4LZ7A

Crystal structures of glur2 ligand-binding-domain in complex with glutamate and positive allosteric modulators
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Discovery and Characterization of a Novel Dihydroisoxazole Class of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazolepropionic acid (AMPA) Receptor Potentiators.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz7A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4lz7A02
3TAJA 1MQHA 2F78A 4H65A 4KD5A 5ITOA 3IJOB 3TODA 4ZZAA 4KFQA 3VE1B 4RPNA 1ZKBA 5H8HB 4FJPA 1JW4A 2B65A 2HQ0A 4JWOA 3VDFA 3H7MA 2QMXA 3TDJA 1R1NA 4XKNA 1P1QA 3LSWA 1MY3A 2PVUA 3MP1A 3PUYE 1T0KA 2YLNA 1B3EA 1NFTA 1GGGA 4NF4A 5I2KB 4EDPA 4Z7EA 3IJXB 2OCUA 1M5BA 3QUJA 4F2QA 1DPPA 3FUZA 1FTOA 4LP2B 5CMBA 1XHYA 2AL5A 2R6GE 5EHMA 4NWCA 1FW0A 5B7DA 1SI1A 3MVXA 3FGSA 3H03A 4F1YA 2Y7PA 3IB1A 4U1OA 1SW2A 1MH4A 1VE4A 2I6EA 5L8DA 3B7DA 1SYHA 3CI8A 3IOTA 1AOVA 2DWHA 3K6XA 3H6TA 3VVFA 4F2OA 4TOZA 3FZVA 5B70A 1FQFA 4FEDA 2RCBA 1URSA 3KSJA 2LAOA 5KDTA 4U21A 3TPAA 3IOUA 3O29A 2XXXA 3R26A 3G7WA 4ZDMA 3WAFA 1LLSA 4BDOA 3T93B 1Y20A 2A5SA 1MPDA 3C31A 1MQDA 1B5JA 3RT6B 1B40A 4DCYA 5ISUA 4YB5A 3PUWE 1OLCA 5CC2A 5CBRA 2R9JA 1FQEA 1GR2A 1MG1A 1OQHA 1A99A 2F5XA 2QL3A 3FXQA 2Y84A 3E4RA 5ELVA 2QMWA 5KCJA 3FV1A 4X1BA 4OHNA 5EYFA 2QPQA 3T9HB 4EQ9A 3FJGA 4ZEFA 4X9TA 4AB6A 2GHBA 1ZBMA 2F6PA 3PMWA 4YB6A 4Q8RA 4GWOA 4OVJA 3FXRA 4OZ9A 2O69A 1D9YA 4OMBA 3S9NC 4LZ8A 4ESWA 1B51A 1VFDA 4H5FA 5AE4A 1I6AA 4MFIA 2Q9TA 2Y7RA 5L9SA 5FHOA 1Z7ME 4ZEDA 1LCFA 3I6VA 3QIMA 4F19A 1IQ7A 2I4BA 4HS7A 1LAXA 4F3PA 1LB8A 2B3FA 3FASA 3PD9A 4JB7A 2NXOA 4O3BA 4ZEBA 1VSOA 3G3FA 3N26A 3N6UA 2X26A 2HAUA 2R71A 2XXVA 4IGRA 1ZU0A 2I49A 4R6HA 2ONRA 1JEVA 2Q88A 2REJA 3TCFA 3RNNA 2QS3A 1LB9A 2DP8A 1EZPA 2NVUB 1IXHA 3MZ1A 3ZKKA 5I57A 3KN7A 1N3XA 4R9GA 3KGCA 5DYHA 3V5AA 4TLMB 5CI5A 2XX7A 2Z8DA 4NF4B 1RKMA 2DWIA 4KYSA 5I2KA 3QAXA 1ATGA 4HTGA 4H6DA 4ND9A 3HCQA 2UVGA 3VXBA 4C1UA 2P1SA 4R75A 2QS1A 3K0VA 1IXIA 3OMBA 3U93A 3A09A 4EQ7A 3ECRA 3OELA 4G4PA 3SEVA 1A54A 2O68A 3PUVE 4JSOA 2HAVA 3A3UA 4GLIA 3UGWA 1US4A 3BKIB 1Y4TA 3F11A 3PU5A 1BP5A 4NE4A 5J1DA 3L6HA 4ZZEA 4AQ4A 2ABHA 2Z8FA 1JW5A 2XX9A 5AA4A 2ZNTA 3U92A 5K2XA 1YTVA 3RN8A 3UN6A 1XVYA 5I84A 2Q2AA 2A5TB 3M3KA 3K02A 4WXJA 1MQGA 3MBPA 2ESNA 3IR1A 5EHSA 1SW5A 1MPBA 3CFZA 4GD5A 3U94A 4YKPA 4DXBA 1DMBA 3D4GA 3OO6A 3MVWA 3S9MC 2PMSA 1FQDA 3DLNA 1MDQA 1MY4A 2A5TA 4PETA 4C1TA 2GRVA 5DVFA 1NNFA 3KBRA 4ELOA 5CBSA 3KEIA 3BFUA 1SD3A 1XT8A 2PYYA 2ZNUA 1GVCA 1DOTA 3TZAA 3T9XB 4DIGA 2XXYA 1NH8A 1DPEA 3CG3A 3MUQA 1IEJA 1GV8A 1MXVA 3QXMA 4M4GA 2Z22A 4MLVA 5KCJB 3SERA 3IL1B 1UIVA 3DP8A 4QF9A 1B9JA 1S50A 1UIUA 4GL8A 3RT8A 5HM4B 1MXYA 2DS9A 3MZBA 1TXFA 2THIA 4KR5A 4NTLA 4P0IA 2ONKE 5HBCA 5TPAA 3RTFB 2I3WA 5JK4A 2HZLA 2Y7IA 3FV2A 1MM7A 3EQ1A 2PT1A 2HXWA 1N76A 1US5A 1OIBA 4GVOA 4F1UA 1QUKA 4OXVA 3TTMA 1I69A 3KN3A 5TPAB 1H3DA 1A7LA 3H6WA 3MW0A 3JV9A 4U2RA 1N0TA 5H8SA 2F36A 5I56A 2NOOA 2W7YA 1DTGA 1R9QA 1JQFA 1URGA 2XXWA 4EQBA 4H5GA 4NF5B 2KLFA 4EUOA 1OLAA 1O63A 4ONYA 3VXCA 1QUJA 1SVXB 3IB2A 4HCYA 4U23A 2DWAA 2IA4A 1FTMA 3KOTA 4G68B 1SDXA 1MY0A 2UVJA 4NWDA 4XIGQ 5M2VA 4NF5A 1Y4CA 3IB0A 1MQJA 1MXUA 3C33A 4OEUA 2F97A 4YAHX 1MY2A 1MM6A 1QJMA 2H9BA 2XXHA 3K6VA 5DEXA 2O7IA 3Q28A 3RGYA 1H45A 2F7CA 3UP9A 4EXKA 3FJ7A 4IY5A 5H8HA 2RC7A 1B5IA 3VVDA 3PD8A 4F3GA 3K00A 3KG2A 1LBBA 3L6GA 1AMFA 4YICA 1LAFE 1B1HA 1EZ9A 1M5FA 1N04A 2WKYA 5DEXB 1ZMGA 3JYRA 4GQOA 3FVNA 3PMVA 4IO5A 2D21A 4H1XA 4MLQA 3UORA 1PBQA 3ONMA 2XXQA 2YJPA 3M8UA 3U72A 3U8QA 2B3BA 1FCKA 1SW4A 4F18A 1Y3PA 3OO9A 1II5A 2DVZA 1UTHA 2Q2CA 3R6UA 4GIZA 1EH3A 3TUSA 2ZMBA 4RPOA 1D3KA 4F31B 4BDQA 3CFLA 3PPQA 3AXFA 1SBPA 3KN8A 4RK2A 1IIWA 4K3FA 5IKBA 1ZLQA 3MQ9A 4XKQA 1B0LA 3IOWA 1R9LA 1ZJLA 3BBRA 1VR5A 3EHUA 3G3GA 3VLVA 3K1MA 2D5WA 1FTKA 4R2FA 4U4XA 3TFLA 4DE8A 4FATA 3PMXA 1MDP1 3K1NA 4DCXA 2UYEA 3O2AA 4IO2A 1ZIUA 1IZ1A 3O66A 3V89B 1B7ZA 3LUYA 2I48A 2I0BA 2Z23A 2F35A 1ELJA 1QKAA 1SI0A 1LCTA 1M5EA 2M8CA 2XD3A 1N84A 4FECA 4RNSA 4RK9A 4ZS9A 3IO6A 2VD2A 4Q30B 3T22A 3SEWA 4ZE9A 1UTBA 2OZZA 2RC8A 5FTHA 3PGFA 2PBWA 3A3CA 3LSXA 3IAZA 2XHDA 1Y3QA 3B6WA 3TEPA 1B4ZA 1P1NA 4QFPA 1TT1A 4H8JA 4JDFA 1D9VA 1P1WA 3ILTB 3IX1A 1B58A 2Y7WA 3I5OA 3KJ7A 3O28A 3VFJA 1MXZA 3PPOA 2X7PA 1PC3A 2DE4A 1QUIA 1JVYA 1UQWA 3PPNA 4TQUQ 4L17A 4DDDA 3UK4A 3ZKLA 1B52A 2OBGA 4THIA 2NWJA 1NNKA 3DELB 3PPRA 4BLAA 3S9LC 3CSBA 1H43A 4ELRA 4LUBA 1S9TA 3Q25A 4U4SA 1YPNA 4OTEA 4XKRA 5TP9A 3C4MA 1QW0A 2VOZA 4ZECA 4Q5TA 3KFMA 3QUFA 4NMYA 2F6GA 4QSCA 4RA1A 5DVIA 1Y1MA 4F29A 3FATA 3TTNA 5H8FA 2YPNA 4GL0A 4JWXA 1AL3A 3T9VA 3V8XB 2ZYKA 1P99A 2P0SA 2VHAA 4YZZA 3O6HA 2GHAA 3G3IA 3HPIA 4ZEIA 1JVXA 4ZE8A 3S4UA 4IO6A 5A5XB 4WEPA 2IEEA 1Q35A 2DXRA 4HW8A 3OENA 3MPKA 3WAEA 3H6VA 3OSRA 3R7XA 4KYDA 5I2NA 1AIVA 4IY6A 1QULA 4JXIA 1POTA 4ECFA 3VVEA 2OK2A 3K01A 4F1VA 1B32A 4YB7A 4OESA 5ITPA 1I6BA 3LSLA 4G68A 2G93A 3IOVA 4DXCA 3IK6B 5I2NB 4NF6A 4OENA 2H25A 3MVZA 3QK6A 1FQCA 2ONSA 2UXAA 4QHQA 1MXWA 3IO4A 4FEBA 4POXA 1A8EA 2HCAA 2DOJA 1B3HA 4R6KA 1OVBA 3I3VA 4PFYA 1B4HA 1NKXA 4KCCA 4N13A 4NEDA 1BKAA 3FXUA 1IXGA 4RXLA 1LFIA 1NNTA 4YMBA 2ZNSA 2XXPA 4QFOA 1CE2A 2BJJX 3H6UA 2VGQA 3ILUB 3P7IA 3Q27A 2V3TA 3RLFE 3W15C 4EF2A 4PP0A 4G2ZA 5CMKA 4ESXA 5AA2B 3EPEA 3MAMA 4OFJA 4U22A 4P0GA 2H98A 4YU0A 3CSGA 4EXLA 1OQGA 2VP1A 5FHNA 1UTHB 1P1UA 4LZ5A 4R9FA 3T96B 3TCHA 1P1OA 2P2AA 5AA2D 2DWJA 2ZYMA 1NH7A 4N6PA 1Y1ZA 5CRYA 5H8QA 5AA2A 2VD3A 4UA8A 2HEUA 3B6TA 1TFDA 2I0CA 1PB9A 3SKPA 3TELA 1IXCA 1ANFA 3OXNA 2CZLA 2UVIA 4LATA 1B46A 1B6HA 1PB7A 1A55A 1A8FA 2E1SA 2NUVA 2Q89A 3HV1A 4IB2A 1MRPA 1YCJA 3O97A 4POWA 2OWSA 3SEYA 1JETA 2QRYA 3VLWA 1AH5A 2V3QA 3SEUA 1XS5A 3LC8A 3HSTA 2HZKA 1PBPA 3E3KA 3H4ZA 2F7BA 4G8MA 4IO3A 4XXUA 4F39A 1LFHA 4LQ2A 2AL4A 1EU8A 3H06B 3C35A 1BLFA 4H0WA 5DT6A 3TCGA 4GRKA 3EN3A 2F8DA 4MBPA 3N6TA 4JSDA 2UYFA 2GFEA 2RINA 3SEXA 2ZYOA 1JW1A 3D4CA 1XC1A 3EHSA 3FJMA 3HO7A 3M3LA 2QSXA 2RF1A 3N5LA 4FORA 1BTJA 3KZGA 3HN0A 4P11A 3CRBA 1DTZA 4OWDA 1F9BA 2V93A 4Z0IA 5K2YA 4Q0CA 4LZ7A 3CFXA 2DE2A 1GTKA 5L9MA 2DXYA 4OYVA 4I9DA 2G29A 2CMOA 1RYOA 2XXTA 3V83A 2QJEA 4LQ5A 1LBCA 3RPWA 5AA1A 5A5XA 4RY1A 2Q8JA 4U1ZA 1LFGA 3QSLA 4IGTA 4QSEA 2OJTA 4ZEKA 3SDFA 1IITA 3TQLA 4ELPA 1USYH 1O7TA 4X1DA 3OD7A 3GZGA 5TP9B 1EZOA 4ISUA 3DM0A 2QS2A 3PPPA 4JBZA 4KHZE 4R2BA 3O6GA 4DLDA 4YMAA 2I58A 4IO4A 3GBBA 3TQWA 3DP4A 4C0RA 4R73A 1B05A 2QS4A 3EHTA 4WEDA 4AB5A 4LONB 2XD2A 4G8NA 5BWJA 3TTLA 3GBAA 1KWHA 1IUDA 4KPTA 1FTJA 4BDLA 3ZSFA 4G8HA 4GXSB 3KOSA 1NL5A 1PEBA 3PUZE 2ZYNA 3Q26A 3Q29A 4YKIA 1LAGE 4PFTA 1QKBA 2UVHA 3C36A 3GLBA 5I58B 1N7WA 2O1MA 1B3FA 3TKDA 4BDMA 3TTKA 4NF6B 5IAIA 1MH3A 3G3HA 5F1QA 2DE3A 3E13X 3SESA 2V84A 3ODBA 4H67A 5H8NA 4QRZA 1PB8A 4I62A 5CM6A 5I58A 1NNPA 1Z7NE 3THIA 1N3WA 1JEUA 4FE8A 1LGBC 1LSTA 4RJZA 4RYAA 1HSLA 1ZTYA 3FVKA 4G68C 3T66A 1WDNA 2O84X 4PFUA 1MPCA 2O7UA 4KCDA 5H8QB 1L5TA 4E0XA 1H76A 5I59B 1JNFA 3QYTA 4MF3A 1OVTA 2DSFA 4QFLA 5JEIA 1XVXA 2DVCA 2HFBA 2DQVA 2I4CA 1D4NA 3MWBA 4ELQA 2FA7A 4OEVA 5HPQA 4F3BA 3CG1A 1MQIA 1RYXA 2O6AA 2RKMA 3CR9A 1TFAA 4GFRA 4PE5B 3LSFB 3T9UA 1B7HA 3U1OA 4TLLB 2ANJA 4NF8A 1UTBB 1B0HA 4PFWA 4X48A 3CIJA 2XXRA 4FAJA 4M1VA 3MVYA 3PV0E 3SETA 4GF8A 4KYEA 4YKKA 2ALUA 3O9PA 1B3GA 2V25A 5I57B 1R6ZA 3H3GA 3RTWB 2FNCA 3RQTA 3USDA 4NF8B 1Q1KA 3TTRA 3N94A 2O51A 1S7YA 2F34A 4F22A 3C32A 4XTCQ 3OOAA 4OERA 1QVSA 4MH5A 3KSXA 4R72A 2AIXA 4WKMA 1DSNA 5DVJA 4FIMA 5FTIA 4I8CA 3TYHA 5AA3A 4F3SA 4OETA 1FTLA 2I3VA 4QFKA 4QSDA 3S9EA 4YKJA 1WODA 1FQAA 4IO7A 1SW1A 3FVOA 1USYE 3PUXE 5DTBA 4R6YA 3RUMA 3K2DA 3MP8A 5CMCA 3UA8A 5KDTB 1A40A 4E0WA 3K4UA 4XKPA 1MY1A 5H8FB 3EF7A 5F7VA 1XOCA 4HCWA 1VFEA 5AA4B 4JWYA 2F7AA 3K1PA 4KQPA 2AYSA 1WVJA 1YAEA 1TWYA 2H99A 4KI0E 5CMMA 4LVQA 3O6IA 3M3FA 3MPLA 1FQBA 2XX8A 3OEMA 5ICQA 1J1NA 1N7XA 3VV5A 3HHFA 3W9VA 4N07A 1CB6A 2OWTA 4O3AA 1SQYA 4BDNA 3OO7A 3G3KA 2OLBA 5FHMA 3TMGA 3MZ9A 4PQJA 3KJTA 1B3LA 5BUUA 1Y9UA 3C9HA 3LR1A 3MJNA 5TU0A 3UIFA 2V3UA 4I1DA 1LAHE 3G3JA 4G77A 4OFOA 3S2VA 3W9WA 1B5HA 1H44A 2GH9A 2Z8EA 2ZXTA 2RC9A 3ZS6A 2FYIA 1NMUA 4LA9A 2X7QA 4QFNA 4GOTA 3BFTA 1B2HA 5H8NB 4OQOA 3MP6A 1B7UA 4R74A 4BDRA 3C34A 1BIYA 3B6QA 2PT2A 3JZJA 5L9OA 1M5DA 2Y7KA 2RCAA 2XXUA 2REGA 5JTYA 1URDA 2PX1A 5I59A 3K6WA 5ICTA 2O1LA 1B1XA 3FIRA 1M5CA 3VLUA 3FVGA 4UACA 3DP6A 2E0SA 3HHGA 4EF1A 1Y3NA 4H8IA 5I56B 1OMPA 3GXAA 1SYIA 1PDAA 3CVGA 3OEKA 4GXAA 5JTYB 3MC2A 1O64A 1POY1 2H4IA 2DYXA 3E9XA 3IORA 3RY3A 5KZTA 5LOMA 2H5YA 4DZ1A 2D3IA 4DXUA 1MS7A 3K6UA 3LBSA 3FD3A 1MXXA 3OO8A 3OSQA 2XXIA 1I6QA 1HSEA 4O3CA 4OFLA 1HSJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TAJA 1MQHA 4GWYA 3VDFA 3H7MA 1P1QA 3MP1A 4Z7EA 5I7IA 1XHYA 2R6GE 4PAKA 4O8MA 1SI1A 4U1OA 2FIEA 4G61A 1AOVA 2DWHA 5KDTA 2LAOA 3TPAA 3O29A 2XXXA 4ZDMA 1Y20A 2A5SA 3RT6B 1B40A 4DCYA 2R9JA 3FXQA 5ET6A 5ELVA 3E4RA 5KCJA 4X1BA 4OHNA 5EYFA 2QPQA 2GHBA 1ZBMA 3PMWA 4GWOA 4OVJA 5FBPA 1D9YA 1QGXA 3S9NC 1LCFA 4JB7A 3PD9A 2NXOA 2XXVA 2REJA 1JEVA 2HXRA 4OVTA 2NVUB 3ZKKA 3KGCA 3V5AA 1Q9DA 2XX7A 5I2KA 5IZ1A 3HCQA 1NV5A 4R75A 3U93A 4EQ7A 3ECRA 3PUVE 5EQ7A 1US4A 4NE4A 3QMFA 5J1DA 3RN8A 2Q2AA 5EHSA 2A5TB 4WXJA 3LV0A 3U94A 3D4GA 2PMSA 1MY4A 3BIGA 3BFUA 1FPKA 2XXYA 3MUQA 4O94A 5KCJB 2Z22A 3SERA 3IFCA 5HBCA 4P0IA 4PCDA 4NTLA 4F1UA 4OXVA 4MEVA 3JV9A 4U2RA 5I56A 2W7YA 4H5GA 4NF5B 1OLAA 4ONYA 3T0JA 4HCYA 4G68B 4PFIA 1SDXA 2UVJA 1MXUA 4JVCA 1MM6A 5DEXA 4EXKA 2KQZA 3VVDA 3PD8A 1FBHA 3L6GA 4YICA 3JYRA 3FVNA 4MLQA 4H1XA 2YJPA 4MAGA 4GIZA 4BDQA 3PPQA 1SBPA 3MQ9A 5I3SA 1R9LA 3VLVA 2D5WA 3PMXA 1MDP1 2UYEA 3O2AA 3LUYA 2I48A 2I0BA 2Z23A 1SI0A 2R8TA 1LCTA 1M5EA 5AE4A 1N84A 4ZS9A 5FTHA 3PGFA 2PBWA 3TEPA 1P1NA 4QFPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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