4M7XA

Staphylococcus aureus type ii pantothenate kinase in complex with a pantothenate analog
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIYKDTEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEKHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Discovery of Potent Pantothenamide Inhibitors of Staphylococcus aureus Pantothenate Kinase through a Minimal SAR Study: Inhibition Is Due to Trapping of the Product.
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Type II pantothenate kinase
total genus 98
structure length 273
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4m7xA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4m7xA01
3EKSA 3GG4A 3P4IA 3OHRA 3WQTA 5BN8A 1KAZA 4CZKA 5BRHA 4BR7A 3TPQA 1QZ5A 3O4WA 1TYQB 4IJAA 4NB4A 1HJOA 3U8XA 4IWVA 5LJWA 3CI5A 5AQVA 5AQPA 3VPZA 4WQ5C 3L0QA 4FPAA 3JXUA 3HZ6A 3SJHA 3AAQA 3C7NA 3GBTA 4ISFA 4BRQA 1MWMA 5KQ8A 3DJCA 3UKUB 4MLHA 4EFHA 4O8KA 3GOIA 4ISEA 3QB0A 3MN7A 3UB5A 2ASPA 3QBWA 4BRCA 4IZ9A 4JD2A 3LDNA 2P9NB 3WQUA 3FR0A 5JMVA 1GLEG 4FOIA 4BC5A 2QM1A 4BC2A 2J4RA 4BG9A 2A3ZA 3LDOA 1HKGA 3MCPA 3WXKA 5BRDA 3GL1A 1T6CA 4HWIA 4BRAA 4B9QA 3VEXA 3O80A 3HSCA 1NWKA 3DXKB 1J6ZA 4YDUA 3HBTA 3I33A 4A62A 4CJ7A 1HUXA 1ATNA 2P9KA 5AZIA 3KHYA 4A2BA 2GELA 5KPRA 4FWNA 4CD3A 1GLCG 1QQNA 2P9PB 1GLBG 2FXUA 3FE1A 4BR2A 3VGMA 1DKGD 1X3NA 1NGAA 3CJ9A 4BQZA 1JCFA 5KQDA 2QWLA 3AAPA 3LDLA 2BUPA 3FLCO 2NRHA 4CBXA 1KAYA 4Y0WA 3GE1A 2CGJA 5AQHA 1E4FT 4H5RA 3O5BA 4FWQA 5AQOA 2Q31A 4E1JA 4BROA 2F9WA 3U4LA 2OANA 2P9PA 2F9TA 3VEZA 3EKUA 3VERA 1BDGA 3UKUA 4WQ5A 2WUSA 1ATSA 4FO0A 2P9UA 1NGEA 5AQXA 4CI6A 4JNEA 3VF6A 4RWTA 4ISGA 3UKRB 3WXJA 2GUPA 4CZLA 1DEJA 3DWLA 3MMVA 3WEEB 3SMSA 2HF4A 1TYQA 1JCEA 3CETA 3D2FB 1V4SA 3D2EA 1D4XA 3QFUA 3UE5A 2QWOA 4QS9A 5B8HA 5KPTA 2ITMA 1BUPA 1GLAG 2GWKA 3BP8A 3R9PA 2NZTA 4HTLA 4H5VA 4IO8A 4B1VA 1GLLO 3WXIA 4JAXA 1U2VB 5AQUA 1HLUA 4GNIA 3DXKA 4B1UB 4BR4A 1HKCA 1NLVA 1YAGA 3G25A 3M3ZA 1C0FA 1BA0A 2IVPA 3HM8A 2V51B 4FPBA 2Q1NA 5BPNA 2HOEA 2VCPA 4EAHD 4CBWA 3CQXA 5AQFA 1MDUB 2QWQA 3MN9A 2NLXA 3FZLA 4XH5A 3AARA 5BRFA 3LDQA 4J8FA 4BRNA 4JHDB 5AQJA 4JN4A 3S41A 4H0XB 1Y64A 2QWRA 2E88A 5AQKA 4CD1A 2YHXA 3ULEA 3VEVA 3L6QA 4BREA 1BG3A 4I6MB 4CZHA 2A40A 2QWPA 5F1XA 4XEIA 3ZEUB 1U6ZA 1YXQA 4BGAA 5LJVA 5AR0A 1H1VA 4IXCA 5F2RA 1EQYA 3ZEUA 1T6DA 5FPDA 4FWKA 3U9ZA 2CGKA 2HF3A 1GLDG 4BR0A 2P9SA 3ZX0A 2KHOA 5AQYA 4EHTA 3RSEB 4BG8A 1NGFA 3BEXA 3W0LA 3VEOA 4RTFD 4O5FA 2V7YA 2CH5A 2BTFA 3EO3A 1XUPO 3MN6A 3SK3A 1MA9B 1QQOA 4EIAA 1IJJA 1BA1A 3ATVA 4H0PA 5AQIA 3VF4A 1JCGA 4BRMA 3O1BA 5TKYA 5BPLA 4MO4A 4PL7A 4B1ZA 3A8YA 1X9JA 5EOYA 3VGLA 4H03B 3ATUA 3O6WA 4WQ4A 2E1ZA 2GTDA 4QS7A 4L3QA 3U9DA 4B1WB 4FOEA 2FSJA 2E8AA 4YDUC 3IDHA 2YCHA 3DAWA 3LM9A 3CJBA 1LOTB 4AM7A 3CJ7A 3TU5A 1SZ2A 3KZBA 1XQSC 5AQQA 4AM6A 4BRLA 2P9SB 2I7PA 2PAVA 1QHAA 2IIRA 3O8MA 2VWBA 3VESA 2QWNA 5EVZA 4QS8A 4Z94A 3A0IX 4H5WA 4PL8A 4H0TB 4CZFA 4FSVA 4BR5A 1K8KB 1CZAN 5F0XA 1MWKA 3FZFA 3ENOA 3H45C 2DPNA 1KXPA 1ATRA 1ESVA 5ADXH 2ZGYA 5BREA 2QW9A 2GWJA 1QQMA 4C23A 1HPMA 2ASMA 2FSKA 5JICA 3CQYA 4H5NA 3A5NC 4PKIA 5FPMA 3FFKB 4JD2B 4LC9B 4WYBA 3LM2A 1S22A 4F9OA 2D0PA 5E84A 4IJNA 4BC4A 4CZGA 3ENHA 2P9LA 1RDWX 1S3XA 3SLCA 3I8BA 2Q2RA 3BF1A 5EXWA 3VGKA 3ID8A 2QWMA 3CJCA 5ELZA 1SQKA 2P9LB 3LDPA 4XH1A 2ASOA 4BRIA 2A6AA 3O08A 4FWLA 4H0VB 3VF2A 4I6MA 2ZWHA 2H3GX 3FZMA 3MDQA 3H46O 5AFUA 5BPMA 1X3MA 3IFRA 2D4WA 2E2QA 3H6EA 3WUHA 4CZJA 1NGCA 4FWPA 5ADXA 3C0BA 2E20A 1C0GA 3IMXA 4FWSA 1QZ6A 3ZETA 2P9KB 2YHYA 4FWRA 1K8KA 1Q18A 3BUZB 2PBDA 3KVGA 5AQZA 4PKHA 4BRFA 2Q0RA 4M63C 5AQWA 4BRHA 3FZHA 1NGGA 2FF3B 3F9MA 3EN9A 1TUYA 4A61A 2YHWA 2I7NA 5AQRA 4BR9A 3QFPA 1R59O 3JS6A 5AQSA 2ZGZA 3SMPA 3ULEB 2UYTA 5KPZA 4PKGA 3VOVA 2AP1A 3VEWA 3VETA 2E2PA 3D2FA 5BR9A 2YJEA 1NMDA 3O1WA 4DCHA 3VENA 4BRGA 2CGLA 3R8EA 2HMPA 5AQGA 4M7YA 2FSNA 4BQLA 2A42A 1NGDA 4MO5A 3C7NB 1ZXOA 3B8AX 4M7XA 3ZETB 3EL2A 3CJ1A 5CE3A 1HX1A 2D0OA 1P8ZA 4WQ4C 3M6GA 2P9NA 3ZX3A 1G99A 3CERA 2D1KA 4BGBA 3H3OB 1GLJO 3WEEA 3BF3A 1ZC6A 4FL9A 4DB3A 2Q97A 4K42A 5AQTA 3W3DA 1IG8A 1NGBA 1ZBSA 2IVOA 2V52B 4GY2B 1NGJA 1E4GT 2P9UB 1NGIA 3AY9A 2P9IA 5AFUH 4NO7A 3H1VX 2EWSA 4KBOA 4BRPA 5BN9A 4DHYA 4CBUA 3FZKA 3R6MA 4BC3A 1U2VA 5AZJA 4BVPA 4FWOA 3HI0A 5LY3A 1BWFO 5EY4A 4BVOA 4BRKA 3LL3A 3CHWA 3EZWA 1TUUA 3QMLA 1BU6O 1XC3A 3ZX2A 1WOQA 2V7ZA 2CH6A 4B1XB 4B1YB 3J8AA 4H0YB 5JLHA 3UKRA 2AA4A 3D7EO 5JLFA 3IUCA 1Z6RA 5AQMA 2P9IB 2GEMA 4K25A 1WUAA 1RFQA 5AQLA 2FLOA 1T44A 4RCHA 2IVNA 3DXMA 1RGIA 1SAZA 2E2NA 3M1FA 3CIPA 4BRDA 2YJFA 3FGUA 3VEYA 2E1YA 5AQNA 5FPNA 3A5OC 3GDQA 3H1QA 3QICA 1KAXA 4JHDA 3MK6A 4FWMA 2A5XA 3RSEA 4MLEA 3D2EB 3WT0A 3MN5A 1BO5O 1YUWA 3A5LC 3H3NO 5I9EB 1Z05A 4K43A 2E2OA 5E26A 3L4IA 1OKJA 5AZJB 2VYPA 3DXMB 1YVNA 4EHUA 2Q36A 4H0OA 5AZIB 1V4TA 2FF6A 2YI1A 1BOTO 2W41A 4CZEA 1LCUA 2QXLA 2W40A 4A2AA 4H5TA 1NGHA 4CZMA 4DQ8A 1NBWA 1HKBA 3QDKA 3QBXA 3WXLA 4XH4A 3HTVA 4CZIA 4K41A 2A41A 3A5MC 2Q0UA 5FPEA 1NM1A 1GLFO 3CJAA 1DGKN 5EX5A 2ZF5O
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SQ0A 3OYEA 5CZ2A 3OYMA 3CCQN 1RNHA 3LZIA 3CI5A 1SKSA 4WQ5C 1BL3A 1IBMK 4FPAA 3DLGA 3JXUA 3AAQA 1NJZA 3C7NA 4ISFA 3ZSXA 1RTHA 2OPPA 4E89A 1QSYA 3O9SA 1IKVA 4ISEA 2UXBK 4FLXA 4FJLA 3CPEA 4OLAA 2EX3A 3RMAA 3LDNA 3DRPA 3K57A 1Q82O 1TKDA 5BR8K 5C12A 4FOIA 4HHTA 1VSLA 4BC2A 4YNQA 2JGUA 4AHTA 4BG9A 2G8WA 1RBVA 1HKGA 3MCPA 5C24A 4DQSA 4ELTA 3NF8A 3NH1A 4G1QA 3VEXA 4CEDA 3PLAA 3DXKB 3F5TA 4PA1A 3HBTA 4A62A 2O8DB 1NNEA 1ZBIA 3CM6A 3KHYA 4NCAA 1GLCG 2P9PB 1GLBG 2FXUA 4BR2A 4NYFA 4DV2K 3LPUA 4IG0A 1NGAA 3F9KA 4Z4CA 5HRNA 1JCFA 5KQDA 2PY5A 2QWLA 4F3OA 4DU1A 4PWDA 4DFPA 3SV4A 1EX4A 4WCEL 4H5RA 4FWQA 2F9WA 3U4LA 3VEZA 3S9HA 4X62K 2NRXA 3N4PA 3QEWA 2DFFA 2WUSA 1ATSA 1VRUA 1NGEA 1R0AA 1ZYQA 5I3UA 4CGJA 3NF9A 5GINA 4J2DA 3EE9A 4OKJA 4CZLA 4JI4K 3MMVA 4JKEA 2WOMA 3EZ5A 3PX6A 2YX6A 2X74A 1TYQA 4LFBK 1YJ9N 3LDSA 3TSQA 1D4XA 4QS9A 5B8HA 4IOXA 1GLAG 3O4QA 2NZTA 4B3SK 4H5VA 4IO8A 4B1VA 1TL1A 5AJ3K 1T05A 3T19A 3DXKA 2AJQA 3O3HA 1HKCA 1NLVA 2ETJA 3CFRA 1L5UA 1C0FA 1VQMN 5BPNA 3AA5X 1YHQN 4DWIA 4BDPA 2RKIA 4H4MA 1ASVA 1VSHA 4B3RK 3MN9A 2X6SA 4FK4A 4Z4FA 2D0CA 3OBYA 2RPIA 3LDQA 5BRFA 4YFUA 4N56A 1NK5A 5HOOA 4BRNA 1TVRA 4Z0UA 4H0XB 2VG7A 2OYQA 4G9ZA 2HSTA 2W6LA 4I6MB 3HSTB 4DV0K 1D5AA 3ZEUB 1YXQA 4CEBA 4JLHA 5KTQA 5F2RA 3ZEUA 4XIUA 4NLCA 2KKZA 1BQNA 1Y97A 1U45A 4O44A 1GLDG 2O8BA 2KFZA 1QQCA 3ZX0A 1S1VA 2KHOA 3HVTA 4EHTA 3RSEB 4C1NI 3K5LA 2V7YA 2NRRA 2YHAA 1EO1A 4A59A 2BTFA 4Y1CA 5LL6Z 2NRWA 1XUPO 3CCJN 3SK3A 1KFDA 4N76A 1QQOA 4WF9L 5BPLA 3OYFA 4YORA 1JCGA 4DFKA 3O1BA 4B1ZA 4W5TA 4KHUA 3A8YA 3DLRA 3ATUA 4IKFA 3O6WA 1RT5A 4E7LA 4M3YA 1T7PA 3NVMA 4CHOA 1W9HA 3L3VA 4OGEA 4IFYA 3CCRN 4B9TA 4CCHA 3DRRA 4YDUC 2E8AA 2YCHA 1RILA 4JEPA 2IOCA 3RVCA 3CJ7A 3E9OA 3SUOA 1JJ2M 1VSFA 1NJYA 3G10A 2IIRA 4A5AA 3O8MA 2QWNA 4DSLA 3VQ5A 4QAGA 3LZJA 3A0IX 1XWLA 3T1YK 1YI2N 5F0XA 1A5WA 1IKWA 2G8IA 1U4BA 4F4KA 1ESVA 2E5LK 2ZGYA 4M41A 2D0BA 3AGKA 4I9QA 1VHXA 2KQ2A 2YNHA 4PKIA 5FPMA 4JI5K 4FLWA 3FFKB 4WFBL 3TANA 4Q0BA 3ASMA 1S1UA 3LM2A 5HRPA 4NYNA 4E7IA 4E1NA 4IJNA 2DFEA 3ENHA 3OJUA 1T3VA 1TKXA 1Q7YO 2Q2RA 3BF1A 4JI0K 1BI4A 3VGKA 3G6EN 3ID8A 3WNGA 2D0AA 3O9UA 3SAHA 2HHXA 4XH1A 3K5OA 2UUAK 3O08A 4CJUA 4JKGA 3VF2A 4ELUA 1NJXA 3CCUN 4FJMA 5AFUA 3IKMA 3SAFA 3AVAA 2F4VK 3AA4A 3H6EA 4KKOA 1NGCA 1TAQA 4FWPA 3C0BA 1TK8A 3NBPA 3L2WA 1HRHA 3IMXA 3V9SA 4FJ7A 3V9ZA 5GAHP 2F8TA 1REVA 4FVUA 1NOZA 3PY8A 1TKZA 5KGWA 3EN9A 1TUYA 3L2UA 5LMNK 4KB0A 4IDKA 1T03A 3MECA 2VWJA 1JLFA 3SMPA 2KFNA 3KLEA 5SZTA 1JLCA 3VOVA 3J81O 1YVUA 3QEXA 3VEWA 1E3MA 2WFBA 3D2FA 3KK7A 4CE9A 3VA3A 5HROA 3VENA 5HBMA 4CF0A 2CGLA 3NCIA 3MX2A 4NCGA 2PYJA 1J9AA 3C95A 5AQGA 4M7YA 1RBUA 4CJRA 4Z4EA 2FSNA 1XC9A 1KTQA 3NE6A 3CCSN 4C8NA 4CIEA 1BCMA 3ZETB 3S3OA 3QNNA 1VSJA 1VQ8N 1JLAA 1QS4A 1XI1A 1P8ZA 4WQ4C 4QOZB 3ZX3A 2P9NA 4JI2K 3SUNA 1B9FA 4GV9A 4K8XA 1J54A 2FC0A 5CYQA 4DSIA 1NOYA 1Q9XA 4E1MA 1BIUA 2EHGA 4B9NA 1XMOK 1IG8A 2IVOA 1ZBSA 2V52B 4DSFA 3VQ8A 3AO5A 1E4GT 3AY9A 5AFUH 1ASWA 4NO7A 1WSJA 2EWSA 2GBZA 4BRPA 3THXA 4B3OA 1LV5A 3D45A 4JS5A 3SZ2A 1UA0A 5AZJA 3SUQA 1TK5A 4DR1K 4C8MA 5LY3A 1BWFO 3RRGA 4BRKA 3LL3A 3DOLA 3CHWA 2UU9K 3K5MA 1OH8A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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