4M7SA

Crystal structure of semet btrn in an open conformation
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
249
structure length
214
Chain Sequence
MDKLFSMIEVEVNSQCNRTCWYCPNSVTGEMDPALYKTLMEQLSSLDFAGRISFHFYGEPLLCKNLDLFVGMTTEYIPRARPIIYTNGDFLTEKRLQTLTELGIQKFIVTQHAGADKEKVVYLDHSASKANMSCMVPSNLAVVTVLGNVLPCFEDFNQKMVMGNIGEQHISDIWHNDKFTSFRKMLKEGHRGKSDLCKNCNNVSVQTEEQYDYV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal binding protein
source organism Bacillus circulans
publication title X-ray analysis of butirosin biosynthetic enzyme BtrN redefines structural motifs for AdoMet radical chemistry.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BtrN
total genus 71
structure length 214
sequence length 249
ec nomenclature ec 1.1.99.38: 2-deoxy-scyllo-inosamine dehydrogenase (AdoMet-dependent).
pdb deposition date 2013-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13186 SPASM Iron-sulfur cluster-binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4m7sA00
2Y63A 4DQWA 2QCDA 3AO0A 3TU9A 1UUOA 1QPRA 5CSSA 3F03K 4JTFA 3O1NA 1KM5A 1T0OA 1LOSA 3KFTA 3FLUA 3G1FA 2RDTA 4DF2A 1DQXA 1F7BA 3TMQA 3DFPA 1KW1A 4NX5A 3DZ1A 4IMDA 1ME9A 4MZ8A 1JRBA 1GYLA 4AWUA 4EF9A 3GDTA 3SJ3A 1YXCA 4R34A 1DHPA 3M43A 3VCRA 3FKRA 3PUEA 1U5JA 2BX7A 5FF7A 2F7FA 4MYAA 2ZZ3A 4OU1A 1W8SA 5AC6A 3IIOA 1ZALA 1AL7A 3P80A 1H7XA 2NUXA 3G22A 4CCDA 2KZHA 4BK9A 2Y6ZA 3UWUA 1ZJIA 4E2DA 1GG1A 5F1VA 1AG1O 2QCHA 3F4WA 3W1UA 3M5ZA 2BTMA 3NL5A 3UD6A 3O6DA 1ICSA 3W1NA 4LS2A 2JGYA 3W84A 5HUPA 4ZZ9A 3A5VA 2PRHA 3HGOA 4S2CA 2H3DA 4GXMA 3I7SA 4CNOA 1H1YA 4JICA 4AEOA 1H50A 2DP3A 1I2PA 3V1PA 4O4VA 3QMRA 3NDOA 4MVAA 1K8YA 3L68A 2Q3OA 2PURA 1WQ5A 3EXRA 2OMAA 1YYAA 1L9WA 3QPYA 4IX2A 4Y6GA 1VHCA 1L2UA 3A23A 4HT3A 4OHQA 3C52A 4PCFA 3PULA 3W6YA 1QFEA 1R30A 4GWEA 4X9SA 4M19A 4GUHA 3KVKA 2EHHA 3ABOA 4AF0B 2XN0A 4O18A 1I4NA 1VRDA 3C61A 4K8HA 4LVFA 3NL2A 1J5TA 4M5PA 1GG0A 2X2GA 3P8IA 2Z0IA 5HNRA 3QFEA 3LB0A 4FXSA 4FIRA 1GVRA 5DN1A 3OEXA 4TO8A 2DJLA 3G0XA 3S6DA 3DI0A 3FYOA 3TH6A 3WJWA 1UJPA 1GVSA 1EP1A 1K03A 4UTLA 3PSWA 1KM3A 1WV2A 3NYZA 3S5ZA 3CIXA 4JX4A 1OX6A 1VYRA 1Z42A 3C2EA 3LTSA 1HFBA 3P61A 4Y8FA 1F5ZA 3U8GA 3L5MA 1K7XA 4AHPA 3OVRA 3W87A 4NXKA 1JQVA 3B0VC 1B9BA 3HPXA 1H61A 3ANYA 1SZFA 3TA6A 3EWBX 5DBTA 5EPDA 1EIXA 1I2RA 2A2IA 4GFSA 1A53A 4M6VA 3P82A 5CPOA 2C3ZA 3TAKA 2GJLA 2QDGA 3NPWA 2C15A 3OVPA 1I45A 1HUVA 3KXQA 4Q32A 1IIGA 5D32A 4DO5A 4K36A 4UMBA 3LCGA 5KINA 3GNNA 4YLWA 4MZYA 5CZ0A 1FDJA 4ZQRA 2ZA2A 3GZ3A 3IRDA 2J6XA 1OFAA 4DEFA 3BLEA 1JULA 3IV3A 3G1AA 2VEIA 3K30A 4K8EA 3THQA 3RK8A 5AYXA 2ZTKA 3LHYA 3NG3A 1HO1A 4MPQA 3HOJA 5G1TA 1F2JA 3HGRA 3STGA 4KKXA 5CZTA 1KFEA 3L9CA 2QR6A 4O54A 4AB4A 2QCEA 3QQ1A 1FWTA 1QR7A 5AB3A 3LRLA 2R94A 1PS9A 3I7QA 4R53A 3KVMA 1NF7A 3N2XA 1VR6A 2QCDB 3A5FA 4GUGA 2WPBA 3INPA 3PS7A 3CEPA 3O63A 1WBJA 3O07A 1NAL1 1K7EA 5GVJA 1IIHA 2VKZG 4O12A 2J88A 2YW4A 1QOPA 2HMCA 1VLWA 3M9YA 5CZSA 5TBOA 2YZRA 2RDUA 3W7RA 4O50A 1PL9A 1Y0EA 2FLIA 3P8JA 2DU2A 3TW7A 3HF3A 2YR1A 5D37A 4NX0A 2VOMA 1QNVA 1LBMA 1OVDA 3W1XA 1VPXA 1QPOA 2H6RA 5LNRA 2CLKA 3TFXA 5AHFA 1GJPA 4UFLA 1P0KA 1XCFA 4K38A 2WO5A 1VJIA 4ADUA 3BK0A 4O1DA 3LV6A 3DKJA 4JDBA 3LERA 4XBSA 1FY6A 3HGSA 3R89A 4ZVJA 2FFCA 2QCCA 4UMCA 3NAVA 2DZUA 1A50A 2WSQA 5FF2A 3S8HA 5LHEA 3P5YA 5D09A 4FIQA 1H60A 2V82A 5K3VA 4K39A 5E0KA 1SQ7A 3STFA 4IX0A 4JTUA 3HG4A 2W0UA 4AHOA 4EIVA 2EPHA 1H51A 1JRCA 3CM4A 4NUWA 1W3IA 5DCDA 3WK2A 3W2JA 3S1WA 3BLFA 3NQAA 4N9CA 2TSYA 5LSMA 1H7PA 4UTIA 3LHZA 3C3NA 1SPQA 2FPVA 2H8ZA 3NL3A 1F05A 3QSTA 1ZENA 2O7SA 4PL1A 5E1QA 1YTEA 2QJIA 3DKLA 4NJKA 4DBDA 4LW7A 1IXOA 5LKYA 1NVMA 3TMLA 2VEKA 3EWWA 3W85A 2X16A 3LCIA 3OIXA 3EX1A 4UFKA 3TE9A 5CPMA 4HN4A 1VC4A 1XL9A 2O7QA 2YYTA 1GOXA 1T99A 4X3ZA 2HSAA 2B4GA 1ZAJA 2F84A 3B05A 3W7LA 2ZBTA 3FIGA 2A4AA 3TC6A 1UASA 2QUVA 3PVFA 4IXXA 4UNLA 4UMAA 4O14A 4JTKA 2RH9A 3GAKA 4O13A 3N2MA 5LGXA 1KFCA 4LTSA 5D33A 3C6CA 5F4XA 2NWSA 3PB0A 3NZRA 3NQCA 3UNDA 3LDVA 5H2ZA 4MZ1A 1YTKA 1X1OA 1ADOA 2FJKA 2VXNA 4BR1A 3SSJA 4TIMA 2D73A 1YDNA 4LY8A 2VFHA 2WQPA 1R2SA 2DZTA 5J5RA 3NVTA 1V5XA 3MMTA 3R8RA 4O4WA 3BVJA 3O6YX 3NZ1A 4PC8A 3E12A 5G1YA 3RLVA 3NL6A 5G2WA 2E6YA 1OK4A 5DY3A 3UZ5A 5K2ZA 1XBZA 1W3TA 4MUZA 2HS6A 3MHFA 4LVGA 3TDFA 3DXIA 2DZVA 5MHBA 4YWIA 4LRSA 4O52A 3LI1A 3GK0A 1L6SA 3MWAA 1OHLA 5HWJA 3YPIA 5IM51 3PBWA 4JEQA 1MEIA 1TTJA 5HR7A 3W71A 2Y62A 3RMJA 2NUWA 4KWWA 4HPJA 4DO6A 4A29A 5LNWA 2CLLA 3MBDA 3EX3A 4BF9A 3BW3A 2DZWA 1VCGA 1YDVA 2Y85A 3DENA 4UTTC 4ML9A 2EGZA 3G0SA 4FO4A 2WNNA 4EF8A 3IIZA 1ZY9A 4LRTA 5D2WA 4UTKA 4QISA 1KFJA 1ML1A 3O16A 4YCPA 4Z1DA 3W1PA 5KSWA 3P67A 3TSMA 3TXZA 2YX0A 1LBFA 3QM3A 5AHEA 1Q6LA 3HG5A 5I3FA 1G7VA 1D3GA 5AOUA 4IGHA 4FNTA 1RV8A 4JIPA 4WOZA 1ICPA 4O11A 3C2VA 2VFEA 5HJLA 2Y7FA 4UTWA 4WXYA 4N9EA 4O0ZA 3MI6A 3W2MA 4HPXA 1GVFA 3FFSA 4UR7A 4IOTA 2OT1A 4O17A 3G1DA 3FEMA 2X30A 3SY5A 5G5IA 1XC4A 5HQEA 1HG3A 1WA3A 3SR7A 4JNMA 4JTHA 3M5VA 4WY0A 4WXZA 3NQGA 3Q94A 3UPBA 1CW2A 3EX4A 4P2VA 3LRMA 3NQEA 4JX6A 3R2GA 4O53A 3CB8A 3NM3A 1L6YA 3KHJA 4HKPA 1H5YA 3GR7A 4JY8A 4NZJA 4AXKA 3W7DA 2ISVA 1SZGA 3VKJA 3VNDA 2I1OA 1O4UA 4JD4A 1XKYA 3VFLA 3LTPA 5D30A 3N34A 1GVQA 3LHUA 1ICQA 2V5LA 1TCDA 3IGUA 4LWWA 1TPUA 3DFTA 4X2RA 3CTLA 2YPIA 3LBCA 4A3UA 2CZ5A 3RU6A 3PBUA 1W56A 4R7JA 3VE7A 2E68A 2X1UA 2CLIA 3WK1A 1TV7A 3I6RA 4GNJA 3KRUA 2X1RA 2NX1A 4NJJA 4FNRA 2E1DA 4ZQPA 2OCZA 3L0GA 4JS3A 1W31A 2HTMA 3C8FA 1SO5A 3GLCA 3NGJA 3LGEA 3NQFA 2E5CA 4BI6A 2B7PA 2FPYA 4A22A 4RJEA 1LBLA 4OQVA 5CGQA 1R2RA 3WK0A 4I7UA 2V2CA 3LM7A 3W9ZA 3HIJA 4G1KA 1BTMA 3L5AA 4H6KA 3GDLA 5EL1A 5U7SA 1KM0A 1JCJA 2WKJA 3S42A 1X1ZA 2JKPA 1TPB1 1SFLA 4O1AA 3LV5A 4IJBA 4UCGA 4O10A 1YLVA 2GPTA 2HS8A 2QCMA 5C55A 3G8EA 4AMAA 3E96A 1JCLA 3GDRA 4M7SA 1XBVA 1VQTA 4DF1A 4Q33A 2J9ZA 1F74A 3LCLA 3U2OA 4LVBA 2EAWA 2ZA1A 3QPZA 5EY5A 3A24A 1PHQA 2DJXA 1P5BA 3BW2A 4DBEA 3LCXA 1FCUA 3EX6A 3CT7A 3SFKA 4U4MA 2Q8ZA 4N4QA 3LXAA 3ABSA 5L9FA 2TRSA 3S9YA 2YYUA 4JTGA 4JY9A 2YGYA 3C2OA 3G24A 3B4UA 5FF3A 5J5DA 4QSHA 3I7RA 1UB3A 1XDLA 3GIYA 3BG3A 1FWRA 2ZCGA 3O8AA 1YDOA 3GNDA 2I9EA 3OHIA 4FXRA 1ZAHA 3BPWA 1LYXA 1L6WA 1W37A 3TR2A 4BI5A 1G4TA 3H53A 4JTIA 3TROA 4EVZA 1TJPA 3DFQA 5FF4A 1BWKA 4JYFA 1FDYA 3RLUA 4JR5A 2A6NA 5HWNA 3NPUA 3BARA 4JIQA 3LXCA 1TPWA 1QCWA 1HO4A 4JTLA 1H7NA 4KFPA 5HMSA 5BRBA 1TJRA 4RZ5A 4TX9A 4CNNA 4WOQA 2RFGA 3EKLA 2EKCA 5K4XA 3NA8A 1KM1A 3CHVA 3Q58A 4CNPA 5EMUA 5AHIA 4WY0B 4LU0A 2ZRWA 2CFFA 1LROA 3PSVA 1XFBA 4K7VA 2NXHA 3IIPA 1KM4A 3BW4A 1W1ZA 1X6UA 1NEYA 1I2NA 3NXFA 5EKYA 3EWXA 2V2HA 5K9CA 2PE4A 2VFFA 2Y7DA 1TPDA 2QAPA 3R13A 2DZSA 4NZFA 4OGZA 2GOUA 4LV9A 4J9JA 3BLIA 3SIZA 3MW7A 3CC1A 4JGDA 1LORA 3OBKA 1G67A 2ABAA 5F2IA 3QW4B 5CSRA 1GZGA 5T26A 4WD0A 4HIBA 5F2GA 1LOLA 3QZEA 4H3DA 4MLJA 3P5ZA 5I3JA 3DU0A 3C2RA 4MFDA 1A5AA 3GDMA 5D03A 1U83A 4N02A 4PEKA 3E0IA 3LBMA 4GUJA 2NXIA 4RLIA 3GXNA 3TUUA 2QDHA 2ZRYA 3DI1A 1I2QA 1TTIA 4UFIA 4O1BA 2DZPA 3HBLA 3BG5A 4UIOA 3W88A 2QUUA 3KRSA 1F76A 4XUGA 2GVGA 1EWEA 2C14A 1T8XA 2Y7EA 2ZZ6A 1TRIA 3PM6A 1KFKA 5AC7A 4A2RA 4UNKA 1W5PA 5KZEA 3DHDA 3OA3A 3G1YA 2VEPA 3FJ6A 3LHVA 3MYOA 1RR2A 3LTYA 2C6QA 1AMKA 4AWSA 2CLFA 1YXYA 5D2VA 4E38A 4N2YA 3PG9A 1DJQA 1DJNA 2B7OA 2FB2A 3S5YA 5LHFA 4AAJA 1NF0A 2ATMA 1OFOA 4RR4A 1CI1A 2VENA 3IVUA 5I3IA 1LM1A 3EX2A 3LCFA 1G4PA 1R46A 3BV4A 4D2JA 3LCWA 3G1VA 1W0MA 4Y96A 1RVGA 4NXSA 4JYDA 6ALDA 2BWGA 1DV7A 2Z2UA 1X8FA 5KTLA 1NSJA 3FJLA 1NFBA 2W6RA 2VEMA 3MO7A 1PHWA 3VI2A 1FBAA 3TW6A 4XQ6A 5U4NA 3UQNA 3M16A 1DVJA 1QDSA 5D38A 2YFNA 2WV8A 1SU5A 3ZWSA 1P1XA 1OFPA 1YPFA 4DELA 2CLMA 3B03A 1N55A 4UFJA 3IEBA 3N73A 3PBVA 3W1LA 4YXGA 1JUEA 1VS1A 3MP4A 5F4WA 1UUMA 4U28A 1UBSA 4L4MA 3MP5A 1KV8A 5LZLA 1YPIA 1IF2A 5G4EA 3BO9A 4DXVA 1JQXA 3AJXA 3M5YA 5G2HA 4QQ3A 4IPIA 4OBTA 3ABQA 3P60A 2ZDRA 1LDCA 3HQ1A 2QAFA 2CLHA 3MI3A 5CG7A 5LNVA 4UR8A 2GVLA 3S1XA 5LNSA 1AL8A 4I7VA 3SECA 3STCA 3W1MA 2NZLA 3VE9A 3W2KA 1M7OA 1KFLA 3DH7A 3G1SA 2ISSA 1I8JA 3TKFA 4YMZA 1MZHA 3T7VA 4P61A 2Y61A 2P10A 3CWOX 4TMCA 4BFAA 1ZHAA 1ME7A 4GE8A 4ALDA 4OT7A 2YXGA 4O15A 2TYSA 3W7CA 2NX3A 3O15A 1SO3A 3P62A 4UC5A 2C18A 2CLEA 1S5TA 5KZDA 1M6JA 1VHNA 4MIMA 2Q3RA 1VGAA 3NQVA 4O0KA 1XDMA 1KLYA 4CQ9A 4YL2A 4PFMA 5D2TA 4K7YA 3DFSA 4Z1AA 1SZNA 4JYEA 1O94A 4NNBA 5FEWA 4NU7A 3GAYA 1SO6A 1WX0A 5ABTA 3KX6A 1K8ZA 3B0PA 1WOBA 1BWLA 2VFIA 3QYQA 4Z1BA 3EWUA 2ZZ4A 1WAUA 1P0NA 1SW0A 3LHWA 3T78A 5HWMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3GY1 A;  1TV8 A;  2QVH A;  3WJY A;  1EB3 A;  3ART A;  1XLE A;  2PDH A;  4C5Y A;  2CZF A;  1G4E A;  4G56 A;  1TPF A;  3L5L A;  2D2G A;  1O95 A;  1UA3 A;  4E5T A;  4PA8 A;  2NVA A;  1H63 A;  3MHG A;  3PG8 A;  3ID7 A;  1XBY A;  3VCC A;  1AQ0 A;  5A2C A;  1TQJ A;  3MV1 1;  5KMY A;  5HDR A;  2QUM A;  4IIC A;  4WK9 A;  3LXB A;  3L67 A;  9XIM A;  3JR2 A;  3N13 A;  4GA8 A;  1D2K A;  4JTS A;  4PCT A;  1DIK A;  1POJ A;  1J0H A;  3CUI A;  2L5H A;  2WOQ A;  4LAK A;  4UQA A;  5DQP A;  1B4E A;  1YBQ B;  3CPG A;  3ANU A;  3FJN A;  1Q6Q A;  4DB7 A;  1XSJ A;  3NQ8 A;  3RAO A;  3VGH A;  4LB4 A;  4YHG A;  4PYS A;  3UVI A;  1BSL A;  5G4W A;  1KM2 A;  3LHT A;  1F6P A;  2GJX B;  1MVY A;  1HKV A;  3G18 A;  3S1V A;  4Q8V A;  1B30 A;  3ZT6 A;  3NPV A;  2G96 A;  5FAC A;  1HL2 A;  2E5D A;  2C16 A;  1XLF A;  3OTR A;  3V1H A;  3W1Q A;  3WDH A;  1T5A A;  4NI8 A;  3R0U A;  1TVP A;  4S23 A;  3WF3 A;  1X39 A;  1UCW A;  3ITG A;  1H1N A;  5FAJ A;  4AEF A;  2X09 A;  4PTN A;  2IUZ A;  2R24 A;  4MYX A;  3LN3 A;  4O1E A;  1DE5 A; 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