4LZ7A

Crystal structures of glur2 ligand-binding-domain in complex with glutamate and positive allosteric modulators
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Discovery and Characterization of a Novel Dihydroisoxazole Class of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic acid (AMPA) Receptor Potentiators.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz7A02
3H6WA 4ESWA 4ZEBA 2DVCA 5H8HB 3UGWA 1HSEA 1ZJLA 3MVWA 2Z22A 1A55A 2QS2A 2DWIA 1DPPA 1P1WA 4G8NA 3FZVA 2GHBA 4GL0A 4KYSA 4IGRA 4GFRA 3PD8A 4AB6A 4HW8A 5AE4A 1S7YA 1LAHE 3UA8A 4U21A 1IQ7A 3K2DA 1DSNA 5CRYA 3T66A 1PBQA 2NXOA 4BLAA 1SW2A 3RT6B 4XIGQ 1O64A 5CMKA 5EHSA 4XKQA 3EQ1A 3QUFA 4EXKA 1LAFE 1YTVA 3HCQA 1JW4A 1Z7NE 3I5OA 3FVOA 3O6HA 4I8CA 1T0KA 2ALUA 5CC2A 3SERA 1SW1A 1I6BA 5I57B 1NNFA 4KD5A 2X7QA 4P11A 4KR5A 1SQYA 1PBPA 1JW5A 4F3GA 4M4GA 2ONRA 4GXAA 4QFKA 3OO8A 1Q35A 1J1NA 4U23A 2OWTA 3Q27A 3U93A 3RGYA 1QUKA 2LAOA 3TYHA 4UACA 4RPOA 1IXCA 2NWJA 3SEWA 3OMBA 4F3SA 3IO4A 1Y3QA 3IR1A 1LFGA 5I84A 4EQBA 2Z8DA 4OERA 4F2QA 3LSFB 1ZLQA 1USYE 1ZTYA 2E0SA 3FVKA 2VD2A 3BBRA 3BFTA 3S9LC 1LFHA 4KYEA 1UTBA 4R6KA 3E3KA 1AL3A 2D3IA 1DOTA 1Y1MA 2G93A 5FHNA 2XD3A 2Z23A 1QUIA 4Q8RA 3CG1A 2GHAA 1P1NA 2XX8A 3KSJA 5JTYB 1N84A 4P0IA 1RYOA 4JSOA 3KN3A 3ZSFA 5I59A 4UA8A 5AA2A 2XXXA 3HHGA 1OQGA 2THIA 1LFIA 4RNSA 3EHSA 3PV0E 1I6QA 4G8HA 3ZS6A 3QAXA 3K01A 5L9MA 4LA9A 3KSXA 4GQOA 1Y4CA 3GBAA 3IOUA 4WKMA 3V89B 3K4UA 1P1QA 3UIFA 1FTKA 2RKMA 1TFDA 4TOZA 3LBSA 4WXJA 3USDA 2ZYNA 1M5CA 3TCGA 2O69A 1B1XA 5H8FA 2DWJA 5AA4A 3MJNA 1TWYA 3ILTB 3TODA 3B6WA 4JWYA 1Y20A 4GL8A 5DTBA 4NTLA 3S9NC 5J1DA 5BWJA 4ELOA 4DXUA 1QKAA 1D9YA 3FIRA 3MW0A 4POWA 3O29A 3K6XA 4OEUA 4FECA 1N7WA 3SEYA 1MPDA 2QS4A 1P1UA 3G3FA 2OK2A 3QIMA 3T22A 1N76A 4ISUA 1NNKA 2Q89A 3ONMA 3TDJA 3IORA 3PUWE 3E4RA 1II5A 1MXUA 1US4A 1ATGA 2B65A 2F5XA 1S50A 1SW4A 3I6VA 2H99A 1URDA 1MH4A 4BDLA 3DLNA 3T9HB 1O63A 1WODA 1ZBMA 3VE1B 2QJEA 3CFLA 4OYVA 5EYFA 4R74A 3O6IA 1XHYA 3LUYA 4QSCA 1UIVA 5AA1A 4KFQA 3QSLA 1JVXA 1AMFA 4NF8B 4MBPA 2Z8FA 5TP9B 5AA2D 4I62A 2I3WA 3O9PA 4GRKA 1KWHA 1B40A 2V25A 2H9BA 3MZBA 4ECFA 1B58A 4G68A 3OELA 2I4CA 3H6VA 3T9VA 4C0RA 3G7WA 5HBCA 3PGFA 1B0HA 5H8HA 4LZ8A 3LSLA 4TQUQ 1B4HA 3FUZA 4ZE9A 4MLQA 3O6GA 4H67A 4IGTA 3SKPA 2O51A 1IXGA 4KI0E 4RK9A 2ZXTA 1GTKA 4OESA 3IOWA 1N3WA 4EF2A 4PFUA 4Q5TA 4RY1A 1DTGA 5TPAB 1B5IA 3TEPA 4F3BA 3HSTA 4HS7A 4LONB 3IK6B 5FHOA 3PUXE 3OO6A 5JEIA 4F39A 4THIA 2UYEA 4N6PA 1NH8A 3EF7A 3SEUA 1B3FA 4PP0A 3RLFE 4YMBA 3VLVA 4ZZEA 3THIA 3EN3A 3O66A 4MFIA 1Z7ME 1B7UA 3FV2A 2F36A 3G3JA 2ZNSA 3K02A 1AOVA 4BDNA 5B7DA 4R2BA 1OVTA 2I3VA 5TU0A 4GOTA 4JWOA 3H6UA 2OCUA 3OSQA 4YKJA 2AIXA 3PUZE 1MY2A 3D4GA 2Y7KA 3OENA 4C1TA 3PPPA 1A8FA 4QFPA 3VLUA 3ODBA 4GWOA 1MY1A 3PPOA 4G4PA 2OJTA 3QUJA 4YMAA 4TLMB 1MQGA 3U72A 1MXXA 2QS3A 4DXBA 3IL1B 3G3IA 3OXNA 3QK6A 4X1BA 3DP6A 4YZZA 4KHZE 1EZOA 4G8MA 3W9VA 3OEMA 3OD7A 5ITPA 2ONSA 4BDOA 2F7AA 2H25A 2HXWA 3WAEA 2F7CA 4DLDA 3BKIB 4TLLB 3R26A 1IXIA 1YAEA 1AIVA 3EPEA 3QYTA 4FJPA 1OQHA 3QXMA 3CG3A 1F9BA 1LB9A 2XX7A 1NL5A 5JTYA 1FTLA 3RPWA 1MRPA 1P99A 2FNCA 3HV1A 3HPIA 1MDP1 1HSJA 5L9OA 3GXAA 2UYFA 3VDFA 1MXYA 4ELRA 3R6UA 1SYIA 5IKBA 2O7IA 5DT6A 1OIBA 3T96B 1D3KA 2QSXA 4XKPA 2DS9A 3PU5A 1UIUA 5B70A 4RXLA 3CSGA 5JK4A 2O1LA 2F34A 5L9SA 3TTKA 5I2NB 3VVFA 1FW0A 4XKRA 2HZLA 2D5WA 2NVUB 4U1OA 3OEKA 1M5EA 1A7LA 1B4ZA 3MZ9A 3D4CA 4U1ZA 3N94A 3CSBA 3UK4A 1PEBA 4WEDA 4NEDA 4F3PA 4M1VA 3N5LA 1IEJA 4I1DA 1H44A 4G77A 2OLBA 3G3KA 4OETA 4QF9A 2O7UA 4IO7A 1URSA 4RK2A 3H6TA 2O84X 3OO7A 1DTZA 1B7ZA 2P1SA 3KN7A 2GFEA 2VD3A 4O3AA 2ZYMA 3C34A 4F22A 4H8JA 5H8NB 2QS1A 4EXLA 1N04A 2Y7IA 4NWDA 1B32A 1JETA 2X26A 4X48A 2ZMBA 4NF5A 4OFJA 1BLFA 3MC2A 3C33A 3IB0A 3W9WA 3U1OA 4JXIA 5CMCA 5DEXB 3E13X 2UVJA 4NMYA 3JZJA 1JEVA 2IEEA 1USYH 1TT1A 3KOSA 4QFOA 3CR9A 3FD3A 4C1UA 1LAXA 5A5XA 1MY4A 3PUVE 4IB2A 3TQLA 3TFLA 4EQ7A 1MS7A 2F35A 1MQJA 3VLWA 3MP1A 5I58B 5TP9A 3I3VA 2F6GA 2ZYKA 4QSEA 2XXYA 2IA4A 1JW1A 4Q0CA 3VXCA 2B3BA 4FAJA 1PDAA 1I69A 4GIZA 3IAZA 1LBCA 3U94A 1R9QA 2M8CA 4ND9A 4H6DA 4GD5A 1N0TA 4R6YA 4RJZA 1MG1A 1OLAA 4PFWA 2Q2AA 2V84A 3MWBA 2ONKE 2R6GE 4LP2B 4L17A 2AYSA 2OBGA 3N26A 3V5AA 4OZ9A 1H76A 1VSOA 2XXPA 1NNTA 5HM4B 2ZNUA 3DELB 2PMSA 2UVIA 5ICTA 1FQBA 2AL4A 4LQ2A 3WAFA 3CIJA 5TPAA 3KBRA 3MVXA 5L8DA 2RC7A 1MPCA 5H8SA 3ILUB 3L6HA 5H8QB 3N6TA 1RKMA 3MP6A 3TAJA 3SESA 2QPQA 3JV9A 4RA1A 1MY0A 3IB2A 4NF6B 4N07A 4YU0A 2WKYA 2DOJA 1US5A 2F7BA 3O97A 2PT2A 1B51A 3B7DA 4KCDA 5I56B 4FORA 4IY5A 4XXUA 2VOZA 3C35A 1SI0A 2RF1A 1M5DA 1YPNA 3F11A 4O3CA 3G3HA 3H4ZA 3A3UA 5DVJA 2Y84A 1A40A 4F18A 4GF8A 4PE5B 3LSXA 3W15C 1MPBA 3OSRA 4IO3A 4IO6A 1I6AA 1H43A 3K1NA 1IZ1A 3FVNA 1FTMA 3OO9A 2DWAA 4YB6A 3OOAA 1Y3NA 3TTNA 2RC8A 3C4MA 2R71A 4DIGA 1PB9A 2B3FA 5KDTA 5I59B 4IO2A 3HN0A 3RTFB 4JDFA 4ZZAA 2XXQA 1MM6A 1B5JA 3O2AA 1R6ZA 4FATA 2PYYA 1YCJA 2CZLA 2PBWA 4OVJA 3SEXA 1GGGA 4WEPA 5CI5A 2DE3A 4YB7A 3M3FA 2QMWA 1Y3PA 1PB7A 4U4SA 2A5SA 2NUVA 3IX1A 4PQJA 2FYIA 5DVIA 3PPQA 4ZDMA 2HAVA 1UQWA 3TCFA 3TKDA 1URGA 2I0CA 2RC9A 3TCHA 4H8IA 3MVYA 4HTGA 4LUBA 4NWCA 1FTJA 3KZGA 1LB8A 1UTHB 4GLIA 3B6QA 2G29A 1OMPA 3N6UA 4KQPA 4NE4A 1MM7A 1POTA 4FEBA 3MZ1A 1B2HA 4ESXA 2I49A 2Q88A 1NNPA 3H06B 1N7XA 3C36A 5I2NA 2XD2A 3TTLA 3C9HA 4H5GA 2H4IA 2I6EA 3TUSA 4IO5A 1M5FA 2F97A 3E9XA 2V3QA 2DWHA 2REJA 1IIWA 1MXVA 2AL5A 3C32A 1EH3A 2E1SA 5KCJB 1XVYA 4OMBA 1H3DA 4R9FA 2D21A 4Z0IA 3SDFA 4OTEA 1DMBA 1GR2A 1B6HA 1XS5A 3VV5A 5I57A 2XHDA 1MDQA 4IY6A 1SI1A 4R6HA 2XXIA 4YKPA 5I2KB 2DQVA 3CVGA 2RCBA 3RY3A 5IAIA 3L6GA 2Z8EA 1NH7A 3FV1A 1H45A 4RPNA 4E0WA 1IUDA 3A3CA 3G3GA 1ZMGA 4ELQA 1B46A 2A5TB 4OHNA 5H8NA 4K3FA 3DM0A 5F7VA 3FATA 3MP8A 2HZKA 3V83A 3T9UA 4LZ7A 3K0VA 3FJGA 4X1DA 3FXQA 3KN8A 2F6PA 2HQ0A 1JVYA 3PPNA 4RYAA 4DCYA 1LCFA 5K2YA 1BKAA 5DEXA 3PD9A 4KPTA 3K1PA 2ABHA 2XXTA 1LAGE 4JB7A 2QMXA 4DE8A 1NMUA 2PVUA 2I48A 2XXUA 2DXYA 1R1NA 4O3BA 2V3TA 5CMMA 1XC1A 4LQ5A 3IO6A 1LSTA 3M3LA 4YAHX 1JNFA 4Q30B 4OEVA 5I58A 1B52A 3R7XA 1B1HA 4DXCA 3PMVA 2Y7WA 3KGCA 2O68A 5HPQA 1MQDA 4LZ5A 4G68C 2RINA 5F1QA 4P0GA 4QSDA 3IJXB 4H0WA 2F78A 3FXUA 4QFLA 2GRVA 4YICA 2Q2CA 2Y7PA 4ZEFA 4R2FA 5FTHA 1SYHA 3PMWA 3T93B 1FQFA 1VE4A 4F1YA 3ZKLA 4R75A 2UVHA 1BP5A 3TELA 3PMXA 4NF4B 3SETA 2P2AA 2ESNA 1O7TA 3KFMA 1QUJA 2Q9TA 3KEIA 3CI8A 4ZE8A 1B5HA 1BTJA 3MPLA 4YB5A 5EHMA 4U22A 2OZZA 1GV8A 1FCKA 1CB6A 5ELVA 1LLSA 4KYDA 5H8QA 5AA3A 3Q28A 1AH5A 5ICQA 1SW5A 3EHTA 3MQ9A 4DZ1A 1QVSA 4Z7EA 4NF6A 4X9TA 3C31A 4QRZA 1JQFA 4U2RA 3B6TA 4LVQA 5M2VA 1MQIA 4QHQA 2DP8A 2Q8JA 2VP1A 4R73A 4BDRA 5BUUA 5I56A 2XX9A 3M3KA 3Q25A 1A8EA 4R72A 1A54A 2ANJA 1QKBA 2O1MA 1B3HA 1XT8A 3IJOB 2I58A 3GZGA 3H03A 1B3EA 3KJ7A 1M5BA 4KCCA 1QJMA 2VHAA 4F31B 2HEUA 1TFAA 2XXRA 1GVCA 4F19A 3TQWA 4NF8A 2P0SA 3FJMA 3VVDA 1P1OA 1OVBA 4DCXA 1ZIUA 4ZEKA 4OENA 3O28A 3IOVA 1B3LA 1B9JA 2V3UA 1Y4TA 1JEUA 1XOCA 4ZECA 3T9XB 4ZEIA 1SDXA 3HHFA 3IB1A 1NFTA 5DVFA 1FQDA 2ZNTA 3KOTA 2ZYOA 2DVZA 4PFTA 2REGA 3RUMA 1OLCA 4H5FA 3RT8A 3M8UA 1Q1KA 4EQ9A 2OWSA 3AXFA 3IOTA 5K2XA 3S9EA 4JBZA 3MUQA 1D9VA 1B3GA 3A09A 4H65A 3TTRA 1EZ9A 4E0XA 4F1UA 1POY1 1UTHA 5KZTA 2YLNA 2HFBA 1IITA 1PB8A 5CM6A 2I4BA 1L5TA 4OQOA 4OWDA 1IXHA 3MBPA 1N3XA 3FVGA 1R9LA 3S2VA 4H1XA 4JSDA 1B7HA 4F1VA 4LATA 4FEDA 1FQAA 3GLBA 3Q26A 4HCWA 2XXVA 4GXSB 3KG2A 2RCAA 5ISUA 4N13A 5KCJA 2YJPA 4G2ZA 4BDMA 3P7IA 1B05A 1D4NA 1FQCA 2DXRA 4NF5B 1LCTA 2O6AA 1QW0A 1ELJA 1VR5A 4XKNA 1UTBB 2Y7RA 5I2KA 4POXA 4GVOA 4U4XA 3PPRA 3MAMA 4YKIA 2FA7A 2PT1A 1VFDA 1MY3A 2A5TA 3ZKKA 4QFNA 2NOOA 2QRYA 2HCAA 3H7MA 3RNNA 3EHUA 2CMOA 5AA2B 3K6WA 5A5XB 4AB5A 1Y1ZA 1FQEA 1MXWA 2W7YA 2HAUA 4F29A 4YKKA 4FE8A 2UVGA 2XXWA 1BIYA 3LSWA 3VVEA 4ZS9A 3K6VA 1XVXA 3LR1A 3BFUA 4JWXA 2PX1A 3DP4A 1PC3A 3CFXA 1SVXB 5FHMA 4PETA 1SD3A 2DE4A 5H8FB 1A99A 5AA4B 1FTOA 4OFOA 4EDPA 3TPAA 3U8QA 3DP8A 4OXVA 2V93A 4IO4A 1ANFA 3KJTA 5CBRA 1ZU0A 3K00A 1VFEA 4EF1A 3UORA 1WVJA 2H98A 3RQTA 5FTIA 3S4UA 4BDQA 1ZKBA 2BJJX 1WDNA 1EZPA 1SBPA 3CRBA 3S9MC 4ZEDA 2DE2A 1MXZA 4ONYA 3V8XB 1MQHA 3ECRA 3U92A 3FJ7A 3UP9A 1B0LA 4EUOA 2I0BA 3TTMA 3RN8A 3PUYE 1HSLA 3CFZA 4F2OA 3JYRA 4NF4A 2XXHA 3H3GA 4DDDA 2X7PA 1CE2A 4MF3A 2KLFA 2F8DA 3TZAA 3MPKA 2VGQA 4MLVA 1EU8A 2R9JA 3FGSA 2UXAA 2DSFA 4R9GA 1S9TA 4HCYA 3K1MA 1NKXA 5DYHA 3UN6A 4ELPA 3HO7A 5CMBA 3LC8A 3RTWB 3FXRA 3MVZA 1TXFA 4AQ4A 3K6UA 5ITOA 4MH5A 3VXBA 3SEVA 2QL3A 1LGBC 1QULA 5KDTB 4OFLA 1LBBA 4FIMA 3GBBA 1DPEA 4PFYA 1RYXA 4I9DA 3VFJA 5LOMA 2DYXA 4XTCQ 2H5YA 3FASA 2GH9A 1MH3A 2YPNA 4G68B 1Y9UA 3TMGA 5CBSA 3Q29A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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