4L17A

Glua2-l483y-a665c ligand-binding domain in complex with the antagonist dnqx
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKICVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A conformational intermediate in glutamate receptor activation.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 77
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence C, E, G
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-06-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4l17A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4l17A02
4MH5A 4RK2A 4GXAA 1FQBA 4N13A 3MUQA 5KDTA 4KYSA 1D9VA 3T22A 3RTFB 3SESA 4LA9A 1LB8A 1JEUA 3LR1A 3WAFA 1P1OA 3HHFA 1B7UA 4JSOA 5AA2D 3N5LA 3RGYA 5BUUA 3HO7A 1OQGA 5ITOA 4HCWA 3UN6A 3RNNA 4L17A 4MLQA 3U92A 3ZSFA 1Z7ME 1LGBC 2ESNA 3MC2A 4YICA 4JB7A 3LSXA 1Y3QA 1YTVA 1I6AA 1PBQA 2RF1A 3IOTA 1EU8A 1RKMA 1NNFA 2PVUA 2Y7KA 3GXAA 3EHTA 4KD5A 4C1UA 1EZOA 3BFUA 4JBZA 2F8DA 4M4GA 4OETA 3HCQA 4U21A 4EQBA 1IUDA 2OCUA 1ZLQA 3BFTA 4FIMA 4GLIA 1MRPA 1N84A 5EHSA 1N3WA 3MJNA 3Q28A 2RKMA 3CG1A 4DCXA 1MPDA 4F39A 4FAJA 1LFHA 2Y7PA 4LZ7A 3RTWB 1OLCA 5HM4B 1ZKBA 3FXRA 3SEUA 3B7DA 1SQYA 1PB9A 1SW2A 2GFEA 4FECA 1S50A 2Z8EA 4F22A 3VVDA 4F1UA 2F78A 3TQLA 4ND9A 4BDNA 2DWAA 3WAEA 3PUZE 2Z22A 1XVYA 1L5TA 5CI5A 3RY3A 1AH5A 1MH3A 2REJA 4IO7A 1B3FA 1HSLA 1WODA 4IY5A 3SETA 4DIGA 4R73A 5FHOA 1R9LA 3K1MA 1UTHA 3I6VA 3OO7A 4POXA 4ZE8A 2OK2A 3FV1A 3T66A 4HCYA 1JW5A 1VR5A 3K6WA 2O68A 1N7WA 1B32A 3V8XB 1GTKA 1LSTA 2V93A 2YJPA 4OQOA 1UIUA 5I2NA 5JEIA 2DWIA 4R2BA 1OMPA 3OXNA 5FHMA 3W15C 5I58B 2D5WA 1DPPA 4JDFA 3KN8A 3RLFE 3I5OA 2F5XA 3EHUA 1AMFA 3VVFA 1IXIA 1B4HA 1URDA 3QXMA 2B3BA 2OJTA 3RN8A 2THIA 5KZTA 4K3FA 1N0TA 3THIA 2F36A 3KJTA 4OFJA 1JEVA 1TFDA 3A09A 3KJ7A 4H8JA 2KLFA 1N3XA 3TTMA 1Y4CA 4UACA 4Q0CA 4BDRA 3O97A 2QS3A 4F2QA 4MBPA 5HBCA 4G68C 5H8FA 3TEPA 3Q26A 4X1BA 4KYEA 5DYHA 1SI0A 2XXRA 1MPBA 1FW0A 4H65A 3S2VA 2HXWA 1SBPA 4M1VA 4E0WA 2XX9A 3IORA 1A55A 1Q35A 3CG3A 4R9FA 2Q89A 3G3IA 1B05A 5J1DA 2CZLA 3C33A 1ELJA 3TMGA 1MY2A 3KSXA 3U1OA 1TT1A 3PV0E 4Z7EA 1Y3PA 2RCAA 2I0BA 1AOVA 3Q25A 3QAXA 2UXAA 2F7BA 1M5CA 3TQWA 3G3JA 5CM6A 2Q2AA 5IKBA 5CRYA 4F3BA 3IO4A 3HPIA 1B1HA 4TOZA 3OO6A 3U72A 2ZNTA 4KFQA 4YAHX 1D9YA 1SYHA 1US5A 2Y84A 2W7YA 4GXSB 4ZEIA 1B58A 2HAUA 4G2ZA 2DWJA 2QL3A 4LQ5A 3KFMA 2V3UA 5DEXB 2D3IA 1LBBA 1FTLA 2F97A 1USYE 2RC8A 2E0SA 1I6QA 3N6TA 3PD9A 2QSXA 1H76A 5H8FB 2ZYOA 4PFYA 3SEWA 3GBAA 3MW0A 3MZ1A 1ZBMA 2ONKE 2RCBA 2NVUB 5CMBA 3UA8A 2DYXA 1R6ZA 2H5YA 1N7XA 3LUYA 1B3HA 1Y9UA 3RQTA 3HHGA 3JYRA 4DLDA 3S9EA 4R9GA 3EF7A 4KI0E 2XX7A 5FTHA 3FVOA 1QJMA 3GZGA 5ICQA 1Z7NE 4YB7A 1B46A 1ZIUA 4ONYA 3HSTA 3LSFB 3EN3A 3VXCA 4EQ7A 4F3GA 5A5XA 5TU0A 2OWTA 4QFPA 1US4A 2FNCA 3M3FA 5M2VA 1P1WA 2RINA 3TTKA 4QSEA 4KR5A 1IZ1A 1P1NA 1QUIA 2XXPA 3USDA 4YB6A 4PP0A 3EHSA 5H8HA 1MDQA 1MS7A 2DXRA 2DSFA 1Q1KA 3PMVA 3QUJA 2Q8JA 2HZLA 3K0VA 4MFIA 1AL3A 3DP8A 1XC1A 1I69A 1SD3A 5KDTB 2QMWA 4IGRA 2XD2A 3M8UA 4OERA 2QS1A 2ZYKA 4MF3A 5CMCA 4Q30B 3PUWE 5IAIA 2REGA 3JZJA 1PC3A 2DE2A 2UVIA 3QIMA 2E1SA 1QULA 3IOVA 1JW1A 3H7MA 4TLLB 5AA1A 3CR9A 3PUYE 4LZ5A 2ZYNA 1TXFA 4G8NA 3LSLA 1B51A 4GVOA 1PB8A 1MY4A 4QRZA 1PBPA 1R9QA 4H6DA 1MQHA 4OWDA 3T96B 3O2AA 4NEDA 1PEBA 4DE8A 3TODA 4PETA 2ZMBA 1N04A 1TWYA 1GV8A 4I9DA 1B5IA 4IO5A 1FQAA 4I8CA 5KCJA 5LOMA 4RPOA 4AB5A 4U2RA 1D3KA 3QK6A 4ECFA 4ESWA 1NNKA 1MXXA 5AA3A 4N6PA 4E0XA 2Z8DA 3O9PA 4GD5A 5AA2A 3VFJA 4C1TA 1QKAA 3E9XA 1IIWA 4O3BA 2PT1A 3E3KA 3ILTB 4DXBA 4BDMA 4NWDA 3MWBA 3UP9A 1CE2A 2DE3A 3I3VA 4BDQA 2F6PA 4NF6B 2AL4A 4ZECA 1URGA 1LCFA 4G68B 4GL0A 3PPQA 4QFOA 1MDP1 3FJGA 4OVJA 1LAXA 4G8MA 1DSNA 3VLWA 1TFAA 3CI8A 1B9JA 3TTNA 1A8EA 3N6UA 5HPQA 4ZEDA 1XVXA 3TYHA 4FORA 2X7PA 1BLFA 3DP6A 3KGCA 4R6YA 1HSJA 2UVHA 4F3SA 1B3LA 1MXWA 3B6TA 5H8HB 2UYFA 2ANJA 1RYXA 1FQEA 1USYH 2VP1A 5DT6A 3FATA 3ONMA 2QS4A 4ZEKA 2OBGA 4POWA 2PBWA 4UA8A 5H8QA 2XXTA 5CMKA 2VGQA 2ABHA 3G7WA 1Y1MA 3O6IA 4IGTA 2A5TB 1I6BA 1M5DA 3BBRA 3DELB 3TUSA 3H3GA 4GOTA 2D21A 3QSLA 3ZKKA 2I49A 4HTGA 4NF5B 1LAHE 1LCTA 3L6HA 5B7DA 4BDOA 1ANFA 3AXFA 3HN0A 1LBCA 1KWHA 1UTHB 3O6HA 4I62A 5F7VA 2I3VA 2G29A 3OELA 1DMBA 1M5FA 4ELPA 3IX1A 1NFTA 1POY1 2F6GA 4XKNA 2G93A 4IO4A 4OEUA 3RT6B 4JWYA 3Q27A 4QFKA 4ZE9A 4ZZEA 2H98A 5AE4A 3FJ7A 4TLMB 2B3FA 3CSBA 4R72A 3PUXE 1DOTA 1FTMA 2XXXA 3PPRA 3MVWA 4DXUA 2F7AA 2PT2A 4ISUA 5ICTA 2VD2A 4O3CA 4H67A 3MVZA 4EF1A 3KEIA 2VHAA 3DM0A 4OFOA 1B3EA 4KPTA 1EZPA 3OEMA 4EXLA 4YZZA 1SYIA 3TCHA 5H8QB 3FVNA 5FHNA 3H6TA 4F31B 3BKIB 1A40A 1NKXA 1UTBA 3IR1A 2OWSA 2VD3A 4ZEBA 5I57B 3R26A 4U23A 4U1ZA 1FQFA 3GLBA 3Q29A 2I0CA 4BDLA 2O7UA 1SDXA 2O1MA 4KCCA 4MLVA 5ELVA 1B4ZA 1B0LA 3EPEA 1A7LA 1B3GA 1BTJA 2ZXTA 2UVGA 3OENA 2O1LA 3PMWA 4LVQA 4DDDA 1ZU0A 4ESXA 4LONB 4DZ1A 4F1VA 3FJMA 1NH8A 4QFNA 1B52A 5CC2A 2F7CA 3TTLA 1IXCA 2NUVA 4KYDA 4OFLA 1MQIA 2DE4A 3C35A 3F11A 2I6EA 3LBSA 3OOAA 3PUVE 4NF4A 2NOOA 3H6WA 3O6GA 1P1QA 2AYSA 3MP8A 2FYIA 2DS9A 4NF5A 4XKRA 5AA2B 1B7ZA 1D4NA 5K2YA 2QJEA 1LLSA 4QHQA 2B65A 3C4MA 4WKMA 3O29A 3UGWA 1BIYA 5DVFA 4DXCA 4YMAA 5L9OA 4RA1A 3H4ZA 4WXJA 1MXUA 3CIJA 4PQJA 3KN7A 4NWCA 4YKJA 3IB2A 5BWJA 1POTA 3IO6A 3MZBA 4NTLA 2VOZA 4RYAA 3TAJA 3G3HA 3K00A 3SEVA 2IA4A 4H8IA 3T93B 4KQPA 2PMSA 4OHNA 2ALUA 3LSWA 2DQVA 5I2KA 3G3FA 4IB2A 1H43A 1B5HA 1XOCA 2DVCA 2X7QA 3H6VA 4JWOA 2UVJA 3LC8A 1Y3NA 2I3WA 4AB6A 3IAZA 5B70A 4THIA 4F1YA 3KSJA 3FIRA 1MXVA 2I4BA 3C9HA 1B1XA 2I4CA 1MY1A 2F34A 3ODBA 1IITA 1JETA 2XD3A 2Z23A 3C32A 3A3CA 3GBBA 4G8HA 2DOJA 1CB6A 3H06B 3OSRA 4LZ8A 4NMYA 2O69A 3N26A 5I56A 4U22A 1FTKA 2OLBA 2XXQA 4OENA 4ELOA 3C36A 5DTBA 2H9BA 1MXYA 3PMXA 3E13X 3MVYA 2X26A 1A8FA 1Y4TA 4EDPA 1SW5A 2FA7A 4FJPA 3TFLA 4NE4A 3T9XB 3FXQA 1F9BA 1QVSA 2F35A 1ZJLA 2GH9A 3TDJA 4GWOA 2Y7IA 1M5EA 3D4GA 3MAMA 4JSDA 4WEPA 5I2KB 4ELQA 3UORA 2ZNSA 2DWHA 2HCAA 3K02A 3MZ9A 4U4XA 2H99A 4ZDMA 4RJZA 4LP2B 4KCDA 4O3AA 4YKPA 1MXZA 2RC7A 2QS2A 3FV2A 3TELA 4ELRA 1FCKA 3S9MC 1OIBA 2M8CA 3RT8A 1JVXA 3U93A 4ZS9A 1IXHA 3OSQA 1II5A 3K4UA 2XXVA 4HS7A 1DTZA 2HFBA 5JTYA 1MY3A 1XHYA 3B6QA 3KOSA 3PPPA 5TPAB 4YMBA 5JK4A 1MY0A 1S9TA 1NNPA 1O63A 3VV5A 2XXIA 3K1NA 1NNTA 2V3TA 4OYVA 3FD3A 2PYYA 3ILUB 3IB1A 1ZTYA 5AA4B 3S9LC 2HAVA 4H5FA 3RPWA 1EH3A 3M3LA 2GRVA 3B6WA 3FVKA 5TPAA 4ZZAA 5JTYB 2BJJX 5TP9A 3V89B 2DXYA 3CFZA 1VFEA 4U1OA 2XX8A 5I84A 3PPOA 2NWJA 4IO3A 3IL1B 3VLVA 3KG2A 2RC9A 4LQ2A 3U94A 3JV9A 1ZMGA 3QUFA 1A54A 2QMXA 3KOTA 2UYEA 4NF8A 4RPNA 3H03A 3TCFA 1GR2A 2A5TA 4XIGQ 4WEDA 2O51A 1B0HA 1NMUA 3FXUA 3M3KA 2P1SA 3PU5A 2XXWA 5A5XB 3C31A 3T9HB 4XKPA 1JNFA 3TZAA 3PGFA 5EHMA 2HZKA 4X9TA 1MQDA 4JXIA 3W9VA 4EUOA 3R6UA 4OEVA 5L8DA 5AA4A 4RXLA 1QW0A 1DPEA 4G4PA 1SW1A 3MBPA 3SDFA 2I48A 3TTRA 1OQHA 1HSEA 1JQFA 4RK9A 1B6HA 3C34A 2P0SA 3G3GA 3H6UA 2PX1A 3K1PA 4I1DA 1A99A 1URSA 4FEDA 4G68A 2AIXA 4GQOA 3K2DA 1B5JA 3K01A 4N07A 1NL5A 1QUJA 3FVGA 3O28A 4QF9A 1H45A 1DTGA 1MG1A 5DEXA 2QPQA 1LB9A 3VLUA 3HV1A 5L9MA 1YCJA 2QRYA 4H5GA 4Z0IA 3MP6A 2DP8A 1RYOA 4F29A 3CRBA 1NH7A 3O66A 3OMBA 4R2FA 2ONSA 5DVJA 4F3PA 1YAEA 1T0KA 1UTBB 3IJOB 4OZ9A 3VXBA 1FTOA 3IOWA 1SVXB 4GRKA 4FATA 5EYFA 3VDFA 2YLNA 1WVJA 3UIFA 2NXOA 3ECRA 3PPNA 1UQWA 1LFGA 2CMOA 4C0RA 2Q9TA 1OLAA 4G77A 2XXYA 1QUKA 4OESA 2H25A 1P99A 5I59A 1QKBA 3FGSA 3MVXA 5H8NB 2ZNUA 3L6GA 2Q88A 1XT8A 4NF4B 2O6AA 4P0IA 4LUBA 5TP9B 3RUMA 3K6UA 3SERA 4TQUQ 3IJXB 5ITPA 1O64A 4YB5A 5K2XA 2XXUA 3OO9A 1OVTA 1PDAA 4EF2A 2V84A 3MP1A 1VFDA 2ONRA 1N76A 3CVGA 4IO2A 4EXKA 1LFIA 3FASA 1WDNA 4JWXA 5DVIA 3TCGA 1H44A 3S9NC 5CBRA 1B7HA 1MQGA 1FTJA 1R1NA 2O84X 1Y1ZA 3FZVA 3OD7A 2IEEA 4QFLA 1BKAA 3IK6B 2WKYA 3TPAA 1J1NA 4IY6A 4X48A 1GGGA 4GF8A 2Q2CA 4GL8A 2V25A 3W9WA 2R6GE 2HEUA 2V3QA 1H3DA 4YKIA 2YPNA 5I57A 1PB7A 5KCJB 2AL5A 4XXUA 3IOUA 3N94A 4XTCQ 5ISUA 4RY1A 5I58A 4NF8B 4FEBA 4ZEFA 4HW8A 3KBRA 3E4RA 4GIZA 5I2NB 3OO8A 3PD8A 4F2OA 1VSOA 4Q5TA 1O7TA 2O7IA 3DP4A 4R75A 3SEXA 2Y7WA 3TKDA 3V5AA 1IXGA 3QYTA 3KN3A 4EQ9A 3FUZA 1EZ9A 1M5BA 2DVZA 2OZZA 5I56B 2XHDA 3U8QA 3S4UA 2HQ0A 4RNSA 3IB0A 3MPKA 3MQ9A 4OMBA 5CMMA 4AQ4A 1FQDA 4NF6A 4F19A 1GVCA 4P11A 1FQCA 3SEYA 4R74A 2GHBA 5F1QA 1P1UA 5L9SA 1MH4A 3CFXA 3R7XA 4YKKA 3UK4A 1SI1A 1YPNA 1OVBA 2A5SA 4P0GA 3D4CA 1SW4A 1LAGE 4PFTA 4R6KA 1XS5A 4YU0A 1AIVA 3V83A 4OTEA 1UIVA 4FE8A 2GHAA 2I58A 1B2HA 1S7YA 3G3KA 1ATGA 3P7IA 3OEKA 4KHZE 1IQ7A 3T9VA 3ZKLA 3T9UA 4DCYA 4IO6A 3A3UA 4H1XA 5H8NA 4H0WA 4LATA 5I59B 2ZYMA 3K6VA 2R71A 2XXHA 4GFRA 1BP5A 5CBSA 1MPCA 4XKQA 2LAOA 1IEJA 2P2AA 4U4SA 1JVYA 1VE4A 2Z8FA 1JW4A 3K6XA 3MPLA 4QSCA 1B40A 1MQJA 4PE5B 5FTIA 2Y7RA 2R9JA 3SKPA 4BLAA 3VVEA 4Q8RA 3VE1B 5H8SA 1Y20A 3EQ1A 4OXVA 2H4IA 1MM6A 1MM7A 3KZGA 4PFWA 4PFUA 4QSDA 4R6HA 4X1DA 3ZS6A 3DLNA 1LAFE 4F18A 3CFLA 3CSGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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