4LT3A

Hewl co-crystallized with carboplatin in non-nacl conditions: crystal 2 processed using the xds software package
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Carboplatin binding to histidine.
pubmed doi rcsb
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4lt3A00
1JISA 1HEPA 1J1OY 2BQAA 4H91A 1IC4Y 3N9CA 1REMA 4H9IA 1LZYA 5APDA 1BB3A 4CHXA 4BS7A 1GF7A 1FBIX 1UIFA 1F0WA 4IASA 2DQHY 1SLYA 1BB6A 4ETBA 1GE0A 1LJIA 1ZV5L 1GB7A 3CT5A 1LKRA 4TWSA 1LPIA 2Z37A 1IWXA 135LA 2YBMA 1CKGA 3W6CA 1VDTA 3AZ6A 4NGLA 4H9HA 1FLYA 3WW6A 1MELL 1J1PY 4GCEA 4XYYA 4ZEEA 1JJ1A 1FKQA 5E4PA 1GFJA 1LAAA 5KXYA 3IJVA 1IVMA 1IP5A 4H94A 1UUZC 1UIGA 3GXRA 5I4WA 1EQ5A 3M18B 2C8PA 4PRUA 4TTDA 5LAGA 1XGUC 4B4EA 3TXFA 1AT5A 1CKFA 3CQLA 2H9KA 3TXKA 3AW7A 4N5RA 5KXKA 5LXWA 2BQBA 4II8A 1BB5A 4GCDA 4GLAA 4NWEA 5LA5A 5ILFA 4DD0A 1FLQA 1UIHA 1UIBA 3AYQA 4C3WA 2Z38A 3AGHA 4O34A 4Z3MA 5DN4A 9LYZA 1QSWA 1GXV2 2ZNXY 2ZYPA 5KJ9A 1GAYA 3ULRA 2LYZA 4ET9A 3LYMA 1NF5A 1GE3A 5A3EA 3RW8A 4GCBA 1HMKA 4W94A 4WMGA 3GXKA 2X0AA 2F4AA 1D0LA 4U3XB 1D6QA 5D5FA 1AM7A 4XJFA 2Z12A 4R6CA 1IORA 2BQOA 1LSMA 2LZ2A 2CGIA 3FI7A 3IWRA 4BAPA 4ET8A 2BQCA 1FN5A 1DI5A 1GDXA 1PS5A 1YANA 2Z2FA 1LHIA 2LHMA 2XTHA 3OJPA 5B1FA 5I5QA 1JSEA 4QGZA 1GB3A 2ZYCA 5LVJA 1OUHA 1LZTA 2D4KA 4DDAA 2DQGY 3CT0A 1UCOA 4YEOA 1HFZA 1LHJA 1GF8A 3AGIA 2MEIA 1GFUA 3B6LA 3B0OA 3HFMY 2AUBA 2EKSC 2Z18A 4OWBA 1CJ9A 4L41A 2I26L 3TXJA 2I6ZA 5T3FA 3WYHA 4NHSA 3WU8A 3P4ZA 4ANRA 3A34A 5KXZA 7LYZA 154LA 1LJ3A 3ATOA 2DQJY 5L9JA 1IWYA 1IX0A 4H9BA 3RZ4A 3WU9A 3M3UA 2DQDY 2BQLA 2DQAA 3W6AA 2BLYA 1HNLA 1UIDA 5I4XA 1GAZA 3EMSA 2YBJA 3WVYA 1RFPA 4Z41A 5KXOA 1SQ2L 133LA 2G4PA 1JTTL 4YEMA 132LA 1IP3A 4DWXA 1YKXX 1OUEA 1IR8A 1GE4A 1YIKA 4PGJB 4G9SA 4RW2A 1JKDA 1GFGA 4J0LA 1G7HC 2XBSA 3N9EA 2I25L 1B9OA 3QE8A 3A91A 3W6FA 2W1XA 5B1GA 1C45A 4YOPA 2MEFA 5LA8A 4DC4A 1CNSA 1IWZA 3CSZA 1E8LA 1YILA 1GFEA 1TAYA 1B7LA 4G4BA 3WXTA 4LYMA 1KXXA 1CJ8A 1F6SA 1GE1A 5A3ZA 4NWHA 3ZVQA 5LYZA 4QDNA 3TXHA 5DLAA 1B2KA 1FKVA 1LJGA 207LA 2MECA 4N0JA 4HV1A 5F81A 3A95A 1DKKA 1GE2A 1H87A 3ZVQB 1EQ4A 3MGWA 4H8YA 4WLDA 1LHHA 4AGAA 2YDGA 3LYTA 2XJWA 1NMMA 1LSBA 1XGRC 2VB1A 1GFKA 1B5WA 1LZBA 4FDYA 4NEBA 1HEQA 2DQCY 2BQJA 1LZ8A 5HQ1A 1LYYA 3T6UA 2Q0MX 4X3BA 1XFPL 4ZIXA 4RLMA 4XJDA 4CJ2A 2HU3A 4YENA 5KXLA 1GEVA 1LJJA 1QDTA 1HMLA 1UC0A 4NGIA 5M1YA 2BQEA 5KXWA 5LAFA 5IHGA 1RI8B 4HJYA 1NBZC 1LSCA 5IDDA 5LINA 2DBTA 4G4HA 4HJVA 1LJEA 1JJ0A 4RLNA 1B5UA 1VDPA 1YKYX 2BPUA 4XJGA 2ZNWY 4ETEA 1RE2A 2HTXA 4Z46A 4FJRA 1GBYA 4OWEA 2F30A 1OUIA 1ZVHL 4TSBA 3W6DA 1BVKC 4WLTA 1FLUA 4H93A 4J1AA 3A3RX 1BWIA 1IY4A 1A2YC 4WO9A 2YBHA 1DZBX 4WO6A 3TXEA 3BKHA 4NGVA 1GF4A 1UIEA 4ML7A 1XGPC 1IWWA 3WXUA 1RJCB 2Y8PA 2ZQ3A 4WM5A 1V7SA 2CDSA 5KXMA 1LSGA 3WU7A 1GF6A 5APEA 2YBIA 1LSPA 1LJHA 2LZTA 3BKVA 2ZIJA 4NSIA 4NFVA 1REYA 2HEAA 1O23A 3W3EA 3W6BA 4HPIA 4B49A 3LZTA 1C46A 1LJNA 4N1EI 5FSTA 1W6ZA 2BQDA 1YROA 1IEEA 1JPOA 3RNXA 3TXDA 4TUNA 3HBDA 1HSWA 5FCPA 5HMVA 1LYZA 1BWHA 3RT5X 6LYZA 4HTKA 1AKIA 4NGZA 4XN6A 1LSDA 2Z39A 1LZ4A 3AB6A 4P2EA 4I8SA 4H8XA 4M6DA 2YBNA 1CKHA 4OWCA 1LMNA 1IC5Y 1I20A 2Z2EA 3CB7A 2LYOA 3AZ4A 4ETAA 1NWGA 1C10A 2MEHA 5FHWA 1AZFA 3WULA 1UBZA 2ZQ4A 1GFVA 1GF0A 1G7JC 1LZ6A 1LYOA 4UWUA 4CGEA 2FBBA 1NBYC 1GWDA 3IJUA 4HTQA 1TBYA 1PZYA 1GFTA 1KXYA 3AZ7A 4LT0A 1IIZA 1IR9A 1YKZX 1ZMYL 2W1YA 2H5ZA 1HELA 2MEBA 2N5ZA 2HEBA 2PC2A 4HPEA 4GN3A 3A3QA 4PPOA 2W1MA 1LZGA 1B7PA 1LTMA 1YL0X 4H90A 4PRQA 1IOSA 4AXTA 3B72A 4B4JA 1LMOA 3A93A 4LT3A 4UWVA 4WM2A 3HBHA 4DT3A 5LVHA 5KXNA 4HSFA 1C7PA 1LMCA 4TX7A 1LMPA 208LA 1G7MC 1JUGA 4IATA 1HC0A 1CJ7A 2RSCA 2C8OA 1XGTC 1YL1X 4RW1A 1N4FA 1ALCA 1LYSA 4KT3A 3VWOA 2HUBA 4NGYA 4NG8A 1WQRA 1EL1A 2YBLA 1D0MA 5HLLA 1LJKA 1LSAA 1VEDA 4WM3A 5LIOA 3P66A 1LZCA 4BAFA 1OP9B 5I53A 5DL9A 2GV0A 1WVVA 5L3HA 1LZNA 5F9UA 4WL7A 1GBZA 3AJNA 4KXIA 3CSQA 3WUNA 1LHMA 1HEWA 2LYMA 4H1PA 4XJBA 5B06A 4HP0A 4H92A 4G49A 1T3PA 5K7OA 2BLXA 5LVKA 193LA 1CKCA 5LVIA 1JHLA 1DPWA 3WUAA 1GF3A 1OUJA 1JITA 1B7QA 2D6BA 2BQFA 1TCYA 1VATA 5HMJA 3P68A 4WM1A 1GF9A 1QDRA 1QTEA 2HECA 1GFRA 4EOFA 1VDQA 2BQIA 3A94A 1XEKA 1JIYA 1GF5A 5F16A 5LVGA 4HJZA 4OWHA 1UICA 1KIPC 4GCFA 1GB9A 1GD6A 3G3AB 3K3TA 4OOOA 1GBSA 5KXSA 4D9ZA 1FLWA 4QY9A 4G4CA 5B05A 1GXXA 3WH1A 4NSGA 1IOTA 3T36A 5FDJA 3WMKA 4W96A 3G3BB 3TMWA 2ZILA 1BWJA 1DPXA 2BAAA 1LSNA 2D4IA 4BADA 2FBDA 5C6LA 4H9AA 1IP4A 2YSSC 3LYOA 4C5FA 1NHEA 4LYBA 4MCKA 1B5YA 1JKBA 1JTPL 4GCCA 3CT1A 1YAOA 4NGWA 1GBXA 3EO5A 1GFHA 3WPKA 3WW5A 1W08A 4J1BA 3CSRA 3WVXA 1IP1A 4GN4A 1IWUA 1IOQA 5F14A 1VFBC 1GBOA 5B59A 3A6BY 1B5VA 4M4OA 4WM4A 5APFA 3KAMA 1BGIA 1C08C 2HEFA 4PJ2C 3TXBA 4IJ4A 1GPQC 4NIJA 3P65A 2Z19A 6LYTA 1OQMA 1JTOL 1GB8A 5C6IA 4H8ZA 4LT1A 1DXJA 2EQLA 1T6VL 3QY4A 4WG1A 4H9CA 2IFFY 4ETDA 2XBRA 3W6EA 1WTNA 1QTKA 1TEWA 1XEIA 1ZVYB 4KL7A 1LCNA 4CFOA 5JENB 1IR7A 1GHLA 4WLYA 5EBHA 1LJ4A 3LHMA 4NHPA 1KIQC 2MEEA 1KXWA 4E3UA 1HFXA 1IWTA 3D3DA 1LZ5A 4NHQA 2A7DA 5C6JA 5FELA 3A67Y 1TDYA 1LOZA 3A90A 4H9EA 3LYZA 1GFAA 5KXPA 3A6CY 5I4YA 5II3A 2BQKA 1LSFA 4NG1A 5LYTA 5E9RA 1HEOA 3J6KA 1GB6A 4I0CA 1XSFA 1C43A 4LGKA 1B7RA 1EQEA 1GDWA 2H9JA 4LYOA 3TXGA 8LYZA 1OUDA 2F2NA 1B0DA 4WL6A 4DDCA 1HSXA 5DN5A 1WQPA 1H6MA 1LSEA 1WVUA 4ETCA 1DKJA 5LYMA 1WQOA 2NWDX 2CWIA 1QSAA 3OK0A 3TMUA 1XGQC 1YAQA 1LHLA 4R0FA 1JWRA 1BQLY 3RU5A 4DD9A 1LZDA 2DQEY 4H9FA 1JKAA 3F6ZA 5HNCA 1HENA 3E3DA 3FE0A 3P64A 5B07A 2YVBA 3N9AA 1IWVA 4EMNA 2FYCA 1FDLY 5IELA 2F4GA 1B7SA 1JEFA 2BQNA 2IHLA 1LZRA 1XEJA 4ZFPA 2HEDA 5HNLA 2D91A 1D0KA 2G4QA 4DD1A 3LN2A 1WTMA 1G7IC 1UA6Y 2ZIKA 3A96A 4Z98A 4NGOA 4XENA 5DM9A 4HV2A 2A7FA 1D9UA 1LMTA 2BQHA 5L3IA 2DQFC 1B7MA 1REXA 1P2CC 5FEKA 2D4JA 1BHZA 2BQGA 1JSFA 1IC7Y 153LA 1IP6A 1LZSA 4DD7A 4NHTA 1LJFA 2HU1A 3A92A 1QUTA 4NGKA 1IY3A 4NHIA 3AW6A 4WOAA 1LZEA 1LMQA 3AGGG 3D9AC 4XADA 2DQIY 1GB0A 4LT2A 5KY1A 1D6PA 2WARA 2DKVA 1BB4A 4MSTA 4XJIA 1GBWA 5APCA 5KXRA 1NDMC 4LFXA 1I56A 134LA 1CKDA 4B1AA 4LZTA 1V7TA 4KPMA 5KKIA 1HEMA 1VDSA 3WL2A 1HERA 4NSHA 5AMYA 4B4IA 1MLCE 1LZ9A 4WG7A 2MEDA 1LZ1A 1INUA 1IO5A 1B5ZA 5KKJA 4B0DA 1JJ3A 1IP7A 1GB5A 1NQIA 3WPJA 3TMVA 1QIOA 4TSCA 4MR1A 1J1XY 1GEZA 1Z55A 2B5ZA 4N8ZA 1I1ZA 4LYCA 5F9XA 3SP3A 1HF4A 3TXIA 3J4GA 4YM8A 1BVXA 1WQMA 1AT6A 1OUFA 4NGJA 4N1CC 5ILCA 1HHLA 5D5CA 1OUGA 2HEEA 4RDSA 4OOTA 2EIZC 1GB2A 3ZEKA 1LZAA 1NKHA 4LFPA 4GLVA 1LHKA 4XJHA 2MEAA 1VAUA 1QUSA 2CJLA 3A8ZA 1YAMA 1F6RA 4QEQA 1YQVY 1CJ6A 4PHIA 3WUMA 3B0IA 4A7DA 3QNGA 3HBEX 3EBAB 1UACY 4UWNA 1OUAA 4WLXA 5J7CA 3TMXA 1LKSA 2ZWBA 1DI3A 1NDGC 1IP2A 2BQMA 4OW1A 4DYGA 5I54A 3EXDA 1DQJC 1DI4A 3AZ5A 1LSZA 5KXXA 1OUCA 1RCMA 4DD3A 4OWAA 4YF2A 4NSJA 4WM6A 1B5XA 2W1LA 3ATNA 1B7OA 1UIAA 3LZ2A 1WQQA 1JKCA 2MEGA 4J7VA 3WPLA 4CFPA 194LA 1LMAA 1A4VA 1B7NA 4N9RA 4DDBA 4LYZA 1BB7A 1QQYA 1YAPA 4DD2A 4NY5A 1HFYA 4GN5C 4HTNA 5KXTA 1F10A 1WQNA 2EPEA 2FYDA 1G7LC 1IOCA 2G4NA 4LYTA 3B0KA 1REZA 1OUBA 1LSYA 1KIRC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JISA 4DAJA 4S0WA 1REMA 1C6EA 4BS7A 1GF7A 1F0WA 1SLYA 3QAKA 1XJUA 3HDFA 1G1VA 1LPIA 1LYFA 1CKGA 1QT7A 4NGLA 4H9HA 4XYYA 3GUIA 1JJ1A 2LC9A 5E4PA 1IP5A 1KW5A 1UIGA 5I4WA 4PRUA 160LA 5LAGA 1CKFA 3TXKA 3AW7A 5KXKA 188LA 3FADA 4GLAA 4GCDA 4NWEA 1FLQA 4C3WA 3AGHA 1QSWA 247LA 2ZNXY 2LYZA 3GXKA 2X0AA 3G3XA 2F4AA 1D6QA 1PQDA 4R6CA 216LA 2Z2FA 1PS5A 5I5QA 1JSEA 4QGZA 1GB3A 5LVJA 2RBNA 1L35A 137LA 1UCOA 1JTNA 1GFUA 2AUBA 2EKSC 2Z18A 4OWBA 2I26L 2I6ZA 4ANRA 1L41A 3A34A 1IX0A 2DQDY 3W6AA 133LA 2G4PA 1IP3A 1L09A 4PGJB 3QE8A 3SB7A 1CV5A 5B1GA 4YOPA 4DC4A 1E8LA 1YILA 1CJ8A 1F6SA 1QS5A 3ZVQA 4EKSA 5DLAA 1LJGA 207LA 9LYZA 3HTGA 1DKKA 3ZVQB 1H87A 3MGWA 4WLDA 3LYTA 181LA 2RB0X 1XGRC 1L54A 143LA 1GFKA 1L67A 1LYYA 1XFPL 4CJ2A 4YENA 1GEVA 1LJJA 1HMLA 1G0GA 1RI8B 3GUOA 4G4HA 1L48A 2BPUA 4YXCA 1T8AA 2B6TA 2ZNWY 1RE2A 2HTXA 4TSBA 3W6DA 1BVKC 4WLTA 1P46A 4EKPA 1DYGA 4J1AA 140LA 3A3RX 1A2YC 159LA 2HULA 107LA 1GF4A 1UIEA 3L2XA 2CUUA 3CDRA 3WXUA 2ZQ3A 1LSPA 1SWYA 4NFVA 1REYA 1O23A 1L29A 206LA 1LJNA 2BQDA 3TXDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1JIS A;  1HEP A;  1J1O Y;  2BQA A;  4H91 A;  1IC4 Y;  3N9C A;  1REM A;  4H9I A;  1LZY A;  5APD A;  1BB3 A;  4CHX A;  4BS7 A;  1GF7 A;  1FBI X;  1UIF A;  1F0W A;  4IAS A;  2DQH Y;  1SLY A;  1BB6 A;  4ETB A;  1GE0 A;  1LJI A;  1ZV5 L;  1GB7 A;  3CT5 A;  1LKR A;  4TWS A;  1LPI A;  2Z37 A;  1IWX A;  135L A;  2YBM A;  1CKG A;  3W6C A;  1VDT A;  3AZ6 A;  4NGL A;  4H9H A;  1FLY A;  3WW6 A;  1MEL L;  1J1P Y;  4GCE A;  4XYY A;  4ZEE A;  1JJ1 A;  1FKQ A;  5E4P A;  1GFJ A;  1LAA A;  5KXY A;  3IJV A;  1IVM A;  1IP5 A;  4H94 A;  1UUZ C;  1UIG A;  3GXR A;  5I4W A;  1EQ5 A;  3M18 B;  2C8P A;  4PRU A;  4TTD A;  5LAG A;  1XGU C;  4B4E A;  3TXF A;  1AT5 A;  1CKF A;  3CQL A;  2H9K A;  3TXK A;  3AW7 A;  4N5R A;  5KXK A;  5LXW A;  2BQB A;  4II8 A;  1BB5 A;  4GCD A;  4GLA A;  4NWE A;  5LA5 A;  5ILF A;  4DD0 A;  1FLQ A;  1UIH A;  1UIB A;  3AYQ A;  4C3W A;  2Z38 A;  3AGH A;  4O34 A;  4Z3M A;  5DN4 A;  9LYZ A;  1QSW A;  1GXV 2;  2ZNX Y;  2ZYP A;  5KJ9 A;  1GAY A;  3ULR A;  2LYZ A;  4ET9 A;  3LYM A;  1NF5 A;  1GE3 A; 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 5KKI A;  1HEM A;  1VDS A;  3WL2 A;  1HER A;  4NSH A;  5AMY A;  4B4I A;  1MLC E;  1LZ9 A;  4WG7 A;  2MED A;  1LZ1 A;  1INU A;  1IO5 A;  1B5Z A;  5KKJ A;  4B0D A;  1JJ3 A;  1IP7 A;  1GB5 A;  1NQI A;  3WPJ A;  3TMV A;  1QIO A;  4TSC A;  4MR1 A;  1J1X Y;  1GEZ A;  1Z55 A;  2B5Z A;  4N8Z A;  1I1Z A;  4LYC A;  5F9X A;  3SP3 A;  1HF4 A;  3TXI A;  3J4G A;  4YM8 A;  1BVX A;  1WQM A;  1AT6 A;  1OUF A;  4NGJ A;  4N1C C;  5ILC A;  1HHL A;  5D5C A;  1OUG A;  2HEE A;  4RDS A;  4OOT A;  2EIZ C;  1GB2 A;  3ZEK A;  1LZA A;  1NKH A;  4LFP A;  4GLV A;  1LHK A;  4XJH A;  2MEA A;  1VAU A;  1QUS A;  2CJL A;  3A8Z A;  1YAM A;  1F6R A;  4QEQ A;  1YQV Y;  1CJ6 A;  4PHI A;  3WUM A;  3B0I A;  4A7D A;  3QNG A;  3HBE X;  3EBA B;  1UAC Y;  4UWN A;  1OUA A;  4WLX A;  5J7C A;  3TMX A;  1LKS A;  2ZWB A;  1DI3 A;  1NDG C;  1IP2 A;  2BQM A;  4OW1 A;  4DYG A;  5I54 A;  3EXD A;  1DQJ C;  1DI4 A;  3AZ5 A;  1LSZ A;  5KXX A;  1OUC A;  1RCM A;  4DD3 A;  4OWA A;  4YF2 A;  4NSJ A;  4WM6 A;  1B5X A;  2W1L A;  3ATN A;  1B7O A;  1UIA A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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