4LBTA

Endothiapepsin in complex with 100mm acylhydrazone inhibitor
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Endothiapepsin
publication title Structure-based design of inhibitors of the aspartic protease endothiapepsin by exploiting dynamic combinatorial chemistry.
pubmed doi rcsb
total genus 88
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 2013-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4lbtA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4lbtA01
3M9FA 1SDVA 4WY1A 4DUSA 2P8HA 1AIDA 1FFFC 2B42A 3SA5A 4LAPA 3FNSA 4ZE6A 1EBWA 1IZIA 3KN0A 3OXCA 4QJ6A 5BWYA 1HIHA 1MRXA 5P5AA 4Y5GA 5OZQA 3BRAA 5P4UA 2UXZA 3VEUA 2OHMA 1IIQA 3Q3TA 4D8CA 4R91A 3KT2A 3DM6A 5P5DA 2UPJA 2WEDA 5OZ3A 5OZEA 2QI7A 1FMUA 5P73A 4J1IA 5P7PA 3EM4A 4OBDA 1F34A 2IQGA 2ZJIA 4DQHA 5P6HA 4J55A 4H1EA 5P2DA 1FLHA 4XKXA 1DMPA 8HVPA 3JVYA 5OZTA 5P2MA 5COPA 5P3JA 5P5HA 3PM4A 5KOSA 2OHNA 5P6EA 3UFLA 5OZXA 4A6CA 1EEDP 5P6DA 1FQ4A 5ER2E 4J0TA 3OU1A 4HE9A 4DI2A 4HLAA 5P14A 3EKYA 5OZ6A 1UH9A 1WBMA 5P6SA 4ZPFA 5P7UA 4EJDA 5P8PA 1HEGE 3D3TA 1SGUA 3TOHA 3IXJA 2ER6E 4L7JA 5P6KA 3SABA 7UPJA 5P5JA 1B5FA 3VV6A 1T7JA 3BXRA 1LYWB 5SY3A 1YTHA 5OZRA 3SA4A 1EAGA 5P3TA 5P26A 1CMSA 3K4VA 3SQFA 4X7IA 4ZSRA 4IVTA 4MC2A 3UQRA 3HBOA 5AH6A 5P3WA 5EZXA 2PK5A 4I0ZA 1BV7A 1T6GA 4EP2A 2AVSA 2OHUA 2G22A 5P4ZA 4Y9WA 2PYNA 2QNPA 3H5BA 4LP9A 5P79A 1HVLA 2AOIA 5P8VA 4A6BA 3UFNA 1MT9A 2R5QA 3OQFA 5P5XA 4CPWA 3O9LB 2V11C 3LIQA 4EXGA 1XN2A 4QJ2A 5OZ4A 1CZIE 2HM1A 3SPKA 4K9HA 5OYYA 3NWXA 4NJSA 3EL1A 2PWCA 2AOHA 5P6BA 3QAAA 4ZSQA 5DR7A 4CPUA 3EKVA 5OZBA 5P32A 2V00A 3SA9A 3VCMA 5P1IA 2FLEA 5P2OA 3UDNA 4PZWA 3QRSA 4YCYA 2CENA 3OU1B 3OAGA 5COOA 5P00A 4RRSA 5P1WA 3OQ7A 1G2KA 1ZAPA 5P7VA 4EPJA 3L38A 3KM4A 5P3AA 5P54A 5I3XA 2FIVA 5OZNA 4B1EA 1ZTZA 3KDCA 3VFBA 5P8BA 4J1FA 1SMRA 1B5FB 3ER3E 5P39A 1HVSA 2PK6A 5P0UA 4Z2ZA 4Y3MA 5P7GA 2ASIA 5CLMA 1KJFA 5P88A 1LYBA 2ZDZA 2NPHA 2IDWA 2OHKA 3VYDA 4WY6A 3T3CA 3NU9A 3Q6YA 4Y3HA 5P5KA 5AHBA 5C9BA 5P89A 5P8FA 1BAIA 5P6ZA 5P4VA 5KQYA 4DJOA 4DQCA 1IDAA 4R95A 5OZ5A 2WF0A 2IKUA 5P34A 3OU4A 4Y3NA 4J54A 3JW2A 2OHTA 2QMDA 4Y5KA 1DIFA 3KF0A 3RTNA 4KB9A 5P0YA 1LF2A 3I2LA 3NR6A 5P2AA 3LIXA 1EPPE 4FRJA 3BUGA 4PYVA 4YBIA 1MEUA 2OF0A 2ZYEA 4MC1A 4Y4AA 1QDMA 1PROA 1FIVA 2QI4A 1B11A 4Y35A 4FSLA 2IS0A 3DV1A 5P0WA 2JJIA 5P3MA 3CIDA 1A8KA 3O9CA 3SM1A 4B72A 1AAQA 2V13A 2NXDA 2B7FA 3FX5A 1AM5A 3EKPA 1K6CA 4I8ZA 5COKA 5OZ9A 1IVQA 1DW6C 5P7IA 3OAGB 3OXWA 3CKRA 5P0AA 3SA3A 1MRWA 5P7HA 4YDFA 3LPKA 3O9HA 5P7NA 5P65A 4EQ0A 5P1QA 5P3VA 3GGVA 2ZE1A 3NU3A 3ZKNA 3BGBA 4S1GA 3VSWA 4Y5EA 2J9JA 2O4KA 2R43A 5P45A 3KFNA 1QRPE 5P2RA 3DUYA 4X2LA 5P8JA 3CYXA 1FQ7A 2AOCA 4Y3AA 1EC1A 3R1GB 5P3NA 1Q9PA 5KQXA 2V16C 5IVRA 4A4QA 5P40A 4Y3EA 2RKGA 2I4XA 1K6TA 3UF3A 4K8SA 4Y3QA 5P1ZA 4M8YA 4Y4DA 5ER1E 3OU4B 4LXAA 4WTUA 2B8LA 1EC3A 1BDQA 3KYRA 4D85A 3G70A 4ER4E 4GJ6A 5P69A 5P5PA 3Q5HA 4QJAA 3D1ZA 5KQFA 4FRSA 4K4QA 5P8UA 2Q63A 9HVPA 5BRYA 3G6ZA 1T6EX 4F73A 3INFA 5P0QA 5P0FA 3KFRA 3DCKA 3NXEA 3INEA 5P3QA 1QBSA 4Y3ZA 1BVEA 4I1CA 3LIVA 5P8LA 1PSAA 2HB3A 2ZHVA 2ZHRA 1ODXA 2G1SA 3VUCA 1HXWA 5P8MA 4DJWA 3T11A 5P0CA 3VF3A 3CKTA 3UDQA 4Y5LA 4OBZA 4CKUA 1BBSA 1ER8E 1HBVA 5P53A 5P83A 2F3KA 3NWQA 4E43A 4Y5BA 3S2OA 2ZJKA 3SA6A 5P48A 2AOEA 4Y3DA 3PRSA 5P5ZA 4HDBA 2IGXA 3NU5A 1PSOE 2J9JB 4I0HA 5KR0A 1SIVA 2IKOA 5P4IA 2OHQA 2NNKA 2Q64A 2VJ9A 1HOSA 2G27A 4CMSA 3WSJA 4DJXA 5P7OA 1W5XA 5P8AA 2B8VA 1KJ7A 3LIZA 3PWMA 1ZJ7A 5P1CA 3ZKMA 5P1YA 3ST5A 5ENKA 1NH0A 4R92A 5P6QA 5P09A 3BUFA 4J1CA 4JECA 3D91A 3TOGA 5JFPA 4GZFA 3HZCA 4ACUA 2V0ZC 3K1WA 5DR0A 1UH8A 4J0PA 3TKWA 2PSUA 2AODA 3L58A 4AZYA 2Q5KA 3O9FA 4Y4JA 4EYRA 2QMPA 4D83A 3UDYA 2QHCA 3URIA 5P4MA 2XYFA 3C9XA 1D4JA 4XXSA 5P0ZA 5P51A 5P06A 1B6MA 1MUIA 4FRKA 2QZLA 4U7QA 4EP3A 3I25A 3DOXA 5P3PA 3OK9A 2Q55A 3VLBA 2I4VA 5P1EA 1MIQA 2RSPA 1SBGA 3TPJA 2FMBA 2NR6A 3S53A 3R4BA 3PCWA 4DJYA 2G24A 2P3AA 5P42A 2O4NA 1GVUA 3TTPA 5P0VA 1NPVA 4J1KA 4FM8A 1PPLE 1KJGA 3OY4A 2HB4A 2F3EA 5P4HA 1BWAA 1YG9A 2FS4A 3QVIA 3EL4A 2R3WA 4YD5A 4JPEA 5P35A 3OUBA 3NUJA 3EKXA 3LIYA 2XFIA 3WB4A 2B7ZA 3KFPA 5OYSA 3MSKA 4Y3RA 4LXMA 5P7JA 1M0BA 5P1LA 2NMZA 3QBFA 4OBJA 5OYWA 4YE3A 3VG1A 2ZJHA 2WEBA 2WF2A 4GJ8A 2QHYA 3SA7A 1APUE 2QU2A 1NSOA 4B70A 5OZHA 1ODYA 2XYEA 4XX3A 2RENA 4YD6A 2APRA 6UPJA 4OBHA 4B1CA 3UCBA 5P0LA 1HTGA 5P8KA 4RRNA 5OZSA 3OU3A 1HVCA 1D4KA 5P12A 5IS4A 3LPIA 2BPYA 3IVHA 4L6BA 5P63A 1ZSFA 4Q1XA 5HTZA 3K5DA 4I8WA 2VKMA 2WF1A 4I0IA 4RZ1A 1K6VA 5P77A 4DVFA 3TPLA 3IGBA 2G1YA 4PHVA 3HAUA 3DK1A 1W6HA 3KDBA 1MT8A 1EC0A 5P81A 5P3ZA 4B78A 5P0KA 3S54A 3S56A 3QROA 5EZZA 2O4SA 2VS2A 5ENMA 1SMEA 2ANLA 1Z1HA 1YTJA 5OZIA 3NSHA 4CPTA 2R3TA 3PWWA 3KMXA 5P1UA 5SZ9A 4I0JA 4YCKA 2HS2A 1C6ZA 1HVIA 1WBKA 1TCXA 3PCZA 4QGIA 4UPJA 3TL9A 4RYGA 4D89A 3OQAA 2IENA 5I3WA 5DQ4A 2RMPA 3ZPSA 5OYZA 3TNEA 2IEOA 4OC6B 5AGZA 4AA9A 5P6WA 1HTEA 2QP8A 3HDKA 5P6NA 5P0IA 1SH9A 4CPRA 5OZMA 5P03A 1TW7A 3VYEA 4Y58A 5P7XA 1HVHA 5P3HA 5HD0A 5P7LA 4Y4EA 5P7FA 5HE5A 2BKSA 1BDLA 1HPXA 5P7ZA 2QNNA 2NTRA 5JFUA 3LZVA 5P5TA 5OZUA 3IA9A 5HE4A 3LPJA 2OAHA 1EBZA 2Q54A 2BPVA 4FIVA 1K6PA 2FNSA 4Y4GA 2AVOA 3QIHA 3GI6A 5P76A 3ZL7A 4Y3FA 3L5FA 3EM3A 3BVAA 5P7WA 3VV8A 5P2JA 1A9MA 1ZSRA 1GNOA 1T7IA 3N3IA 5P1OA 5KR2A 4EXHA 2OHLA 2VIJA 2QD6A 4DH6A 1W5WA 3INDA 3FSMA 4FL8A 2PH6A 3H0BA 5P3SA 3VV7A 4EQJA 1HPOA 3ER5E 3PB5A 5P60A 4B0QA 3OXVA 2OHRA 5IVSA 5P4WA 3GGUA 3UHLA 3NU4A 5P4RA 4Y51A 4BELA 5P0NA 5P2KA 4Y3SA 3ZPUA 1EPOE 5ISKA 1A30A 3FIVA 4QLHA 5HU1A 4CP7A 1META 1BILA 1AXAA 4RCDA 1EC2A 1FFIC 4Y3PA 5P46A 1IDBA 5P1DA 2QD7A 3NXNA 1AVFA 3KA2A 3BXSA 3TKGA 5P5RA 1EPLE 5P0XA 3D1YA 1MESA 3OADA 5P72A 5DR3A 2QMGA 4EJKA 5P5SA 5P4JA 3QRMA 1E81E 1HHPA 4GMIA 2P3BA 2F8GA 4DQEA 1BXOA 4BFDA 2I4QA 2ZJJA 4Z4XA 3SFCA 3HLOA 3PI0A 5P3DA 3HAWA 1QBTA 4Y6MA 1FEJC 5E5KA 2QZKA 4LXKA 3RSVA 2UY0A 2QHZA 5P8NA 2WF3A 1EBKC 4CPXA 3FNTA 1IZEA 1XS7D 2EWYA 4GJCA 1RPIA 5DR1A 5F01A 2QI3A 5DGUA 4Y39A 3BGCA 4GJDA 4J17A 3OOTA 3L3AA 5OZJA 3URJA 5P8EA 4J1EA 5P4FA 5DQCA 2NMYA 5AHAA 5P66A 1FG8C 3CMSA 3VSXA 5P8OA 1LF3A 2PQZA 5P3BA 5P7AA 1FGCC 3U6AA 2QMFA 4NJUA 3EL9A 3EL0A 4L1AA 4LHHA 1GKTA 4Z22A 1IVPA 3PMUA 3O99A 1RV7A 5OYUA 2AOJA 5OYTA 1MSMA 5OZ8A 4J1HA 1MPPA 2FDEA 3T7PA 5P5GA 2FNTA 5OZVA 5KQZA 3EKQA 1LF4A 3HVGA 1HTFA 5P6LA 3JVWA 3G72A 3SA8A 3BC4A 3OADB 5JODA 5P1NA 5P8CA 5P38A 1ZBGA 1TZSA 3EL5A 5I3VA 2ZHTA 5BS4A 2PSVA 1BIMA 1PFZA 2QI6A 4YOAA 2QD8A 4U8WA 3UDKA 3D20A 1OHRA 2PC0A 5P50A 5P6OA 2BKTA 3PLDA 1EPQE 2ER9E 2R9BA 5APRE 4APRE 5P7EA 5OZCA 3S85A 2Q15A 3QN8A 1LYBB 1OD1A 5HDUA 1TSQA 2BJUA 4YD7A 3EC0A 3S43A 4K4RA 5P1MA 4DV9A 4I11A 5P57A 1XDHA 1ME6A 3L59A 3UQPA 4AA8A 5B18A 5OZLA 1ENTE 5P3XA 2OHSA 5P01A 3ZKSA 3SAAA 1YTIA 4MC9A 5OZFA 4GJAA 2AVVA 2I0AA 5P2TA 1D4SA 3OTYA 2P4JA 5P3KA 5P7RA 2IGYA 5DQ2A 5P5MA 1K1TA 3L5BA 1DPJA 5P61A 1N49A 4F74A 2I4UA 2ZJMA 4RGHA 2QAKA 5P1VA 4TVHA 5P8QA 2NXLA 1LYAA 4DPFA 1MTBA 3Q70A 4Q5MA 4FLGA 3PSGA 1KZKA 1HSGA 4L1AB 3EKTA 3VF7A 5P37A 3UPJA 1AJVA 2G1NA 2G21A 1M4HA 1KJ4A 3K5CA 1SIPA 2QI5A 2HPEA 2WECA 2Z4OA 5AH7A 5P8GA 1XL2A 1E80E 1HVKA 3Q4BA 2QNQA 4HEGA 1VIJA 5P55A 1K2BA 5KOQA 5OYVA 4FCOA 3SM2A 5P1PA 5P2IA 3PLLA 3IN4A 5P02A 2BPWA 2WF4A 5HE7A 3WB5A 5KR8A 3OGQA 1GNMA 4J5JA 4I10A 4RCEA 5J25A 3A2OA 1GVWA 4YCTA 5P2UA 3ZKQA 4GJ9A 4DFGA 4Y56A 5HDVA 2I4DA 1APVE 5FIVA 5P4XA 2QZWA 5P4PA 4F76A 5P0PA 3LNKA 4GB2A 5P04A 3S43B 1TCWA 4Y38A 3PGIA 1HSHA 5P5EA 4Y4WA 1EBYA 1ODWA 5P2CA 4FE6A 5AH9A 3LINA 2G1RA 1HXBA 3QBHA 4GYEA 4I12A 2JXRA 1BWBA 1YT9A 3TH9A 4Y53A 3EMYA 4U7VA 4TRWA 2I1AA 2FDPA 5P4QA 4GJ7A 4TRZA 1G35A 4RLDA 3UDJA 1QBUA 2AOFA 1LYAB 5OZOA 3VYFA 2G94A 5P13A 3GGAA 5P5UA 4GJ5A 5P62A 4R5NA 3FKTA 5DR8A 1TQFA 5P5LA 5IVQA 4Y3WA 5P4DA 1B6PA 4COEA 1SDUA 5P2ZA 5P4NA 4L7HA 6APRE 3WZ8A 4J0ZA 5P7DA 4MC6A 2AQUA 2G1OA 3FNUA 1OEWA 5P4LA 1MERA 4OBZB 4CPQA 2VNMA 5DQ1A 3UTLA 3UDHA 4ZSMA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3M9F A;  1SDV A;  4WY1 A;  4DUS A;  2P8H A;  1AID A;  1FFF C;  2B42 A;  3SA5 A;  4LAP A;  3FNS A;  4ZE6 A;  1EBW A;  1IZI A;  3KN0 A;  3OXC A;  4QJ6 A;  5BWY A;  1HIH A;  1MRX A;  5P5A A;  4Y5G A;  5OZQ A;  3BRA A;  5P4U A;  2UXZ A;  3VEU A;  2OHM A;  1IIQ A;  3Q3T A;  4D8C A;  4R91 A;  3KT2 A;  3DM6 A;  5P5D A;  2UPJ A;  2WED A;  5OZ3 A;  5OZE A;  2QI7 A;  1FMU A;  5P73 A;  4J1I A;  5P7P A;  3EM4 A;  4OBD A;  1F34 A;  2IQG A;  2ZJI A;  4DQH A;  5P6H A;  4J55 A;  4H1E A;  5P2D A;  1FLH A;  4XKX A;  1DMP A;  8HVP A;  3JVY A;  5OZT A;  5P2M A;  5COP A;  5P3J A;  5P5H A;  3PM4 A;  5KOS A;  2OHN A;  5P6E A;  3UFL A;  5OZX A;  4A6C A;  1EED P;  5P6D A;  1FQ4 A;  5ER2 E;  4J0T A;  3OU1 A;  4HE9 A;  4DI2 A;  4HLA A;  5P14 A;  3EKY A;  5OZ6 A;  1UH9 A;  1WBM A;  5P6S A;  4ZPF A;  5P7U A;  4EJD A;  5P8P A;  1HEG E;  3D3T A;  1SGU A;  3TOH A;  3IXJ A;  2ER6 E;  4L7J A;  5P6K A;  3SAB A;  7UPJ A;  5P5J A;  1B5F A;  3VV6 A;  1T7J A;  3BXR A;  1LYW B;  5SY3 A;  1YTH A;  5OZR A;  3SA4 A;  1EAG A;  5P3T A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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