4M7XA

Staphylococcus aureus type ii pantothenate kinase in complex with a pantothenate analog
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
MKVGIDAGGTLIKIVQEQDNQRTFKTELTKNIDQVVEWLNQQQIEKLCLTGGNAGVIAENINIPAQIFVEFDAASQGLGILLKEQGHDLADYIFANVGTGTSLHYFDGQSQRRVGGIGTGGGMIQGLGYLLSQITDYKQLTDMAQHGDRNTIDLKVRHIYKDTEPPIPGDLTAANFGHVLHHLDADFTPSNKLAAVIGVVGEVVTTMAITVAREFKTENIVYIGSSFHNNALLRKVVEDYTVLRGCKPYYVENGAFSGAIGALYLEKHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Discovery of Potent Pantothenamide Inhibitors of Staphylococcus aureus Pantothenate Kinase through a Minimal SAR Study: Inhibition Is Due to Trapping of the Product.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Type II pantothenate kinase
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
total genus 98
structure length 273
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2013-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03630 Fumble Fumble
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4m7xA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4m7xA01
5E26A 1MWMA 1T44A 2UYTA 3BP8A 4ISEA 1SQKA 1ATNA 3H6EA 3LDNA 5FPEA 2P9LA 3C7NB 4QS9A 1U2VB 3UB5A 5B8HA 5AQRA 3UE5A 3FLCO 2P9SB 4IWVA 1K8KB 3FFKB 1NGBA 2J4RA 3FZFA 2BTFA 4FL9A 3R9PA 3WQTA 3H1QA 5KQDA 5E84A 4H0PA 1TUYA 3CJCA 3H3NO 3AY9A 3VGKA 4CZLA 5BPLA 1QHAA 2H3GX 4BRFA 3LL3A 4JHDB 2YCHA 3O5BA 3WEEA 4BC5A 5FPMA 1NLVA 5JMVA 3SLCA 3ATVA 3D2FB 4XH5A 4CZGA 3O4WA 3B8AX 5AZIA 3FZHA 5AQHA 1C0FA 2P9UA 5FPDA 3A5NC 2FSKA 4CZKA 3G25A 3AAPA 4H0XB 3O8MA 4EFHA 2V52B 4EAHD 4Y0WA 4I6MB 2E20A 4O8KA 2CH5A 3GBTA 3A0IX 2Q1NA 4GY2B 3C7NA 1NGHA 1U2VA 2E2PA 4CZIA 5LJWA 3VENA 3CQXA 2P9SA 1K8KA 2P9PB 3MMVA 4FWLA 4WQ5C 1BDGA 4BC3A 3CHWA 4FWMA 1ATSA 2E1ZA 4BR4A 3CETA 1V4SA 2Q31A 2NZTA 3W3DA 3O6WA 4A2AA 3JXUA 4Z94A 4JAXA 4FOEA 4ISFA 3EO3A 2D0OA 1MA9B 2ZGZA 1NM1A 3HM8A 4JHDA 3VESA 2HMPA 1LCUA 5EY4A 4A62A 1X3MA 1GLAG 1T6CA 3VPZA 3ULEA 3BUZB 4BROA 3D2FA 4BGAA 4BR5A 5AQSA 2BUPA 3DAWA 4HWIA 1NBWA 5AQFA 3JS6A 2WUSA 4DQ8A 3DXKB 1IJJA 1DGKN 5LY3A 5JICA 3L0QA 3MN5A 3UKUB 1P8ZA 3J8AA 3MCPA 2QW9A 3O1WA 5AQUA 3I33A 1HKBA 2E2OA 2Q0UA 4KBOA 4BRLA 4CZMA 5EXWA 4BREA 5JLFA 2P9PA 3CJ1A 4B1UB 3H1VX 1V4TA 2QWMA 2IVOA 3FZMA 4BRAA 4XH1A 4BRHA 3A5OC 4PKGA 3U4LA 2I7NA 2QWOA 1CZAN 3A5MC 3LDLA 5ADXH 2E2QA 4XH4A 1EQYA 2CGLA 4FWNA 1YXQA 3CIPA 2D1KA 3L6QA 4CZEA 2CGJA 2HF3A 1JCFA 1HLUA 1JCEA 3FE1A 3U9DA 4CD3A 3KZBA 4EHTA 3H3OB 1G99A 1SZ2A 2NLXA 4CBXA 1KAXA 5AZJB 3ZX2A 4H0VB 2QWQA 3MN9A 5KPZA 3QB0A 1R59O 3L4IA 4A2BA 3DXKA 1GLCG 3RSEB 3UKUA 4QS8A 1E4GT 1GLJO 4FWRA 2YI1A 3A8YA 1RDWX 3SMSA 5ELZA 1RFQA 1NGCA 3HTVA 4H03B 1J6ZA 5TKYA 2HOEA 4B1ZA 1Y64A 2E1YA 1GLEG 3GG4A 1RGIA 2QWRA 4PL8A 5AQNA 1HKCA 3WXKA 4WQ4A 1KAYA 4BRCA 2VWBA 4BR2A 3H46O 2ZWHA 3CJAA 2HF4A 4BR0A 1DKGD 4CI6A 4BC4A 4DCHA 3ULEB 4K42A 1U6ZA 4FWOA 4FO0A 1BA0A 4CBWA 1NGGA 3U8XA 4B9QA 1ZXOA 4MLEA 3VF2A 3GDQA 1TUUA 1HKGA 2QM1A 3VEXA 2DPNA 4JD2B 2P9IB 5AZJA 3WQUA 4FWSA 4PKIA 4EHUA 2PBDA 5BPNA 1X9JA 4H5NA 3RSEA 2AA4A 3HZ6A 3O80A 5BRFA 5KQ8A 2W41A 3KHYA 2AP1A 4BGBA 5FPNA 1NGDA 4H5RA 5AQJA 2A42A 2D4WA 4RCHA 2GUPA 1YUWA 5AQYA 1GLDG 1QZ6A 3H45C 4FPBA 2NRHA 2VYPA 2V51B 4BC2A 4BRDA 2ITMA 4H0TB 3KVGA 4H5VA 2ASMA 5AQIA 3R6MA 2QWLA 3A5LC 3CQYA 4BRNA 5AQXA 1DEJA 3OHRA 3VOVA 4IO8A 4DB3A 5BRHA 3VF6A 4CJ7A 2A41A 4GNIA 1NMDA 1QQOA 5LJVA 4JD2A 2W40A 1NGIA 4YDUA 3W0LA 2P9IA 4CZJA 2FSJA 2I7PA 2GWKA 5AQMA 3EN9A 3CI5A 4YDUC 4DHYA 4H0OA 4H5WA 5AQOA 4JN4A 2P9NB 4WYBA 5AFUH 3BEXA 2E2NA 4BRMA 3VEWA 2E88A 3VEVA 2Q0RA 4IZ9A 2FF3B 1E4FT 1Q18A 3QFPA 5I9EB 5AQVA 3IFRA 1NWKA 3SJHA 2GELA 4BR7A 3ZX3A 3LM9A 1KAZA 2GTDA 3MN6A 1H1VA 2P9KB 4F9OA 4B1YB 3VEYA 3WUHA 2Q36A 5BN9A 4BG9A 4NB4A 3CJBA 3DJCA 4CZHA 4O5FA 1QZ5A 3IMXA 3EZWA 4C23A 1BU6O 4BQLA 1BG3A 2PAVA 4BRKA 2EWSA 4QS7A 4M63C 4PL7A 3CJ7A 3VGLA 3UKRB 1HJOA 2F9WA 1XC3A 1ZBSA 4J8FA 1S3XA 1SAZA 4CD1A 1BWFO 1NGEA 3FGUA 1S22A 2P9NA 5BPMA 4H0YB 4XEIA 2D0PA 1XQSC 3CERA 3LM2A 3WXLA 4BG8A 5ADXA 5AQLA 4RTFD 3ZX0A 4B1XB 5AQQA 2ASOA 3C0BA 4M7YA 1ESVA 3EKSA 2FXUA 1NGFA 3GE1A 3VETA 2P9KA 3M1FA 5F2RA 2CH6A 2A5XA 2IVPA 1WUAA 1HUXA 4WQ4C 3BF1A 1YAGA 2ASPA 3ENOA 1LOTB 5BR9A 3O08A 2YHYA 1HX1A 3R8EA 4ISGA 1WOQA 3TU5A 5BN8A 2YHXA 4IJNA 2YJFA 4NO7A 5EX5A 3BF3A 4LC9B 4AM7A 4BRIA 5F1XA 3DXMA 2Q2RA 2A40A 3UKRA 3ENHA 4EIAA 4A61A 3FZLA 4JNEA 3D2EB 1TYQB 4E1JA 1MDUB 3VEOA 3U9ZA 1GLBG 4BRGA 4AM6A 4PKHA 4BVPA 1GLFO 3MDQA 5KPTA 4FWPA 3WXJA 2GEMA 3D7EO 3AAQA 2GWJA 3QBXA 4K25A 2ZF5O 3I8BA 1X3NA 2CGKA 5AQKA 2E8AA 4FWKA 5KPRA 4WQ5A 2IVNA 5AQPA 4BR9A 4CBUA 1KXPA 3ZEUB 1T6DA 3P4IA 1BO5O 3F9MA 1YVNA 1Z6RA 2YHWA 4MO4A 2FSNA 4B1WB 3VF4A 5F0XA 3ATUA 3MN7A 3S41A 2QXLA 3ZETB 3QMLA 3IDHA 2QWNA 3EKUA 1JCGA 4K41A 3QDKA 1D4XA 3D2EA 1TYQA 2V7ZA 5BREA 2Q97A 2YJEA 1ATRA 3M3ZA 3FR0A 5AQWA 4CZFA 1BA1A 2FLOA 3FZKA 3WXIA 5JLHA 4FWQA 5AQGA 1BOTO 4M7XA 4BVOA 4B1VA 3QICA 1OKJA 2F9TA 2VCPA 2P9LB 3EL2A 3AARA 3QFUA 3O1BA 3IUCA 4I6MA 3M6GA 3CJ9A 5EVZA 1Z05A 3QBWA 4FOIA 4FPAA 5AQZA 1BUPA 1C0GA 3VERA 3VEZA 3ID8A 1GLLO 5CE3A 3LDOA 3ZEUA 5AFUA 1MWKA 2A3ZA 2KHOA 4BRQA 5EOYA 2V7YA 3HBTA 1XUPO 4IJAA 2OANA 4K43A 3DXMB 3SK3A 3VGMA 2QWPA 5AR0A 4BQZA 3GOIA 4BRPA 3DWLA 2ZGYA 3WEEB 5BRDA 3ZETA 1HPMA 3LDPA 2A6AA 3GL1A 3LDQA 5AZIB 1ZC6A 2P9UB 4H5TA 4MO5A 5AQTA 4RWTA 1NGAA 4HTLA 4FSVA 2FF6A 3WT0A 1NGJA 1QQMA 4MLHA 3HSCA 3MK6A 3TPQA 1IG8A 3HI0A 3SMPA 1QQNA 4IXCA 4L3QA 2IIRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1TK0A 1MWMA 4B9MA 3H6EA 3LDNA 5FPEA 4A5AA 1VK0A 2F4VK 2QKBA 3ZSWA 4CVNE 1NGBA 2J4RA 4LH4A 4NYNA 2FBVA 4BDZA 4AF1A 4V19S 4RW7A 4DQSA 3AY9A 4CJ3A 3V1RA 2H3GX 2Q3SA 4BRFA 3LL3A 2YNFA 2HB5A 1HPZA 3CCVN 5JMVA 1J9AA 3SLCA 2I5JA 3HL8A 3ZSRA 4CZGA 3OYAA 5AZIA 2O8FA 3NVMA 5AQHA 4OLBA 3A5NC 3RWUA 2VGNA 1BCMA 3G25A 1NK8A 2WBNA 1QHTA 4FM1A 3HPHA 4RW9A 4KHUA 4EFHA 4CEZA 2V52B 1IBMK 4Y0WA 1MU2A 2E20A 3A0IX 3VQPA 2Q1NA 1KSPA 4N76A 3THYB 2E2PA 4CZIA 2X78A 5LJWA 4K8XA 4FVMA 4WE1A 2P9PB 3AO1A 2ETJA 4FWLA 4FJIA 1FKOA 2W6LA 4CJWA 3FFIA 5HL7L 2Z1IA 2UUBK 4A2AA 4CJPA 4B3MK 1EWRA 2BE2A 4FOEA 4JAXA 4DU3A 3RR7A 4ISFA 4NCBA 4YNQA 3CCJN 4X62K 1T6CA 3SQ1A 1TAQA 3JYTA 3L8BA 4CEAA 2HBLA 4LY7A 3ENBA 1NBWA 2XY8A 4DQ8A 4KRFA 1KCFA 1DGKN 5JICA 3MN5A 3RMBA 1NK0A 3SJJA 3OYHA 4W5NA 1T05A 3O1WA 1YTAA 3KKSA 2KLAA 3I33A 1OH6A 1XMQK 3THYA 3VTIA 1UA0A 2E2OA 1XNQK 3DRPA 3TABA 1CLQA 2HHHK 2P9PA 2OTJN 3MXIA 2KFNA 1V4TA 2QWMA 3AGRA 3FZMA 4XH1A 1NJYA 4BRHA 3A5OC 4BE1A 3A5MC 5ADXH 3J81O 3MWPA 4DR7K 3L2QA 1Q8IA 4FWNA 4CF8A 2HF3A 1JCFA 1WSJA 3FE1A 1JCEA 3U9DA 4CIGA 4CD3A 3C65A 1SZ2A 3DRRA 3DLBA 5C2DA 2QWQA 3MN9A 5KPZA 4OKJA 3QB0A 3K57A 4B9VA 1KVAA 3AO5A 4FWRA 4B3RK 4B3OA 2YKMA 1NK9A 5TKYA 3IRXA 1GLEG 3GG4A 4AH9A 2IDOA 2ZWHA 3CJAA 2HF4A 4BC4A 4FWOA 4FO0A 1ZBFA 1NGGA 4IEEA 4BDYA 5J2QA 2W6KA 4DSIA 4CGDA 4MLEA 2WFBA 4HCCA 3VEXA 4GKJK 3HPOA 2XY7A 4JD2B 4F4KA 4EZ6A 4CFAA 4IOXA 1OH8A 3PSIA 2P51A 4QCLA 3PIPL 4AHTA 4FWSA 4Y1CA 1X9JA 1XNRK 2VWKA 3VMFB 4U67L 3VQBA 4DLEA 5DM7L 5HRNA 4FLZA 4YY3K 4RCHA 3ZLJA 1N33K 1CXQA 1GLDG 1QZ6A 3L3UA 1RDBA 3TAGA 1JLAA 2VYPA 2KFZA 2YHBA 5MLCQ 2ITMA 3LWMA 5AQIA 4EP4A 3O9TA 3O3FA 3SUOA 3A5LC 3VQQA 1DEJA 4KHPK 3C6TA 3O4QA 1RT7A 4DB3A 5BRHA 1LAWA 4PY5A 4JRPA 1N8RO 4UY8O 4JD2A 4YDUA 5C15A 4JLHA 2I7PA 2E4LA 4DHYA 5AQOA 4JN4A 5IT9O 3H08A 4CEQA 1BL3A 2E88A 5M1FA 4YOUA 3VA3A 5FDLA 1TAUA 1E4FT 2QTDA 4CJFA 5M1NA 1KRPA 1Q18A 1CZBA 4CGGA 1SL0A 4QAGA 1KAZA 2P9KB 4F9OA 4F3OA 3ZT3A 4FLXA 2Q36A 5BN9A 4NB4A 3DJCA 4DTOA 3OYBA 3RMAA 1RBVA 3SI6A 4E7JA 3IMXA 1XC9A 4CF9A 1S6PA 3J80O 4DV7K 3K2PA 2PAVA 1Q9XA 3C6HA 4M63C 2A1RA 3UKRB 1HJOA 3CCQN 1S3XA 4M3YA 3O9QA 4CD1A 4FLWA 1W0HA 2ITGA 4CHPA 5GAGP 5BPMA 4J2AA 4N47A 4WFBL 3F5TA 4BG8A 3E1YA 1EXQA 3AO4A 5GIOA 1LW2A 3QIPA 1J54A 5AQQA 4B1XB 3P38A 3ZSVA 4M7YA 2ZJRL 3EKSA 4CFBA 3GE1A 2P9KA 3DOLA 2CH6A 2A5XA 1L3TA 1HUXA 4WQ4C 3BF1A 1SKRA 2W42A 1LOTB 4HTUA 4PHTX 4Z4GA 4NYFA 3TSQA 1O13A 3O08A 3HP9A 3R8EA 1TK8A 4IOAL 4BRIA 3L3VA 4Z4CA 3UKRA 3ENHA 4EIAA 1JLQA 3WNEA 4HVJA 4E1JA 1NG9A 3AVHA 4BVPA 3MDQA 4KH4A 3OYLA 4O5BA 3E9PA 3AAQA 4M3XA 5HP1A 3K59A 4PWDA 4JI2K 2D0BA 1EO1A 4K25A 4FJKA 2P1JA 4RG8A 1N5YA 4OPJA 3OYGA 1NK5A 4FVUA 5KPRA 3TR8A 2NRTA 4BR9A 4JEPA 3ZSOA 1VAZA 1NJWA 1S1VA 3ZEUB 2GUIA 2KZZA 4FJ7A 2ZJPL 3E9LA 1F21A 4F2RA 1YVNA 3D45A 4JV5K 1KQSM 5GAHP 3MX2A 4DR4K 1S1TA 3S41A 1SKSA 1L3SA 4GVMA 3CCMN 4I9QA 3S3NA 2YX6A 4KHSA 3AA3A 3CF5L 3QDKA 4J2DA 4ILGB 1VSKA 3E66A 3M3ZA 4DR1K 4CZFA 1VQON 2ZD1A 3LWLA 1HNZK 4FWQA 4E19A 1VSFA 3QICA 1OKJA 3I55N 2HSTA 2IOCA 2P9LB 3EL2A 1HJRA 4F2SA 4FM0A 1TKDA 1BI4B 3G6EN 4ILJA 3CPWM 1C0GA 3T69A 3N4PA 4O8UA 3VEZA 3ID8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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