4LNY | Genus

Total Genus 88

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	88
sequence length	248
structure length	248
Chain Sequence	PRYLKGWLEDVVQLSLRRPSVRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAEYKRKDPSGLDVERDPIEYAKFMERYAVGLFISTEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMYDFIVKESQIDDAYNLGADTVALIVKILTERELESLLEYARSYGMEPLIIINDENDLDIALRIGARFIGIAARDWETGEINKENQRKLISMIPSNVVKVAKEGISERNEIEELRKLGVNAFVTASGSLMRNPEKIKELIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	De novo protein
source organism	Artificial gene
publication title	Crystal Structure of Engineered Protein OR422. rcsb
molecule keywords	Engineered Protein OR422
total genus	88
structure length	248
sequence length	248
ec nomenclature	ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date	2013-07-12

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00218	IGPS	Indole-3-glycerol phosphate synthase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4lnyA00

4B5NA 4XBSA 1FXQA 2DZVA 2WO5A 1N8FA 2QJHA 2A7RA 2ZZ2A 2GQAA 3TC6A 2Z6IA 5D03A 4O4VA 2VFIA 1SW3A 2WV8A 1F05A 4HNUA 2PC4A 1T99A 3W71A 3MYPA 1TTQA 4PODA 2V2CA 2FJKA 1O5XA 4O52A 1A53A 1OFQA 3DFTA 1ADOA 1KM6A 4R53A 4TX9A 1H7OA 2O7QA 1F6PA 2QCDB 2V30A 2GUUA 4ALDA 2ZZ5A 3NL2A 4AXKA 1M7PA 4JIQA 4UFMA 3OVPA 1G6CA 1G4PA 1OABA 1LROA 4UFHA 5AC7A 2QCGA 4UR8A 5SWUA 2NWRA 2G96A 4OV4A 1OVDA 2EHHA 2ZRYA 3G3MA 3IIZA 3A22A 4M7SA 3MBFA 3S9YA 3IVSA 1GT8A 3W1MA 5HMSA 3C2RA 4RXFA 2QR6A 5A8GA 1FX6A 2ZYFA 3GYEA 4JTIA 4JNMA 2QUUA 3E49A 4NZFA 3N3MA 2Z0IA 2QJGA 3W2MA 3RFAA 1NEYA 4M6PA 4XTIA 3SZ8A 3ZR4A 3S1XA 3W85A 1VYPX 4FNUA 1SZGA 3GNNA 1EB3A 1UUOA 4BWLC 1EP1A 4ZQMA 2A0NA 3TV8A 3MP5A 4Y96A 3G1SA 2ALDA 1K7EA 1R30A 4IPIA 3P8IA 4JYEA 3O15A 4RLIA 3SGUA 1WV2A 3A5FA 3K30A 1H7PA 3TH6A 2ISVA 3BVJA 4PH6A 2NXIA 3OHIA 3TW7A 4ORMA 1TV8A 2A5HA 1R46A 1ZFJA 4MZYA 4UC5A 3NZ1A 2BZNA 4AWSA 3LLFA 3S6DA 2VELA 4IXXA 2CZ5A 3SIZA 4N4PA 3W7GA 4GUIA 2DZTA 3TAOA 2A4AA 5KZDA 3S5NA 3QFEA 1X8FA 3NAVA 1TTJA 5LKYA 4FNQA 3W76A 3NXFA 4O0ZA 4LS2A 4Z08A 1UJPA 2Y7FA 1VJIA 1ME7A 3NQVA 5FF4A 4NJGA 3ABSA 4TR9A 1JQXA 2X1RA 5L9FA 1SW0A 4RKAA 5D05A 1QPOA 1OFDA 3W1TA 2F7FA 1TPH1 3QW3A 5IBXC 4UFKA 2ZZ3A 3HG4A 2WSRA 1RZMA 4Y90A 3NQFA 3HGJA 3T78A 3BGGA 4A2RA 2DZPA 4E0CA 3PS7A 3TQ0A 4KWWA 4OV9A 4O15A 4MY9A 5EKYA 2Y63A 3W88A 1KW1A 3SSJA 4LUIA 3L9CA 4LVGA 2J88A 2A2IA 1XFBA 3WJXA 1GVQA 2BTMA 1LLZA 3BG5A 4FB7A 1EP3A 3C61A 4AMAA 3HG3A 3SW6A 4E2BA 1OHLA 2J9XA 4MOZA 3C56A 3W2JA 2Y61A 4BI5A 5D02A 4GUJA 5U7SA 1RQEA 1GYNA 1TPB1 2FQIA 3OBKA 4O14A 4RZ4A 2HS8A 3SGZA 2Q8LA 3B4UA 4NU7A 3N14A 3CTLA 1FWTA 1WBHA 2BWGA 4LVAA 3I6RA 1KFKA 3QSRA 2ZA1A 1TJPA 4MIMA 1KFJA 3GLCA 4O4WA 3FJ6A 2VFEA 5F1UA 3LTSA 1FUYA 3R8RA 3DZ1A 2NUXA 1B4KA 4FX7A 1HO4A 1XBXA 4ADSA 1F76A 1W3IA 4IUOA 4XQ6A 4H3DA 4CCDA 3PG8A 4IMFA 1RVGA 3P74A 4WY0B 3KFTA 2DP3A 4X9SA 5F2LA 1FCBA 3UPWA 1P1XA 2CLHA 3W7IA 1H51A 3MYOA 4LV9A 1SO4A 3UWQA 1W8SA 3T44A 1O60A 3ABQA 3LI1A 4KWVA 2TRSA 3WJZA 2A7NA 1NF0A 3LV6A 1C8VA 1Q3NA 3W1RA 2P0OA 3BG3A 1H61A 2OX1A 4LVDA 3DHDA 3MP3A 3C3NA 2A1YA 3ANYA 3LCIA 4DPPA 3DKJA 2BLEA 2NUYA 2G95A 3O1NA 1LBLA 1W5PA 6ALDA 4UTWA 4H4IA 5HWMA 2RHGA 2E1DA 2CZDA 1OK4A 3LLDA 5G1YA 5C5YA 3G3DA 2QUVA 2PRHA 3IGUA 2A6LA 1LRTA 1ICSA 1TYGA 2GQ9A 4Q33A 3W74A 3PY2A 1LOQA 1LTDA 5FF7A 4OE7A 1IXQA 1SU5A 1W3NA 3NQ7A 4NNCA 4JS3A 3M43A 2OCZA 1K8YA 1DJNA 3TW6A 2Q3OA 1HFBA 5AB3A 3C2VA 4QITA 1JQVA 4K6AA 4HNVA 2V82A 3G8EA 2RDUA 3M5XA 2CLFA 1O94A 3NGJA 4QAIA 4FIQA 3O63A 1WBJA 3PG9A 1VQTA 4M7TA 1ICQA 3B0PA 1RD5A 2YXGA 3DU0A 3OEXA 3JS3A 1FDZA 4ML9A 2V5LA 3PR2A 3P5ZA 4TMBA 1QFEA 4J9JA 3WK0A 1KV5A 2FFCA 2EKCA 3NQEA 3WK2A 4N9BA 3UD6A 4G1KA 3BK0A 2VEPA 4UTKA 3EWZA 4UMBA 3S5ZA 4ZL1A 3DXIA 3CIXA 2VFFA 2YW4A 4IMEA 1ZAHA 1VYSX 3TR2A 3N34A 3R13A 1EP2A 3W7PA 5K9DA 1TCDA 2Y6ZA 4AVFA 2QCMA 1B9BA 5G5IA 1IIGA 5DN1A 4NT0A 5EPDA 1LOSA 4XZ9A 4AH7A 4O1DA 3GXTA 4RCXA 2B4GA 1VR6A 1TTPA 4KFNA 1UB3A 1JUBA 1KBIA 5HR7A 3NM3A 1KM4A 3HPZA 2YSWA 2VOMA 1LM1A 5CZTA 3T40A 1GVFA 2H3DA 4LVBA 4O1AA 4CQAA 1DOSA 3Q58A 3LXAA 2ATSA 3W87A 1H7WA 3V1PA 3NQ2A 4PL2A 5J5RA 4OBTA 3INPA 4AAJA 3UQNA 1KFEA 1X6UA 2X1TA 3PUEA 1CX9A 5DXYA 2B7PA 2VEIA 1Z42A 3H54A 1F2JA 1OFRA 1WDWA 5FF3A 1K7XA 2ZCGA 3KRZA 1E51A 4Z1DA 3O06A 3BGJA 4ZQNA 1P0NA 1W37A 3ABRA 3W7KA 3LI0A 1T96A 3CEPA 2ZZ6A 1KFLA 1T0OA 2QAFA 3CM4A 3FA5A 1OG0A 3DFQA 1QPQA 2WJZA 3O6CA 4BI7A 1DHPA 1Q45A 1KTCA 4EIVA 2AAMA 2J24A 3VKJA 2YDAA 3M5YA 1VS1A 3FLUA 3HGOA 1XDLA 3NDOA 3THQA 4N2YA 1D3HA 3CHVA 4YXGA 1GOXA 1SFJA 3L2IA 1W54A 3MI3A 5HWJA 2ZA2A 1UUMA 3EWYA 2GOUA 4FNPA 1DV7A 3WJYA 1I2PA 3W07A 5F2MA 1YDNA 3GDKA 3W73A 1FDYA 4ZMGA 1H7RA 5D2WA 1KBJA 1VYRA 4ADUA 3M9YA 5TIMA 1PS9A 1O95A 2CZFA 4ZVJA 5DBTA 4QSHA 3STGA 4DO5A 4IQLA 1G67A 2V2DA 3NL3A 2YX0A 5HJLA 3FKKA 1XL9A 5J5DA 3A21A 1GJPA 1JCLA 3LTPA 1F73A 4FNSA 3M47A 1SSGA 1GG1A 4NXSA 4RZ6A 4LWWA 4BWLA 4QNEA 4OWGA 1NFBA 3HPXA 4UNLA 3STEA 3PAJA 2YFOA 3B04A 4O13A 7TIMA 3G22A 1EUAA 2A6NA 3BLFA 2ZBTA 3PVFA 3EKLA 3LBCA 5AC6A 1IXOA 3QQ0A 4LW7A 4HKPA 4S2BA 2J9YA 4NJHA 2V2HA 3PM6A 4NJJA 1LDCA 2ZTKA 5D2TA 5TBOA 1GTEA 2B7NA 3P60A 4Z0SA 4EVZA 3IV3A 1Z44A 2R91A 1SSDA 4NVTA 1TIMA 2AGKA 1F74A 3TROA 1Q6LA 5BRBA 5FI8A 3NL6A 4UTLA 2UV8G 3NQCA 1I8JA 4ADTA 3LERA 3HG5A 4XKYB 4K38A 1GEQA 2CLKA 1RPXA 4HIBA 1JCMP 5F2IA 4NX0A 3CEUA 3TJXA 2G97A 3ZWSA 3WK3A 1JRCA 5LZLA 1RQHA 5U4NA 2D73A 3G1DA 3JRKA 4X3ZA 1GQNA 5IBXA 2ZRUA 3E9AA 1Z41A 3BW4A 3WFAA 1JRBA 3DFSA 1QOPA 4I7UA 4EOUA 4JGDA 2FTPA 1HL2A 1OYAA 4CQ9A 3F03K 4MYAA 2VENA 3E96A 4JTTA 4O1BA 4ZZ9A 1V5XA 3WJWA 1L9WA 4MY8A 3SI9A 3CWOX 4K8HA 4S1FA 4GBUA 3RK8A 1ONRA 4YL2A 3GAKA 3HGRA 2QCHA 3NQ8A 2VEKA 2CU0A 3HMJG 4K39A 4EWND 4UTTC 3L0KA 2OZ0A 3HB9A 1SZNA 4JD4A 3C2FA 3TSMA 3W3OA 5D30A 1VHNA 2NV2A 1GVOA 3DHFA 4OHQA 3TMLA 3NQDA 1QMLA 5G2IA 2A7PA 3PC0A 3R89A 4TIMA 3I7QA 3TNOA 3EWBX 1FWNA 1J4EA 2GVLA 3CC1A 3TXVA 3RU6A 1UASA 1TPUA 1Z48A 4GXMA 3AJXA 4JTSA 2V5BA 2NX9A 1EIXA 1I45A 3W7QA 3KAOA 5DLCA 2Y62A 2CLMA 2Z6JA 3S5YA 3EX2A 3QC3A 2QKFA 3LB0A 5KITA 2C18A 4YCPA 5CZJA 3IIPA 1DQXA 3RF9A 3W2UA 2QCFA 1DORA 1YTKA 4DO4A 3L5LA 1PHQA 3OG3A 1WX0A 3QZEA 5KZMA 3M5VA 3NQAA 3GZ3A 4CNNA 3P61A 4UFLA 3IEBA 4U28A 5D32A 1AW2A 3UWVA 5CG7A 1OFPA 4PA8A 3QYQA 4MJZA 1YYAA 1ALDA 2I1OA 3NR0A 3KOFA 3O07A 2B7QA 3VCRA 1YADA 3LTYA 3HF3A 3NYZA 5CPNA 3QW4B 4ORIA 1X1ZA 2ZRVA 5CPOA 1QOQA 2YR1A 3S8HA 3GDTA 3UZJA 3WK1A 1OJXA 1H63A 3PWAA 3B8DA 4ZQPA 4JEQA 2CLLA 3LCGA 2P10A 4LRSA 2QCCA 1ML1A 5AHLA 2B0MA 3LHYA 3LXCA 5C6MA 4H6KA 4OGZA 4NZJA 2RDWA 1XCFA 3EX1A 5LNUA 3UZ5A 2Q8ZA 3IIXA 2YPIA 1W0MA 4PFMA 2QCDA 3FOKA 3T7VA 3W1NA 1D3GA 2JK2A 3G1FA 2NV1A 3BW3A 3KRUA 4C1KA 5K3VA 3VE7A 4WOQA 1OF8A 3DH7A 1S3HA 3RLUA 1OFEA 1ZHAA 3C4UA 2GJNA 3UXDA 3ABOA 3W70A 3PSVA 1XBVA 3W2KA 1AW1A 4BFAA 1K3UA 3TFCA 2NX1A 2A85A 3GX9A 3SFKA 2RKXA 2QF7A 5DY2A 4K36A 5I3JA 4O10A 5DXXA 1PE1A 4N6EA 3E12A 1QAPA 1A5BA 2DZWA 3G0UA 2ABAA 1T8XA 2WKJA 2X1UA 4YCOA 3QEZA 4DO6A 2R94A 5CPLA 2WNQA 4N4QA 3UWZA 1PCWA 1VHCA 3IGXA 1XC4A 4UTHA 1VGAA 3QMTA 2FIQA 3G1YA 4WD0A 3OIXA 3G1VA 1LOLA 1THFD 3UWYA 3VI2A 2C3ZA 1PL9A 1QCWA 3DKLA 3G8RA 1GYLA 3IVUA 4GE8A 1LRNA 3CU2A 4N9DA 1TREA 3A5VA 4JYFA 4JTLA 2EGZA 4CCEA 5KTLA 4LS1A 3W22A 1O4UA 2NXGA 3BPWA 3L5MA 4QM1A 4XBKA 1KM2A 3H53A 1FCUA 1SZEA 3L0GA 5HINA 3PBUA 4ZQCA 5AOUA 1AL8A 2FB3A 3FJLA 2VXNA 1FWRA 5D33A 1LYXA 4R34A 4U4MA 5TQLA 3MHFA 4GWEA 2GJLA 3W7MA 5HULA 2TSYA 1ZNNA 1YLVA 5EYWA 4MVAA 2PCQA 3TA6A 1SQ7A 3FYPA 3TK7A 1JJKA 3S5OA 1H7NA 3DFPA 2HSAA 5G4WA 1ME9A 1G4TA 3PF3A 4FXSA 2CWNA 1QNVA 3UY7A 3DENA 1D9EA 3A24A 3NPVA 1H7XA 2C0AA 2V9DA 3GXPA 3BO9A 1YDVA 5C55A 1KFBA 1FDJA 2H3BA 1LRQA 5BMWA 2LLEA 1EA0A 2DZXA 4PC8A 1A5CA 4M6VA 2VFDA 4DQWA 4Z1AA 1A5SA 3N9SA 4O28A 1QPNA 3HO8A 4O16A 1OYCA 1I2NA 3NO5A 3TX9A 1OFAA 3GB6A 4JN6A 4QNWA 3UXAA 2Y70A 4LUJA 5CZ0A 3B0VC 3SR7A 2V81A 3LDVA 1DBTA 4WX2A 5CSRA 3W1QA 2TPSA 2X1SA 5CGQA 1MEHA 5EBUA 1O5KA 1GVSA 3F4WA 5DCDA 1MEIA 1IXNA 4P2VA 4MZ8A 3L66A 2RH9A 3P84A 3NM1A 4WXYA 5FEZA 3T4CA 1AL7A 3KVKA 3FS2A 3KXQA 3NA8A 4JIPA 5K2ZA 3MO7A 3UWUA 3Q2DA 5MHBA 4LOCA 3S42A 4MY1A 4IOTA 3USBA 4MFEA 3FYOA 1TJRA 5DY3A 4TO8A 1WOBA 3P7YA 1PCKA 1ZALA 2ZTJA 3S1VA 1W31A 1TPC1 1JUKA 1VZWA 2YGYA 4RK8A 2V0TA 1W5MA 1PIIA 1VCVA 3BG9A 5D38A 4WY0A 3S1UA 1AG1O 1U5JA 2Y85A 3I68A 2QEZA 3PUOA 3EXSA 1KFCA 5BW6A 1HUVA 3NEVA 3FFSA 1YXDA 4M19A 3THAA 2R8WA 1R2TA 4GUGA 3LHUA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4LNYA

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