4LFXA

X-ray structure of the adduct between hen egg white lysozyme and auoxo6, a dinuclear gold(iii) complex with -dioxo bridges linking the two metal centers
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title The mode of action of anticancer gold-based drugs: a structural perspective.
pubmed doi rcsb
total genus 44
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4lfxA00
1LZCA 5HMVA 3WW5A 4HTNA 2Z18A 1YKYX 3N9CA 1GD6A 1IR7A 3GXKA 1GF3A 5C6LA 3AGHA 5F14A 1GBZA 4D9ZA 1F6RA 4EOFA 2H9KA 1ALCA 2HECA 4GCDA 4LT2A 2BQHA 4WL6A 2CJLA 5B06A 1LZSA 3WUMA 1VDQA 4UWUA 3WXTA 1YANA 1BWJA 4ML7A 4NY5A 3EBAB 2ZYPA 1TBYA 4DWXA 2BQAA 1BHZA 1VDPA 1ZVHL 1OUEA 1ZV5L 2YBHA 3LYZA 1WVVA 4N1EI 1OP9B 3OK0A 3W3EA 2CDSA 1DPXA 1KIPC 2HU1A 1JJ1A 4XJDA 1GFRA 2W1LA 3A67Y 4PPOA 5B1FA 4QGZA 1SLYA 3A8ZA 3A91A 1DZBX 5FDJA 1LSMA 4LYOA 4N9RA 2NWDX 5F9UA 1OUGA 4NIJA 5LINA 5LXWA 135LA 1MELL 4W94A 4XADA 4C5FA 1OQMA 1A4VA 3CT0A 4GCFA 1HEQA 2FBBA 5FELA 1GEVA 1HEMA 7LYZA 1IWXA 2D6BA 1IP2A 4GCEA 3W6AA 3ZEKA 1NHEA 4AGAA 2ZNXY 5I54A 1C10A 2HU3A 5LIOA 5LYMA 1UIEA 1REXA 4HJVA 3RT5X 1LHJA 4WM2A 4XJHA 4B1AA 3TMVA 1HMLA 1J1PY 2ZIJA 4YOPA 1UIFA 5HNCA 1LMPA 1JKBA 3A6CY 1GAZA 5M1YA 2ZWBA 2BQIA 3P4ZA 1EL1A 1YQVY 4ETDA 3WH1A 2BQKA 2N5ZA 4RDSA 1IY3A 1G7HC 3WMKA 1XGTC 1T6VL 4KPMA 5APCA 2DQGY 5I4YA 5KXRA 3M3UA 1TCYA 1Z55A 5F9XA 2ZYCA 3B72A 4LYZA 5L3HA 3RW8A 1XEKA 3VWOA 1HFXA 3TXHA 2YBLA 4GCBA 1G7JC 1EQ5A 3ATOA 2BQNA 3WPLA 1B5YA 3B0OA 1IWVA 4WM3A 3TMWA 4CHXA 5LVJA 1OUCA 3LYTA 3TXDA 1C46A 1GF8A 4BAPA 1GFTA 5LYZA 5AMYA 2GV0A 134LA 1D9UA 4PRUA 4LYCA 5II3A 4G9SA 1DXJA 3G3BB 4M6DA 4DYGA 4Z46A 1FLUA 4XJFA 1LZRA 4J1AA 1W08A 4LZTA 1G7LC 1CJ7A 1LYZA 5T3FA 4BADA 2I26L 5EBHA 154LA 3AW6A 4IATA 1LZNA 1P2CC 1VATA 4YEOA 4BAFA 5HQ1A 1BB3A 4YEMA 4OOTA 1HSWA 4B4EA 4L41A 2IFFY 1CNSA 1F6SA 1KXXA 2B5ZA 5D5FA 4NGWA 4EMNA 5B1GA 1C43A 1IP5A 1XGQC 1UA6Y 1YROA 1LHMA 1FLQA 1BQLY 1LZEA 1XGUC 3MGWA 4G4HA 4MSTA 5E4PA 2Q0MX 1GB9A 1H6MA 4HTQA 2YVBA 3RZ4A 2HTXA 2HUBA 1LYSA 5APDA 5KXSA 1QTKA 4H9CA 3ZVQA 2BQLA 2C8OA 5LAGA 3D9AC 5A3ZA 4P2EA 1YIKA 4NGYA 1LOZA 4ETEA 4N0JA 1FDLY 4XN6A 4I8SA 1LJJA 4ANRA 1A2YC 1IWWA 4E3UA 2F4AA 1IP4A 1J1XY 1UC0A 1C7PA 1LZ9A 2G4NA 4H93A 4WLTA 3K3TA 4DT3A 1NQIA 4M4OA 1B7RA 4GN3A 1G7MC 1GFUA 1BGIA 1NF5A 4B4JA 1VAUA 3A92A 3AZ4A 1WQRA 1LJIA 1QSWA 4J0LA 3WW6A 1B5VA 1XGRC 4ZFPA 4G4BA 1WTMA 1LHHA 1LHIA 1HEPA 2Z2EA 1T3PA 1HFYA 4WM1A 2BQOA 5LVKA 1GE4A 1UIAA 2C8PA 4NG8A 1B7LA 1YILA 4XJIA 1GB6A 1AM7A 2MEFA 1XEJA 1I20A 4OWCA 4OW1A 4LFPA 4TSCA 1UBZA 1YL1X 1WQQA 1HC0A 1JSFA 1NDGC 4H9IA 3TXIA 1GF6A 4DD9A 1VDTA 3TXFA 2D4JA 3AGGG 3CSRA 1GAYA 3J4GA 1LYYA 3HBEX 4Z98A 1GF9A 3CB7A 1GB0A 1OUHA 2A7FA 3CT5A 2ZQ4A 3OJPA 1GPQC 5I53A 1GB7A 3A3RX 2YSSC 3FI7A 1C45A 1FN5A 1REYA 2BLXA 3WU8A 3D3DA 1IO5A 1DKKA 1GF7A 1OUJA 3ZVQB 4LYTA 3FE0A 1JPOA 3A94A 4H1PA 1JITA 1LZ8A 1GBXA 1DPWA 208LA 4H9BA 3QY4A 3G3AB 3A96A 1EQ4A 1CJ6A 1IOTA 3RU5A 2G4QA 2YBNA 1KXYA 1LMOA 194LA 2LYOA 5IDDA 4I0CA 1CKDA 1KXWA 4H9FA 1FKQA 4OWHA 1BWHA 5KXTA 4B0DA 1GDXA 1LSYA 5FCPA 3A34A 4TX7A 4AXTA 2IHLA 1G7IC 1GHLA 1D0KA 3AW7A 4HSFA 4HJZA 4J7VA 3B6LA 4NHSA 2FBDA 1WTNA 3AJNA 4HV1A 4XYYA 2MEEA 5KXWA 4HPIA 9LYZA 1B7SA 4NWEA 4NHQA 4PHIA 1JSEA 1IR9A 1D6PA 1LTMA 4R0FA 4QY9A 5KY1A 2EIZC 4GLAA 4OWEA 1BVKC 4OOOA 5K7OA 2DQDY 3WYHA 4WL7A 3TXEA 2F4GA 2WARA 2FYDA 4H92A 2YBIA 5LVGA 2ZNWY 1HHLA 1LMQA 3EXDA 4GCCA 5APEA 4DD1A 8LYZA 1IC4Y 3B0IA 1XSFA 3B0KA 3A3QA 3P65A 1IR8A 2D4IA 1GFEA 5HMJA 1WQNA 5B05A 1BVXA 1IC5Y 1IIZA 1LZ5A 2DQCY 1VDSA 5C6IA 1OUBA 4G49A 1BB5A 1DQJC 1QIOA 1HENA 1I56A 4NGJA 1QQYA 1F0WA 3LYOA 1UICA 1JWRA 1LSEA 2LZTA 2HEAA 1QDRA 4LFXA 2RSCA 4H9AA 3WPKA 2EKSC 1O23A 4WM5A 3W6CA 4A7DA 1LCNA 3WVXA 1GB5A 1YAMA 2F2NA 1HSXA 1RCMA 4RW2A 3WPJA 2YBJA 1NKHA 4HTKA 2DKVA 3QNGA 1FBIX 4YF2A 1LZAA 2I25L 1LSGA 153LA 1DI3A 1UIDA 1ZVYB 2BLYA 4HJYA 3LYMA 4H8XA 4PGJB 3T36A 4BS7A 4NGOA 1GEZA 4Z41A 3A95A 1WQOA 3WL2A 1HERA 3WUAA 4G4CA 1IWTA 1GFAA 4DD7A 1EQEA 4TWSA 3BKHA 1OUIA 2BQMA 2XJWA 3IJUA 5LYTA 3ATNA 4HV2A 1IWYA 3TMUA 3W6BA 3CSZA 1IORA 1TDYA 1UIGA 1GF5A 2CGIA 4DD0A 4MR1A 1LZBA 132LA 2D91A 4TSBA 3KAMA 6LYZA 4WG7A 2FYCA 5KKJA 1LSZA 2BQJA 2HEFA 1B2KA 1B5ZA 4WM4A 3P66A 2XBSA 4CFPA 2CWIA 2ZIKA 5J7CA 1CJ8A 4RW1A 1GDWA 3LN2A 4MCKA 4LT1A 1PZYA 2LZ2A 5KXNA 4NSGA 4ETBA 5IELA 4C3WA 3QE8A 2Z37A 5APFA 1XEIA 3TMXA 3TXKA 1NBYC 4WLDA 3CQLA 1RJCB 1NWGA 1IWZA 2DQIY 4XJGA 4FJRA 4H9EA 4WOAA 3WULA 4LT0A 1LPIA 1LZ4A 1NMMA 1GFKA 1F10A 3LHMA 1CKCA 4IASA 4YENA 1HMKA 2W1YA 4LGKA 1D0LA 1PS5A 4RLNA 2DQAA 5FEKA 1GE3A 3E3DA 1GBOA 1B5XA 4NFVA 5B07A 1GE1A 1GB2A 2A7DA 1OUDA 2YDGA 3AZ7A 4UWNA 1QUSA 1UACY 1LSCA 1XFPL 1CKFA 1GB3A 2MEBA 5DN4A 5D5CA 1UCOA 4N5RA 4XJBA 3AYQA 4QDNA 1JKAA 1LMAA 4GN5C 1LMTA 2Z2FA 5DM9A 5L9JA 4GLVA 2HEDA 4UWVA 1LZDA 1GFGA 4H8ZA 4CFOA 4J1BA 4DDCA 4DDAA 5KXLA 1JJ3A 4KL7A 1YAPA 2MEDA 5IHGA 3IWRA 1IVMA 1QUTA 1CJ9A 3A90A 1DI4A 1JTOL 133LA 5LAFA 2Z39A 2I6ZA 4NGKA 1RFPA 3TXJA 4DC4A 1BB7A 5DL9A 1V7TA 2YBMA 1JEFA 1LSNA 1KIQC 5FHWA 1HF4A 5I5QA 2MEHA 1LZ6A 1V7SA 1YKXX 2BQCA 2HEEA 5F16A 5KXYA 2XBRA 1E8LA 1UIBA 3P64A 4KXIA 1LKSA 6LYTA 2EPEA 4ET9A 207LA 3T6UA 1JKCA 2LYZA 4NGVA 4NEBA 4NSHA 2LHMA 1GFJA 4N1CC 1SQ2L 1GE0A 1DI5A 1B7QA 1W6ZA 4NHIA 1BB6A 4II8A 4ETAA 1VFBC 1GBSA 1YKZX 1IWUA 2MEGA 2MECA 1GWDA 1JTPL 2PC2A 3CT1A 3P68A 4O34A 2BQFA 2F30A 4ET8A 4WG1A 5ILFA 1KIRC 2DBTA 1N4FA 1FLWA 3N9AA 5LA8A 5KXKA 5I4XA 4PJ2C 4WLXA 3TXGA 1B5UA 1IOCA 4H8YA 2DQJY 4LYMA 5KJ9A 4FDYA 3WUNA 5KXMA 1IOQA 1LJ4A 1IX0A 2XTHA 1QTEA 1MLCE 2MEAA 2DQHY 4YM8A 4H91A 1GBYA 1GF4A 1C08C 1QDTA 1HELA 4KT3A 1B7NA 3TXBA 1LJHA 2Z12A 3A6BY 1LMNA 1LJNA 2DQEY 2BQGA 3F6ZA 5KXPA 1YAOA 1YAQA 1GBWA 1RI8B 1H87A 2VB1A 5C6JA 3EMSA 3A93A 1LZTA 1FKVA 4WMGA 3HFMY 1IP1A 3HBDA 4DD2A 1B9OA 1GB8A 2BQEA 3WVYA 1CKGA 4N8ZA 5DLAA 1INUA 3WXUA 5KXXA 1B7OA 1DKJA 1JKDA 1TEWA 4H94A 4H90A 4IJ4A 2Z19A 4W96A 5JENB 2Y8PA 4ZEEA 4NSJA 1B5WA 3IJVA 2BQDA 1JIYA 1IP3A 1AZFA 1JUGA 1LHLA 1LZGA 1LSAA 1LSBA 1UIHA 2AUBA 3LZTA 4OWAA 3W6EA 3ULRA 3W6FA 1RE2A 1LYOA 2X0AA 2BPUA 4Z3MA 2BQBA 1QSAA 1IEEA 3J6KA 4B4IA 1VEDA 1D6QA 1JHLA 2DQFC 1GE2A 3LZ2A 3WU7A 2H5ZA 3AZ6A 1WQPA 1NDMC 1WVUA 1HEOA 1GF0A 5B59A 5E9RA 3GXRA 3AB6A 5HLLA 4WLYA 1I1ZA 1FLYA 1GFVA 4OWBA 1HFZA 3RNXA 4R6CA 1LJFA 2W1XA 1LMCA 1BWIA 4HPEA 4B49A 4DD3A 4X3BA 1B7PA 3AGIA 1GXV2 5LVIA 2W1MA 4NWHA 2HEBA 1HEWA 1LKRA 3CSQA 1LAAA 2EQLA 3HBHA 1CKHA 5KXOA 1JTTL 4TTDA 4U3XB 4NHTA 3BKVA 1IP6A 4LT3A 2MEIA 3SP3A 1J1OY 1IOSA 4H9HA 4TUNA 1TAYA 1IP7A 1JISA 4LYBA 4PRQA 3WU9A 5ILCA 1LJ3A 5L3IA 5LVHA 1LHKA 1OUFA 3W6DA 5LA5A 2Z38A 1HNLA 1AT5A 1AT6A 1UUZC 1YL0X 1LZ1A 1OUAA 1LJKA 1D0MA 3EO5A 1LJEA 1NBZC 1REZA 3N9EA 1LSFA 1JJ0A 1ZMYL 2LYMA 4GN4A 4NGIA 4DDBA 1B7MA 3M18B 1LJGA 2BAAA 1LZYA 2H9JA 2ZILA 1IY4A 1WQMA 4RLMA 4WM6A 4CJ2A 1LSDA 1LSPA 3AZ5A 5F81A 2D4KA 2G4PA 4NGZA 4WO9A 5A3EA 1B0DA 5HNLA 1GXXA 1AKIA 5I4WA 1IC7Y 4NSIA 5FSTA 4XENA 4QEQA 4ZIXA 4ETCA 4NHPA 4HP0A 4NGLA 193LA 1BB4A 5DN5A 4CGEA 5KKIA 4WO6A 1GFHA 1REMA 2ZQ3A 5KXZA 1XGPC 4NG1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C6IA 5HMVA 1LYJA 3WW5A 3HDEA 1G0PA 1IR7A 1GF3A 1L31A 3AGHA 1GBZA 4EOFA 2H9KA 4EPFA 1ALCA 1P36A 5B06A 1LZSA 216LA 3G3XA 3EBAB 1L17A 2ZYPA 1BHZA 1ZV5L 1OUEA 3OK0A 1QT8A 2CDSA 1DPXA 1JJ1A 2W1LA 1SLYA 246LA 5FDJA 1LSMA 2NWDX 1OUGA 1CX6A 2B74A 1L54A 4XADA 226LA 4C5FA 1IWXA 1K28A 158LA 3W6AA 177LA 3ZEKA 5I54A 1C6HA 3RT5X 1OVHA 4XJHA 4B1AA 1J1PY 1C64A 1L05A 1L19A 4ETDA 1OV7A 5APCA 1L38A 1TCYA 3VWOA 1XEKA 254LA 1EQ5A 2BQNA 3WPLA 1IWVA 151LA 1GF8A 4PRUA 4XJFA 4LZTA 118LA 1L13A 178LA 4IATA 1C6QA 5HQ1A 1BB3A 4YEMA 4OOTA 1C66A 4NGWA 4EMNA 197LA 5B1GA 1C43A 1L29A 1XGUC 4HTQA 2HTXA 1L46A 3DN3A 5KXSA 4H9CA 3ZVQA 5LAGA 1KW7A 146LA 4N0JA 1FDLY 1A2YC 4E3UA 222LA 3HH3A 1UC0A 4H93A 4DT3A 1B7RA 1VAUA 3A92A 1L75A 1WQRA 2RB1X 1LJIA 4J0LA 7LZMA 249LA 3WW6A 4G4BA 1LHIA 4WM1A 2BQOA 5LVKA 1UIAA 2C8PA 4XJIA 1D3JA 4LFPA 1YL1X 1JSFA 1NDGC 1GF6A 1P6YA 1WTHA 2D4JA 3J4GA 2B75A 4Z98A 3HBEX 1GF9A 3CB7A 4EKRA 1GB7A 1FN5A 1LYHA 262LA 3DKEX 1PQJA 1SX2A 1DYCA 1JPOA 1JITA 208LA 1GBXA 1DPWA 3G3AB 1DYGA 1CJ6A 257LA 1KXYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1LZC A;  5HMV A;  3WW5 A;  4HTN A;  2Z18 A;  1YKY X;  3N9C A;  1GD6 A;  1IR7 A;  3GXK A;  1GF3 A;  5C6L A;  3AGH A;  5F14 A;  1GBZ A;  4D9Z A;  1F6R A;  4EOF A;  2H9K A;  1ALC A;  2HEC A;  4GCD A;  4LT2 A;  2BQH A;  4WL6 A;  2CJL A;  5B06 A;  1LZS A;  3WUM A;  1VDQ A;  4UWU A;  3WXT A;  1YAN A;  1BWJ A;  4ML7 A;  4NY5 A;  3EBA B;  2ZYP A;  1TBY A;  4DWX A;  2BQA A;  1BHZ A;  1VDP A;  1ZVH L;  1OUE A;  1ZV5 L;  2YBH A;  3LYZ A;  1WVV A;  4N1E I;  1OP9 B;  3OK0 A;  3W3E A;  2CDS A;  1DPX A;  1KIP C;  2HU1 A;  1JJ1 A;  4XJD A;  1GFR A;  2W1L A;  3A67 Y;  4PPO A;  5B1F A;  4QGZ A;  1SLY A;  3A8Z A;  3A91 A;  1DZB X;  5FDJ A;  1LSM A;  4LYO A;  4N9R A;  2NWD X;  5F9U A;  1OUG A;  4NIJ A;  5LIN A;  5LXW A;  135L A;  1MEL L;  4W94 A;  4XAD A;  4C5F A;  1OQM A;  1A4V A;  3CT0 A;  4GCF A;  1HEQ A;  2FBB A;  5FEL A;  1GEV A;  1HEM A;  7LYZ A;  1IWX A;  2D6B A;  1IP2 A;  4GCE A;  3W6A A;  3ZEK A;  1NHE A;  4AGA A;  2ZNX Y;  5I54 A;  1C10 A;  2HU3 A;  5LIO A;  5LYM A;  1UIE A;  1REX A;  4HJV A;  3RT5 X; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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