DPPA 2XXUA 4OESA 3FJMA 4YB7A 1DOTA 3HV1A 4FAJA 3MUQA 4DXUA 4U22A 2NVUB 4I62A 1FQAA 4U4XA 1YCJA 3TCFA 4JDFA 1M5CA 1NL5A 1URDA 3ECRA 2Z22A 2H98A 1I6QA 3FJGA 1B3HA 2PX1A 4TLLB 4ZZEA 2W7YA 3KGCA 3B6TA 4NF5B 2GHAA 1BIYA 1I6BA 3T9XB 1H43A 4POWA 3K1PA 3AXFA 3N26A 2XXXA 2REGA 4GXSB 4KCCA 2PT1A 3S2VA 4BLAA 1FTJA 4BDMA 4RK9A 4NMYA 3PPPA 4U21A 2PMSA 2AL5A 3G3GA 1Z7ME 4MLQA 5ITOA 4IO5A 3S9LC 4N13A 3S9EA 2CMOA 1BP5A 3V8XB 2OK2A 3PU5A 2UVHA 2ZYKA 1SW5A 2E1SA 1DTZA 1EU8A 1Y3NA 2QS2A 1US5A 2ZMBA 3G3IA 4WXJA 1O7TA 3OD7A 2HEUA 3U94A 4P11A 3W9WA 1UIUA 4LZ5A 1QKAA 1N0TA 4QFKA 1GVCA 1IQ7A 3KSXA 5H8QB 5AA1A 1B2HA 5LOMA 1ANFA 1OMPA 1LCFA 3O9PA 3VLVA 4YKJA 4U1OA 4WKMA 3ILUB 4G4PA 4F29A 4YMAA 3CVGA 3KN7A 1HSEA 1SW2A 1MH4A 1JEUA 4G68A 1B4HA 4DCYA 3ONMA 4LA9A 3QK6A 3QYTA 1JW4A 2F6PA 2RCAA 2O7IA 3IAZA 3TPAA 4LP2B 3UK4A 1B5IA 2V93A 4QF9A 2I0BA 1TXFA 4XKRA 3OELA 4U23A 5TP9A 4M1VA 3IJOB 4X1DA 3MVZA 1ATGA 5I59A 4RYAA 2NWJA 4JSDA 3IB2A 4QFOA 2Y7PA 4R6KA 3PD8A 4YKKA 2RCBA 5AA2D 1ZBMA 1B1XA 1B7HA 1Y1MA 5K2XA 1MY1A 3GXAA 4U4SA 3HHGA 4MFIA 1B9JA 3IB0A 1Y4TA 1BTJA 3IOTA 4QSDA 2DS9A 3OEKA 4ZECA 1TWYA 3CI8A 4UA8A 3JYRA 4AQ4A 3KN8A 4YMBA 3O66A 3TTMA 4F1VA 3H6WA 1GR2A 1XT8A 1DMBA 2Y7KA 3MZ9A 4OFLA 3OO9A 3W9VA 1SI0A 3LSXA 4LVQA 1AOVA 3O97A 2AL4A 3MJNA 2F7AA 1OLCA 3SEXA 1LFIA 3RY3A 1B40A 2NUVA 4M4GA 3UGWA 4MLVA 3Q28A 3TAJA 4F19A 1FQDA 4PP0A 2IEEA 3K6XA 4F18A 3LBSA 2F6GA 1SYHA 1MQDA 3U93A 5B70A 2A5SA 4YAHX 3IOWA 3M3LA 4NF8A 1IXHA 3P7IA 3RPWA 2Y7WA 3IR1A 3KFMA 5IAIA 5FTHA 1OQGA 4U2RA 4G8HA 3C31A 2XXHA 4ZE8A 2DWIA 4RY1A 3TTNA 4IO4A 1GGGA 2DE3A 1MXVA 1SW1A 3DP8A 1OVBA 1NH8A 1D9YA 3DLNA 1MG1A 4X1BA 5AA2A 5H8NB 3S9MC 1S50A 3TMGA 4F3PA 3PUXE 3SERA 1MM7A 1WODA 3U1OA 4ZEFA 1DSNA 3VV5A 3FXUA 3B6QA 4U1ZA 3V89B 3OO6A 5I58B 2HAUA 2NOOA 2XHDA 3IO4A 1LAXA 3I3VA 1B5HA 1UTBA 2V25A 3TUSA 3OOAA 2UYFA 2QS4A 3Q25A 2RKMA 3PPNA 3ILTB 5I2KA 5M2VA 3FJ7A 2AIXA 1MQHA 3EHTA 5F7VA 4GQOA 3KOTA 4H8IA 4FE8A 2D3IA 3E9XA 2DOJA 1FQFA 2F8DA 3RUMA 5BUUA 3IOUA 1XOCA 4C1UA 2D5WA 5ELVA 1IXCA 3THIA 1EZ9A 1P1NA 3HHFA 2I0CA 3KZGA 4GL0A 4R9GA 2O51A 4E0XA 1JQFA 1I69A 1IXGA 4AB6A 3T9UA 4ELQA 4FECA 1I6AA 4LUBA 4ZEKA 4LZ8A 3U8QA 3QUFA 3C4MA 4ND9A 2P0SA 5DVIA 4EUOA 4RPOA 2XXTA 3FUZA 3MVWA 3EN3A 1L5TA 5EHSA 1LLSA 3KSJA 4ELRA 3OSQA 3A3CA 4DZ1A 1GTKA 2RC9A 5CI5A 3PPQA 4R6HA 2OLBA 3KG2A 1EH3A 3DP6A 3RGYA 5ICQA 3C33A 3HCQA 4XTCQ 3UA8A 2PVUA 2GHBA 2ZNTA 5DEXA 4DXBA 4JBZA 4YU0A 5H8HB 5TPAB 3K1NA 4OVJA 4BDRA 3RQTA 4NF5A 2Q2AA 2V3QA 1XC1A 2XXIA 3K2DA 3FVKA 3OXNA 1YAEA 4PE5B 5CMKA 4KYSA 1FQBA 2H4IA 1PBPA 2QPQA 3LC8A 1WDNA 1N3XA 1JW5A 4YKIA 4DXCA 1N76A 5TU0A 3V5AA 2HQ0A 5A5XB 5CBSA 4TQUQ 1D9VA 3ODBA 4FORA 2DYXA 2UXAA 3WAEA 1DPEA 5FHOA 2OBGA 3R7XA 3T22A 2OWTA 1SBPA 1N3WA 2QL3A 3K1MA 2DVZA 1FW0A 2P2AA 1B6HA 4EQBA 3RN8A 1SYIA 3EHSA 4DIGA 2FA7A 2THIA 2XD3A 3IORA 4ESWA 4XKQA 1FTMA 4LONB 1CB6A 3CSGA 1IITA 3MAMA 3FVNA 1A54A 2A5TB 1XVXA 3BFUA 1USYE 1LB9A 2ONKE 2XXVA 3U72A 2B3BA 2VOZA 3FZVA 4DDDA 3TYHA 4QFLA 2H5YA 3TODA 3VDFA 1R6ZA 1N7WA 2F7CA 1B0HA 4G2ZA 2B3FA 3QUJA 3M3KA 2F36A 1AL3A 1N84A 1QUJA 2H9BA 2R9JA 2DWHA 1B05A 2X7PA 5DVFA 1R9LA 3QSLA 4KYEA 5DVJA 1IIWA 3T66A 3QXMA 1XVYA 5KDTA 4BDOA 3H6UA 1OVTA 3EPEA 2I4CA 1MDQA 4ZEDA 2RINA 2XXQA 1LFHA 3HN0A 4ISUA 4WEPA 3C35A 1ELJA 1H76A 4JXIA 4AB5A 2OZZA 1BLFA 1MDP1 4N6PA 3MPKA 3PUZE 5I56A 5KCJA 4OEUA 2QS1A 1P99A 1LAHE 3K01A 4QSCA 1A99A 4Q8RA 3CG1A 3GBBA 3L6HA 3RLFE 2Q88A 4KFQA 4ELOA 1ZKBA 3KEIA 3ZKKA 3SETA 3H6TA 4KCDA 3FVGA 1MXYA 4Q0CA 4JB7A 2R71A 3MVYA 4GVOA 4IO6A 2Y84A 3JV9A 5AA4A 5I57A 3KOSA 4OYVA 4OERA 2KLFA 3G7WA 2DE4A 5HBCA 5H8FA 1MXZA 2OWSA 4O3BA 1MY4A 3KBRA 4YB5A 1B4ZA 2XXWA 4E0WA 3OO8A 3SEYA 1Y4CA 1NMUA 4KYDA 4F22A 1FTKA 5FTIA 4H0WA 3BFTA 3CR9A 4YZZA 3SEVA 3E13X 1URSA 4NF4A 4TLMB 3UORA 4PFWA 3IO6A 4MH5A 3A3UA 4F3BA 4HW8A 3D4GA 2F7BA 1B3LA 1TT1A 1FQEA 4G68B 4JWXA 2G29A 2ONSA 1P1OA 2H25A 4P0IA 2I4BA 2D21A 4NE4A 4ZDMA 4IY6A 4H8JA 2O69A 4GFRA 3JZJA 4JWYA 4NWDA 4R9FA 3Q29A 3DP4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1S9TA 1EZPA 2XXRA 2R6GE 5TP9B 2HXWA 2ZZWA 1MH3A 5I59B 1HSJA 3SKPA 4EDPA 3QAXA 3G3JA 2QRYA 2B65A 5JTYB 2VD2A 2QSXA 2WKYA 4MNCA 1SW4A 1MPDA 1LBXA 4KI0E 4XF5A 3KJ7A 1LFGA 1J1NA 1FPFA 3PGFA 1O63A 1WVJA 4Z0IA 4NF6A 1INPA 2F5XA 4OVTA 5L8DA 1M5BA 4P8BA 1MXWA 1Q35A 3NOHA 2NXOA 1JETA 4R75A 2PT2A 1RDZA 5L9OA 1LBVA 3TELA 1TFAA 3EKIA 4H1XA 1ZMGA 5KZTA 4EF2A 4N15A 2YPNA 1Y9UA 1T0KA 3B6WA 1NV3A 2DSFA 3FXRA 5B7DA 3M3FA 5IKBA 2XXYA 3G3KA 1FPKA 5CBRA 5EQ9A 3V83A 1VR5A 2CZHA 1AMFA 1NI9A 4JSOA 4THIA 1PB9A 4PF6A 1QKBA 1B51A 3FGSA 2ANJA 1FPJA 3IOVA 3LSLA 2F35A 4G8MA 3RTFB 4NF8B 1VDWA 3IJXB 4X8RA 1XHYA 3O6HA 2I6EA 3PUYE 3FV1A 4OVPA 3T96B 1UQWA 4RPNA 4P0GA 4NEDA 2CZIA 3CHGA 4Z7EA 4Q5TA 2Q2CA 3H06B 2YLNA 4ZEBA 4BDLA 2V84A 4QHQA 4DLDA 1MRPA 4ZE9A 4IGTA 2QJEA 4IO7A 3TQWA 5EQAA 4PTKA 5F1QA 4OTEA 4G8NA 1FTOA 4Q30B 3D4CA 1QUIA 4EXLA 1KA1A 3EQ1A 3W15C 2QVRA 3PPOA 5AA2B 3LUYA 3IX1A 3RNNA 4LQ2A 1Q1KA 1B7ZA 4GLIA 3MZ1A 1Y20A 1R1NA 1TFDA 4RJZA 2UVJA 5I2NA 1VFEA 2KR0A 3T9HB 4PFRA 5ET5A 3UN6A 4YKPA 1PEBA 5H8HA 1UTHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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