4KYEA

Partial structure of the c-terminal domain of the hpiv4b phosphoprotein, fused to mbp.
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
400
structure length
400
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPAAAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAADALKITVSEMIRDLFGDSDKSRKLLESINM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Binding protein, viral protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein, Phosphoprotein, chimeri
publication title Protein domain definition should allow for conditional disorder.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 135
structure length 400
sequence length 400
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4kyeA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4kyeA01
1UTBA 3K6VA 4ESWA 1SW2A 2I3VA 1HSEA 3U94A 3TEPA 3OMBA 3CFZA 3KN3A 5JTYB 3TTLA 1JW1A 4R2BA 3JZJA 2RKMA 1FQFA 2ZMBA 3GZGA 1B3FA 3E4RA 2DWJA 3N6UA 1OVBA 4YB6A 4QHQA 1LLSA 4JSDA 4DIGA 4U22A 3FASA 4NWDA 4OHNA 4GFRA 4NF6B 5I57A 1N04A 2ZYKA 4BDOA 2HZLA 2BJJX 3VV5A 4PQJA 1PB7A 4RPNA 4YKPA 5I58B 3QUJA 1ZJLA 5BUUA 3MVXA 4H67A 2OWTA 4DXBA 3THIA 4F3GA 3PMVA 4MH5A 5F1QA 1FTJA 2ZYMA 3TFLA 1GTKA 5TP9B 1NFTA 3T96B 3LC8A 4PFTA 1LAXA 3RNNA 3G3HA 2F7BA 2E0SA 4N6PA 3OD7A 4PFYA 3GLBA 2F78A 3RTFB 1ELJA 5B7DA 1UTBB 4EF1A 1NNPA 1EZPA 3RGYA 3B6TA 1GGGA 4ONYA 1FTOA 4R9GA 4U4SA 3V5AA 1Y3NA 5CRYA 2XXUA 2Q88A 3FV2A 2QMXA 4YKKA 3PPRA 1SYHA 1YCJA 3W9WA 1AIVA 3BFUA 3OO7A 1BLFA 2NOOA 2RCBA 4WEDA 3VDFA 3MP1A 3QAXA 4OYVA 4GLIA 1D9VA 2LAOA 4G68C 1MM6A 3FXQA 1Q35A 4H0WA 1H44A 5TPAB 4ZEFA 4XTCQ 5EYFA 4BLAA 3KG2A 2AL4A 3IOWA 1PC3A 3ZKKA 2CMOA 4U23A 1IQ7A 1OIBA 1BKAA 4UA8A 2ESNA 4DZ1A 1SW1A 4NF8A 3T9XB 1NKXA 4TLMB 5H8HA 4E0WA 4P0GA 3H06B 3K6XA 3C31A 3D4GA 3MBPA 1KWHA 3U72A 4XKQA 1POTA 3OEMA 3IB0A 2XXWA 5KDTB 1JVXA 1WODA 3L6HA 5H8NB 4OEVA 1B40A 1IXIA 1MPDA 3RT6B 4QFOA 1GVCA 5H8FA 1SYIA 2DWHA 4QFPA 1QW0A 2O1LA 1O63A 3EHTA 3DP4A 2NUVA 4DDDA 3UORA 4H1XA 2G93A 3IB1A 1QVSA 3O6GA 1Y20A 5I56A 4WXJA 3MUQA 1TFAA 1AMFA 2P2AA 3FGSA 3MC2A 1MPBA 4R6YA 4YICA 5CBRA 4R73A 2OCUA 3S9LC 1WDNA 1N7XA 2Q2CA 4GOTA 2VOZA 4NF8B 2QPQA 3VXCA 4O3CA 2I48A 2HEUA 1MXUA 4XKRA 4U4XA 2GRVA 2I3WA 5H8HB 3OSQA 5FTIA 4JBZA 2GHBA 4EQ9A 3MVYA 3HSTA 3N5LA 3FXUA 4PETA 4YB5A 2QJEA 3G7WA 2I58A 3MZ1A 3TCGA 4ECFA 3F11A 3TELA 4LONB 3OXNA 2DE2A 4HW8A 4AQ4A 1R9QA 1B3GA 3MQ9A 3TYHA 1OQGA 3LUYA 2PYYA 2OJTA 3QUFA 3B7DA 1QUIA 4M1VA 1MXYA 4FORA 5AA2D 1XT8A 2XXVA 2Z8DA 3O6IA 1SW4A 5CC2A 4JWYA 3RT8A 5DVJA 1JVYA 3M8UA 4JWXA 3LSFB 3PPNA 5DVIA 1URGA 3OO8A 5HBCA 1A55A 3HV1A 2XX7A 1IEJA 2QMWA 5I84A 4KYDA 1IITA 1VR5A 3V89B 4QFKA 4FEBA 3FVOA 1OMPA 3JYRA 4MFIA 3K1PA 2DXYA 3M3LA 1XC1A 5I2KA 2D5WA 4NF5A 2UXAA 1D4NA 4N13A 1SD3A 1J1NA 3H4ZA 3P7IA 2PBWA 4KYEA 1PBPA 4F1YA 5L9OA 4F3BA 1N3WA 2HQ0A 1N7WA 2V25A 3B6WA 3C35A 1R1NA 1M5FA 3ODBA 3CSBA 1OLAA 1MDP1 3IO4A 3TCHA 2Y7WA 1OQHA 2XXQA 1B7ZA 3PUXE 1XS5A 1RYXA 3BFTA 3U1OA 4ZS9A 1A8EA 4ND9A 5JTYA 5DTBA 5AA3A 1JW4A 3FUZA 1B3EA 4OWDA 3HHGA 2Q9TA 4Q0CA 3W15C 3DP8A 3FVKA 3LSXA 4R2FA 2Q8JA 1H3DA 3PUWE 2F5XA 4F18A 2RC9A 4ZEIA 2XXTA 1DTZA 1MQDA 3RQTA 1A99A 4WKMA 4PFUA 3FVNA 1QJMA 4NF6A 2PMSA 2VD2A 1NNKA 1ZIUA 1M5EA 1Y1MA 4QSDA 3KZGA 5I2KB 3GBBA 5CMBA 4NF5B 2DWIA 3TPAA 1Y4TA 3R26A 4G4PA 4OFOA 5B70A 4YMAA 2Z22A 3K6UA 2O68A 1B7UA 1LGBC 1FQDA 1IIWA 1MXVA 1B1HA 4P11A 4I9DA 2O84X 2I0BA 4HTGA 5KZTA 3PUVE 5DT6A 3PD9A 3N26A 2V93A 3R7XA 3WAEA 2E1SA 1LAFE 4OTEA 4LQ5A 3T9HB 3A09A 4BDNA 3QYTA 4EQBA 3ILTB 3PU5A 4AB5A 1CE2A 5K2YA 4RPOA 3O2AA 1B6HA 3VLWA 4IGRA 4R74A 4QFNA 4XKNA 4JSOA 3MVWA 3SETA 3VVDA 3LR1A 3TTNA 3SEYA 1JETA 5DEXB 4U21A 3MP6A 3T22A 5TPAA 4RK2A 4RA1A 5EHMA 3T9UA 1HSJA 3N6TA 4I1DA 3DELB 2I49A 1XHYA 1MM7A 2YPNA 3N94A 1H43A 1LSTA 2O51A 4GRKA 3BBRA 1R9LA 4NF4A 3FVGA 5I2NB 3O97A 2IEEA 2QRYA 3IORA 2XXIA 3ZSFA 1FTMA 3OO9A 4OMBA 3KN7A 5EHSA 4IO6A 5ICTA 4OZ9A 1AOVA 5L8DA 4RK9A 3T66A 3TZAA 1SBPA 3PPPA 4BDLA 1IZ1A 3K6WA 1MQGA 4ZDMA 2V3QA 2F35A 1LFIA 4YU0A 4GD5A 3K02A 4KCCA 2DSFA 4R9FA 2DVCA 3MZ9A 4FIMA 3PMXA 1MXXA 3IX1A 5KDTA 5H8NA 5CMMA 4JWOA 4QRZA 1B52A 1S50A 2H4IA 1D3KA 3UN6A 1DOTA 5L9MA 4TLLB 4GXSB 2HFBA 5HPQA 1VFEA 2QS3A 4FJPA 5I59B 5H8QA 4MLQA 3H6UA 1FQAA 4EF2A 1EU8A 1NNTA 2QS4A 1B7HA 4H6DA 5AA4B 5A5XB 3ILUB 4NF4B 3R6UA 1LBBA 3SDFA 3B6QA 4NWCA 1URDA 3W9VA 2ABHA 5CMCA 2V3UA 4YKJA 4IO4A 3SERA 1B9JA 4EXLA 2R6GE 4KYSA 2XXHA 4ZE8A 1QUJA 3VLVA 1TWYA 3FV1A 4Z0IA 4H8IA 4ELOA 4QFLA 3K01A 4YMBA 4I8CA 2H99A 2YLNA 3HCQA 1BTJA 1UQWA 3QK6A 1FTLA 4ZECA 1GV8A 1US5A 2DS9A 4ISUA 1LAHE 2VD3A 1OLCA 1ANFA 3O29A 3Q25A 3CIJA 3I3VA 4KI0E 4EUOA 4H65A 1MH4A 3DP6A 1LBCA 3S4UA 3KJ7A 4IY6A 3TDJA 4RXLA 4DLDA 3KBRA 2QL3A 5H8QB 3QXMA 4F2OA 4EQ7A 2HAVA 2HAUA 4YZZA 1ZTYA 1TFDA 1IXHA 2VP1A 3PD8A 3H7MA 1M5BA 3C34A 3TMGA 4DE8A 4POWA 3LSLA 5IAIA 1H45A 4G8MA 1BP5A 4IO3A 3FD3A 1Z7NE 4G68A 1FTKA 2HXWA 4R6HA 4HS7A 4F3SA 3UP9A 3O6HA 3K4UA 3OEKA 1EZ9A 4ZEKA 3ECRA 5KCJB 4FECA 4E0XA 4DXCA 2Q2AA 3FZVA 4O3AA 1QKAA 2F97A 4R72A 1M5DA 4RY1A 2AYSA 4F19A 3A3CA 4ZEDA 2H25A 5HM4B 1CB6A 1AL3A 1B46A 3FJ7A 2DQVA 3IOTA 3OOAA 2ZYOA 1MH3A 2A5TB 1P1NA 4X1BA 1PEBA 2ONKE 5CMKA 4IGTA 4JB7A 4R6KA 4OQOA 1N76A 3IR1A 2O6AA 3FJGA 4LZ5A 2DE4A 4DCXA 2VHAA 3U8QA 2IA4A 3MJNA 4LUBA 3E9XA 4G68B 2ANJA 3UK4A 1IUDA 4BDQA 3CVGA 4OENA 1PB9A 4MBPA 4X48A 2F6PA 3K1MA 3HO7A 2P1SA 1DTGA 3TQLA 1SW5A 1R6ZA 4K3FA 2OK2A 5ELVA 2AL5A 2PX1A 3S9NC 2RC8A 5DVFA 3EN3A 3V8XB 4M4GA 5AA2B 4G77A 2F34A 4LATA 1B5IA 1NMUA 2YJPA 3IAZA 1B0HA 1N0TA 1MY3A 3VLUA 2QS2A 5DYHA 4OETA 1HSLA 1FQEA 1ZKBA 2UYEA 3H03A 3KEIA 1QULA 3FXRA 1TXFA 1LCTA 2RCAA 2OLBA 3Q27A 4JDFA 5F7VA 3IK6B 3FIRA 1SI1A 1EH3A 3MVZA 4ZZEA 5ITOA 2V84A 3T9VA 2XX8A 4FEDA 2KLFA 2THIA 2A5SA 3MP8A 4PP0A 4I62A 4NE4A 4IO2A 5JEIA 4F1UA 3VFJA 5DEXA 3O66A 1T0KA 5FHMA 4N07A 1JNFA 1P1QA 4X1DA 4F3PA 3EHSA 4KQPA 4PFWA 3LSWA 1LB9A 4GL0A 1B3LA 5I2NA 4FATA 4YB7A 2AIXA 4GF8A 5BWJA 2O69A 2UYFA 2GHAA 1JQFA 4KR5A 1LB8A 2O7IA 3KSXA 1XVYA 5ICQA 3BKIB 3KSJA 3I6VA 3IL1B 1SVXB 1YAEA 4ELPA 3S9MC 1L5TA 4F31B 1NL5A 4G8NA 5ITPA 1LAGE 3E13X 1PB8A 2P0SA 2FA7A 1MQHA 1Y4CA 1SDXA 5IKBA 1SQYA 2Z8EA 2R71A 3I5OA 4ZE9A 4OFJA 4HCYA 3VVEA 3T93B 2FNCA 4LVQA 5AA1A 3IOUA 5CBSA 3SEXA 2RINA 3D4CA 3WAFA 3Q26A 1MDQA 1MY1A 3PMWA 3SEUA 3PPQA 1RYOA 1IXGA 3FJMA 1D9YA 2ZXTA 3JV9A 4ELRA 1AH5A 5I59A 3VVFA 1FQBA 3KGCA 3RTWB 2UVGA 2F6GA 3CG1A 4EDPA 1YPNA 3HN0A 1FCKA 5A5XA 5AA4A 3DM0A 4EXKA 3EPEA 2X26A 2HZKA 3G3KA 2REJA 4NEDA 3MW0A 4H5GA 4KD5A 2Y7RA 3RPWA 2XXRA 2B3FA 4GWOA 3K0VA 4BDMA 1MXWA 3G3JA 2F36A 1US4A 5LOMA 4MF3A 1XOCA 3TTKA 2OBGA 3KFMA 2O7UA 2QSXA 2M8CA 3RLFE 2I6EA 3Q28A 1I6QA 3TTMA 4RYAA 1JEVA 3H6VA 2PT2A 5JK4A 2W7YA 1TT1A 3DLNA 3K1NA 1Y3PA 3MAMA 3O28A 4HCWA 2GFEA 3SKPA 3C33A 2ZNTA 4G2ZA 3KJTA 5FHNA 2B65A 1OVTA 4Z7EA 3KOTA 3ONMA 1B05A 1N84A 4H5FA 3M3FA 2ALUA 4JXIA 3TQWA 1B58A 4F22A 2XHDA 5I57B 3SESA 1UIVA 4XXUA 3SEVA 1POY1 1Z7ME 1DPEA 1MY4A 1B1XA 3IB2A 1GR2A 3A3UA 2NVUB 3C36A 4GIZA 2CZLA 3MPLA 1DSNA 4GQOA 1MRPA 1QKBA 1Q1KA 2GH9A 2Y7KA 3L6GA 1IXCA 3VXBA 5K2XA 3G3GA 1DMBA 2PT1A 5CM6A 4LZ8A 2REGA 3S2VA 3PUZE 1NH8A 2FYIA 2Z23A 3SEWA 3OO6A 3IO6A 3HHFA 3OELA 4KFQA 5KCJA 2I4CA 5M2VA 2V3TA 3EQ1A 4RNSA 2Q89A 4MLVA 2OZZA 5ISUA 4YKIA 3UGWA 3QSLA 1A8FA 2ZNSA 3IOVA 1FQCA 3TUSA 2ZYNA 4TQUQ 3PPOA 1VFDA 2NWJA 4BDRA 4RJZA 2F8DA 3C9HA 5L9SA 4TOZA 1SI0A 2PVUA 1WVJA 2Y7IA 2XXYA 4ELQA 1URSA 2A5TA 3PV0E 3Q29A 1PDAA 1MS7A 3EF7A 4DXUA 2D21A 5J1DA 2NXOA 4O3BA 4ZZAA 1Y3QA 1B4ZA 3USDA 4IO7A 3H6TA 2R9JA 1A54A 4IY5A 3RN8A 4U2RA 3AXFA 1P99A 1ZBMA 2OWSA 3TTRA 1LFGA 3C32A 4OVJA 4IB2A 2DVZA 4ZEBA 1S7YA 2F7CA 3QIMA 5FHOA 4U1ZA 2Y84A 2UVHA 3FATA 2F7AA 1MXZA 4H8JA 2H5YA 3RY3A 4R75A 2H98A 4KCDA 4C1TA 4C1UA 5H8SA 1EZOA 4U1OA 2X7QA 1H76A 1MY2A 3IJXB 3LBSA 4Q30B 4F2QA 4QSCA 3S9EA 1RKMA 1NNFA 4G8HA 1B51A 1A40A 3U93A 4Q5TA 3HPIA 4ESXA 5AA2A 1I6AA 1LCFA 4OEUA 4F1VA 1Y9UA 3H6WA 4LQ2A 3E3KA 1I69A 4P0IA 2DWAA 3ZKLA 4AB6A 3ZS6A 4LZ7A 1JW5A 3M3KA 5H8FB 2XD2A 3GXAA 4XKPA 3O9PA 2WKYA 3CG3A 1USYE 1LFHA 1MQJA 4F39A 3OENA 1MG1A 1II5A 5I56B 2XXPA 2UVIA 3G3FA 2HCAA 4F29A 2ZNUA 1A7LA 4WEPA 4THIA 3CFLA 1P1WA 3VE1B 1VSOA 1B5JA 2O1MA 2G29A 2X7PA 1O64A 2XX9A 4OESA 3U92A 2H9BA 1ZMGA 1PBQA 3GBAA 2DOJA 3V83A 1I6BA 4C0RA 4LA9A 1Y1ZA 4OXVA 4YAHX 3CSGA 3CI8A 1DPPA 4KHZE 3MWBA 1B4HA 2RC7A 1F9BA 1B2HA 1P1UA 1ATGA 4GXAA 4X9TA 1USYH 3EHUA 2ONSA 1ZLQA 2QS1A 2B3BA 1JEUA 3MPKA 2VGQA 4UACA 4LP2B 3CRBA 4Q8RA 1MY0A 3CR9A 2ONRA 2RF1A 3PUYE 2DYXA 5TU0A 4L17A 1P1OA 1UTHA 2Z8FA 4XIGQ 3UA8A 1MPCA 1VE4A 5CI5A 1YTVA 3TCFA 4PE5B 1UIUA 1M5CA 5AE4A 1MQIA 1QUKA 1B5HA 2DE3A 1ZU0A 1B3HA 4OERA 3RUMA 1O7TA 1XVXA 1S9TA 5FTHA 1B32A 3G3IA 1B0LA 1BIYA 3TODA 4FAJA 2XXXA 2I4BA 3K00A 3KN8A 2DP8A 3TKDA 1N3XA 1FW0A 4POXA 1NH7A 3C4MA 4GL8A 4NMYA 4IO5A 4FE8A 4QSEA 4GVOA 5I58A 4KPTA 3PGFA 3CFXA 2XD3A 2DXRA 4DCYA 4QF9A 3K2DA 3TAJA 3KOSA 5TP9A 2I0CA 3OSRA 3MZBA 2D3IA 3H3GA 3UIFA 1UTHB 3IJOB 4OFLA 2Y7PA 2UVJA 4NTLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1UTBA 3K6VA 4ESWA 1SW2A 4PC9A 2I3VA 1HSEA 3U94A 3TEPA 2FVZA 3OMBA 3CFZA 3KN3A 3RPLA 5JTYB 3TTLA 1JW1A 4R2BA 5ET8A 3JZJA 1LBVA 2RKMA 1FQFA 4XEQA 2Y5LA 2ZMBA 3GZGA 1B3FA 3E4RA 2DWJA 3N6UA 1OVBA 4YB6A 4QHQA 1LLSA 4JSDA 4PGNA 4DIGA 4U22A 2Y5KA 3FASA 4NWDA 4OHNA 4GFRA 4NF6B 5I57A 1N04A 2ZYKA 4BDOA 2HZLA 2BJJX 3VV5A 4PQJA 1PB7A 4RPNA 4YKPA 5I58B 3QUJA 1ZJLA 5BUUA 3MVXA 4H67A 2OWTA 4DXBA 3THIA 4F3GA 3PMVA 4MH5A 5F1QA 1FTJA 1KZ8A 2ZYMA 3TFLA 1GTKA 5TP9B 4DI3D 1NFTA 4PBHA 3LC8A 4PFTA 3T96B 4MEVA 3HFUA 1LAXA 3RNNA 3G3HA 3LV0A 2F7BA 2E0SA 4N6PA 3OD7A 4PFYA 3GLBA 2F78A 1FSAA 3RTFB 1ELJA 5B7DA 1UTBB 4EF1A 1NNPA 1EZPA 3RGYA 3B6TA 1GGGA 4ONYA 1FTOA 4R9GA 4U4SA 3V5AA 1Y3NA 5CRYA 2XXUA 5EYHA 2Q88A 4X04A 1EYIA 3FV2A 4O7MA 4I3YA 2QMXA 4YKKA 3PPRA 1SYHA 1YCJA 3W9WA 1AIVA 3BFUA 3OO7A 1BLFA 2NOOA 2RCBA 4WEDA 3VDFA 3MP1A 3QAXA 4OYVA 4GLIA 1D9VA 2LAOA 4G68C 1MM6A 3FXQA 2WYKA 1Q35A 4H0WA 1H44A 2QVRA 5TPAB 4ZEFA 4XTCQ 5EYFA 4BLAA 3KG2A 2AL4A 3IOWA 1PC3A 3ZKKA 2CMOA 3BIGA 4U23A 1IQ7A 1OIBA 1BKAA 1LEVA 5I3SA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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