4LS2A

Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) with dh03a313
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
364
structure length
364
Chain Sequence
GDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) with DH03A313
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 141
structure length 364
sequence length 364
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2013-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ls2A00
2E5DA 1M5WA 2BLEA 3LRMA 4RXGA 5EA9A 2QUVA 1IF2A 1P1XA 1QFEA 4JTHA 1QO5A 1B4KA 4RR4A 4MVAA 1J5TA 2JBMA 1R2SA 4JY9A 1DVJA 3IGUA 5AC6A 4AXKA 3W7JA 1UUOA 3LI0A 1TIMA 5G1YA 3P60A 3DHFA 3IIOA 3INPA 1Z44A 4A2SA 3L65A 3LV6A 1TV5A 3TW7A 2QF7A 1QPOA 1XBXA 2BTMA 4FX8A 2BWGA 4LOCA 3G1DA 1S5WA 1CW2A 3DFQA 5H91A 2A5HA 1EEPA 1ONRA 3C4UA 3OIXA 4UFHA 3H53A 3ABQA 1KFJA 4N02A 1F76A 5BNKA 3NM1A 3HO8A 1W1ZA 4RCXA 2CZ5A 3W2JA 3P80A 4MYXA 1W31A 1SUXA 3GXNA 3E49A 4OGZA 3LRLA 3W73A 4NNBA 4TIMA 3CT7A 3ZS4A 4DELA 5I3JA 1IIGA 1SR9A 1GVOA 4ORIA 3USBA 3S8HA 1YADA 4IXHA 2NWRA 3G18A 1B4EA 2GVLA 3BV4A 1K8XA 3N2MA 4UMBA 5D2TA 5HUOA 2VENA 5AN7A 3TAOA 1LYXA 2V9DA 3LOTA 1T0OA 1OYAA 2Y62A 2E5CA 1O5KA 2WNQA 2RDUA 3IEBA 4O1BA 3G1YA 5CPNA 1A5BA 2NXGA 3LBMA 3MHFA 3TXZA 1LBMA 3NGJA 1YXCA 3TSBA 4UTUA 3T55A 3MBDA 2NUXA 1OHLA 5CZ0A 1L9WA 3W07A 3P7YA 4DPQA 3HG5A 5KZDA 1LBLA 8TIMA 3ELFA 1R2TA 5D30A 1FCBA 1VR6A 1RV8A 4NNCA 4O15A 2J9XA 3L5AA 1GJPA 3LTPA 4UMCA 2JGYA 3NQ7A 4YWIA 3B0UX 4UTIA 4FNRA 4MYAA 4NUWA 3P81A 3QRHA 5DCDA 5C5YA 1YTKA 3F03K 5SWUA 3F1QA 3MI3A 4GUIA 3N2XA 4MLJA 5HQEA 2QCMA 1VYRA 3STFA 5HWNA 1WA3A 5HNRA 1X8FA 4MLRA 3I6RA 1FCUA 1R46A 1SZEA 3QW3A 1GT8A 2V2DA 3O6DA 1O60A 3FIGA 4KFPA 4X3ZA 4AVFA 4QAIA 2EKCA 2V8ZA 3HBLA 1GTEA 4FNQA 5KZEA 2FPTA 3GNNA 4O13A 2E6YA 1JQXA 3A22A 3R5EA 4R33A 1QOPA 3O16A 3W9ZA 4JD4A 1P0KA 3IVUA 4MZYA 1MSSA 1FXQA 4O57A 1MEWA 3M47A 1G4SA 3HOJA 1W0MA 1YTEA 3HJZA 3V75A 2ZZ7A 1KFKA 1R47A 2ZBTA 3LHVA 1LOLA 4FX7A 1FWTA 4HPJA 3VE9A 1QMLA 1NSJA 1SO6A 4BF9A 1OVDA 4JTFA 1MEHA 5AHIA 4NXSA 1GYLA 4HIBA 1KLYA 3PG9A 1X1ZA 4H6KA 2ZRXA 3ZR4A 2DJLA 5D09A 3QZEA 4Z1DA 2J24A 3AJXA 3V1PA 3TH6A 1YPIA 1BTMA 3SJ3A 4K7VA 2H3DA 2FPVA 4E0CA 1TTQA 1Q6QA 1KV5A 4WZHA 2V5BA 4ZQRA 4XKYB 3M9YA 2C13A 4FEZA 2Y6ZA 1P0NA 1OFDA 5DY3A 1KTCA 3KXQA 2E6AA 4WY0B 4BFAA 2ZZ2A 1JCMP 2PE4A 5AC7A 4UXDA 4I7VA 3GDRA 4FIQA 1EUNA 1S5TA 2FTPA 4AHQA 2YXGA 2EGZA 4K7YA 5CPLA 4WUIA 3WK0A 5AHNA 3G22A 3NQVA 2CLEA 3TJXA 2QCDA 4UTTA 4YLWA 2DP3A 1NFBA 1TV8A 2I9EA 1LORA 4LTSA 1XDLA 2PRHA 4Q4KA 3T7VA 1OFEA 4LVAA 1FWSA 4UTLA 2A7RA 4JY8A 3W1RA 5K7JA 2CU0A 3GLCA 4O14A 1HTIA 4MY1A 3A23A 1QR7A 2C1HA 4Z0SA 2C14A 3QQ0A 1K7XA 2NWSA 1TPC1 1LZOA 1XFBA 3QJAA 3TUUA 1IXPA 1RQHA 3I7RA 4NQ1A 4CNNA 3W7NA 1F7BA 2CLOA 1GVRA 3TNOA 4S1FA 3CU2A 1TPVA 1EB3A 3U6WA 2QJIA 3W7KA 3QQ1A 3NG3A 4M6QA 1QOQA 3PSVA 5LHEA 1WBJA 4AMAA 4NX5A 5ABTA 1TPH1 3TXVA 4NT0A 2YCEA 3MUXA 1ME9A 5K2ZA 1AW1A 5F2MA 4IUOA 5D04C 1XBVA 4OQVA 1B3OA 4QSHA 1I2RA 1CI1A 1XKYA 3H54A 2CZEA 1NF0A 2Y7DA 3DGRA 4JDYA 5FF4A 5D2VA 2ZZ4A 4ADSA 1TREA 3FOKA 2GJLA 2HTMA 1XC4A 4A2RA 1S5VA 3W72A 2VOMA 2QAFA 1FXPA 3N9RA 4OV4A 5C54A 1OFAA 2J6XA 3N34A 4Q32A 3CWOX 2VKZG 3TK7A 3FFSA 3LCLA 1QAPA 3EWBX 3TFXA 3P8IA 1H7RA 1PV8A 1VHNA 1H5YA 2FFCA 4M7TA 5IM51 1X7FA 2GVGA 5HR6A 4QJ1A 3BG5A 3T40A 3TA6A 3NVTA 1ZALA 4DO4A 4HNTA 1VLIA 2QDGA 4UTTC 3TQVA 3DXIA 4BWLA 2ZRWA 1JUKA 3HG2A 4PC8A 4FHAA 4ZQMA 1Z41A 5DBTA 5HWJA 3PBYA 1AW2A 2QCDB 4TO8A 2Z2UA 5EBUA 4CLMA 1JULA 3PF3A 1SZNA 4YL2A 3A21A 4GWEA 5E1QA 3PBUA 3BARA 3E0IA 4EF9A 3W7GA 3MHGA 4MIMA 2YYTA 1EIXA 1W3NA 4UTWA 1A53A 3MYOA 3FA5A 4L4LA 1W5PA 3PB0A 1FDYA 1TTPA 3PB2A 4IMDA 1J2WA 3LCGA 3GKFA 3STEA 4EIVA 2A4AA 3M5YA 2RHGA 1JCNA 2VC6A 3C2OA 2ZTJA 2VEPA 3P84A 4O1AA 1GVSA 3NM3A 3S1UA 1XUZA 1JRBA 5HMSA 3EX1A 4GC4A 1SZGA 2F84A 3NNTA 1PHWA 4FNSA 3CHVA 1QPQA 3UWVA 3W7OA 4MY9A 2TSYA 3S1WA 4LC6A 4ADUA 1VH7A 3O63A 1ICPA 1CX9A 5FEZA 1I8JA 3W75A 1XM3A 4RV8A 3ATYA 1BEUA 3TV8A 3IVTA 2Q8LA 1X1OA 3FKRA 1N55A 4YCPA 3PG8A 1Z48A 1LRNA 4ALDA 2KZHA 1KV8A 4JDBA 3S9YA 3DFSA 3S5OA 3DI0A 5HJLA 1KFEA 4ICNA 3S5NA 5IBXA 3W1QA 1A5CA 4E38A 3C2FA 1TQXA 4LS0A 4GFSA 1E51A 4JYDA 3DFNA 3KVKA 3W7MA 2FB3A 3KAOA 4BWLC 5LSMA 3P5YA 3QFEA 4O1DA 3T4CA 1H60A 4RXFA 4NJKA 2ISWA 3JR2A 3W7LA 3OG3A 3L0KA 1TMHA 3F4NA 4UUIA 5AHEA 2YYUA 2VFFA 2TPSA 3H55A 5F4XA 4UTWC 2OCZA 1W5QA 3MI6A 1ME8A 3BG3A 3LCFA 4N9CA 2YDAA 1HFBA 1JCXA 1RZMA 2ALDA 4RX0A 1VC4A 4ZQCA 3UY7A 2WO5A 2Y88A 3NPVA 3NL2A 2RDTA 5DXXA 1H7XA 4IXXA 3MP3A 3VCRA 4PH6A 3LDVA 4O54A 1LOSA 1AK5A 3LI1A 2VFEA 1RQBA 3S1XA 5G2IA 2R91A 5K4ZA 1LM1A 3EWXA 3CC1A 3W7CA 4GRSA 2J27A 5AB3A 2QCHA 3LCHA 5LGXA 4DPPA 1TYGA 2J88A 1ICQA 1ZAHA 1OX4A 3M6YA 1TRIA 1VYSX 2Y7FA 2EHHA 4AH7A 2VFIA 2QCCA 3TSDA 1GG1A 1M6JA 2V2CA 3UWQA 2BSLA 2DZSA 3LERA 3NL6A 3P5ZA 5AHLA 1ML1A 4Y6GA 3PR2A 1JVNA 1KM0A 3M0ZA 4K38A 5I3KA 1PVNA 4HKPA 3W1PA 3SGZA 1F5ZA 4NJIA 1WAUA 1SZFA 2YZRA 1OK4A 4QIUA 4ADTA 2IQTA 5TQLA 3BPWA 3KRZA 2FQIA 3B03A 5G2HA 1D9EA 3N14A 2X1UA 5KSWA 1H63A 4JXCA 3C2EA 2ZA3A 3SFKA 5FF7A 3C2RA 4RLIA 3B0PA 1K03A 4BK9A 1GWJA 2Z0IA 4RZ6A 2X16A 3STGA 1OFBA 1MEIA 3PUDA 1AG1O 4LU0A 1NEYA 4JTUA 1I4NA 3C52A 2DZTA 5EPDA 3NO5A 2B7PA 1MZHA 4JEQA 1KFLA 4O12A 3TDFA 3DAQA 1I2PA 2FDSA 3SW6A 2P1FA 1FCQA 3GKAA 3W74A 1DJQA 3SECA 5BMWA 1SO4A 4IOTA 3WJWA 3SI9A 3EX2A 3LBCA 4LT9A 4UR8A 4QNWA 4LS1A 2C0AA 5D32A 4ZQPA 2JK2A 1OFRA 1WBHA 2E6FA 3QPZA 3KRUA 4TMBA 5C55A 5DCBA 3P67A 4QNEA 2VFDA 2QUUA 5F1VA 1FQ0A 1YXYA 3P8JA 5G1TA 5F4SA 3M1ZA 1SFJA 2QR6A 4FX6M 4Q33A 2J9YA 1R30A 4GXMA 2RKXA 3VE7A 4JIPA 3IVSA 5AHFA 3G1XA 1MXSA 1R2RA 1GVQA 3P74A 3Q94A 4GBUA 4TU1A 4UTJA 4A22A 1QWGA 4DF0A 1EP2A 4CCDA 1RQEA 5EY5A 3R89A 3L0NA 4NVTA 2GJNA 1NVMA 3NQCA 4UFIA 1H51A 4PL1A 2QKFA 5D02A 5D38A 3MW7A 4N6FA 2PRLA 1H7NA 1LLZA 2A2IA 4MFEA 3G3DA 3W70A 4MUZA 4J9JA 4KFOA 4ORMA 3NQEA 1UBSA 1PIIA 1TRDA 1WQ5A 3QMSA 3HG4A 3NPUA 2XFWA 4AHPA 3B8DA 1KFCA 3OHIA 1OX5A 3RF9A 2G97A 3QMTA 2CLKA 4UMAA 3PUEA 5A5WA 2WJZA 3DKJA 1HO4A 2A6LA 3DBPA 4MZ8A 4O19A 1G7VA 3HB9A 2YPIA 1Q6RA 1FX6A 1JUBA 3KFTA 3MI2A 3SY5A 3GAYA 1TJRA 4FNUA 5LNRA 2GPTA 1P5BA 1FUYA 4HT3A 1SO3A 3HF3A 4QQ3A 3W2MA 4DBDA 3ZWSA 1QPRA 2CFFA 1JJKA 1GG0A 3O05A 3EWZA 3G0UA 1IXNA 4PCFA 3HPSA 1QCWA 3FKKA 3L5LA 2Z1BA 3JS3A 3TW6A 3I7SA 5CZTA 4LRTA 3PVFA 3HG3A 1ZAJA 4ONVA 5D03A 2ABBA 1KTNA 5DBUA 4O28A 3VI2A 3T78A 2JKPA 3QSRA 4NJJA 4X22A 2A21A 1QDSA 2ZYFA 4L4MA 5LNVA 5L6UA 3RMJA 5TIMA 5KINA 5AC8A 1FY6A 4UNKA 3ABOA 3G24A 3RU6A 4M6PA 5FF3A 3O07A 4MY8A 5D2YA 4MJMA 3YPIA 4WXZA 4WX2A 3SIZA 3BGJA 5I3GA 3TAKA 4LC8A 1OJXA 3LHUA 3W2UA 1BWKA 4MOZA 1DQWA 4IQLA 5HWMA 1RPXA 1Q45A 3W7IA 3D0CA 1Y0EA 5BMXA 4K39A 1F73A 2ZA2A 2JGQA 2ZFAA 4W9TA 3M5XA 4X2RA 2W0UA 4N9EA 1ME7A 4FNPA 1XL9A 4HNUA 4P61A 2F7FA 3L21A 3DH7A 4CQ8A 5DXYA 4R53A 1A5SA 2E09A 2GUUA 3LCIA 5DELA 4RJEA 4H3DA 2TRSA 1EWDA 1TCDA 3STCA 3M43A 2E6DA 4WOZA 3QC3A 3PS7A 3S5ZA 5D33A 1VHCA 4S2BA 3OVQA 1SSDA 5HULA 1ZAIA 3CPRA 2ZRYA 2VEIA 4O1CA 1H7OA 2Z6JA 3UXDA 2A7NA 3QMRA 3C3NA 5BOOA 5AYZA 1K3UA 3B05A 1WDWA 1SPQA 3E96A 4IPIA 4PL2A 3MBFA 4IGHA 3AO0A 1VCFA 1TTIA 3LHTA 3Q2DA 4D2JA 4DEFA 5BW6A 3L5MA 5EMUA 3GR8A 4O53A 1YTDA 4A21A 3W7PA 2GVJA 4ZQNA 4CNPA 3IIPA 3EEGA 2ATSA 3TMLA 2CLFA 4N2YA 4JYEA 2YFNA 2RH9A 3GR7A 3GB6A 2YSWA 1JCYA 2EF9A 2B7NA 2ZTKA 5CPOA 2YFOA 1VCVA 2WSQA 1EPXA 1PHQA 2H6RA 5TBOA 2E1DA 1AW5A 2E5BA 2ZRVA 2NZLA 3M5VA 4M19A 2Y85A 2B4GA 3MMTA 3PY2A 3I65A 3PC0A 1O94A 4I9AA 3ABRA 3RLUA 3QM3A 4JX4A 1FDJA 3EKLA 3QSTA 2X1RA 3ABSA 4A3UA 3CIXA 2H8ZA 2ZQ0A 3IV3A 3R12A 3PM6A 3THQA 5CGQA 2XN0A 1KBIA 3FYOA 1TSIA 1GTHA 3LM7A 2AQWA 1KLZA 4PA8A 3EKZA 3UPBA 2C18A 4TX9A 5J5RA 1ZJIA 1D3HA 3EXTA 4P2VA 2NUWA 5KZMA 5G4EA 2OJPA 4GJ1A 5LKYA 4GUHA 3TKFA 2Q3OA 4XTIA 2QCGA 1SSGA 1OF6A 2RFGA 3SGUA 3CM4A 1SW0A 1KM4A 2O7QA 4JTLA 2DZPA 3W23A 2EPHA 4O0ZA 1V7YA 3KRSA 3FLUA 4WY0F 2WNNA 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 3R2G A;  2X30 A;  2B0M A;  4FF7 A;  1ZY9 A;  4EWN D;  3GAK A;  1ZHA A;  1FWR A;  1UJP A;  4KKX A;  4UNL A;  4ML9 A;  4XUG A;  4XWU A;  1XBZ A;  3C2V A;  3NQ6 A;  3W1L A;  2ZZ5 A;  2X2G A;  5CPM A;  2FPY A;  3RFA A;  4WD0 A;  3GXP A;  3NQD A;  4IMF A;  3FJL A;  5CG7 A;  3G1F A;  4ZQO A;  3LB0 A;  5F1U A;  2R94 A;  3GND A;  5AOU A;  3LXC A;  4O52 A;  2Q8Z A;  3K30 A;  1NAL 1;  4XQ6 A;  3SZ8 A;  4O11 A;  3NAV A;  1C29 A;  1JCL A;  1SU5 A;  4JTI A;  5KTL A;  1OX6 A;  5GVJ A;  5MHB A;  1OG0 A;  3NZR A;  2XN1 A;  3DFT A;  2Y63 A;  5K9D A;  1O4U A;  1OYB A;  3B06 A;  3LHW A;  3U8G A;  4UCG A;  1TTJ A;  2W6R A;  2QAP A;  3BO9 A;  1EA0 A;  4UFM A;  3B04 A;  3BGG A;  3WJZ A;  5LHF A;  1Q3N A;  4LUI A;  3GDM A;  4KFN A;  4NU7 A;  3GXT A;  1O95 A;  4IME A;  5F4W A;  4IX2 A;  4RKA A;  2E68 A;  1FWN A;  2DJX A;  1LTD A;  4GE8 A;  4Y90 A;  2NV1 A;  2X1S A;  3LXB A;  3WK2 A;  3NQA A;  4AF0 B; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1P1X A;  2QDE A;  4JTH A;  3WNP A;  1QO5 A;  1QK0 A;  3LGD A;  4Q4O A;  4RR4 A;  3WIJ A;  1AH0 A;  2OOG A;  4C7G A;  1J5T A;  1TVP A;  1V3J A;  4X60 A;  4JCM A;  4DUV A;  3W7J A;  4D6J A;  1UUO A;  4HTB A;  2VRK A;  2WVT A;  3LK6 A;  3DHF A;  5AKQ A;  1Z44 A;  3K8M A;  3RX2 A;  3LV6 A;  3TW7 A;  3WEZ A;  2QF7 A;  4GJI A;  2PBG A;  1XLB A;  2L5H A;  4QS5 A;  3G1D A;  1CW2 A;  1FWE C;  3BAY A;  3N18 A;  1EEP A;  4YVP A;  2BVT A;  4KF1 A;  4N02 A;  1F76 A;  4F2B A;  2CZ5 A;  3P80 A;  3UZZ A;  1W31 A;  4KWO A;  1CBG A;  5DT7 A;  3E49 A;  2Z25 A;  2XZ9 A;  4XZL X;  3W73 A;  4DEL A;  3VNZ A;  5I3J A;  1E0V A;  2GK1 B;  4L9Y A;  2PEV A;  8XIA A;  2RDX A;  2XTK A;  3EBV A;  1HL8 A;  2DV0 A;  1CZ1 A;  1YAD A;  5E70 A;  3UR5 A;  1K8X A;  1IR2 A;  1YDY A;  4UMB A;  1ONX A;  3HV8 A;  3OTR A;  3WF1 A;  4C1N B;  1ISV A;  2VEN A;  3E0V A;  3XIS A;  1U33 A;  5EML A;  4ZO6 A;  1XWY A;  3IEB A;  2WB5 A;  1K9T A;  3G1Y A;  5CPN A;  3CNY A;  4ZOC A;  3LBM A;  4P5U A;  2G8Z A;  1YXC A;  4UTU A;  1FP8 A;  3QR1 A; 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