4L17A

Glua2-l483y-a665c ligand-binding domain in complex with the antagonist dnqx
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKICVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A conformational intermediate in glutamate receptor activation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 77
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence C, E, G
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-06-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4l17A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4l17A02
3MWBA 4OETA 4ND9A 3MW0A 3OO8A 4U2RA 4QSEA 1Z7NE 1B6HA 4GL0A 2FA7A 2UVJA 1AMFA 1UIVA 4F3PA 4KCCA 3CIJA 4C1UA 3T9HB 3JV9A 1ZIUA 3VVDA 4H5FA 4HW8A 3ZS6A 2PMSA 2QMWA 3E9XA 2VOZA 3PMWA 1D3KA 2DQVA 3MC2A 2F7BA 4U4SA 2OBGA 4X48A 2ONRA 1WVJA 1DOTA 4GWOA 1NH7A 2A5TA 4ELQA 2Z8DA 3RQTA 3V5AA 1OLAA 1QUJA 4XKQA 4N13A 4BDQA 3O29A 4EUOA 4HCWA 3HPIA 2WKYA 3B7DA 4LVQA 2CZLA 4NF8A 1F9BA 5CI5A 1B5HA 5B70A 1LCTA 3EPEA 4FEDA 3K2DA 3THIA 2XXYA 3UIFA 3GZGA 4QFLA 2E1SA 1MXYA 3FGSA 1ZLQA 1I6AA 4R73A 1XVXA 3O6IA 1LAHE 2IEEA 3QUFA 3HHGA 4EQ9A 4GLIA 2ONSA 2O7IA 5EHMA 3K1MA 1GTKA 3K1PA 4PFTA 1RYOA 2ALUA 4XXUA 4GOTA 4O3BA 1LSTA 5H8FB 4XKRA 2Y7KA 3C34A 1P1WA 4ZEKA 1JW5A 3LBSA 3VFJA 2OWTA 1FQDA 3M3LA 3TYHA 3FZVA 1B58A 3EHUA 4Z0IA 4LZ5A 1NFTA 3UGWA 1EH3A 4BDLA 4KR5A 3OO6A 3RTFB 1IEJA 3E13X 3IB1A 1VFDA 5M2VA 2O69A 2F78A 3MP1A 5IAIA 1B7UA 3T96B 1H45A 4I9DA 3E3KA 3A3CA 1UTBA 1L5TA 4HCYA 2F36A 4QFKA 4NF4B 5CMBA 5J1DA 1B0LA 5CM6A 4F3SA 1LCFA 3LSLA 1USYH 2H25A 4G77A 1XOCA 1OQHA 1MDP1 3KN8A 3RNNA 3CFXA 4TLLB 5AA1A 2XXTA 3TEPA 4AB6A 5H8QB 3JZJA 1WDNA 3OELA 1PB8A 2XX7A 5I2NA 2Z8EA 2D5WA 2REGA 1H43A 3T9UA 3N94A 4YB6A 1JEUA 2QPQA 1N84A 1YAEA 3EF7A 3TTRA 1Y9UA 1VE4A 1S50A 3KN3A 3CI8A 4OTEA 3T9XB 1QW0A 4R9FA 1BKAA 1SI1A 1B2HA 1M5FA 4TOZA 3H6TA 3PPPA 4QHQA 1S9TA 3SEVA 3D4GA 1B3EA 5CMKA 4G68C 4UACA 4F2OA 4N07A 3OOAA 4GXSB 4H67A 2F5XA 3OEKA 4OESA 5F1QA 4H65A 2HXWA 4JBZA 2RCBA 4RNSA 2QJEA 1B1XA 4EXKA 1YCJA 5CRYA 4OERA 1UTHB 3O66A 2E0SA 3MVYA 4F18A 5EHSA 4BDOA 4K3FA 2O1LA 3TKDA 4MH5A 4F22A 1R1NA 2I4BA 4R6HA 2I48A 3UK4A 2HAVA 4YKPA 1B4HA 3KSJA 5AE4A 1JW1A 3IORA 5FHMA 5BUUA 2ZXTA 3HCQA 5KDTB 1SQYA 5I2KB 1M5CA 4R2BA 3FUZA 4EF1A 1QKAA 4R2FA 4N6PA 2B65A 1R9QA 3OENA 2DE4A 4DXBA 2ZYOA 3TZAA 3HO7A 2RKMA 3BFTA 1HSJA 3PU5A 3IK6B 3U94A 4IY6A 1P1QA 2ZNSA 2ANJA 2Y7WA 2OLBA 2F6PA 4THIA 2D21A 4R6KA 1FQBA 1XC1A 5DTBA 1B3HA 3PPNA 2ZMBA 1A40A 3MBPA 2RF1A 3C31A 3H6WA 4IO4A 5I57B 5AA3A 4ECFA 5A5XA 1FQFA 1NNTA 1SW5A 2DWHA 5F7VA 1MRPA 3TMGA 1MPBA 2UVIA 1POTA 4FEBA 2DWAA 1FQEA 4Q0CA 1XS5A 1LB9A 4ESXA 3LR1A 1TWYA 2DP8A 3R6UA 2V25A 2V3TA 1MY4A 1SBPA 2XX8A 3ECRA 4OYVA 3ZKKA 1R6ZA 4YICA 3VXCA 1DSNA 1II5A 2ZYKA 3FV1A 1OVBA 1M5EA 2PT1A 1Y3NA 4MBPA 5FHOA 4YMBA 2PVUA 3DP4A 5AA4A 1AL3A 1DPPA 2DOJA 3PUYE 2XD3A 1I6BA 3M8UA 2Q88A 3FXRA 3UA8A 1ELJA 3S9LC 3BKIB 3B6TA 3LSWA 4M4GA 2XXQA 1A8FA 3U72A 3M3FA 4QFPA 3GBBA 4PQJA 4GL8A 1URGA 4YB7A 1ZU0A 2XXVA 4FORA 1DPEA 1PBPA 3G7WA 2I3VA 3C9HA 4ZEFA 5H8NA 1B9JA 3ILTB 3MAMA 3VV5A 2YPNA 1JQFA 3S2VA 1ANFA 4LA9A 4KYEA 3MP6A 1FW0A 4G68B 5K2XA 1Y3PA 2GFEA 2PT2A 1ATGA 3TCHA 2HCAA 3FJ7A 4R74A 5ISUA 5TP9A 5DVFA 1QUKA 1SI0A 5DT6A 5AA2B 1A8EA 3O9PA 1MY0A 3Q27A 4RPNA 4KHZE 4JDFA 5CC2A 4EXLA 4PFYA 5I59B 3IX1A 4RK2A 3PD9A 1B52A 3FXQA 2OCUA 4G8HA 2RC7A 1SYHA 4X1BA 1IITA 1MXUA 4ELRA 3KJTA 3QXMA 3RT6B 2OWSA 3TTLA 3M3KA 2UYEA 2PYYA 4U1OA 3TQLA 3PPOA 4GIZA 4LUBA 4P0GA 2VD2A 1BIYA 5TU0A 3W9WA 3K01A 3A3UA 3U1OA 3TTNA 3Q29A 2VD3A 3MZ1A 3N26A 4YU0A 3KOTA 1MDQA 3G3FA 3OD7A 1BTJA 3CFLA 1M5DA 2NWJA 2XXIA 4IGRA 1IXGA 3UN6A 3C4MA 3DP8A 2I6EA 4I8CA 4DCYA 1YTVA 1IIWA 1N7XA 3KEIA 4OFLA 1O64A 4H1XA 4RYAA 1ZJLA 4PFWA 3I3VA 1AH5A 4LONB 4OFJA 3MZBA 2UVHA 1N3WA 2KLFA 1H3DA 2FYIA 2DXYA 3P7IA 4OEUA 3MUQA 4RXLA 1LB8A 3T22A 3N6TA 1MQIA 5H8HB 3O2AA 1A7LA 1B5IA 3R7XA 3CVGA 3RY3A 1P99A 3B6QA 4F39A 2I0CA 5KCJA 3MZ9A 1MY1A 3QIMA 1LAGE 3K6XA 4U23A 2DXRA 2NUVA 3CFZA 4LQ2A 4EF2A 3F11A 4NE4A 2XX9A 1JEVA 1M5BA 1LFGA 5I58B 3RUMA 1A99A 1NMUA 4LZ8A 4L17A 4H8IA 2G93A 4NEDA 4QRZA 4KQPA 3D4CA 2XXPA 4GD5A 4QF9A 3EHSA 5HM4B 1H44A 3CSBA 4HS7A 1LBBA 3MPKA 1OLCA 1MXVA 4FJPA 3PUVE 3I6VA 1POY1 4H8JA 4OQOA 3RLFE 4POXA 3IAZA 4PE5B 1P1NA 3U8QA 4IO3A 3Q28A 3H7MA 3TQWA 5DEXA 3FJMA 1D9VA 3QUJA 4IY5A 1SYIA 4Q8RA 4Q5TA 1S7YA 2XD2A 3O97A 2X7PA 3C36A 4TQUQ 3SDFA 2F34A 3KSXA 4EQ7A 1GVCA 4OENA 4RY1A 3ZKLA 4FATA 3TUSA 5DVIA 1R9LA 3T93B 4NF8B 3VLUA 3HSTA 2XXWA 2F8DA 5KDTA 4P0IA 1GGGA 1VSOA 3K6WA 1Z7ME 2Q89A 2RCAA 4DCXA 3R26A 2DSFA 2UVGA 4BDMA 4I1DA 2I4CA 4MFIA 1N76A 2HFBA 4XTCQ 2Z23A 4G4PA 4NWCA 3SESA 2QRYA 3K4UA 3KJ7A 1N7WA 3L6GA 1B3FA 4NF6A 1XHYA 1QUIA 3KFMA 2Q2AA 4HTGA 4JWOA 4ESWA 2Y84A 2FNCA 5I56A 1PDAA 5ICTA 4NF5A 4OMBA 3VVEA 3IB2A 1I69A 3N6UA 2DYXA 3QK6A 1SVXB 2Q9TA 4EDPA 3TELA 4ZE9A 5JTYA 1EZPA 4ISUA 3RPWA 2O7UA 1Y1MA 2OK2A 4E0XA 3SEWA 3WAEA 1B32A 2H4IA 3VLVA 1NNFA 5KZTA 3KBRA 4F29A 3EQ1A 4MLVA 3FVNA 4KYDA 3SEUA 3Q25A 1UTBB 3V89B 3C35A 1B05A 4JWYA 4TLMB 2X7QA 2DS9A 4F3GA 2H98A 3C33A 3HN0A 3KOSA 3MQ9A 1B5JA 4U21A 3FVOA 4PFUA 5K2YA 2HEUA 3VLWA 2DVCA 3IOWA 1URDA 3W9VA 3MVZA 4ZECA 1JW4A 2ZNTA 1MPCA 1PEBA 1GR2A 4NMYA 1LGBC 3BBRA 4DIGA 2PX1A 1LAFE 2M8CA 4U1ZA 1NNKA 3BFUA 3ODBA 3FD3A 1EZOA 4IO7A 5I2NB 5TPAB 4ZDMA 2A5SA 1FCKA 1B4ZA 2XXRA 2RC8A 5L9SA 2AL5A 3I5OA 3WAFA 2HZLA 3H03A 3HV1A 4XKNA 3OMBA 1TXFA 2AYSA 3RGYA 2V3UA 3DM0A 5CMMA 4ZEBA 4OFOA 1Y3QA 2XXHA 4F19A 2QSXA 1N0TA 2UYFA 1JVYA 5ITOA 1KWHA 3FJGA 4OEVA 3S9MC 3PMVA 4Q30B 1DMBA 3H3GA 3S9NC 3VE1B 3PV0E 3DLNA 4POWA 4YZZA 1NKXA 1JVXA 4YKJA 3KG2A 4O3CA 2XHDA 4NTLA 4QSDA 2O68A 1DTGA 3IB0A 2YLNA 4YKKA 4U22A 1MXWA 1SD3A 1PBQA 2BJJX 1B51A 3OXNA 5CBSA 2W7YA 4FIMA 4OHNA 1Q35A 2DE3A 4R75A 1OMPA 3T9VA 3FASA 3IJXB 4MLQA 4H6DA 1UIUA 3SEYA 1IUDA 5FHNA 1LBCA 1UQWA 2V3QA 1B1HA 4DE8A 3CR9A 1JNFA 1TT1A 1MM7A 2RINA 2V84A 4G8NA 1RYXA 3RTWB 4ZS9A 5ITPA 1MXXA 1B7ZA 1B0HA 4H5GA 1CE2A 4R6YA 2P2AA 3GLBA 3T66A 2F35A 1EZ9A 3KZGA 5A5XB 1XT8A 4H0WA 2R9JA 1B3GA 5H8HA 2GHAA 1MQHA 1QKBA 4FAJA 2D3IA 3PUXE 2IA4A 4C0RA 1SW1A 4ZEDA 1D9YA 1Y20A 2ZYNA 4BDRA 4YKIA 1H76A 4ELOA 2RC9A 4GF8A 4P11A 1TFAA 3MPLA 1FTLA 1MS7A 4LZ7A 1IQ7A 3CG1A 3ILUB 4YAHX 2ZYMA 3SERA 5I58A 2NVUB 5FTHA 1O63A 5H8FA 3QYTA 4WXJA 3RT8A 1MY2A 1EU8A 1PB7A 1IXHA 3TFLA 3K0VA 1ZTYA 1MH4A 2Z22A 3DELB 2DWJA 5DYHA 4KPTA 1CB6A 3TTMA 5CBRA 5AA4B 2VHAA 1SW4A 1US4A 3K00A 3FVKA 1MQDA 2AL4A 2I3WA 3OO9A 2F7AA 4O3AA 5LOMA 4IGTA 4LATA 3EHTA 1QULA 5ELVA 4NF4A 3USDA 4F2QA 4WEPA 1OVTA 1BP5A 5BWJA 3FV2A 1MM6A 4XKPA 5H8NB 3A09A 3GBAA 1PB9A 4Z7EA 3U92A 2I0BA 4FE8A 2VP1A 5I84A 1IXIA 3G3KA 1N04A 4F31B 4ZE8A 4OXVA 1FQAA 5H8QA 3TPAA 4JSDA 4R9GA 1I6QA 3S9EA 4AQ4A 4KYSA 5TP9B 4F1VA 1LFIA 3IO4A 2QMXA 4GRKA 5L9MA 2ESNA 4IO6A 4ZZEA 3TTKA 1Y4TA 2QS2A 2Y7IA 3PPRA 2THIA 4ONYA 4RK9A 4BDNA 3G3HA 2GRVA 4M1VA 3VVFA 4G8MA 1MY3A 4U4XA 4RA1A 2AIXA 2HQ0A 3GXAA 1MG1A 4RPOA 3CSGA 1SDXA 2ZNUA 1Y1ZA 1D4NA 2OJTA 3OSRA 3K6VA 1BLFA 2Q2CA 4KFQA 4OWDA 3UP9A 3FXUA 3LC8A 1Y4CA 1FTMA 2ONKE 3TAJA 4OVJA 2V93A 5HPQA 1B3LA 2A5TB 3TCFA 1UTHA 3EN3A 1GV8A 3JYRA 4BLAA 4IO5A 5L9OA 5IKBA 1VFEA 1USYE 3PUWE 5B7DA 1A55A 4DLDA 1JETA 3TCGA 4KCDA 4ZZAA 3FIRA 3H4ZA 2LAOA 4JXIA 2F97A 2O84X 5I2KA 2R6GE 3LSFB 1DTZA 1LAXA 4F1YA 1OQGA 3G3JA 1HSLA 4R72A 3W15C 2NXOA 1SW2A 1US5A 1MPDA 2O6AA 4JSOA 3IOVA 3KN7A 1FQCA 3KGCA 5KCJB 3IOUA 4YMAA 4IO2A 2HAUA 1FTOA 2R71A 5I57A 5TPAA 3UORA 1HSEA 1URSA 4XIGQ 3OO7A 1T0KA 1ZKBA 2Y7PA 3QSLA 5H8SA 2NOOA 3ONMA 1AIVA 3ZSFA 3FATA 3MVWA 2GHBA 4GQOA 4I62A 3C32A 2PBWA 3MVXA 1QJMA 5AA2D 3L6HA 2QS1A 4FECA 2QS3A 2F7CA 2QL3A 3B6WA 2DE2A 3SETA 4IB2A 2I49A 2ABHA 3O6GA 3OSQA 3IL1B 2H99A 5JK4A 1WODA 3IOTA 3O28A 5DEXB 4YB5A 4DDDA 5HBCA 1MXZA 3CRBA 2XXXA 4EQBA 3IJOB 2UXAA 5FTIA 5L8DA 1J1NA 3SKPA 1P1OA 3PUZE 4GXAA 3E4RA 1B40A 4KI0E 3QAXA 3O6HA 2Q8JA 2X26A 3FVGA 4JB7A 2F6GA 3MJNA 4PP0A 1NNPA 2CMOA 4PETA 2I58A 4GFRA 4G2ZA 5DVJA 1A54A 4OZ9A 4QSCA 4DZ1A 1LLSA 3HHFA 4G68A 4KD5A 3H6UA 4NF6B 4E0WA 2O51A 2DWIA 1YPNA 5I56B 4NF5B 1IZ1A 2Z8FA 3V83A 4LQ5A 4GVOA 2B3FA 2GH9A 4LP2B 3U93A 5AA2A 5JEIA 4WKMA 2DVZA 1FTKA 5CMCA 1P1UA 4QFOA 4UA8A 5I59A 1B7HA 2HZKA 5JTYB 3MP8A 3PD8A 3RN8A 1LFHA 3VXBA 1VR5A 1Q1KA 2QS4A 3Q26A 1QVSA 3OEMA 2REJA 3IR1A 3LUYA 1XVYA 2OZZA 2XXUA 4QFNA 3PPQA 2O1MA 3N5LA 1NL5A 3K6UA 4JWXA 4AB5A 3S4UA 2H9BA 1O7TA 1ZMGA 1MH3A 1NH8A 2G29A 3PGFA 1TFDA 3VDFA 3SEXA 2H5YA 2P0SA 2B3BA 3G3IA 2VGQA 3DP6A 4X1DA 1AOVA 5EYFA 2YJPA 4F3BA 3PMXA 3G3GA 1ZBMA 4ZEIA 4F1UA 3H06B 1PC3A 4DXCA 3CG3A 3LSXA 3IO6A 3TODA 4NWDA 4C1TA 3K1NA 1RKMA 3TDJA 3K02A 3H6VA 4MF3A 4RJZA 4WEDA 2Y7RA 3V8XB 1MQGA 5ICQA 1MQJA 1B46A 4X9TA 4ELPA 1IXCA 1FTJA 3AXFA 1N3XA 4DXUA 1OIBA 2P1SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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