4LZ7A

Crystal structures of glur2 ligand-binding-domain in complex with glutamate and positive allosteric modulators
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery and Characterization of a Novel Dihydroisoxazole Class of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic acid (AMPA) Receptor Potentiators.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz7A02
3GZGA 3MP8A 2ESNA 2Z23A 1MQGA 1R9LA 2RKMA 4ISUA 4POWA 4ELQA 5ISUA 1MPBA 1MY0A 1SW2A 3IJOB 3S2VA 3VFJA 4ZEDA 4EXKA 5ELVA 3K1PA 3FATA 1ATGA 3KGCA 3O6HA 4ZEIA 1Y1MA 4RJZA 3TAJA 2I6EA 3UK4A 2XD2A 1P99A 3KN3A 3TMGA 3IJXB 4LZ5A 3BFTA 3D4GA 4H1XA 3W9WA 2CMOA 5CMBA 1HSLA 2IA4A 3V5AA 1TWYA 3MQ9A 4MLQA 4EDPA 5DVIA 4GIZA 4O3CA 2VHAA 1AL3A 3G3IA 3ILTB 3R7XA 3DP4A 2I4CA 2I3WA 2I4BA 3IB0A 1IXCA 1FTKA 1FTLA 4XKRA 3K6WA 1IXIA 3RPWA 2R6GE 3HHGA 5DEXA 4ELPA 5JK4A 1YCJA 2F78A 3VLUA 1UQWA 4THIA 1Y3NA 4ZS9A 1GV8A 2WKYA 4KPTA 1FQFA 4ESWA 2XHDA 3MWBA 4ZEFA 1JEUA 3PMVA 3B6QA 3QSLA 3VV5A 3M3KA 5L9SA 1FQEA 2OLBA 4IO5A 4NF4B 3C36A 3OMBA 3RUMA 4H5FA 3TZAA 1SI1A 1DPEA 4IY6A 4QFNA 1DPPA 1YAEA 2R9JA 4NF4A 4U4SA 3QUJA 4ZEKA 3MVXA 4JWOA 1LAHE 2V3QA 1Z7ME 4GLIA 4LQ2A 5IAIA 2FYIA 4IB2A 1MS7A 1NFTA 1AH5A 4FIMA 3RQTA 3BKIB 3TCGA 3TEPA 2XXIA 4L17A 1NH8A 1B1HA 4KD5A 4DLDA 1BKAA 2LAOA 1ANFA 1Z7NE 2ZYOA 1Y20A 3TKDA 1NL5A 1MDQA 3MC2A 3QK6A 4MH5A 1H44A 4LZ7A 1URGA 3MJNA 4H67A 4LONB 4XXUA 4ZEBA 3VLVA 2DS9A 3DP8A 1B9JA 3UP9A 5K2XA 2NVUB 3RNNA 2AYSA 1OVBA 1SBPA 3KOTA 1B3LA 2F7CA 3VXBA 1LB8A 2IEEA 5FTIA 5BWJA 1LGBC 2ZNSA 1JW5A 4GL8A 3MUQA 1II5A 4GQOA 3SEWA 4BDMA 4P0GA 4GD5A 3KSXA 2Z8EA 2A5SA 3CVGA 1MXVA 2OWSA 4HCYA 5AA3A 4OERA 1LBBA 3H7MA 4PFWA 4TQUQ 1JQFA 3EHTA 2ONSA 1LFHA 2HCAA 3C32A 2DWIA 4R73A 1B05A 2DXRA 3PPQA 4IO2A 5EYFA 3PUZE 4R6KA 3C35A 1B51A 2QPQA 4TLMB 3RGYA 1Y3QA 1MQDA 2GHBA 3FVOA 3PMWA 3CFZA 4NTLA 1XVXA 2V25A 2YLNA 2QS4A 4GXAA 3K02A 4RXLA 3OO6A 2D3IA 2DWAA 4R9GA 3FVKA 3ZSFA 4IO4A 1B46A 2XXPA 4IO3A 4JSDA 3WAFA 1YPNA 2DVZA 5I56A 1XVYA 2OWTA 1CE2A 4BDQA 1SW4A 3HSTA 5ITOA 2O68A 4EF2A 3S9NC 3IB2A 5CBRA 3VE1B 2O1LA 3MZ1A 4R72A 4RY1A 3SEXA 3EPEA 2ONKE 3QIMA 4WKMA 2QSXA 3A3UA 3P7IA 1H3DA 3LR1A 4OWDA 3T96B 1P1QA 4F29A 1QW0A 5CMMA 1OIBA 3KG2A 2DP8A 5CI5A 4ZZAA 5KDTB 1OLCA 3RLFE 2DE3A 3MPKA 1A55A 3PD9A 5KDTA 2F34A 4EQ7A 4OFLA 5H8QB 1B2HA 5IKBA 5H8NA 4OYVA 3OD7A 3T22A 3VVEA 5TPAB 4F18A 4KI0E 4I9DA 3RTFB 3PPNA 4NF6B 1MPCA 3TQWA 4KYEA 2VGQA 2DYXA 4FE8A 1MQJA 4KYSA 3RY3A 3PV0E 2A5TA 3MPLA 3OEMA 4OMBA 1T0KA 2AL4A 4PFUA 3D4CA 4FEDA 5L9MA 4G8NA 5L9OA 1XS5A 3M8UA 1O7TA 3G3KA 2H25A 1PDAA 2H5YA 3IO4A 3ZKKA 1F9BA 4F22A 2O7UA 1MXZA 3GLBA 2ZXTA 4LA9A 4OTEA 4UA8A 4WEDA 5AA2D 1NKXA 1VFDA 2QS2A 3N6TA 3PD8A 4YKIA 3MZBA 4UACA 3DP6A 3PUWE 3FJGA 1M5EA 3O29A 2ABHA 4DZ1A 1Y9UA 3K6XA 1SDXA 4YB6A 4FAJA 1GGGA 4F2OA 1GTKA 2HZLA 3QYTA 3UA8A 3IORA 2AL5A 3K1MA 4U4XA 2DWJA 3N26A 2XX9A 1FQBA 2REJA 3RT8A 3TTKA 1B5JA 1M5BA 1EZPA 3U1OA 4OEUA 4Z7EA 3QAXA 1NNTA 4FJPA 4XKPA 2VD2A 2ZNUA 3HCQA 4H5GA 4WXJA 2M8CA 4JB7A 1A7LA 1Q1KA 1VFEA 3N94A 4WEPA 1PB8A 1WODA 5F7VA 4C1TA 1PBQA 3TCFA 4HW8A 3S9MC 3EHUA 3OO9A 1J1NA 1URDA 5FHMA 3TTLA 2B3BA 5ICQA 1MH4A 3Q25A 5CC2A 2Z8FA 1QKAA 3CG1A 1N3WA 2I0CA 2P2AA 1SD3A 3KN8A 4QHQA 1ZTYA 3HV1A 5DVJA 3FUZA 3G3FA 2F5XA 4QF9A 4LZ8A 5I84A 3TFLA 1I6BA 2XD3A 2NOOA 2PYYA 4F1VA 2ANJA 4U23A 3H6WA 3N5LA 5DT6A 5I59B 4R75A 1I6AA 1UTBB 2D21A 1TXFA 3E9XA 4G77A 4YU0A 2VOZA 5DYHA 2XXUA 5F1QA 2PMSA 1B6HA 1UTBA 5TP9B 4I62A 3SETA 5A5XA 5KCJB 1A8EA 3CRBA 3V89B 4EXLA 5M2VA 3T9HB 3SEUA 3MVWA 3U8QA 1B32A 2YPNA 3W9VA 1AIVA 5FHOA 4NWDA 3PUVE 4Q5TA 2DVCA 2HFBA 2G29A 3IK6B 3PUYE 4YB5A 1NH7A 1QUIA 2Y7IA 3RN8A 5BUUA 4YMBA 4EQ9A 5H8NB 3H4ZA 5I57B 3S9LC 1MG1A 2Q2CA 4Q30B 1MY3A 3OXNA 3I6VA 2Q2AA 4F3PA 3GXAA 3LSWA 1IITA 1Y1ZA 1P1NA 4IY5A 5EHSA 4YMAA 3USDA 1US5A 4R6YA 3T9VA 5FTHA 4OZ9A 2DSFA 2W7YA 4F19A 1B7HA 1BTJA 1H45A 4LVQA 1A8FA 1IXHA 1ZMGA 2QL3A 3OENA 4AB6A 4G4PA 1A99A 1FQAA 1P1UA 2RC9A 4R6HA 2HAVA 3EHSA 3SESA 4PETA 1LFGA 5AA4B 3S9EA 5TP9A 1WVJA 1ELJA 1NNPA 3PPOA 4PFYA 3EQ1A 1B7ZA 4Q0CA 5CBSA 1I69A 2PVUA 3H6VA 1ZU0A 4NF5A 1ZKBA 5I59A 3Q28A 4U1OA 4HS7A 4MBPA 2QS1A 3K0VA 1OQGA 3KFMA 1DSNA 1FQCA 1USYH 2OJTA 1QJMA 2XX8A 3K6VA 2O69A 4FECA 1VR5A 5KZTA 3MVZA 1PEBA 2QJEA 1AOVA 1O63A 4IO7A 2FA7A 1GVCA 2OK2A 4EF1A 4F2QA 2B65A 2FNCA 1AMFA 1S50A 1YTVA 3ZKLA 3U92A 3KZGA 1PBPA 3CI8A 2PBWA 4LQ5A 1B5HA 4K3FA 3PPRA 1SI0A 1TT1A 4RK9A 3FZVA 1Y3PA 3V83A 1UIUA 3TELA 2I48A 3CFXA 4OEVA 4YKPA 4PP0A 4DXCA 3ONMA 4ND9A 1MXXA 1DTGA 1EU8A 3MP1A 4QSEA 5AA4A 1LSTA 2O6AA 4BDNA 1FW0A 2GH9A 3TPAA 1US4A 1S7YA 4JWYA 3I3VA 1MY4A 4QFPA 3S4UA 3THIA 2THIA 3ODBA 1PC3A 1JVXA 2H98A 1Y4CA 4KQPA 4R2FA 2V3UA 4H0WA 1N0TA 3A09A 4FATA 1XOCA 2REGA 1MRPA 3M3FA 3G3JA 4OFJA 1VSOA 3G3HA 3CG3A 2V93A 1CB6A 1FTMA 2ZNTA 3FASA 1MM6A 4OHNA 5I58A 1ZLQA 2X7PA 1B5IA 4HTGA 5AE4A 1MXWA 1O64A 1LBCA 2HEUA 2OZZA 4H6DA 4AQ4A 1LCTA 3FVNA 1HSJA 4U2RA 2Z8DA 3V8XB 3O97A 3L6GA 3OELA 3IOTA 2QMWA 3DLNA 5H8SA 4OVJA 3KJ7A 1D3KA 1R9QA 2O84X 3MP6A 4NF8A 4YB7A 5DVFA 3KEIA 4ZE8A 4ZZEA 2NXOA 1NMUA 3TTNA 1BIYA 3H6UA 3O2AA 1P1WA 3G7WA 4MF3A 4X1BA 1L5TA 5AA2A 3LBSA 3T9UA 1SQYA 3UGWA 3R6UA 1R6ZA 3OOAA 5I2NA 1RYXA 2XXXA 4C0RA 3VDFA 5L8DA 4DCYA 1FTJA 4RNSA 4DE8A 2UYFA 4NMYA 3N6UA 1A40A 1B3HA 1URSA 3FXQA 3PPPA 4R9FA 1IQ7A 2V84A 1Y4TA 3F11A 1MXUA 1USYE 4JSOA 4DCXA 4GXSB 3BFUA 3O66A 1XC1A 3DM0A 1JVYA 2GRVA 3B6WA 3H03A 4NF5B 3RT6B 4F3GA 2ONRA 3C33A 4F31B 3Q29A 3LUYA 4TLLB 5HM4B 4RA1A 3IX1A 5EHMA 3EF7A 2VP1A 3O28A 5DTBA 4I1DA 1LLSA 2HZKA 4JDFA 2AIXA 1ZBMA 2I3VA 3C34A 4PE5B 4F3SA 5B7DA 2HQ0A 3JZJA 1TFDA 2I0BA 4QFLA 1DTZA 2F6GA 3WAEA 3G3GA 4GWOA 4BDRA 4ELOA 4NEDA 2XXHA 2PX1A 2ZYKA 3LSFB 2H99A 1JW1A 3Q26A 4H8IA 4U22A 2NWJA 2DQVA 2UYEA 3UORA 3KJTA 4GOTA 3TYHA 1ZJLA 2HXWA 4E0WA 3QUFA 2QS3A 3K2DA 5HBCA 4OESA 1SW5A 3H6TA 1QKBA 5H8HA 1LCFA 2HAUA 3E3KA 4DXBA 2B3FA 1DOTA 3B7DA 2OCUA 2F7BA 4KFQA 1UTHB 2NUVA 2XXWA 4GVOA 2F97A 5I2KB 2P1SA 1WDNA 4ZE9A 1XT8A 2Q89A 2QRYA 1TFAA 1LFIA 3L6HA 2ZYMA 2Y7PA 4JWXA 2G93A 4F3BA 1N04A 4KCCA 3IL1B 4ELRA 3MBPA 3VVDA 3E13X 1D9VA 1LAFE 4RPNA 4X1DA 4KR5A 4E0XA 3HHFA 3PU5A 2V3TA 4M1VA 4O3AA 1MM7A 5H8FB 3C4MA 3FVGA 1MH3A 3CIJA 3HO7A 4NF6A 4R2BA 2Z22A 4DIGA 3FD3A 2E1SA 4YICA 1N7XA 4FEBA 1FCKA 3JYRA 3ILUB 1FQDA 3HN0A 4RPOA 2Y7KA 2CZLA 3FXUA 5AA1A 4BLAA 1IZ1A 3VLWA 2OBGA 4AB5A 3K01A 1QULA 2P0SA 3IOWA 1DMBA 1B1XA 3UIFA 3LC8A 3Q27A 4H8JA 4PFTA 1RKMA 3FV2A 3TDJA 5CM6A 3TQLA 3SEVA 5J1DA 4O3BA 3C31A 4X48A 1ZIUA 5JEIA 3HPIA 1JEVA 2R71A 4X9TA 1JW4A 4IGTA 5I2NB 3T9XB 5A5XB 2UXAA 4KYDA 4XIGQ 1B4ZA 1MY2A 1LB9A 3O6GA 1MQIA 3PUXE 1QVSA 4TOZA 5ITPA 2GFEA 2Y7WA 4G68C 3TODA 4OETA 2H4IA 5LOMA 2H9BA 2RCBA 1BLFA 5B70A 2RINA 2D5WA 1OLAA 5KCJA 3SKPA 3CSBA 2ZMBA 4DXUA 3KN7A 1BP5A 4IO6A 1B3FA 1PB9A 1LAGE 3DELB 3IB1A 3K6UA 3R26A 2XXYA 3B6TA 1D9YA 1H43A 2DWHA 1H76A 5TPAA 4ONYA 2GHAA 4XKNA 4C1UA 2DXYA 2F6PA 2ALUA 3MVYA 4G2ZA 4ZECA 2ZYNA 3FJ7A 3CFLA 3ZS6A 5I58B 2RCAA 2DE2A 2UVGA 4QSCA 4OXVA 1RYOA 2Q9TA 3OO8A 4Z0IA 5H8QA 1B3EA 2O51A 4EQBA 4M4GA 3VVFA 1NNFA 3VXCA 4Q8RA 3TUSA 3KSJA 3O6IA 1OQHA 4G8HA 2UVIA 1IXGA 1EZOA 1N76A 1A54A 5JTYA 4RK2A 3CR9A 3U94A 1B58A 5CMKA 5HPQA 1B52A 2F7AA 4RYAA 4YZZA 3IR1A 1R1NA 1B0LA 1SVXB 1QUJA 4QRZA 3RTWB 4GFRA 3OSRA 4LATA 4BDLA 5I56B 3KOSA 4QFKA 1FTOA 1SYHA 4F1UA 2UVJA 1B4HA 1I6QA 3JV9A 3OSQA 4H65A 3K4UA 4MFIA 3GBBA 4N6PA 2I58A 3PGFA 4N07A 2YJPA 1B3GA 4ESXA 2RC7A 3KBRA 3FIRA 1JNFA 4U1ZA 1SYIA 3E4RA 1D4NA 1S9TA 2DOJA 1B7UA 2Q8JA 4OQOA 5I57A 3ECRA 2DE4A 1M5DA 2KLFA 3MZ9A 3SDFA 3SEYA 2XXVA 2XXRA 5CMCA 4I8CA 5AA2B 2O1MA 3K00A 2UVHA 2X26A 4G8MA 1POTA 1PB7A 2X7QA 3EN3A 3QXMA 4YAHX 3TTMA 1N3XA 1JETA 3IOVA 3IO6A 3PMXA 4KCDA 4G68A 4NWCA 1MQHA 2I49A 2VD3A 4R74A 4U21A 1VE4A 1B40A 2F35A 3I5OA 3FGSA 2A5TB 5K2YA 4XKQA 2XX7A 1M5FA 1UIVA 4LUBA 3IOUA 3H06B 4POXA 3FV1A 1IUDA 4KHZE 5FHNA 2F8DA 4GL0A 2PT1A 3U93A 3GBAA 3IAZA 4LP2B 1QUKA 4QFOA 2BJJX 3AXFA 1KWHA 1OVTA 4P11A 5DEXB 4P0IA 1LAXA 3U72A 4OENA 3T66A 1MPDA 2O7IA 3TCHA 1EH3A 2Y7RA 3CSGA 3SERA 1M5CA 5ICTA 4YKKA 4FORA 4ZDMA 3W15C 3LSXA 4NE4A 4QSDA 4JBZA 5H8FA 3H3GA 3MAMA 4EUOA 4OFOA 2E0SA 4BDOA 1P1OA 4F39A 1NNKA 2XXQA 3OEKA 4JXIA 1N84A 2QMXA 2Q88A 2XXTA 4HCWA 1IEJA 4N13A 4YKJA 3FJMA 2RF1A 4G68B 4XTCQ 5TU0A 1IIWA 1B0HA 1MDP1 1N7WA 2F36A 4GF8A 5JTYB 2PT2A 3FXRA 4MLVA 4F1YA 3A3CA 3M3LA 4NF8B 2Y84A 1GR2A 1XHYA 1SW1A 1POY1 3T93B 1EZ9A 1UTHA 5I2KA 3TTRA 4GRKA 3OO7A 4PQJA 4IGRA 1MY1A 3K1NA 4ECFA 3C9HA 1MXYA 1OMPA 3LSLA 3O9PA 3BBRA 1HSEA 1Q35A 3MW0A 2RC8A 5H8HB 3UN6A 4DDDA 5CRYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MP8A 2ESNA 1MQGA 2RKMA 4POWA 4ELQA 5ISUA 1MPBA 1MY0A 3S2VA 5ELVA 3TAJA 1ATGA 4ZEIA 1Y1MA 2I6EA 4PGPA 1FPGA 3UK4A 3KN3A 2XWOA 2CMOA 4MLQA 4EDPA 2VHAA 3G3IA 3KC0A 3NOHA 4XKRA 3RPWA 2R6GE 5DEXA 4N8GA 1UQWA 4MCOA 5LDZA 1FQEA 4NF4B 1SI1A 4U4SA 4ZEKA 2V3QA 4IB2A 1LBVA 2HHMA 4DLDA 3MC2A 3UGWA 2KQZA 1B9JA 2NVUB 3VXBA 1DCUA 2IEEA 5FTIA 5EYGA 2ZNSA 1II5A 3SEWA 3CVGA 4HCYA 5AA3A 2MKZA 2DWIA 1B05A 4IO2A 5EYFA 4NX1A 4TLMB 4NTLA 3CFZA 2V25A 2QS4A 4GBWA 3OO6A 1B46A 4JSDA 4BDQA 3HSTA 1KZ8A 3QIMA 1QW0A 3KG2A 4ZZAA 5KDTB 1OLCA 4I3YA 4P47A 1B2HA 5IKBA 3PPNA 1MPCA 4KYEA 4PE3A 2A5TA 1YYZA 1XS5A 3M8UA 2H5YA 4OTEA 3GLBA 2ZXTA 2ABHA 4FAJA 1GTKA 3K1MA 4U4XA 2DWJA 3E78A 1NNTA 4FJPA 2M8CA 4JB7A 3N94A 1WODA 4C1TA 4GX3A 1J1NA 5ICQA 3Q25A 5CC2A 2I0CA 2P2AA 5DVJA 5I84A 1I6BA 5DT6A 3E9XA 1TXFA 5F1QA 5TP9B 3SEUA 3MVWA 1B32A 5FHOA 5H8QA 2HFBA 2G29A 4YB5A 3H4ZA 2Q2CA 3OXNA 3I6VA 4YMAA 2WYKA 3T9VA 1FPEA 1B7HA 1BTJA 1H45A 4AB6A 1A8FA 2QL3A 1FPFA 1NNPA 5CBSA 4N91A 3EQ1A 4PFYA 2OX3A 1ZU0A 5I59A 4U1OA 3KFMA 2OJTA 1USYH 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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