4L41A

Human lactose synthase: a 2:1 complex between human alpha-lactalbumin and human beta1,4-galactosyltransferase
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
AKQFTKCELSQLLKDIDGYGGIALPELICTMFHTSGYDTQAIVENNESTEYGLFQISNKLWCKSSQVPQSRNICDISCDKFLDDDITDDIMCAKKILDIKGIDYWLAHKALCTEKLEQWLCEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Calcium binding protein/transferase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structure of Human Lactose Synthase forms a Novel 1:2 Complex between beta1,4Galactosyltransferase 1 and alpha-Lactalbumin Proteins
rcsb
molecule keywords Alpha-lactalbumin
total genus 38
structure length 123
sequence length 123
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-06-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4l41A00
3WPLA 1FLUA 2G4QA 4EMNA 1HMKA 1ZV5L 2G4PA 1JSFA 1JISA 4OWCA 1IP7A 4WO6A 1LZEA 3ATOA 1IWTA 1JTPL 3A34A 4LYZA 1FBIX 1WQNA 5I53A 3AGGG 5LYMA 5B05A 1QIOA 1QUTA 3ZVQB 1IX0A 2C8OA 4UWVA 5C6JA 1F6RA 1JWRA 1INUA 1VDQA 2BQOA 1JKDA 3WU8A 5ILCA 1B7NA 1OUEA 2HUBA 1IOCA 4NGYA 4NIJA 4NHSA 5I4YA 2G4NA 1GFKA 1HEOA 2F4AA 2IHLA 1LAAA 5JENB 1JKCA 4KPMA 5LAGA 1VDSA 3W6CA 2BQNA 3TXIA 1DKKA 1LHIA 2LYOA 1IOSA 3A3RX 3B72A 1P2CC 4WG1A 1D0KA 4H9HA 1REZA 4OOTA 2LHMA 1RCMA 4XJGA 5LVIA 3A6BY 2MEDA 5B07A 3TMVA 4TTDA 1GB3A 4HPIA 5LYZA 1LZ4A 1B0DA 1B7SA 4GCFA 1BWIA 4MCKA 4UWNA 1GF3A 1GE4A 2I25L 1LZ1A 2NWDX 4DD0A 5L3HA 1YANA 1GFVA 3P4ZA 5APFA 4HTQA 1UIAA 1WTMA 4J7VA 2HTXA 4I0CA 1IP5A 4LT1A 5KXWA 4H9BA 1DPWA 1O23A 5L3IA 2Z39A 1XGUC 4OWHA 2DQAA 1OUGA 2Z2EA 1GB0A 1BGIA 3CSQA 4NGZA 1KXXA 4ETCA 1NBYC 4NGWA 2W1YA 3KAMA 5DM9A 6LYZA 3LYZA 4NGLA 1D6PA 5B06A 1HERA 1KIQC 1WVVA 1B5ZA 4NGJA 1B5WA 1IWUA 1GF8A 1QTEA 4TWSA 1VDPA 3HBEX 1IWXA 1FDLY 3LZ2A 3WH1A 5KXKA 3TMUA 2A7FA 4ET8A 1LKSA 5KKJA 1WQMA 4DDBA 1KIPC 2BQKA 5F9UA 1GF5A 1GF0A 2BLXA 3A67Y 3W6DA 1TAYA 5F14A 3QE8A 1GF7A 1IY3A 1G7LC 1LHLA 5IDDA 2HU1A 5LA8A 1IP2A 5KY1A 1LSAA 4HJVA 3P68A 2ZNXY 3A91A 4C5FA 4PRQA 1C7PA 1YIKA 4ML7A 2LZTA 3B0OA 4YOPA 1YL1X 1LMPA 4GCBA 1IIZA 1QSAA 8LYZA 4OWBA 4BADA 5J7CA 1CJ9A 1LMQA 2FYCA 3AYQA 1GFUA 1LYSA 1LJ4A 4ETBA 1UIGA 4LZTA 2WARA 2DQHY 1GDXA 1PZYA 1RI8B 4Z98A 2FBDA 1JEFA 1LHJA 1BB4A 2F2NA 1LZ6A 4H8ZA 1CJ7A 1RFPA 1HC0A 1LZ5A 1QDTA 1G7HC 3A92A 4WOAA 3TXKA 4DC4A 5KXPA 2BQFA 3J4GA 1GBXA 4GN5C 5F16A 5A3ZA 3WW5A 4ZIXA 1B5UA 1LSDA 3LYOA 2A7DA 4G9SA 5KKIA 5FHWA 5KXXA 2BQMA 2LYMA 1LSGA 1QDRA 1WQRA 1JUGA 3CT5A 4IASA 3ULRA 3RZ4A 1HEPA 4G4CA 1IWYA 4DWXA 1NWGA 4YEMA 1HSWA 1GWDA 4ANRA 1JJ0A 4XYYA 2BQHA 3HBDA 4PHIA 1BVKC 2N5ZA 4PGJB 2EQLA 5APEA 1GFTA 4OWAA 1BHZA 1AZFA 1B7QA 1IP6A 1UIDA 2MEHA 1V7TA 2MECA 4LYBA 1NF5A 3E3DA 4U3XB 4HJZA 3AZ5A 3N9CA 5KXTA 1B5VA 1IR8A 3EBAB 4YM8A 3M3UA 3P65A 1LZBA 2I6ZA 1RE2A 1MLCE 3A95A 3TXHA 1JKBA 2BQLA 2XBSA 3WMKA 4OW1A 4ZEEA 4LYTA 1QTKA 1D6QA 2YBNA 1IO5A 1IC4Y 3CQLA 1XGRC 9LYZA 5K7OA 2FYDA 4NGIA 1ALCA 1GBZA 2DQFC 4IATA 1DI3A 4R0FA 1LKRA 1GB5A 1HFYA 2D4IA 1GB7A 1B7RA 3M18B 1GFEA 2DQGY 1XGQC 4TUNA 1LMCA 1V7SA 3LYTA 4XJBA 5APDA 1OUHA 4NEBA 2LYZA 1UACY 5HMJA 1EQEA 3WVYA 2DQJY 1GXV2 4A7DA 2Z19A 4NSGA 1UICA 1XGTC 4B4JA 1DPXA 2CJLA 5LIOA 4H1PA 2ZQ3A 7LYZA 2ZIJA 3G3AB 1LSFA 4C3WA 3P66A 4NFVA 3IWRA 3WL2A 1WVUA 2MEIA 2I26L 1LMOA 5IELA 4HTKA 1IWVA 2BQBA 3AB6A 1UIEA 1VAUA 2YBLA 1F10A 3ATNA 3EMSA 4II8A 3VWOA 1LSZA 1UIFA 4CFPA 2YBMA 4LFPA 1I56A 1QSWA 4LFXA 1CKFA 1LYYA 3LYMA 1TBYA 1WQOA 5M1YA 4FDYA 4DD2A 4H91A 1LMNA 1KXYA 3W6AA 4H92A 5L9JA 1GB8A 4M4OA 4HTNA 2XTHA 1LJEA 1GE1A 3D9AC 1YQVY 3CT1A 4LT2A 2HU3A 2W1XA 1OUDA 1NKHA 2PC2A 1LJFA 3TXGA 1XEIA 2CGIA 2Y8PA 3EO5A 1FKVA 4N5RA 1IWWA 4B0DA 4QY9A 1GPQC 1YILA 4KT3A 4B4IA 133LA 4QDNA 5LVHA 132LA 1GE0A 4LYCA 2DBTA 2BQDA 3W6EA 1LMTA 1XGPC 1YAOA 2HEAA 5E4PA 4DDCA 4DDAA 1EQ5A 1LZTA 4WL7A 2ZIKA 3TXJA 1I1ZA 1CKDA 4WLYA 1JIYA 3WXUA 2FBBA 2IFFY 2CDSA 193LA 2CWIA 4HV2A 3P64A 4GLAA 5LVKA 1GF6A 1OQMA 134LA 4UWUA 3K3TA 5HNLA 4CGEA 4CFOA 3F6ZA 5F9XA 1IOTA 2ZNWY 5LA5A 4LGKA 1G7IC 4D9ZA 4XJDA 1GD6A 1VFBC 2YBJA 3J6KA 5B1GA 1FLQA 1GAZA 1HNLA 3IJVA 5APCA 2HEEA 1JJ3A 4NGOA 1LJNA 1C10A 1XEKA 4H9CA 3CT0A 4G4HA 1E8LA 1KXWA 1T3PA 1LHKA 1GBWA 2F30A 3FI7A 5DL9A 2YDGA 4TSCA 1W6ZA 1Z55A 4HJYA 1UC0A 5HQ1A 2MEAA 2D4KA 5T3FA 1IVMA 1B7OA 1OUCA 1HFXA 1PS5A 1FLWA 2XBRA 4H94A 3WXTA 4ETEA 1LZDA 3CSZA 4NSIA 3CB7A 1LZNA 4J1BA 5KJ9A 2DQCY 4XENA 3RNXA 1UUZC 1GFGA 1YKYX 4WLTA 2YVBA 5I5QA 3B6LA 2D6BA 5FSTA 4NG1A 1GBSA 2BQCA 4X3BA 4Z46A 207LA 6LYTA 3A94A 5EBHA 2EKSC 4DT3A 1GXXA 1N4FA 1NDMC 1D0LA 1LJJA 3FE0A 1HMLA 1T6VL 1OUFA 1HEWA 1F0WA 3HBHA 4MR1A 5C6LA 1CKCA 3N9EA 5D5FA 4XADA 4P2EA 4Z3MA 1IR9A 1LOZA 1LYOA 2MEEA 4GCEA 5IHGA 2BQIA 5LXWA 1JJ1A 1GB6A 4Z41A 1UIBA 1D0MA 5DN5A 5I4XA 5HLLA 1IP3A 1IWZA 4NSJA 5FELA 3AW6A 1B5YA 2EPEA 4NHTA 1LZSA 2D91A 5KXNA 208LA 4DD9A 1NQIA 3IJUA 1LSEA 3WYHA 1LCNA 4ETDA 4XJHA 4LYMA 1OUAA 1I20A 1TEWA 1OUBA 1VATA 1IP1A 1LYZA 1IR7A 1IEEA 1NHEA 2X0AA 4G49A 1JITA 4O34A 5KXLA 2HEFA 3A6CY 3WPJA 3WPKA 4NWHA 1IORA 1GE2A 4DD7A 1FN5A 1JTTL 4MSTA 4PPOA 1D9UA 1GDWA 1HENA 2BQAA 2BQJA 4NWEA 4RW1A 5E9RA 1HELA 5KXYA 3RU5A 3WW6A 5FDJA 1J1OY 1C45A 1C46A 2MEFA 4R6CA 3WUMA 5ILFA 5LVJA 1GHLA 2VB1A 2W1LA 4LT3A 5AMYA 4NGKA 3WUAA 1LJGA 4GN3A 1OUIA 3TXDA 4AXTA 1SLYA 1JSEA 5A3EA 2BQEA 3B0IA 1LZCA 4HP0A 5HNCA 3OJPA 1BWHA 1DXJA 4IJ4A 4QGZA 4TSBA 3TXBA 1XEJA 1LZYA 3W6FA 1LSPA 1LJIA 1LTMA 2C8PA 4B49A 1ZVYB 4ETAA 5LINA 2Z12A 3LHMA 1FLYA 5DN4A 1HFZA 4RLMA 1RJCB 1J1XY 3A8ZA 4DYGA 5F81A 1G7JC 1YROA 1WQQA 5B1FA 3GXRA 4RDSA 1LZRA 2HEDA 5B59A 1JKAA 1GFRA 1HF4A 4W94A 3WVXA 1YAPA 4TX7A 1GEVA 2H5ZA 2LZ2A 2HEBA 1A2YC 4J0LA 1LMAA 1LHHA 1DKJA 1JPOA 4H9AA 1IP4A 4HPEA 3W3EA 2DQDY 1YL0X 5KXRA 2BLYA 3AGIA 5HMVA 1BB5A 4NHQA 1DQJC 1C43A 2Z2FA 1LPIA 1LSMA 4AGAA 4WG7A 5FEKA 3EXDA 4H8YA 4H9FA 4NHIA 135LA 1GB9A 4H90A 4WLXA 2F4GA 2DKVA 4CJ2A 1XSFA 4WL6A 1AT5A 4OWEA 3TXFA 3BKVA 1NBZC 1DZBX 1HEMA 2Z18A 1OUJA 4H9EA 1NMMA 4DD1A 2YBHA 4GCCA 2D4JA 4H93A 2DQEY 1B9OA 1SQ2L 1MELL 1CNSA 1H6MA 3LZTA 4RLNA 4BS7A 1LSCA 1WTNA 4M6DA 1GB2A 2ZQ4A 4NHPA 3QNGA 1C08C 4KL7A 2BQGA 4WM3A 1DI5A 4YEOA 3WU9A 1CJ8A 4N1CC 4LYOA 3TMXA 1LJHA 4PRUA 4YENA 3GXKA 154LA 4HSFA 1B7LA 2GV0A 2W1MA 1LHMA 5LVGA 2MEGA 1GE3A 1DI4A 4HV1A 5KXSA 4WM6A 1XFPL 1YKXX 1GEZA 1UA6Y 1QQYA 1UCOA 4FJRA 1LSYA 3HFMY 4OOOA 1B2KA 5I54A 1H87A 4WLDA 1GFJA 1GF9A 1GFAA 3A93A 3WUNA 2ZILA 4XJFA 4GN4A 3RT5X 5D5CA 3WULA 3QY4A 3A90A 3AZ7A 1KIRC 4GLVA 4N8ZA 1LSNA 1NDGC 1QUSA 2ZYCA 4N1EI 1CJ6A 3TMWA 3D3DA 4YF2A 3A96A 2ZYPA 4XN6A 4CHXA 5FCPA 1BB7A 3G3BB 4EOFA 1FKQA 3MGWA 1REXA 4GCDA 1REYA 4B1AA 3T6UA 1B7PA 3AW7A 2BPUA 3AZ4A 4W96A 194LA 2RSCA 1ZVHL 2H9JA 5KXMA 4L41A 4RW2A 1GAYA 1IC7Y 1IC5Y 4NG8A 4I8SA 1GFHA 1IY4A 153LA 1JHLA 4NSHA 1GF4A 1YKZX 3A3QA 4KXIA 3RW8A 2DQIY 1CKGA 4WO9A 2AUBA 3LN2A 2Z38A 4H8XA 3ZEKA 1LZ8A 2YBIA 3AJNA 4J1AA 3SP3A 4BAFA 5KXOA 1AKIA 2YSSC 3CSRA 3ZVQA 4E3UA 4H9IA 4N0JA 2Q0MX 1BQLY 1YAQA 1A4VA 1VEDA 3WU7A 1BVXA 1YAMA 4XJIA 4NGVA 4WM4A 3W6BA 5II3A 1OP9B 1B5XA 1HHLA 4DD3A 1B7MA 4LT0A 4WM5A 2EIZC 1F6SA 4BAPA 1UIHA 1EQ4A 1LZ9A 1GBYA 2Z37A 4G4BA 4WM1A 1LZGA 1ZMYL 4WM2A 1HSXA 2BAAA 2ZWBA 5LAFA 5KXZA 5C6IA 1JTOL 3AGHA 2H9KA 1LJKA 1HEQA 3OK0A 1WQPA 3BKHA 4ZFPA 1G7MC 1BWJA 3AZ6A 1IOQA 1W08A 1TCYA 1AM7A 1GBOA 1TDYA 1REMA 3B0KA 4WMGA 3T36A 5LYTA 4N9RA 2MEBA 1VDTA 2XJWA 1AT6A 1BB6A 1EL1A 1LZAA 1LJ3A 2HECA 1BB3A 4NY5A 4PJ2C 5DLAA 3TXEA 1J1PY 4ET9A 5I4WA 4B4EA 1UBZA 1LSBA 1CKHA 3N9AA 4QEQA 2B5ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CDOA 3DMVA 2G4QA 3DN2A 2Z6BA 1IP7A 1C64A 1IWTA 4LYZA 3A34A 1WQNA 237LA 183LA 1IX0A 2C8OA 3WU8A 2BQOA 1INUA 1C65A 4ARLA 258LA 170LA 120LA 2G4NA 2LC9A 229LA 1L28A 239LA 2F4AA 4KPMA 5LAGA 1VDSA 3B72A 1SWZA 1D0KA 1RCMA 1OWZA 255LA 2MEDA 4TTDA 1GB3A 1C6EA 4W51A 4MCKA 1L32A 1L24A 2NWDX 3C81A 4DD0A 5L3HA 4J7VA 1QSQA 1C62A 4H9BA 1L75A 2OE7X 1XGUC 4OWHA 1L96A 4NGZA 1GB0A 4NGWA 2W1YA 3KAMA 5DM9A 1L60A 1L09A 1C6BA 4NGJA 1L47A 1QTEA 3K2RA 1FDLY 3TMUA 2A7FA 1CV4A 110LA 227LA 113LA 2BLXA 1TAYA 5F14A 4I7LA 129LA 1IP2A 3P68A 3A91A 4C5FA 1C7PA 2B73A 4ML7A 181LA 1QTDA 1QSAA 178LA 1P46A 1LMQA 2FYCA 1LYSA 1LYDA 1PZYA 3G3VA 1RI8B 252LA 1QTCA 137LA 1TLAA 1QS9A 187LA 1RFPA 1XJTA 4GN5C 254LA 3WW5A 1QTHA 3LYOA 2A7DA 5KXXA 1WQRA 3CT5A 225LA 4IASA 3ULRA 1HEPA 201LA 4DWXA 1GWDA 1L67A 2N5ZA 231LA 2ANVA 4LYBA 164LA 1B5VA 1T6HA 3HTGA 4OW1A 4ZEEA 4LYTA 1IC4Y 3CQLA 1C6IA 1P2RA 1GBZA 4IATA 1DI3A 4R0FA 1GB5A 1HFYA 238LA 1C6JA 212LA 1V7SA 5APDA 1OUHA 4NEBA 1UACY 5HMJA 1GXV2 160LA 1XGTC 3G3WA 1L94A 1WTHA 1QSBA 5IELA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3WPL A;  1FLU A;  2G4Q A;  4EMN A;  1HMK A;  1ZV5 L;  2G4P A;  1JSF A;  1JIS A;  4OWC A;  1IP7 A;  4WO6 A;  1LZE A;  3ATO A;  1IWT A;  1JTP L;  3A34 A;  4LYZ A;  1FBI X;  1WQN A;  5I53 A;  3AGG G;  5LYM A;  5B05 A;  1QIO A;  1QUT A;  3ZVQ B;  1IX0 A;  2C8O A;  4UWV A;  5C6J A;  1F6R A;  1JWR A;  1INU A;  1VDQ A;  2BQO A;  1JKD A;  3WU8 A;  5ILC A;  1B7N A;  1OUE A;  2HUB A;  1IOC A;  4NGY A;  4NIJ A;  4NHS A;  5I4Y A;  2G4N A;  1GFK A;  1HEO A;  2F4A A;  2IHL A;  1LAA A;  5JEN B;  1JKC A;  4KPM A;  5LAG A;  1VDS A;  3W6C A;  2BQN A;  3TXI A;  1DKK A;  1LHI A;  2LYO A;  1IOS A;  3A3R X;  3B72 A;  1P2C C;  4WG1 A;  1D0K A;  4H9H A;  1REZ A;  4OOT A;  2LHM A;  1RCM A;  4XJG A;  5LVI A;  3A6B Y;  2MED A;  5B07 A;  3TMV A;  4TTD A;  1GB3 A;  4HPI A;  5LYZ A;  1LZ4 A;  1B0D A;  1B7S A;  4GCF A;  1BWI A;  4MCK A;  4UWN A;  1GF3 A;  1GE4 A;  2I25 L;  1LZ1 A;  2NWD X;  4DD0 A;  5L3H A;  1YAN A;  1GFV A;  3P4Z A;  5APF A;  4HTQ A;  1UIA A;  1WTM A;  4J7V A;  2HTX A;  4I0C A;  1IP5 A;  4LT1 A;  5KXW A; 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 4CHX A;  5FCP A;  1BB7 A;  3G3B B;  4EOF A;  1FKQ A;  3MGW A;  1REX A;  4GCD A;  1REY A;  4B1A A;  3T6U A;  1B7P A;  3AW7 A;  2BPU A;  3AZ4 A;  4W96 A;  194L A;  2RSC A;  1ZVH L;  2H9J A;  5KXM A;  4L41 A;  4RW2 A;  1GAY A;  1IC7 Y;  1IC5 Y;  4NG8 A;  4I8S A;  1GFH A;  1IY4 A;  153L A;  1JHL A;  4NSH A;  1GF4 A;  1YKZ X;  3A3Q A;  4KXI A;  3RW8 A;  2DQI Y;  1CKG A;  4WO9 A;  2AUB A;  3LN2 A;  2Z38 A;  4H8X A;  3ZEK A;  1LZ8 A;  2YBI A;  3AJN A;  4J1A A;  3SP3 A;  4BAF A;  5KXO A;  1AKI A;  2YSS C;  3CSR A;  3ZVQ A;  4E3U A;  4H9I A;  4N0J A;  2Q0M X;  1BQL Y;  1YAQ A;  1A4V A;  1VED A;  3WU7 A;  1BVX A;  1YAM A;  4XJI A;  4NGV A;  4WM4 A;  3W6B A;  5II3 A;  1OP9 B;  1B5X A;  1HHL A;  4DD3 A;  1B7M A;  4LT0 A;  4WM5 A;  2EIZ C;  1F6S A;  4BAP A;  1UIH A;  1EQ4 A;  1LZ9 A;  1GBY A;  2Z37 A;  4G4B A;  4WM1 A;  1LZG A;  1ZMY L;  4WM2 A;  1HSX A;  2BAA A;  2ZWB A;  5LAF A;  5KXZ A;  5C6I A;  1JTO L;  3AGH A;  2H9K A;  1LJK A;  1HEQ A;  3OK0 A;  1WQP A;  3BKH A;  4ZFP A;  1G7M C;  1BWJ A;  3AZ6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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