4LDLA

Structure of beta2 adrenoceptor bound to hydroxybenzylisoproterenol and an engineered nanobody
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
457
structure length
454
Chain Sequence
DAENLYFQGNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYAADEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILTKTWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKFALKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein/hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Adrenaline-activated structure of beta 2-adrenoceptor stabilized by an engineered nanobody.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme, Beta-2 adrenergic receptor
total genus 166
structure length 454
sequence length 457
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4ldlA01
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4ldlA02
144LA 1OVJA 1ZYTA 1P6YA 213LA 3AM6A 2RB2X 2RH1A 3F9LA 3HTBA 2KS9A 2RBSA 3G3VA 1QKOA 2NTHA 3CAPA 2YCXA 1BRDA 3HANA 1G0GA 1L74A 1QKPA 1K28A 3CDVA 4W58A 3HT6A 4W57A 5G28A 107LA 4JQ6A 3FADA 5H2KA 1L83A 2KSAA 1L70A 2KSYA 4G71B 3QJSB 147LA 3QBKA 1KNIA 1L75A 130LA 2ANVA 2RB0X 169LA 3C8RA 1DYEA 3ODUA 4EIYA 1L10A 4YXAC 1D2YA 1OV7A 2R4SA 156LA 3HAQA 1C61A 1XJUA 2YCYA 4N6HA 1L68A 3WQJA 4GP4B 4EA3A 3HASA 1G0JA 1L38A 3QDCA 4TL3A 215LA 1M0LA 230LA 2F32A 3DNAA 1L40A 5H2IA 221LA 3VI0A 1S52A 1L57A 3QJUB 5H2NA 1P56A 199LA 4I7OA 3VG9A 4GP5B 1L32A 1X0K1 4G72B 1D9WA 1L18A 1L71A 1R2NA 3X3CA 5G36A 2I21A 4XXJA 3QJTB 1C6QA 1CV3A 3NY9A 1L46A 2RBQA 2Y01A 1L86A 200LA 1C66A 5C1MA 216LA 1L92A 1AP9A 261LA 4G7SB 1IW9A 1QTHA 158LA 1L51A 1T8FA 1CTWA 1LGXA 4ZPUA 195LA 1L48A 1L07A 1L20A 257LA 1EPYA 1G1WA 233LA 252LA 4W54A 1VGOA 2OTZX 1L69A 1LWKA 122LA 3QJVB 1LI2A 1XEPA 2PEDA 198LA 1C68A 1L58A 3HT8A 1L65A 3S3BB 3DKEX 250LA 1G1VA 1OYUA 1S8LA 3UTWA 3UZCA 1G06A 3HH4A 1L89A 242LA 3GUNA 211LA 3DN8A 3PXOA 1LYGA 1L72A 258LA 109LA 1L53A 259LA 1P46A 4JKVA 4PK0A 1L31A 1BRXA 1P2RA 1P64A 1M0KA 4QI1A 3RFMA 2ZIYA 4DAJA 4EKSA 1KMEA 2CUUA 1LW9A 1C64A 231LA 5AHYA 1UAZA 1P37A 1PQIA 4LDEA 1QT4A 3C8QA 4GP8B 1LYEA 1PQKA 2J4YA 3DN2A 4IARA 2O79A 2HPYA 1C6DA 5F8UA 1T97A 4YX7C 1L37A 241LA 246LA 3VVKA 1QS9A 3DN1A 1U19A 149LA 1C6LA 4W56A 1XJIA 1L26A 3UTXA 152LA 2RBPA 5B6XA 1WTHA 1C6JA 1CUPA 2OEAX 3HTGA 3UONA 123LA 4ARMA 3QAPA 5JJJA 251LA 2F93A 1KG9A 5DYSA 4DKLA 1C6MA 1QUDA 3EMLA 1L56A 2RBRA 128LA 1CVKA 1L79A 4I7TA 1S54A 2OU9A 1L61A 4ARQA 4MQTA 1G0KA 1L91A 1E12A 2WJKA 3ZEVA 4BWBA 129LA 1BM1A 1LYFA 1C6HA 1C8SA 1T8GA 4IAQA 4BUOA 3NYAA 2KSBA 4LDLA 120LA 4W55A 2X72A 131LA 1DYCA 1IXFA 1CV5A 146LA 237LA 2AT9A 1LGUA 110LA 1TN0A 1L9HA 1L34A 1OV5A 3NS0A 1L80A 3V2WA 226LA 3COCA 190LA 236LA 1P8UA 1L60A 3C8SA 1JTMA 1L04A 1C65A 253LA 1L25A 1P2LA 2OE9X 4BEYA 1L99A 2Z55A 1LI3A 3HH6A 1G07A 4A4MA 1M0MA 5G53A 1C6AA 1C3WA 1E0PA 1L02A 176LA 1MGYA 240LA 1HZXA 2RBNA 3C7YA 223LA 2HUMA 4I7JA 3RZEA 115LA 1CV1A 3PDSA 4ARJA 1LN6A 4WW3A 5B6VA 143LA 3HU8A 1C60A 2F95A 1L01A 3QBLA 197LA 1JV6A 4UG2A 1LPYA 184LA 1DZEA 192LA 4G70B 125LA 5LZMA 1GZMA 1QTDA 1QUOA 4X31A 3DN6A 1OWYA 239LA 1C6IA 1L23A 2O7AA 4LZMA 2B70A 2B6WA 2B75A 2Z6BA 1Q5JA 4KLYA 4EJ4A 1DYDA 5J7AA 1CUQA 2IGCA 1TN5A 2M3GA 4OV0A 157LA 3DN4A 1LYJA 2RB1X 2O4WA 172LA 205LA 4FA7B 1C67A 4AQNA 1CU3A 1L03A 1L67A 2A4TA 3MBVA 4WAVA 1L62A 4FAAB 260LA 5B6ZA 1QSQA 1KY0A 2Q9EA 1C69A 3C82A 2Y03A 1L66A 1XMEB 5JJNA 112LA 2Y02A 3REYA 1L84A 1D3FA 2ZZLA 3HAPA 5TGZA 4XTOA 1IW6A 5ITCA 137LA 219LA 225LA 3CODA 1QT5A 151LA 3EH3B 1JFPA 1QSBA 3GUKA 1L43A 4S0WA 4AMIA 189LA 4FPDA 3X3BA 4W51A 229LA 1C6GA 1L88A 3C81A 5B2NA 1GU8A 3HARA 5I14A 2QB0B 256LA 4QIDA 1C63A 1CWQA 4NC3A 170LA 1L33A 2OU8A 1P3NA 4XTNA 1DYGA 1TLAA 2RAZX 4DJHA 5AHZA 155LA 1L05A 1D3NA 212LA 1AT9A 4J4QA 1SSYA 214LA 1L47A 3G3WA 2B72A 1PY6A 228LA 1QTZA 2B73A 3HAOA 2NTUA 5H2JA 1S53A 3OAXA 1QUHA 4KNFA 1QM8A 1R84A 3OE6A 3UZAA 1T6HA 4MD1A 1Q5IA 4JR8A 2ZFEA 4OO9A 1DYBA 3KJ6A 150LA 5H2OA 2NTGA 1L36A 3SBAA 3GUIA 1L63A 3HUKA 4MQSA 1KGBA 3K2RA 182LA 1O0AA 1CU6A 227LA 3PBLA 3BVDB 3RUNA 5B6WA 168LA 254LA 3HWLA 4G7QB 1XJTA 3S8FB 3DQBA 1L35A 3QBGA 1L77A 1LI6A 245LA 248LA 1C6NA 1L29A 1L0MA 1S8JA 1L09A 5G54A 1L90A 4ARQB 2LZMA 5B6YA 1L59A 1LYIA 1F50A 3S8GB 160LA 102LA 5ETZA 1L15A 1QTCA 4BV0A 3C83A 1L14A 5BR5A 1D3JA 1PQJA 3G3XA 3L2XA 5G2CA 4ARLA 2YCWA 4I7NA 1QT8A 4I7PA 174LA 1H68A 1DYAA 3FI5A 104LA 1L73A 2Y04A 1UCQA 4N4YB 3T45A 4XTLA 1CX7A 1G0MA 1L95A 175LA 3SN6R 3ZPQA 1QT3A 186LA 1LYDA 5H2LA 139LA 1C6FA 1NHBA 4GBRB 1C6KA 4W52A 4YXCA 1C6PA 3HTFA 4PXFA 3UTVA 2F2QA 3VW7A 3HDFA 1JTNA 1FBKA 1C6EA 3HDEA 3DMXA 1L94A 3PWHA 2JAGA 1L87A 3SB8A 1L96A 5FJGA 7LZMA 1L13A 2LNLA 1I6SA 2OE7X 1QTVA 3FA0A 2G87A 1FBBA 4FBZA 5AX1A 1SX7A 4MD2A 4BEZA 1L44A 1SWYA 4L6RA 1OVHA 2Z73A 3GUMA 2YDVA 2BRDA 4G7RB 1L17A 2R4RA 3HUQA 3SBBC 4ARMB 5DHHA 218LA 5H2MA 3NSBA 1VJMA 3QJRB 3S3DB 4XT1A 3DMZA 1C6BA 187LA 3CDOA 1CU2A 1L12A 1F4ZA 5KKHA 3EH5B 1C6TA 5B0WA 163LA 1L11A 3EH4B 145LA 4PJZA 2B6ZA 1P5CA 2L78A 4EPIA 5BR2A 114LA 3DDLA 3HH5A 1L97A 108LA 2I1XA 1L22A 1BRRA 5H2HA 4GPOA 3C9MA 1L24A 3VGAA 4E97A 5A44A 1JV7A 2VT4A 3CDQA 4X1HA 3HU9A 1QS5A 238LA 5AZDA 4AMJA 1LLHA 3NY8A 3CDRA 2LC9A 2HULA 3C9LA 1KS3A 4HYJA 2WJLA 113LA 140LA 173LA 2B6TA 1L39A 4GYCA 209LA 1L28A 3HTDA 4HYXA 1P7SA 2HUKA 2Y00A 1L81A 3L64A 2I35A 5ITEA 1SSWA 201LA 3AYMA 3QBIA 2QPEB 1L98A 5DHGA 255LA 2ANXA 1F88A 5AWZA 3AYNA 141LA 4PXKA 119LA 1PXRA 4UHRA 3HUAA 118LA 1L19A 3ABWA 1CV0A 1P36A 4W59A 1L16A 234LA 1CV4A 1L30A 4I7RA 177LA 3OE8A 2NTWA 4EKRA 180LA 3SB6A 1QT6A 1ZURA 4IB4A 2OE4X 1KG8A 2RAYX 1L00A 4X32A 3UG9A 3GULA 1KY1A 3P0GA 4HWLA 5JJEA 5LWEA 1L0JA 2I20A 1PXSA 1L50A 1P8IA 1PQMA 1SWZA 166LA 196LA 6LZMA 1L08A 217LA 1EHKB 142LA 1C62A 1L64A 1S51A 3F8VA 3PQRA 1D3MA 3V2YA 3C7ZA 3OE9A 3UTYA 127LA 3JR6A 3A7KA 4N4WA 1PQOA 3QJQB 243LA 1C6CA 5EN0A 2B74A 4QRYA 224LA 3QAKA 188LA 4I7MA 4BVNA 235LA 2F47A 1JGJA 3SB7A 1L45A 1D2WA 1DYFA 3C80A 1SX2A 2YCZA 1QT7A 1G0PA 1L27A 3CDTA 185LA 4W53A 5A45A 4XT3A 1L85A 5B35A 5B34A 4GBRA 103LA 2B6YA 1L42A 1G0LA 126LA 3GUOA 183LA 1KW7A 2LCBA 3SB5A 1L21A 2B7XA 171LA 2B6XA 1L49A 3GUJA 181LA 1G0QA 1JQUA 1P8HA 3HT9A 2QPDB 1QTBA 2OTYX 3GUPA 1LYHA 1C8RA 3OE0A 162LA 249LA 1LWGA 138LA 4LDOA 210LA 1GUEA 4EPFA 167LA 1OVKA 3ZPRA 5A8EA 244LA 161LA 3D4SA 1PQDA 178LA 111LA 5G2DA 3LZMA 4IAPA 1L55A 4GRVA 1L52A 4Y9HA 191LA 1L0KA 220LA 262LA 5G2AA 1CX6A 1L41A 3DN0A 3HH3A 3S3CB 2Q9DA 1L76A 1CU5A 1L93A 4I7LA 1CU0A 5H2PA 3SB9A 3DMVA 1KW5A 3C7WA 148LE 4I7KA 4EXMA 1QHJA 1L82A 206LA 2YDOA 222LA 1ZWNA 2JAFA 1H2SA 2RBOA 2EI4A 1T8AA 3VHZA 4ARPA 4EKQA 2QARC 2L6XA 4K5YA 1CV6A 1QUGA 1LGWA 3HT7A 1B6IA 1L06A 5AX0A 1X0SA 1OWZA 4L35A 247LA 4EKPA 1X0I1 232LA 164LA 4I7QA 1L54A 159LA 165LA 2OU0X 1XIOA 4MBSA 4I7SA 3DN3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
144LA 1P6YA 213LA 4NIJA 2RB2X 3AM6A 5KXWA 2RH1A 2RBSA 2Z18A 3EXDA 2YCXA 1BRDA 1GB3A 5G28A 4W57A 4TWSA 4JQ6A 1L83A 1XEKA 1B7PA 1CKCA 1DI5A 5D5CA 3C8RA 1GE4A 1IP3A 1GF5A 1D2YA 1YKYX 1VDTA 4NGYA 2G4QA 1C7PA 4GP4B 4EA3A 4KT3A 4TL3A 5ILFA 1M0LA 230LA 5H2IA 1S52A 3QJUB 1P56A 3G3BB 3A96A 4G72B 3WW6A 3X3CA 1B5VA 5KXKA 1C6QA 1CV3A 3B0IA 1IC7Y 1W08A 4YOPA 1GF9A 1XSFA 216LA 5B1GA 2DQFC 158LA 1CTWA 1PZYA 1F6RA 4B4IA 1L20A 1LSBA 1DQJC 4DD3A 1IC5Y 4W54A 1JTTL 2OTZX 1LWKA 5D5FA 198LA 3HT8A 3M18B 3S3BB 3DKEX 250LA 4WM1A 1S8LA 3TMWA 1BQLY 3DN8A 1LYGA 258LA 2VB1A 4CJ2A 1L31A 3OK0A 2BQGA 4XYYA 4EKSA 2CUUA 4OWCA 231LA 3AZ4A 1P37A 1BB6A 4CGEA 4IARA 1L37A 2HU1A 1U19A 4W56A 1XJIA 2YBIA 1LZ6A 3UONA 4ARMA 1CJ6A 3QAPA 251LA 5IELA 1KG9A 4LYMA 2Z39A 1LKRA 4DKLA 1L56A 2HECA 1CVKA 4H1PA 4H8XA 1E12A 4NWEA 1JSFA 4BWBA 1C8SA 1LJHA 4IAQA 1VATA 2KSBA 4E3UA 3J4GA 120LA 1UCOA 2YSSC 1CV5A 1BWJA 4WM3A 1L34A 4X3BA 3V2WA 190LA 236LA 1C65A 253LA 1XGTC 2OE9X 1LI3A 4A4MA 4EMNA 4M6DA 1M0MA 176LA 240LA 1HZXA 4I7JA 4ARJA 115LA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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