4L17A

Glua2-l483y-a665c ligand-binding domain in complex with the antagonist dnqx
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKICVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A conformational intermediate in glutamate receptor activation.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 77
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence C, E, G
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-06-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4l17A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4l17A02
4NMYA 2DWAA 3G3JA 3I5OA 3PUYE 2REGA 5TP9A 1VE4A 1Y9UA 2Y7PA 4O3CA 4JSOA 5AA1A 4OQOA 3T9HB 3KGCA 4H8JA 3DP8A 3I3VA 3L6HA 4BDNA 3IX1A 1B05A 1ELJA 2ALUA 5BWJA 1A40A 2UYEA 3KG2A 1MRPA 4P0GA 4KYEA 1O64A 4NF4A 1YTVA 4AB5A 5KCJB 3C4MA 3C33A 3FXQA 3EQ1A 4OENA 4FECA 1B0LA 1FQCA 5HBCA 2PVUA 1RKMA 1BKAA 3ZKLA 2KLFA 4RYAA 2ONKE 5CMBA 1B9JA 2H9BA 3T9XB 3PPPA 4E0XA 3CI8A 1URGA 3FGSA 1FCKA 2O1MA 4LUBA 4IO7A 2VD3A 1WVJA 1JQFA 1TFDA 5KZTA 1NNKA 2I3VA 1QUKA 4U22A 4E0WA 4GL0A 2XXHA 4G8HA 3TCFA 3QUFA 5H8QB 2HZLA 2XX7A 4MLVA 2XXPA 5K2XA 1B0HA 1MPCA 1MXVA 3OO7A 3G3KA 3IOTA 1XOCA 1LFGA 2I49A 4ZS9A 3MBPA 1LAFE 4F2OA 4OWDA 1P1UA 3M3KA 3TTMA 4RK9A 1VR5A 3LSFB 2ABHA 4QSDA 3PD8A 5DVIA 4PP0A 1AL3A 3TTKA 3UGWA 4ISUA 5L8DA 4PFTA 1Z7ME 1B4HA 2Y7IA 2NUVA 1LFIA 5HPQA 3T66A 3KN7A 3UP9A 2O7IA 5H8HA 4IO2A 2PX1A 3MZ9A 1FQAA 3TQWA 3LSXA 3TEPA 1MXWA 5AA2A 4DXBA 1B3HA 2A5SA 3G3HA 4R6YA 5CI5A 3RLFE 3RN8A 1OQHA 2QMWA 3KBRA 3B6TA 4KFQA 1A8EA 1A99A 4FAJA 2ZNSA 4I62A 3ILTB 3OO9A 5TP9B 4G68A 2OCUA 3Q29A 1ZJLA 2F97A 2H98A 1Y1ZA 2I6EA 3VXBA 4GXSB 2UVJA 4JWXA 4NF4B 4LVQA 1FTMA 2R6GE 2DE4A 3MUQA 2QS2A 2V25A 5I56A 3IOUA 4KI0E 1KWHA 3G3FA 1LB8A 4YKIA 2V3UA 4OEVA 4FJPA 4NEDA 4UACA 4DXCA 4N13A 2ONRA 2D3IA 3M3FA 1XC1A 3KSXA 4ZE9A 1POTA 3MVYA 4YB7A 4KYDA 1B40A 3R26A 1USYE 4F3BA 1DMBA 1MY2A 3K00A 1QULA 4GVOA 4NF5A 5J1DA 5IAIA 4LZ5A 3IAZA 4GWOA 3CG3A 4H67A 1M5CA 3B6QA 3RY3A 5FHOA 3OOAA 2XXTA 4DZ1A 4FIMA 1B3FA 4YKJA 2DVCA 1RYXA 3PPOA 2CZLA 2YLNA 3MP8A 1B3LA 3C34A 4GLIA 1IXIA 1R9QA 1H45A 3HV1A 3FVKA 4F3SA 3IJXB 2XXXA 1EH3A 1I69A 2PMSA 1IXCA 2A5TA 2RC8A 4JB7A 3AXFA 4JSDA 3F11A 2Q2CA 3E3KA 3T9UA 2HAUA 1DPEA 4WKMA 4RNSA 1Y20A 5H8HB 2AIXA 1R6ZA 3MWBA 4FE8A 3K1PA 3PD9A 1H44A 2GHAA 1I6AA 4BDOA 4ZEBA 3T9VA 5AA2B 2VHAA 4F18A 2DQVA 4KQPA 4EQ7A 2PBWA 2X26A 3CG1A 4F39A 2ZYMA 2F8DA 3KOTA 4MH5A 2E0SA 1NH8A 1MQIA 3RPWA 4R74A 4OTEA 3O6IA 4QF9A 4MBPA 4GQOA 2H99A 3THIA 1LCTA 1NNTA 4X48A 5ITPA 3H06B 1SBPA 1SD3A 4HW8A 3TAJA 1Z7NE 2H4IA 4F29A 5TU0A 3TCGA 4G8MA 1JW4A 2P0SA 3MW0A 4F1YA 3IOWA 4ZDMA 2F6PA 4OESA 1A54A 2DE2A 3E9XA 4IGRA 3CSGA 3K4UA 2V84A 2HFBA 1PB9A 3PUWE 1JEUA 3DP6A 4OFJA 2D5WA 1N3WA 1NL5A 1FTJA 5AA3A 2QS3A 3LBSA 4H1XA 3K6VA 1QW0A 3V89B 3UIFA 1PEBA 5H8SA 4NF5B 4ESXA 4WEPA 4EUOA 1AOVA 4QHQA 4GL8A 2WKYA 3EHUA 3KFMA 3OELA 1LGBC 1MG1A 3IORA 4POXA 5CBRA 3FD3A 1QUIA 4PFWA 3K6WA 1GTKA 2THIA 1I6QA 1YAEA 1NNFA 2XXQA 1JNFA 2F7AA 1B7UA 2M8CA 3WAFA 3RTFB 4OFOA 4XKPA 5ICTA 1GR2A 3V5AA 2E1SA 3PGFA 4OERA 2A5TB 2CMOA 4PFYA 2F36A 1P1QA 3WAEA 2ZNUA 2ZYKA 1IXHA 4DDDA 2B3BA 4YKKA 3K02A 3OEMA 4DCXA 3W9VA 2OBGA 4EQBA 1N84A 4Q30B 3LUYA 3FVOA 3FV1A 4I8CA 2DWHA 1FQFA 1M5BA 1SQYA 3TZAA 2RCBA 1NNPA 1Y4TA 2Y84A 2ZMBA 1LAHE 3EHSA 1I6BA 3M3LA 2ZYNA 1WDNA 4RK2A 1BLFA 2NOOA 4OFLA 5I84A 1UTBA 2YPNA 3DM0A 3IK6B 3VE1B 4NWDA 3EN3A 4F2QA 3GXAA 4ZZEA 1PC3A 1B51A 4H0WA 1L5TA 2Q9TA 1JW1A 4RA1A 4LA9A 4OHNA 2UVGA 2DE3A 4BDLA 4YICA 4YMBA 4AB6A 3O97A 2DOJA 4AQ4A 1SW1A 4ND9A 3Q26A 1PB7A 3FASA 4YU0A 3K01A 5EHSA 3HCQA 5AA2D 4F19A 2IA4A 5AA4A 1LCFA 1XS5A 2Q89A 1URDA 2RF1A 3A09A 3KN3A 4LZ8A 1OVBA 5H8NA 1A7LA 3JZJA 3O6GA 3H6UA 5ELVA 2ESNA 1HSJA 3O6HA 2R71A 2GHBA 1UIVA 1MXUA 3C36A 4H5FA 5I57A 2PT1A 3N6TA 3D4GA 4P11A 2G93A 5I58A 2H5YA 1TT1A 3SEYA 1PDAA 2I3WA 1B1XA 1N7WA 3T22A 4O3BA 1LSTA 5A5XA 3CFZA 3LR1A 1NH7A 3O29A 5H8FA 4F22A 2HEUA 3TELA 3QYTA 2XX8A 4KCCA 3RGYA 1UIUA 3A3CA 4UA8A 2DYXA 2X7PA 2GFEA 4QFPA 3HHFA 3Q25A 2F7CA 1MPBA 4NF8A 1QJMA 5DVJA 3N94A 1URSA 4H5GA 3RT6B 4OYVA 4WEDA 1H3DA 1O7TA 3K0VA 4FEDA 4HTGA 3C31A 4K3FA 4DXUA 5EYFA 3QSLA 4RPOA 1HSEA 1HSLA 3CIJA 3S2VA 3Q27A 4ZEFA 5BUUA 2HZKA 2F78A 2FNCA 3RTWB 4ZZAA 3ZSFA 1Y3PA 1B5IA 2AL4A 1ZIUA 1SI1A 3T96B 2NWJA 2OWSA 2O69A 4YZZA 2RC7A 2Z8DA 3TFLA 1B52A 3SEWA 2DVZA 2HXWA 4OVJA 1FTLA 1H76A 4R9GA 4MFIA 1MY4A 4Q5TA 3IB1A 4LQ2A 3VVEA 3S9NC 5F1QA 3IB2A 3K2DA 4JXIA 3H7MA 2I0CA 4EXLA 1H43A 2XXWA 4QRZA 3S9LC 4YKPA 1DOTA 1EZPA 3PPNA 4ELPA 2DXYA 3IB0A 3CRBA 1MQJA 2Q88A 4JWOA 4FATA 2DXRA 1AH5A 4G77A 5AA4B 3SERA 4U4SA 4XIGQ 2Q2AA 4KD5A 1UQWA 4ZEKA 5CM6A 5H8NB 4L17A 1A8FA 1MQDA 4KHZE 3N26A 2O84X 4PETA 4ZEDA 3V83A 3CFXA 3OMBA 3OSQA 4LATA 3E4RA 1DSNA 3DP4A 5I2NA 4DE8A 1RYOA 1XVXA 1M5EA 3PU5A 5CMMA 1N76A 4GD5A 4YB5A 3FZVA 5I57B 1OQGA 4R75A 1SW2A 3KEIA 2PYYA 2V3TA 3FIRA 3KJ7A 4H8IA 4U4XA 4M4GA 5A5XB 2XXUA 3HSTA 1XT8A 2FA7A 1MXYA 5H8FB 1MXZA 2XD2A 3P7IA 4U21A 1SYIA 4EF1A 4U23A 2GRVA 3FXUA 1FQDA 3SEUA 1FTOA 2D21A 3QIMA 4NF8B 1M5FA 2P1SA 2AYSA 1QKBA 2Z22A 4NWCA 5EHMA 3EPEA 4G4PA 3QAXA 3CR9A 4H65A 4FEBA 3V8XB 1TFAA 3TTNA 3W15C 3C35A 2DWIA 4TLMB 1B46A 1MH3A 4EDPA 4R2BA 2O1LA 1O63A 3O66A 3TODA 1PBQA 3ONMA 4JBZA 3MP1A 3PUZE 3HPIA 3H4ZA 2XXIA 2VD2A 2FYIA 4TLLB 2Y7RA 2W7YA 3UA8A 3SEVA 4QFLA 5CMCA 1IITA 1D3KA 3TKDA 4G68B 4BDRA 5CRYA 2R9JA 4POWA 3ZKKA 2DSFA 3S9EA 1MDP1 2QL3A 4NF6A 3OD7A 3OO6A 4JWYA 2O68A 3MVWA 1ZMGA 1JETA 3OEKA 4X1DA 3K6UA 3TYHA 1JVXA 3SEXA 3IJOB 1GV8A 3PMVA 4YAHX 5I56B 1ZTYA 4OETA 3HHGA 4XKNA 2I48A 3TTLA 5HM4B 4X1BA 3U72A 3MJNA 3TTRA 4EF2A 3KOSA 3MQ9A 2Q8JA 1BIYA 3FJ7A 1US5A 5KDTA 3MPLA 4PQJA 5FHNA 1AMFA 1IUDA 3O2AA 4I9DA 5I2NB 1MDQA 3T93B 3H3GA 2Y7WA 1XVYA 4GRKA 5F7VA 2UVIA 3D4CA 3K1NA 3ZS6A 4DIGA 3IO6A 2DP8A 3K1MA 4C1TA 5L9MA 3VVDA 4YB6A 1B5HA 3GLBA 1XHYA 2HQ0A 3LSLA 1ZKBA 4ZEIA 4IO3A 3FVGA 1QKAA 3B6WA 3ODBA 3QUJA 2DWJA 4XKRA 3JYRA 1LLSA 1N7XA 2B3FA 3HO7A 3M8UA 1F9BA 2LAOA 3H6VA 3JV9A 3PMXA 3OSRA 3GBBA 5K2YA 1QVSA 1SI0A 1OVTA 1DTZA 3U94A 3MVZA 1Y4CA 4OXVA 5TPAA 2OJTA 1OIBA 3W9WA 1JW5A 5ICQA 4Q0CA 3G7WA 3MC2A 2Y7KA 1TWYA 3KSJA 2ZYOA 3FJGA 3MAMA 3PPQA 4JDFA 4NF6B 3FVNA 3UK4A 5B7DA 1SW5A 1S9TA 1FTKA 1LAXA 3O28A 3U93A 4EXKA 2Z8EA 3CSBA 2IEEA 1PB8A 4ELOA 1JEVA 3Q28A 1M5DA 4Q8RA 3EF7A 1NMUA 4R73A 4RPNA 2BJJX 4I1DA 1GGGA 1LAGE 5FTIA 3ILUB 4IO6A 1ZLQA 1LBBA 5KDTB 1D9VA 2V93A 2VP1A 4N6PA 3EHTA 3VVFA 2Z23A 1P1WA 4U2RA 2QMXA 5FTHA 3IOVA 1YCJA 3SESA 4IO5A 1MM7A 3BFUA 2NVUB 3VLUA 1MY0A 4O3AA 3PPRA 1B1HA 3VLWA 2OLBA 1IIWA 3H6WA 5CBSA 2HCAA 4GIZA 4F1VA 3L6GA 4OMBA 5JTYA 2V3QA 4OEUA 4KCDA 4HCWA 4RXLA 3BBRA 1SYHA 4LONB 3H03A 1QUJA 5JK4A 2ZNTA 2QSXA 3GBAA 3OO8A 3MP6A 1VFEA 3S9MC 1II5A 1MY1A 5IKBA 3FUZA 1B6HA 3BKIB 1FQBA 1B32A 4R9FA 2F34A 3TCHA 3U1OA 1IEJA 3QK6A 2YJPA 1IXGA 3PUXE 4ONYA 1S50A 1B3GA 5I2KA 2O51A 1CB6A 4RY1A 1B5JA 1B58A 2HAVA 3FV2A 1JVYA 4GOTA 4LZ7A 5ITOA 3VV5A 1IQ7A 5TPAB 4R6HA 1FQEA 2VGQA 2F35A 1LBCA 1NKXA 1R1NA 3TUSA 4TQUQ 4N07A 3VLVA 3C32A 3U8QA 1UTBB 4Z0IA 4R6KA 2RC9A 3CFLA 1ZBMA 1FW0A 1ANFA 4ELQA 2NXOA 4DLDA 1US4A 2H25A 1B7ZA 5L9SA 2QS4A 3N5LA 4R2FA 1A55A 3MZBA 4U1ZA 3QXMA 4WXJA 2QS1A 2XX9A 2OWTA 4G68C 1Y3NA 2OK2A 5DEXA 2RINA 3RUMA 2RKMA 4HS7A 3USDA 5LOMA 1DPPA 4ECFA 5DYHA 3HN0A 3IO4A 1CE2A 2I58A 1USYH 2DS9A 2ZXTA 4C0RA 2RCAA 4F3GA 3R6UA 2ANJA 3IL1B 3SDFA 5AE4A 1D9YA 2ONSA 4IY5A 1S7YA 1MS7A 4F31B 3LSWA 3PUVE 3N6UA 3MZ1A 5JTYB 2X7QA 3RT8A 5I58B 1VFDA 3G3GA 4QFNA 5JEIA 4IY6A 4U1OA 1BP5A 2VOZA 1BTJA 4OZ9A 2O6AA 1SVXB 1MY3A 4ZECA 1DTGA 1EU8A 4THIA 1LB9A 4XTCQ 4X9TA 4DCYA 5DT6A 2F6GA 3TPAA 4XXUA 4BDMA 1OMPA 4BDQA 4QFOA 2AL5A 1ZU0A 1P1NA 2UYFA 5I59A 4XKQA 2B65A 3I6VA 4M1VA 2XD3A 3KN8A 2P2AA 5I2KB 4QSCA 4LP2B 4ESWA 1B3EA 4KYSA 3FJMA 3VFJA 3CVGA 3DELB 1PBPA 3IR1A 4RJZA 4HCYA 1N04A 4G2ZA 3VXCA 1UTHA 1AIVA 3DLNA 1Q1KA 1SDXA 3A3UA 3RNNA 3O9PA 3PMWA 4FORA 3K6XA 1SW4A 3C9HA 1POY1 4IB2A 2QPQA 3UN6A 3OENA 3B7DA 3BFTA 2REJA 2XXRA 5L9OA 3KJTA 2GH9A 2XHDA 4GF8A 4BLAA 4NTLA 1LFHA 4PE5B 4ZE8A 1Y1MA 4R72A 4KR5A 5DEXB 1TXFA 4EQ9A 3TMGA 1N0TA 1J1NA 2UVHA 1MH4A 5FHMA 3RQTA 5KCJA 1B7HA 4IO4A 3LC8A 3SETA 1VSOA 1NFTA 4YMAA 1B2HA 3MVXA 4TOZA 5DVFA 4ELRA 3PV0E 4C1UA 2I0BA 3MPKA 4G8NA 3UORA 4IGTA 5ISUA 4P0IA 1EZOA 1Y3QA 2F7BA 4Z7EA 1N3XA 3R7XA 5H8QA 2Z8FA 1MQHA 4MLQA 3FATA 3GZGA 1IZ1A 3KZGA 3SKPA 1YPNA 4NE4A 5M2VA 1D4NA 4MF3A 1WODA 3G3IA 2QRYA 4PFUA 3TQLA 1OLCA 5CMKA 1Q35A 1MXXA 4F1UA 4F3PA 1B4ZA 1GVCA 1MPDA 3VDFA 4LQ5A 3S4UA 5DTBA 2QJEA 5I59B 2I4CA 3FXRA 1MQGA 1EZ9A 1P99A 3E13X 2OZZA 3ECRA 2O7UA 4GFRA 3U92A 1ATGA 1P1OA 5B70A 3H6TA 2UXAA 2I4BA 1OLAA 4KPTA 4QSEA 3OXNA 2PT2A 2XXYA 4H6DA 1UTHB 2F5XA 2G29A 1MM6A 1R9LA 4QFKA 5CC2A 4GXAA 1T0KA 2XXVA 3TDJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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3TEPA 1MXWA 5AA2A 4DXBA 1B3HA 2A5SA 3G3HA 4R6YA 4GWXA 3ROJA 5CI5A 4PAFA 3RLFE 3RN8A 1OQHA 2CZIA 2QMWA 3KBRA 3B6TA 4KFQA 1A8EA 1A99A 4FAJA 2ZNSA 4I62A 3ILTB 4GWZA 3OO9A 5TP9B 4PDDA 2WYPA 4G68A 2OCUA 3Q29A 1ZJLA 2OWZA 1LBWA 2F97A 2H98A 1Y1ZA 2I6EA 3VXBA 1FPKA 4GXSB 2UVJA 4MNCA 4JWXA 1FPGA 4NF4B 4LVQA 1FTMA 2R6GE 2DE4A 3MUQA 2QS2A 2V25A 5I56A 2QVVA 3IOUA 4MNIA 4KI0E 1KWHA 3G3FA 4P1EA 1LB8A 4YKIA 2V3UA 4OEVA 4FJPA 4NEDA 3E78A 4UACA 4DXCA 4N13A 2ONRA 2D3IA 3M3FA 1XC1A 3KSXA 4ZE9A 1POTA 3MVYA 4YB7A 4KYDA 1B40A 3R26A 5ESYA 3T1BA 1FPFA 1USYE 4XF5A 4F3BA 4MJOA 1DMBA 1MY2A 3K00A 1QULA 4GVOA 4NF5A 5J1DA 5IAIA 4LZ5A 3IAZA 1IMBA 4GWOA 3CG3A 1SPIA 4H67A 1M5CA 3B6QA 3RY3A 5FHOA 3OOAA 2XXTA 4DZ1A 4FIMA 1B3FA 4YKJA 2DVCA 1RYXA 3PPOA 2CZLA 2YLNA 3MP8A 1B3LA 3C34A 4GLIA 1IXIA 1K9YA 4I3EA 1R9QA 5F24A 1H45A 3HV1A 3FVKA 4F3SA 1NV4A 3IJXB 4XEQA 2XXXA 1EH3A 1I69A 2PMSA 1IXCA 2A5TA 2RC8A 4JB7A 3AXFA 4JSDA 3F11A 2Q2CA 3E3KA 3T9UA 2HAUA 1DPEA 4WKMA 4RNSA 1Y20A 5H8HB 3IFCA 2AIXA 1R6ZA 3MWBA 4FE8A 2L5VA 3K1PA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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