4LZ7A

Crystal structures of glur2 ligand-binding-domain in complex with glutamate and positive allosteric modulators
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery and Characterization of a Novel Dihydroisoxazole Class of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic acid (AMPA) Receptor Potentiators.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz7A02
1NNPA 5B7DA 3PUWE 3MP1A 2Z8DA 3T9UA 3BBRA 1TFAA 4RPNA 1B7ZA 1ZMGA 4F1YA 1UTBB 1URGA 1Y4TA 4QFPA 1EZOA 3K6XA 4ZE8A 3RUMA 1OLAA 4OFOA 2M8CA 1VFDA 2ABHA 2A5TB 2Y7WA 4WXJA 1IQ7A 3OEMA 2WKYA 3W9VA 4GOTA 2QJEA 3CG1A 2GH9A 2Y7RA 3TTLA 3PPOA 1MXUA 5AA2B 1IXHA 1WODA 1LB8A 3MP8A 4F1VA 5TPAA 3C36A 1H76A 3IB1A 1N3WA 3R26A 2ZYKA 1QKBA 4NWDA 2HCAA 3LR1A 1MXZA 4EXLA 4QRZA 4ZEDA 4BDNA 2D5WA 2VOZA 3FGSA 1WVJA 2VP1A 2E0SA 1GR2A 2DWJA 2RCBA 1QUKA 2I3VA 4YKKA 3MPLA 4ISUA 2PYYA 3OOAA 2Q2AA 3K00A 1I6AA 2REJA 2F35A 5IKBA 3U1OA 3PU5A 3TODA 4NE4A 1MY1A 3IOWA 3M3LA 4EQ7A 1TXFA 2ONRA 4ESWA 1LAHE 2AYSA 1MXWA 3TKDA 4G4PA 4Q8RA 3N5LA 3EN3A 2ZYMA 4MFIA 1EU8A 3VXBA 1HSLA 4U4SA 3CSBA 3IR1A 5TP9A 3O28A 3H6VA 2I3WA 1QUJA 2PBWA 3Q25A 3LSWA 1Y3PA 2HFBA 3HV1A 3QXMA 4QHQA 3H3GA 3TQLA 1EH3A 4H5GA 5TPAB 4BDMA 5ITPA 3KN7A 1ZTYA 3OD7A 2ZNSA 3PD9A 3PUZE 5H8SA 2CMOA 4Q30B 1OVBA 4OWDA 1VR5A 4PP0A 3MPKA 2X7QA 2QS3A 3O66A 3RQTA 2AL5A 3C35A 2RC9A 4GF8A 3OO8A 1B52A 3C31A 5AA2D 1ZKBA 4U22A 3TYHA 2AIXA 4H6DA 5I59A 3MZ1A 1M5FA 4F3BA 2ONKE 4TOZA 2QMWA 2AL4A 4KCCA 4I8CA 2IA4A 3VLUA 4E0WA 3MVWA 2XD2A 1USYH 4FATA 1B3HA 3TDJA 3CSGA 3K1NA 2DS9A 4YKPA 5JTYB 2I48A 2DXRA 4DLDA 2XXTA 4BDQA 3RY3A 1UIUA 2XXYA 1DPEA 5HM4B 3HPIA 4NF5A 3EHUA 1URDA 3QIMA 3GXAA 3H7MA 4YB6A 3KJTA 3O6IA 3G3JA 4ELOA 3TEPA 1JW1A 3IOUA 1NFTA 4QSEA 5CRYA 4GFRA 3KSJA 3ZKKA 4LZ7A 1BLFA 2Q88A 3K1MA 4N6PA 3TTKA 4KR5A 3UP9A 3TMGA 4G68B 1US5A 1MRPA 3R6UA 4TQUQ 2V25A 1MDP1 5EYFA 2GFEA 3B6WA 3A3UA 4OYVA 4F1UA 4H8IA 3FIRA 1MQIA 5AA4A 2DE4A 1MQGA 3KSXA 4EF1A 3O97A 3VVDA 4O3BA 3IX1A 4QF9A 1TWYA 5I59B 1TT1A 3TCHA 2DWIA 4I9DA 4HCWA 4ZECA 4OEUA 4R75A 1QULA 2UVIA 4XKQA 4C1UA 1N84A 3B6QA 1JW5A 5J1DA 3H4ZA 1MG1A 4LZ5A 3KBRA 3TELA 4H5FA 4ZEKA 1EZ9A 3N6TA 4FORA 1H44A 5JEIA 5TU0A 4NF5B 2NWJA 1ATGA 2VHAA 1SVXB 4OHNA 3TPAA 1AL3A 3FVOA 5H8FA 1XOCA 3OO6A 2GHBA 5JK4A 3RNNA 2V84A 2Y7IA 4RPOA 2Q2CA 2I6EA 1S9TA 1B5IA 2XXXA 1DTGA 1IXCA 5H8QA 5I57B 4GLIA 1SW1A 2OK2A 4AQ4A 1D3KA 3MUQA 4H1XA 4Q5TA 1B4ZA 3MZBA 1H45A 2OWTA 2XXQA 1XS5A 3RLFE 5AA4B 3U92A 3PMXA 3BKIB 2Y7KA 2XX9A 1N04A 4PE5B 1A40A 1P1UA 4P0GA 2GHAA 1CE2A 3FD3A 1UTBA 3SETA 1MS7A 1B9JA 4G77A 3ECRA 2XXUA 4LA9A 1DPPA 4MBPA 2FYIA 5H8NA 2A5TA 3HCQA 3FXRA 2HZKA 1P1NA 4U4XA 3SEWA 4P0IA 1POY1 4ZS9A 2F7AA 2NOOA 1QW0A 2O6AA 5AA2A 3V8XB 5CMKA 1H43A 2O7IA 2P2AA 3FJ7A 4ZE9A 1OIBA 5L9SA 3S9NC 3K01A 3GZGA 1B32A 1UTHA 2O69A 1IITA 4R74A 4MLVA 3IJOB 3IOVA 1B4HA 3KEIA 3FATA 3UORA 3SDFA 2F34A 2HEUA 2HAVA 1FCKA 4QFLA 4AB5A 1MXYA 3IJXB 2DXYA 4UA8A 2CZLA 2ANJA 2PX1A 1YAEA 2H25A 3HHGA 1HSEA 4ONYA 1OMPA 1LBBA 4QSCA 3KGCA 4FJPA 2OCUA 1B05A 3SEUA 1VFEA 1D9VA 4NF6A 2B3FA 2XD3A 3VVEA 4QSDA 1B3FA 1DSNA 3QYTA 4U2RA 2XXHA 1P1WA 1F9BA 5EHSA 4BDRA 1B3GA 4BDLA 3MJNA 2YLNA 4R2BA 1FTKA 2ZYOA 2ZNTA 2O1MA 2F97A 1Z7ME 5H8NB 5KZTA 2H4IA 2NXOA 1HSJA 2HZLA 2RINA 1FQDA 4R6KA 1LSTA 3MVZA 3A3CA 1N3XA 4F2OA 1TFDA 2DQVA 2UYFA 5ISUA 3EPEA 1UTHB 4ZDMA 2DSFA 5A5XB 1B3EA 2V93A 2QS1A 3JV9A 3KN8A 1AOVA 3G3FA 4F3PA 4IO4A 1EZPA 1PDAA 2QMXA 2UXAA 5AA3A 1FQAA 5CBRA 2XXVA 2YJPA 3H03A 3SESA 5CM6A 3IB0A 1M5BA 1N7WA 1R1NA 1II5A 4YAHX 4FEDA 5FHMA 4JSOA 1LGBC 2O51A 4ZZEA 3MW0A 4NF6B 1XVXA 4U21A 3S9EA 1R6ZA 2XXWA 3LBSA 1B40A 4U1OA 1ELJA 4F2QA 2OBGA 3KZGA 2QS4A 1MPBA 1B0HA 4DCYA 2PMSA 3FVNA 5DT6A 3GBBA 2YPNA 3VDFA 2ALUA 5JTYA 4OFLA 3T66A 3U94A 4DXCA 3KJ7A 2VGQA 3HN0A 1B5HA 4R6HA 3OXNA 3EQ1A 4G68C 2OWSA 5CMBA 1JVYA 1KWHA 3MVYA 3OENA 1Y20A 1YTVA 5KDTB 4OMBA 4IO3A 2Y7PA 4ELPA 1QUIA 1YPNA 3DELB 1ZLQA 1GVCA 3LSFB 3G3GA 3O6GA 1PB8A 4G68A 1P99A 1RYXA 1LB9A 2ZYNA 3IO6A 3EF7A 4RXLA 2I4BA 3HSTA 4WEDA 4OFJA 1B1XA 5DTBA 5HPQA 2OLBA 4RK2A 2NVUB 3N94A 4X1BA 2HXWA 1Z7NE 3T93B 1Y9UA 3VLVA 1BKAA 2ESNA 2XXPA 4YB7A 1PBPA 3BFTA 1IIWA 1LAGE 3M3KA 2R71A 1JETA 1ZBMA 3D4CA 3L6HA 4YMAA 4O3AA 2FNCA 3IB2A 4ELRA 1B6HA 3WAFA 4ESXA 4GD5A 2F7BA 4KHZE 3UA8A 1J1NA 1A8EA 1L5TA 3QUFA 1B46A 4BDOA 4PFTA 2R6GE 3LSXA 3FV2A 3DLNA 4L17A 1FW0A 3K1PA 3SEVA 4QFNA 2E1SA 2DE3A 4P11A 3IK6B 1SW5A 3MAMA 1NL5A 3VFJA 1Y3NA 1Q1KA 1T0KA 3T9XB 1POTA 3OSRA 3T9VA 4LVQA 4KPTA 3Q29A 5I57A 3I6VA 3Q26A 3K6VA 3FJMA 1NNTA 3C4MA 5L9MA 3PMWA 3ILUB 1MPDA 1ZIUA 2Z22A 4ELQA 1FQEA 1MXXA 1JQFA 4F3SA 1I6BA 2XHDA 3MBPA 4OERA 2QSXA 1LCTA 3TZAA 2OJTA 2DYXA 3W15C 1Y3QA 3RT6B 3B7DA 4GL8A 4FAJA 1BP5A 4DIGA 2I49A 3VLWA 1PB9A 1JW4A 4NMYA 4ZEFA 2P1SA 2PT1A 4KYEA 3C9HA 2F6PA 3CR9A 5CC2A 4LP2B 1Q35A 2ZXTA 1FQFA 3KG2A 3RGYA 3D4GA 2H99A 3E3KA 4OQOA 1Y1ZA 1OVTA 3GLBA 4OETA 4KFQA 1LAFE 3USDA 5DYHA 4HCYA 2FA7A 2HAUA 1LLSA 3Q27A 2Q8JA 4NTLA 1PB7A 2P0SA 4H0WA 3CFXA 1LBCA 5KCJA 4C0RA 1SW2A 3DP8A 2V3TA 4KI0E 4FEBA 4KCDA 2V3UA 4XIGQ 4R6YA 3FXUA 5M2VA 4OESA 5I56A 1O7TA 3LUYA 3N6UA 4YB5A 3ILTB 2XX7A 2DVCA 3PD8A 3Q28A 3P7IA 1XT8A 3H6UA 4WEPA 3CI8A 4Z0IA 3KOSA 1O63A 3E9XA 1P1OA 1MQDA 1QKAA 4X48A 1B1HA 4PFYA 3TTNA 4R73A 3PPQA 3I3VA 3RTFB 1OQHA 3K0VA 4NEDA 3L6GA 2GRVA 4MLQA 3ZSFA 4EQ9A 1A8FA 3F11A 4IO7A 2QRYA 2H9BA 1UQWA 3IAZA 3O9PA 3KOTA 4FE8A 4TLLB 4QFOA 1P1QA 4BLAA 4X1DA 3PUXE 4X9TA 2I0CA 4OZ9A 5A5XA 5DVIA 2V3QA 2O84X 3U93A 2DWAA 3TTMA 1GV8A 5KCJB 4IGTA 2F78A 3FJGA 2G93A 2Q9TA 2DVZA 3IO4A 4RNSA 4XKNA 5L9OA 4K3FA 4R9FA 1PC3A 5F7VA 1A7LA 1I6QA 5I56B 4OVJA 2F8DA 1IXIA 4I62A 1ZJLA 2ONSA 5AA1A 4EXKA 3QK6A 2UYEA 1WDNA 4HTGA 4DDDA 4R72A 5I2KA 1SYIA 2F36A 4LUBA 1LFHA 5B70A 4YICA 3CVGA 4IY5A 1SW4A 4ZEBA 1MH4A 3H6WA 3CIJA 4JXIA 3FVKA 1URSA 3AXFA 1FTJA 2RKMA 3HO7A 5DVJA 2UVHA 4JDFA 4EUOA 5ELVA 5ITOA 4KYDA 1R9QA 3PPRA 5FHNA 1H3DA 3W9WA 3FV1A 4H8JA 3ONMA 2THIA 1RYOA 4RK9A 1MM6A 3O2AA 1LAXA 2DWHA 5KDTA 1MDQA 4YKJA 4ECFA 4NF4A 3JZJA 3RN8A 3PMVA 4G8MA 3WAEA 3FUZA 5CBSA 3C32A 2IEEA 4H67A 2Q89A 3RTWB 4IB2A 1B7HA 4LATA 3K02A 4U1ZA 3KFMA 4IY6A 2Z8FA 4PFUA 4ZZAA 1PEBA 5I2NB 2F7CA 3O6HA 1ANFA 4RY1A 1MY4A 1N0TA 1MPCA 3M3FA 4F39A 5I2KB 5DVFA 4G2ZA 3MQ9A 1M5DA 1US4A 3V83A 2D3IA 3T9HB 4NWCA 3S9LC 4GQOA 1IUDA 3MP6A 3S4UA 3K2DA 1SQYA 4AB6A 1R9LA 2DP8A 5BWJA 4FECA 3FASA 1O64A 3I5OA 2PT2A 4M4GA 1M5EA 4R9GA 5LOMA 1JNFA 4PFWA 1AIVA 2F6GA 3ODBA 3MWBA 1BTJA 4Q0CA 3PV0E 3FVGA 1CB6A 2KLFA 2RF1A 3U8QA 3THIA 3H6TA 3R7XA 3V89B 1D4NA 3HHFA 4NF4B 1FTOA 4G8HA 4LZ8A 3MC2A 3LC8A 4JWXA 5DEXA 4JWOA 4IGRA 3K6UA 4JSDA 2XXIA 3QAXA 2DOJA 3EHTA 1NMUA 1I69A 4F22A 3T22A 2Y84A 4JWYA 3QSLA 3EHSA 3VVFA 4NF8A 1FQBA 1N7XA 4YZZA 4F29A 1DOTA 2PVUA 4RJZA 4C1TA 4FIMA 4OEVA 3K6WA 4JB7A 3FZVA 2Z8EA 2A5SA 3OO9A 5ICQA 3E13X 3PGFA 3CRBA 3S2VA 2QS2A 4YU0A 1SDXA 4GRKA 2F5XA 3LSLA 3DM0A 1VE4A 4DCXA 3OELA 4GXAA 4UACA 3TUSA 1IZ1A 2DE2A 3SEXA 1B5JA 3TQWA 4GVOA 5FTIA 4KYSA 4PQJA 3UK4A 3ZS6A 3OMBA 4EDPA 4LQ2A 4OTEA 1LFGA 3KN3A 4IO5A 1MM7A 5TP9B 4H65A 5CMCA 1Y4CA 1S7YA 1GTKA 1B2HA 4KD5A 5DEXB 5L8DA 4MH5A 4MF3A 3VXCA 1B0LA 3E4RA 3JYRA 1USYE 1FQCA 4HS7A 2ZNUA 4IO6A 5I58A 5H8HA 2W7YA 1MY0A 1NH7A 2I58A 1SBPA 4NF8B 1PBQA 5CI5A 4F3GA 4JBZA 3CFZA 1MQHA 5F1QA 1S50A 2RCAA 3SERA 3IOTA 1MXVA 1DMBA 4GIZA 1QVSA 1M5CA 1A99A 1B7UA 3SKPA 2O7UA 1SI0A 2XXRA 5FTHA 3UIFA 4POWA 4GWOA 3GBAA 1AH5A 4E0XA 4DXUA 4Z7EA 2I0BA 4YMBA 4N13A 1RKMA 2LAOA 4YKIA 3TCGA 5AE4A 1FTLA 4GL0A 4F18A 4RYAA 3G3KA 4N07A 3TTRA 2REGA 3TFLA 2R9JA 3RPWA 2QL3A 2ZMBA 1LCFA 2X7PA 5ICTA 1JVXA 3OSQA 5CMMA 4EF2A 1Y1MA 1BIYA 1SD3A 3TAJA 1ZU0A 3OEKA 4U23A 3CG3A 3QUJA 3VV5A 1VSOA 2QPQA 4LONB 1JEVA 4F31B 2Z23A 2H98A 4EQBA 5I58B 3T96B 5H8HB 3IL1B 2RC8A 5K2YA 5EHMA 4THIA 2NUVA 1DTZA 3OO7A 3DP4A 2VD2A 1B51A 1XHYA 5HBCA 1NKXA 1QJMA 3A09A 3H06B 5I84A 2XX8A 4LQ5A 1UIVA 3IORA 4TLMB 3PPPA 1MH3A 3RT8A 4XTCQ 5K2XA 1NNKA 4POXA 1A54A 4DE8A 3PUVE 3SEYA 1GGGA 4O3CA 3FXQA 1B3LA 2OZZA 4ZEIA 1SI1A 2B65A 2UVGA 1A55A 1XC1A 4I1DA 3M8UA 5IAIA 4WKMA 2VD3A 3TCFA 1N76A 4DZ1A 3UGWA 3PUYE 3CFLA 4GXSB 2I4CA 2O68A 1NNFA 4HW8A 1MY2A 3MZ9A 4R2FA 3S9MC 3C33A 1NH8A 4OENA 3DP6A 3U72A 3MVXA 3ZKLA 1XVYA 2G29A 1OLCA 2H5YA 3C34A 2O1LA 4F19A 5I2NA 5H8FB 4XXUA 1MQJA 5BUUA 1MY3A 2HQ0A 4G8NA 2D21A 4ND9A 4RA1A 2X26A 3O29A 4OXVA 3VE1B 4IO2A 3G3IA 1D9YA 2BJJX 4QFKA 1FTMA 5H8QB 1JEUA 2UVJA 4KQPA 3BFUA 3PPNA 3B6TA 2RC7A 3UN6A 1YCJA 2B3BA 4XKRA 3G3HA 4PETA 1IEJA 4XKPA 3G7WA 1SYHA 3K4UA 3N26A 1AMFA 4DXBA 5FHOA 1OQGA 4M1VA 1B58A 1IXGA 1LFIA 3V5AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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