4LL4B

The structure of the trx and txnip complex
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
b'MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPAKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKCMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The structural basis for the negative regulation of thioredoxin by thioredoxin-interacting protein
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin-interacting protein
source organism Homo sapiens
molecule tags Antitumor protein/protein binding
total genus 35
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ll4B00
1DBYA 3O76A 4DSQA 2C0DA 2QC7A 2F9SA 2LNSA 4ML1A 4TXOA 3IHQA 3F6FA 1PL1A 1S3DA 4LL4B 2GQKA 4RI7A 3QPMA 4IGJA 19GSA 4AJ6A 5ID2A 5JWQB 1WPIA 1ZYEA 2F51A 3HJOA 1GLPA 2O7KA 1TI3A 1J0FA 2VIMA 1T4YA 4O5RA 5F05A 1USBA 2HT9A 1X5EA 1A8LA 1K3OA 5KN3A 1DE2A 4MA9A 3GIXA 2C3TA 1TW9A 2CVKA 3GNJA 5CYYA 3TCOA 1V40A 4CW9A 1M2DA 3NOFA 1MD4A 5J41A 2FWFA 1GTUA 1MDKA 1V57A 4TR1B 5A4WA 4MF7A 2K8VA 4GSNA 3EINA 2K9FA 2B3SA 3DKSA 2HNLA 1PA3A 3GH9A 2VCXA 4GQFA 2MMZA 1JZOA 2C8UA 3TKSE 3DVWA 1ON4A 2VO4A 3CSIA 3TJGA 1T3BA 1GTAA 3DVXA 1V58A 3U6VA 2B7KA 4JR4A 4KDUA 3FZ5A 4Q5RA 1EP7A 2YZUA 1TJDA 2I81A 3BJ5A 5GSSA 3GV1A 4GWRA 3IK9A 4NWYA 2ZNMA 4L0WA 2YJHA 6GSTA 2BMXA 3KD0A 3C1SA 6GSWA 3E3EA 1V9WA 5A4UA 5HFIA 3TRXA 4L0UA 3IBHA 3J7Yk 1Y25A 2EC4A 2OA7A 1B9YC 1LBKA 4IP6A 1M99A 3IC4A 2E2GA 4OMVA 3VWVA 4AGSA 1ABAA 1AUCA 1XZOA 1YQ1A 5F8BA 4ZXGA 1QUWA 1G0TA 2GTUA 2KP1A 1X5DA 4ZL8A 4POLA 3VLNA 3O6TA 4WR5A 4PUAA 4RQRA 1EV9A 1I5GA 3C7MA 3PINA 1A24A 2MZCA 2J23A 2OBKA 4O92A 4KUNA 2IMDA 2HFDA 3IPZA 1FB0A 4WXTA 2IL3A 4TN8A 5CRGA 1OVNA 1ILOA 2WFCA 1SK1A 3GHAA 1E6BA 4BVXA 4KX4A 2F3MA 3C8EA 4YAPA 5IMCA 5HR3A 2AV4A 2VL3A 1B9XC 3ERGA 1ZOFA 5JCWA 4Z7XA 1ERUA 2G0FA 1CQGA 3ISOA 1FO5A 1GUHA 3GX8A 2AJQB 3LEFA 4E8HA 5DAKB 2V41A 2JZTA 2H70A 5EY6A 1IYIA 4IJ3A 1M9AA 3HZ4A 3H93A 2L6DA 3ZYWA 2Z9SA 3D6IA 2PUKC 3KTBA 3ZITA 1XOAA 2FD3A 3HYPA 3DXBA 4GXZA 3G7IA 5GZZB 2ZUPA 3VURA 3TRPA 1A2MA 1HNBA 3D21A 3L9SA 2GSRA 4HOJA 1AIUA 2GZYA 4V1Ap 4XS6A 1K3YA 2P5RA 1S3AA 2H66A 4LMVA 1PSQA 3EU3A 2FA8A 4HS1A 2N5AA 1OC8A 1UVZA 3EE2A 3GURA 3ZIVA 4HZ4A 2XBQA 5CAXA 2XBIA 1YKAA 2V6KA 5H5QA 3ZMLA 3TJBA 2V6OA 3PGTA 1KTEA 1XWAA 4BA7A 3O3TA 1SJZA 2H1AA 2V2GA 3I9V2 1SL2B 1XVQA 2VL2C 2YWIA 3VWWA 3VPTA 3WD6A 1XWCA 1JZWA 2B7JA 3UIWA 1S3CA 3W8SA 1VRSD 1G7EA 1RK4A 3TKQA 1PN9A 2WJUA 3HVXA 1W4VA 4O7HA 1WIKA 1K0CA 5D96A 4MF5A 3Q19A 5IMZA 5E59A 1I9DA 3VPQA 2H71A 5CO3A 1K0MA 2DMLA 2YCDA 2H0IA 1GL8A 5LNKe 2YWNA 3TDGA 3GKXA 1X9WB 1FVKA 3H1NA 5ECRB 2FCHA 4K7NA 2H6ZA 5HFGA 4KGIA 1KBNA 13GSA 1GSSA 2NBSA 3KP9A 2YANA 3VK9A 3KXOA 4IP1A 2JZRA 1Z3EA 2VLVA 3D5JA 1TRSA 1ACVA 3MNGA 3IAS2 5ENUA 3A5WA 2GSTA 3L78A 2VCQA 3CSHA 1ZCPA 4RUVA 4EXJA 2TRXA 5E4WA 3D22A 3RPPA 1C72A 1HNAA 4JU5A 5IOWA 4YH2A 1BAYA 3UBKA 9GSSA 2RUFA 4ACSA 2OJLA 3F4SA 22GSA 1NHOA 4OO5A 1TRVA 4ECJA 4N11A 3GA4A 2DBCA 2VL2A 20GSA 3HDCA 4KW6A 5KN0A 4MLYA 1TK5B 1TI1A 1X9SB 2WB9A 3IAM2 2KP2A 3WGXA 2EIRA 1EEJA 2F8AA 3TOTA 4PQHA 2N5FA 1SKSB 3CTGA 3L9VA 4GQCA 2GQLA 1U87A 5D8IA 4HU7A 2JSYA 3H79A 5B8BA 2DJ3A 5JCGA 2YZHA 4V1Ag 2FWGA 2B5EA 1GSUA 1PL2A 3S9FA 3A2WA 3FW2A 3P2AA 5D9TA 2CVDA 3M3MA 2GT6A 4PNFA 4I97A 1V2AA 4POKA 1GULA 4MZBA 3FEUA 12GSA 3TJFA 2TIRA 1YZXA 1XWGA 1BX9A 4XS4B 5J5NA 4ZB6A 2DIZA 1PKZA 5KN2A 1BG5A 4OFNA 1JZDA 4EVMA 4EKZA 3F3RA 5DCGA 4KE3A 3IRAA 1F37A 4KA0A 3U5RE 2OE3A 3A2VA 6GSYA 2CX4A 2I9HA 1MD3A 2QGVA 1KEBA 2HE3A 1N2AA 1XW9A 2J9HA 3LORA 3EURA 3HZ8A 1G7OA 4G19A 3DIEA 2XPDA 2IWTA 3WT1A 1JLVA 1XWBA 3F9UA 2ZCTA 1GLQA 3K8NA 1HYUA 1GWCA 4E8EA 1YEXA 2A2RA 1Z6NA 5EL8A 4OFMA 1GSFA 2NVLA 3UVTA 4KCEA 2LRNA 1CQHA 2H1DA 5CRWA 1GUKA 3KZQA 3ZFBA 4MABA 4V2NA 3FZ9A 1EZKA 3GL5A 1EEMA 1DE1A 1AAZA 3TKRA 4IELA 2MMNA 4L5LA 3TRQA 3D0ZA 3I6AA 3TOUA 1TXXA 2HZEA 2A2SA 2R37A 1G6YA 2FWHA 3IOSA 3HY2A 4HDEA 6GSSA 1MTCA 6GSUA 2VCTA 1XVWA 4ZL9A 2IJYA 2DJJA 1H75A 4D73A 3LYKA 3MWHA 1SYRA 2MBTA 3KJYA 4NHZA 4DSSA 3ZIJA 4F82A 4ULXA 1F3BA 1Z9HA 2YWMA 5IO0A 3GYKA 3KH9A 4MDCA 4FYUA 4OD7A 2HLSA 3GKMA 1EOGA 1QXHA 1VF4A 1OYJA 1XW6A 3KIJA 2VD0A 3APOA 1EV4A 3M8NA 1GSQA 5AIXA 1EGRA 2WZ9A 1DSBA 2VLTA 5ECKB 3GL3A 2E0QA 1YJ6A 3N5OA 1GNEA 1A8YA 1PMTA 2H6XA 1MEKA 2X8CA 3BBYA 1PX6A 1O7UA 1K0BA 4XRAA 1O73A 5B6NA 2DIYA 6GSXA 3EWLA 1XWKA 2YV9A 5HR0A 4J2FA 1H4OA 3APSA 4EUYA 4WETA 1FOVA 1GP1A 5ECIB 2CQ9A 4NPBA 1URMA 3Q6OA 1LU4A 4KSOA 4BWSA 4DVCA 2XC2A 4DSRA 4Q5NA 2HI7A 3W8JA 2C0EA 4KDXA 1VF3A 2JSZA 1T7PB 3ZLPA 1GRXA 1YF1A 4TR4A 3LWAA 4TXOB 1X0RA 4F9ZA 3PR8A 2V1MA 3ERFA 4F0BA 5DVBA 2V32A 2JZSA 5ID2B 1PGTA 1XXUA 3VI5A 1GSDA 4G9HA 2L59A 1T4ZA 3QAVA 4F0CA 2VL9A 2VLUA 3FR9A 5FT3A 2LJRA 4BPYA 5G31A 2AYTA 2PVQA 4MK3A 3N9JA 2X8GA 1B8XA 2OE1A 2WRTA 4L8EA 4IQ1A 2L4CA 2MYGA 4KDYA 1AXDA 4MJEA 4X1UA 1A0FA 3VWUA 2AB6A 3F4TA 2PERA 4EO3A 1DUGA 4FYCA 2GDRA 2DLXA 4AF2A 4XTSA 1QQ2A 5CREA 4IHUA 1HD2A 3CRUA 1M7TA 4IVFA 2KHPA 3QCPA 1SK0A 2DMMA 1QK8A 1O8WA 3RBTA 3KMNA 1O8XA 4WR4A 4N30A 3NIVA 3C71A 2H8LA 2H01A 3H4KA 3HJPA 2EIOA 3E0UA 2YNXA 5IMDA 3FR6A 4OWYA 1K0OA 2LTKA 1OKTA 3PH9A 4GSSA 2DJ0A 1TOFA 3IXRA 3LFLA 4WKWA 3LSZA 3US3A 3LYPA 1SJ6A 1ERVA 2I1UA 2ON7A 3DWVA 3GKNA 4TW5A 3Q18A 1WP0A 4NHWA 3EMPA 1WMJA 1TRWA 5INYA 3LXTA 2H0GA 1Z6MA 2RLIA 5F0GA 5ECQB 5G30A 3TKSC 3KM6A 4PQ1A 1THXA 1OC9A 2L6CA 5G1LA 2VCWA 16GSA 3M0FA 5COHA 5B8AA 4XIHA 3BOAA 2IMEA 2WGRA 2G2QA 2H1BA 3UOMA 2GZPA 4O32A 3UJ1A 2M80A 2AAWA 1SD9A 3D4TA 2DJ1A 4QL9A 2M46A 3FRCA 4F2IA 4EE0A 5CRDA 1FAAA 2OBIA 3UVHA 2VAFA 2H75A 5LCZA 1GTBA 5DCHA 4EL1A 3UEMA 1TP9A 3UBLA 3OR5A 3ZZXA 3GSTA 5H5RA 2BJXA 5ECHB 4KB3A 2CAQA 4K0GA 1UC7A 3ERWA 2IN3A 4POBA 3FR3A 4HU9A 2FLSA 4FH8A 2FHEA 1R5AA 2F8FA 1THOA 2OACA 1SK2A 3DRNA 2LKUA 1TK8B 1FW1A 4LL1B 3M1GA 5IOXA 2DJ2A 4N0ZA 2C0GA 4LLRA 3IDVA 1B4QA 5IO2A 5J3RA 4NV2A 4PGTA 3ZTLA 1AQVA 3CRTA 2X99A 1VF2A 3SWLA 2HZFA 2YWOA 4K1FA 1V98A 2IFQA 3TB2A 4MJBA 2VM1A 3TKSA 1SL0B 4ZB9A 2R4VA 1F2EA 2TRCP 2H72A 2X64A 6GSVA 5CP1A 3HD5A 3GTUA 2RUEA 4K0NA 4IN0A 4EF0A 3V1WA 4AJ7A 1NW2A 4GSTA 2O8VB 1SD8A 3TGZA 4YQMA 1SL1B 3F8UA 4CHSA 1M9BA 3F4RA 3LG6A 3H8QA 4ECIA 2KOKA 4TOPA 5DALA 3GSSA 4ZL7A 4N0VA 2O89A 4EDYA 1FHEA 3ED3A 1AQXA 1OE8A 2D2ZA 2VCVA 1O85A 2LSTA 5ELAA 3G7YA 4KNDA 18GSA 1MDIA 2M72A 4KH7A 2JACA 2ALBA 11GSA 1YEPA 3ZFLA 4LA1A 3RHCA 2PMTA 2FWEA 2P5QA 3TJKA 3P8WA 3F63A 1UA5A 1F3AA 2PPTA 1NSWA 4WBJA 4GCIA 3FKFA 4HJ2A 4NAXA 2GGTA 5HR1A 4NMUA 4WF4A 3ZVJD 4YQVA 1AQWA 2LJKA 4GRFA 3UMAA 4X43A 2H74A 2HRFA 3QAGA 3VWXA 1B4PA 1J9BA 2REMA 2FY6A 2YN1A 4YQUA 3W6GA 4XRDA 2CV4A 2CA8A 2RM5A 3A2XA 4G2EA 2CX3A 3EC3A 3FY7A 2GZZA 3GMFA 3DD3A 3P90A 4ZBAA 3QFAC 5ECNB 1XPVA 3DMLA 4YAVA 2JU5A 4I2TA 2LQOA 3GN3A 4TR1A 4KAEA 2H73A 2GQMA 4H86A 2GSSA 1A2JA 3VI7A 5GAPD 3TJJA 2CZ3A 3P7XA 1WJKA 4K9ZA 2DC5A 3I69A 3ME7A 4PURA 2O87A 1QGVA 5J4UA 4OFTA 4X0XA 3CXGA 3HA9A 3J7Yb 3RPNA 2KUCA 3HCZA 3QD9A 3GKKA 3D4MA 1W89A 5KN1A 5G5FA 1ZMAA 1HNCA 4MJAA 1GSEA 3WGDA 1FB6A 5EPFA 3QR6A 3LQ7A 1TU7A 1U6TA 2PVOC 4OO4A 3TUEA 2OADA 1NHYA 2HRNA 2PGTA 4BVYA 5GSTA 2P0GA 3GRXA 3R2QA 3FK8A 3E9JB 4MPGA 3VFIA 3F0IA 5G1KA 1F9MA 2IMKA 3BCIA 4EC0A 4P3YB 1ZYQB 2LNTA 5F06A 3F6DA 1U3AA 1IYHA 2L57A 4HJMA 2LEGA 5D9XA 1JHBA 2L5LA 4K2DA 5AGYA 2MMOA 3BD2A 4WBRD 1UN2A 2GSQA 4XCSA 2GT5A 1EP8A 2JADA 4PQIA 4NXIA 5AN1A 1MDJA 5AIVA 3LGCA 5HR2A 5KEJA 1RW1A 1TU8A 1ML6A 4IQAA 1A0RP 1J08A 3RHBA 4Q5QA 4K6XA 1K0NA 3L0HA 1OC3A 1SENA 1TK0B 2NPBA 1FG4A 4FIWA 4DEJA 5DAKA 2YV7A 2E2MA 1Z5YE 3NZNA 3M9JA 5D73A 3I43A 4IJIA 4JR6A 2EIQA 2L4QA 1EGOA 4PX1A 3KMOA 2LUSA 5HQPA 5ECLB 1A2LA 2HZEB 2YP6A 1Y6EA 4RQXA 5AISA 4TR0A 4GLTA 3FHKA 4HQSA 4CDOA 1T1VA 3QMXA 3HJMA 3G7JA 4MJCA 2DSAA 3IR4A 1Q98A 4D73B 1JFUA 4MP4A 2RM6A 2IMIA 1PQNA 4DSSB 1U3IA 2OKAA 4WF5A 1GH2A 3EMXA 2QSIA 4ML6A 1M2AA 5IPHA 4K8MA 5ECPB 2VCZA 3CMIA 1OE7A 2OE0A 1ZL9A 3HKRA 4TR3A 2B5YA 5A5KA 3GX0A 3HVSA 4XHMA 1LJRA 10GSA 1RQMA 4TKYA 2I4AA 3IV4A 5C04A 1R7HA 4ZIJA 5B6MA 1QMVA 1VF1A 4LMWA 4MZWA 8GSSA 3IE3A 4HQZA 4JE1A 2C4JA 5ABRA 4HEA2 4HZ2A 4QQ7A 1BYEA 5JWRB 2WULA 3RAZA 1BQ7A 1F6MC 2B1KA 2LQQA 5HFKA 1TTZA 2RIIA 2PBJA 5ECOB 3KP8A 5IQYA 4JZQA 3CSJA 4TVEA 3UARA 4MH2A 4I8BA 2LRTA 3WYWA 2C80A 2LJAA 1AC1A 1XBSA 1WOUA 2H6YA 2HSHA 4BL7A 2GVPA 2ON5A 1ERWA 2H30A 1X5CA 1Z7PA 3MDKA 3QDNA 3HXSA 1U88A 4JBBA 4N10A 3TKPA 2PN8A 5A4VA 5IMFA 2IPAA 4PNGA 1X9MB 1TRUA 5GAND 5IMVA 4HI7A 5ECSA 4ILFA 4GF0A 1XIYA 2CT6A 5J9CA 3ZRDA 2X8HA 4MH3A 1R26A 4I6XA 2K18A 2WCIA 4MF6A 4ZILA 1M2BA 4F03A 3KGKA 2BTOT 4POMA 5IIZA 4FYBA 17GSA 1QFNA 2E7PA 1PKWA 3DYRA 5IPGA 4QL7A 3CYNA 3C1RA 1K0DA 1SU9A 5JWOB 2R5GA 3AY8A 2IIYA 2R3XA 5ELGA 2L5OA 4OCEA 5DBQA 3CTFA 5F07A 5D9VA 4J56E 4KSMA 3KH7A 3MSZA 4HUAA 4IS0A 1ERTA 3ZVJA 5D9WA 1WRYA 1BEDA 4XS1A 2R6KA 1PD21 4ID0A 1YDKA 1YKCA 1XFLA 3FYGA 3ZMKA 3GFKA 2AUVA 3DGQA 2XHFA 2IMFA 2XPEA 4OCFA 1ZGNA 2HXKA 3EU4A 2FGXA 3L9UA 2AHEA 3SBCA 4EDZA 1B48A 2K8SA 5LD0A 2O85A 3RDWA 2DJKA 1T8EB 3HVVA 2C0FA 4RI6A 4PXOA 3QAWA 1KNGA 1K0AA 2FUG2 3EVIA 3HHVA 2LV3A 4XS4A 1TDIA 2ES7A 3F3QA 2JL4A 3ME8A 4K7IA 4IBPA 2H76A 5ECMB 5CNWA 4MZCA 3G9BA 2MMAA 1WWJA 3Q74A 3KEBA 3CBUA 2YOIA 2HYXA 1XW5A 5C00A 4I2UA 4GTUA 2PWJA 4KCAA 1Q4JA 1AW9A 2VUPA 5B7CA 1XOBA 1OC9B 5EVOA 2P31A 1A23A 3EYTA 4JRRA 2C1YA 3QFBC 4ZBBA 2C3NA 1R5PA 3GUSA 3LJRA 5DDLA 3ZL5A 2KLXA 4L5OA 2NTOA 5G2ZA 2HSYA 3WT2A 3KTLA 1NM3A 4WEYA 2I3YA 1M0UA 2GS3A 2VM2A 3LXZA 1E2YA 2WDUA 2FNOA 1N8JA 5DQSA 1O6JA 1YY7A 5JCUA 3GH6A 3MAKA 2CAIA 2B1LA 1EWXA 1JLWA 1XCCA 1GSYA 4AJ8A 2H1GA 4MMMA 4I5QA 3C73A 2YPMA 4J57E 3WGEA 5IM9A 4FO5A 5FWGA 2A4VA 5H5SA 1GTIA 2NDOA 1R4WA 2CZ2A 4NV5A 3KCMA 1SYXA 4ISDA 1Z7RA 3M9KA 1GUMA 4IW9A 3BCKA 2WS2A 4BWQA 4MPFA 5DJMA 4ZB8A 4V2LA 2C3QA 7GSSA 2IFQB 4PUFC 2MBSA 1G6WA 5G5EA 1EOHA 1BJXA 2R2JA 5FHIA 1ST9A 3L4NA 3FZAA 2N5BA 2VD1A 1PRXA 2YJ7A 1TKDB 1VGLA 3GTUB 3IK7A 4ECBA 4MCUA 1OAZA 4TXVA 3UAPA 2H19A 3IA1A 2B5XA 3APQA 1PX7A 5J9BA 1WE0A 2FA4A 1O81A 4IKHA 2B6MA 1YF0A 5DALB 1SJIA 1HQOA 2LS5A 1GNWA 5DQYA 2CVBA 2PU9C 4ZBDA 4V2MA 1SKWB 1FVJA 1ZZYA 2LRCA 3A3TA 3UL3A 5DJLA 1T00A 4Q5FA 2GLRA 3JCML 1JZRA 4JEDA 4ECCA 3QOUA 3FZ4A 5L71A 2K6VA 5D93A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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