4L8EA

Crystal structure of a glutathione transferase family member from xenorhabdus nematophila, target efi-507418, with two gsh per subunit
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
203
structure length
203
Chain Sequence
b'IDLYYAPTPNGYKITLFLEEVGLPYTIHPIDISAGDQFKPEFLAIAPNNKIPAIVDHQPDGGGEAISIFESGAILLYLANKTGRFLSKDTRERTEQLQWLFWQVAGFGPMLGQNHHFNRYAPEVVPYAIKRYTEESQRLYKVLNTQLEKTPYLGGNEYSIADIAVYPWAKCYEHQKINLEDYPAVKKWLEKIQQRPATQAAYN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a glutathione transferase family member from xenorhabdus nematophila, target efi-507418, with two gsh per subunit
rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase enzyme with thioredoxin-like domai
source organism Xenorhabdus nematophila
molecule tags Transferase
total genus 76
structure length 203
sequence length 203
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-06-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4l8eA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4l8eA01
2A2SA 1ILOA 4EE0A 1WE0A 4YQMA 4QQ7A 2GT6A 2JSYA 3ZIJA 1MTCA 2V41A 4ZILA 2IMKA 1S3CA 4FO5A 2C3QA 1SJZA 5G1LA 5HFIA 1SK1A 2PVOC 2HZEA 4BVYB 5A4VA 4ZL9A 5GSSA 4JBBA 2H0HA 5CP1A 4NXIA 4ECJA 3ERWA 1LJRA 3W6GA 4NHZA 1YJ6A 4WKWA 4LMWA 5IMZA 1JFUA 3FW2A 5DALB 4PURA 2F9SA 3MAKA 4XIHA 1WRYA 2NTOA 5FT3A 4ULXA 2YZHA 3I9V2 3FZAA 2K18A 5EY6A 2IN3A 4I5QA 3TB2A 2TRCP 3F0IA 1JLWA 1GRXA 2DC5A 4NHWA 1XOAA 1ZL9A 4KB3A 4TR4A 5F0GA 2B1LA 18GSA 2FWHA 2HRAA 2PVQA 1BQ7A 2JZRA 5IPGA 3VWXA 5IIZA 4BWQA 2F51A 4MJBA 3ZZXA 2G0FA 1OAZA 5HFGA 1VGLA 5G5FA 2LJAA 1QUWA 2YZUA 2HZFA 2JACA 4TR0A 3DYRA 3UARA 2HSNB 4HEA2 3FK8A 3IRAA 4G0LA 3IAS2 2FNOA 3DGQA 2IL3A 4PUFC 4LL1B 1X9SB 3GNJA 2ON7A 5G30A 5ECSA 3EURA 4FYUA 5GSTA 3NOFA 2GSQA 4FQUA 4PQIA 4PQ1A 3DRNA 1TJDA 5DJLA 1ZMAA 2EIQA 2C8UA 1OC3A 1HNBA 2L4QA 1NHOA 2YP6A 1JLVA 2H75A 1J9BA 1EV9A 3QMXA 2YJ7A 1PKZA 2H8LA 2R37A 1F6MC 1M2DA 1XFLA 1BG5A 3HVSA 1F37A 1A0RP 4OMVA 2K6VA 3DMLA 2V6KA 3K8NA 2ALBA 4JR4A 1AAZA 5A4UA 3LJRA 1NHYA 1ERVA 4EDZA 1ZOFA 3A2XA 1F9MA 1FAAA 3TOUA 4NPBA 1SL0B 3LXZA 2BTOT 4GQCA 4OO5A 2DJJA 3QOUA 2K8SA 2VUPA 3HZ4A 3S9FA 3G7YA 4WBRD 2B5EA 3MNGA 2VCTA 4IVFA 4GCIA 3D4TA 2C0FA 3RAZA 3D0ZA 3CTGA 4RI7A 5DCGA 2MMZA 3IPZA 4FYCA 2VCZA 2VL2C 5CRWA 3GN3A 2GZYA 3DVXA 5D9XA 1B8XA 1WIKA 4XS4B 3UBKA 2H30A 1SU9A 3F4RA 3GKNA 3F4TA 3DVWA 2H0GA 1SYXA 2VCVA 4POMA 3IC8A 4ML6A 5KEJA 1MD4A 1BYEA 2HRKB 4I2TA 1XWBA 4J56E 4K6XA 2TRXA 2LNSA 2YPMA 3QCPA 5ABRA 2ON5A 3GTUA 2DIZA 16GSA 2GS3A 1OC9B 4K7IA 4YH2A 4F2IA 1HNAA 3EU3A 1K0NA 4K2DA 4F03A 2X64A 1DUGA 4ML1A 4DEJA 4N0VA 4HS1A 1ST9A 1T1VA 2L59A 2FHEA 3GSSA 4GRFA 4I8BA 2HE3A 2PERA 3RHCA 4RQXA 4F9ZA 1AQWA 5DQSA 2FWFA 9GSSA 3TRXA 2H76A 1JZWA 3VK9A 1F3BA 2CVDA 5E4WA 1Z3EA 2I3YA 2R2JA 4AJ7A 3DD3A 3GMFA 3IV4A 4CW9A 3Q18A 3QR6A 4BVXA 1X0RA 3APOA 1GUKA 3W8SA 1PX7A 5F05A 2F8AA 2IMIA 4RQRA 5B8AA 3F3QA 4F82A 1XBSA 1EP7A 2CAQA 4MDCA 4POBA 1LU4A 4V2LA 3C73A 5GZZB 2GQLA 3HHVA 3UVHA 2NVLA 2N5FA 1XOBA 4GQFA 1J08A 1O73A 5D93A 1V40A 2NBSA 1B9XC 5ECIB 2CAIA 2B5YA 3CMIA 3GX8A 5D96A 3BJ5A 4Q5FA 1GTBA 1OVNA 3F63A 3VURA 4IJIA 2KOKA 4N10A 5H5SA 2VM1A 3IA1A 4FIWA 3ERGA 3TJFA 4K9ZA 3O76A 1B48A 3PR8A 2VLVA 3QAWA 1GH2A 3FR3A 5A4WA 3EINA 5ECOB 2HSMB 2C1YA 1GP1A 3D5JA 1OC8A 5DBQA 1M0UA 3UOMA 2EC4A 3ZVJA 4K7OA 3FR9A 1FW1A 2OE1A 2AJQB 2H6ZA 1FG4A 4TVEA 4ECCA 2X8GA 1WP0A 2RUEA 4ZL8A 3NIVA 3RPNA 1TW9A 1R26A 4IQ1A 2PGTA 1Z6MA 3GA4A 5KN1A 5DDLA 3CSJA 1A24A 3QFAC 4ACSA 3PINA 2VD1A 4KDYA 6GSUA 1CQHA 3UEMA 2LNTA 2E2GA 4JR6A 1XW6A 3EVIA 2OBKA 3UJ1A 4PQHA 3RPPA 5JCGA 2CV4A 4G9HA 1AXDA 2OE0A 1TDIA 1SKRB 3F3RA 1JZDA 2LS5A 4NMUA 3VPTA 5J5NA 5IMVA 4KGIA 3BCIA 2HXKA 2B7JA 22GSA 5AIXA 3VPQA 1A2LA 1VRSD 2E7PA 1GUHA 3EYTA 3ME7A 5ECQB 1AW9A 4XRAA 4IQAA 3G9BA 4IELA 5EL8A 4WBJA 4IKHA 4MJCA 4I2UA 2PWJA 4QL9A 1WMJA 2VOCA 5B6NA 1VF1A 3M3MA 2P5RA 2KUCA 2VLUA 3IR4A 2R4VA 3CRUA 4MF7A 4O5RA 2FCHA 4X1UA 2CVBA 3FKFA 4DSQA 1XWGA 5ECNB 17GSA 2DBCA 1HYUA 2IMEA 1WWJA 2G2QA 1ERUA 4ID0A 2H74A 4OO4A 4TW5A 3GSTA 3QDNA 3EU4A 2HI7A 1ON4A 4BVYA 4YAVA 4QL7A 3FRCA 1M9AA 3CSIA 3F8UA 12GSA 1XPVA 5IMFA 5G5EA 1PL1A 4KCEA 3VWUA 4PNGA 2C4JA 4XS6A 1PKWA 2PMTA 5JWOB 5DALA 3IC4A 4IJ3A 4NV5A 2L4CA 5DAKB 2H1BA 1O85A 13GSA 1HD2A 2WS2A 5C04A 3KM6A 3WGDA 3VWVA 1AUCA 4HZ4A 2YN1A 5CAXA 1F3AA 3GRXA 2E2MA 3KCMA 4HU7A 1O81A 5CRHA 1ERWA 2OBIA 5DJMA 4XRDA 1O8XA 1N2AA 2N5BA 2GQKA 1GSFA 2MZCA 1QQ2A 3IK9A 1TTZA 3CRTA 2DJKA 3L4NA 1A8LA 1G7EA 3A2VA 5AN1A 3HJMA 3CBUA 2F8FA 4K0GA 3G7JA 1GNEA 1GTUA 3EWLA 3KTBA 4K1FA 2CZ2A 5GAPD 4ISDA 5HR0A 3PPUA 2I1UA 3I43A 1K3OA 3O3TA 1EGRA 3DEXA 2HNLA 2PBJA 4MPFA 1H4OA 3M1GA 1XIYA 5KN0A 1XWAA 2XHFA 2F3MA 2V32A 4ZBAA 4EF0A 2C3NA 4TOPA 4IGJA 3M9KA 4XS1A 2VCWA 2L5LA 2CT6A 3F4SA 3UVTA 3HKRA 1FB0A 1A0FA 4GXZA 4KA0A 1VF4A 2MYGA 3KJYA 1ERTA 1K0BA 1TK5B 4WXTA 1DE1A 4GSNA 5IQYA 4EKZA 1GUMA 1A2JA 3L9VA 2H66A 1Z7RA 1A8YA 3TJBA 4MH2A 3GKXA 1K0DA 2RIIA 5EVOA 1FVKA 2H0IA 1J0FA 4IHUA 3A2WA 1OE7A 2QC7A 1U3AA 2BMXA 2A2RA 2LSTA 1MEKA 1GWCA 4BA7A 2H1GA 3R3EA 3N5OA 3BD2A 5E59A 2FY6A 1B9YC 1TXXA 1X9WB 3APQA 3MWHA 2O7KA 1MDKA 3KZQA 3WGEA 2V2GA 1O8WA 3UAPA 1QFNA 4BL7B 5FHIA 4MH3A 5CRDA 4ECIA 1T4ZA 2H71A 1W89A 3WGXA 2FWGA 1NM3A 5IO2A 2M72A 3IXRA 4TR1B 3KMNA 5CRGA 5ENUA 1EZKA 4G0KA 4XS4A 4EUYA 3L9SA 2H6YA 4D73B 4PX1A 3R2QA 4ILFA 3GH6A 2WB9A 1GSYA 2HRKA 2N5AA 3N9JA 2LRCA 4MF5A 3HYPA 1OE8A 2VL2A 3FEUA 2H01A 1OC9A 1RQMA 2H72A 1VF2A 4WETA 5JCWA 2FGXA 3HZ8A 3P7XA 4LMVA 4EL1A 1C72A 1SJIA 2I81A 5J9BA 2WRTA 1GLPA 5J41A 5H5RA 2GDRA 3EE2A 3TCOA 3HA9A 3W8JA 1TKDB 3H79A 1S3DA 3GIXA 1ACVA 1XWKA 2FA8A 2DSAA 2IWTA 2RM6A 3D21A 4MABA 4IN0A 1IYIA 3J7Yb 3P8WA 4KAEA 4E8EA 1M2AA 1NW2A 3ERFA 5DVBA 1Z7PA 4POLA 1M2BA 1N8JA 4N30A 1SENA 3TJJA 1GSDA 1JZRA 1TK8B 2WULA 1UVZA 3VLNA 4EVMA 4O7HA 1GSSA 4K7NA 4Q5QA 4PTSA 3GKMA 5G2ZA 4MMMA 1Z9HA 2FUG2 4HJ2A 1BX9A 3UL3A 2FD3A 1ZZYA 2MMOA 1HNCA 3IHQA 4PNFA 2LKUA 3C1SA 4ZBBA 1FVJA 2MMNA 1XW9A 2GSRA 1Z6NA 3AY8A 4RUVA 1O7UA 2YCDA 3KD0A 3KP9A 4EXJA 4GLTA 3HY2A 3HJOA 1XWCA 4L0UA 5G1KA 2HSMA 1M99A 3F9UA 4MZCA 1G6YA 2MMAA 2VO4A 2OA7A 1UC7A 3GH9A 3TKRA 1JHBA 3LFLA 5JCUA 4AF2A 4RI6A 1V98A 6GSVA 3ISOA 2RM5A 1SKSB 2YANA 3SWLA 2H6XA 2YWIA 3IOSA 5ECMB 3G7IA 4KW6A 1KTEA 2M46A 3LQ7A 4CDOA 3HXSA 3A5WA 3P2AA 3LXTA 3OR5A 3ZIVA 6GSXA 2EIRA 3BCKA 2P5QA 2X8HA 1G7OA 2HSHA 1GSEA 4GTUA 4WR5A 4Q5RA 1KEBA 1NSWA 5IMDA 5ID2B 3C1RA 1SK2A 4K0NA 1EV4A 5IO0A 3H4KA 4IW9A 5KN3A 2ZUPA 2IPAA 1TRWA 3GUSA 3TKSE 1F2EA 3MDKA 3NZNA 1U3IA 2IFQB 1GNWA 5KN2A 2TIRA 3ME8A 4F0CA 5B6MA 4OFNA 5B7CA 4G10A 4AGSA 4NV2A 2LRTA 2P31A 1SL2B 1T7PB 5LD0A 2KP2A 3LSZA 2WGRA 4GSTA 4JEDA 1IYHA 2JU5A 2YJHA 4EC0A 1XVQA 1SK0A 4HOJA 4ZIJA 3Q19A 1EP8A 1VF3A 4V1Ag 1OKDA 3ZREA 2H1DA 3EC3A 3LORA 1BEDA 2XPEA 5IPHA 4YQVA 3LEFA 2GT5A 1K0CA 4HU9A 1K3LA 1AQVA 1EEJA 3DIEA 1G0TA 3TKSA 4LA1A 4N11A 2LTKA 4OCFA 1ZGNA 2CX3A 2IIYA 3TRPA 4HI7A 4HUAA 2AUVA 3ED3A 2OKAA 5CO3A 2K8VA 3Q74A 1YEPA 1RK4A 2B3SA 1QK8A 3GX0A 2HFDA 3TKSC 5IOXA 2AB6A 1XXUA 3KXOA 3C7MA 3ZL5A 5DQYA 4MLYA 1DSBA 6GSYA 1GTIA 3O6TA 4POKA 1THOA 3ZTLA 2YV7A 3GL5A 4JE1A 5DAKA 3TKPA 2OADA 2ZCTA 2GZPA 3GL3A 2L6DA 4KSOA 4PGTA 2PU9C 3LYKA 2RLIA 2FA4A 4XTSA 5LNKe 2HRFA 4P3YB 1AIUA 4TXVA 1V9WA 4OD7A 4TRXA 5D9TA 2C80A 2O87A 3BOAA 2WJUA 3TJGA 2LQQA 1YZXA 2IMFA 4K8MA 2D2ZA 4MJEA 2AAWA 4Q5NA 1UN2A 3F6DA 3ZVJD 4USSA 4L5LA 2B6MA 4ZB6A 3DKSA 1Y6EA 5AIVA 1OKTA 2K9FA 4DVCA 1GLQA 3FYGA 1W4VA 3CYNA 4HQZA 4WF5A 3WYWA 4JZQA 4DSSB 5ELGA 2CVKA 1K0MA 1PA3A 1R4WA 4O92A 2V1MA 4WF4A 5C00A 4GF0A 2C0DA 4EDYA 2M80A 4IBPA 1SD9A 5L71A 1GL8A 3TRQA 3TDGA 2CZ3A 3KIJA 1BAYA 1KBNA 4TXOB 3GFKA 2L57A 7GSSA 5JWRB 1U87A 1HQOA 3H8QA 3ZFLA 4IP6A 5F07A 1QGVA 3VWWA 4ZB9A 5IMCA 1A2MA 2HLSA 4KUNA 4CHSA 3HDCA 14GSA 1PL2A 3ZMLA 2PPTA 4Z7XA 5D9WA 4J57E 1SYRA 2AHEA 1TI1A 5G31A 4NAXA 1EOGA 2HT9A 4F0BA 2R3XA 2JL4A 4MK3A 5ELAA 4TKYA 5BMUA 3HCZA 10GSA 2MBTA 2FLSA 4HZ2A 4MF6A 1KNGA 2O89A 1YQ1A 1ABAA 3ZMKA 3TUEA 2O85A 4MCUA 3A3TA 1PRXA 1SD8A 4L5OA 1PN9A 4BL7A 5H5QA 3KMOA 2O8VB 2VL9A 2YWNA 5AGYA 3M8NA 4WR4A 1RW1A 3IE3A 3TJKA 2VCXA 2GZZA 1Z5YE 4HQSA 3L78A 2HZEB 4TR1A 3IBHA 4TN8A 4MPGA 2B5XA 2LJRA 3LYPA 3QPMA 3UMAA 1CQGA 1H75A 1YKCA 3BBYA 1S3AA 1YF1A 2PN8A 8GSSA 3TGZA 3HVXA 3PH9A 1EEMA 5COHA 4D73A 4GSSA 3GHAA 2LRNA 1FO5A 1R5AA 5EPFA 4LL4B 6GSTA 4DSRA 4J2FA 1T4YA 3E3EA 2L6CA 2GSTA 2E0QA 1PMTA 3H93A 1Q4JA 3US3A 2JADA 1E2YA 2BJXA 3UIWA 3QAVA 1Y25A 1T00A 4HDEA 3KP8A 1B4QA 4EO3A 5F06A 1SL1B 4G19A 2H1AA 2VM2A 3ZRDA 2DLXA 5HFKA 2XBIA 4KH7A 5J9CA 3TKQA 2VL3A 3CXGA 2C3TA 2VAFA 4IP1A 2CX4A 2RUFA 2UZ8A 5AISA 1K0OA 2FWEA 2LEGA 1V58A 2HRNA 4V2NA 20GSA 2LJKA 3EMXA 4LLRA 1PGTA 1XCCA 6GSWA 2PUKC 3ZLPA 4OFTA 2XPDA 2KP1A 3APSA 2YNXA 2GTUA 2JSZA 3JCML 1TRUA 2DMLA 3EMPA 3J7Yk 5D9VA 3UBLA 1I9DA 5A5KA 4L0WA 5ECHB 3ZFBA 3LGCA 2OE3A 2XC2A 1SKWB 3U5RE 2DMMA 2GSSA 3SBCA 5ECKB 1QXHA 3DWVA 2YWOA 3HVVA 3GKKA 1ZYEA 2WFCA 4L8EA 1X5CA 2WZ9A 3CSHA 1FHEA 1YEXA 3Q6OA 2R6KA 2H70A 6GSSA 2VIMA 1M7TA 5IOWA 3E0UA 5LCZA 19GSA 2MBSA 2XBQA 4WEYA 2P0GA 1JZOA 4PXOA 1YF0A 3I6AA 11GSA 3WT2A 5GAND 5CYYA 2HQTA 3QAGA 5FWGA 2R5GA 4FH8A 5ECRB 3KH7A 4G2EA 4XHMA 1TU7A 2ZNMA 3KH9A 1ZYQB 3M0FA 3GURA 3L0HA 2YV9A 5F8BA 1EOHA 1I5GA 2NDOA 5IMAA 5B8BA 3QD9A 1FOVA 3RDWA 3KEBA 1MD3A 5ID2A 4JRRA 1URMA 1PQNA 2KHPA 1E6BA 4IS0A 2HYXA 4I97A 2GVPA 3D4MA 3LG6A 3FHKA 3IAM2 4H86A 1PSQA 2QSIA 2DJ1A 4MP4A 2IFQA 2QGVA 5DCHA 1YY7A 3IDVA 2J23A 1PX6A 4KDXA 1AC1A 4JU5A 1BJXA 5D8IA 3D22A 4KX4A 1XZOA 2REMA 2B1KA 5J4UA 2VCQA 2X99A 1XVWA 2GGTA 4NWYA 2LUSA 4XCSA 1GSQA 4BPYA 4MZWA 1GULA 1Q98A 2IJYA 1X5DA 3GTUB 3M9JA 2ES7A 1QMVA 3RBTA 2OACA 3GYKA 2CQ9A 1YKAA 1GTAA 2LV3A 5CREA 1EWXA 3ZITA 2IMDA 3HD5A 4ZB8A 2NPBA 3F6FA 1R7HA 4I6XA 5HR1A 1YDKA 1TRVA 3ZYWA 4KDUA 1A23A 4OCEA 4ZBDA 1WOUA 1V2AA 4ZXGA 1ZCPA 1G6WA 4V1Ap 1EGOA 3VI5A 1U88A 1M9BA 5ECPB 3MSZA 1TU8A 1X9MB 3H1NA 3FY7A 1K0AA 3PGTA 5ECLB 4BVXB 3VFIA 4HJMA 2A4VA 2X8CA 3LWAA 4KCAA 3U6VA 4X43A 4ZL7A 2WDUA 3WT1A 1UA5A 1SJ6A 1V57A 3QFBC 3IK7A 4G0IA 1TOFA 2L5OA 2VD0A 2QKEA 3I69A 1USBA 1TI3A 4AJ6A 4ECBA 1LBKA 3FR6A 5INYA 5IM9A 3DXBA 2WCIA 1XW5A 4FYBA 3E9JB 2DJ0A 1PD21 2J9HA 3FZ9A 2DJ3A 1MDJA 2V6OA 3P90A 4KE3A 4BWSA 1THXA 4MJAA 2JZTA 1O6JA 2DIYA 2AYTA 2YWMA 4X0XA 5HR2A 2GQMA 5CNWA 4TR3A 2Z9SA 1T3BA 1U6TA 1GSUA 3FZ4A 3TOTA 3WD6A 3KGKA 3HJPA 4DSSA 2I4AA 4KNDA 1TK0B 1WJKA 2JZSA 3GV1A 4KSMA 2C0GA 1DE2A 4GWRA 4OFMA 4OWYA 2OJLA 5J3RA 3C8EA 3VI7A 1FB6A 3RHBA 5HQPA 1WPIA 4TXOA 2AV4A 1R5PA 2GLRA 4O32A 3FZ5A 1OYJA 3V1WA 4MA9A 1K3YA 1B4PA 2HSYA 4V2MA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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