The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
140
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structure length |
140
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| publication title |
Degradation of human hemoglobin by organic C-nitroso compounds.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
58
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| structure length |
140
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| sequence length |
140
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-08-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3HXN B; 1MNH A; 2W72 B; 2BNL A; 3S48 C; 1G9V B; 1G09 B; 1YEN A; 1Y7Z A; 2H8F B; 4N7P A; 1GBU A; 1V4X B; 3QJB A; 1LFZ A; 2MBW A; 3BOM A; 2RI4 A; 1CQ2 A; 4N7O B; 2IN4 A; 1JL6 A; 5JDO D; 4XS0 A; 1MLL A; 1CLS A; 3AQ6 A; 1FHJ B; 3QJE B; 1EMY A; 5E6E B; 1Y4G A; 1D8U A; 3WCP A; 3V2V A; 1L2K A; 1HAC B; 3ZHW A; 3NG6 B; 1K1K A; 1A3O B; 1HDS B; 1FSL A; 1YH9 B; 1MOA A; 4DC8 A; 1FAW A; 3E4N A; 3OO5 B; 1RQA B; 1Y0C B; 3UGZ A; 4G1B A; 1BIN A; 3WCU B; 1QXD A; 5CNB A; 3QM9 A; 1A01 A; 1CO8 A; 1YE0 A; 2BW9 M; 1T1N B; 1CIO A; 2GKM A; 3E5O A; 2YRS A; 2W6V B; 1WVP A; 4KN3 A; 3GQP B; 2B7H B; 1SI4 A; 4DC7 A; 1Y4P B; 3WCV D; 1SDL A; 4U8U C; 1MYF A; 2PEG B; 1YMB A; 1CBM A; 1FDH A; 2HBE B; 110M A; 5JOM A; 3HHB B; 3DUT B; 2HHD A; 3UHV A; 106M A; 5EUI A; 1MYI A; 5HY8 B; 1V07 A; 1V4W A; 5HU6 B; 1JEB B; 3LQD B; 1C7C A; 1JP8 A; 1CQX A; 3GQR A; 4C44 A; 3PT8 B; 2NSR A; 2EKU A; 1Q1F A; 1O1L A; 3WTG B; 4MQJ B; 4FH7 A; 3EDB A; 2DN2 B; 1Y8K A; 3HF4 A; 1MNI A; 1HV4 A; 4H0B A; 3B75 B; 1GZX B; 1MBO A; 3A2G A; 4NXC A; 1YHR A; 1YMC A; 2MGD A; 2HHB A; 3A0G A; 3GQG B; 1DXC A; 3UHU A; 1CH4 A; 2RI4 B; 1S5Y A; 4WJG 1; 3VRF A; 4GZG A; 1MYH A; 3RJN B; 1G08 A; 3WR1 B; 1O1P B; 2MHB A; 2D60 A; 3ECX A; 3NMM B; 4NI0 A; 3GK9 A; 1MBN A; 2LHB A; 1XZ2 A; 2ZS1 C; 2MGK A; 4DWU A; 1J7S B; 4HHB B; 3UGY A; 3U3E A; 4WJG A; 2Z6T A; 5CN4 A; 1COH B; 3S66 A; 1A0Z A; 2WTH A; 1S5X A; 1OR4 A; 1CG5 A; 2D2N D; 1HBG A; 1XZU A; 1MZ0 A; 5HLU A; 4MQC A; 3S65 B; 2VRY A; 2AA1 B; 1C40 A; 5D1V A; 2AUO A; 1YIE B; 1UVX A; 1FCS A; 5CHQ A; 1KD2 A; 4F6B A; 5B84 A; 4U8U B; 1S0H A; 2BLJ M; 1MCY A; 2QFK A; 1J7W B; 1J3Z B; 2HCO A; 1MBD A; 5JGG B; 2ZT3 A; 2XKH A; 5E29 A; 1YZI B; 2BLH A; 1YGD B; 3ZH0 A; 1Y0T A; 1Y83 B; 1H1X A; 3QQR A; 1BZ0 A; 2DHB A; 2HHD B; 1HDA B; 1LA6 A; 3HYU A; 4NZI A; 2ZLT A; 2V1H A; 3WCW C; 2BMM A; 3GOU B; 3VHB A; 1J40 A; 1DO7 A; 4N8T B; 5AZQ A; 3UH5 A; 1UIW B; 2HHE A; 2QSS B; 5C6E A; 1OUT A; 1Y5J A; 1YEV A; 1Y0D B; 1BIJ A; 2ZST A; 4HRR A; 1WMU A; 2DN1 A; 3GKT A; 3EU1 B; 1Y5K B; 1Y2Z A; 3R0G A; 2VEB A; 1ABW B; 4PQB A; 3WCT A; 4M4A A; 1OJ6 A; 3D4X B; 3HRW B; 3A59 A; 1CMY B; 1YGF B; 2ZSR A; 4TYX A; 1J41 B; 5MBA A; 2ZS1 B; 1O1M B; 5C6Y A; 2MHB B; 2R1H A; 1A9W E; 3PIA A; 112M A; 4ROM A; 1YFF A; 1GJN A; 4MQK A; 1S6A A; 3KMF A; 3CY5 A; 1NZ2 A; 2SPO A; 3ZOL A; 2QLS B; 1C7D B; 3CIU B; 1A0Z B; 1LUE A; 3QZZ A; 3UHZ A; 1IRD B; 2E2Y A; 1Y35 B; 3D7O B; 2VLZ A; 3ECL A; 3QM8 A; 3DHR A; 1HBH B; 1V4U B; 1YMA A; 2GKN A; 1W92 A; 2H8D A; 4HSX A; 1THB A; 3ODQ B; 1O1K B; 1YVT A; 2R4Z A; 2FAL A; 1RQ4 A; 1QPW A; 1MBA A; 1Y22 B; 1YDZ A; 3UH6 A; 1O16 A; 3WFT A; 1S0H B; 3ZJO A; 1NXF A; 1LFV A; 2ZLX A; 4ODC B; 4F6J A; 1Y01 B; 1Y45 B; 5CNG A; 2GTL C; 1MYM A; 1XZ7 B; 3R5I A; 1J52 A; 1LA6 B; 5HBI A; 1DXV A; 1LH2 A; 3WCW B; 4MQG A; 7HBI A; 2D2M C; 1HBA A; 1N9H A; 4H2L A; 3UHR A; 2ZS0 D; 2FRJ X; 1BVD A; 1YVQ A; 1J3F A; 5CN5 A; 1V75 B; 3G46 A; 3UBC A; 1J3Y A; 1Y8W B; 3EDA A; 1LFY A; 3A5B A; 1HBB A; 2QMB B; 3ZJL A; 1YEU A; 1AJG A; 4TWV A; 1FN3 A; 2HBG A; 2R80 A; 1HRM A; 2XKG A; 1AJH A; 1O1J B; 3OK5 A; 3EOK B; 1O1I B; 1N9I A; 3BJ1 B; 3IA3 B; 2NRL A; 4NK2 A; 2ZSX A; 4VHB A; 1FSX A; 1TES A; 2RAO A; 1BBB A; 3PI1 A; 6HBW A; 1NWN A; 1DXU A; 1GBV A; 5JDO C; 5JDO F; 1CH3 A; 2DXM A; 3H58 A; 3O89 A; 1MOD A; 3FS4 A; 2C0K A; 3BCQ A; 1K0Y A; 1XZ5 B; 1Y4R A; 5CNC A; 2M6Z A; 2ZFB B; 1B86 B; 1HBR A; 1IWH A; 2IG3 A; 5AZR A; 1BUW A; 3ZJJ A; 1XQ5 B; 4JAC A; 1Y4F B; 2GDM A; 2W6W A; 3UHX A; 2GTL B; 1LFV B; 3OVU C; 2QSP B; 3A5A A; 1GCV B; 1Y4B B; 1JF4 A; 1HSY A; 3SDN A; 3LR9 A; 4N7N A; 1DUK A; 1LH3 A; 3A5G A; 1Y4Q A; 2O5Q X; 3D17 B; 2D5X B; 1C7B A; 4MQI A; 2G0V A; 2HBS B; 3K9Z A; 2D2M B; 4O2G A; 3WCV C; 1Y85 B; 4MQG B; 3PI3 A; 1BVC A; 5ILM A; 6HBI A; 1Y8I A; 2VYZ A; 1QI8 B; 1YVQ B; 2VM0 A; 1RVW B; 3P5Q A; 1SPG B; 1MOC A; 1Y4V A; 1BZ1 B; 3W4U B; 3A9M A; 1CBL A; 1VRE A; 3NL7 B; 3ARJ A; 3GKV B; 1YHU B; 2G12 A; 1NQP A; 1XXT B; 4NI1 B; 2ZLV B; 3VRE B; 3ONZ A; 1BAB B; 3PI4 A; 3UHK A; 1BZR A; 4ZVA A; 105M A; 3NFE A; 1O1N A; 1X9F A; 2ZLU B; 4L7Y B; 4ESA B; 1MKO A; 1DO4 A; 1BZZ B; 1OBM A; 2VYW A; 4MQH A; 3HEO A; 3QM6 A; 1QSH B; 4F4O B; 3AT6 B; 3D1K A; 2OIF A; 1DUO A; 2SPN A; 1NEJ A; 2M6Z B; 3VRG B; 1LFT B; 4OOD A; 3SZK B; 1Y8H A; 1CP5 A; 2OH8 A; 1HBR B; 2D2N A; 2QU0 A; 5EU2 A; 4MPM A; 2ZLW A; 2Z6N A; 2D2N C; 3OZW A; 1QSI A; 1UMO A; 1YHE A; 3PI8 A; 3QJC A; 3LB4 A; 2PGH A; 1OR6 A; 3UHN A; 3WCV B; 1UT0 A; 1HHO A; 2MGA A; 5ILE A; 3BJ2 A; 2EB8 A; 1HAB A; 1RPS B; 1OFJ A; 1YE2 B; 1HGB A; 4MBN A; 5E83 B; 1ABY A; 1XY0 A; 1Y4V B; 4X0L B; 1GCW B; 1XZV B; 1XZ4 B; 1RSE A; 3FH9 A; 1SDK B; 1A4F A; 2AUQ A; 5EYJ A; 3OGB A; 3GYS B; 3PI9 A; 3WHM A; 4UZV A; 5EQM A; 3ONZ B; 107M A; 1VWT B; 1A00 A; 5F2A A; 1DXT B; 3GDJ B; 2ZSN A; 2ZSS A; 1Y0A A; 2W6Y A; 2D5Z A; 3DHT B; 1UVY A; 3BA2 A; 3UH3 A; 2VEE A; 1ECN A; 1YIH A; 2ZT1 A; 4G51 A; 1MLK A; 3TM3 A; 1UC3 A; 2GRF A; 1A3N A; 1YEN B; 2D2N B; 1BZ6 A; 3KUN A; 4B3W A; 3G4W A; 1A6N A; 1Y7Z B; 1XCH A; 4N7P B; 5KDQ A; 1GBU B; 2MGM A; 1LFZ B; 3QJB B; 1YEQ A; 3BOM B; 1Y0W A; 1YHE B; 3MJU A; 2GRH A; 2EKT A; 2HZ2 A; 1X9F D; 2AUR A; 4XS0 B; 1CLS B; 3G4V A; 1G0A A; 3MOU A; 1YOI A; 5JDO E; 1Y4G B; 3WCP B; 2R50 A; 5KER A; 1K1K B; 1VXE A; 2Z8A A; 1FAW B; 3BJ2 B; 5SW7 A; 4ILZ A; 1Y7D A; 3PEL A; 3M3A A; 4BJA A; 1QXD B; 1A01 B; 1OUU A; 2SPL A; 2ZS0 A; 1YE0 B; 2MGH A; 1GDK A; 2ZSQ A; 2YRS B; 1NS9 A; 3AT5 A; 1UFP A; 1SI4 B; 4C0N A; 1Z8U B; 4ROL A; 4PQC A; 1SDL B; 3ECZ A; 2XYK A; 3OO4 A; 1HGA A; 2GNW A; 1X46 A; 1ECO A; 1DKE A; 3IC2 A; 4JYQ A; 5EUI B; 2AUP A; 1MNJ A; 1MWC A; 1V4W B; 2HZ3 A; 2G3H A; 1C7C B; 1HDB A; 3G52 A; 3GQR B; 3KUO A; 2ZWJ A; 2LH3 A; 1O1L B; 2ZSY A; 2DN3 A; 5HLX A; 2H35 A; 2MGI A; 2G10 A; 1LFL A; 3HF4 B; 1Y8K B; 4FC3 A; 1HV4 B; 1JDO A; 2G0X A; 4O4T A; 1MLM A; 1YHR B; 1M9P A; 2HHB B; 1CG8 A; 3A0G B; 1HBI A; 3OJ1 A; 1S5Y B; 3MJU B; 2V1E A; 1U7S A; 3VRF B; 1LFQ A; 1CH9 A; 2V1K A; 4YU3 A; 4HRT A; 1G08 B; 1Y09 A; 2G11 A; 3MVC A; 3WCT C; 1AJ9 A; 1MLH A; 2D60 B; 4NI0 B; 1XYE A; 1XZ2 B; 1M6C A; 1U7R A; 2FRF A; 2NSS A; 1M6M A; 1G0B A; 4PQ6 A; 1VRF A; 3D1A A; 5SW7 B; 1LHS A; 1HCO A; 4YU4 A; 3S66 B; 3AQ7 A; 3KMF C; 1S69 A; 1HGC A; 1DLW A; 2W6X A; 4F69 A; 1EW6 A; 1S5X B; 1CG5 B; 3ZJH A; 1XZU B; 3UHE A; 2VHB A; 4MQC B; 1YG5 A; 1C40 B; 4M4B A; 1GLI A; 2MGL A; 4MU5 A; 1JY7 A; 1KD2 B; 1DM1 A; 2XKI A; 2VLX A; 3UHG A; 1JZM A; 2HCO B; 4ROL B; 5CHR A; 5E29 B; 4UIQ A; 1Y7G A; 2G0Z A; 4KMV A; 1MOH A; 1CH2 A; 1Y0T B; 3BJ3 A; 5CNE A; 1Y46 A; 2VLY A; 2OHB A; 1BZ0 B; 1YEO A; 1DKE B; 2DHB B; 1SHR A; 1NIH A; 3HYU B; 1V5H A; 2OLP A; 3ZJS A; 1MYZ A; 2HBF A; 1Y7C A; 1QXE A; 4KMW A; 2ZT2 A; 3HC9 A; 3G4Q A; 2ZLT B; 1J40 B; 2HBD A; 1DTI A; 2HHE B; 5C6E B; 2FRK X; 2MGB A; 1A6K A; 1OUT B; 1Y5J B; 1YEV B; 2EB9 A; 1BIJ B; 4HRR B; 1WMU B; 1EBC A; 2DN1 B; 1R1X A; 3MKB A; 3UH7 A; 1LHT A; 1DWR A; 1Y31 A; 3UHC A; 1Y2Z B; 3WCT B; 4M4A B; 3A59 B; 4NS2 A; 4HRT B; 2LH7 A; 1MBI A; 2R1H B; 3PIA B; 1OFK A; 4ROM B; 1YFF B; 4MQK B; 1IBE A; 1RQ3 A; 3CY5 B; 3LB1 A; 3SDH A; 1YOH A; 3S1I A; 1A0U A; 2G0R A; 5EV5 A; 1Y5F A; 2ZSZ A; 3QJD A; 3DHR B; 3IC0 A; 3HEN A; 2Z85 A; 2ZFO A; 3WCW D; 2MGG A; 2AV0 A; 2H8D B; 1THB B; 4WCH D; 1YVT B; 1ECA A; 1JP9 A; 4FH6 A; 3M3B A; 1JL7 A; 1MGN A; 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1O1O A; 3PT8 A; 2MGE A; 2O5M X; 3LR7 A; 3WTG A; 3RGK A; 4AVE A; 3S1J A; 1NWI A; 4MQJ A; 3QZX A; 2DN2 A; 4N7N B; 3B75 A; 1GZX A; 1Y4Q B; 1YHU D; 1C7B B; 4MQI B; 2Z6S A; 1BZP A; 3PT7 A; 3UHQ A; 3GQG A; 2MGC A; 103M A; 4FWX A; 4HSW A; 3OZV A; 1MLJ A; 1IDR A; 2ZFO D; 2MYD A; 1Y8I B; 1N9X A; 1JW8 A; 1UFJ A; 3WR1 A; 2V1G A; 1O1P A; 3NMM A; 3P5Q B; 3QQQ A; 1ECD A; 1J7S A; 4HHB A; 1N9F A; 3M39 A; 1RTX A; 1COH A; 3MJP A; 2MYB A; 5MBN A; 2R4W A; 1NQP B; 1CH1 A; 3H57 A; 3S65 A; 2AA1 A; 2G0S A; 1SWM A; 2MYA A; 1YIE A; 3NFE B; 1O1N B; 1X9F B; 5HLQ A; 1SPE A; 2EF2 A; 1MKO B; 1NZ4 A; 1F5O A; 4IRO B; 4U8U A; 4NK1 A; 1J7W A; 4MQH B; 1J3Z A; 1HJT A; 1LH7 A; 5JGG A; 2CMM A; 1J7Y B; 1YZI A; 2LH2 A; 3D1K B; 3G4Y A; 1YGD A; 1Y83 A; 3LHB A; 3TM9 A; 2LH5 A; 1NEJ B; 5EYS A; 1VXC A; 1HDA A; 4O1T A; 1Y8H B; 2HBC A; 2QU0 B; 4G1V A; 3WCU D; 2ZLW B; 5EOH A; 1O1O B; 2Z6N B; 1DWS A; 2BK9 A; 1QSI B; 3MBA A; 3ZOM A; 3ZJM A; 1CIK A; 3GOU A; 3G53 A; 3PI8 B; 4N8T A; 1UIW A; 2QSS A; 3QJC B; 2O5S X; 2V1J A; 1MLS A; 1S61 A; 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