4LDOA

Structure of beta2 adrenoceptor bound to adrenaline and an engineered nanobody
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
457
structure length
454
Chain Sequence
DAENLYFQGNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYAADEVWVVGMGIVMSLIVLAIVFGNVLVITAIAKFERLQTVTNYFITSLACADLVMGLAVVPFGAAHILTKTWTFGNFWCEFWTSIDVLCVTASIETLCVIAVDRYFAITSPFKYQSLLTKNKARVIILMVWIVSGLTSFLPIQMHWYRATHQEAINCYAEETCCDFFTNQAYAIASSIVSFYVPLVIMVFVYSRVFQEAKRQLQKFALKEHKALKTLGIIMGTFTLCWLPFFIVNIVHVIQDNLIRKEVYILLNWIGYVNSGFNPLIYCRSPDFRIAFQELLCL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein/hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Adrenaline-activated structure of beta 2-adrenoceptor stabilized by an engineered nanobody.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme, Beta-2 adrenergic receptor
total genus 164
structure length 454
sequence length 457
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-06-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4ldoA01
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4ldoA02
1B6IA 5ITCA 5C1MA 3MBVA 5B34A 224LA 3X3CA 2F95A 2JAGA 1L36A 3HAQA 1L84A 1KG8A 2OU0X 5DYSA 1G0LA 4DJHA 3CDVA 1C6PA 1SX7A 1G0JA 261LA 1L18A 4I7RA 1OVKA 5G2DA 1OYUA 218LA 3EH3B 236LA 4FPDA 1O0AA 191LA 1BRXA 1CV0A 1L72A 2ZIYA 2RBQA 4EKSA 167LA 3S8FB 1L20A 1G0GA 1L79A 1P6YA 4YXAC 4AQNA 147LA 2KSBA 3CAPA 3QJTB 3S3CB 3C82A 1R2NA 1DYCA 1DYGA 1EPYA 1L90A 2QB0B 3DDLA 3PWHA 1D3FA 1L0MA 1DYEA 1QTZA 158LA 2B6WA 234LA 3GULA 3SB9A 1F50A 1JTNA 1X0I1 3AYMA 195LA 1L25A 1K28A 3VI0A 2YCZA 2J4YA 2ZZLA 4AMJA 1GZMA 122LA 1CU5A 2NTHA 4I7KA 1L14A 1G0QA 1QT6A 4L35A 4N6HA 4E97A 1NHBA 3GUIA 3L2XA 1C67A 1T8FA 1QUGA 1C6GA 3HAPA 3QJRB 4DKLA 2KS9A 4G72B 1L61A 3HTBA 176LA 1T6HA 6LZMA 1QTVA 1L56A 5EN0A 1L19A 3C83A 1AP9A 1PQJA 2OU8A 125LA 2ANVA 1L47A 2WJLA 157LA 3JR6A 3RUNA 1L35A 1XEPA 3RZEA 3HT9A 215LA 1OV7A 4W56A 1P56A 221LA 3DN6A 1L11A 3NYAA 1CX7A 118LA 3DN3A 1L49A 251LA 4JR8A 1OV5A 3DN4A 1L80A 1ZWNA 1L06A 1L95A 3EH5B 123LA 1L43A 1DYDA 1L12A 1L63A 3OE0A 3UONA 1D3MA 219LA 1I6SA 235LA 1L66A 1IW6A 1QTDA 2R4SA 164LA 2Y00A 209LA 1G07A 2I20A 5DHGA 3VVKA 1C68A 1PQMA 160LA 1FBBA 1LGWA 108LA 1C6BA 246LA 4FAAB 1T8AA 4EIYA 3C80A 5AHZA 113LA 3QJQB 1L51A 2ZFEA 2Z6BA 2OTZX 1E12A 1L69A 3C8QA 184LA 1SWYA 107LA 244LA 1LWKA 1TLAA 3C7ZA 1L83A 5H2LA 245LA 3GUNA 4XT3A 5BR5A 1TN5A 226LA 2LC9A 4PXFA 2B6YA 3F8VA 2OU9A 1L65A 247LA 1PXSA 1GU8A 4W59A 3C8RA 4GP8B 1L99A 103LA 1SX2A 3GUOA 1P3NA 197LA 4W51A 1T97A 1GUEA 1OWZA 1QTHA 5G28A 3UZCA 1C62A 4YXCA 3GUPA 1AT9A 5B6ZA 1QHJA 1L70A 4GBRB 3RFMA 4S0WA 4EPIA 189LA 5H2NA 196LA 2RBSA 1ZURA 2HUMA 3OE8A 1CX6A 2OEAX 3HTDA 1L85A 1PQDA 1L48A 3CDOA 1XIOA 165LA 3HH6A 4K5YA 1Q5IA 1LYHA 2YDVA 3GUKA 102LA 1L33A 1F4ZA 4GBRA 3UTVA 1CVKA 1L03A 1L86A 3QAKA 1C6TA 1KS3A 1C6AA 1L60A 3ODUA 4LDEA 4G7SB 4OV0A 3HH3A 1QTBA 181LA 233LA 1UCQA 3DN2A 4MQSA 3GUJA 1L05A 1L74A 1L98A 4MQTA 4W58A 3C9LA 4G71B 4FA7B 3ZPRA 2RAYX 3FI5A 198LA 4KLYA 1C6DA 2B7XA 1L07A 1JV6A 1QM8A 4HYJA 1LI2A 3VG9A 3WQJA 4UHRA 199LA 2B72A 1G06A 3QJUB 2NTWA 1PXRA 206LA 229LA 2LNLA 1G0MA 5TGZA 5AWZA 1CV3A 3HDFA 3UG9A 1L81A 5H2PA 1QSQA 2B70A 1T8GA 3QBGA 220LA 3PXOA 5H2KA 1C8RA 5ITEA 1BM1A 3QAPA 156LA 4W52A 3HH4A 1C6KA 5AX1A 2B6TA 5BR2A 2F47A 4W53A 1OVHA 1CV4A 1CU0A 4PJZA 3C9MA 4JKVA 5AHYA 1L62A 3P0GA 4I7TA 4UG2A 1L17A 175LA 3DNAA 3L64A 260LA 205LA 1P46A 1QKPA 1L94A 5JJJA 4BWBA 1JQUA 1L68A 137LA 3HT6A 1P2RA 1L53A 5G2CA 3QDCA 119LA 3DMVA 5H2MA 2RB2X 1L32A 1EHKB 1L38A 259LA 3AYNA 4NC3A 2RB1X 240LA 150LA 2YDOA 1CU6A 1L96A 3NY9A 3G3VA 2IGCA 256LA 190LA 1L76A 3C8SA 1BRRA 1G1VA 1SSWA 3FA0A 1C6FA 2ANXA 1R84A 174LA 4HYXA 3KJ6A 4Y9HA 1L39A 3HTFA 5A44A 3EH4B 4EKQA 1L44A 1WTHA 253LA 4I7NA 4GYCA 1L9HA 1SSYA 5B35A 1C6JA 1OWYA 3ZEVA 143LA 186LA 1IXFA 4G70B 182LA 1D3NA 109LA 1LYJA 1OVJA 1D2YA 185LA 148LE 2HULA 4X1HA 1LPYA 2L78A 180LA 1S52A 5B6WA 1JFPA 5KKHA 2F93A 1JV7A 2I35A 3VHZA 104LA 1L10A 2B73A 4ARLA 4X31A 3PBLA 1QS9A 2HPYA 228LA 3QJVB 1X0K1 1C8SA 2CUUA 4ZPUA 1L67A 2Y04A 2YCXA 1KW7A 3EMLA 5H2IA 111LA 166LA 5G36A 1JTMA 214LA 4IAPA 5JJEA 3PDSA 216LA 4QI1A 2Z73A 5H2OA 1L54A 171LA 2NTUA 5B6VA 255LA 4LDOA 183LA 5J7AA 2RB0X 126LA 4G7QB 4TL3A 1L57A 4XTNA 1VGOA 232LA 4KNFA 1M0LA 2LCBA 1L30A 4DAJA 4N4WA 4LDLA 211LA 222LA 4BUOA 1KG9A 5F8UA 2B6ZA 3HDEA 223LA 141LA 142LA 1D9WA 4EPFA 1C6EA 3DN8A 1LYEA 2AT9A 4MBSA 4PXKA 1L37A 3FADA 1P8IA 4WAVA 4ARJA 3OAXA 146LA 1P5CA 5B6XA 3HUQA 2QPEB 1L34A 1L59A 2M3GA 1L0KA 2RBPA 3HUKA 3HU8A 1QT8A 3C7YA 4MD1A 241LA 5H2JA 249LA 1C63A 5G2AA 3C81A 3D4SA 4FBZA 1LGUA 2B75A 3CDQA 1L31A 1CTWA 1P64A 173LA 2RBNA 1JGJA 4ARMB 3UTYA 2HUKA 1H2SA 1CU3A 1HZXA 1C60A 2OE4X 1LN6A 4YX7C 3CDRA 1P8HA 5B2NA 7LZMA 213LA 1C6IA 210LA 1C6MA 1QUDA 212LA 1LYFA 3DN1A 1CV1A 2QARC 3ABWA 4ARMA 3HTGA 1C6NA 5FJGA 4W54A 4BEZA 187LA 1L52A 4I7OA 139LA 2QPDB 3UTWA 3S3DB 3CDTA 237LA 230LA 3G3XA 4MD2A 188LA 257LA 1QT5A 4GRVA 1XJIA 5G53A 1U19A 1L92A 1BRDA 112LA 3G3WA 1CUQA 2O4WA 1C65A 3DMXA 2RAZX 217LA 1C61A 1H68A 1L40A 3HASA 2O79A 4BV0A 168LA 1S51A 161LA 3QJSB 162LA 4BEYA 1L22A 4GP5B 200LA 1L28A 4XTOA 5JJNA 3HT7A 2JAFA 1P2LA 1C64A 1QKOA 1UAZA 1KY0A 1C6CA 1L71A 178LA 4I7MA 2O7AA 1S53A 1VJMA 2EI4A 1DYBA 4HWLA 5A8EA 1P36A 2F2QA 1L75A 1C69A 1G0PA 201LA 3OE9A 1C66A 127LA 2L6XA 252LA 3V2WA 1QUHA 4XXJA 1PQKA 1QT7A 3S8GB 5G54A 1CWQA 231LA 2I1XA 1D2WA 4EXMA 4N4YB 1LWGA 5AZDA 1L09A 1SWZA 1L01A 4IAQA 1PQIA 1IW9A 1L91A 3COCA 4QRYA 2G87A 149LA 3DMZA 3QBIA 239LA 1G1WA 170LA 5A45A 248LA 2YCYA 3UZAA 2Y03A 115LA 5DHHA 1KY1A 1QUOA 3LZMA 3PQRA 3SB8A 169LA 1L88A 2YCWA 4PK0A 4L6RA 2A4TA 2OTYX 152LA 3X3BA 238LA 3HARA 3NSBA 4WW3A 4J4QA 1P37A 1XJUA 2Q9DA 2X72A 4GP4B 3SB5A 1XJTA 254LA 130LA 1S54A 1L89A 129LA 1QT4A 3HU9A 3SBAA 4GPOA 1L41A 4IARA 1CV5A 4X32A 1L50A 1QTCA 5LZMA 1CU2A 1X0SA 1KGBA 1L97A 1KMEA 3NY8A 1S8JA 5B0WA 3UTXA 4JQ6A 2OE7X 1C6LA 1LYIA 3HH5A 110LA 1M0KA 1CUPA 4EKRA 1TN0A 1L58A 1LLHA 1C6HA 3GUMA 4BVNA 1L55A 2Q9EA 1L00A 3HWLA 4EJ4A 1XMEB 3A7KA 3AM6A 1LGXA 155LA 3DQBA 3VGAA 4XTLA 3C7WA 3ZPQA 1L77A 145LA 3K2RA 2VT4A 1L04A 4I7LA 2Z55A 4W55A 1G0KA 172LA 1P7SA 1S8LA 1L13A 1LW9A 163LA 4W57A 1DZEA 258LA 2RH1A 3BVDB 1L21A 120LA 3HANA 4XT1A 177LA 1L16A 2Y01A 1L02A 1F88A 1LI3A 2RBRA 1CV6A 3V2YA 3SN6R 1L15A 3SBBC 1LYGA 138LA 131LA 225LA 4A4MA 128LA 2B74A 2B6XA 3T45A 4EKPA 1LYDA 1KNIA 3VW7A 4I7QA 1ZYTA 1MGYA 3SB7A 1QS5A 1QSBA 3S3BB 114LA 1C3WA 192LA 3F9LA 1L42A 2WJKA 1P8UA 4EA3A 1L82A 3HT8A 4I7JA 144LA 2Y02A 3QBLA 3HUAA 4QIDA 5AX0A 243LA 3HAOA 4AMIA 1L0JA 1L27A 1L87A 1L08A 3OE6A 1DYAA 1KW5A 2OE9X 3QBKA 5LWEA 140LA 1L46A 2KSAA 1DYFA 1L23A 1QT3A 250LA 3NS0A 5I14A 151LA 3REYA 4G7RB 1L73A 227LA 4LZMA 5B6YA 4I7SA 2F32A 1L26A 1L24A 1LI6A 3CODA 2R4RA 1C6QA 1D3JA 4ARQB 1FBKA 3DKEX 2NTGA 3SB6A 1L93A 2RBOA 1PY6A 1PQOA 262LA 242LA 1L64A 4I7PA 4ARPA 1E0PA 3DN0A 1L45A 2I21A 5ETZA 2LZMA 1Q5JA 2KSYA 4OO9A 1M0MA 4ARQA 1L29A 5H2HA 2BRDA 2PEDA 4IB4A 159LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F95A 3WVXA 1ALCA 4H93A 1DI5A 1SX7A 261LA 4M4OA 1L18A 4I7RA 3W6FA 4FPDA 1T3PA 1PS5A 1RCMA 1L72A 167LA 4NHTA 3WUNA 2C8OA 1G0GA 4AQNA 3CAPA 3QJTB 3C82A 1DYCA 1L90A 2QB0B 5IDDA 1L0MA 4WLDA 1F50A 4L41A 4ZFPA 3AYMA 1LHMA 2ZZLA 5F16A 1IWWA 1CU5A 1FLYA 2ZIKA 1LJJA 1NHBA 4E3UA 1C67A 4WL6A 1QUGA 1CJ9A 5KKIA 3HAPA 5LVIA 1BWIA 1F10A 4CFPA 1LHIA 3HTBA 4NGJA 6LZMA 1QTVA 1L56A 1L19A 2D91A 5KXSA 157LA 3RUNA 4EOFA 1VDTA 4H9AA 1LMQA 4W56A 1CX7A 118LA 1F0WA 2W1MA 4G4HA 1L49A 251LA 4LT1A 1DPXA 1LMNA 3DN4A 3QNGA 1L80A 4QY9A 1ZWNA 2DQJY 2Z2EA 3EMSA 1I6SA 1QTDA 2YBIA 2NWDX 3TXEA 2Y00A 2I20A 1GE2A 2ZWBA 1HMLA 1FBBA 4KT3A 108LA 1C6BA 4FAAB 5F81A 4EIYA 3C80A 1HERA 1GB7A 1B5VA 2Z6BA 1I56A 4BAPA 1L69A 184LA 244LA 3A34A 3WYHA 1TLAA 1L83A 3GUNA 1NHEA 1KXYA 2XBRA 3M3UA 3K3TA 1L65A 247LA 1PXSA 1GF3A 4GP8B 1XEJA 3GUOA 4LYOA 3UZCA 2FYCA 4W51A 3WPLA 4YXCA 4G4CA 3E3DA 1AT9A 5B6ZA 1LZ4A 1DI4A 3RFMA 4EPIA 3P64A 5H2NA 196LA 4A7DA 4TTDA 1ZURA 1L85A 3UTVA 5HQ1A 5M1YA 4N8ZA 2BQOA 4H90A 181LA 233LA 2C8PA 1L05A 1C46A 1VDQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2B75 A;  3CDQ A;  1L31 A;  1CTW A;  1P64 A;  173L A;  2RBN A;  1JGJ A;  4ARM B;  3UTY A;  2HUK A;  1H2S A;  1CU3 A;  1HZX A;  1C60 A;  2OE4 X;  1LN6 A;  4YX7 C;  3CDR A;  1P8H A;  5B2N A;  7LZM A;  213L A;  1C6I A;  210L A;  1C6M A;  1QUD A;  212L A;  1LYF A;  3DN1 A;  1CV1 A;  2QAR C;  3ABW A;  4ARM A;  3HTG A;  1C6N A;  5FJG A;  4W54 A;  4BEZ A;  187L A;  1L52 A;  4I7O A;  139L A;  2QPD B;  3UTW A;  3S3D B;  3CDT A;  237L A;  230L A;  3G3X A;  4MD2 A;  188L A;  257L A;  1QT5 A;  4GRV A;  1XJI A;  5G53 A;  1U19 A;  1L92 A;  1BRD A;  112L A;  3G3W A;  1CUQ A;  2O4W A;  1C65 A;  3DMX A;  2RAZ X;  217L A;  1C61 A;  1H68 A;  1L40 A;  3HAS A;  2O79 A;  4BV0 A;  168L A;  1S51 A;  161L A;  3QJS B;  162L A;  4BEY A;  1L22 A;  4GP5 B;  200L A;  1L28 A;  4XTO A;  5JJN A;  3HT7 A;  2JAF A;  1P2L A;  1C64 A;  1QKO A;  1UAZ A;  1KY0 A;  1C6C A;  1L71 A;  178L A;  4I7M A;  2O7A A;  1S53 A;  1VJM A;  2EI4 A;  1DYB A;  4HWL A;  5A8E A;  1P36 A;  2F2Q A;  1L75 A;  1C69 A;  1G0P A;  201L A;  3OE9 A;  1C66 A; 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 1XME B;  3A7K A;  3AM6 A;  1LGX A;  155L A;  3DQB A;  3VGA A;  4XTL A;  3C7W A;  3ZPQ A;  1L77 A;  145L A;  3K2R A;  2VT4 A;  1L04 A;  4I7L A;  2Z55 A;  4W55 A;  1G0K A;  172L A;  1P7S A;  1S8L A;  1L13 A;  1LW9 A;  163L A;  4W57 A;  1DZE A;  258L A;  2RH1 A;  3BVD B;  1L21 A;  120L A;  3HAN A;  4XT1 A;  177L A;  1L16 A;  2Y01 A;  1L02 A;  1F88 A;  1LI3 A;  2RBR A;  1CV6 A;  3V2Y A;  3SN6 R;  1L15 A;  3SBB C;  1LYG A;  138L A;  131L A;  225L A;  4A4M A;  128L A;  2B74 A;  2B6X A;  3T45 A;  4EKP A;  1LYD A;  1KNI A;  3VW7 A;  4I7Q A;  1ZYT A;  1MGY A;  3SB7 A;  1QS5 A;  1QSB A;  3S3B B;  114L A;  1C3W A;  192L A;  3F9L A;  1L42 A;  2WJK A;  1P8U A;  4EA3 A;  1L82 A;  3HT8 A;  4I7J A;  144L A;  2Y02 A;  3QBL A;  3HUA A;  4QID A;  5AX0 A;  243L A;  3HAO A;  4AMI A;  1L0J A;  1L27 A;  1L87 A;  1L08 A;  3OE6 A;  1DYA A;  1KW5 A;  2OE9 X;  3QBK A;  5LWE A;  140L A;  1L46 A;  2KSA A;  1DYF A;  1L23 A;  1QT3 A;  250L A;  3NS0 A;  5I14 A;  151L A;  3REY A;  4G7R B;  1L73 A;  227L A;  4LZM A;  5B6Y A;  4I7S A;  2F32 A;  1L26 A;  1L24 A;  1LI6 A;  3COD A;  2R4R A;  1C6Q A;  1D3J A;  4ARQ B;  1FBK A;  3DKE X;  2NTG A;  3SB6 A;  1L93 A;  2RBO A;  1PY6 A;  1PQO A;  262L A;  242L A;  1L64 A;  4I7P A;  4ARP A;  1E0P A;  3DN0 A;  1L45 A;  2I21 A;  5ETZ A;  2LZM A;  1Q5J A;  2KSY A;  4OO9 A;  1M0M A;  4ARQ A;  1L29 A;  5H2H A;  2BRD A;  2PED A;  4IB4 A;  159L A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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