4L17A

Glua2-l483y-a665c ligand-binding domain in complex with the antagonist dnqx
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKICVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title A conformational intermediate in glutamate receptor activation.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 77
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence C, E, G
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-06-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4l17A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4l17A02
3G3KA 3B6TA 1XVYA 3KOSA 4H6DA 4NF4B 3W9WA 2VGQA 4YB5A 4LZ8A 1B7HA 3VLVA 1Y1MA 4JWXA 1MY1A 4P0IA 1FQDA 4XIGQ 1ZLQA 1GTKA 4N13A 3S9NC 2XXVA 1T0KA 3H6WA 1UTBA 4KYEA 1H43A 5J1DA 1ZMGA 2QSXA 3PD9A 1VFEA 2PT1A 1YTVA 2O1MA 4F29A 1TFAA 2Y7PA 4OEVA 2HZLA 4R6HA 2HXWA 3ONMA 3SEXA 4BDLA 4PFYA 5B7DA 4XKPA 1B5HA 1N3XA 2F34A 2VHAA 2QMXA 4DXUA 3V8XB 2OWTA 1R9LA 5AA3A 3KBRA 3TMGA 2QPQA 3G3HA 4ND9A 4GLIA 1JEVA 1MXUA 5I58B 1XOCA 1SI0A 3R7XA 2I3WA 1FQCA 1FTLA 2VOZA 2O6AA 1URGA 4R73A 1NNKA 4MLQA 3E4RA 2QS3A 1PB9A 1EZ9A 5ELVA 3EQ1A 1LAXA 3SDFA 3CG3A 3PPPA 3UIFA 2I6EA 4DE8A 1A99A 3BBRA 2G29A 2ZNSA 4LONB 1OQHA 4H5GA 4XTCQ 1OMPA 4EXKA 1OVTA 1BTJA 3HSTA 3U72A 3PV0E 1B32A 4RPOA 3O6GA 2FYIA 3A3CA 4RXLA 2ZYKA 2V3QA 1MPCA 3USDA 4H1XA 5DVJA 3G3FA 2O51A 1XC1A 5HBCA 1P1WA 1IXCA 3IK6B 4H65A 3PMXA 2DOJA 3K6XA 1LLSA 4NEDA 4Z0IA 3OSRA 4LA9A 1S50A 1IQ7A 1NKXA 3IOWA 1POY1 1LGBC 3K6WA 5L9SA 2PVUA 3TELA 4EUOA 1LCFA 4NF6A 3HO7A 2LAOA 1AOVA 2DE3A 4G4PA 4GFRA 4M1VA 4TLMB 1Y20A 4DXCA 2CMOA 1A40A 3Q26A 4F1YA 2I0BA 4Z7EA 4YB7A 1IITA 3TFLA 3ZS6A 3PU5A 4PETA 4JDFA 4Q5TA 4YZZA 2HAVA 3E3KA 2I3VA 3UGWA 5DTBA 3M3KA 4XXUA 4NF8A 3UN6A 3QIMA 5AE4A 1WDNA 5H8FA 4G8MA 5DEXA 2F36A 2V84A 4OHNA 3MW0A 2KLFA 3QK6A 3SEVA 3CFLA 4BLAA 4QFLA 4IO4A 4OENA 4YKPA 1NH7A 1B5IA 3B7DA 3UP9A 3FATA 3K01A 3I6VA 4ZS9A 4C1TA 5I57A 3VDFA 1PBQA 5FTIA 2Q2CA 3C32A 1SBPA 3K2DA 1D9VA 3T9XB 2Y84A 2HFBA 1QUJA 3BFTA 3VVDA 3IJOB 3MUQA 4IY6A 3PUYE 3FVKA 1B3EA 2I4BA 3VE1B 1MXXA 4G68C 4E0XA 2RINA 1SYIA 1MY0A 4Q30B 4IO6A 4TLLB 4KQPA 5KDTB 1OQGA 3TUSA 2QS4A 1R6ZA 3LSLA 1AL3A 4G68B 1OLCA 3MP1A 3KN3A 3K4UA 1B6HA 2Q8JA 4DCXA 3LR1A 5H8QA 1URDA 4NF6B 3OEMA 3E13X 4U1OA 4JBZA 4FEDA 1MY2A 3ODBA 3VV5A 5JTYA 4ESWA 1M5CA 1LBCA 1QW0A 1H45A 4R2FA 5CMCA 4ECFA 2AIXA 3MVZA 5LOMA 1ZIUA 4QFOA 4I9DA 4OEUA 2VD3A 3OELA 1SW2A 3FVOA 1B52A 5H8FB 1A55A 1SW5A 5DEXB 2AL5A 3OD7A 1B4HA 3S4UA 4N07A 2HAUA 5TPAA 4EF1A 5A5XA 4FIMA 4OWDA 3WAFA 3H6UA 1GR2A 1TT1A 2THIA 1YPNA 2ZNTA 3U92A 3KSJA 4ZZEA 4HS7A 3Q28A 4ZEIA 1R9QA 1S7YA 4XKNA 2A5SA 3DP6A 2V25A 2B3FA 3TTLA 3T9UA 2XXWA 2O7IA 2Q89A 3TCGA 4R6KA 3PD8A 3TCHA 4RY1A 3HCQA 1XHYA 3EF7A 4NTLA 2P0SA 3MJNA 3I3VA 3IAZA 1XVXA 5ISUA 5IAIA 3PUZE 2ABHA 3KSXA 5FHMA 3THIA 2RCBA 3H4ZA 4I1DA 1P1OA 5H8QB 4PFTA 3L6HA 4LZ5A 3O9PA 2Y7KA 3KN8A 4LQ5A 5JTYB 1II5A 3PPOA 1I69A 1FQAA 1MQJA 5EHMA 2PX1A 2XXUA 4PFWA 4U23A 3HV1A 2H9BA 4OXVA 2UYEA 4KI0E 3RGYA 3L6GA 1RYOA 4OMBA 1IZ1A 4PQJA 1MXZA 2DVCA 3HHGA 1B4ZA 3IOVA 2OCUA 3GXAA 3FZVA 2XX9A 5TPAB 5A5XB 5KCJA 2F8DA 3JV9A 5CMBA 1QKAA 1USYE 4OETA 1RKMA 3KEIA 3CI8A 1FQFA 1I6BA 1H76A 1B7UA 2ONSA 2H99A 2Y7RA 4OVJA 2OZZA 1NH8A 1QKBA 4IO7A 3K1PA 3T9VA 1RYXA 1XT8A 2E1SA 3MC2A 1OVBA 2REJA 4POXA 4ZZAA 4EXLA 1Q1KA 4G8HA 2PT2A 2Z8EA 3V5AA 1ZU0A 3C35A 2F7BA 2XD3A 4ELOA 3RNNA 3EN3A 4R75A 1N04A 1FW0A 4YMAA 3UK4A 4ZEDA 1QUIA 1P99A 2DWAA 3CSBA 5FHOA 3T66A 1MG1A 3GBAA 2F6PA 4BDQA 2HCAA 4IGRA 4OFJA 3S9LC 4O3CA 3LSXA 2PBWA 5F7VA 4EQ7A 3G3JA 3FASA 3O2AA 4YU0A 3SEUA 3TDJA 4LZ7A 1MQIA 1WODA 1LAGE 3TAJA 3PPQA 3S2VA 2DVZA 4G2ZA 1IXIA 3ECRA 4F18A 1Z7ME 4JXIA 4GVOA 1FCKA 5CMMA 2QS2A 2QS1A 2BJJX 3MP8A 2WKYA 4HW8A 3Q29A 3PMWA 3GLBA 5KCJB 1POTA 3KJ7A 1B1HA 3A09A 3H7MA 3IORA 4F22A 1A8FA 4OYVA 2QMWA 4U21A 1US4A 1MDQA 1BIYA 1Y4TA 4NMYA 4KYDA 5IKBA 1PC3A 2XD2A 2H4IA 4P0GA 4X1BA 1LFIA 4KD5A 2D21A 4K3FA 4ZE9A 3IB0A 4O3AA 2Q9TA 2DWHA 5I2NA 5H8NA 3FJ7A 3MVYA 4QRZA 1MRPA 5ITOA 4JWOA 1ZBMA 1NNPA 2H5YA 4QSEA 2F6GA 2Q88A 5KDTA 3PUVE 4XKQA 1MH4A 1D9YA 5L9OA 2F5XA 3B6QA 1SVXB 3C34A 3ILUB 4G68A 1EU8A 1Q35A 1H3DA 1VE4A 3W15C 3OO8A 4TQUQ 4F3GA 2XXHA 2AL4A 3KG2A 2B65A 1N7WA 1YCJA 1EH3A 4QSDA 4Q8RA 1EZOA 1I6QA 1PDAA 3OOAA 3PUXE 2DS9A 1JNFA 1MXWA 4F2OA 1MH3A 2UVJA 3O66A 3IJXB 1IEJA 1USYH 3O6HA 2V3UA 3IOUA 4RPNA 2UVGA 1B46A 1DPEA 4WEPA 1LAFE 2R6GE 1QULA 3C9HA 2GHBA 2PMSA 3S9EA 4R9FA 4NWDA 4DXBA 5ITPA 3MVWA 2OLBA 3S9MC 2F97A 2D5WA 4R2BA 1TXFA 2IEEA 3RT6B 1LFHA 3HPIA 2RCAA 3MP6A 1PEBA 1AIVA 4LVQA 3C33A 5AA2A 5BWJA 3C36A 4H67A 2P1SA 3KJTA 4PP0A 4R9GA 5I2NB 5H8NB 1AMFA 1DMBA 2E0SA 3BFUA 3SERA 1N76A 3FVNA 2V3TA 3OO6A 4IO5A 4HTGA 3GZGA 2RC9A 3IB2A 2Z8DA 4KPTA 3FUZA 1H44A 4YB6A 5JEIA 3TEPA 1GGGA 2X7QA 2XXPA 4THIA 4JWYA 4DDDA 3O28A 2DE4A 3H06B 4RK9A 5DT6A 1MS7A 4R74A 2UVHA 3T93B 3LUYA 2IA4A 3TTKA 4EF2A 5TU0A 3VLWA 1WVJA 4LATA 2Y7IA 4H0WA 3H6VA 2UXAA 4WKMA 1FQBA 2FNCA 4MF3A 3MZBA 5FTHA 1EZPA 3H03A 4LQ2A 3R26A 2NWJA 3U94A 3UORA 2I58A 4FATA 4M4GA 5CBRA 4OZ9A 3FJGA 1SW1A 1O7TA 2F35A 2RKMA 4ISUA 4GL8A 2I49A 1B51A 1LFGA 2O69A 2HEUA 1MPDA 4NWCA 4ELQA 1AH5A 4X48A 5I2KA 4QF9A 2P2AA 4RJZA 1DOTA 1JVXA 2YJPA 2XXQA 4GQOA 1US5A 2D3IA 1B1XA 1BP5A 2XX7A 1NL5A 4FECA 4OFLA 2ZXTA 1VSOA 1SD3A 1SYHA 4QSCA 4IO3A 1LB9A 3QUFA 1MM6A 3E9XA 5AA2B 3K02A 3C31A 3IO6A 4HCYA 3WAEA 5EYFA 1MPBA 1QUKA 1BLFA 4GD5A 4WXJA 1J1NA 3CIJA 1Y3NA 5ICQA 3SEWA 3FXRA 4POWA 4R6YA 5CM6A 2Z22A 2NUVA 3SETA 3IR1A 3FV2A 1B9JA 3GBBA 3M3LA 3VXCA 3K6VA 2XXIA 4IO2A 3FJMA 3UA8A 2OJTA 3RQTA 2M8CA 3B6WA 1MQGA 1D3KA 2QL3A 3ZKKA 1PBPA 3SESA 4I62A 2DWJA 1QJMA 1MY3A 1N84A 3K6UA 2DSFA 3VLUA 1UQWA 5JK4A 3N94A 1B40A 3DP4A 4MFIA 2I0CA 1JW1A 1GVCA 3DM0A 4GXAA 1MY4A 1R1NA 2ZNUA 5L9MA 2DYXA 2F78A 4LUBA 1FTJA 4F39A 1JVYA 4C0RA 4MH5A 3QYTA 2HZKA 1MM7A 3MAMA 3MQ9A 1SI1A 2Y7WA 3H3GA 5I2KB 3G7WA 1IUDA 1MXVA 2XXRA 4ZEBA 2NOOA 1UTHA 4PFUA 2DXRA 1B0HA 4C1UA 3OMBA 3QXMA 3Q25A 2AYSA 2ALUA 4GIZA 1P1QA 5I59A 2R9JA 2GH9A 1JW4A 2B3BA 3O6IA 3KGCA 4UACA 5H8SA 3EPEA 3W9VA 4GXSB 3PPRA 2ONKE 2XXTA 1ZKBA 5CMKA 1BKAA 3RUMA 1CE2A 3FIRA 4DIGA 4F3PA 1F9BA 4U2RA 1MQHA 3U93A 4KHZE 1M5FA 4U4SA 4ESXA 4F2QA 3VVEA 4G77A 3TTMA 5DVFA 4U22A 1PB8A 3KN7A 3EHTA 2OWSA 1NNFA 2REGA 1FTOA 4FJPA 3SEYA 4LP2B 3PPNA 5K2YA 2O68A 4ZDMA 3O97A 4H8JA 1B3FA 4ZEFA 3RN8A 4FAJA 1JETA 5CC2A 2X7PA 3QUJA 1A7LA 4QHQA 3T22A 4KFQA 5AA4A 3RLFE 4JSOA 1FTKA 2CZLA 2FA7A 2ESNA 2PYYA 1B5JA 1LSTA 1ELJA 2YPNA 4PE5B 2ANJA 2NXOA 3CSGA 2ZYOA 4KR5A 1B3HA 4NF5A 3G3GA 2H25A 3RY3A 2GHAA 4TOZA 1N7XA 5CRYA 1UTHB 4EQBA 3T96B 2ONRA 1I6AA 4BDOA 1YAEA 5I59B 3HHFA 4OQOA 3TKDA 3TQWA 1Y3PA 1HSLA 5EHSA 2UVIA 1Y1ZA 5H8HA 4ONYA 4QFNA 1KWHA 4X1DA 1M5BA 3PGFA 1UIUA 1B7ZA 4O3BA 4U1ZA 5TP9A 3VFJA 3LSFB 1Y3QA 5HM4B 3MBPA 3IB1A 1SQYA 5KZTA 2G93A 3TPAA 3JZJA 5HPQA 1UTBB 3CR9A 2RC8A 3DELB 3QAXA 3TTRA 2Q2AA 4IB2A 4G8NA 4Q0CA 2W7YA 1LB8A 3N5LA 4ELPA 3IOTA 2O84X 3JYRA 1MQDA 1NFTA 3LSWA 1IXHA 1SDXA 2RC7A 3KOTA 1JW5A 3MVXA 4IGTA 1PB7A 1IXGA 2XXXA 4OESA 1OLAA 4H5FA 4KCDA 1N0TA 2YLNA 1DPPA 4F1VA 4UA8A 2R71A 4IY5A 4N6PA 2A5TA 3VXBA 4GOTA 3OO9A 3TCFA 5AA4B 4OFOA 2F7AA 1NMUA 3D4CA 3M8UA 3BKIB 4JSDA 3DLNA 4RK2A 5M2VA 4DZ1A 2ZYMA 5FHNA 1NNTA 2OBGA 5I56A 3CFXA 1N3WA 4NF5B 4L17A 1LCTA 1A8EA 5ICTA 3QSLA 5L8DA 3CRBA 1DTGA 3EHSA 4GRKA 4DLDA 2Z23A 3A3UA 1A54A 1DSNA 3TYHA 2X26A 4F31B 1SW4A 3G3IA 5AA2D 3SKPA 1TWYA 5H8HB 4FEBA 3RT8A 3ZSFA 3FXUA 3V83A 4RNSA 3TQLA 5TP9B 1B3LA 1ZJLA 3PMVA 5F1QA 3VVFA 1ATGA 3EHUA 1QVSA 4HCWA 3OENA 4AB5A 1B05A 4ZEKA 4YICA 1XS5A 1HSJA 2HQ0A 2UYFA 4OERA 2GRVA 4AB6A 1M5DA 1Y9UA 3RPWA 3MPKA 4DCYA 3CG1A 3ILTB 4XKRA 3OO7A 5I84A 3MZ9A 2OK2A 1FTMA 2A5TB 1DTZA 3MZ1A 3U1OA 3IL1B 1LAHE 3FV1A 4ELRA 1JQFA 1P1NA 4E0WA 1P1UA 2I4CA 4QFPA 4NF8B 3T9HB 1L5TA 5DYHA 5I56B 4YAHX 5CBSA 1B2HA 3I5OA 2DP8A 4YKKA 4BDRA 4F3BA 3K0VA 5K2XA 5B70A 3MWBA 1D4NA 1ANFA 1JEUA 3PUWE 3FXQA 3ZKLA 3HN0A 3KZGA 2DWIA 3IO4A 4YMBA 1CB6A 4R72A 5I57B 2RF1A 2Z8FA 3C4MA 4GWOA 2DE2A 4RA1A 2XX8A 3OEKA 4X9TA 4GL0A 4FE8A 4NF4A 1LBBA 2QJEA 1Y4CA 3LC8A 4AQ4A 4MBPA 3LBSA 1Z7NE 2DXYA 2DQVA 3D4GA 3RTWB 3OSQA 2ZMBA 4YKIA 3TZAA 2O1LA 4KCCA 4MLVA 4P11A 4YKJA 4QFKA 2XXYA 1O64A 3P7IA 4ZECA 3M3FA 3FD3A 1MDP1 2XHDA 3DP8A 4JB7A 3U8QA 3RTFB 4I8CA 5BUUA 3FVGA 1M5EA 1URSA 3N6UA 1B0LA 1VR5A 3KFMA 4GF8A 4RYAA 4KYSA 2NVUB 3K1MA 1VFDA 1B58A 1FQEA 3CVGA 2O7UA 1MXYA 1S9TA 2V93A 3FGSA 3O29A 1B3GA 2VD2A 4H8IA 2H98A 2I48A 4BDNA 3OXNA 3Q27A 2GFEA 4BDMA 3R6UA 1TFDA 3AXFA 3TODA 4WEDA 4ZE8A 5DVIA 3IX1A 5I58A 4EDPA 4F19A 3V89B 4F1UA 3N26A 1O63A 1IIWA 2F7CA 2ZYNA 4F3SA 1UIVA 1ZTYA 4NE4A 3K1NA 1GV8A 2QRYA 1HSEA 3TTNA 3N6TA 4OTEA 4U4XA 3MPLA 4FORA 4EQ9A 3F11A 3CFZA 3H6TA 5AA1A 2VP1A 5CI5A 1OIBA 3K00A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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