4M7XA

Staphylococcus aureus type ii pantothenate kinase in complex with a pantothenate analog
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIYKDTEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEKHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Discovery of Potent Pantothenamide Inhibitors of Staphylococcus aureus Pantothenate Kinase through a Minimal SAR Study: Inhibition Is Due to Trapping of the Product.
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Type II pantothenate kinase
total genus 98
structure length 273
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4m7xA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4m7xA01
1D4XA 2GTDA 3EZWA 3LDOA 4MO5A 5AQPA 4B1UB 3VEXA 4WQ5C 1QQMA 1QQOA 5AR0A 4B1VA 3A0IX 5AQXA 3QBWA 1BU6O 3KVGA 3CJ1A 4CZGA 4JD2B 3WXKA 2YJFA 3CQXA 3IDHA 3QICA 4B1WB 3WXIA 1HPMA 2P9LA 5E26A 3ZEUA 3WQTA 1XUPO 1Y64A 3MN7A 3GE1A 2D0OA 4FWKA 5F0XA 5ELZA 3C7NA 2FXUA 2ZGYA 2QM1A 2NRHA 2CH5A 1DKGD 3CHWA 4H0VB 1GLDG 1T6CA 2Q2RA 3EKSA 4FWSA 3HSCA 2YHXA 2ITMA 3VEWA 4AM7A 3WEEB 3BP8A 5EY4A 4FSVA 2PBDA 1KXPA 4HWIA 5AQKA 3SK3A 5EVZA 4H0YB 1Z6RA 1ZC6A 4MLHA 1J6ZA 3H45C 3O8MA 4H0PA 3DAWA 1BWFO 1R59O 2FF3B 2HMPA 4MO4A 5BN8A 1X9JA 4CZKA 5BPLA 2E1YA 2QWMA 2Q97A 4PKHA 2IVNA 4B1XB 4EFHA 4ISFA 4E1JA 3G25A 5KPRA 2IIRA 3KZBA 2P9LB 3ZX0A 2FSKA 4CD1A 1Q18A 4FL9A 1HX1A 2P9UB 2V51B 4XEIA 3M3ZA 5AZIB 3RSEA 2FF6A 5AQRA 4ISEA 4H5VA 5AFUH 1K8KA 5LJVA 3LM2A 3QMLA 3U4LA 4BC5A 4IO8A 4M63C 3VGMA 5AQOA 2A5XA 3GL1A 3QBXA 2IVOA 2D1KA 5JMVA 2V7ZA 4O8KA 4JNEA 3TU5A 5AQFA 3SLCA 3W3DA 4IJNA 5AQSA 3U9DA 3B8AX 4FWMA 3DXMA 3SJHA 4BRLA 3VF2A 5AQIA 1S3XA 3HI0A 2YJEA 5AQVA 1ESVA 3I33A 1TYQA 1NGBA 4CZMA 3SMPA 5ADXH 3MN9A 2GEMA 1OKJA 3UKRB 2Q0UA 4EAHD 5FPDA 2D0PA 3MK6A 3F9MA 3JXUA 2IVPA 5EOYA 1NGDA 3WXJA 5AQMA 4I6MA 4JHDB 3EKUA 3L0QA 3VEOA 2NLXA 5KQDA 4WQ4C 4H5NA 5LJWA 4BRFA 1RFQA 2ASPA 1XC3A 3L4IA 4CZFA 1ATSA 4CBUA 4CBXA 1E4FT 2QWPA 3DJCA 4K41A 3UB5A 3HM8A 5KPTA 1SQKA 5AQHA 2CH6A 3FZHA 3H3OB 4HTLA 3GDQA 2GUPA 3FZKA 4RTFD 5FPMA 1BOTO 4FWPA 4CI6A 3CJ7A 3SMSA 4YDUA 4DHYA 3C7NB 3ZETB 3VEVA 5KQ8A 1ATNA 4I6MB 3A5NC 3VGLA 3CIPA 4FWLA 5AQNA 2P9PB 4CBWA 4BQLA 4BREA 1IG8A 3CJAA 1TUUA 3VEYA 1TYQB 3H1VX 4K42A 4BGBA 4FOIA 3D2FB 4XH5A 5F2RA 3WUHA 3VF6A 4BC3A 5JLHA 1X3NA 5AZJB 1MWKA 2CGLA 3DXMB 4ISGA 4L3QA 1QQNA 4FWRA 5BR9A 4JD2A 1QHAA 2J4RA 1NGGA 4BRAA 3W0LA 2FLOA 2E88A 5JLFA 1K8KB 3LM9A 2W41A 3QDKA 3FZFA 3O1BA 3QFUA 4FPBA 3FGUA 4K25A 5AZIA 1HKCA 3RSEB 1SAZA 2Q31A 2QW9A 1NM1A 2V52B 3S41A 5BREA 1ATRA 4M7YA 3D7EO 3ULEA 3FE1A 2VWBA 4EHTA 3HBTA 1GLFO 2ZWHA 3R8EA 2P9IA 4A62A 3H6EA 4CZJA 4H0XB 4H0TB 2E2NA 3LDLA 1KAXA 1YUWA 4B1YB 4QS9A 2ASOA 4BR7A 4PKIA 4KBOA 4FWQA 4WYBA 3VENA 3M1FA 3ZX3A 4FO0A 3CQYA 3UKUA 3ULEB 2GWKA 2QWOA 2I7PA 2NZTA 2W40A 2ASMA 2ZF5O 4XH4A 4BVPA 3EL2A 3WQUA 4FOEA 5AQQA 1QZ5A 5FPNA 4EIAA 3H3NO 5JICA 1MWMA 1C0GA 1P8ZA 2D4WA 5AQUA 3MDQA 3LL3A 4IJAA 3O08A 4CJ7A 3VOVA 5AQYA 4BRGA 1NGFA 3HZ6A 3O80A 4CD3A 4GY2B 4BR4A 1BUPA 4BGAA 4XH1A 1ZXOA 4JAXA 1NGEA 4QS8A 3VETA 1LOTB 5FPEA 2F9TA 3CI5A 4BG8A 1U2VB 1NMDA 3VESA 2CGKA 3AY9A 3CJ9A 2KHOA 4PL7A 4DCHA 2V7YA 4H5WA 3U8XA 1YVNA 2EWSA 4BRIA 1H1VA 4A61A 1NGJA 5AQJA 2YHYA 4JN4A 2HF3A 3CERA 2P9KA 3WT0A 2I7NA 3VF4A 3BUZB 3VGKA 1RGIA 3R6MA 1BDGA 1JCFA 4BRNA 5I9EB 4PKGA 5CE3A 2QXLA 4F9OA 4NO7A 1U2VA 2YHWA 1T6DA 2E8AA 3ID8A 1JCGA 3A5MC 2QWLA 4DQ8A 1HKBA 4BRMA 3DXKA 4Y0WA 4BRKA 3EN9A 3MN6A 5BPNA 4WQ5A 2FSJA 4BRPA 4QS7A 2BTFA 3MCPA 1GLEG 3IUCA 1QZ6A 4WQ4A 2QWRA 2YCHA 3UE5A 3QB0A 4H0OA 3A5LC 3LDPA 5ADXA 3BF3A 1GLCG 3DWLA 4O5FA 3UKRA 1NLVA 5BN9A 1BA0A 3MMVA 4LC9B 3FFKB 4CZHA 1GLAG 3LDNA 2E20A 3OHRA 4GNIA 4BR2A 1NBWA 3BEXA 4J8FA 3GBTA 1XQSC 3MN5A 1ZBSA 1YAGA 4K43A 5AQLA 4BVOA 2F9WA 2E2QA 3VPZA 1GLBG 3GG4A 2GWJA 2E1ZA 2PAVA 3AARA 4H03B 4CZEA 5B8HA 5BPMA 1KAYA 3FR0A 3GOIA 4AM6A 5BRHA 4BR0A 4EHUA 1NGCA 3AAPA 3EO3A 1X3MA 4NB4A 2A6AA 2P9NB 4RCHA 5KPZA 1V4TA 3VEZA 2DPNA 2P9UA 3CETA 3VERA 3ATVA 4H5TA 3D2FA 2A41A 2GELA 2P9SA 2P9IB 4CZIA 2ZGZA 2BUPA 1BG3A 2FSNA 2E2PA 1C0FA 1NGIA 1S22A 3O4WA 1NGAA 2YI1A 3ATUA 3ENHA 5EXWA 3R9PA 3U9ZA 3IMXA 5AZJA 2Q0RA 1HUXA 5LY3A 2HF4A 1GLJO 1IJJA 4H5RA 2AP1A 4A2BA 4CZLA 3JS6A 2OANA 3FZLA 5AQGA 4BG9A 4IZ9A 1T44A 1V4SA 1CZAN 3J8AA 1HJOA 3CJBA 4B1ZA 4BRDA 3WEEA 2A40A 3I8BA 2P9SB 1DGKN 3O6WA 3ZETA 2WUSA 4BROA 3WXLA 4DB3A 2QWNA 3HTVA 1YXQA 4FPAA 4A2AA 2A3ZA 2P9NA 2H3GX 4BC2A 2E2OA 3P4IA 4FWOA 2Q1NA 5EX5A 3ZX2A 5AQWA 4BR9A 5BRDA 1JCEA 3AAQA 4Z94A 5AQTA 5AQZA 3O1WA 3C0BA 4IWVA 2CGJA 1KAZA 4BRQA 4BRHA 5E84A 1Z05A 3ENOA 3TPQA 3BF1A 1TUYA 1MDUB 2A42A 1NGHA 3A5OC 4M7XA 4BRCA 4BR5A 5AFUA 4FWNA 1WOQA 2VCPA 3CJCA 3ZEUB 4C23A 2HOEA 3H46O 4BQZA 4BC4A 5F1XA 1NWKA 1SZ2A 3UKUB 3D2EA 4YDUC 3A8YA 1EQYA 1BO5O 3L6QA 1U6ZA 3DXKB 1HLUA 3FZMA 4RWTA 1DEJA 1LCUA 3H1QA 3O5BA 4JHDA 2QWQA 2VYPA 1WUAA 4IXCA 1GLLO 1HKGA 4PL8A 4B9QA 3LDQA 1MA9B 1E4GT 2Q36A 1BA1A 2P9PA 4MLEA 2AA4A 3IFRA 2P9KB 3M6GA 5BRFA 3D2EB 2UYTA 3KHYA 5TKYA 1G99A 3FLCO 1RDWX 3QFPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IDKA 3VEXA 1QQMA 5AR0A 2Z1HA 4DTPA 3PO5A 3LDSA 3CJ1A 3OJSA 1YI2N 4JD2B 3JAMO 2UXBK 2YJFA 3CQXA 2JLEA 1S1WA 3IDHA 4B1WB 3WXIA 4OPJA 2OZMA 3QIOA 5E26A 1L3SA 3PLAA 3CYMA 3L3UA 1QQCA 2UU9K 3CQ8A 2O8BB 5F0XA 4N5SA 5ELZA 2ATQA 1SUQA 2QM1A 3RMDA 1X9MA 4H0VB 1KQSM 1T6CA 4AM7A 2HHTA 4RG8A 2ITMA 3THWA 2KLAA 1BCMA 4FSVA 2HBJA 3SV4A 1VRUA 5EVZA 4H0YB 1ZC6A 5GAGP 1N5YA 4E0DA 4M3RA 4CERA 1TAUA 1YT3A 3AVJA 2FF3B 2HMPA 5BN8A 3PV8A 1X9JA 3NFAA 3K5NA 5BPLA 4B1XB 2IVNA 3G25A 5KPRA 5CZ2A 3KZBA 1EKEA 4CHZA 4DTUA 4FL9A 1EWQA 1VAZA 1RT2A 4KI4A 1E3MA 3RSEA 3J81O 1WBDA 4DSFA 4HUFA 3U4LA 4M63C 1NKCA 3CFOA 4DSEA 1VQON 4YOYA 2QK9A 4FM1A 2XY8A 1NJYA 4DR4K 4JNEA 1RDBA 5AQFA 3E9LA 1NK6A 2ZQBA 3U9DA 3SAGA 4XIUA 4Y1CA 5M1FA 3MEDA 5AQIA 1S3XA 4KREA 5AQVA 4JLHA 3I33A 4KB0A 1U48A 1HRHA 1M90O 3EY1A 3D45A 5ADXH 1C6VA 4JI0K 3C95A 1VK0A 1OKJA 4FJ7A 2Q0UA 5FPDA 2D0PA 3MK6A 1CXQA 2X74A 2DY4A 4CHQA 3VQ9A 3CC4N 2BDPA 4IEIA 3ZSVA 3SAFA 1ILYA 4WQ4C 3ZCMA 1FW6A 2ASPA 1XC3A 3L4IA 2PYLA 5M1QA 3L8BA 4HHTA 4IFEA 1P90A 4AHUA 1IH7A 2GUPA 4CGFA 3FZKA 4J2DA 3AVIA 3LZJA 1TKXA 3CJ7A 4LD0A 1KVBA 5CHIA 1BHLA 2G8IA 1OH6A 5KQ8A 3I0RA 3T1HK 3A5NC 1L3VA 3RRGA 4FJIA 3VQ4A 5FLXO 1QSYA 2YV0X 5AQNA 3CIPA 4CBWA 1TVRA 2W6LA 4DUYK 2XO7A 1TKDA 4GV3A 3H1VX 1BI4B 3ZSZA 4E7IA 3HVTA 5JLHA 4A5AA 1MWKA 3MWTA 4PUOA 4DV2K 3TAMA 4L3QA 5C15A 5KI6A 1HNZK 2QEXN 4E1MA 3PX0A 1QHAA 4DQRA 3NCIA 2FLOA 5JLFA 4C1NI 1K8KB 4KHWA 3RWUA 2KZZA 4DFMA 3QFUA 4H8KA 4K25A 3VQPA 5IT9O 2HBKA 2Q31A 2HBLA 4N47A 4DKWA 1SV5A 3CXCM 1ATRA 4RW9A 3AVHA 1JKHA 5HRSA 4I9LA 5I42A 4KHYA 3LWMA 4EHTA 5GADP 4CESA 3G6EN 2ZWHA 4A62A 3SUPA 2HHUA 4OPKA 1DLOA 4QOZB 3KD5E 3J7YP 4LFAK 4H0TB 2E2NA 2YNIA 3TI0A 4B1YB 2ASOA 4BR7A 2O8DA 4DSLA 3OY9A 5CYQA 4L8RB 4OKJA 3M1FA 3RMCA 3HPOA 1KRPA 2ASMA 3MWPA 3EL2A 4DLGA 3LAKA 5AQQA 5FPNA 4EIAA 3K9JA 4FJ9A 1MWMA 1KFDA 1J9AA 3VN5A 4Z4CA 1VSFA 1K9MO 2ETJA 3O08A 5CR4A 3ULDA 4DTMA 4CJ7A 4LSLA 3L2UA 4JKAA 4BRGA 3O80A 4AF1A 5BR8K 4U7BA 4BGAA 4XH1A 1ZXOA 1NGEA 4QS8A 3TABA 3AVCA 5FPEA 3AA5X 3CI5A 1VQKN 2F4VK 4YOUA 3V4IA 2KHOA 4FLVA 3NE6A 1H1VA 1NGJA 3G10A 2QKBA 4DMNA 3SQ0A 3CERA 2I7NA 3BUZB 3M8SA 4F9OA 4X65K 5J2PA 3NF9A 3O4QA 1JCGA 3PUFA 2QWLA 4CEDA 1VSEA 1ASVA 3AO4A 1YITN 3EE9A 4CJ3A 3EE8A 1RTHA 1VQ6N 4CJEA 1GOCA 1VSLA 3O9SA 4FM2A 3J7AP 3UE5A 3A5LC 4MDAA 4ELUA 4CEAA 1GLCG 4FJMA 1NLVA 4OVLA 4X66K 1S1TA 3OYEA 3MMVA 4E7JA 1XHXA 3TR8A 3TAEA 3OHRA 4DF8A 4FLYA 3BEXA 2HNYA 4CJSA 3MN5A 4JS4A 4LF8K 1SL0A 3B6PA 1YAGA 5AQLA 4FLTA 2VWKA 2F9WA 5FRMA 1SL2A 4FZZA 1VQNN 1GLBG 1RBRA 2O8CA 1WN7A 1NJZA 3CMAN 3AARA 5M1OA 5B8HA 4BE1A 3FR0A 5BRHA 3NDKA 3T69A 2YNGA 4BR0A 2G8HA 2F8SA 3EO3A 3RRHA 2P9NB 1VSMA 4MFBA 4KHNA 3ATVA 1KTQA 3D2FA 1NK5A 4CZIA 3DLHA 1BG3A 2FSNA 3J7ZO 5J1EA 1RT4A 3MX5A 1BIUA 4H4OA 3R9PA 1C0UA 3HM9A 3WNFA 2YHAA 1IJJA 4A2BA 5AQGA 4BG9A 1XHZA 4IZ9A 1T44A 4BDYA 4IOAL 5JVHL 3DLGA 5HOOA 3E66A 3J8AA 1HJOA 2D0AA 3ALYA 4JKDA 3CJBA 2FBXA 3M5RA 1IKWA 2FC0A 2A40A 3MXJA 3I8BA 3O6WA 1VRTA 2WUSA 3RTVA 2QWNA 4FJHA 4CJVA 4V19S 2PZSA 1Q86O 2A3ZA 2P9NA 1ZBIA 2E2OA 2DTUA 2Q1NA 1JJ2M 3AAQA 1LAVA 3K58A 3O1WA 4IWVA 2CGJA 2EX3A 1KAZA 4BRHA 3QEVA 3KTQA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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