4LAPA

Endothiapepsin in complex with thiophen-based inhibitor sap114
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Endothiapepsin
publication title Endothiapepsin in Complex with Thiophen based Inhibitors
rcsb
total genus 85
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2013-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4lapA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4lapA01
4NJUA 4Y5AA 5P7WA 1HPVA 1HXWA 5CONA 5P58A 3QI1A 2OHQA 1D4SA 2VKMA 4MC9A 2VJ9A 4Y53A 3VF5A 5P68A 1IIQA 3O99A 3U71A 1SMRA 3OWNA 2XFJA 1FQXA 3BUGA 3GGAA 5P8QA 1ENTE 4QJ8A 4CPTA 4Y3RA 4B0QA 2P4JA 3G70A 5P6PA 1QBSA 3PGIA 4FM8A 4PEPA 4RCDA 5DGWA 3DM6A 2B8LA 1IBQA 5OYVA 1GNNA 1LV1A 5P0WA 2QI4A 4FRSA 5P86A 2R43A 3PI5A 2I4XA 3G72A 4J1EA 3RTNA 5JFUA 3NXNA 4ZPFA 3OUAA 4Y3AA 2AODA 5P5VA 5P8TA 3NWQA 5P4MA 2PWCA 4EXGA 4K4QA 4OD9B 5IVQA 1PPKE 4DJQA 3Q5HA 1OEXA 2VS2A 5OZNA 4Y36A 1RNEA 4Z22A 5P0EA 3LPIA 4QJ6A 8HVPA 5P7NA 5P0BA 1W5VA 3DCRA 2ZHRA 2QK5A 4YD4A 3UFNA 2PH8A 5P63A 1FKNA 3VFBA 3S54A 4L6BA 3DCKA 2OHKA 4JP9A 3NU5A 2R3WA 4MC1A 1EC1A 5SZ9A 4FAEA 2ZHTA 3SKGA 2Q55A 5P4QA 5P7ZA 3FX5A 3K4VA 5P4BA 2WF3A 5EZZA 2F3KA 3VF7A 3QS1A 1TSQA 1J71A 4DQCA 1CZIE 4J5JA 3ZPUA 1NPVA 5DR4A 3KT5A 1GVWA 1HIVA 3FNSA 1YM4A 4MC2A 3S7LA 2IGYA 5OZIA 5P1BA 2AVOA 5OZXA 2ZJJA 2QMDA 1PSAA 3OK9A 5HDXA 4GJAA 1TCWA 1MT8A 5P8UA 1BVGA 4HE9A 5DPZA 3KMXA 5P3SA 5P7RA 2QCIA 6APRE 3VG1A 3HVPA 4I8WA 2O4NA 1LS5A 3D3TA 5OZBA 4J1FA 2QNNA 5AHBA 3K5GA 5P1QA 5P4LA 1ZSFA 5P62A 3RSXA 5OZ9A 1BDRA 3SA6A 3APRE 5IS4A 2VJ7A 2PH6A 3BHEA 4PYVA 4Y3JA 4FM7A 1FG6C 4R91A 5P19A 4DJPA 4RYGA 3L38A 2G1NA 3QVCA 5P4AA 1GVXA 1AVFA 5P0CA 5P2XA 5P8HA 5ENMA 4A6BA 1M4HA 1ZPKA 2ANLA 2QI1A 4Y5LA 1DAZC 2BBBA 4GJDA 5KAOA 5J25A 3GI5A 4S1GA 5P4OA 4HDPA 1NPAA 5KQYA 5IVTA 3OUCA 5OZUA 3IN4A 1YG9A 4I0FA 5P42A 1HSHA 5P1PA 2OHMA 1K1UA 1MVPA 3I25A 1W50A 5OZPA 3I7EA 5P6HA 3UDYA 5P2BA 3OU1B 4FSLA 5JFPA 4Y3FA 3NDXA 3CMSA 3HLOA 4CPRA 3OHFA 4YOBA 1GVUA 4GMIA 3O9LA 4DPFA 1ME6A 4ZEAA 5COOA 3EL9A 5P8JA 4YDFA 4EQ0A 1EPNE 5OZKA 5P7IA 3S53A 2QI6A 5OZ8A 5P28A 5P2UA 1U8GA 2WEAA 1ZP8A 1EPOE 5KQXA 3ZLQA 2VIYA 4Y4DA 5P6AA 5OYZA 3EL4A 2IKUA 5P67A 2BPXA 4CPUA 2OHPA 5P8AA 1M0BA 2WF4A 3O9FA 4JPCA 5P6ZA 5P6UA 5P4NA 5P71A 1EPME 1BDQA 3ZMGA 4GZFA 3UF3A 5P78A 2OHNA 5HCOA 5P24A 1GVVA 4QJ2A 5P5CA 2HIZA 5P61A 5P0VA 3U7SA 3EM3A 2AIDA 4EHCA 4DQEA 5P0GA 5P2MA 3CKPA 2PQZA 1IDBA 3T3CA 1HPXA 1HTEA 1HXBA 5IVSA 4LAPA 3O9DA 2WJOA 1W6HA 1QS8A 3A2OA 5OZ4A 3IN3A 1ZAPA 1W51A 5P4UA 5P7UA 1PFZA 5P6JA 5P36A 5HU0A 2I0DA 1YTIA 1HIIA 5JG1A 2QMFA 4J1HA 4Y4GA 1IZDA 5EZXA 1HVIA 2PYMA 4FRJA 4Y5NA 5HDZA 3PLLA 5ER1E 4HEGA 4Q1WA 3LPKA 5KOQA 1FMBA 3CYXA 1MTRA 2AVMA 5P53A 5P1XA 5COPA 3PWRA 1MT7A 1MIQA 5P3WA 3IGBA 3EKQA 2HM1A 4TRYA 5P70A 4AZYA 5P2SA 3EKXA 5P4RA 5P7AA 1EEDP 5KR1A 1OD1A 3ZPTA 2O4KA 5DQ5A 4D85A 1LF3A 2F81A 2Z54A 3EMYA 1ZJ7A 4OBZA 3BGBA 2Q54A 3R1GB 2FNSA 3O9EA 5P32A 3ZOVA 5P0IA 5OZAA 5P3OA 4RCEA 5OZDA 5P7DA 3Q6YA 2P3DA 3PJ6A 5P4CA 5P4ZA 4ZIPA 3OU4A 4Y5MA 3NU9A 5P4PA 3KMYA 2BKTA 3GI0A 5AHAA 5OZVA 2PSVA 3FSMA 3UQUA 5P5BA 2CEJA 3S43A 3OU3A 5KQFA 2HC0A 3TPPA 5P5PA 3VYFA 4CPQA 4Y44A 5P54A 4DQGA 5P81A 4LP9A 5P6FA 3D20A 5COKA 1BV9A 2G1YA 5P01A 1TQFA 4OBHA 5P3YA 3FV3A 2V0ZC 4NKKA 2SAMA 3S2OA 1HVKA 5P3NA 5P5KA 3LIVA 2V11C 3UQRA 5P6NA 3NWXA 5P4SA 3I2LA 5P3BA 1BBSA 5P74A 3OADB 4K4PA 5P0ZA 2QHZA 3MSKA 3UHLA 2O4SA 1EC0A 5P1IA 5OYSA 1T6EX 3KDDA 1T7JA 4L7JA 1HVSA 1HRNA 4FM6A 5DQ4A 5P6DA 4X2LA 4ACUA 1HTRB 3L5EA 5P11A 5KOSA 1ODYA 4WY6A 4OBGA 3VCMA 5UPJA 1KJHA 2JJJA 2P3BA 2R5QA 3OXXA 4DQBA 3ZL7A 5P0HA 3N3IA 1B6KA 2ZHUA 5P0AA 4YD7A 1K6TA 2G21A 4Y5PA 2RKGA 5P0NA 4WTUA 3PWWA 4ZLSA 2AQUA 1IVPA 3SFCA 4HDFA 5P8GA 5P1SA 1ER8E 5P22A 2QNQA 3S8IA 4NPUA 4OC6A 5P5WA 3BVBA 4GJ6A 5OZLA 5P82A 3UDQA 4RVIA 5P3VA 5P4JA 3ZKSA 1EBWA 5P2YA 3O9CA 3VLBA 1EAGA 3GGUA 2FMBA 4EP3A 4Y3WA 3LIYA 1C6XA 5P5HA 3T7QA 1CPIA 4KB9A 5P6EA 2MIPA 1KJFA 5P89A 2NXMA 2BPYA 4PZWA 5P2CA 1HVRA 4YDGA 5P04A 2BPZA 5AH6A 4ZPEA 4NJSA 1FQ7A 1AIDA 3O9IA 5P57A 2I4DA 2V13A 5P44A 5OZGA 2HPEA 1E82E 5HTZA 1BXOA 2IQGA 3EKPA 3BXRA 2NTRA 2R9BA 3SO9A 5P4FA 4Y4ZA 2FLEA 3TTPA 1FEJC 4Y6MA 5P2FA 2ZJKA 4GJ7A 4AA9A 5P5OA 5P1TA 5P0LA 3OAGB 4ZPGA 5P23A 5P6TA 4ZSQA 3L58A 2R3TA 3I6OA 5P5YA 4Q1YA 3B80A 3SA3A 4I10A 5OYTA 3PCZA 1HWRA 3IVIA 5P27A 1SIPA 1MSMA 5P7TA 5P3EA 1BIMA 2XFIA 5P4VA 5P0FA 3LZYA 1B5FA 3LINA 5P66A 2NNPA 4B1CA 4EJKA 4D89A 1HSIA 1IZEA 3MXDA 2ASIA 5BS4A 5APRE 5P45A 2AVSA 2F3EA 5P16A 5P46A 2ZDZA 5BWYA 2VA5A 3K5CA 5P84A 5P60A 5ISKA 4L1AA 5DQ2A 4R95A 3IA9A 5P4HA 4DV9A 2HS1A 2RKFA 2Q11A 4KE1A 5P7SA 1HHPA 5P6CA 1NPWA 5DR0A 2J9JB 4Y3ZA 4J0YA 3OQAA 5OZWA 4J1KA 4CMSA 4HVPA 4KE0A 5P1UA 2AOEA 5P6LA 5P18A 5P7HA 2WL0A 4U8WA 4Y58A 2I4UA 4GJ8A 3BUHA 1TCXA 4Y47A 1LYWB 2V00A 4OBJA 1OEWA 3NU4A 2WHHA 2HS2A 2RENA 3SABA 5P1DA 5P3ZA 4A4QA 4Y39A 2QI5A 5P02A 5P3RA 5P06A 4MC6A 3PSUA 5P8EA 3UDHA 1Z1RA 1BILA 2HB2A 4PHVA 3EBZA 5P33A 1OHRA 4X7IA 3KDCA 5P38A 3SLZA 1IVQA 3ZPSA 3VV6A 3GGVA 5P7LA 5OZQA 2G20A 3LNKA 3S56A 3VEUA 3L3AA 5P26A 5P14A 4GJ9A 4Y4BA 5P0XA 3EL0A 2H6TA 1TSUA 3NDWA 5DGUA 5P2JA 4EPJA 2Q5KA 4ACXA 3DV1A 5OZ7A 3S85A 4GIDA 2Q64A 1FQ4A 2ZHVA 4TVGA 2ER9E 3MXEA 3HDKA 4FLGA 3URIA 2IRZA 5P8PA 2P83A 5P5ZA 4I0EA 1XN2A 3ER3E 1XE6A 1LYAA 3TNEA 5P6VA 3FNTA 5P77A 5P56A 4J17A 5P5UA 3PBZA 1F34A 5P05A 5P8IA 2ER7E 4RLDA 4Y5CA 3GI6A 4DVFA 3URLA 4H3GA 2IKOA 3FNUA 2QMPA 3OTYA 3UQWA 4NJTA 5P72A 3WZ8A 3ZKGA 4K4RA 5P07A 2IGXA 3CIBA 1EC2A 1FIVA 4Z4XA 1ZLFA 5T4SA 3TOFA 3VV7A 1FMUA 5P2TA 1BWBA 4Q1XA 1YM2A 1BXQA 3UDMA 1A30A 5P00A 3R0YA 2H6SA 2AZBA 1W5YA 5P3LA 3QIHA 4Y5EA 2NMYA 1HVLA 3NUJA 5P7GA 5P5IA 3PVKA 4CP7A 1FLHA 1EPLE 4EJLA 3C9XA 3DJKA 1BAIA 4DJUA 1D4HA 4LC7A 2PK5A 4RROA 5P1VA 3L5CA 5P5AA 5P3IA 3RTHA 4KUPA 2PC0A 2UXZA 4LL3A 3ECGA 5P2GA 3SM2A 4TRZA 2FXDA 1QRPE 3DOXA 4CKUA 1DP5A 5P2ZA 2R8NA 5OYYA 2CEMA 5P7JA 2PWRA 4M8YA 3NU3A 5P5MA 5E5KA 3UPJA 1IZHA 1SBGA 4B70A 4B05A 5P10A 1SH9A 3NYGA 2I4QA 1K2BA 2QI0A 3GGXA 3UDRA 3QAAA 5OZ3A 3QVIA 5P3KA 2OHSA 2WKZA 3TKGA 1F7AA 3OY4A 5P3TA 3ST5A 3SA8A 4K8SA 4DUSA 4QJAA 5OZ2A 1ODXA 4CPWA 3UCBA 3H0BA 2XFKA 4Y4WA 2JYSA 1QBUA 3INFA 3KFPA 4U7QA 5DR8A 3SA5A 2OHTA 1B6PA 2AVQA 1HVHA 5P49A 4EWOA 5P35A 1W5WA 1B11A 5ER2E 4COEA 5AGZA 1B6LA 3UQPA 2I1AA 2G1RA 4ZSMA 1UH7A 3K4VC 3PI0A 4A6CA 3DK1A 4OBDA 3O9LB 3Q4BA 1K6PA 2O40A 1B6MA 5P4TA 5P0MA 3T11A 3ZKXA 4F74A 1D4YA 5OZRA 3RTMA 4TRWA 3PMYA 3OQ7A 5P0RA 3NSHA 5AH9A 1GNOA 4Q1NA 5HVPA 2FNTA 2AOFA 5HE7A 1E80E 4Y50A 3JW2A 5P2KA 4YBIA 5P59A 5P2WA 2QAKA 4H3JA 2NXLA 4NJVA 1W5XA 2AZ9A 2QI7A 3HBOA 5P6XA 4IVSA 3I8WA 5P1CA 2B8VA 2APRA 2AOJA 5P64A 2AVVA 2VIEA 3VF3A 4CPXA 3OUDA 5PEPA 3CICA 4YD5A 3FKTA 4LBTA 3CYWA 4GB2A 3IXJA 4J0TA 5P3HA 1WBMA 3L59A 4I0ZA 4Z50A 1XS7D 4J55A 1LF4A 5P34A 3T7XA 5KR2A 5P4WA 4XX4A 1FQ8A 2HB4A 2WF0A 4Y3DA 5P2QA 4D8CA 4R92A 3Q3TA 4Y37A 2OAHA 3UTLA 4Y3LA 4YCYA 4DQHA 1D4JA 1EC3A 4YD6A 4B1EA 5C9FA 5P2IA 3OQFA 5CLMA 5P7CA 2P8HA 3KM4A 5P55A 1FGCC 2NPHA 4YBFA 2G27A 4I0JA 1HVCA 4GYEA 5P6KA 3S7MA 5OZYA 4PPHA 4HZTA 4DJXA 5P0KA 2A4FA 3OGPA 1SDVA 5P0YA 3SACA 3DUYA 1K6VA 1MEUA 4AA8A 1UPJA 4Y9WA 2QHCA 1ODWA 3UDNA 4XX3A 5OZMA 5IVRA 4YCKA 5ENKA 4R8YA 5P8FA 1DMPA 3O9HA 2RSPA 5P4IA 3MSJA 1YTJA 3LZUA 1SMEA 1G2KA 3QN8A 2V12C 3EC0A 4FRKA 1DIFA 3K5DA 5P1JA 1FQ6A 5P6YA 2OHRA 5OZHA 2O4LA 3KFSA 4OBZB 2R5PA 1HVJA 3VSXA 4FIVA 5P8SA 2I0AA 2ER6E 4YCTA 2OF0A 5P43A 5P3MA 5DR7A 5P8OA 3TOGA 4Y35A 5P7EA 1AZ5A 3H5BA 3OU4B 3KYRA 1LYBA 2QZWA 1T7IA 4APEA 1SIVA 2P3AA 3PB5A 2AOHA 3IXKA 3S43B 4Y54A 5P5DA 3HVGA 5P4KA 4QJ7A 3OQDA 5P08A 3T6IA 1DW6C 3LITA 2AZ8A 1ZBGA 4LHHA 1KJ4A 1LZQA 3LIXA 3EKYA 2FS4A 4I11A 2OHLA 3SA4A 3CKRA 4J1CA 5P5XA 1XDHA 1HOSA 2PYNA 5P8BA 3KA2A 1MERA 2IDWA 3EXOA 5P0DA 1N49A 3CKTA 5B18A 2QP8A 5P7QA 3TL9A 1GNMA 1EPQE 5P1KA 3Q70A 5P20A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4NJU A;  4Y5A A;  5P7W A;  1HPV A;  1HXW A;  5CON A;  5P58 A;  3QI1 A;  2OHQ A;  1D4S A;  2VKM A;  4MC9 A;  2VJ9 A;  4Y53 A;  3VF5 A;  5P68 A;  1IIQ A;  3O99 A;  3U71 A;  1SMR A;  3OWN A;  2XFJ A;  1FQX A;  3BUG A;  3GGA A;  5P8Q A;  1ENT E;  4QJ8 A;  4CPT A;  4Y3R A;  4B0Q A;  2P4J A;  3G70 A;  5P6P A;  1QBS A;  3PGI A;  4FM8 A;  4PEP A;  4RCD A;  5DGW A;  3DM6 A;  2B8L A;  1IBQ A;  5OYV A;  1GNN A;  1LV1 A;  5P0W A;  2QI4 A;  4FRS A;  5P86 A;  2R43 A;  3PI5 A;  2I4X A;  3G72 A;  4J1E A;  3RTN A;  5JFU A;  3NXN A;  4ZPF A;  3OUA A;  4Y3A A;  2AOD A;  5P5V A;  5P8T A;  3NWQ A;  5P4M A;  2PWC A;  4EXG A;  4K4Q A;  4OD9 B;  5IVQ A;  1PPK E;  4DJQ A;  3Q5H A;  1OEX A;  2VS2 A;  5OZN A;  4Y36 A;  1RNE A;  4Z22 A;  5P0E A;  3LPI A;  4QJ6 A;  8HVP A;  5P7N A;  5P0B A;  1W5V A;  3DCR A;  2ZHR A;  2QK5 A;  4YD4 A;  3UFN A;  2PH8 A;  5P63 A;  1FKN A;  3VFB A;  3S54 A;  4L6B A;  3DCK A;  2OHK A;  4JP9 A;  3NU5 A;  2R3W A;  4MC1 A;  1EC1 A;  5SZ9 A;  4FAE A;  2ZHT A;  3SKG A;  2Q55 A;  5P4Q A;  5P7Z A;  3FX5 A;  3K4V A;  5P4B A;  2WF3 A;  5EZZ A;  2F3K A;  3VF7 A;  3QS1 A;  1TSQ A;  1J71 A;  4DQC A;  1CZI E;  4J5J A;  3ZPU A;  1NPV A;  5DR4 A;  3KT5 A;  1GVW A;  1HIV A;  3FNS A;  1YM4 A;  4MC2 A;  3S7L A;  2IGY A;  5OZI A;  5P1B A;  2AVO A;  5OZX A;  2ZJJ A;  2QMD A;  1PSA A;  3OK9 A;  5HDX A;  4GJA A;  1TCW A;  1MT8 A;  5P8U A;  1BVG A;  4HE9 A;  5DPZ A;  3KMX A;  5P3S A;  5P7R A;  2QCI A;  6APR E;  3VG1 A;  3HVP A;  4I8W A;  2O4N A;  1LS5 A;  3D3T A;  5OZB A;  4J1F A;  2QNN A;  5AHB A;  3K5G A;  5P1Q A;  5P4L A;  1ZSF A;  5P62 A;  3RSX A;  5OZ9 A;  1BDR A;  3SA6 A;  3APR E;  5IS4 A;  2VJ7 A;  2PH6 A;  3BHE A;  4PYV A;  4Y3J A;  4FM7 A;  1FG6 C;  4R91 A;  5P19 A;  4DJP A;  4RYG A;  3L38 A;  2G1N A;  3QVC A;  5P4A A;  1GVX A;  1AVF A;  5P0C A;  5P2X A;  5P8H A;  5ENM A;  4A6B A;  1M4H A;  1ZPK A;  2ANL A;  2QI1 A;  4Y5L A;  1DAZ C;  2BBB A;  4GJD A;  5KAO A;  5J25 A;  3GI5 A;  4S1G A;  5P4O A;  4HDP A;  1NPA A;  5KQY A;  5IVT A;  3OUC A;  5OZU A;  3IN4 A;  1YG9 A;  4I0F A;  5P42 A;  1HSH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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