4L5VA

The structural implications of the secondary co2 binding pocket in human carbonic anhydrase ii
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKLRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Structural, catalytic and stabilizing consequences of aromatic cluster variants in human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2013-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4l5vA00
5FL6A 2WEOA 4M2WA 4Q6DA 1G52A 1G3ZA 3IBIA 3RG3A 1CRAA 4WW6A 3KONA 3RZ0B 5BNLA 2GD8A 3GZ0A 3DCSA 3MNAA 3M04A 1CAOA 5SZ4A 4ITPA 1G6VA 1H9NA 1YDDA 2QOAA 3MNHA 1CNCA 3TVNX 4HEZA 4YGKA 1ZGFA 4WUPA 4M2RA 3NI5A 1CNXA 3MMFA 1I9QA 2FOQA 3MDZA 3S74B 2FNMA 4KUWA 2FNKA 4QSJA 5SZ6A 2WEHA 3P5AA 3LXEA 4CNXA 4FVNA 1YO1A 3MNUA 1FQLA 2FOYA 4QK1A 3DV7A 4QJOA 4LU3A 4Z0QA 1ZSCA 5FNGA 5DSPA 3S8XA 2CBEA 4ZX1A 1CNBA 3IEOA 3ML2A 1DMYA 1BNMA 2HKKA 3P58A 3M96A 4FPTA 5CLUA 2FW4A 4ZWXA 3DA2A 4E3DA 3FE4A 3M67A 3FFPX 1CILA 2FOUA 4QTLA 3W6HA 2FOVA 1I90A 3N4BA 5JQ0A 5SZ1A 1OKLA 5BRUA 1YDCA 4E9OX 3DBUA 5SZ2A 4Q0LA 3KOKA 3RYYA 3DAZA 2EZ7A 5E5UA 3OY0A 5FLTA 4RH2A 4M2VA 4Q7VA 3RGEA 1G53A 4YGNA 2POVA 5DSQA 1UGAA 3KOIA 4E49A 3S73B 3DD8A 2F14A 1ZSAA 3P5LA 4KNJA 2FMZA 1UGBA 2QP6A 3HKUA 3RG4A 4ILXA 1A42A 1BCDA 1YDBA 3EFIA 1G1DA 3DVDA 2GEHA 1ZFQA 3RYJB 3S72B 4KP8A 5A6HA 1FSQA 1HVAA 3KIGA 4Q81A 3M1QA 3S97A 9CA2A 4Q07A 4DZ7A 1AZMA 1CAZA 3HLJA 3DD0A 5FL4A 5E5RA 5DSIA 2POUA 4K1QA 3L14A 1CCUA 1CCSA 1IF7A 1RAYA 3D8WA 4XZ5A 1KEQA 3CZVA 4QY3A 4TWLA 1UGFA 3OIKA 3PJJA 5A25A 5E2RA 4RIUA 2QO8A 5EOIA 1BNNA 3IBLA 4MLXA 1ZH9A 3RZ8A 1CAIA 4C3TA 1I9PA 2NNVA 3K2FA 1FSNA 5SZ5A 3FW3A 1MOOA 4CACA 4ETQC 2Q1QA 1CAMA 4IWZA 5G01A 3MHMA 1CRMA 1CALA 1OQ5A 5EH7A 4WL4A 3S9TA 1IF4A 1AVNA 4RIVA 4QJPA 1ZFKA 4UOVA 4Q49A 5JG5B 1V9EA 1TTMA 2WD3A 1IF5A 5E2KA 3MNKA 5CJFA 5EH8A 1KOQA 2Q38A 5C8IA 3IAIA 1G0FA 3RZ7A 5DSOA 3V3HB 3V3IB 5EHEA 3MHLA 3KWAA 1HCBA 4Q9YA 5EKHA 5FLQA 4KNIA 3F4XA 1BICA 4Q7WA 2Q1BA 3DCCA 3D0NA 5G0CA 3F7BA 1BN3A 4LP6A 5AMLA 4MTYA 4E5QA 2NWOA 1ZNCA 2NXRA 4MDGA 4PQ7A 2NWPA 2EU2A 3IBNA 3M2XA 1CVDA 4QJXA 5DVXA 2WD2A 4ZWZA 3IGPA 1TG3A 1ZE8A 4Q87A 1FQRA 2ABEA 3R17B 5FNLA 12CAA 1I91A 3HKTA 1BZMA 1IF9A 1CNJA 1G45A 3PO6A 4GL1X 4MO8A 4BF6A 3D92A 1V9IC 3T85A 2CBDA 2X7UA 3K34A 4HT2A 5SZ0A 3OYQA 5DSLA 4HT0A 5BRWA 5L6KA 1CCTA 4K0ZA 3TVOX 1YO2A 4BF1A 1RZDA 2HOCA 4Q7PA 3W6IA 3D9ZA 3MHIA 1HUHA 3V3JA 5DSJA 5SZ7A 1I8ZA 3ZNCA 3M2NA 3U47A 1T9NA 4Q09A 1LG6A 1F2WA 1LGDA 4HU1A 4L5UA 5DSNA 5JGTB 5FLPA 4YWPA 4Q8XA 4CNWA 5JQTA 5FNHA 4YXUA 2HL4A 1I9NA 4RFDA 1G4JA 2NNOA 3PYKA 4KUYA 1IF6A 1JCZA 3CAJA 5HPJA 4YGFA 5DSRA 4QJMA 4E3GA 4WUQA 4XIWA 4Z1JA 1FLJA 1XQ0A 2OSMA 1UGEA 1CVEA 1CAJA 2ZNCA 3M40A 2CA2A 1BNWA 4LHIA 3V2JA 1HEDA 1KWRA 3M1KA 4G7AA 4R59A 3MHCA 4QIZA 1Z9YA 1FQNA 4RN4A 5BRVA 3C7PA 2HNCA 3M2ZA 4N16A 5E2SA 2FMGA 1DMXA 4N0XB 3M5SA 3S77B 1TEUX 1TBTX 3SBIA 5JEGB 5EHVA 4QJ0A 7CA2A 4QJWA 1UGGA 3KS3A 4MDLA 3U45X 3V3GB 1CNWA 4PYYA 5DOGA 1Y7WA 4FU5A 5JGSB 1FQMA 3Q31A 5FDIA 3BL0A 5CACA 4Q7SA 1XEGA 1TE3X 2NNSA 5DSMA 3OILA 1FR7A 4XE1A 3OKVA 3M98A 2H4NA 5JDVB 5FNJA 3ZP9A 1CA2A 3V5GA 1G54A 3U7CA 1BNVA 4Z1NA 1RZBA 5E2MA 1LZVA 3M5TA 4FVOA 4CA2A 4K0SA 1G48A 3EFTA 5EKJA 5FNKA 4Q6EA 3P55A 2AW1A 3KNEA 1CAKA 3HS4A 4CQ0A 4Z1EA 5EH5A 1CNIA 3JXHC 4Q08A 4KP5A 2WEGA 4WR7A 3RYVB 4JSSA 4L5VA 1XPZA 2X7TA 2NXTA 1I9LA 4KNMA 3MHOA 1BN4A 5FNIA 2AX2A 2WEJA 3DVCA 5DOHA 3S76A 1CVBA 3HFPA 5G0BA 3F8EA 3RLDA 3OIMA 4HF3A 4QK2A 5FNMA 4RUZA 1HUGA 1XEVA 3MYQA 3RZ5A 4ZX0A 3TMJA 5L3OA 3NJ9A 1OKMA 1RZAA 1H4NA 1LG5A 4KUVA 4RUXA 3RYXB 1KWQA 4E3HA 1CNKA 1URTA 5G03A 4YXOA 1Z93A 2CBBA 3K7KA 4Q90A 2FNNA 2CBCA 2NMXA 4QSBA 4XFWA 2W2JA 3DC9A 4YGLA 4TWMA 4G0CA 3HKNA 1I9OA 1RZEA 1FSRA 4QEFA 3P44A 2EU3A 4YGJA 3NB5A 5CA2A 3F7UA 3T5UA 3D93A 4Z1KA 5E2NA 3RYZA 1THKA 2HD6A 4L5WA 1OKNA 1CNGA 3N2PA 5JEHB 4Q8ZA 1CAHA 4RUYA 1CAYA 1H9QA 4JS6A 5FL5A 4X5SA 3T82A 4R5AA 1FR4A 5FDCA 5SZ3A 4Y0JA 1JD0A 5J8ZA 1BNUA 4E3FA 4WW8A 1CVAA 3S78B 1ZSBA 4Q99A 4FIKA 4KV0A 4KNNA 2NXSA 4Q83A 3B1BA 3IBUA 5DRSA 2CABA 2POWA 3P3JA 5IPZA 5JESB 5EIJA 2ILIA 8CA2A 1I9MA 4YXIA 4PXXA 3CA2A 5DSKA 2OSFA 1TH9A 1ZGEA 3MWOA 5JEPB 2NNGA 1CNHA 1TB0X 3P3HA 1MUAA 3DC3A 3SAPA 4ZAOA 3M14A 4HBAA 2NWZA 1RAZA 4PYXA 4Q78A 4QSIA 5FLRA 3ML5A 4YX4A 3T84A 5AMGA 3V3FA 1CNYA 2NN7A 1HCAA 4JSAA 1CVFA 1JV0A 1YO0A 3CYUA 3S75B 4IDRX 5AMDA 4ZWIA 3B4FA 1IF8A 2O4ZA 1CZMA 3MNIA 1RJ6A 4BCWA 3S71B 4CNVA 3N3JA 1CIMA 3SBHA 3UYQA 4KAPA 3UYNA 4MLTA 5EHWA 3U3AX 4E4AA 4HEYA 3KKXA 1KOPA 1BV3A 3RJ7A 3M1JA 2VVAX 4CNRA 1RJ5A 4FL7A 5EZTX 3M3XA 4XIXA 5JG3B 3HKQA 4JSWA 4K0TA 3DVBA 1TEQX 3M5EA 3OYSA 5FLOA 4PZHA 5EKMA 4DZ9A 4JSZA 4ZWYA 2NN1A 6CA2A 3BETA 1BNQA 2X7SA 1BNTA 3BL1A 1HEAA 1LUGA 1G46A 1UGCA 2FOSA 3JXGA 1DCBA 5LMDA 4MDMA 3P4VA 2HFWA 1HECA 1CA3A 4YVYA 1CVCA 4RFCA 3KLDB 1CINA 1CANA 3N0NA 4K13A 4Q06A 4QSAA 2VVBX 4R5BA 3M1WA 3T83A 2H15A 3JXFA 3T5ZA 1TG9A 2NWYA 1RZCA 3V2MA 4HEWA 1G0EA 1AM6A 1J9WA 3M2YA 1HEBA 1G4OA 4COQA 1EOUA 1DCAA 3SAXA 4M2UA 4Q8YA 3QYKA 3R16A 4YHAA 3MNJA 3MZCA 4QK3A 4ITOA 4FRCA 5BYIA 3V7XA 1YDAA 2IT4A 5E28A 5FLSA 3VBDA 1BN1A 3DCWA 4YYTA 3RZ1B 1Z97A 1UGDA 3OKUA 4QIYA 1CVHA 2CBAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5FL6 A;  2WEO A;  4M2W A;  4Q6D A;  1G52 A;  1G3Z A;  3IBI A;  3RG3 A;  1CRA A;  4WW6 A;  3KON A;  3RZ0 B;  5BNL A;  2GD8 A;  3GZ0 A;  3DCS A;  3MNA A;  3M04 A;  1CAO A;  5SZ4 A;  4ITP A;  1G6V A;  1H9N A;  1YDD A;  2QOA A;  3MNH A;  1CNC A;  3TVN X;  4HEZ A;  4YGK A;  1ZGF A;  4WUP A;  4M2R A;  3NI5 A;  1CNX A;  3MMF A;  1I9Q A;  2FOQ A;  3MDZ A;  3S74 B;  2FNM A;  4KUW A;  2FNK A;  4QSJ A;  5SZ6 A;  2WEH A;  3P5A A;  3LXE A;  4CNX A;  4FVN A;  1YO1 A;  3MNU A;  1FQL A;  2FOY A;  4QK1 A;  3DV7 A;  4QJO A;  4LU3 A;  4Z0Q A;  1ZSC A;  5FNG A;  5DSP A;  3S8X A;  2CBE A;  4ZX1 A;  1CNB A;  3IEO A;  3ML2 A;  1DMY A;  1BNM A;  2HKK A;  3P58 A;  3M96 A;  4FPT A;  5CLU A;  2FW4 A;  4ZWX A;  3DA2 A;  4E3D A;  3FE4 A;  3M67 A;  3FFP X;  1CIL A;  2FOU A;  4QTL A;  3W6H A;  2FOV A;  1I90 A;  3N4B A;  5JQ0 A;  5SZ1 A;  1OKL A;  5BRU A;  1YDC A;  4E9O X;  3DBU A;  5SZ2 A;  4Q0L A;  3KOK A;  3RYY A;  3DAZ A;  2EZ7 A;  5E5U A;  3OY0 A;  5FLT A;  4RH2 A;  4M2V A;  4Q7V A;  3RGE A;  1G53 A;  4YGN A;  2POV A; 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