4LFPA

X-ray structure of the adduct between hen egg white lysozyme and a homoleptic gold(i) complex with the saccharynate ligand
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title The mode of action of anticancer gold-based drugs: a structural perspective.
pubmed doi rcsb
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4lfpA00
3ZEKA 1IORA 1Z55A 2VB1A 2LZ2A 3A94A 1IP7A 1LMNA 1GFJA 1UUZC 4GCEA 4KL7A 2DQCY 5E4PA 1LSYA 1GXV2 1LMCA 1C46A 2BQNA 1RJCB 2DQIY 1XGPC 2EKSC 2H5ZA 1BHZA 3HFMY 4NGWA 1LJHA 1XEKA 4XADA 5HQ1A 1LYOA 1FKQA 4PRUA 4W96A 1D9UA 1GDWA 1OUCA 2IHLA 1C7PA 1HFXA 1JSEA 1TBYA 2YBIA 2ZQ3A 2BQCA 1O23A 4GN5C 4H9FA 1JPOA 3RNXA 4CHXA 1JKCA 2MECA 1G7LC 1VEDA 1JKAA 1WQQA 1LMPA 5I4YA 1ALCA 3T6UA 4H9HA 2H9KA 3GXKA 2N5ZA 3ATOA 4WM3A 2BQMA 2ZWBA 1GE2A 2MEDA 3A92A 4PRQA 1QQYA 5B1FA 3SP3A 4NHQA 1GB9A 2MEGA 1BWHA 3A67Y 2BLYA 1HFYA 4NSJA 3WVYA 4CFPA 3W6AA 4ETCA 1GB6A 1DPWA 1YKYX 5C6JA 1GWDA 2DQFC 5FDJA 2Z19A 2ZIKA 3WUMA 1UIFA 4OW1A 4IATA 3FI7A 1SLYA 1GFAA 2W1XA 4PJ2C 4UWNA 3WPJA 5LAGA 1YANA 1CKCA 1CJ8A 1AM7A 4YENA 2LYZA 4YOPA 4H90A 1LZ1A 5B06A 1LMOA 2Z2EA 4H93A 4A7DA 1YQVY 1GB2A 2WARA 6LYZA 4RW2A 2Z2FA 4QDNA 3A95A 3LYTA 2DBTA 1FLWA 1LZ5A 5F16A 1GE3A 4OWHA 3OJPA 1UIDA 1NBYC 1LHKA 3AZ6A 3B0OA 1UIHA 1W08A 3A8ZA 3VWOA 1YAMA 4QGZA 1JTTL 2XBRA 4J0LA 3TXGA 2Z39A 2B5ZA 1GFUA 1LKSA 5C6IA 3WUAA 3AGIA 2BQFA 1VFBC 1IP4A 4HJZA 1HEPA 3EXDA 1GBZA 2BQKA 132LA 1LJEA 1DKJA 2ZYCA 1G7IC 1T6VL 5F14A 1IX0A 1D0MA 1LSNA 4LFXA 1XEIA 1BQLY 3TXBA 1GPQC 3EO5A 5KXRA 1GF0A 2NWDX 3IJUA 1TDYA 1VAUA 4OWCA 4NEBA 4PGJB 1G7MC 1GBWA 4PHIA 4ANRA 1HMLA 3A6CY 1BWIA 3J6KA 1EL1A 3WH1A 1LHLA 4NGIA 2EPEA 1GE1A 3P65A 4WO9A 4X3BA 9LYZA 4LGKA 5J7CA 1B5YA 1B7PA 3WW5A 4H92A 4NGKA 4H8ZA 2MEFA 1IY4A 3W6DA 1WQRA 3A91A 1KIPC 3G3BB 1B5ZA 4RDSA 2BQEA 193LA 2XBSA 2Z18A 5HLLA 4WOAA 4NGYA 1LTMA 1LSCA 3E3DA 4LYMA 1B0DA 4NGJA 1LJ3A 1LZ8A 4XJBA 5KXMA 1B7MA 1A2YC 2ZIJA 4NWEA 1BB4A 4GCDA 4NHIA 3W6BA 5KJ9A 3RZ4A 1GFRA 4WMGA 5LYZA 3WMKA 1FKVA 1IP2A 5F9UA 4DD7A 3A34A 1OUEA 3AZ4A 4NGZA 1GB0A 1IWTA 2MEEA 2CGIA 1JWRA 1LMQA 1LZRA 4DC4A 4WM5A 4XN6A 4AGAA 3A3RX 1LJJA 4NGLA 4DD3A 3LZ2A 1IR8A 4GN4A 5LXWA 3LYMA 1LZBA 2BQIA 1IOQA 2HECA 1LHHA 2YBLA 2YDGA 1YAOA 1LJKA 1QTEA 1BVKC 4YEOA 1HEQA 3CB7A 1VATA 5APCA 4E3UA 2MEBA 1FLYA 3WYHA 1B5VA 1DZBX 1IP3A 4N1CC 1DPXA 2DQHY 1JITA 4N0JA 3RU5A 1VDPA 1WQOA 2BQGA 1LOZA 1HSXA 5KXNA 4EMNA 4YF2A 4TX7A 1GAZA 5JENB 4R0FA 153LA 3AB6A 1OUAA 2BPUA 3G3AB 5F9XA 1B5WA 4H9EA 2HTXA 1LHIA 1YL0X 2W1YA 1I1ZA 1B7SA 1LZNA 1BGIA 1AT6A 1F0WA 1VDSA 4KXIA 1MLCE 5DL9A 4C3WA 1QUTA 5I4XA 2X0AA 5F81A 5FEKA 4ET8A 1JTOL 2I25L 4CGEA 2GV0A 2ZYPA 3W3EA 3WW6A 4EOFA 4OOTA 4KPMA 4B0DA 5B07A 3TXIA 1WVUA 3W6CA 1HENA 4HSFA 4BAFA 1GBSA 4GLVA 1GF4A 2ZNXY 1WQMA 1AT5A 2CJLA 5LYTA 3LZTA 7LYZA 4BAPA 5LA5A 4Z41A 4HJYA 4WLTA 4WLYA 1GFHA 4WG1A 3TXEA 4LT3A 1LAAA 2Q0MX 4OWAA 4WO6A 2DQAA 4TSCA 5I4WA 1GHLA 1G7HC 5M1YA 2EQLA 1UIBA 4TSBA 4J1AA 4G4HA 1IC4Y 1GF5A 5D5CA 2PC2A 3P68A 1IOSA 2BQAA 4Z46A 4H9CA 4CJ2A 1RFPA 1KXYA 1SQ2L 1UA6Y 2YSSC 2W1MA 5KXLA 1EQ4A 3AGHA 1RI8B 3QNGA 4P2EA 1IOCA 1HEWA 2G4NA 4MSTA 2DQJY 4NG1A 4UWVA 1LSFA 1LZTA 3T36A 3BKVA 1J1PY 1LSAA 2BQLA 4H91A 1GFTA 3CSRA 5I54A 1IWXA 1UIAA 2F2NA 2DQGY 4HPIA 1REMA 1LZGA 1KXXA 4FJRA 1D6QA 1GFVA 1KXWA 2DKVA 4NGOA 1GEZA 1FLUA 3K3TA 5IHGA 133LA 5DLAA 4G4CA 3CT0A 1VDQA 5KXYA 5LINA 1B7QA 2F4GA 4H9BA 2BQDA 4WM6A 2IFFY 2MEIA 1IR9A 1V7TA 1FBIX 5HMJA 1FDLY 1F6SA 2HEAA 2BQOA 1GF6A 1HEMA 1PS5A 3D3DA 5L3IA 2ZILA 1ZV5L 1B2KA 3AW6A 1BVXA 3D9AC 3TXKA 1IWZA 2ZNWY 154LA 4XJHA 2Y8PA 5KXZA 2AUBA 4RLNA 1WVVA 1I56A 3EMSA 3M3UA 4TTDA 5FELA 3WL2A 4FDYA 1LPIA 2BQHA 1YILA 1HEOA 4WM4A 5EBHA 134LA 1JKDA 2BQBA 8LYZA 1VDTA 1LZEA 4WLXA 1CNSA 1OUJA 4ETBA 4BS7A 4LT2A 3B0KA 1D0LA 1GB7A 1CJ6A 4NIJA 2CDSA 2HU3A 1LZ6A 5APEA 1AZFA 1LHJA 4LT1A 1H87A 4CFOA 4WM1A 1IR7A 3ZVQB 3AZ7A 3TMUA 1XEJA 4LYZA 1DI3A 4HPEA 1OUGA 1YKXX 1B7NA 1AKIA 3B72A 4ML7A 4W94A 1FN5A 1GD6A 5D5FA 1LZYA 4LYBA 1HC0A 1GB3A 1UC0A 4N1EI 3ULRA 4BADA 3N9AA 1GBOA 4LYTA 1JJ1A 1LZ4A 3AYQA 3HBHA 4O34A 1GE4A 1LSDA 4DD2A 4ZEEA 1JIYA 1MELL 1GBXA 2HEEA 4J7VA 1GB8A 4HJVA 4RW1A 1JISA 1J1OY 5LVIA 5LYMA 3QY4A 1QUSA 1HERA 5KKJA 1IWUA 1LYYA 5KKIA 4ETAA 2D6BA 4XJGA 5L9JA 1GFEA 1B9OA 4NHPA 4OWEA 1IVMA 3RW8A 4ETEA 4I0CA 2F4AA 4G9SA 1RCMA 5L3HA 1HNLA 2XJWA 3TMXA 3WXUA 5E9RA 2D91A 4LT0A 1KIQC 3N9EA 4B4IA 3WU9A 2BQJA 2DQDY 4KT3A 4U3XB 1DI5A 1CKHA 4HTKA 5KXWA 5I5QA 1I20A 4Z3MA 1QSAA 5B05A 3LHMA 1NMMA 1QTKA 2FBDA 5LVGA 4NHTA 5FHWA 1GEVA 2XTHA 3HBDA 5HNCA 1LSMA 1JEFA 2FBBA 4HP0A 5KY1A 4DD0A 3WPKA 3TMWA 2YBMA 1OQMA 4G49A 1A4VA 3WXTA 4NY5A 3KAMA 1DQJC 2D4JA 4DWXA 4B49A 4WLDA 3WUNA 5II3A 2LHMA 1XFPL 5FSTA 3TXHA 2HEDA 1LJNA 3EBAB 4IASA 4HTNA 1QIOA 4H8YA 3AGGG 5C6LA 5IDDA 1CKGA 4WL6A 5T3FA 1GDXA 1IEEA 2C8PA 1XGUC 1GFGA 1V7SA 1REYA 1OUBA 3A96A 4QY9A 4ET9A 4II8A 4H94A 3AJNA 1GF7A 1LMAA 1EQEA 3MGWA 1E8LA 1CJ7A 1YAPA 1UICA 4N8ZA 5DM9A 1B7OA 5B59A 1F6RA 5KXSA 4N5RA 2RSCA 1BB3A 4LFPA 1IWWA 1TAYA 4NG8A 4XJDA 4ZIXA 4WM2A 4HTQA 2H9JA 1LZ9A 2HEBA 4MCKA 1GB5A 1UCOA 3TXDA 4UWUA 4MR1A 2G4QA 4XYYA 5I53A 1IIZA 1OUDA 4WL7A 4OWBA 1WQPA 1DKKA 1NDMC 4DD1A 1B7RA 1LYSA 1HELA 2HUBA 3B6LA 4N9RA 1GF8A 3N9CA 1LSPA 4GCCA 5KXOA 2HU1A 1CJ9A 1LCNA 4Z98A 3FE0A 3TXFA 3ATNA 1C43A 1XSFA 3J4GA 4TWSA 4DT3A 4B4JA 3BKHA 1D0KA 5KXTA 208LA 5A3EA 1T3PA 4GN3A 4NFVA 1INUA 1D6PA 1J1XY 4M6DA 1ZVHL 1HF4A 2LYMA 1NF5A 5LVJA 5FCPA 2BLXA 1LYZA 2I26L 4NSHA 4H9AA 3A3QA 6LYTA 5LVHA 1BWJA 1ZMYL 1XGRC 2YBHA 4DDCA 4YM8A 3AW7A 1NQIA 1YL1X 3WVXA 1XGTC 3WU7A 1LKRA 5A3ZA 4PPOA 4IJ4A 2CWIA 1LJGA 1OUFA 1NHEA 1IY3A 3AZ5A 3IJVA 1DXJA 1QDRA 3A93A 2G4PA 3A6BY 3CT1A 1NWGA 3A90A 1GXXA 1WTMA 1IP6A 4H9IA 1JHLA 4HV2A 1QDTA 1LZCA 1JSFA 3M18B 2FYDA 2LZTA 4XENA 5APDA 2YVBA 1REXA 4NSGA 4R6CA 2ZQ4A 4LZTA 1CKFA 1NKHA 1BB7A 5DN5A 2LYOA 1IO5A 1LZDA 2I6ZA 1GF9A 1FLQA 4TUNA 3QE8A 1P2CC 1OUIA 2A7DA 4J1BA 1EQ5A 1HFZA 5ILFA 1YIKA 1NBZC 3P66A 3WU8A 5K7OA 1TCYA 1GBYA 5LA8A 1IOTA 4B1AA 4B4EA 194LA 5KXKA 1TEWA 1IWVA 1GE0A 3W6FA 1LSEA 1QSWA 4WG7A 4DDBA 4GCFA 1CKDA 1LHMA 1OP9B 4GLAA 3GXRA 1C08C 2HEFA 4HV1A 3CT5A 4M4OA 1LZSA 3W6EA 207LA 3CSZA 1PZYA 1H6MA 1UIEA 1WQNA 4ZFPA 4G4BA 3LYZA 4L41A 3LYOA 1B7LA 1IC5Y 1LSZA 4H8XA 3F6ZA 4H1PA 4OOOA 3CSQA 3HBEX 3OK0A 2W1LA 1LJ4A 1ZVYB 1BB6A 3LN2A 2C8OA 5APFA 5B1GA 5AMYA 1XGQC 2F30A 4ETDA 5LAFA 1W6ZA 3P4ZA 1HSWA 1WTNA 1YKZX 1GAYA 1N4FA 1UIGA 1JTPL 2MEHA 1BB5A 1LJFA 3B0IA 4NSIA 4NHSA 3TXJA 4AXTA 4C5FA 4YEMA 1JKBA 1IC7Y 2DQEY 2YBNA 5ILCA 3ZVQA 1LJIA 2BAAA 1LSBA 1RE2A 5HMVA 4XJIA 1C10A 5HNLA 1G7JC 1IWYA 1IP1A 1JJ3A 3RT5X 4RLMA 1F10A 5IELA 5DN4A 4DD9A 2EIZC 2MEAA 4DYGA 1REZA 1C45A 5KXPA 5LVKA 3WPLA 4QEQA 4GCBA 1B5UA 2YBJA 1JUGA 4D9ZA 3IWRA 1KIRC 2A7FA 1B5XA 2Z12A 1LSGA 1UACY 4I8SA 1GFKA 1OUHA 4LYCA 1IP5A 2Z38A 135LA 4XJFA 1LZAA 5LIOA 5KXXA 1YROA 2FYCA 1LMTA 3P64A 4DDAA 4NWHA 2D4IA 2D4KA 1GF3A 1YAQA 1UBZA 4NGVA 3TMVA 1HMKA 1JJ0A 1HHLA 1NDGC 4LYOA 2Z37A 1DI4A 3WULA 3CQLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1Z55A 3GUMA 1IP7A 2DQCY 2H5ZA 4NGWA 2EKSC 5HQ1A 1BHZA 3HFMY 4XADA 1LYOA 1G0KA 1OUCA 2IHLA 1HFXA 1JSEA 1CV5A 2BQCA 4H9FA 1JKCA 5I4YA 1C6BA 3GXKA 2N5ZA 3VW7A 1DYDA 2ZWBA 2MEDA 235LA 122LA 1DPWA 1GWDA 1LPYA 2ZIKA 1L52A 1SWYA 1L88A 3FI7A 140LA 5LAGA 1CJ8A 1P56A 4YXAC 1LMOA 4H93A 2RH1A 2WARA 1L57A 4RW2A 2Z2FA 255LA 2DBTA 1FLWA 5F16A 1L46A 1L49A 1UIHA 1W08A 2XBRA 1L01A 5C6IA 1L31A 1VFBC 1LJEA 2ANVA 107LA 1G7IC 4LFXA 1LSNA 1XEIA 4YX7C 1GPQC 5KXRA 192LA 1PQIA 2NWDX 3IJUA 1C6IA 1HMLA 1LHLA 4NGIA 1JTNA 1GE1A 9LYZA 1LWKA 162LA 3WW5A 2OE9X 1QT3A 3W6DA 1CX7A 3A91A 2BQEA 4NGJA 1LJ3A 4XJBA 1KW5A 1A2YC 3RZ4A 1BB4A 2RBQA 1IP2A 5F9UA 1OUEA 3AZ4A 1IWTA 1C69A 1JWRA 4XN6A 4DD3A 1T8AA 5LXWA 1IOQA 2YBLA 1LHHA 1L44A 2YDGA 1LJKA 1QTEA 1HEQA 1FLYA 3WYHA 3CDRA 3RU5A 5KXNA 153LA 1L56A 3AB6A 2BPUA 1PQDA 1B5WA 2Q9DA 1L82A 1B7SA 196LA 1LZNA 3FA0A 1AT6A 1VDSA 3DMVA 2X0AA 5F81A 2ZYPA 4EOFA 1XEPA 4KPMA 248LA 1C6KA 3W6CA 1L07A 1GBSA 2ZNXY 2O7AA 3V2YA 1QTVA 4WLTA 1L66A 4LT3A 5I4WA 4TSCA 5M1YA 4TSBA 219LA 4H9CA 4CJ2A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3ZEK A;  1IOR A;  1Z55 A;  2VB1 A;  2LZ2 A;  3A94 A;  1IP7 A;  1LMN A;  1GFJ A;  1UUZ C;  4GCE A;  4KL7 A;  2DQC Y;  5E4P A;  1LSY A;  1GXV 2;  1LMC A;  1C46 A;  2BQN A;  1RJC B;  2DQI Y;  1XGP C;  2EKS C;  2H5Z A;  1BHZ A;  3HFM Y;  4NGW A;  1LJH A;  1XEK A;  4XAD A;  5HQ1 A;  1LYO A;  1FKQ A;  4PRU A;  4W96 A;  1D9U A;  1GDW A;  1OUC A;  2IHL A;  1C7P A;  1HFX A;  1JSE A;  1TBY A;  2YBI A;  2ZQ3 A;  2BQC A;  1O23 A;  4GN5 C;  4H9F A;  1JPO A;  3RNX A;  4CHX A;  1JKC A;  2MEC A;  1G7L C;  1VED A;  1JKA A;  1WQQ A;  1LMP A;  5I4Y A;  1ALC A;  3T6U A;  4H9H A;  2H9K A;  3GXK A;  2N5Z A;  3ATO A;  4WM3 A;  2BQM A;  2ZWB A;  1GE2 A;  2MED A;  3A92 A;  4PRQ A;  1QQY A;  5B1F A;  3SP3 A;  4NHQ A;  1GB9 A;  2MEG A;  1BWH A;  3A67 Y;  2BLY A;  1HFY A;  4NSJ A;  3WVY A;  4CFP A;  3W6A A;  4ETC A;  1GB6 A;  1DPW A;  1YKY X;  5C6J A;  1GWD A;  2DQF C;  5FDJ A;  2Z19 A;  2ZIK A;  3WUM A;  1UIF A;  4OW1 A;  4IAT A;  3FI7 A;  1SLY A;  1GFA A;  2W1X A;  4PJ2 C;  4UWN A;  3WPJ A;  5LAG A;  1YAN A;  1CKC A; 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 1LSE A;  1QSW A;  4WG7 A;  4DDB A;  4GCF A;  1CKD A;  1LHM A;  1OP9 B;  4GLA A;  3GXR A;  1C08 C;  2HEF A;  4HV1 A;  3CT5 A;  4M4O A;  1LZS A;  3W6E A;  207L A;  3CSZ A;  1PZY A;  1H6M A;  1UIE A;  1WQN A;  4ZFP A;  4G4B A;  3LYZ A;  4L41 A;  3LYO A;  1B7L A;  1IC5 Y;  1LSZ A;  4H8X A;  3F6Z A;  4H1P A;  4OOO A;  3CSQ A;  3HBE X;  3OK0 A;  2W1L A;  1LJ4 A;  1ZVY B;  1BB6 A;  3LN2 A;  2C8O A;  5APF A;  5B1G A;  5AMY A;  1XGQ C;  2F30 A;  4ETD A;  5LAF A;  1W6Z A;  3P4Z A;  1HSW A;  1WTN A;  1YKZ X;  1GAY A;  1N4F A;  1UIG A;  1JTP L;  2MEH A;  1BB5 A;  1LJF A;  3B0I A;  4NSI A;  4NHS A;  3TXJ A;  4AXT A;  4C5F A;  4YEM A;  1JKB A;  1IC7 Y;  2DQE Y;  2YBN A;  5ILC A;  3ZVQ A;  1LJI A;  2BAA A;  1LSB A;  1RE2 A;  5HMV A;  4XJI A;  1C10 A;  5HNL A;  1G7J C;  1IWY A;  1IP1 A;  1JJ3 A;  3RT5 X;  4RLM A;  1F10 A;  5IEL A;  5DN4 A;  4DD9 A;  2EIZ C;  2MEA A;  4DYG A;  1REZ A;  1C45 A;  5KXP A;  5LVK A;  3WPL A;  4QEQ A;  4GCB A;  1B5U A;  2YBJ A;  1JUG A;  4D9Z A;  3IWR A;  1KIR C;  2A7F A;  1B5X A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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